A HSP90 NUKLEOTIDKÖTÉSÉNEK VIZSGÁLATA
|
|
- Erika Pintér
- 9 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 Semmelweis Egyetem, Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola Pathobiokémia Program Doktori (Ph.D.) értekezés A HSP90 NUKLEOTIDKÖTÉSÉNEK VIZSGÁLATA Dr. Sőti Csaba Témavezető: Dr. Csermely Péter egyetemi tanár Semmelweis Egyetem Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet Budapest 2002
2 ÖSSZEFOGLALÁS A 90 kda molekulatömegű stresszfehérje (Hsp90) az eukarióta sejt esszenciális dajkafehérjéje. N-terminális ATP-kötő és C-terminális dimerizációs doménjét egy töltött aminosavakban gazdag régió köti össze. Chaperon hatása nélkülözhetetlen a labilis szerkezetű fehérjék felgombolyodásához, stabilizálásához. Az ún. kliensfehérjék a jelátviteli folyamatok kulcsmolekulái (p53, src, Raf, telomeráz), így a Hsp90 funkciójának csökkenése fontos szerepet játszhat az epigenetikus evolúcióban, a civilizációs betegségek elterjedésében, farmakológiás gátlása pedig a daganatellenes terápiában. A Hsp90 funkcióját kismolekulák szabályozzák. A chaperon ciklust a fehérje ATPkötése és ATPáz aktivitása működteti. Az N-terminális ATP-antagonista geldanamycin, illetve az ismeretlen szerkezetű endogén stabilizátorok az ATP-ciklust különböző stádiumokban befagyasztják, a kliens aktivációját meggátolják. A Hsp90 kismolekulákkal kialakított kölcsönhatásainak tanulmányozása által képet kaphatunk egy ismeretlen, esszenciális funkció molekuláris alapjairól, valamint olyan gyógyszerekhez juthatunk, melyekkel korunk népbetegségeit, így keringési és degeneratív betegségeket, többek között daganatokat gyógyíthatunk. A Hsp90 endogén stabilizátorait modellező átmenetifém-anionokkal, illetve nukleotidokkal kialakított kölcsönhatását vizsgáló kísérleteink legfontosabb eredményei az alábbiakban foglalhatók össze: 1., Kimutattuk a Hsp90 kölcsönhatását különféle különböző vanadát-oligoanionokkal, illletve permolibdáttal. A permolibdát kötésében részt vevő régiót a Hsp90 középső doménjére lokalizáltuk. 2., Igazoltuk, hogy a Hsp90 rendelkezik egy második, középső-c-terminális doménen elhelyezkedő ATP-kötőhellyel, mely ciszplatinnal specifikusan gátolható. Azonosítottunk egy új N-terminális -foszfátkötő motívumot, és ennek közelében találtunk rá a C-terminális foszfát-kötő szakaszokra. 3., Eredményeink szerint a Hsp90 töltött régiója egy nukleotid-függő molekuláris kapcsoló, mely csak az N-terminális ATP kötése után teszi lehetővé a C-terminális ATPkötést. A két domén oda-vissza irányuló, szétkapcsolható kölcsönhatásban van. 4., Kísérleteink először mutatták ki a ciszplatin különböző Hsp90-komplexekre kifejtett hatását, így elsőként szolgálnak funkcionális bizonyítékkal az N- és C-terminális ATPkötőhely eltérő biológiai szerepéről. Ciszplatin nem befolyásolta a Hsp90 N-terminális (p23-) komplexének kialakulását, de stabilizálta a C-terminális (Hsp70-) komplexet. A Hsp90-függő kliensfehérjék közül nem hatott az Lck és Raf-1 aktiválódására, ezzel szemben gátolta a luciferáz felgombolyodását. Eredményeink alapján a ciszplatin újabb eszköze lehet a Hsp90 működés modulálásának, és specifikusabb származékaiból második generációs Hsp90- inhibitorok, ígéretes daganatellenes szerek vagy egyéb gyógyszerek válhatnak, melyek segítséget nyújthatnak a C-terminális nukleotid-kötőhely biológiai szerepének felderítésében. i
3 SUMMARY The 90 kda heat shock protein (Hsp90) is an essential molecular chaperone of eukaryotic cells. It is composed of a non-canonical N-terminal ATP-binding domain and a C- terminal dimerization domain, connected by a highly charged region. Hsp90, as central part of a multiprotein complex, the foldosome chaperones a wide variety of inherently unstable clients, mostly represented by key signalling molecules, such as p53, src, Raf, telomerase, or even mutant proteins. A decrease in Hsp90 function may lead to sudden epigenetic evolutionary changes, epidemic appearance of civilizational diseases. Pharmacological inhibition of Hsp90 is an emerging strategy in antitumor therapy. Hsp90 function is modulated by low molecular weight compounds. The chaperone cycle is driven by its ATP-binding and ATPase activity, while the N-terminal ATP-antagonist geldanamycin and hitherto unidentified endogenous cytosolic stabilizers freeze Hsp90 at different stages of the cycle, abolishing client protein activation. Studying these interactions provides a detailed view on the molecular mechanism of Hsp90 action as well as promotes the development of new drugs effective against age-related degenerative disorders, such as diabetes, cardiovascular diseases and cancer. We set out to study the interaction of Hsp90 with nucleotides and with transition state metal oxyanions, model compounds for the endogenous stabilizers. Our major findings are summarized as follows. 1., We could demonstrate a direct binding of different vanadate oligoanions and permolybdate to Hsp90. The permolybdate-binding region is mapped to the middle domain of Hsp90. 2., We showed that Hsp90 possesses a second, C-terminal ATP-binding site. Cisplatin is a specific inhibitor of the C-terminal nucleotide-binding domain. We identified a novel N- terminal -phosphate-binding motif in the middle domain in close proximity or overlapping with the C-terminal phosphate-binding sites. 3., The charged region is a nucleotide-dependent molecular switch, which liberates the C-terminal nucleotide-binding domain upon N-terminal ATP-binding. The nucleotide-binding domains have an intricate allosteric communication that can be uncoupled. 4., Using geldanamycin, novobiocin and cisplatin we presented functional evidence on the divergent biological roles of the N- and C-terminal nucleotide-binding sites, respectively. Cisplatin did not affect N-terminal (p23-) complex formation in vitro, while stabilized the C- terminal Hsp90-Hsp70 complex in vivo. Lck and Raf-1 activation in T-cells was not abrogated by cisplatin, however, luciferase refolding was potently inhibited in reticulocyte lysate. Our data suggest that cisplatin may be a novel tool to manipulate Hsp90 function, facilitating the design of second generation Hsp90-inhibitors. The specific compounds may be promising drug-candidates, and may contribute to elucidate the importance of the C-terminal nucleotidebinding domain in a number of (patho)physiological processes. ii
4 TARTALOMJEGYZÉK 1. Bevezetés Irodalmi áttekintés A dajkafehérjék: életbiztosítás sejtszinten A 90 kda molekulatömegű dajkafehérje család A Hsp90 gén és kifejeződése A Hsp90 általános szerkezeti vonásai A Hsp90 domén-szerkezete A Hsp90 poszttranszlációs módosulása A Hsp90 fő immunogén régiói A Hsp90 doménjeinek elrendeződése Intramolekuláris kölcsönhatás és chaperon funkció Intermolekuláris kölcsönhatások a Hsp90-dimerben Feltételezhető domén-domén kölcsönhatások A Hsp90 doménjeinek finomszerkezete Az N-terminális ATP-kötő domén A GHKL fehérje család Az ATP-kötés szerkezeti alapjai A Hsp90 ATPáz aktivitása A C-terminális régió hatása az ATPáz aktivitásra Az ATP-függő molekuláris fogó A GHKL-domén specifikus gátlószerei A töltött régió A töltött régió autonóm szerkezete A töltött régió indukált szerkezete működésének fontos tényezője lehet A töltött régió kalcium kötése A töltött régió foszforilációja A töltött régió szerepe a Hsp90 chaperon működésében A töltött régió szerepe a Hsp90 sejten belüli elhelyezkedésében A középső és a C-terminális domén A Hsp90 által kialakított kölcsönhatások A Hsp90 kölcsönhatásai kismolekulákkal A középső-c-terminális domén kötőhelyei Taxol kötés az N-terminálison A Hsp90 kölcsönhatásai makromolekulákkal Az N-terminális domén A töltött régió A középső-c-terminális domén A Hsp90 oligomerizációja, avagy kölcsönhatások önmagával A Hsp90 oligomerek előfordulása Az oligomerizáció szerkezeti alapjai iii
5 A Hsp90 elektronmikroszkópos képe ahogy én láttam A fánkok a natív Hsp90 homo-oligomerjei Az oligomerek vizsgálata egyéb módszerekkel Az oligomer forma és a mikrotrabekuláris hálózat Stressz és oligomerizáció A Hsp90 biológiai szerepe A Hsp90 passzív chaperon működése A passzív chaperon szerep teret nyer a törzsfejlődés során A Hsp90 chaperon kötőhelyei A passzív chaperon aktivitás jelentősége A Hsp90 aktív chaperon működése Kiket? Mit? Kikkel? Miért? A Hsp90 ezoterikus sajátosságai Célkitűzések Vizsgálati módszerek Általános megfontolások Anyagok A Hsp90 aminosav sorrendje ATP-regenerációs rendszer Biokémiai, in vitro módszerek A Hsp90 fehérjék eredete, kifejezése, tisztítása Különböző tagszámú vanadát oligoanionok előállítása A Hsp90 permolibdát-módosításának vizsgálata A Hsp90 triptikus emésztése A Hsp90 [ - 32 P]ATP-kötésének vizsgálata natív gélen A Hsp90 fotoaffinitás jelölése [ - 32 P]ATP-vel foszfát-kapcsolt ATP-Sepharose gyanta kötés Oxidatív nukleotid-affinitáshasítás Hsp90-ATP nitrocellulóz filter kötés A Hsp90-p23 komplex in vitro összeépítése Hődenaturált luciferáz renaturációja retikulocita lizátumban Biofizikai, szerkezetvizsgálati módszerek Távoli ultraibolya tartományú cirkuláris dikroizmus mérés Felületi plazmon rezonancia (SPR) mérés V-NMR mérés Sejtbiológiai, in vivo módszerek Sejtkultúra A Hsp90 ATP-kötésének in situ vizsgálata A Hsp90-Hsp70 in vivo komplexének vizsgálata Raf-1 és Lck aktivációjának és mennyiségének vizsgálata T-sejteken iv
6 4.5. Általános analitikai módszerek Poliakrilamid gélelektroforézis (PAGE) Western blot Fehérjekoncentráció meghatározás Bioinformatikai módszerek Páros és többszörös szekvencia illesztés A Hsp90 N-terminális -foszfát kötőhelyének azonosítása Eredmények A Hsp90 kölcsönhatása vanadát oligoanionokkal Immobilizált Hsp90 vanadát kötése A Hsp90 vanadát kötésének vizsgálata 51V-NMR-rel A Hsp90 kölcsönhatása permolibdáttal A Hsp90 permolibdát-indukált kovalens módosítása A Hsp90 permolibdát kötésének jellemzése A permolibdát-kötőhely térképezése A Hsp90 kölcsönhatása ATP-vel A Hsp90 [ - 32 P]ATP kötésének vizsgálata natív gélen A Hsp90 nukleotid kötésének vizsgálata SPR-rel A Hsp90 nukleotid-kötőhelyeinek kimutatása nukleotid-affinitáshasítással A nukleotid-affinitáshasítás igazolása egyéb kísérletekkel Két eltérő ATP-kötőhely kimutatása nitrocellulóz filter kötéssel A Hsp90 ATP-kötőhelyeinek feltérképezése Az N-terminális ATP-kötőhely azonosítása Az N-terminális -foszfát-kötőhely predikciója A foszfát-kötőhelyek behatárolása epitop térképezéssel A Hsp90 ATP-kötőhelyeinek gátolhatósága A Hsp90 ATP-kötőhelyeinek tulajdonságai Az N- és C-terminális ATP-kötőhelyek kölcsönhatásai A p23 partnerfehérje hatása a Hsp90 ATP-kötésére Taxol megbontja az N-és C-terminális domén kommunikációját A Hsp90 nukleotid-kötésének meghatározása in situ Ciszplatin hatása a Hsp90 biológiai funkciójára Ciszplatin hatása a Hsp90 N-terminális komplexének összeépülésére in vitro Ciszplatin hatása a Hsp90 C-terminális komplexének stabilitására in vivo Ciszplatin hatása a T-sejt-aktivációs jelpálya Hsp90-függő kinázaira in vivo Ciszplatin hatása a Hsp90-függő kliensfehérje renaturációjára in vitro Az eredmények megbeszélése A Hsp90 kölcsönhatása vanadáttal A Hsp90-oligovanadát kölcsönhatás lehetséges szerepe A Hsp90-dekavanadát kölcsönhatás lehetséges szerepe A Hsp90 kölcsönhatása permolibdáttal v
7 A permolibdát, mint molibdát analóg vagy SH-reagens A Hsp90 reaktív SH-csoportjai A Hsp90 kölcsönhatása ATP-vel Az N-terminális nukleotid-kötőhely A C-terminális nukleotid-kötőhely Az N- és C-terminális nukleotid-kötőhely kölcsönhatása Párhuzamok a Hsp104-gyel A ciszplatin lehetséges szerepe a Hsp90 működésében Szerkezet-hatás összefüggések Új tudományos eredmények Új kísérleti eredmények Új módszertani eredmények A kutatás további irányai Köszönetnyilvánítás Irodalomjegyzék...I 11. Saját közlemények jegyzéke...xvi Az értekezés témaköréhez kapcsolódó közlemények...xvi Az értekezés témaköréhez szorosan nem kapcsolódó közlemények...xvi vi
8 RÖVIDÍTÉSEK, MAGYARÁZATOK Aha-1 Activator of Hsp90 ATPase 1 as aminosav ATP adenozin-trifoszfát ATP S adenozin-5 -O-(tiotrifoszfát) BCK elágazó szénláncú -ketosav dehidrogenáz kináz, eukarióta hisztidin kináz BiP Immunoglobulin nehézlánc kötő (binding) protein, Grp78 Brij 98 polioxietilén-éter, detergens CD cirkuláris dikrozimus, optikai szerkezetvizsgáló módszer Cdc cell division cycle, az élesztő sejtciklusában szerepet játszó gén(termék)ek elnevezése CDK ciklin-dependens kináz CFTR cisztikus fibrózis transzmembrán konduktancia regulátor, kloridcsatorna fehérje CheA bakteriális GHKL-típusú hisztidin kináz ClpA/X ATP-függő prokarióta proteáz CP cisz-diamin-dikloro-platinum(ii), ciszplatin, kemoterápiás szer Cyp40 ciklofilin, ciklosporin A-kötő dajkafehérje peptidil-prolil izomeráz aktivitással DEAE dietil-amino-etán DMSO dimetil-szulfoxid DnaJ az E. coli 40 kda-os dajkafehérjéje (Hsp40 homológ) DTT D,L-ditiotreitol ECL kemilumineszcenciás Western-blot detektálási módszer eef-2 eukarióta elongációs faktor 2 alegysége eif-2 eukarióta iníciációs faktor 2 alegysége EnvZ bakteriális GHKL-típusú hisztidin kináz ER endoplazmás retikulum FK506 immunszuppresszív makrolid, amely a T-sejt aktiváció több lépését is gátolja; szor hatásosabb, mint a ciklosporin A FKBP FK506-kötő dajkafehérjék peptidil-prolil izomeráz aktivitással FPLC középnyomású folyadék-kromatográfia FSBA fluoro-szulfonil-benzoil-adenozin, a fehérjéhez kovalensen kötő ATP-analóg Fyn tirozin-kináz, az Src család tagja GA geldanamycin; a Hsp90 specifikus gátlószere, daganatellenes antibiotikum GHKL giráz, Hsp90, hisztidin kináz, MutL fehérjéket magában foglaló ATPáz/kináz szupercsalád GimC riboszóma-asszociált chaperon, prefoldin Gp96 a humán Grp94 neve GR glukokortikoid-receptor GroEL az E. coli Hsp60-homológja, dajkafehérje GroES az E. coli Hsp10-homológja, dajkafehérje Grpxy glukóz-regulált fehérje, az xy a protein relatív molekulatömegére utal (kda) GyrB DNS giráz (prokarióta topoizomeráz) GHKL-típusú B alegysége Hap1 hem aktivátor protein 1, az élesztő hemfüggő transzkripciós faktora HBGp82 agyi Hsp90 homológ lektin Hip a Hsp70 ko-chaperonja (Hsp70 interacting protein/p48) HPLC magasnyomású folyadékkromatgráfia vii
9 Hop HSF HSJ1b Hscxy Hsp90N Hspxy HtpG IPTG JFC1 KEKE Lck MAP MBP MEK MutL NAD(P) + NF B NLS NMR NSF OKT3 p53 PAR PBS PDI PDK PMSF PPI PP5 PVDF Raf Ras Rd SDS SDS-PAGE SPR Src TCP1/TRiC TNF TP Trap1 WB a Hsp70 és Hsp90 kapcsolódását segítő ko-chaperon (Hsp organizing protein/p60/sti1) hősokk transzkripciós faktor a Hsp40 család emberi idegszövetben megtalálható tagja az adott hősokk fehérje konstitutív formája membránkötött onkogén Hsp90 homológ hősokk fehérje, az xy a fehérje relatív molekulatömegére utal (kda) az E. coli Hsp90-homológja izopropil- -D-tiogalaktopiranozid, nem metabolizálódó laktóz analóg ismeretlen funkciójú, GHKL-típusú fehérje Lys/Glu tartalmú, fehérje-fehérje kölcsönhatások kialakításában részt vevő szekvencia limfoid sejtek tirozin kináza, a nyiroksejt aktivációs kaszkád korai tagja mikrotubulus-asszociált protein maltózkötő fehérje MAP-kináz-kináz GHKL típusú mismatch repair fehérje nikotinamid-adenin-dinukleotid(-foszfát), redox koenzim transzkripciós faktor, a natív immunitás karmestere nukleáris lokalizációs szignál mágneses magrezonancia spektroszkópia, szerkezetvizsgálati módszer N-etil-maleimid-szenzitív faktor, a vezikuláris fúzióban szerepet játszó fehérje a CD3 T-sejt receptor lánca elleni monoklonális, aktiváló antitest tumor szuppresszor fehérje, transzkripciós faktor proteáz-aktivált receptor, trombin receptor izotóniás foszfátpuffer fehérje diszulfid izomeráz piruvát dehidrogenáz kináz, eukarióta hisztidin kináz fenil-metil-szulfonil-fluorid peptidil-prolil cisz-transz izomeráz (rotamáz) TPR-domént tartalmzó szerin/treonin foszfatáz, a Hsp90 ko-chaperonja polivinilidén-difluorid a MAP-kináz jelpálya szerin/treonin kináza, MAP kináz kináz kináz membrán-asszociált kismólsúlyú GTP-kötő fehérje (GTP-áz) radicicol, nem anzamycin szerkezetű Hsp90-gátlószer nátrium-dodecil-szulfát SDS-poliakrilamid-gélelektroforézis felületi plazmonrezonancia, asszociációs-disszociációs folyamatok paramétereinek valós idejű meghatározására szolgáló módszer csirke Rous szarkóma vírus onkogénje, tirozin-kinázt kódol t(ailless)-komplex polipeptid 1 (eukarióták citoszolikus Hsp60 homológja) tumor nekrózis faktor, citokin transz-diamino-dikloro(ii)-platinum, klinikailag hatástalan platinavegyület mitokondriális Hsp90 homológ, Hsp75 Western-blot viii
10 ÁBRÁK 2.3.ábra A Hsp90-HSF autoregulációs hurok ábra A Hsp90 domén-szerkezete és triptikus fragmentumainak elhelyezkedése ábra A Hsp90 ATP-kötő doménjének kristályszerkezete ábra A töltött régió szerkezete ábra A töltött régió-hsp90 kölcsönhatás modellje ábra A töltött régió konformációs állapotainak modellje ábra A Hsp90 ligandkötőhelyei ábra A Hsp90-család lehetséges taxolkötő motívumai ábra A Hsp90 elektronmikroszkópos képe ábra A Hsp90 specifikus oligomer struktúrája ábra A Hsp90 aktív és passzív chaperon működésének szakaszai ábra A Hsp90 ATP-függő chaperon ciklusa ábra A Hsp90 szerepe a transzkripciós faktorok működési ciklusában ábra A Hsp90-vanadát kölcsönhatás vizsgálata SPR-rel ábra A Hsp90-vanadát kölcsönhatás vizsgálata 51 V-NMR-rel ábra A Hsp90 permolibdát-indukált kovalens módosítása ábra A Hsp90 permolibdát kötésének jellemzése ábra A Hsp90 permolibdát-kötőhelyének térképezése ábra A Hsp90 [ - 32 P]ATP-kötésének vizsgálata natív gélen ábra A Hsp90 ATP-kötésének vizsgálata SPR-rel ábra A Hsp90 nukleotid-affinitáshasítása ábra A nukleotid-affinitáshasítás igazolása egyéb kísérletekkel ábra A Hsp90 ATP-komplex nitrocellulóz filter kötése ábra Az N-terminális ATP-kötőhely azonosítása Edman-degradációval ábra Az N-terminális -foszfát-kötőhely predikciója ábra Az ATP-foszfát-kötőhelyek behatárolása epitop térképezéssel ábra A Hsp90 ATP-kötőhelyeinek gátolhatósága ábra A Hsp90 nukleotid-kötőhelyeinek tulajdonságai ábra A Hsp90 nukleotid-kötőhelyeinek kölcsönhatása ábra A p23 partnerfehérje hatása a Hsp90 ATP-kötésére ábra Taxol hatása a Hsp90 ATP-kötésére ábra A Hsp90 ATP-kötésének vizsgálata in situ ábra Ciszplatin hatása a Hsp90-p23 komplex összeszerelésére in vitro ábra Hsp90-ligandok hatása a Hsp90-Hsp70 komplexre in vivo ábra Hsp90-ligandok hatása a Raf-1 kináz foszforilációjára in vivo ábra Platinavegyületek hatása a luciferáz renaturációjára in vitro ábra A Hsp90 fehérjecsalád feltételezett adeninkötő motívuma ábra A Hsp90-monomer ATP-függő molekuláris kapcsolójának modellje ábra A Hsp90-dimer ATP-függő molekuláris kapcsolójának modellje ábra A Hsp90 nukleotid-állapotának, oligomerizációjának és chaperon aktivitásának kapcsolata..119 ix
11 TÁBLÁZATOK 2.1. táblázat A dajkafehérje családok táblázat A 90 kda molekulatömegű dajkafehérje család tagjai táblázat A GHKL ATPáz/kináz szupercsalád tagjai táblázat A GHKL ATP-kötő domén konszenzus motívumai táblázat Különböző fajokból származó Hsp90 fehérjék ATPáz aktivitása táblázat C-terminálisan trunkált Hsp90 fehérjék ATPáz aktivitása táblázat A Hsp90 N-terminális ATP-antagonistáinak jellemzői táblázat A Hsp90 deléciós mutánsainak tulajdonságai táblázat A Hsp90 kochaperonjai táblázat A Hsp90 chaperon kötőhelyei táblázat A Hsp90-nel kapcsolódó kliens fehérjék táblázat A Hsp90 és a Hsp104 nukleotidkötő tulajdonságainak összehasonlítása táblázat A Hsp90-kötő vegyületek hatásai és hatásmechanizmusa x
12 1. BEVEZETÉS A többsejtű eukarióta élőlény rendkívül bonyolult organizmus, életben maradását számos (többszörösen átfedő, túlbiztosított) mechanizmus teszi lehetővé sejtszinten és az élőlény szintjén egyaránt. A sejtszintű folyamatok már a prokariótákban megjelennek, és (alapelveik) szinte változatlanul öröklődnek tovább a legmagasabb rendű élőlényekig. Hogy csak pár ősi példát említsünk, ilyen a glikolízis, a transzláció, és ilyen a stresszválasz, avagy a dajkafehérjék általános sejtvédő feladata, melyek mind az egyed (a sejt) minden áron való túlélését biztosítják. A szöveti szerveződés megjelenése új kívánalmakat ró a sejtre. A bármi áron túlélni már nem örökérvényű szabály, belép a szolgálni, eleget tenni, vagy az egyed érdekében meghalni altruisztikus parancsolata. A szöveti szerveződés megjelenése elsősorban a sejten kívüli térből érkező üzenetek (növekedés, differenciálódás, sejt-sejt kapcsolat, programozott sejthalál) pontos továbbítását, másrészt a sejt reakcióképességének és épségének (ingerekkel szembeni érzékenység, sejtmozgások, anyagcsere, genom) szabályozását, illetve ellenőrzését kívánja meg; a fentiek elégtelensége vagy inkoherenciája esetén pedig a sejt képessé válik az önnön működését leállító parancs (szeneszcencia, apoptózis) kiadására és végrehajtására. Mindezen forradalmi változások közben megtörténik, hogy addig jelentéktelennek tartott szereplők esszenciális feladatot kapnak. A sejt egyik ilyen szereplője a 90 kda molekulatömegű stresszfehérje, a Hsp90. Prokarióta homológja igazán lényeges feladatokat még nem lát el, génjének hiánya komoly következménnyel nem jár, az élesztőben viszont már két példányban jelenik meg ( és izoforma), melyek együttes hiánya halálos. A Hsp90 egyre inkább bizonyossá válik az előzőekben felsorolt szinte minden eukarióta vívmánnyal szoros kapcsolatban van. Működésének lényege, hogy a folyamatokat kontrolláló fehérjék (kinázok, magi receptorok, p53 fehérje és mások) specifikus dajkája. Szerkezetét azért érdemes tanulmányozni, mert általa képet kapunk egy érdekes, esszenciális funkció molekuláris alapjairól, valamint olyan gyógyszerekhez juthatunk, melyekkel korunk népbetegségeit, így keringési és degeneratív betegségeket, többek között daganatokat gyógyíthatunk. Laboratóriumunk egy évtizede foglalkozik a 90 kda-os dajkafehérjék kutatásával. Eredményeinket, feltevéseinket számos díjnyertes rektori pályamunka és szakdolgozat után három, ezidőtájt elkészített és készülő doktori értekezésben foglaljuk össze. Míg Schnaider 1
13 Tamás értekezése átfogó képet adott a stresszválaszról és a dajkafehérjékről, valamint a Hsp90 makromolekuláris kölcsönhatásairól, Nardai Gábor a dajkafehérjék kórélettanába enged betekintést, addig én a különböző kismolekulák Hsp90 szerkezetére és működésére gyakorolt hatását tűztem toll- és pipettahegyre. Értekezésem terjedelmének csökkentése érdekében az irodalmi áttekintés során többször hivatkozom saját összefoglaló közleményünkre (Csermely és mtsai, 1998), Schnaider Tamás doktori értekezésére (Schnaider, 2000) és témavezetőm könyvére (Csermely, 2001/c). A terjedelmi korlátok mellett a bírálók feladatának egyszerűsítését tartottam szem előtt, amikor néhány eredményünket rendhagyó módon a módszerek részletes ismertetése nélkül az Irodalmi áttekintésbe illesztettem. Ezen eredményeket a tézisekben sem szerepeltettem, mert még nem mentek át a szakfolyóiratok bírálatának szűrőjén, mégis fontosnak tartottam bemutatásukat, mert kitágíthatják a Hsp90 szerkezet-hatás összefüggéseiről kialakított képünket, és teljesebbé tehetik értekezésemet. Mielőtt a Tisztelt Olvasó belekezdene értekezésem olvasásába, előrebocsátom, hogy néha furcsa, magyartalan kifejezésekkel, elnevezésekkel találkozik a következő lapokon. Ezek az idegenszerű nevek valójában annak a törekvésnek gyermekei, hogy magyar elnevezéseket találjunk a terjedőben levő, magyarosabban hangzó angolszász terminológia ellenében. A magyar a világ háromezer-valahányszáz nyelve közül azon néhány tucat egyike, melyen az összes tudományágat képesek vagyunk művelni. Ez a nyelvújítás rendkívül lekes, aktív tevékenységének köszönhető. Cserébe elnézhető az a néhány nyelvi ficam, amit szintén Kazinczyék mozgalmának tulajdonítanak. Bár felelősségem a tankönyvírókéhoz, tehetségem Kazinczyékéhez mérten csekély, a magam szintjén megpróbálok tenni azért, hogy nyelvünk szépsége és hagyományos értéke ne sorvadjon el, mert a nyelv maga a kultúra. Kérem a Tisztelt Olvasót, a ficamokat nézze el, és tegye helyre tehetsége szerint! Ha pedig jobb elnevezést talál, írja meg nekem, vagy a Biokémiai Társaságok honlapjának nevezéktannal foglalkozó címére ( BioChat@WEBio.hu). Budapest, március Sőti Csaba csaba@puskin.sote.hu 2
14 2. IRODALMI ÁTTEKINTÉS 2.1. A dajkafehérjék: életbiztosítás sejtszinten A fehérjék aminosav sorrendje egyedi módon kódolja a fehérje működése szempontjából optimális térszerkezetet, melynek kialakítására a fehérjék túlnyomó többsége megfelelő körülmények között képes. A sejtben korántsem megfelelőek a feltételek: a magas hőmérséklet és a makromolekuláris zsúfoltság segítséget kíván. A segítőket dajkafehérje (molekuláris chaperon) néven illetjük, bár nem valódi dajkák. Valójában a fehérje életének minden szakaszában jelen vannak, mintegy orvosként segítve a fehérje felgombolyodását, transzportját, működését, végül a proteolitikus temetőig kísérve őket (összefoglalásul ld. Hartl, 1996; Bukau és Horwich, 1998; Bukau 1999; Schnaider, 2000; Csermely, 2001/c). Működésüket önkényesen passzív és aktív részre oszthatjuk. A passzív chaperon hatás lényege a hidrofób aminosavakban gazdag polipeptidláncok vagy a meztelen peptid-gerinc kis specificitású és affinitású kötése, mely meggátolja a felgombolyodó vagy denaturálódó fehérjék aggregációját. Passzív chaperon hatása minden dajkafehérjének van. Az aktív chaperon hatás a szubsztrát fehérje ciklikus kötése majd elengedése, részben aktív kitekeréssel zajlik, meggátolja a tekeredési zsákutcákba jutást, és statisztikusan lehetőséget teremt a megfelelő tekeredési útvonal megtalálására. Az aktív chaperon hatás mindig energiaigényes folyamat; vagy ATP hidrolízise (Hsp70, Hsp60, Hsp110), vagy a redoxpotenciál (diszulfidhidak reverzíbilis redukciója, fehérje diszulfid izomeráz) terhére történik. Aktív chaperon hatás segít az újonnan szintetizálódó vagy denaturált fehérjék felgombolyodásában, az oligomerek össszeszerelésében, a sejtalkotókba (mitokondrium, endoplazmás retikulum) történő bejuttatásában, a fehérjeaggregátumok szétszerelésében, és a menthetetlen fehérjék eltakarításában (bemutatás a citoszolikus, ritkábban a lizoszómális fehérjebontó apparátusnak). A dajkafehérjék nagy része stresszfehérje is, azaz valamilyen nem specifikus fehérjeés/vagy lipidkárosító (pl. hősokk) inger fokozza termelődésüket, így a sejt képessé válik működésének helyreállítására, sőt akár a rákövetkező károsító inger közepette fenntartására (pl. termotolerancia). Különböző ingerek kereszttoleranciát váltanak ki. A stresszfehérjék szintje így edzéssel vagy gyógyszeresen növelhető, mely az egyed jobb életkilátásait eredményezi, és jelentős orvosi vonatkozásokkal kecsegtet (Welch, 1992). 3
15 A prokarióta sejt fehérjéinek felgombolyodása döntően a transzlációt követően megy végbe, és a dajkafehérjék aktív segítségét igényli. Az eukarióták nagyobb, több doménből álló fehérjéi nem tudnának így betekeredni. A riboszóma és a riboszóma-asszociált chaperonok (melyek nemcsak stresszfehérjék) veszik át a klasszikus dajkafehérjék feladatát (összefoglalásul ld. Netzer és Hartl, 1998). Bár az eukarióta chaperonok korántsem maradnak feladat nélkül, indokolatlannak látszik, hogy mind a Hsp70, mind a Hsp90 külön-külön kitegye a sejt fehérjekészletének 1-5%-át. Elképzelhető, hogy a nagy mennyiségű dajkafehérje egy olyan dinamikus komplexet alkot, mely a sejt alapvázát képezi, és kis affinitású fluktuáló kölcsönhatások révén összetartja, mozgatja és irányítja a spontán diffúzióval nem magyarázható molekuláris mozgásokat (összefoglalásul ld. Pratt, 1997; Pratt és mtsai, 1999; Csermely, 2001/a). Ez az általános szerep magyarázhatja a stresszválasz korral járó kimerülését, az öregedés beindulását és a degeneratív betegségek illetve daganatok megjelenését (Sőti és Csermely, 1998/b; 2002/a; 2002/b; Csermely, 2001/b). Család Képviselők Chaperon működés Speciális szerep Irodalom Kisméretű Cpn10, GimC, Hsp25, Hsp27, krisztallinok aggregáció gátlás Hsp40 Hsp40, Hdj1, Hdj2 aggregáció gátlás Hsj1a, Hsj1b Hsp60 Cpn60, TCP-1 (TRiC) felgombolyodás, összeszerelés Hsp70 Hsc70 (Hsp73), Hsp70 de novo szintézis, (Hsp72), Prp73, felgombolyodás, mortalin transzport, lebontás Grp78 (BiP), mthsp70 Hsp90 ld táblázat aggregáció gátlás, szerkezet stabilizálás Hsp100 Hsp101/102, Hsp104 Hsp110, Grp170 ClpA/X (E. coli) aggregátumok szétszedése, proteolízis (E. coli) apoptózis, neurodegeneráció Hsp70 segéd ATPáz aktivátor aktin, tubulin apoptózis immortalizáció apoptózis immunitás evolúció jelátvitel daganatképződés immunitás evolúció termotolerancia konformációs betegségek Arrigo, 1998 Sőti és Csermely, 2002/b Hartl, 1996; Bukau, 1999 Thirumalai és Lorimer, 2001 Bukau, 1999 Schnaider, 2000 Srivastava és mtsai, 1998 Chow, 2000 Csermely és mtsai, 1998 Young és mtsai, 2001 Srivastava és mtsai, 1998 McLaren, 1999 Schirmer és mtsai, 1996 Ogura és Wilkinson, 2001 Sőti és Csermely, 2002/b 2.1. táblázat A dajkafehérje családok A dajkafehérjék csoportosítása molekulatömegük alapján történik (2.1. táblázat). Az érdeklődő olvasó további információt talál a tematikus összefoglaló közleményekben. A továbbiakban a 90 kda molekulatömegű dajkafehérjék családjával foglalkozom részletesebben. 4
16 2.2. A 90 kda molekulatömegű dajkafehérje család Elhelyezkedés Képviselő Faj Szerep/asszociáció Deléció Irodalom Prokarióta Citoszol HtpG eubaktérium? marginális Bardwell és Craig, 1987 Eukarióta Citoszol (sejtmag) Hsp90c/Hsp90i Hsc82/Hsp82 Hsp86/Hsp84 Hsp90 /Hsp90 élesztő rágcsáló madár, emlõs labilis konformációjú fehérjék stabilizálása, hősokk: általános chaperon letális Mayer és Bukau, 1999 Richter és Buchner, 2001 Schnaider, 2000 Borkovich és mtsai, 1989 Hsp105 emlõs here p53 chaperon? Kumagai és mtsai, 2000 HBGp82 lektin emberi agy galektin-1 ligand? Chadli és mtsai, 1997 Endoplazmás retikulum endoplazmin Grp94 Gp96 rágcsáló emlős immunoglobulin-érés, antigén bemutatás Mitokondrium Hsp75/Trap1 muslica, emlős TNF -receptor Rb-fehérje chaperonja Plazmamembrán Hsp90N emlős Raf aktiváció (ras független) nem letális, naív immunitás kiesik Csermely és mtsai, 1998 Schnaider, 2000 Randow és Seed, 2001? Chen CF és mtsai, 1996; Song és mtsai, 1995; Felts és mtsai, 2000? Grammatikakis és mtsai, táblázat A 90 kda molekulatömegű dajkafehérje család tagjai A Hsp90c és i a fehérje konstitutív és indukálható izoformájának felel meg A 90 kda molekulatömegű chaperonok eddig azonosított képviselőit a 2.2. táblázat szemlélteti. A prokarióta gén alapos átalakulása és többszörös duplikációja alakította ki a ma ismert eukarióta Hsp90 fehérjéket (Csermely és mtsai, 1998), ezzel együtt a bakteriális és a humán fehérje aminosavai 40%-ban azonosak, 54%-ban hasonlóak (Bardwell és Craig, 1987)! A prokarióta HtpG fehérje csak rendkívül magas hőmérsékleten rendelkezik (passzív) chaperon aktivitással, deléciója csak ekkor válik hátrányossá az organizmusra nézve (Bardwell és Craig, 1988; Csermely és mtsai, 1998). Az egyre magasabb rendű szervezetek Hsp90 fehérjéinek hőstabilitása egyre kisebb, ezzel egyetemben passzív chaperon aktivitásuk hatékonyabb, és alacsonyabb hőmérsékleten jelentkezik (Jakob és mtsai, 1995/b; Nemoto és mtsai, 2001/b). Az eukarióta citoszol két általános izoformája, a Hsp90 és 76%-ban azonosak, és több mint 90%-ban hasonlóak (Csermely és mtsai, 1998). A két izoforma között a szerkezeti és működésbeli hasonlóságból kifolyólag gyakran nem tesznek különbséget. Számos kísérleti rendszerben a humán fehérje helyreállítja a Hsp90-hiányos élesztő mutáns 5
17 életképességét, amely a bakteriális homológról nem mondható el (Picard és mtsai, 1990; Buchner, 1999). Az élőlények bonyolódásával a Hsp90 feladatai egyre sokasodnak. Ez azzal jár, hogy megjelennek a fehérje sejtalkotó-, szövet-, sőt szubsztrátspecifikus variánsai, és leveszik a többletmunkát a Hsp90 válláról. Erre kínál szép példát a Trap1/Hsp75, mely élesztőben még nem, csak muslicában jelenik meg. A muslica Trap1 66%-ban hasonlít a humán Trap1-hez, 50%-ban a humán Hsp90-ekhez. Bár domén-elrendeződése szerkezetileg a HtpG fehérjéhez teszi hasonlóvá, aminosavsorrendje csak 49%-os hasonlóságot mutat (Felts és mtsai, 2000). Kérdéses, hogy a szűk szubsztrátspecificitású, mitokondriális Hsp90-homológ Trap1 hogyan találkozik in vivo szubsztrátjaival, a mebránban található TNF -receptorral, illetve a sejtmagi/citoszolikus retinoblasztóma-fehérjével. A legfiatalabb, legkisebb és legszélsőségesebb Hsp90-homológ a Hsp90N, melynek N-terminális ATP-kötő doménje helyén egy rövid hidrofób szekvencia és egy mirisztoilációs szignál található. A Hsp90N fehérje első példája annak, hogyan válhat egy dajkafehérje onkogénné. A fehérje Ras-deficiens sejtekben is képes a Raf-ot kicsalogatni a membránhoz és a MAP-kináz kaszkádot aktiválni, mely a sejtek daganatos elfajulását okozza (Grammatikakis és mtsai, 2002). A továbbiakban a legfőbb képviselőt, az eukarióta Hsp90-et mutatom be, ahol a család egyéb képviselőinek tulajdonságai segítséget nyújthatnak a szerkezet és működés megértéséhez, ott egyértelműen utalok ezekre. 2.3 A Hsp90-gén és kifejeződése A Hsp90 és izoformájának génjei más stresszfehérjéktől eltérően intronokat tartalmaznak. Mivel hősokk gátolja a splicing-ot, így a Hsp90 mrns hősokkolt sejteken nem képes transzlálódni, bár egész muslica lárván a Hsp90 mrns splicing-ja ellenállóbb a hőkezeléssel szemben (Csermely és mtsai, 1998). Mindazonáltal, ez megkérdőjelezné, hogy a Hsp90 fontos hősokk-fehérjeként funkcionáljon. A Hsp90 gének promotere két-két hősokk elemet tartalmaz, a konstitutív izoforma kevésbé hő-indukálható. Növekedési jel többféle promoteren keresztül mindkét izoforma átíródását fokozza, ezzel szemben az immunsejtek aktivációja és a gyulladásos ingerek elsősorban a izoforma transzkripcióját serkentik. 6
18 Természetesen szinte minden káros hatás még a pszichés stressz is képes a Hsp90 szintézisét fokozni (összefoglalásul ld. Csermely és mtsai, 1998). Nakai és Ishikawa (2001) kísérletei nyomán a hősokk faktor, a Hsp90 és a sejtciklus kapcsolata új dimenzióval gazdagodott. A HSF-1 és -3 hiányos sejtekben a Hsp90 mennyisége közepesen (kb. 60%-ra), a Hsp90 -é jelentősen (25%-ra) csökkent normál hőmérsékleten, rámutatva a HSF konstitutív transzaktivációs, és a Hsp90 mennyiségére gyakorolt hatására. A Hsp90 relatív hiánya már enyhe hősokk hatására is a Cdc2 (CDK1) kináz destabilizálódáshoz vezet, ami leállítja a sejtciklust. A Hsp90 mennyiségének növelése stresszválasz hiányában is helyreállítja a sejtosztódást. A szerzők arra is rámutattak, hogy a Hsp90 mennyiségének a normál szint fölé növelése sem lehetséges, intenzív apoptotikus hatása miatt. A jelen és más kísérletek (Rutherford és Lindquist, 1998; Imai és Yahara, 2000) fő tanulsága, hogy a sejt (és a szervezet) működéséhez a Hsp90 mennyiségét szűk határok között kell tartani, mert különben a jelátviteli folyamatok káosza uralkodik el. A hősokk faktorok szerepe a Hsp90 szintjének szabályozásában (stresszmentes körülmények között is) kulcsfontosságú. A Hsp90-komplex a hősokk faktort is fogságában tartja, végső soron egy önszabályozó hurokkal saját mennyiségét határozza meg (2.3. ábra). + jelátvitel Hsp90 HSF-1 stresszválasz denaturált fehérje geldanamycin ábra A Hsp90-HSF autoregulációs hurok A Hsp90 gátlása stresszválaszt provokál és a jelátviteli folyamatok zavarához vezet. HSF-1, hősokk faktor 1 A Hsp90 a növekedési és differenciálódási jelpályák számos képviselőjével kölcsönhatásba lép (ld. Schnaider, 2000; ill fejezet). Nem csoda, hogy az 7
19 egyedfejlődés során mind a Hsp90 mennyisége, mind sejten belüli elhelyezkedése nagy változásokon megy keresztül. A petesejt érése és a korai embriogenezis során a Hsp90 mennyisége jelentősen megnő, a fehérje nagyobb része jut be a sejtmagba (Csermely és mtsai, 1998). A Hsp90 fejlődéssel és sejtciklussal összefüggő ingadozásában is szerepe lehet a hősokk faktoroknak (Nakai és Ishikawa, 2001). Annak ellenére, hogy a Hsp70-ről és más stresszfehérjék öregedésfüggő elváltozásaival számos közlemény foglalkozik, a Hsp90-ről nincs ilyen adat (összefoglalásul ld. Sőti és Csermely, 2000; 2002/a; 2000/b). A Hsp90 minden szervben kifejeződik, az össz fehérjekészlet 1-3%-át alkotja. Élesztőben a fenti mennyiségnek 15-öd része(!) is elegendő a normál hőmérsékleten történő növekedéshez, úgy tűnik tehát, hogy legalábbis ebben az organizmusban a természet pocsékol a Hsp90-nel (Xu és Lindquist, 1993). Döntően citoplazmatikus, de 5-6%-a a sejtmagban is megtalálható, ami tekintetbe véve a Hsp90 nagy mennyiségét, élettanilag is jelentős lehet (Schnaider, 2000). Hősokk hatására az eddig is tetemes (és felesleges?) fehérje mennyisége 3-10-szeresére nőhet, ami már tényleg luxusnak számít, tekintve, hogy ismét élesztőben a Hsp90 nem vesz részt a fehérjék hőaggregáció elleni védelmében (Nathan és mtsai, 1997). Ugyanakkor a szélsőséges hőmérsékleten való növekedéshez elengedhetetlen a masszív Hsp90 mennyiség (Borkovich és mtsai, 1989), de hogy mi lenne ennek a szerepe, az nem tisztázott. Mint említettem, a passzív chaperon hatás a Hsp90 oligomerizációját előidéző hőmérsékleten lép működésbe, feltehetően ekkor már olyan nagymennyiségű fehérje aggregálódik, aminek védelméhez nem elegendő az elsődleges dajkafehérjék (Hsp70, Hsp27) működése. Hősokk hatására a Hsp90 további 6-7% lassan, mindenféle sejtváz- és mozgatórendszeről függetlenül a sejtmagba vándorol (Akner és mtsai, 1992). A hőkezelés végeztével a Hsp90 visszavándorol a citoszolba, egy rákövetkező rövid hősokk hatására már nem figyelhető meg sejtmagi transzlokáció. Újkeletű az a tény, hogy hipoxia (Katschinski és mtsai, 2002) és az apoptotikus program (Gerner és mtsai, 2000) szintén a Hsp90 sejtmagi transzlokációjához vezetnek. A vesekárosító kemoterapeutikum ciszplatin egyszeri injekciója a Hsp90 szelektív indukciójához és sejtmagi transzlokációjához vezet a vesecsatornácskák sejtjeiben. Az expresszálódó fehérjemennyiség és a transzlokáció az injekció utáni ötödik napon tetőzik, egybeesik a legintenzívebb regenerációs periódussal (Satoh és mtsai, 1994). 8
20 2.4. A Hsp90 általános szerkezeti vonásai A Hsp90 domén-szerkezete ATP-kötés dimerizáció Hartl N-terminális töltött régió középső C-terminális P P Buchner C C C C CC Nemoto 400 A B C Tripszin: P P 80 C C C C CC 50 C C C C CC 50 P P C 40 P P 41 C C C C CC 32/37 P 32/37 C C C C 26/27 26/27 15 C C C CC ábra A Hsp90 domén-szerkezete és triptikus fragmentumainak elhelyezkedése A három kutatócsoport által javasolt doménszerkezetek és a domének nevei felül láthatók. A ciszteineket C, a kazein kináz II által foszforilált helyeket P jelöli az elsődleges szekvenciában. A fő triptikus hasítási helyeket nyilak jelölik. A keletkezett fragmentumokat Lees-Miller és Anderson (1989/a), Nemoto és mtsai (1997), Hartson és mtsai (1999), Bogatcheva és mtsai (1999) és saját nem közölt eredményeink alapján állítottam össze. A fragmentumok feletti számokkal a relatív molekulatömegeket jelöltem. A Hsp aminosavból épül fel (forrás: Swissprot). A továbbiakban ha külön nem jelzem a Hsp90 szekvenciáit az egyéb Hsp90 fehérjékhez illesztett humán Hsp90 (1-731) szekvenciájára vonatkoztatva adom meg. Alakját tekintve elongált fehérje. Izoelektromos pontja 5,1-5,8, amit a fehérje változó foszforilációs állapota is befolyásol (átlagban 2-3 foszfát/monomer). Alapvetően dimer, azonban oligomerizációra hajlamos (ld fejezet). Elektronmikroszkópos tanulmányok alapján a Hsp90 két doménből áll, melyeket egy flexíbilis csukló választ el egymástól lehetővé téve a domének kinyílását vagy becsukódását (Maruya és mtsai, 1999; ld. még A ábra). Predikciós vizsgálatok és limitált proteolís alapján a 9
21 doménszerkezetről további finom részleteket deríthetünk ki (Lees-Miller és Anderson, 1989/a; Nemoto és mtsai, 1997; Stebbins és mtsai, 1997; Sőti Cs., Csermely P., nem közölt eredmények; ábra). A pontos doménfelépítésről megoszlanak a vélemények (ld. ábra). Az N-terminális 25 kda-os ( as) és a C-terminális 60 kda-os ( as) domének között egy rendkívül töltött és flexibilis régió (töltött régió) helyezkedik el. Ha a Hsp90-et alacsony koncentrációjú tripszinnel hasítjuk, a töltött régió az N-terminális doménen marad. A nagy C-terminális domén a 614/617. aminosavnál könnyedén kettéhasad, a keletkező középső domén a 400. aminosavnál két szubdoménre válik szét. Az első töltött régión kívül még egy hasonló található a középső doménben ( as) A Hsp90 poszttranszlációs módosulása A Hsp90 aminosav sorrendje különféle konszenzus motívumokat rejt (Binart és mtsai, 1989; Csermely és mtsai, 1998). Az N-kapcsolt glikozilációt csak az agyban előforduló, ismeretlen funkciójú Hsp90 homológ lektin esetén írták le (Chadli és mtsai, 1997). Kimutatták, de ismeretlen a jelentősége a metilációnak és az ADP-ribozilációnak is (ld. Schnaider, 2000). Tirozin foszforilációt eddig nem találtak, ezzel szemben számos szerin és treonin foszforilált. A Hsp90 N-terminálisát a kettősszálú DNS-függő protein kináz foszforilálja (Lees-Miller és Anderson, 1989/b). Mindkét izoformát foszforilálja a campfüggő protein kináz (Kudlicki és mtsai, 1985), a kazein kináz II (Lees-Miller és Anderson, 1989/a), és a szfingozin-függő kináz (Megidish és mtsai, 1999). A Hsp90 önmagát is képes csekély hatásfokkal autofoszforilálni (Csermely és Kahn, 1991). A foszforiláció szerepe a Hsp90 működésében nagyrészt ismeretlen. A defoszforilált Hsp90 kevésbé képes az autofoszforilációra (Csermely és Kahn, 1991) és a v-src kináz kötésére (Mimnaugh és mtsai, 1995). A kazein kináz II általi foszforiláció szükséges az eif2 kináz natív funkcionális szerkezetének kialakításához (Szyszka és mtsai, 1989). Egy nemrég megjelent közleményben pedig bizonyították, hogy a Hsp90 reovírus sejten történő megtapadást közvetítő fehérjéje a Hsp90 szubsztrátja, és a chaperonról történő leválása egyszerre történik meg a Hsp90 foszforilációjával, bár az ok-okozati összefüggést nem bizonyították (Zhao és mtsai, 2001). A chaperon szerep és a foszforiláció közötti összefüggést támogatja az a megfigyelés is, hogy hősokk hatására a foszfátcsoportok forgalma felgyorsul a Hsp90-en (Legagneux és mtsai, 1991), valamint az, hogy a Hsp90-nel asszociáló, TPR-domént tartalmazó fehérjék között helyet kapott a PP5 foszfatáz is (ld táblázat). A jelátviteli folyamatokkal való kapcsolatot domborítja ki, hogy a plazmamebrán felől induló programozott 10
22 sejthalál során a Hsp90 foszforilálódik, és a sejtmagba transzlokálódik (Gerner és mtsai, 2000) A Hsp90 fő immunogén régiói A Hsp90 nemcsak aktívan, hanem antigénként is fontos szerepet játszik az immunrendszer működésben (ld. Csermely és mtsai, 1998). A Hsp90-ben két immunogén régió térképezhető fel (Nemoto és mtsai, 1997), melyek közül az első a töltött régió területére, a második a C-terminális legvégére ( as) esik. Mindkettő az eukarióta Hsp90-ek szerzeménye. A Nemoto-labor eredményei (és predikciós adatok; Binart és mtsai, 1989) alapján azt hihetjük, hogy ezek az epitopok felületiek, annál is inkább, mert a töltött régió szinte nem tartalmaz hidrofób aminosavat. Nem szabad megfeledkezni azonban arról, hogy a szerzők rekombináns (E. coliban termelt) Hsp90-et használtak, melynek triptikus térképe és negyedleges szerkezete kissé eltér a tisztított fehérjéétől. A töltött régió bővelkedik lizinekben, a natív Hsp90-ben mégis csak a határán (283. as) hasítja a tripszin (Lees-Miller és Anderson, 1989/a; Hartson és mtsai, 1999; nem bemutatott adatok). Ez arra utalhat, hogy a töltött régió az intakt Hsp90 más részeivel lép kölcsönhatásba (ld fejezet), melyet egy nagy aviditású antitest természetesen képes megbontani. Ezt támogatja saját eredményeinken túl az a megfigyelés is, hogy a töltött régió területén található feltételezett nukleáris lokalizációs szignál csak a középső és a C-terminális domének deléciójával válik elérhetővé (Meng és mtsai, 1996, Jibard és mtsai, 1999). A fenti fő immunogén régiókon túl két fontos anti-hsp90 antitestet érdemes megemlíteni. Az első az AC88 antitest (Csermely és mtsai, 1998; Hartson és mtsai, 1999), melynek epitopja a aminosavak által határolt régióban van, és kizárólag a szabad Hsp90-et ismeri fel. A másik az LKVIRK antitest, mely nevét az általa felismert aminosavak által határolt, rendkívül konzervált epitopról kapta. Az (auto)antitest képes kivédeni az invazív kandidázis által előidézett halálozást (Matthews és mtsai, 1991). Mindkét antitestnek nagy hasznát vettük kísérleteink során A Hsp90 doménjeinek elrendeződése A Hsp90 nagy fehérje, doménjeinek többszörös intra- és intermolekuláris kölcsönhatásait számos szerkezeti és funkcionális tanulmány alátámasztja. A legalaposabb kutatásokat Takayuki Nemoto csoportja végezte, a HtpG fehérje szerkezetével kapcsolatosan. 11
23 Mivel modelljüket részben kísérleti eredmények, részben szerkezeti homológia alapján kiterjeszthetőnek vélik az eukarióta Hsp90 fehérjékre, ezért a kölcsönhatásban részt vevő szekvenciákat zárójelben a humán Hsp90 aminosav sorrendjére vonatkoztatva is megadom. Nem szabad elfeledkeznünk arról, hogy a HtpG-ből hiányzik a töltött régió Intramolekuláris kölcsönhatás és chaperon funkció A Nemoto-féle A-domén ( ábra) második kétharmada, a aminosavig ( ) intramolekuláris kölcsönhatásba lép a B-domén aminosavak által határolt B1 szubdoménjével ( ). A kölcsönhatás, bár gyengébb, de konzervált a humán Hsp90 ban is, sőt a prokarióta és eukarióta domének között hibrid komplex is létrehozható (Nemoto és mtsai, 2001/a). A kölcsönhatás hőlabilitása egyik tényezője lehet a HtpG/Hsp90 hő-indukált chaperon aktivitásának (Tanaka és mtsai, 2001) Intermolekuláris kölcsönhatások a Hsp90 dimerben Szintén Takayuki Nemoto laboratóriuma tárta fel a C-terminális domén dimerizációban játszott szerepét (Nemoto és mtsai, 1995; 2001/a). A HtpG B-domén ( ) aminosavig terjedő B2 szubdoménje antiparalel kölcsönhatást alakít ki a C-terminális utolsó 16 aminosavával (Nemoto és mtsai, 2001/a). Megjegyzendő, hogy a HtpG és a humán Hsp90 C-terminálisainak kölcsönhatása nem teljesen egyezik, HtpG-Hsp90 hibrid komplexek ez esetben nem hozhatók létre (Tanaka és mtsai, 2001). A különbség oka az, hogy az eukarióta Hsp90-ek középső és C-terminális doménjei jelentősen eltérnek a bakteriális homológokétól. A humán Hsp90 C-terminális 49 aminosavának törlése gátolja a dimerizációt (Minami és mtsai, 1994), amihez a baktériumból hiányzó utolsó 35 aminosav feltehetően nem szükséges (Owen és mtsai, 2002). A 30 C-terminális aminosavat nélkülöző csirke Hsp90 mutáns más laborban nem dimerizált (Meng és mtsai, 1996). Jibard és mtsai (1999) tovább pontosították a Hsp90 B2 szubdoménjének azt a régióját, mely kölcsönhat a dimer másik felének C- terminális doménjével. Szerintük az és a , valamint a régiók vesznek részt a dimerizációban. Prodromou és mtsai (1997/a) az élesztő Hsp90 N-terminális doménjének kristályszerkezetében dimer struktúrát találtak, bár mások ezt oldatban nem tudták kimutatni (Scheibel és mtsai, 1999/a). A dolog hátterében egyrészt az áll, hogy a diffrakciós képen megfigyelt dimer a kristályosítás során keletkező műtermék volt. Másrészt, a későbbiekben 12
24 szintén Prodromou és mtsai (2000) elegáns kísérletekkel alátámasztott tanulmányban közölték, hogy a dimerizációs tendencia csak ATP jelenlétében valósul meg. Eredetileg ugyanis a ( ) aminosavak által határolt fedél régió az ATP-kötő zsebtől meglehetősen távol, a (32-40) szegmentum által kihorgonyozva helyezkedik el, ATP hatására azonban feltehetően ráhajlik a zsebre, és elősegíti a Hsp90 N-terminális doménjének dimerizációját Feltételezhető domén-domén kölcsönhatások Egyéb domén-domén kölcsönhatásokra csak indirekt bizonyítékok utalnak, minden esetre érdemes itt megemlíteni ezeket. A Hsp aminosavai egy feltételezett kalmodulin-kötő konszenzus szekvenciára emlékeztetnek. A Hsp90 Ca 2+ -kalmodulin kötésére képes (Minami és mtsai, 1993), melyet az szekvenciájú megszintetizált peptid gátol, sőt maga köti a kalmodulint. Ennél is érdekesebb, hogy a peptid a Hsp90-nel is keresztköthető, és elősegíti az oligomerizációját. Feltételezhető, hogy ez a régió a molekula más részéhez köt, amelyet a Ca 2+ -kalmodulin vagy a hősokk felszabadít (ld fejezet). Louvion és mtsai (1996) olyan domináns negatív Hsp90 mutánst találtak, mely az élesztő sejtek növekedését csak magasabb hőmérsékleten gátolja. Az ( ) aminosavak által határolt szegmentum a Hsp90 második töltött régiójában helyezkedik el, amely szerepet játszik a dimerizációban (Nemoto és mtsai, 1995, Jibard és mtsai, 1999). Deléciója destabilizálhatja a dimerizációt, lévén az ebben résztvevő doménben található. További bizonyíték erre az, hogy a domináns negatív hatást ozmotikus stabilizátorok (pl. szorbitol) valamint a mutáns 652. (672) aminosaván túli régió eltávolítása kivédik (a 685. [704] aminosavon túli deléció még nem védi ki). Az sem kizárható, hogy ebben a két régióban találhatóak a Hsp90 C-terminális ATP-kötőhelyének konszenzus motívumai (Csermely és Kahn, 1991; Callebaut és mtsai, 1994). Bár konkrét szekvenciális adatok nem állnak rendelkezésre, egyértelműen bizonyított, hogy az N-terminális domén a fehérje többi részének működését nukleotidfüggően szabályozza (Sullivan és mtsai, 1997; Grenert és mtsai, 1997; 1999). A Hsp90 specifikus chaperonműködése in vitro és in vivo a teljes fehérje jelenlétét igényli (Scheibel és mtsai, 1999/b; Johnson és mtsai, 2000). A töltött régió szintén befolyásolja az N- és C-terminális domének működését (Scheibel és mtsai, 1999/a; Johnson és mtsai, 2000; Bouhouche-Chatelier és mtsai, 2001), melyből fizikai kölcsönhatásra is következtethetünk, amint az N-terminális esetén Prodromou és mtsai (1997/a), a C-terminális esetén mi (Sőti és Csermely, 1998/a) felvetettük. 13
Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre
Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola Pathobiokémia Program Doktori (Ph.D.) értekezés Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre dr. Nardai Gábor Témavezeto:
transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
1b. Fehérje transzport
1b. Fehérje transzport Fehérje transzport CITOSZÓL Nem-szekretoros útvonal sejtmag mitokondrium plasztid peroxiszóma endoplazmás retikulum Szekretoros útvonal lizoszóma endoszóma Golgi sejtfelszín szekretoros
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
2. A jelutak komponensei. 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék
Jelutak 2. A jelutak komponensei 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék Egy tipikus jelösvény sémája 1. Receptor fehérje Jel molekula (ligand; elsődleges
Jelutak. 2. A jelutak komponensei Egy tipikus jelösvény sémája. 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék
Jelutak 2. A jelutak komponensei 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék Egy tipikus jelösvény sémája Receptor fehérje Jel molekula (ligand; elsődleges
A citoszol szolubilis fehérjéi. A citoplazma matrix (citoszol) Caspase /Kaszpáz/ 1. Enzimek. - Organellumok nélküli citoplazma
A citoplazma matrix (citoszol) A citoszol szolubilis fehérjéi 1. Enzimek - Organellumok nélküli citoplazma -A sejt fejlődéstani szempontból legősibb része (a sejthártyával együtt) Glikolízis teljes enzimrendszere
Transzláció. Szintetikus folyamatok Energiájának 90%-a
Transzláció Transzláció Fehérje bioszintézis a genetikai információ kifejeződése Szükséges: mrns: trns: ~40 Riboszóma: 4 rrns + ~ 70 protein 20 Aminosav aktiváló enzim ~12 egyéb enzim Szintetikus folyamatok
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
A negyedleges szerkezet szerepe a kis hő-sokk fehérjék
A negyedleges szerkezet szerepe a kis hő-sokk fehérjék chaperon működésében Készítette: Böde Csaba Témavezető: Dr. Fidy Judit egyetemi tanár Semmelweis Egyetem Elméleti Orvostudományok Doktori Iskola Szigorlati
Jelutak. Apoptózis. Apoptózis Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút. apoptózis autofágia nekrózis. Sejtmag. Kondenzálódó sejtmag
Jelutak Apoptózis 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút Apoptózis Sejtmag Kondenzálódó sejtmag 1. autofágia nekrózis Lefűződések Összezsugorodás Fragmentálódó sejtmag Apoptotikus test Fagocita bekebelezi
A sejtfelszíni receptorok három fő kategóriája
A sejtfelszíni receptorok három fő kategóriája 1. Saját enzimaktivitás nélküli receptorok 1a. G proteinhez kapcsolt pl. adrenalin, szerotonin, glukagon, bradikinin receptorok 1b. Tirozin kinázhoz kapcsolt
Apoptózis. 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút
Jelutak Apoptózis 1. Bevezetés 2. Külső jelút 3. Belső jelút Apoptózis Sejtmag 1. Kondenzálódó sejtmag apoptózis autofágia nekrózis Lefűződések Összezsugorodás Fragmentálódó sejtmag Apoptotikus test Fagocita
A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata
Ph.D. ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata Buzás-Bereczki Orsolya Témavezetők: Dr. Bálint Éva Dr. Boros Imre Miklós Biológia
A sejtfelszíni receptorok három fő kategóriája
A sejtfelszíni receptorok három fő kategóriája 1. Saját enzimaktivitás nélküli receptorok 1a. G proteinhez kapcsolt pl. adrenalin, szerotonin, glukagon, bradikinin receptorok 1b. Tirozin kinázhoz kapcsolt
DNS replikáció. DNS RNS Polipeptid Amino terminus. Karboxi terminus. Templát szál
DNS replikáció DNS RNS Polipeptid Amino terminus Templát szál Karboxi terminus Szuper-csavarodott prokarióta cirkuláris DNS Hisztonok komplexe DNS hisztonokra történő felcsvarodása Hiszton-kötött negatív
Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban
Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban 3. előadás Az immunrendszer molekuláris elemei: antigén, ellenanyag, Ig osztályok Az antigén meghatározása Detre László: antitest generátor - Régi meghatározás:
Fehérje szintézis 2. TRANSZLÁCIÓ Molekuláris biológia kurzus 7. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt- és immunbiológiai Intézet
Fehérje szintézis 2. TRANSZLÁCIÓ Molekuláris biológia kurzus 7. hét Kun Lídia Genetikai, Sejt- és immunbiológiai Intézet Gén mrns Fehérje Transzkripció Transzláció A transzkriptum : mrns Hogyan mutatható
A glükóz reszintézise.
A glükóz reszintézise. A glükóz reszintézise. A reszintézis nem egyszerű megfordítása a glikolízisnek. A glikolízis 3 irrevezibilis lépése más úton játszódik le. Ennek oka egyrészt energetikai, másrészt
A stresszválasz és a membránok kapcsolata emlıs sejtekben
A stresszválasz és a membránok kapcsolata emlıs sejtekben DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS Szegedi Tudományegyetem Biológia Doktori Iskola Készítette: Nagy Enikı Témavezetı: Prof. Dr. Vígh László Magyar Tudományos
Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére.
Újabban világossá vált, hogy a Progesterone-induced blocking factor (PIBF) amely a progesteron számos immunológiai hatását közvetíti, nem csupán a lymphocytákban és terhességgel asszociált szövetekben,
OTKA ZÁRÓJELENTÉS
NF-κB aktiváció % Annexin pozitív sejtek, 24h kezelés OTKA 613 ZÁRÓJELENTÉS A nitrogén monoxid (NO) egy rövid féléletidejű, számos szabályozó szabályozó funkciót betöltő molekula, immunmoduláns hatása
Stresszfehérjék (hősokk fehérjék)
Stresszfehérjék (hősokk fehérjék) Ama különféle fehérjék összefoglaló elnevezése, amelyeket az élő sejtek a megemelkedett hőmérsékletre (a hősokkra) válaszul fokozott mértékben termelnek. A hősokk-fehérjék
Szignalizáció - jelátvitel
Jelátvitel autokrin Szignalizáció - jelátvitel Összegezve: - a sejt a,,külvilággal"- távolabbi szövetekkel ill. önmagával állandó anyag-, információ-, energia áramlásban áll, mely autokrin, parakrin,
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
Intelligens molekulákkal a rák ellen
Intelligens molekulákkal a rák ellen Kotschy András Servier Kutatóintézet Rákkutatási kémiai osztály A rákos sejt Miben más Hogyan él túl Áttekintés Rákos sejtek célzott támadása sejtmérgekkel Fehérjék
Receptorok és szignalizációs mechanizmusok
Molekuláris sejtbiológia: Receptorok és szignalizációs mechanizmusok Dr. habil Kőhidai László Semmelweis Egyetem Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet Sejtek szignalizációs kapcsolatai Sejtek szignalizációs
Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.
Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás. Az immunrendszer felépítése Veleszületett immunitás (komplement, antibakteriális
TRANSZPORTFOLYAMATOK 1b. Fehérjék. 1b. FEHÉRJÉK TRANSZPORTJA A MEMBRÁNONOKBA ÉS A SEJTSZERVECSKÉK BELSEJÉBE ÁLTALÁNOS
1b. FEHÉRJÉK TRANSZPORTJA A MEMBRÁNONOKBA ÉS A SEJTSZERVECSKÉK BELSEJÉBE ÁLTALÁNOS DIA 1 Fő fehérje transzport útvonalak Egy tipikus emlős sejt közel 10,000 féle fehérjét tartalmaz (a test pedig összesen
Natív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok
Natív antigének felismerése B sejt receptorok, immunglobulinok B és T sejt receptorok A B és T sejt receptorok is az immunglobulin fehérje család tagjai A TCR nem ismeri fel az antigéneket, kizárólag az
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterkézés megfeleltetése az Euróai Unió új társadalmi kihívásainak a écsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMO-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi biotechnológiai
A T sejt receptor (TCR) heterodimer
Immunbiológia - II A T sejt receptor (TCR) heterodimer 1 kötőhely lánc lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma V V C C EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL lánc: VJ régió lánc: VDJ régió Nincs szomatikus
TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)
Biokémia és molekuláris biológia I. kurzus (bb5t1301) Tematika 1 TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301) 0. Bevezető A (a biokémiáról) (~40 perc: 1. heti előadás) A BIOkémia tárgya
(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.
Immunbiológia II A T sejt receptor () heterodimer α lánc kötőhely β lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma 1 V α V β C α C β EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL αlánc: VJ régió β lánc: VDJ régió Nincs
Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata
Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének Kutatási előzmények Az ABC transzporter membránfehérjék az ATP elhasítása (ATPáz aktivitás) révén nyerik az energiát az általuk végzett
Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer
Immunológia alapjai 10. előadás Komplement rendszer A gyulladás molekuláris mediátorai: Miért fontos a komplement rendszer? A veleszületett (nem-specifikus) immunválasz része Azonnali válaszreakció A veleszületett
Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B- sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a écsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMO-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
A citoszkeletális rendszer
A citoszkeletális rendszer A citoszkeletális filamentumok típusai, polimerizációja, jellemzıik, mechanikai tulajdonságaik. Asszociált fehérjék 2013.09.24. Citoszkeleton Fehérjékbıl felépülı, a sejt vázát
Glikolízis. Csala Miklós
Glikolízis Csala Miklós Szubsztrát szintű (SZF) és oxidatív foszforiláció (OF) katabolizmus Redukált tápanyag-molekulák Szállító ADP + P i ATP ADP + P i ATP SZF SZF Szállító-H 2 Szállító ATP Szállító-H
Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
Az endomembránrendszer részei.
Az endomembránrendszer Szerkesztette: Vizkievicz András Az eukarióta sejtek prokarióta sejtektől megkülönböztető egyik alapvető sajátságuk a belső membránrendszerük. A belső membránrendszer szerkezete
Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B- sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
Immunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.
Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás. Antigén felismerés Az ellenanyagok és a B sejt receptorok natív formában
Biológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek
Biológus MSc Molekuláris biológiai alapismeretek A nukleotidok építőkövei A nukleotidok szerkezete Nukleotid = N-tartalmú szerves bázis + pentóz + foszfát N-glikozidos kötés 5 1 4 2 3 (Foszfát)észter-kötés
Új, sejthalált befolyásoló tumor-asszociált fehérjék azonosítása. Dr. Szigeti András. PhD tézis. Programvezető: Dr. Balázs Sümegi, egyetemi tanár
Új, sejthalált befolyásoló tumor-asszociált fehérjék azonosítása Dr. Szigeti András PhD tézis Programvezető: Dr. Balázs Sümegi, egyetemi tanár Pécsi Tudományegyetem, Biokémiai és Orvosi Kémiai Intézet
A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.
Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak
A Caskin1 állványfehérje vizsgálata
A Caskin1 állványfehérje vizsgálata Doktori tézisek Balázs Annamária Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola Témavezeto: Dr. Buday László egyetemi tanár, az orvostudományok doktora
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA 2013.10.09. CITOSZKELETON - DEFINÍCIÓ Fehérjékből felépülő, a sejt vázát alkotó intracelluláris rendszer. Eukarióta és prokarióta sejtekben egyaránt megtalálható.
Immunológia alapjai előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B-sejt receptorok:
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B-sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
13. RNS szintézis és splicing
13. RNS szintézis és splicing 1 Visszatekintés: Az RNS típusai és szerkezete Hírvivő RNS = mrns (messenger RNA = mrna) : fehérjeszintézis pre-mrns érett mrns (intronok kivágódnak = splicing) Transzfer
Darvas Zsuzsa László Valéria. Sejtbiológia. Negyedik, átdolgozott kiadás
Darvas Zsuzsa László Valéria Sejtbiológia Negyedik, átdolgozott kiadás Írták: DR. DARVAS ZSUZSA egyetemi docens Semmelweis Egyetem Genetikai, Sejtés Immunbiológiai Intézet DR. LÁSZLÓ VALÉRIA egyetemi docens
avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest
Iparilag alkalmazható szekvenciák, avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest Neutrokin α - jelentős kereskedelmi érdekek
Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben. Doktori tézisek. Dr. Szidonya László
Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben Doktori tézisek Dr. Szidonya László Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola Témavezető:
A plazma membrán mikrodomének szabályzó szerepe a sejtek növekedési és stressz érzékelési folyamataiban. Csoboz Bálint
A PhD értekezés összefoglalása A plazma membrán mikrodomének szabályzó szerepe a sejtek növekedési és stressz érzékelési folyamataiban Csoboz Bálint Témavezető: Prof. László Vígh Biológia Doktori Iskola
Sejt - kölcsönhatások az idegrendszerben
Sejt - kölcsönhatások az idegrendszerben dendrit Sejttest Axon sejtmag Axon domb Schwann sejt Ranvier mielinhüvely csomó (befűződés) terminális Sejt - kölcsönhatások az idegrendszerben Szinapszis típusok
Hamar Péter. RNS világ. Lánczos Kornél Gimnázium, Székesfehérvár, 2014. október 21. www.meetthescientist.hu 1 26
Hamar Péter RNS világ Lánczos Kornél Gimnázium, Székesfehérvár, 2014. október 21. 1 26 Főszereplők: DNS -> RNS -> fehérje A kód lefordítása Dezoxy-ribo-Nuklein-Sav: DNS az élet kódja megkettőződés (replikáció)
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata AKI kíváncsi kémikus kutatótábor 2017.06.25-07.01. Témavezetők : Telbisz Ágnes, Horváth Tamás Kutatók : Dobolyi Zsófia, Bereczki Kristóf, Horváth Ákos Gyógyszerrezisztencia
ÖSSZ-TARTALOM 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás
Jelutak ÖSSZ-TARTALOM 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi- és hormonális kommunikáció 3. előadás Jelutak 1. a sejtkommunikáció alapjai 1. Bevezetés
2006 1. Nemszinaptikus receptorok és szubmikronos Ca2+ válaszok: A két-foton lézermikroszkópia felhasználása a farmakológiai vizsgálatokra.
2006 1. Nemszinaptikus receptorok és szubmikronos Ca 2+ válaszok: A két-foton lézermikroszkópia felhasználása a farmakológiai vizsgálatokra. A kutatócsoportunkban Közép Európában elsőként bevezetett két-foton
Immunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer
Immunológia alapjai 16. előadás Komplement rendszer A gyulladás molekuláris mediátorai: Plazma enzim mediátorok: - Kinin rendszer - Véralvadási rendszer Lipid mediátorok Kemoattraktánsok: - Chemokinek:
Jelutak ÖSSZ TARTALOM. Jelutak. 1. a sejtkommunikáció alapjai
Jelutak ÖSSZ TARTALOM 1. Az alapok 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi és hormonális kommunikáció 3. előadás Jelutak 1. a sejtkommunikáció alapjai 1. Bevezetés
sejt működés jovo.notebook March 13, 2018
1 A R É F Z S O I B T S Z E S R V E Z D É S I S E Z I N E T E K M O I B T O V N H C J W W R X S M R F Z Ö R E W T L D L K T E I A D Z W I O S W W E T H Á E J P S E I Z Z T L Y G O A R B Z M L A H E K J
1. Előadás Membránok felépítése, mebrán raftok
1. Előadás Membránok felépítése, mebrán raftok Plazmamembrán Membrán funkciói: sejt integritásának fenntartása állandó hő, energia, és információcsere biztosítása homeosztázis biztosítása Klasszikus folyadékmozaik
Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására
Szalma Katalin Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására Témavezető: Dr. Turai István, OSSKI Budapest, 2010. október 4. Az ionizáló sugárzás sejt kölcsönhatása Antone
Fehérjeszerkezet, és tekeredés
Fehérjeszerkezet, és tekeredés Futó Kinga 2013.10.08. Polimerek Polimer: hasonló alegységekből (monomer) felépülő makromolekulák Alegységek száma: tipikusan 10 2-10 4 Titin: 3,435*10 4 aminosav C 132983
A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.
A doktori értekezés tézisei A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. Bíró Judit Témavezető: Dr. Fehér Attila Magyar Tudományos Akadémia
Az Ig génátrendeződés
Az Ig génátrendeződés Háromféle változás játszódik le a molekula szerkezetét tekintve: B sejtek fejlődése alatt: VDJ átrendeződés (rekombináció) IgH izotípusváltás rekombináció (CSR) Szomatikus hipermutáció
Biofizika I 2013-2014 2014.12.02.
ÁTTEKINTÉS AZ IZOM TÍPUSAI: SZERKEZET és FUNKCIÓ A HARÁNTCSÍKOLT IZOM SZERKEZETE MŰKÖDÉSÉNEK MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSA IZOM MECHANIKA Biofizika I. -2014. 12. 02. 03. Dr. Bugyi Beáta PTE ÁOK Biofizikai Intézet
ERD14: egy funkcionálisan rendezetlen dehidrin fehérje szerkezeti és funkcionális jellemzése
Doktori értekezés tézisei ERD14: egy funkcionálisan rendezetlen dehidrin fehérje szerkezeti és funkcionális jellemzése DR. SZALAINÉ ÁGOSTON Bianka Ildikó Témavezetők Dr. PERCZEL András egyetemi tanár és
POSZTTRANSZLÁCIÓS MÓDOSÍTÁSOK: GLIKOZILÁLÁSOK
POSZTTRANSZLÁCIÓS MÓDOSÍTÁSOK: GLIKOZILÁLÁSOK Dr. Pécs Miklós Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem, Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudomány Tanszék 1 Glikozilálás A rekombináns fehérjék
~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:
~ 1 ~ Bevezetés és célkitűzések A sejtekben egy adott időpillanatban expresszált fehérjék összessége a proteom. A kvantitatív proteomika célja a proteom, egy adott kezelés vagy stimulus hatására bekövetkező
Doktori értekezés tézisei
Doktori értekezés tézisei A komplement- és a Toll-szerű receptorok kifejeződése és szerepe emberi B-sejteken fiziológiás és autoimmun körülmények között - az adaptív és a természetes immunválasz kapcsolata
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
1. előadás Membránok felépítése, mebrán raftok, caveolák jellemzője, funkciói
1. előadás Membránok felépítése, mebrán raftok, caveolák jellemzője, funkciói Plazmamembrán Membrán funkciói: sejt integritásának fenntartása állandó hő, energia, és információcsere biztosítása homeosztázis
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
A plazmamembrán típusú Ca 2+ ATPáz intramolekuláris kölcsönhatásainak vizsgálata
A plazmamembrán típusú Ca 2+ ATPáz intramolekuláris kölcsönhatásainak vizsgálata Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei Padányi Rita Témavezetok: Dr. Enyedi Ágnes Dr. Sarkadi Balázs Semmelweis Egyetem Doktori
Antigén, Antigén prezentáció
Antigén, Antigén prezentáció Biológiai Intézet Immunológiai Tanszék Bajtay Zsuzsa ELTE, TTK Biológiai Intézet Immunológiai Tanszék ORFI Klinikai immunológia tanfolyam, 2019. február. 26 Bev. 2. ábra Az
Egy idegsejt működése
2a. Nyugalmi potenciál Egy idegsejt működése A nyugalmi potenciál (feszültség) egy nem stimulált ingerelhető sejt (neuron, izom, vagy szívizom sejt) membrán potenciálját jelenti. A membránpotenciál a plazmamembrán
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL Az egyes biomolekulák izolálása kulcsfontosságú a biológiai szerepük tisztázásához. Az affinitás kromatográfia egyszerűsége, reprodukálhatósága
A légzési lánc és az oxidatív foszforiláció
A légzési lánc és az oxidatív foszforiláció Csala Miklós Semmelweis Egyetem Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet intermembrán tér Fe-S FMN NADH mátrix I. komplex: NADH-KoQ reduktáz
A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai
A BIOLÓGIA ALAPJAI A tananyag felépítése: Környezetmérnök és műszaki menedzser hallgatók számára Előadó: 2 + 0 + 0 óra, félévközi számonkérés 3 ZH: október 3, november 5, december 5 dr. Pécs Miklós egyetemi
Vérszérum anyagcseretermékek jellemzése kezelés alatt lévő tüdőrákos betegekben
http://link.springer.com/article/10.1007/s11306-016-0961-5 - Nyitott - Ingyenes Vérszérum anyagcseretermékek jellemzése kezelés alatt lévő tüdőrákos betegekben http://link.springer.com/article/10.1007/s11306-016-0961-5
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: Az orvosi biotechnológiai mesterképzés
MedInProt Szinergia IV. program. Szerkezetvizsgáló módszer a rendezetlen fehérjék szerkezetének és kölcsönhatásainak jellemzésére
MedInProt Szinergia IV. program Szerkezetvizsgáló módszer a rendezetlen fehérjék szerkezetének és kölcsönhatásainak jellemzésére Tantos Ágnes MTA TTK Enzimológiai Intézet, Rendezetlen fehérje kutatócsoport
A citoszkeleton Eukarióta sejtváz
A citoszkeleton Eukarióta sejtváz - Alak és belső szerkezet - Rugalmas struktúra sejt izomzat - Fehérjékből épül fel A citoszkeleton háromféle filamentumból épül fel Intermedier filamentum mikrotubulus
A sejtciklus szabályozása
Molekuláris sejtbiológia A sejtciklus szabályozása? Dr. habil.. Kőhidai László Semmelweis Egyetem Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet Sejtciklus fázisai S G 2 G 0 G 1 M G = gap gap S = synthesis
Összefoglalók Kémia BSc 2012/2013 I. félév
Összefoglalók Kémia BSc 2012/2013 I. félév Készült: Eötvös Loránd Tudományegyetem Kémiai Intézet Szerves Kémiai Tanszékén 2012.12.17. Összeállította Szilvágyi Gábor PhD hallgató Tartalomjegyzék Orgován
Glikolízis. emberi szervezet napi glukózigénye: kb. 160 g
Glikolízis Minden emberi sejt képes glikolízisre. A glukóz a metabolizmus központi tápanyaga, minden sejt képes hasznosítani. glykys = édes, lysis = hasítás emberi szervezet napi glukózigénye: kb. 160
Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót
Az X kromoszóma inaktívációja A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Férfiak: XY Nők: XX X kromoszóma: nagy méretű több mint 1000 gén Y kromoszóma: kis méretű, kevesebb, mint 100 gén Kompenzációs
Az ellenanyagok szerkezete és funkciója. Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE
Az ellenanyagok szerkezete és funkciója Erdei Anna Immunológiai Tanszék ELTE Bev. 1. ábra Immunhomeosztázis A veleszületett és az adaptív immunrendszer szorosan együttműködik az immunhomeosztázis fenntartásáért
Fehérjeglikoziláció az endoplazmás retikulumban mint lehetséges daganatellenes támadáspont
Fehérjeglikoziláció az endoplazmás retikulumban mint lehetséges daganatellenes támadáspont Doktori tézisek Dr. Konta Laura Éva Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola
Immunológia alapjai. Az immunválasz szupressziója Előadás. A szupresszióban részt vevő sejtes és molekuláris elemek
Immunológia alapjai 19 20. Előadás Az immunválasz szupressziója A szupresszióban részt vevő sejtes és molekuláris elemek Mi a szupresszió? Általános biológiai szabályzó funkció. Az immunszupresszió az
Vásárhelyi Barna. Semmelweis Egyetem, Laboratóriumi Medicina Intézet. Az ösztrogénekimmunmoduláns hatásai
Vásárhelyi Barna Semmelweis Egyetem, Laboratóriumi Medicina Intézet Az ösztrogénekimmunmoduláns hatásai Ösztrogénhatások Ösztrogénhatások Morbiditás és mortalitási profil eltérő nők és férfiak között Autoimmun
A biokémia alapjai. Typotex Kiadó. Wunderlich Lívius Szarka András
A biokémia alapjai Wunderlich Lívius Szarka András Összefoglaló: A jegyzet elsősorban egészségügyi mérnök MSc. hallgatók részére íródott, de hasznos segítség lehet biomérnök és vegyészmérnök hallgatók
Transzporterek vizsgálata lipidmembránokban Sarkadi Balázs MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport, MTA-TTK Budapest
Transzporterek vizsgálata lipidmembránokban 2016. Sarkadi Balázs MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport, MTA-TTK Budapest Membrántranszport fehérjék típusok, lipid-kapcsolatok A membránok szerkezete
NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A NÖVÉNYI TÁPANYAG TRANSZPORTEREK az előadás áttekintése A tápionok útja a növényben Növényi tápionok passzív és
Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése
Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése Doktori tézisek Dr. Cserepes Judit Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola
RÉSZLETES SZAKMAI BESZÁMOLÓ
RÉSZLETES SZAKMAI BESZÁMOLÓ 1. A Renox (Nox4)-deficiens egérmodell létrehozása Az OTKA pályázat keretében végzett kutatások egyik legfontosabb eredménye, hogy sikerült létrehozni egy Nox4 (Renox)-deficiens
NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010
NÖVÉNYÉLETTAN Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 Sejtfal szintézis és megnyúlás Környezeti tényezők hatása a növények növekedésére és fejlődésére Előadás áttekintése