- Csatornák pumpák - Ellenállás kondenzátor komponens - Fordulási-, membrán potenciál ellenállás kondenzátor
Alap struktúra: 4x6TM S5-S6: vizes pórus, szelektivitás S1-S4: feszültség-függés gating: általában S6, fontos S4-5 link
Feszültség-függés (non linear IV) - S4 domain: 6-7 + töltések by Arg, Lys, átrendeződés (paddle S4>S1) - gating current Szelektivitás: visszahajló P-loop, belső g
Nátrium csatornák Na V 1.1-9, Na x : SCN1A-5A, 8A-11A, 7 1 alcsalád; fly: 2 féle, worm: 0! Szelektivitás: - 10x Na + : K +,Ca 2+ - (+) vízburok - Asp-Glu-Lys-Ala (DEKA) a S5-S6 között, az oldalláncok által Inaktiváció (h): window current hidrofób, III-IV között IFMT: Iso-Phe-Met-Thr, loop-loop-helix 1-2 ms nyitás után zárja a pórust Gyors működés: AD-jelfeldolgozás anti-konvulzánsok: phenytoin, carbamazepine, lamotrigine stabilizálják az inaktivált állapotot Helyi érzéstelenítők: lidocaine, bupivacaine, procaine
Calcium csatornák Ca V 1-3 : CACNA1X 3 alcsalád; fly: 4 féle, worm: 5 féle Szelektivitás: - 1000x Ca 2+ : K +, Na + - EEEE (pont a DEKA helyén) Ca 2+ -függő inaktiváció (CDI): DA-jelfeldolgozás: gyors deaktiváció synprint, Ca V 2 MFB: gyors deaktiváció L-type: antiarrhythmics antihypertensives Ca V 1.1 CACNA1S: vázizom Ca V 1.2 CACNA1C: szív, neuron, simaizom Ca V 1.3 CACNA1D: CDI, neuron, simaizom Ca V 1.4 CACNA1F P/Q/N/R-types: Ca V 2.1 CACNA1A: P/Q, AgaTx Ca V 2.2 CACNA1B: N, ω-conotx, Ca V 2.3 CACNA1F: R T-type: Ca V 3.1-3 CACNA1G, H, I, pacemaker α2δ: CACNA2D1-4, kinetics, V-dep, (Lyrica) β subunit: CACNA2B1-4, traffic, kinetics γ Subunit: CACNA2G1-8;
Kálium csatornák 1: K V K V 1-9 : KCNX 12 alcsalád; fly: 9 féle, worm: 16 féle Szelektivitás: - 1000x K + :Ca 2+, Na + - TVGYG, 12 x 2.5 Å >C=O: a v H2O-t helyettesítve T1 tetremerizációs domain: - K V 1-4 (KCNA-D): csak homológ - K V 5-6,8-9: önmagukban nem alkotnak-k V 2 - K V 7 (KCNQ): K Ca -val azok RCK domain Kcsa Funkció: AP, serkenthetőség (I D, I A ) K V 7: (1) heart, (2,5-3) M 1 -R K V 10-12 (KCNH): heart, herg és slow-act Inaktiváció: N-típusú: K V 1 sensor uncoupling, Kv3.1, 2.1, Kv4 KChIP, DPP: K V 4 Kiegészítő alegységek: K V β, K V 1 KChIP1-4, K V 4
Kálium csatornák 2: K Ca K Ca 1-5: fly: 3 féle, worm: 6 féle K Ca 2: SK, K Ca 3: IK (KCNN) - Calmodulin - NEM V-függőek - közelebb áll a K V 1-4, mint BK-hoz K Ca 1,4,5: BK KCNMA KCNT, KCNMC, maxik Calcium bowl: Ca 2+ kötés hatására balra tolt V-függés RCK (K V 7) S 0
Kálium csatornák 3: CNG, HCN CNG (CNGA1-4, CNGB1-2) - 3A:1B - Retina - Non-selective cation TVGxG: x-hydrophil - NEM V-függőek - C-terminal: camp/cgmp-binding HCN (HCN1-4) - Homo- heteromer? - Non-selective cation xxgyg: de divalent nem! - V-függés: S4 10+ - camp shift V-dep - Pacemaker (heart, Thal), leak (pyr)
Kálium csatornák 4: K ir, K 2P K ir - 2TM, homomer - 15 féle human, 3-3-féle fly, worm - K + selective: (T/S)IG(Y/F)G - Leak, fentartja a MP-t, K + transport - nem V-függőek, alapvetően, de - Intracell. polyamine, Mg 2+ blokk ld.ir - Gated by: K ir 1: H +, ATP K ir 2: H +, PIP 2 K ir 3: Gβγ, PIP 2 K 2P - 4TM, 15 human gén, worm 44! - Általános anesztetikumok - K + selective: T(I/V)IG(Y/F)G - nem V-függőek - Leak, background (some T, ph, lipids)
TRP csatornák Human: 32 féle fly: 3 féle, worm: 6 féle Hasonló 6TM, kevés + töltés az S4-n, V-függés: nem phys Non-selective cation, Ca 2+ is Intracell organellumok TRPV, TRPM - Adott T tartomány, magas ozmolaritás, alacsony ph, alacsony intracell Ca 2+, capsaicin - Szenzoros működések - TRPM8: Menthol <25⁰C TRPC - Effektor: hormon, PLC, Ca 2+
Irodalom: Yu, F. H. and Catterall, W. A.: The VGL-chanome: a protein superfamily specialized for electrical signaling and ionic homeostasis. Sci. STKE. 2004, 253 re15. Ajánlott: Catterall: Electrical Signaling: Part 2-3, on YouTube: https://www.youtube.com/watch?v=hfxgsjcoc9a https://www.youtube.com/watch?v=bue8gzmqqb8 Roderick MacKinnon: POTASSIUM CHANNELS AND THE ATOMIC BASIS OF SELECTIVE ION CONDUCTION, Nobel Lecture, December 8, 2003 Érdekes adatok: http://channelpedia.epfl.ch/ionchannels http://mouse.brain-map.org/