DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A HMG-KOA REDUKTÁZ FUNKCIONÁLIS VIZSGÁLATA MUCOR CIRCINELLOIDES-BEN NAGY GÁBOR TÉMAVEZETŐ: DR. PAPP TAMÁS EGYETEMI DOCENS

Hasonló dokumentumok
KAROTINTERMELŐ JÁROMSPÓRÁS GOMBÁK

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Bevezetés

Szakmai zárójelentés OTKA azonosító: PD 48537

MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

A VASFELVÉTELBEN SZEREPET JÁTSZÓ GÉNEK MOLEKULÁRIS. Nyilasi Ildikó DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

A KOLESZTERIN SZERKEZETE. (koleszterin v. koleszterol)

Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással

Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése

A HMG-KOA REDUKTÁZ FUNKCIONÁLIS DOKTORI ÉRTEKEZÉS NAGY GÁBOR TÉMAVEZETŐ: DR. PAPP TAMÁS EGYETEMI DOCENS BIOLÓGIA DOKTORI ISKOLA

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

Ph.D. értekezés tézisei. A c-típusú citokrómok biogenezisében résztvevő fehérjék. szerepe és génjeik szabályozása Sinorhizobium meliloti-ban

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA

MTA DOKTORA PÁLYÁZAT DOKTORI ÉRTEKEZÉS A KAROTINOID-BIOSZINTÉZIS GENETIKAI HÁTTERE ÉS MÓDOSÍTÁSÁNAK LEHETŐSÉGEI JÁROMSPÓRÁS GOMBÁKBAN DR.

A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata. Ph.D. értekezés tézisei.

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia

Növényvédelmi Tudományos Napok 2014

Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

KAROTINTERMELŐ JÁROMSPÓRÁS GOMBÁK

Egy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

GAZDA - PATOGÉN KÖLCSÖNHATÁS VIZSGÁLATA CANDIDA FERTŐZÉSEK SORÁN

A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata

Kis molekulatömegű antimikrobiális fehérjék és kódoló génjeik vizsgálata

~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:

A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban

A MIKROBIOLÓGIA GYAKORLAT FONTOSSÁGA A KÖZÉPISKOLÁBAN MÚLT, JELEN, JÖVŐ SPENGLER GABRIELLA

A Rhizomucor miehei járomspórás gomba HMG-koenzim A reduktáz génjének molekuláris és funkcionális vizsgálata

Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére

Az elért eredmények rövid ismertetése (T37471) 1. 2.:

A felépítő és lebontó folyamatok. Biológiai alapismeretek

Szakmai önéletrajz. Nyelvvizsga: Angol orvosi szaknyelv középfok (Bizonyítvány száma: D A 794/1997), orosz alapfok.

ÖNÉLETRAJZ. Gyermekei: Lőrinc (1993), Ádám (1997) és Árpád (1997) Középiskola: JATE Ságvári Endre Gyakorló Gimnáziuma,

Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL

Fiatal kutatói beszámoló

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A BIOAKTÍV LIPIDEK ÉS A ZSÍRSAV-BIOSZINTÉZIS SZEREPE A CANDIDA PARAPSILOSIS VIRULENCIÁJÁBAN GRÓZER ZSUZSANNA BARBARA

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

A zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

Antiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei)

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS PATOMECHANIZMUSÁNAK MOLEKULÁRIS SZABÁLYOZOTTSÁGA TÓTH RENÁTA TÉMAVEZETŐ:

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Génkifejeződési vizsgálatok. Kocsy Gábor

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

ADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására

Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben

folsav, (a pteroil-glutaminsav vagy B 10 vitamin) dihidrofolsav tetrahidrofolsav N CH 2 N H H 2 N COOH

GALAKTURONSAV SZEPARÁCIÓJA ELEKTRODIALÍZISSEL

Hamar Péter. RNS világ. Lánczos Kornél Gimnázium, Székesfehérvár, október

sejt működés jovo.notebook March 13, 2018

Kromoszómák, Gének centromer

Lignocellulóz bontó enzimek előállítása és felhasználása

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Dr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai

Bokor Judit PhD. Szerz, cím, megjelenés helye, Szerz, cím, megjelenés helye, Szerz, cím, megjelenés. helye, PUBLIKÁCIÓ. Könyv, idegen nyelv

A kvantitatív PCR alkalmazhatósága a fertőző bronchitis vakcinák hatékonysági vizsgálatában. Derzsy Napok, Sárvár, 2011 Június 2-3.

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.

Összehasonlító környezetmikrobiológiai. Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Az MDR1 gén kromatin szerkezetének tanulmányozása gyógyszerérzékeny és gyógyszerrezisztens humán sejtekben.

A MIKROSZKOPIKUS GOMBÁK, MINT A MÁSODLAGOS

A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei.

Oszvald Mária. A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro és in vivo vizsgálata rizs modell rendszerben

A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA

avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

Oktatói önéletrajz Dr. Droppa Magdolna

Oktatói önéletrajz Dr. Droppa Magdolna

A vas homeosztázis, oxidatív mutagenezis és az antibiotikum rezisztencia evolúciójának kapcsolata

BIOGÉN ELEMEK MÁSODLAGOS BIOGÉN ELEMEK (> 0,005 %)

MIKROKOZMOSZ: MIKROBIOLÓGIAI GYAKORLATOK KIDOLGOZÁSA ÉS INTEGRÁLÁSA A KÖZÉPISKOLAI BIOLÓGIATANÍTÁS MÓDSZERTANÁBA

A citoszolikus NADH mitokondriumba jutása

Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák

Zárójelentés. Gabonafélék stresszadaptációját befolyásoló jelátviteli folyamatok tanulmányozása. (K75584 sz. OTKA pályázat)

A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D.

Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Háziállatokból izolált Histophilus somni törzsek összehasonlító vizsgálata

A Neosartorya fischeri által termelt defenzinszer antifungális protein azonosítása és jellemzése

MTBE degradációja mikrobiális rendszerekben

A Thiocapsa roseopersicina[nife]- hidrogenázainak szerepe a sejt metabolikus folyamataiban

Human genome project

Doktori értekezés tézisei

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

ÖSZTÖNDÍJ BIOLÓGUSHALLGATÓKNAK ÖSZTÖNDÍJ PÁLYÁZATI FELHÍVÁS

DNS-szekvencia meghatározás

AZ AEROSZOL RÉSZECSKÉK HIGROSZKÓPOS TULAJDONSÁGA. Imre Kornélia Kémiai és Környezettudományi Doktori Iskola

Biológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek

Átírás:

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A HMG-KOA REDUKTÁZ FUNKCIONÁLIS VIZSGÁLATA MUCOR CIRCINELLOIDES-BEN NAGY GÁBOR TÉMAVEZETŐ: DR. PAPP TAMÁS EGYETEMI DOCENS BIOLÓGIA DOKTORI ISKOLA SZEGEDI TUDOMÁNYEGYETEM TERMÉSZETTUDOMÁNYI ÉS INFORMATIKAI KAR MIKROBIOLÓGIAI TANSZÉK 2015

BEVEZETÉS A terpének, azaz az izoprén vázas vegyületek, a természetben előforduló egyik legnagyobb és legváltozatosabb vegyületcsoportot alkotják. Részt vesznek a sejtmembrán felépítésében (koleszterin, ergoszterin) és a sejten belüli biokémiai folyamatokban. Lehetnek színanyagok (karotinok), valamint fontos szerephez jutnak a fotoszintézisben és a fotooxidatív védelemben is. Az élő sejtben betöltött fontos szerepük miatt bioszintézisük intenzíven kutatott terület. Ezenkívül a különböző iparágak is nagy mennyiségben hasznosítják őket. A járomspórás gombák (Mucoromycotina) közé tartozó Phycomyces blakesleeanus, Blakeslea trispora és Mucor circinelloides a mikrobiális karotinoid bioszintézis tanulmányozásának modellorganizmusai. Közülük a Phycomyces-ben tanulmányozták legrészletesebben a karotinoidok bioszintézisének szabályozását. A karotinoidok és az egyéb izoprénszármazékok bioszintézisének korai szakasza megegyezik. Ez az úgynevezett mevalonsav bioszintézis útvonal (MEV), mely során az acetil-koenzim A-ból több lépésen keresztül kialakul az öt szénatomos izopentenil-pirofoszfát (IPP), ami a terpének közös építőköve. A mevalonsav bioszintézis útvonal központi lépése a 3-hidroxi-3-metilglutaril koenzim A (HMG-KoA) átalakulása mevalonsavvá, mely lépést a HMG-KoA reduktáz (HmgR) katalizálja. Mivel az enzim a korai izoprén bioszintézis egyik központi lépését határozza meg, így kihatással van az összes terpén termelődésére. A sztatin vegyületek az enzim szelektív gátlószerei. Humán gyógyászatban felhasználják őket a koleszterin szint csökkentésére, de gombaellenes hatásukat is vizsgálják. Az HMG-KoA reduktáz gének száma az egyes élőlényekben eltérő. Az emlősökben általában egy reduktáz gén található, míg növényekben fajtól függően eltérő számban fordulnak elő. A járomspórás gombák genomja általában egy vagy két reduktáz gént kódol, azonban a M. circinelloides genomja 3 ilyen gént tartalmaz (hmgr1, hmgr2 és hmgr3). Munkánk során tisztázni szeretnénk az egyes reduktázok specifikus szerepét a gomba izoprén bioszintézisében. Ezért a dolgozatban ismertetett vizsgálatok során a gének izolálását követően kísérletet tettünk a gének kópiaszámának emelésére és azok csendesítésére, valamint megvizsgáltuk, hogy e módosítások milyen hatással vannak a gombára. A gének kifejeződésének vizsgálatával képet szeretnénk kapni az egyes HMG-KoA reduktázok szabályozásáról és az kifejeződésük esetleges eltéréseiről. Mind gyakorlati, mind pedig elméleti szempontból fontosnak tartottuk megvizsgálni a HMG-KoA reduktáz szerepét a Mucor sejten belüli folyamataiban (morfogenezis, apoptotikus folyamatok és stresszválasz). Ezen ismeretekről kevés információval rendelkezünk, azonban fontosak lehetnek az esetleges biotechnológiai alkalmazások szempontjából. A szabályozó 2

folyamatok feltárása hozzájárulna, hogy az eddigi karotinoid és terpén bioszintézis módosításával kapcsolatos eredmények felhasználásával egy, az iparban is jól használható karotinoid termelő törzset hozzunk létre. Az enzim ergoszterin bioszintézisben betöltött szerepének tisztázása pedig hasznos lehet új, a patogén gombákkal szembeni szerek kifejlesztésében is, valamint a környezethez való alkalmazkodás és a membránszerkezet kialakulásának tanulmányozása területén. 3

CÉLKITŰZÉSEK Mivel a HMG-KoA reduktáz a terpén bioszintézis korai szakaszának központi lépését katalizálja, hatással lehet számos vegyület, többek közt a karotinoidok és az ergoszterin, valamint az ubikinon és egyes fehérjék prenil csoportjainak képződésére. Közvetlenül vagy az említett metabolitok szintézisén keresztül olyan fontos biológiai folyamatokat befolyásolhat, mint a membránszerkezet kialakítása, a különböző környezeti faktorokhoz való alkalmazkodás, a morfogenezis vagy az apoptotikus folyamatok. Mindezeket figyelembe véve fő célunk a karotinoid termelő járomspórás gomba, a M. circinelloides HMG-KoA reduktáz génjeinek azonosítása, funkcionális vizsgálata és az izoprén bioszintézisben betöltött, esetlegesen eltérő szerepük tisztázása. Ennek érdekében a következő konkrét célokat tűztük ki magunk elé: 1. A M. circinelloides HMG-KoA reduktáz génjeinek izolálása és elemzése. 2010-ben fejeződött be a M. circinelloides teljes genomszekvenciájának meghatározása (http://genome.jgi-psf.org/mucci2/mucci2.home.html), mely nagymértékben megkönnyíti az izoprén bioszintézisben szerepet játszó gének azonosítását és jellemzését. Célul tűztük ki egyes rokon fajok hmgr gén szekvenciájának segítségével homológ génszakaszok keresését a M. circinelloides genomban, majd az így talált szekvenciák in silico elemzését. Az így nyert adatok alapján terveztük a legnagyobb homológiát mutató, feltételezett gének izolálását és klónozását is. 2. A hmgr gének kifejeződésének vizsgálata különböző tenyésztési körülmények között. Terveink között szerepelt, hogy valós idejű kvantitatív PCR segítségével megvizsgáljuk az azonosított gének transzkripcióját eltérő környezeti feltételek, illetve tenyésztési körülmények mellett. A vizsgálat során választ kaphatunk arra, melyek azok a specifikus körülmények, amikor a gének átíródása indukálódik és arról, hogy a vizsgált körülmények esetén van-e különbség a három gén kifejeződése között. 3. A hmgr gének kópiaszámának emelése és a gének csendesítése. A gének izolálását követően, olyan vektorkonstrukciók létrehozását terveztük, melyek a gének túlműködtetését és csendesítését teszik lehetővé és így alkalmasak lehetnek a funkció vizsgálatára. A sikeres transzformációt követően megvizsgálhatjuk az egyes reduktáz gének 4

szerepét a sejtek növekedésére, a sztatinokkal szembeni érzékenységre és a termelődő karotinoidok és ergoszterin mennyiségi változására. 4. Az egyes HmgR fehérjék sejten belüli lokalizációja. További terveink között szerepelt az egyes reduktáz fehérjék sejten belüli lokalizációjának vizsgálata. Ennek érdekében olyan vektorkonstrukciók létrehozását terveztük, melyekben az egyes reduktáz fehérjék transzmembrán régióját kódoló génszakaszt zöld fluoreszcens fehérje génjével fuzionáltatjuk. Az endoplazmatikus retikulum és a mitokondrium festését követően vizsgálhatóvá válhat ezen organnelumok és a reduktáz fehérjék esetleges kolokalizációja. ALKALMAZOTT MÓDSZEREK A vizsgálatainkhoz a M. circinelloides f. lusitanicus MS12 jelű törzsét választottuk. DNS és RNS alapú technikák: DNS tisztítása RNS tisztítás, cdns szintézis DNS/RNS gélelektroforézis Polimeráz láncreakció (PCR), valós idejű PCR (qpcr) DNS fragmentumok klónozása, DNS szekvenálás Plazmid konstrukciók létrehozása Baktériumok transzformációja Plazmid DNS tisztítása Northern hibridizáció Nukleotid és aminosav szekvencia adatok elemzése: Nukleotid szekvenciák analízise és összehasonlítása A nukleotid szekvenciákból származtatott aminosav szekvenciák meghatározása és összehasonlítása Gombák genetikai transzformációja: Gombaprotoplasztok képzése Gombaprotoplasztok polietilén-glikol (PEG)-közvetített transzformációja autonóm replikálódó expressziós vektorok alkalmazásával Sztatin érzékenység vizsgálat 5

Analitikai módszerek: Karotinoidok és ergoszterin tisztítása gombából Karotinoid minták analízise spektrofotometriás méréssel Ergoszterin minták analízise nagyhatékonyságú folyadék kromatográfiával (HPLC) Mikroszkópos vizsgálatok: Fény-, fluoreszcens- és konfokális mikroszkóp használata Apoptotikus folyamatok nyomonkövetése GFP fúziós fehérjék vizsgálata Kolokalizációs vizsgálatok Membránfrakció tisztítás EREDMÉNYEK 1. A M. circinelloides HMG-KoA reduktáz génjeinek izolálása és elemzése. A munkánk elején a Phycomyces blakesleeanus és Rhizomucor miehei hmgr génjével kerestünk homológiát mutató szekvenciákat a Mucor genom adatbázisban. Három olyan gént (hmgr1, hmgr2 és hmgr3) azonosítottunk, amelyek nagyfokú hasonlóságot mutattak az ismert gomba hmgr génekkel. A géneket izoláltuk, majd meghatároztuk a cdns szekvenciájukat. A hmgr1 és hmgr2 esetében 5 intront azonosítottunk, míg a hmgr3 esetében csak kettőt. Elemeztük a kódolt fehérjék feltételezett aminosav szekvenciáit is. Mind a három fehérje tartalmazza az I. típusú reduktázokra jellemző két fő domént, a variábilis N-terminális régiót és a konzervált C-terminális régiót, valamint a kettőt összekötő rövid szakaszt. Mindhárom feltételezett fehérjében azonosítottunk a NADPH- és HMG-KoA-kötő motívumokat, valamint szterol érzékelő domént (SSD). Utóbbi felelős a fehérje poszttranszlációs szabályozásáért. A HmgR1 fehérje esetében 6, a HmgR2 esetében 9, míg a HmgR3 esetében 5 transzmembrán hélixet azonosítottunk. 2. A hmgr gének kifejeződésének vizsgálata különböző tenyésztési körülmények között. Valós idejű PCR segítségével vizsgáltuk a három hmgr gén kifejeződését különböző tenyésztési körülmények mellett. A vizsgálatok során azt tapasztaltuk, hogy a hmgr1 transzkripciója aerob, a hmgr3 transzkripciója anaerob körülmény között volt erősebb, míg a hmgr2 mind két esetben erős kifejeződést mutatott. A hmgr1 kifejeződése a hifákban volt jellemző és kifejeződésének maximumát a leoltástól számított 2. napon érte el. Az egyre növekvő hőmérsékletek hatására a kifejeződése folyamatosan csökkent, ezen kívül reagált a sóstresszre is. A hmgr2 és a hmgr3 gének már a csírázó spórákban is aktívak. Szignifikáns 6

hőmérsékletfüggést nem tapasztaltunk a két génnél. Mindkét gén kifejeződését gátolta a maltóz és a nátrium-acetát, mint egyedüli szénforrás. A hmgr2 reagált leginkább a sóstresszre. Eredményeink azt mutatják, hogy a környezeti hatásokra a hmgr2 átíródása változott leginkább. 3. A hmgr gének kópiaszámának emelése és a gének csendesítése. A génekre alapozva olyan vektorkonstrukciókat hoztunk létre, melyek segítségével megemeltük a gének kópiaszámát (png vektorok), illetve csendesítettük (pas vektorok) azokat. A transzformáció során bejuttatott gének és génszakaszok megfelelő kifejeződése érdekében a Mucor gpd promóter és terminális régióját használtuk. A géncsendesítést antiszensz RNS alapú géncsendesítéssel valósítottuk meg. A létrehozott vektorokkal PEGmediált protoplaszt transzformációt hajtottunk végre, majd a transzformáns telepeket izoláltuk. Megvizsgáltuk a transzformánsok növekedését, makro- és mikromorfológiáját, karotin és ergoszterin tartalmát és a sztatinokkal szembeni érzékenységüket. A hmgr1 gén túlműködtetésének és csendesítésének hatására jelentős változást egyik vizsgált körülmény mellett sem tapasztaltunk. A transzformáns telepek mikromorfológiájának vizsgálata során plazmakiáramlásokat tudtunk detektálni, de megváltozott hifákat nem. A gén csendesítésének hatására az izolátumok ergoszterin tartalma kismértékben csökkent a vad típusú törzshöz képest. Apoptózis festést követően mindkét típusú transzfománsban azonosítottunk nekrotikus hifákat és sejteket. A hmgr2 gén túlműködtetésének hatására nőtt a transzformánsok karotin és ergoszterin tartalma, valamint csökkent a sztatinokkal szembeni érzékenységük. A gén csendesítése szintén plazmakiáramlásokhoz vezetett, valamint csökkent az izolátumok ergoszterin tartalma is. Az esetleges apoptotikus folyamatok detektálása során itt is találtunk nekrotikus sejteket és hifarészeket. A legtöbb változást a hmgr3 gén esetében tapasztaltuk. A gén kópiaszámának emelése hatására ezekben a transzformánsokban nőtt leginkább a karotinoid tartalom és csökkent a sztatinokkal szembeni érzékenység. A gén csendesítésének hatására a transzformánsok makromorfológiája szabálytalanná vált, a hifák megduzzadtak, a hifák elágazásainak száma megnőtt és számos plazmakiáramlást azonosítottunk. Az ergoszterin szint és a karotinoid szint jelentősen lecsökkent. Apoptózis festést követően az apoptózis korai fázisát és a nekrózist is ki tudtuk mutatni. A csendesített transzformánsok spóráinak csírázó képessége is megváltozott. 4. Az egyes HmgR fehérjék sejten belüli lokalizációja. A M. circinelloides HMG-KoA reduktázainak sejten belüli lokalizációjának vizsgálatához a reduktázok transzmembrán régióit GFP-vel fuzionáltattuk. A fúziós fehérjék 7

segítségével nyomon tudtuk követni a fehérjék sejten belüli lokalizációját. A létrehozott vektorokkal PEG-mediált protoplaszt transzformációt hajtottunk végre, majd a transzformáns telepeket izoláltuk. A transzformánsok elemzését fluoreszcens mikroszkópiával kezdtük meg, melynek során azt tapasztaltuk, hogy mindhárom fehérje a sejten belül egy nagyméretű organellumban lokalizálódik, illetve a HmgR2 emellett számos kisebb, jól körülhatárolható kompartmentben is megjelent. Ahhoz, hogy a fehérjék pontos lokalizációját meghatározzuk endoplazmatikus retikulum és mitokondrium festést alkalmaztunk, majd a festett mintákat konfokális mikroszkóppal vizsgáltuk. A HmgR2 és a HmgR3 a festéseket követően egyértelmű kolokalizációt mutattak az endoplazmatikus retikulummal, azonban a mitokondriummal nem. EREDMÉNYEK Vizsgálataink során a következő fő hasonlóságokat és különbségeket azonosítottuk a M. circinelloides három hmgr génje között: 1. A hmgr1 gén aerob körülmények között íródik át, csak a hifákban és a spóraképződés időszakában. A gén relatív transzkripciós szintje a hmgr2-nél és hmgr3-nál mért értékekhez viszonyítva igen alacsony, és csak ennél a génnél mutattunk ki hőmérsékletfüggő transzkripciót. Anaerob körülmények között a gén aktivitása jelentősen lecsökken. A gén megváltozott működésének hatására (kópiaszámának emelése, csendesítése) a gomba karotinoid és ergoszterin termelése nem változott, ugyanakkor hatással lehet a citoplazma membrán integritására. A HmgR1 fehérje jellemzően a spórákban és a csíratömlőben jelenik meg és feltehetőleg az endoplazmatikus retikulum membránjába ágyazódik. 2. A hmgr2 gén aerob és anaerob tenyésztési körülmények mellett erős aktivitást mutatott, valamint relatív transzkripciós szintjét összehasonlítva a másik két gén értékeivel megállapítottuk, hogy az anaerob tenyésztést leszámítva e gén a legaktívabb a három reduktáz gén közül. A spórák csírázásának idején és az intenzív micéliumképzés során relatív transzkripciós szintje magas. A növekvő só koncentráció változásával párhuzamosan nőtt a relatív transzkripciós szintje, azonban a szénforrások közül a trehalóz és a maltóz gátolta a kifejeződését. A gén túlműködtetésének hatására a transzformáns törzsek karotinoid és ergoszterin tartalma jelentősen megnőtt, ugyanakkor a sztatinokkal szembeni érzékenysége lecsökkent. Mivel a HMG-KoA reduktáz az ergoszterin bioszintézisben is központi jelentőséggel bír, a HmgR2 8

funkcionális vizsgálata hasznos lehet új, a patogén gombákkal szembeni szerek kifejlesztése és terápiás célpontok megtalálása szempontjából is. Az ergoszterin bioszintézis a gombaellenes terápiák egyik legfontosabb célpontja. Újabban HMG-KoA reduktáz gátlók alkalmazási lehetőségét is intenzíven kutatják (Galgóczy és mtsi. 2011). A gén csendesítésének hatására csökkent a karotinoid és ergoszterin mennyisége, valamint a citoplazma membrán integritásában is zavarok keletkeztek. A HmgR2 fehérje a sejten belül az endoplazmatikus retikulum membránjában helyezkedik el, azonban a konfokális mikroszkópos vizsgálatok nem zárják ki más, kisebb méretű kompartmentekben történő lokalizációját sem. 3. A hmgr3 gén kifejeződését nagyban befolyásolja a környezet oxigéntartalma, ugyanis anaerob körülmények között megnő a gén relatív transzkripciós szintje. A gén terméke fontos a spórák csírázásának idején, valamint a spóraképződés időpontjában. Hőmérsékletfüggést, mint a hmgr1 esetében, vagy szerepet az ozmotikusan megváltozott környezethez való adaptálódáshoz, mint a hmgr2 esetében, nem találtunk. Leginkább e gén terméke befolyásolta a termelődő karotinoid mennyiséget és az ergoszterin bioszintézisre is hatással volt. A gén csendesítése csökkentette leginkább a termelődő ergoszterin tartalmat. A hmgr3 és a hmgr2 felhasználható a karotinoid bioszintézis fokozására és esetleg egy, az iparban is alkalmazható karotinoid termelő törzs létrehozására. A gén csendesítésének hatására a termelődő karotinoid mennyiség jelentősen lecsökkent, a gomba makro- és mikromorfológiája megváltozott, valamint apoptotikus folyamatok játszódtak le a sejtekben. A spórák elvesztették csírázóképességüket és a csírázás ideje jelentősen kitolódott. A járomspórás gombákban lezajló apoptotikus folyamatokról igen keveset tudunk, emiatt a gén kiváló célpontja lehet az ezirányú kutatásoknak. 9

A DOLGOZAT ALAPJÁT KÉPZŐ KÖZLEMÉNYEK Referált folyóiratokban megjelent publikációk Nagy G., Imre G., Csernetics Á., Petkovits T., Nagy G.L., Szekeres A., Vágvölgyi Cs., Papp, T. (2011) A prenyl pyrophosphate synthase gene from the zygomycete fungus, Gilbertella persicaria. Acta Biol. Szeged. 55 (1): 7-12. Nagy G., Csernetics Á., Bencsik O., Szekeres A., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2012) Carotenoid composition of Mucorales fungi. Afr. J. Microbiol. Res. 6: 7265-7270. Papp T., Csernetics Á., Nagy G., Bencsik O., Itturiaga E.A., Eslava A.P., Vágvölgyi Cs. (2013) Canthaxanthin production with modified Mucor circinelloides strains. Appl. Microbiol. Biot. 97: 4937-4950. IF: 3,811 Nagy G., Farkas A., Csernetics Á., Bencsik O., Szekeres A., Nyilasi I., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2014) Transcription of the three HMG-CoA reductase genes of Mucor circinelloides. BMC Microbiol. 14(93): 10. IF: 2,976 A dolgozat témájához kapcsolódó konferencia összefoglalók Nagy G., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2009) Cloning and characterization of three HMG-CoA reductase genes in Mucor circinelloides. Acta. Microbiol. Hung. 56: 210. Nagy G., Farkas A., Imre G., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2011) HMG-CoA reductase genes of the carotenoid producing fungus, Mucor circinelloides. Acta. Microbiol. Immunol. Hung. 58: 190. Papp T., Csernetics Á., Nagy G., Farkas A., Vágvölgyi Cs. (2012) Modification of the acetatemevalonate pathway in the beta-carotene producing fungus, Mucor circinelloides 15th European Congress on Biotechnology Istanbul, Turkey New Biotechnol. 29(S): 214-215. Nagy G., Csernetics Á., Imre G., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2010) Characterization of HMG- CoA reductase genes in Mucor circinelloides. 11th International Symposium "Interdisciplinary Regional Research ISIRR, Szeged, Hungary, Abstracts CD 101. Nagy G., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp, T. (2010) HMG-CoA reductase genes of Mucor circinelloides. CESC-2010, Szeged, Hungary, Abstracts p. 66. Nagy G., Csernetics Á., Imre G., Farkas A., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2011) Characterization of HMG-CoA reductase genes of the carotenoid producing Mucor circinelloides. 2nd CEFSER, Novi Sad, Abstract p. 54. Nagy G., Farkas A., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2012) Functional characterization of three HMG-CoA reductase genes int he beta-carotene producing Mucor circinelloides. 11 th ECFG, Marburg, Germany, Abstract p. 97. 10

Nagy G., Farkas A., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2012) Differences in expression and function among three HMG-CoA reductase genes of Mucor circinelloides. 5th Hungarian Mycologiacal Conference Budapest, Hungary, Abstract p. 39. Nagy G., Farkas A., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2012) What is the role of HMG- CoA reductase genes in the carotene producer Mucor circinelloide? A Magyar Mikrobiológiai Társaság 2012. Nagygyűlése Keszthely, Hungary, Abstract pp. 31-32. Nagy G., Krizsán K., Petkovics T., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2012) Molecular identification and susceptability to antifungal agents of clinically important Bipolaris strains. 3rd Central European Summer Course on Mycology: Biology of pathogenic fungi, Szeged, Hungary. Abstract p. 84. Papp T., Nagy G., Farkas A., Páll O., Csernetics Á., Vágvölgyi, Cs. (2013) Functional charcterization of HMG-CoA reductase genes in Mucor circinelloides. Emerging Zygomycetes, a new problem in the clinical lab, Utrecht, The Netherland, Abstract pp. 31. Nagy G., Farkas A., Páll O., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2013) Silencing of HMG- CoA reductase genes with antisense RNA in Mucor circinelloides. 5th Congress of European Microbiologist, FEMS-2013, Leipzig, Germany, Abstract 1263. pdf Nagy G., Farkas A., Páll O., Csernetics Á., Bencsik O., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2013) Effects of HMG-CoA reductase on carotenoid and ergosterol biosynthesis and morphology in Mucor circinelloides. Power of Microbes in Industry and Environment 2013, Primosten, Croatia, Abstract pp. 70. Papp T., Nagy G., Farkas A., Páll O., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs. (2013) Functional characterization of HMG-CoA reductase genes in Mucor circinelloides. Emerging Zygomycetes, a new problem in the clinical lab: A workshop of the ECMM/ISHAM Working Group on Zygomycetes p. 31. Nagy G., Páll O., Farkas A., Csernetics Á., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2014) Function and subcellular localization of Mucor circinelloides HMG-CoA reductase 2 and 3. 12th European Conference on Fungal Genetics (ECFG12) p. 358. 11

Egyéb referált folyóiratban megjelent közlemények Papp T., Nagy G., Csernetics Á., Szekeres A., Vágvölgyi, Cs. (2009) Beta-carotene production by Mucoralean fungi. J. Eng. Ann. Fac. Eng. Huned. 7: 173-176. Csernetics Á., Nagy G., Iturriaga E.A.,Szekeres A., Eslava A.P., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2011) Expression of three isoprenoid biosynthesis genes and their effects on the carotenoid production of the zygomycetes Mucor circinelloides. Fung. Genet. Biol. 48: 696-703. IF: 3,737 Csernetics Á., Tóth E., Farkas A., Nagy G., Bencsik O., Manikandan P., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2014) Expression of a bacterial β-carotene hydroxylase in canthaxanthin producing mutant Mucor circinelloides strains. Acta Biol. Szeged. 58(2): 139-146. Csernetics Á., Tóth E., Farkas A., Nagy G., Bencsik O., Vágvölgyi Cs., Papp T. (2015) Expression of Xanthophyllomyces dendrorhous cytochrome-p450 hydroxylase and reductase in Mucor circinelloides. W. J. Microbi. Biotech. 31(2): 321-336. IF: 1,353 ÖSSZESÍTETT IMPAKT FAKTOR: 11,877 12