Számítógépek és modellezés a kémiai kutatásokban

Hasonló dokumentumok
Jedlovszky Pál Eszterházy Károly Egyetem, Kémiai és Élelmiszerkémiai Tanszék Tanszék, 3300 Eger, Leányka utca 6

Számítógépes szimulációs módszerek kolloidkémiai alkalmazásai

Kolloidkémia 5. előadás Határfelületi jelenségek II. Folyadék-folyadék, szilárd-folyadék határfelületek. Szőri Milán: Kolloidkémia

Számítógépes szimulációk: molekuláris dinamika és Monte Carlo

Monte Carlo módszerek a statisztikus fizikában. Az Ising modell. 8. előadás

Molekuláris dinamika I. 10. előadás

Kémiai reakciók mechanizmusa számítógépes szimulációval

Az anyagi rendszer fogalma, csoportosítása

Víz. Az élő anyag szerkezeti egységei. A vízmolekula szerkezete. Olyan mindennapi, hogy fel sem tűnik, milyen különleges

Altalános Kémia BMEVESAA101 tavasz 2008

Hidrosztatika, Hidrodinamika

Molekuláris dinamika. 10. előadás

Allotróp módosulatok

Határfelületi jelenségek: felületi feszültség koncepció

Kvantumszimulátorok. Szirmai Gergely MTA SZFKI. Graphics: Harald Ritsch / Rainer Blatt, IQOQI

Atomok. szilárd. elsődleges kölcsönhatás. kovalens ionos fémes. gázok, folyadékok, szilárd anyagok. ionos fémek vegyületek ötvözetek

Fázisátalakulások. A víz fázisai. A nem közönséges (II-VIII) jég kristálymódosulatok csak több ezer bar nyomáson jelentkeznek.

MOLEKULÁRIS FOLYADÉKOK SZERKEZETÉNEK VIZSGÁLATA DIFFRAKCIÓS MÓDSZEREKKEL ÉS SZÁMÍTÓGÉPES SZIMULÁCIÓVAL. PhD tézisfüzet

Energia. Energia: munkavégző, vagy hőközlő képesség. Kinetikus energia: a mozgási energia

Minta feladatsor. Az ion neve. Az ion képlete O 4. Szulfátion O 3. Alumíniumion S 2 CHH 3 COO. Króm(III)ion

Vezetők elektrosztatikus térben

Határfelületi jelenségek: szétterülés és nedvesítés

HIDROSZTATIKA, HIDRODINAMIKA

Transzportjelenségek

A kolloidika alapjai. 4. Fluid határfelületek

Gőz-folyadék egyensúly

Az atom- olvasni. 1. ábra Az atom felépítése 1. Az atomot felépítő elemi részecskék. Proton, Jele: (p+) Neutron, Jele: (n o )

Atomok. szilárd. elsődleges kölcsönhatás. kovalens ionos fémes. gázok, folyadékok, szilárd anyagok. ionos fémek vegyületek ötvözetek

Többkomponensű rendszerek. Diszperz rendszerek. Kolloid rendszerek tulajdonságai. Folytonos közegben eloszlatott részecskék - diszperz rendszerek

Mivel foglalkozik a hőtan?

Az egyensúly. Általános Kémia: Az egyensúly Slide 1 of 27

Légköri termodinamika

A gáz halmazállapot. A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011

AZ ANYAGI HALMAZOK ÉS A MÁSODLAGOS KÖTÉSEK. Rausch Péter kémia-környezettan

Folyadékok és szilárd anyagok

Energia. Energiamegmaradás törvénye: Energia: munkavégző, vagy hőközlő képesség. Az energia nem keletkezik, nem is szűnik meg, csak átalakul.

Kolloidkémia 1. előadás Első- és másodrendű kémiai kötések és szerepük a kolloid rendszerek kialakulásában. Szőri Milán: Kolloidkémia

Folyadékok és gázok mechanikája

5. Állapotegyenletek : Az ideális gáz állapotegyenlet és a van der Waals állapotegyenlet

Biofizika szeminárium. Diffúzió, ozmózis

Atomszerkezet. Atommag protonok, neutronok + elektronok. atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Technikai áttekintés SimDay H. Tóth Zsolt FEA üzletág igazgató

Dimenzióváltás becsapódásos fragmentációban

rugós erőmérő parafa dugó kapilláris csövek drótkeret cérnaszállal műanyag pohár víz, mosogatószer

Modern Fizika Labor. 2. Elemi töltés meghatározása

Gázok. 5-7 Kinetikus gázelmélet 5-8 Reális gázok (korlátok) Fókusz: a légzsák (Air-Bag Systems) kémiája

ZERVES ALAPANYAGOK ISMERETE, DISZPERZ RENDSZEREK KÉSZÍTÉSE

Az α értékének változtatásakor tanulmányozzuk az y-x görbe alakját. 2 ahol K=10

Az élethez szükséges elemek

Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése

Hőtágulás - szilárd és folyékony anyagoknál

Az elektromos kettősréteg. Az elektromos potenciálkülönbség eredete, értéke és az azt befolyásoló tényezők. Kolloidok stabilitása.

Előszó.. Bevezetés. 1. A fizikai megismerés alapjai Tér is idő. Hosszúság- és időmérés.

Diffúzió 2003 március 28

1. előadás. Gáztörvények. Fizika Biofizika I. 2015/2016. Kapcsolódó irodalom:

Orvosi Fizika 10. Biológiai membránok fizikája, diffúzió, ozmózis Dr. Nagy László

Számítástudományi Tanszék Eszterházy Károly Főiskola.

Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

1. feladat Összesen: 8 pont. 2. feladat Összesen: 11 pont. 3. feladat Összesen: 7 pont. 4. feladat Összesen: 14 pont

Kötések kialakítása - oktett elmélet

Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások Definíciók

Anyagismeret 2016/17. Diffúzió. Dr. Mészáros István Diffúzió

Diffúzió. Diffúzió. Diffúzió. Különféle anyagi részecskék anyagon belüli helyváltoztatása Az anyag lehet gáznemű, folyékony vagy szilárd

Fluidum-kőzet kölcsönhatás: megváltozik a kőzet és a fluidum összetétele és új egyensúlyi ásványparagenezis jön létre Székyné Fux V k álimetaszo

Projektfeladatok 2014, tavaszi félév

A szilárd testek alakja és térfogata észrevehetően csak nagy erő hatására változik meg. A testekben a részecskék egymáshoz közel vannak, kristályos

Szedimentáció, elektroforézis. Biofizika előadás Talián Csaba Gábor

A kémiai és az elektrokémiai potenciál

Monte Carlo módszerek a statisztikus fizikában. Az Ising modell. 8. előadás

FIZIKA. Ma igazán belemelegszünk! (hőtan) Dr. Seres István

7. osztály 2 Hevesy verseny, megyei forduló, 2004.

Hidrosztatika, Hidrodinamika

Zárthelyi dolgozat I. /A.

Jegyzet. Kémia, BMEVEAAAMM1 Műszaki menedzser hallgatók számára Dr Csonka Gábor, egyetemi tanár Dr Madarász János, egyetemi docens.

FELÜLETI FESZÜLTSÉG. Jelenség: A folyadék szabad felszíne másképp viselkedik, mint a folyadék belseje.

DINAMIKA ALAPJAI. Tömeg és az erő

Határfelületi reológia vizsgálata cseppalak analízissel

Az egyensúly. Általános Kémia: Az egyensúly Slide 1 of 27

Anyagtudomány BMEGEMTMK02, 4 krp (2+0+1/v)

KÉMIA ÍRÁSBELI ÉRETTSÉGI- FELVÉTELI FELADATOK 2002

KÉMIA ÍRÁSBELI ÉRETTSÉGI- FELVÉTELI FELADATOK 1995 JAVÍTÁSI ÚTMUTATÓ

6. Oldatok felületi feszültségének meghatározása. Előkészítő előadás

Rendezetlen kondenzált fázisok tulajdonságainak vizsgálata számítógépes szimulációs módszerekkel

Hevesy György Országos Kémiaverseny Kerületi forduló február évfolyam

Biológiai membránok fizikája, diffúzió, ozmózis Dr. Nagy László

Hőtan ( első rész ) Hőmérséklet, szilárd tárgyak és folyadékok hőtágulása, gázok állapotjelzői

5. gy. VIZES OLDATOK VISZKOZITÁSÁNAK MÉRÉSE OSTWALD-FENSKE-FÉLE VISZKOZIMÉTERREL

Részecske azonosítás kísérleti módszerei

Modellszámításokkal kapcsolatos kutatások bemutatása

Pelletek térfogatának meghatározása Bayes-i analízissel

Elektronegativitás. Elektronegativitás

Fizikai kémia 2. Előzmények. A Lewis-féle kötéselmélet A VB- és az MO-elmélet, a H 2+ molekulaion

A MODELLALKOTÁS ELVEI ÉS MÓDSZEREI

Radioaktív nyomjelzés

PHYWE Fizikai kémia és az anyagok tulajdonságai

Reakciókinetika. Általános Kémia, kinetika Dia: 1 /53

A diffúzió leírása az anyagmennyiség időbeli változásával A diffúzió leírása a koncentráció térbeli változásával

NEDVESEDÉS (KONTAKT NEDVESEDÉS TANULMÁNYOZÁSA TENZIDOLDATOKKAL)

SEMMELWEIS EGYETEM. Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet, Nanokémiai Kutatócsoport. Zrínyi Miklós

Átírás:

Számítógépek és modellezés a kémiai kutatásokban Jedlovszky Pál Határfelületek és nanorendszerek laboratóriuma Alkímia ma 214 április 3.

VALÓDI RENDSZEREK MODELL- ALKOTÁS MODELL- RENDSZEREK KÍSÉRLETEK VÉGZÉSE ELMÉLETI KÖZELÍTÉSEK KÍSÉRLETI EREDMÉNYEK ÖSSZEHASONLÍTÁS ELMÉLETI JÓSLATOK AZ ELMÉLET ÉS A MODELL TESZTJE

VALÓDI RENDSZEREK MODELL- ALKOTÁS MODELL- RENDSZEREK KÍSÉRLETEK VÉGZÉSE SZÁMÍTÓGÉPES SZIMULÁCIÓK ELMÉLETI KÖZELÍTÉSEK KÍSÉRLETI EREDMÉNYEK EGZAKT EREDMÉNYEK A MODELLRE ELMÉLETI JÓSLATOK ÖSSZEHASONLÍTÁS ÖSSZEHASONLÍTÁS A MODELL TESZTJE AZ ELMÉLET TESZTJE

Számítógépes szimulációk Atomi szintű betekintést nyújtanak a vizsgált rendszer alkalmasan választott modelljének szerkezetébe és dinamikájába - Sokkal részletesebb információt szolgáltatnak, mint bármilyen kísérleti módszer -Ez az információ azonban csak a modellre vonatkozik, a modell érvényességét kísérleti adatokkal való összehasonlításokkal igazolni kell Kísérlet, elmélet és szimuláció egymást támogatja az anyagszerkezeti kutatásokban

Számítógépes szimulációk Molekuláris dinamika Monte Carlo

Számítógépes szimulációk molekuláris dinamika - a molekulák egymással való kölcsönhatásának energiáját (U) számítja - innen a molekulákra ható erő (F) számítható F = -grad U - Newton második törvénye alapján a molekulák gyorsulása (a) számítható a = F/m - a molekulák t = t beli helyének és sebességének valamint a gyorsulásának ismeretében a t = t + t beli hely és sebesség számítható 1 4-1 6 részecske t 2 fs teljes szimulált idő 1-1 ns

Számítógépes szimulációk Monte Carlo - a molekulák egymással való kölcsönhatásának energiáját (U) számítja - véletlen mozdításokat végez - a véletlen mozdításokat adott valószínűséggel fogadja el ez a valószínűség kapcsolja a véletlen mozgatásokat a valódi fizikai rendszerhez -ha a véletlem mozdítást elfogadtuk, az új, ha nem, a régi konfigurációból folytatódik a szimuláció Alapmódszer (ha a rendszer térfogata, hőmérséklete és térfogata állandó): (Metropolis, Rosenbluth, Rosenbluth, Teller, Teller, 1953) ha a rendszer teljes U potenciális energiája csökkent a mozdítás során elfogadjuk ha nem, P = exp(- U/k B T) valószínűséggel 1 - exp(- U/k B T) valószínűséggel elfogadjuk elvetjük

Első példa A víz sűrűségmaximumának magyarázata ρ/g cm -3 1.2 1..98 1 bar.96 265 27 275 28 285 29 295 268 K 283 K T/K - a modell sűrűsége is maximumon megy át - keressünk azonos sűrűségű pontokat a maximum két oldalán - nézzük meg, miben különbözik a szerkezet az azonos sűrűségű pontokban - az egyes tulajdonságok különbségét számítjuk a két pontban

f(i) az éppen i hidrogénhídkötéses szomszéddal rendelkező vízmolekulák aránya f(i) ennek a különbsége a magas és alacsony hőmérsékletű állapotokban

f(i) az éppen i hidrogénhídkötéses szomszéddal rendelkező vízmolekulák aránya f(i) ennek a különbsége a magas és alacsony hőmérsékletű állapotokban - a víz tetraéderes kristályszerkezete (geometriailag) nem jelent szoros pakolást - tetraéderes hálóban a molekuláknak 4 szomszédjuk van - a hőmérséklet növelésének két szerkezeti hatása van: erősebb hőmozgás (szokásos) térfogatot növeli, sűrűséget csökkenti tetraéderes szerkezet szétzilálása a kiszakadt molekulák a háló üregeibe bújnak be (anomális) térfogatot csökkenti, sűrűséget növeli Sűrűségmaximum a két ellentétes hatás eredője

Második példa Folyadékok határfelületének vizsgálata Probléma: ha a rendszert molekuláris felbontásban látjuk, a felület fogalma nem triviális Makroszkopikusan Molekuláris felbontásban 2D Időben állandó Kapilláris hullám effektus 3D Időben változó

gőzfázis folyadékfázis gőzfázis Sűrűségprofil: felületi régió.9 ρ bulk.1 ρ bulk d surf d surf

gőzfázis folyadékfázis gőzfázis

gőzfázis folyadékfázis gőzfázis Dolgozzunk ki egy módszert amivel egyértelműen kiválaszthatjuk a felületi molekulákat, és lehetővé teszi a határfelület szerkezetének vizsgálatát.

Próbagolyót ejtünk a felületre, arra merőleges tesztvonalak mentén amelyik molekulán megakad a próbagolyó, az felületi Tömbfázis

Próbagolyót ejtünk a felületre, arra merőleges tesztvonalak mentén amelyik molekulán megakad a próbagolyó, az felületi Tömbfázis

Próbagolyót ejtünk a felületre, arra merőleges tesztvonalak mentén amelyik molekulán megakad a próbagolyó, az felületi Tömbfázis

A próbagolyó sugara szabad paraméter! 3 3 3 25 25 25 X axis 2 15 1 5 4 3 Z axis 2 1 5 4 3 2 1 Y axis X axis 2 15 1 5 4 3 Z axis 2 1 1 5 4 3 2 Y axis X axis 2 15 1 5 4 3 Z axis 2 1 5 4 3 2 1 Y axis ésszerű választás: a próbagolyó mérete a molekulák méretének tartományába essen

Az első rétegbelinek talált molekulák eltávolításával és az eljárás megismétlésével a második (harmadik, stb.) réteg molekulái is azonosíthatók gőzfázis folyadékfázis vízmolekulák első két rétege víz-gőz határfelületnél

A módszer folyadék-folyadék határfelületre is alkalmazható víz- és CCl 4 molekulák első két rétege víz-ccl 4 határfelületnél

Feldúsulás a felületen metanol és acetonitril vizes oldata másképp viselkedik 1. 1. methanol mole fraction at the surface layers.8.6.4.2 surface layer second layer Acetonitrile mole fraction in separate layers of the surface.8.6.4.2 surface layer second layer third layer...2.4.6.8 1....5.1.15.2 Overall acetonitrile mole fraction in the bulk phase methanol mole fraction in the bulk phase a fenti eredményeket azóta kísérletileg igazolták

Vízmolekulák orientációja apoláros fázissal alkotott határfelületen "dombok" "völgyek" a felület lokális görbülete kulcsfontosságú: analógia kis apoláros oldott molekulák hidrátburkában fellépő orientációs preferenciákkal

Molekulák orientációja víz-metanol elegy apoláros fázissal alkotott határfelületén

Harmadik példa Felületaktív anyagok megkötődése víz felületén Felületaktív anyagok (amfifilek): poláros és apoláros csoporttal egyaránt rendelkeznek, ezért poláros és apoláros fázisok határfelületén nagyon erősen feldúsulnak

tiszta víz.1 M NaDS.2 M NaDS.3 M NaDS.4 M NaDS

Harmadik példa Felületaktív anyagok megkötődése víz felületén Felületaktív anyagok (amfifilek): poláros és apoláros csoporttal egyaránt rendelkeznek, ezért poláros és apoláros fázisok határfelületén nagyon erősen feldúsulnak Nátrium dodecil szulfát (NaDS) Polietilén-oxid (PEO) A fenti két molekula közül a NaDS kötődik erősebben a víz felületén, képes onnan a PEO-t leszorítani Kérdés: hogyan kötődik meg a víz felületén a PEO, és hogyan szorítja le onnan a NaDS

1 8 6 4 2 (a) ha a felületen csak PEO van bulk liquid phase interface vapor phase folyadékfázis határfelület gőzfázis Percentage of PEO monomer units PEO monomer egységek százalékban

Percentage of PEO monomer units 1 8 6 4 2 (a) ha a felületen csak PEO van bulk liquid phase interface vapor phase - a PEO lánc nem a felületen fekszik, csak néhány monomer egység horgonyzik le a felületen, a lánc többi része belóg a folyadékfázisba - rövid hurkok a gőzfázisba is belógnak

(b) ha a felületen PEO és NaDS is van 1 5 µmol/m 2 PEO monomer Percentage of egységek PEO monomer százalékban units 1 µmol/m 2 5 5 2 µmol/m 2 5 3 µmol/m 2 5 4 µmol/m 2 5 5 µmol/m 2 5 6 µmol/m 2 aqueous phase interface apolar phase folyadékfázis határfelület gőzfázis

(b) ha a felületen PEO és NaDS is van 1 Percentage of PEO monomer units 5 5 5 5 5 µmol/m 2 1 µmol/m 2 2 µmol/m 2 3 µmol/m 2 4 µmol/m 2 5 5 µmol/m 2 2 µmol/m 2 5 6 µmol/m 2 aqueous phase interface apolar phase 3 µmol/m 2 - kis mennyiségű NaDS odavonzza a felületre a PEO láncokat, velük micellaszerű komplexeket alkot (az apoláros molekularészeket a víz felől körülveszik a poláros csoportok)

(b) ha a felületen PEO és NaDS is van 1 5 µmol/m 2 Percentage of PEO monomer units 5 5 5 5 1 µmol/m 2 2 µmol/m 2 3 µmol/m 2 4 µmol/m 2 2 µmol/m 2 3 µmol/m 2 5 5 µmol/m 2 5 6 µmol/m 2 aqueous phase interface apolar phase 2 µmol/m 2 - kis mennyiségű NaDS odavonzza a felületre a PEO láncokat, velük micellaszerű komplexeket alkot (az apoláros molekularészeket a víz felől körülveszik a poláros csoportok) 4 µmol/m 2 - nagy mennyiségű NaDS már nem fér el a felületen a PEO láncok mellett, ezért leszorítja, belöki a vízbe azokat 6 µmol/m 2

Köszönöm a figyelmüket!