Az oxitocinreceptor genetikai variabilitásának in silico elemzése
|
|
- Zita Faragó
- 8 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 Az oxitocinreceptor genetikai variabilitásának in silico elemzése Marx Péter 1, Arany Ádám 1, Rónai Zsolt 2, Antal Péter 1 és Sasvári-Székely Mária 2 1 Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem, Méréstechnika és Információs Rendszerek Tanszék, Budapest 2 Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet, Budapest Az oxitocinreceptor gén (OXTR) polimorfizmusait kiterjedten vizsgálják bizonyos pszichológiai jellegek és pszichiátriai rendellenességek vonatkozásában, az eredmények azonban ellentmondásosak. Ennek egyik oka az lehet, hogy az OXTR génben több mint 270 SNP-t (single nucleotide polymorphism) azonosítottak, melyek molekuláris funkciója általában nem ismert. Célkitűzések: Vizsgálataink célja a humán és a kutya oxitocinreceptor genetikai variabilitásának in silico elemzése volt. Eredmények: A humán és a kutya OXTR aminosav szekvencia összehasonlító analízise szerint a legerőteljesebb különbség egy olyan, 5 aminosav hosszú szakasz, ami a kutya receptorából hiányzik, míg a humán fehérjében megvan. A kutya oxitocinreceptor aminosav szekvenciáját in silico kiegészítve ezzel az öt aminosavval lényeges változást tapasztaltunk a receptor intracelluláris régiójának térszerkezetében. Következtetés: Az OXTR génváltozatok fajon belüli és a fajok közti in silico hasonlósági analízise fontos szerepet kaphat a genetikai variánsok funkcionális eltéréseinek megjóslásában. (Neuropsychopharm Hung 2011; 13(3): ; doi: /nph ) Kulcsszavak: oxitocin, receptor, polimorfizmus, humán, kutya Az oxitocin egy kilenc aminosavból álló peptid, melynek két cisztein oldalláncát összekötő diszulfid hídja a peptid láncával gyűrűt alkot. Az oxitocinreceptor egy 7 transzmembrán domaint tartalmazó, G-fehérjéhez kötött receptor típus. Legfontosabb jellemzője a G q fehérje által mediált inozitol-trifoszfát jelátvitel, mely serkentő jellegű a célsejtre, és hatására megemelkedik az intracelluláris Ca 2+ koncentráció. Ugyanakkor további jelátviteli utak érintettsége is ismert, mint például a G s és G i fehérjék által mediált adenilát-cikláz aktiváció és gátlás (Viero et al., 2010). A centrális és periferiális oxitocin forrása egyaránt a hipotalamusz, de a perifériára jutott peptid rossz vér-agy gát penetrációja, és a szekréció eltérő mechanizmusa miatt a két rendszer működése bizonyos vonatkozásokban függetlennek tekinthető. A centrális oxitocin számos, kulcsfontosságú folyamatban játszik szerepet, mint például a tejelválasztás megindításában, a reproduktív viselkedés, szülő-gyermek kötődés, általában a szociális kötődés, illetve szociális memória szabályozásában (Viero et al., 2010). Humán pszichológiai vizsgálatokban kimutatták, hogy a nazálisan adagolt peptid növeli a partnerrel szembeni bizalmat, és csökkenti az alany bizalmával történő visszaélés okozta averziót (Baumgartner et al., 2008). Érdemes megjegyezni, hogy a nazálisan adagolt peptid feltehetően az extracelluláris téren át éri el a liquort, és nem szükséges átjutnia az vér-agy gáton (Born et al., 2002). Számos eredmény utal arra, hogy a centrális oxitocinrendszer és dopaminrendszer interakciója igen fontos. Ismert például a jutalmazási rendszer, a depresszió és a függőség vonatkozásában fontos dopaminerg pályák és az oxitocinreceptor expresszió átfedése (Baskerville and Douglas, 2010). Funkcionális MRI vizsgálatokkal azt is kimutatták, hogy szociális helyzetekben történő oxitocin adagolás hatására csökken az amygdala és az általa aktivált agytörzs félelmi efferens zónáinak aktivitása (Baumgartner et al., 2008; Kirsch et al., 2005). Az oxitocin azonban nemcsak a dopaminerg rendszerrel áll kölcsönhatásban, hasonló eredményeket kaptak a szerotonerg rendszer vonatkozásában is (Emiliano et al., 2007; Galfi et al., 2005). Korábbi eredményeinkben beszámoltunk a szerotonerg rendszer és a depresszió összefüggéseiről (Domotor et al., 2007), továbbá részletesen vizsgáltuk a dopaminerg polimorfizmusok hatásait gyermekkori figyelemhiányos hiperaktivitási zavarban (Mozes et al., 2010; Kereszturi et al., 2007), a drogfüggőség (Szilagyi et al., 2005; Vereczkei et al., 2009), a dohányzás (Kotyuk et al., 2009) és a személyiség (Szilagyi et al., 2005) vonatkozásában, valamint a szülő-gyermek kötődési típusok viszonylatában (Birkas et al., Neuropsychopharmacologia Hungarica XIII. évf. 3. szám 139
2 e r e d e t i kö z l e m é n y Marx Péter és mtsai 2005). Pszichogenetikai vizsgálatainkat újabban az oxitocinreceptor gén (OXTR) allélvariánsainak irányába szeretnénk kiterjeszteni. Ehhez azonban érdemesnek tűnt elméleti szempontból megvizsgálni, hogy a számos OXTR egypontos nukleotid polimorfizmusok (single nucleotid polymorphism, SNP) közül melyeknek lehet funkcionális hatása. A jelen vizsgálatban in silico módszerekkel tanulmányoztuk a fajon belüli és fajok közti eltéréseket az OXTR génrégióban. MÓDSZEREK Felhasznált adatbázisok Az OXTR gén in silico vizsgálatához a két legismertebb adatbázist NCBI (Sherry et al., 2001) és Ensembl (Flicek et al., 2011) használtuk fel. A két, egymástól független adatbázisból származó adatok összehasonlító analízise lehetővé tette számunkra az adatok validálását. Ahol a két adatbázisban különbségek adódtak, ott más fajok oxitocinreceptorának aminosav szekvenciájának összehasonlító analízisével azonosítottuk a megbízható szekvencia verziót. Számítási módszerek DNS szekvenciák illesztéséhez elsősorban a Basic Logical Alignment Search Tool-t (BLAST) (Altschul et al., 1990) alkalmaztuk blastn és blastp algoritmusokkal. A BLAST bemenete egy vagy több DNS szekvencia volt. Ha bemenetként egyetlen szekvenciát használunk, az algoritmus ezt az NCBI adatbázisában szereplő más szekvenciákhoz hasonlítja. Több DNS szekvencia megadásánál az egymáshoz képesti hasonlóságok, illetve különbségek állapíthatóak meg. Eredményként megkapjuk a hasonlóság szerint sorba rendezett szekvenciákat. A fehérje szekvencia vizsgálatokhoz alkalmazott pblast hasonló elvek alapján működik, de más paramétereket használ a hasonlóság pontozására. Mindkét esetben az alapértelmezett beállításokkal használtuk az algoritmusokat. A filogenetikai fa számításához a ClustalW2 Phylogeny eszközét használtuk, melyhez a bemenetet a ClustalW2 (Chenna et al., 2003) programmal generáltuk, majd az Interactive Tree of Life (itol) (Letunic and Bork, 2007; Letunic and Bork, 2011) eszköz felhasználásával jelenítettük meg. A fehérjék szerkezetének jóslására az I-TASSER (Roy et al., 2010; Zhang, 2008) programot használtuk. Jósági mérceként pedig a C-score értékét alkalmaztuk, ami egy -5 és 2 közötti értékkel becsli a predikált fehérje szerkezet valósághűségét (minél nagyobb a C-score, annál pontosabb a predikció). EREDMÉNYEK A humán OXTR gén variabilitása A humán genom szekvenciára és annak variabilitására vonatkozó információk igen kiterjedtek, és ezen adatok legnagyobb része szabadon hozzáférhető különböző adatbázisokban. A humán OXTR génben a jelen közlemény írásának időpontjában összesen 275 SNP ismert. A genetikai variánsok ezen nagy halmazából kiválogattuk azokat, amelyekről feltételezhető, hogy módosítják a fehérje felépítését, vagy hatással lehetnek a képződő fehérje mennyiségére. Így elsősorban exonokra eső, illetve olyan, nem átíródó (untranslated region, UTR) régiók SNP-it vizsgáltuk, melyek közel esnek a kódoló régióhoz. További fontos 1. táblázat A humán OXTR gén valószínűsíthetően funkcionális SNP-i Kromoszóma pozíció SNP rs száma Minor allél frekvencia (MAF) Funkció Allél Kódolt aminosav rs missense A Thr[T] contig ref. G Ala[A] rs UTR G/T rs UTR A/C rs UTR A/G rs UTR A/G rs UTR C/T 140 Neuropsychopharmacologia Hungarica XIII. évf. 3. szám
3 Az oxitocinreceptor genetikai variabilitásának in silico elemzése e r e d e t i kö z l e m é n y 1. ábra Néhány faj oxitocinreceptora által meghatározott filogenetikai fa 0.1 Canis lupus-familiaris Sus-scrofa Bos-taurus Ovis-aries Macaca-mulatta Homo-sapiens Pan-troglodytes Mus-musculus Rattus-norvegicus Oryctolagus-cuniculus Gallus-gallus A latin nevek magyar megfelelői: Canis lupus familiaris - kutya, Sus scrofa - vaddisznó, Bos taurus - szarvasmarha, Ovis aries juh, Macaca mulatta rhesus majom, Homo sapiens ember, Pan troglodytes csimpánz, Mus musculus egér, Rattus norvegicus patkány, Gallus gallus tyúk, Oryctolagus cuniculus házinyúl. Az ábrán látható legfelső vonal 0.1 távolságnak megfelelő hosszúságú. Ez alapján látható az egyes fajok gyökértől való távolsága (az elágazások sorrendjének nincs jelentősége). A szekvencia illesztéshez és a filogenetikai fa számításához a ClustalW2 míg a fa megjelenítéséhez az itol programot használtuk fel. szempont volt, hogy a minor allél frekvencia (MAF, az SNP két allélja közül a ritkábbik allél gyakorisága) nagyobb legyen 5%-nál. Ezen feltételek mellett jelentősen lecsökkent az analizálandó SNP-k száma. A fenti feltételeknek megfelelő humán SNP-ket az 1. táblázat tartalmazza. A táblázatban látható, hogy egyetlen olyan SNP ismert, amely a kódoló régióba esik, és allél frekvenciája nem túlságosan alacsony (13% körüli). Az 5 UTR szakaszban 2 db, a 3 UTR szakaszban 3 db olyan SNP-t találtunk, mely megfelelt a fenti feltételeknek. Ezekben az esetekben a MAF értéke 10-25% közötti értéknek mutatkozott. Az oxitocinreceptor aminosav szekvenciájának fajok közti hasonlósága A genetikai variabilitás másik megközelítési módja az egyes fajok közti eltérés vizsgálata. A filogenetikai fa építéséhez az egyes fajok OXTR aminosav szekvenciáit használtuk fel, és a ClustalW2 Phylogeny eszközével generáltuk a fajok közti távolságokat, az eredményt az itol program segítségével jelenítettünk meg (1. ábra). Eredményeink azt mutatják, hogy csupán egyetlen gén, az OXTR vizsgálata alapján is lehetséges a fajokat különböző rendek és osztályok szerint csoportosítani. Esetünkben a páros ujjú patások kerülnek egy ágra, ahogy az egér és a patkány, ember és csimpánz. Sajnos az OXTR szekvencia sok faj esetében nem hozzáférhető, így vannak olyan ágak, ahol kevés vagy egyetlen faj szerepel, például a kutya. Ugyanakkor a fa jól prezentálja az egyes fajok közötti különbségeket, például a csirke, a madarak egyedüli képviselője messzire kerül az emlősöktől. A humán és kutya oxitocinreceptor aminosav szekvenciájának összehasonlítása Bár a kutya genomja már egy ideje ismert (Wayne and Ostrander, 2007), az egyes gének variabilitásáról viszonylag keveset tudunk, mivel a kutya genomjában található SNP-k csak néhány állat genetikai analíziséből származnak, így bizonytalan és hiányos információk állnak rendelkezésre. Ugyanakkor a humán és a kutya OXTR gén által kódolt fehérje hasonlósága igen nagyfokúnak tűnik, és a meglévő különbségek analízise hipotézisünk szerint rámutathat a fehérje funkcionális variabilitására. A kutya és az ember oxitocinreceptor aminosav szekvenciájának összehasonlító elemzésével a következő eredményeket kaptuk. A humán fehérje 389, míg a kutya 384 aminosav hosszúságú. 26 ponton van eltérő aminosav, ezek közül 8 esetben az eltérő aminosavak főbb kémiai tulajdonságai megegyeznek (polaritás, saverősség). A legerőteljesebb különbségnek az tűnik, hogy a humán OXTR tartalmaz egy olyan, 5 aminosav hosszú szakaszt, ami a kutya génből hiányzik. A különbség funkcionális jelentőségét alátámasztják az Uniprot (TheUniProtConsortium, Neuropsychopharmacologia Hungarica XIII. évf. 3. szám 141
4 e r e d e t i kö z l e m é n y Marx Péter és mtsai 2. ábra A kutya OXTR gén által meghatározott és a humán-specifikus szekvenciával kiegészített oxitocinreceptor szerkezet A kétféle aminosav szekvencia alapján predikált fehérje szerkezet számítása és ábrázolása az I-TASSER segítségével készült. A beillesztett 5 aminosav által létrehozott változást piros nyíllal jelöltük. A baloldali, eredeti (kutya) fehérjén egy hosszabb alfa hélix (sárga színnel jelölve) látható, melyet rövidebb hurok követ, míg a jobb oldalt látható, módosított fehérjén rövidebb a már említett hélix és hosszabb a hurok. 2011) adatbázisának adatai, mely szerint ez a humánspecifikus régió a citoplazmába esik, így hatással lehet a G fehérjékhez való kötődésre. In silico vizsgálatainkkal alá kívántuk támasztani a fenti feltételezést azzal, hogy megvizsgáljuk, mi lenne a hatása annak, ha a kutya fehérje tartalmazná ezt a humán specifikus szakaszt. Ezért összehasonlító analízist végeztünk a kutya eredeti aminosav szekvenciája által meghatározott, és az eredeti szekvenciát a humán specifikus darabbal mesterségesen kiegészített fehérje térszerkezete között, a prediktált fehérje szerkezeteket a 2. ábra mutatja. A két fehérje C-score mutatója (-0.04 az eredeti, és a módosított fehérje esetén) hasonló, vagyis a predikció megbízhatónak tűnik. Ugyanakkor jól látható, hogy az ábrán piros nyíllal jelölt szekvenciarészlet jelentősen eltér a két változatban, azaz a humán specifikus darab inszerciója jelentősen módosítja a receptor fehérje citoplazmatikus részének (az ábrán a felső rész) térszerkezetét. MEGBESZÉLÉS A humán OXTR gén polimorfizmusait számos pszichogenetikai asszociáció vizsgálatban tanulmányozták, az eredmények a genetikai asszociációs vizsgálatok jelenlegi általános helyzetét jelzik, amely szerint a populációs rétegződés, episztatikus hatások, ritka variánsok, epigenetikus hatások és környezeti hatások szerepe miatt a funkcionális, oksági és rendszerszintű megértés/hipotézisek még csupán körvonalazódnak. Az autizmus az egyik legtöbbet tanulmányozott pszichiátriai rendellenesség az OXTR génvariánsok vonatkozásában, mely pozitív (Lerer et al., 2008) és negatív (Tansey et al., 2010) eredményeket is szolgáltatott. Hasonlóan sokat tanulmányozott, de vitás kérdés az OXTR polimorfizmusok és a szociális tanulás összefüggése (Park et al., 2010), illetve a depresszióval való összefüggés is (Costa et al., 2009). Az ellentmondások egyik forrása lehet az is, hogy az OXTR gén számos génvariánsából az 142 Neuropsychopharmacologia Hungarica XIII. évf. 3. szám
5 Az oxitocinreceptor genetikai variabilitásának in silico elemzése E r e d e t i kö z l e m é n y egyes vizsgálatok más-más SNP-ket választanak ki az analízishez, de nem elhanyagolható az oxitocin és más neurotranszmitter rendszerek kölcsönhatásának jelentősége sem. A jelen dolgozatban megvizsgáltuk az oxitocinreceptor genetikai variabilitását a humán fajon belül, illetve fajok között. Eredményeink azt mutatják, hogy a fajok közti eltérés nagyjából követi a filogenezisről alkotott képünket. Kiemelendő ugyanakkor, hogy az emberi és a kutya oxitocinreceptor aminosav szekvenciája meglehetősen hasonló. A legjellemzőbb eltérésnek az az 5 aminosav hosszúságú szakasz tűnik, mely a humán fehérjében benne van ( humán-specifikus darab ), míg a kutyából hiányzik. Megvizsgálva a humán specifikus darab szerepét in silico, azt találtuk, hogy a kutya receptor intracelluláris régiójának térszerkezetét ez az inszerció lényegesen megváltoztatja. Hasonló jellegű vizsgálatok még nem jelentek meg a szakirodalomban. Eredményeinket limitálja az a tény, hogy mindez csupán számítógépes predikción alapul. Farmakológiai vonatkozások Az oxitocinreceptor agonisták és antagonisták fejlesztése a modern gyógyszeripar egyik fontos területe. Perifériális hatásai (például az agonisták szülést megindító, illetve az antagonisták koraszülés kockázatát csökkentő hatása) mellett reményeket fűznek a vér-agy gáton átjutó és orálisan aktív, nem-peptid agonisták további kedvező terápiás hatásaihoz. Ezen reménybeli hatások közé tartozik az anxiolitikus hatás kifejezetten szociális töltettel rendelkező szorongásos kórképek kezelésében, proszociális hatások az autizmus spektrum különböző kórképeiben (Hollander et al., 2007), illetve kábítószer dependencia rehabilitációja során elérhető hatás (Baskerville and Douglas, 2010). Várhatóak továbbá mindkét nemben jótékony hatások szexuális zavarokban, és a táplálék felvétel zavaraival együtt járó pszichiátriai kórképekben. Egyes adatok szerint az oxitocin intravénás infúzióban adva javítja az autisták és Asperger szindrómás betegek szociális képességeit, elsősorban a szociális információk felismerését és ezek bevésését (Hollander et al., 2007). Általánosságban elmondhatjuk, hogy az oxitocin agonisták és antagonisták farmakológiai hatásai nemcsak rendkívül szélesek, de igen reménykeltőek is. Keveset tudunk azonban az oxitocinreceptorra ható vegyületek farmakogenetikai vonatkozásairól, ezért a jelen munkában bemutatott genetikai variabilitás vizsgálat fontos adalék lehet az egyénre szabott gyógyszerterápia kialakításában. Köszönetnyilvánítás. Ez a munka az OTKA-PD tématámogatással, a TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KMR és az NKTH TECH 08-A1/ keretében készült. Rövidítésjegyzék. OXTR oxitocinreceptor gén, SNP single nucleotide polymorphism, MAF minor allél frekvencia. Levelezési cím: Dr. Sasvári Mária, Semmelweis Egyetem, Orv. Vegyt. Mol. Biol. és Patobiok. Int., H-1444 Budapest, Pf maria.sasvari@eok.sote.hu IRODALOM 1. Altschul, S. F., Gish, W., Miller, W., Myers, E. W., Lipman, D. J. (1990) Basic local alignment search tool. J Mol Biol, 215: Baskerville, T. A., Douglas, A. J. (2010) Dopamine and oxytocin interactions underlying behaviors: potential contributions to behavioral disorders. CNS Neurosci Ther, 16:e Baumgartner, T., Heinrichs, M., Vonlanthen, A., Fischbacher, U., Fehr, E. (2008) Oxytocin shapes the neural circuitry of trust and trust adaptation in humans. Neuron, 58: Birkas, E., Lakatos, K., Nemoda, Z., Ney, K., Toth, I., Novak, A., Sasvari-Szekely, M., Gervai, J. (2005) [Effects of the D4 dopamine receptor gene variation on behavior problems at 6 years of age]. Neuropsychopharmacol Hung, 7: Born, J., Lange, T., Kern, W., McGregor, G. P., Bickel, U., Fehm, H. L. (2002) Sniffing neuropeptides: a transnasal approach to the human brain. Nat Neurosci, 5: Chenna, R., Sugawara, H., Koike, T., Lopez, R., Gibson, T. J., Higgins, D. G., Thompson, J. D. (2003) Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs. Nucleic Acids Res, 31: Costa, B., Pini, S., Gabelloni, P., Abelli, M., Lari, L., Cardini, A., Muti, M., Gesi, C., Landi, S., Galderisi, S., Mucci, A., Lucacchini, A., Cassano, G. B., Martini, C. (2009) Oxytocin receptor polymorphisms and adult attachment style in patients with depression. Psychoneuroendocrinology, 34: Domotor, E., Sarosi, A., Balogh, G., Szekely, A., Hejjas, K., Sasvari-Szekely, M., Faludi, G. (2007) [Association of neurocognitive endophenotype and STin2 polymorphism in major depressive disorder]. Neuropsychopharmacol Hung, 9: Emiliano, A. B., Cruz, T., Pannoni, V., Fudge, J. L. (2007) The interface of oxytocin-labeled cells and serotonin transportercontaining fibers in the primate hypothalamus: a substrate for SSRIs therapeutic effects? Neuropsychopharmacology, 32: Flicek, P., Amode, M. R., Barrell, D., Beal, K., Brent, S., Chen, Y., Clapham, P., Coates, G., Fairley, S., Fitzgerald, S., Gordon, L., Hendrix, M., Hourlier, T., Johnson, N., Kahari, A., Keefe, D., Keenan, S., Kinsella, R., Kokocinski, F., Kulesha, E., Larsson, P., Longden, I., McLaren, W., Overduin, B., Pritchard, B., Riat, H. S., Rios, D., Ritchie, G. R., Ruffier, M., Schuster, M., Sobral, D., Spudich, G., Tang, Y. A., Trevanion, S., Vandrovcova, J., Vilella, A. J., White, S., Wilder, S. P., Zadissa, A., Zamora, J., Aken, B. L., Birney, E., Cunningham, F., Dunham, I., Durbin, R., Fernandez-Suarez, X. M., Herrero, J., Hubbard, T. J., Parker, A., Proctor, G., Vogel, J., Searle, S. M. (2011) Ensembl Nucleic Acids Res, 39:D Galfi, M., Radacs, M., Juhasz, A., Laszlo, F., Molnar, A., Laszlo, F. A. (2005) Serotonin-induced enhancement of vasopressin and oxytocin secretion in rat neurohypophyseal tissue culture. Regul Pept, 127: Neuropsychopharmacologia Hungarica XIII. évf. 3. szám 143
6 e r e d e t i kö z l e m é n y Marx Péter és mtsai 12. Hollander, E., Bartz, J., Chaplin, W., Phillips, A., Sumner, J., Soorya, L., Anagnostou, E., Wasserman, S. (2007) Oxytocin increases retention of social cognition in autism. Biol Psychiatry, 61: Kereszturi, E., Kiraly, O., Csapo, Z., Tarnok, Z., Gadoros, J., Sasvari-Szekely, M., Nemoda, Z. (2007) Association between the 120-bp duplication of the dopamine D4 receptor gene and attention deficit hyperactivity disorder: genetic and molecular analyses. Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet, 144B: Kirsch, P., Esslinger, C., Chen, Q., Mier, D., Lis, S., Siddhanti, S., Gruppe, H., Mattay, V. S., Gallhofer, B., Meyer-Lindenberg, A. (2005) Oxytocin modulates neural circuitry for social cognition and fear in humans. J Neurosci, 25: Kotyuk, E., Kovacs-Nagy, R., Faludi, G., Urban, R., Ronai, Z., Sasvari-Szekely, M., Szekely, A. (2009) [Association between nicotine dependence and the -521 promoter polymorfism of the dopamine D4 receptor in patients with major depression]. Neuropsychopharmacol Hung, 11: Lerer, E., Levi, S., Salomon, S., Darvasi, A., Yirmiya, N., Ebstein, R. P. (2008) Association between the oxytocin receptor (OXTR) gene and autism: relationship to Vineland Adaptive Behavior Scales and cognition. Mol Psychiatry, 13: Letunic, I., Bork, P. (2007) Interactive Tree Of Life (itol): an online tool for phylogenetic tree display and annotation. Bioinformatics, 23: Letunic, I., Bork, P. (2011) Interactive Tree Of Life v2: online annotation and display of phylogenetic trees made easy. Nucleic Acids Res. 19. Mozes, V., Bence, M., Sasvari-Szekely, M., Keszler, G. (2010) [Dopamine D4 receptor hypoxia sensitivity and child psychiatric disorders]. Neuropsychopharmacol Hung, 12: Park, J., Willmott, M., Vetuz, G., Toye, C., Kirley, A., Hawi, Z., Brookes, K. J., Gill, M., Kent, L. (2010) Evidence that genetic variation in the oxytocin receptor (OXTR) gene influences social cognition in ADHD. Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry, 34: Roy, A., Kucukural, A., Zhang, Y. (2010) I-TASSER: a unified platform for automated protein structure and function prediction. Nat Protoc, 5: Sherry, S. T., Ward, M. H., Kholodov, M., Baker, J., Phan, L., Smigielski, E. M., Sirotkin, K. (2001) dbsnp: the NCBI database of genetic variation. Nucleic Acids Res, 29: Szilagyi, A., Boor, K., Szekely, A., Gaszner, P., Kalasz, H., Sasvari-Szekely, M., Barta, C. (2005) Combined effect of promoter polymorphisms in the dopamine D4 receptor and the serotonin transporter genes in heroin dependence. Neuropsychopharmacol Hung, 7: Tansey, K. E., Brookes, K. J., Hill, M. J., Cochrane, L. E., Gill, M., Skuse, D., Correia, C., Vicente, A., Kent, L., Gallagher, L., Anney, R. J. (2010) Oxytocin receptor (OXTR) does not play a major role in the aetiology of autism: genetic and molecular studies. Neurosci Lett, 474: TheUniProtConsortium (2011) Ongoing and future developments at the Universal Protein Resource. Nucleic Acids Res, 39:D Vereczkei, A., Sasvari-Szekely, M., Barta, C. (2009) [The role of genetic variants of the dopaminergic system in heroin dependence]. Neuropsychopharmacol Hung, 11: Viero, C., Shibuya, I., Kitamura, N., Verkhratsky, A., Fujihara, H., Katoh, A., Ueta, Y., Zingg, H. H., Chvatal, A., Sykova, E., Dayanithi, G. (2010) REVIEW: Oxytocin: Crossing the bridge between basic science and pharmacotherapy. CNS Neurosci Ther, 16:e Wayne, R. K., Ostrander, E. A. (2007) Lessons learned from the dog genome. Trends Genet, 23: Zhang, Y. (2008) I-TASSER server for protein 3D structure prediction. BMC Bioinformatics, 9:40. Genetic variability of the oxytocine receptor: an in silico study There is an ongoing extensive study on the polymorphisms of the oxytocine receptor (OXTR) gene and their relation to certain psychological traits and psychiatric disorders, however the results are contradictory. One of the sources of inconsistency could originate from the fact that the OXTR gene contains more than 270 SNPs (single nucleotide polymorphisms) without clarified molecular effect. Goals: The aim of this study was an in silico analysis of sequence variations between the human and dog OXTR gene. Results: Comparative analysis of the human and the dog OXTR amino acid sequence revealed that the most robust difference between the two proteins is a five amino acid containing fragment which is present in the human but absent in the dog receptor. In silico addition of this sequence to the dog receptor resulted in a dramatic change in the conformation of the intracellular region. Conclusion: In silico comparative analysis of OXTR gene variants among species and individuals might serve as an important cue for predicting the functional effects of genetic variants. Keywords: oxytocine, receptor, polymorphism, human, dog 144 Neuropsychopharmacologia Hungarica XIII. évf. 3. szám
Szakmai beszámoló (időközi beszámoló: 2014-02-01-2015-01-31)
Szakmai beszámoló (időközi beszámoló: 2014-02-01-2015-01-31) OTKA K-100845 Zsűri: PSP, futamidő: 48 hónap (2012.02.01 2016.01.31) Kutatásban résztvevők azonosak-e a szerződésben szereplő kutatókkal? NEM
Gén kópiaszám és mikrorns kötőhely polimorfizmusok vizsgálata
Gén kópiaszám és mikrorns kötőhely polimorfizmusok vizsgálata Doktori tézisek Dr. Kovács-Nagy Réka Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola Témavezető: Dr. Rónai Zsolt egyetemi adjunktus,
Gyakorlati bioinformatika
Gyakorlati bioinformatika Szekvenciaillesztés PhD kurzus 2. Szekvenciaillesztés Bagossi Péter Fajtái: - egyszer ill. többszörös illesztés - globális ill. lokális illesztés Alkalmazása: - adatbázisokban
A stresszteli életesemények és a gyermekkori depresszió kapcsolatának vizsgálata populációs és klinikai mintán
A stresszteli életesemények és a gyermekkori depresszió kapcsolatának vizsgálata populációs és klinikai mintán Doktori értekezés tézisei Dr. Mayer László Semmelweis Egyetem Mentális Egészségtudományok
A kutya, mint viselkedésgenetikai modell:
A kutya, mint viselkedésgenetikai modell: Az oxytocin receptor gén polimorfizmusainak és különböző szocio-kognitív képességek asszociációjának vizsgálata Tudományos Diákköri Dolgozat Készítette: Földi
Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok
Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok Dr. Patócs Attila, PhD MTA-SE Molekuláris Medicina Kutatócsoport, Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika Laboratóriumi Medicina Intézet Genetikai
Szakmai beszámoló (időközi beszámoló: )
Szakmai beszámoló (időközi beszámoló: 2012.02.01 2013.01.31) OTKA K-100845 Zsűri: PSP, futamidő: 48 hónap (2012.02.01 2016.01.31) Kutatásban résztvevők azonosak-e a szerződésben szereplő kutatókkal? NEM
HABILITÁCIÓS PÁLYÁZAT. Temperamentum, kognitív teljesítmény és hipnábilitás pszichogenetikai asszociációvizsgálatai" című habilitációs dolgozat
HABILITÁCIÓS PÁLYÁZAT Temperamentum, kognitív teljesítmény és hipnábilitás pszichogenetikai asszociációvizsgálatai" című habilitációs dolgozat T É Z I S E I Veres-Székely Anna, Ph.D. 2010 BEVEZETÉS Napjainkban
Többgénes jellegek. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek. 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása alatt áll
Többgénes jellegek Többgénes jellegek 1. 1. Klasszikus (poligénes) mennyiségi jellegek Multifaktoriális jellegek: több gén és a környezet által meghatározott jellegek 2.Szinte minden jelleg több gén irányítása
OTKA K 81466, témavezető: Dr. Sasvári Mária.
PROJEKT ZÁRÓ BESZÁMOLÓ A pályázati munkatervben a 4 éves futamidőre összesen 10 részfeladatot terveztünk, ezeket a feladatokat teljesítettük, és a kapott eredményeket nemzetközi folyóiratokban publikáltuk,
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Biológiai adatbázisok. Cserző Miklós 2018
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás Mi az adatbázis A biológia kapcsolata az adatbázisokkal Az adatbázisok típusai Adatbázis formátumok,
8. A fehérjék térszerkezetének jóslása
8. A fehérjék térszerkezetének jóslása A probléma bonyolultsága Általánosságban: találjuk meg egy tetszõleges szekvencia azon konformációját, amely a szabadentalpia globális minimumát adja. Egyszerû modellekben
A fehérjék térszerkezetének jóslása
A fehérjék térszerkezetének jóslása 1. A probléma bonyolultsága 2. A predikció szintjei 3. 1D predikciók (másodlagos szerkezet, hozzáférhetõség, transzmembrán hélixek 4. 2D predikciók (oldallánc kontaktusok,
Bioinformatics: Blending. Biology and Computer Science
Bioinformatics: Blending Biology and Computer Science MDNMSITNTPTSNDACLSIVHSLMCHRQ GGESETFAKRAIESLVKKLKEKKDELDSL ITAITTNGAHPSKCVTIQRTLDGRLQVAG RKGFPHVIYARLWRWPDLHKNELKHVK YCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGI DLSGLTLQSNAPSSMMVKDEYVHDFEG
10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik
10. Genomika 2. 1. Microarray technikák és bioinformatikai vonatkozásaik Microarrayek és típusaik Korrelált génexpresszió mint a funkcionális genomika eszköze 2. Kombinált megközelítés a funkcionális genomikában
A függőség fajtái 1. A függőség fajtái 2.
A függőség pszichogenetikája A függőség pszichogenetikája 2013.11.26 Addikciók fenotípusos vonatkozásai Addikciók genetikai vonatkozásai E kettő közötti asszociációk Függőség, szenvedélybetegség, addikció
Temperamentum, kognitív teljesítmény és hipnábilitás pszichogenetikai asszociációvizsgálatai
Temperamentum, kognitív teljesítmény és hipnábilitás pszichogenetikai asszociációvizsgálatai Habilitációs dolgozat Veres-Székely Anna, Ph.D. 2010 TARTALOMJEGYZÉK BEVEZETÉS... 4 Ábrajegyzék... 6 Táblázatok
A kötődési mintázat és a
Fakultatív program: Tudományos diákköri műhelyek: TDK háziverseny (dec 16. du) A kötődés mérése és genetikai háttere A gyermekkori temperamentum Személyiségvonások, mint endofenotípusok További érdekes
A HUMÁN GENOM PROJEKT Sasvári-Székely Mária* Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet
A HUMÁN GENOM PROJEKT Sasvári-Székely Mária* Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet *Levelezési cím: Dr. Sasvári-Székely Mária, Semmelweis Egyetem, Orvosi
A DOPAMIN D4-ES RECEPTOR GÉNVARIÁNSOK VIZSGÁLATA FIGYELEMHIÁNYOS HIPERAKTIVITÁSI ZAVARBAN
A DOPAMIN D4-ES RECEPTOR GÉNVARIÁNSOK VIZSGÁLATA FIGYELEMHIÁNYOS HIPERAKTIVITÁSI ZAVARBAN Kereszturi Éva 1, Király Orsolya 1, Csapó Zsolt 1, Tárnok Zsanett 2, Gádoros Júlia 2, Sasvári-Székely Mária 1 és
A függőség pszichogenetikája 2013.11.26
A függőség pszichogenetikája 2013.11.26 A függőség pszichogenetikája Addikciók fenotípusos vonatkozásai Addikciók genetikai vonatkozásai E kettő közötti asszociációk Függőség, szenvedélybetegség, addikció
Genetikai tényezők szerepe a hangulati dimenziók és a dohányzási szokások variabilitásában
Genetikai tényezők szerepe a hangulati dimenziók és a dohányzási szokások variabilitásában Kótyuk Eszter Doktori értekezés tézisei ELTE-PPK Pszichológia Doktori Iskola Magatartáspszichológiai Program Témavezető:
Az etológia módszere és fogalmai. A Humánetológia
Humánetológia Darwin evolúcióelmélete A fajok eredete (1859) az egyedek különböznek, és ezek a különbségek öröklődnek az egyedek versengenek A természetes kiválasztódás az a folyamat melynek során bizonyos
Hálózati modellek alkalmazása a molekuláris biológia néhány problémájára. Doktori (PhD) értekezés tézisei. Ágoston Vilmos
Hálózati modellek alkalmazása a molekuláris biológia néhány problémájára Doktori (PhD) értekezés tézisei Ágoston Vilmos Témavezető: Dr. Pongor Sándor SZEGED 2007 Konferencia-részvétel: Bevezetés Ágoston,
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika A ~20 ezer fehérje-kódoló gén a 23 pár kromoszómán A kromoszómán található bázisok száma: 250M
ISMÉTLDÉSI POLIMORFIZMUSOK A KUTYA DOPAMINERG GÉNJEIBEN
ISMÉTLDÉSI POLIMORFIZMUSOK A KUTYA DOPAMINERG GÉNJEIBEN Biológia Doktori Iskola Vezet: Prof. Erdei Anna Doktori tézisek Héjjas Krisztina Eötvös Loránd Tudományegyetem Szerkezeti Biokémia Doktori Program
A függőség pszichogenetikája
A függőség pszichogenetikája A függőség pszichogenetikája Addikciók fenotípusos vonatkozásai Addikciók genetikai vonatkozásai E kettő közötti asszociációk Függőség, szenvedélybetegség, addikció Hétköznapi
2. Ismert térszerkezetű transzmembrán fehérjék adatbázisa: a PDBTM adatbázis. 3. A transzmembrán fehérje topológiai adatbázis, a TOPDB szerver
A 2005 és 2007 között megvalósított project célja transzmembrán fehérjék vizsgálata és az ehhez szükséges eljárások kifejlesztése volt. Ez utóbbi magába foglalta új adatbázisok és szerkezet becslő módszerek
A DNS szerkezete. Genom kromoszóma gén DNS genotípus - allél. Pontos méretek Watson genomja. J. D. Watson F. H. C. Crick. 2 nm C G.
1955: 46 emberi kromoszóma van 1961: mrns 1975: DNS szekvenálás 1982: gén-bank adatbázisok 1983: R (polymerase chain reaction) Mérföldkövek 1 J. D. Watson F. H.. rick 2008 1953 2003 Watson genomja DNS
A depresszió biomarkereinek vizsgálata
A depresszió biomarkereinek vizsgálata Doktori tézisek Halmai Zsuzsa Semmelweis Egyetem Szentágothai János Idegtudományi Doktori Iskola Témavezető: Dr. Székely Anna, Ph.D., habil. egyetemi docens Hivatalos
Miben különbözünk az egértől? Szabályozás a molekuláris biológiában
Az atomoktól a csillagokig, 2010. október 28., ELTE Fizikai Intézet Miben különbözünk az egértől? Szabályozás a molekuláris biológiában brainmaps.org Homo sapiens (Miroslav Klose) Mus musculus Farkas Illés
Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014. Április 8 Május 22 8th April 22nd May
Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014 Április 8 Május 22 8th April 22nd May Hét / 1st week (9. kalendariumi het) Takács László / Fehér Zsigmond Magyar kurzus Datum/ido Ápr. 8 Apr. 9 10:00 10:45
Mai témák. Fehérjék dinamikájának jelentősége. Számítógépes modellezés jelentősége
Mai témák Fehérjék szerkezetének predikciója, szerkezeti adatok felhasználása adatbázisok segítségével, a számítógépes molekuladinamikai modellezés alapjai Hegedűs Tamás tamas@hegelab.org Bevezetés szimulációk
A NIKOTIN DEPENDENCIA ÉS A DOPAMIN D4-ES RECEPTOR -521 CT PROMOTER POLIMORFIZMUSÁNAK ASSZOCIÁCIÓJA MAJOR DEPRESSZIÓS BETEGCSOPORTBAN
A NIKOTIN DEPENDENCIA ÉS A DOPAMIN D4-ES RECEPTOR -521 CT PROMOTER POLIMORFIZMUSÁNAK ASSZOCIÁCIÓJA MAJOR DEPRESSZIÓS BETEGCSOPORTBAN KÓTYUK ESZTER 1, KOVÁCS-NAGY RÉKA 2, FALUDI GÁBOR 3, URBÁN RÓBERT 1,
A HUMÁNGENETIKA LEGÚJABB EREDMÉNYEI Péterfy Miklós
A HUMÁNGENETIKA LEGÚJABB EREDMÉNYEI Péterfy Miklós Összefoglalás A humángenetika korunk egyik legdinamikusabban fejlődő tudományága. Ennek a fejlődésnek legfőbb mozgatórugója az, hogy a humángenetika,
T 038407 1. Zárójelentés
T 038407 1 Zárójelentés OTKA támogatással 1996-ban indítottuk az MTA Pszichológiai Intézetében a Budapesti Családvizsgálatot (BCsV), amelynek fő célja a szülő-gyermek kapcsolat és a gyermekek érzelmi-szociális
SZTE ÁOK PSZICHIÁTRIA KLINIKA 2006. SZAKIRODALMI MUNKÁSSÁGA (ELŐADÁSOK ÉS ELŐADÁSKIVONATOK)
SZTE ÁOK PSZICHIÁTRIA KLINIKA 2006. SZAKIRODALMI MUNKÁSSÁGA (ELŐADÁSOK ÉS ELŐADÁSKIVONATOK) Álmos Péter Juhász Anna Rimanóczy Ágnes Béres Judit Janka Zoltán Kálmán János Romák neuropszichiátriai kórképeinek
Kognitív teljesítménymutatók pszichogenetikai vizsgálata
Kognitív teljesítménymutatók pszichogenetikai vizsgálata Absztrakt A kognitív képességek örökletessége ikervizsgálatok és genom-analízissel végzett kutatások tanúsága szerint jelentős (Butcher és mtsai,
A T sejt receptor (TCR) heterodimer
Immunbiológia - II A T sejt receptor (TCR) heterodimer 1 kötőhely lánc lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma V V C C EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL lánc: VJ régió lánc: VDJ régió Nincs szomatikus
Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK
Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK Fehérjét kódol? Tulajdonságai? -Hol lokalizálódik? -Oldható? -3D szerkezete? -Accession #? -Annotációja elérhető? Már benne
Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP)
Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP) A genom ~ 97 %-a két különböző egyedben teljesen azonos ~ 1% különbség: SNP miatt ~2% különbség: kópiaszámbeli eltérés, deléciók miatt 11-12 millió
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
A metabolikus szindróma genetikai háttere. Kappelmayer János, Balogh István (www.kbmpi.hu)
A metabolikus szindróma genetikai háttere Kappelmayer János, Balogh István (www.kbmpi.hu) Definíció WHO, 1999 EGIR, 1999 ATP III, 2001 Ha három vagy több komponens jelen van a betegben: Vérnyomás: > 135/85
Semmelweis Egyetem, Mentális Egészségtudományok Doktori Iskola, Magatartástudományi Program
Semmelweis Egyetem, Mentális Egészségtudományok Doktori Iskola, Magatartástudományi Program A D4 dopamin receptor és a katekol-o-metiltranszferáz gének polimorfizmusának hatása a figyelmi rendszerek működésére
Immunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.
Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás. Antigén felismerés Az ellenanyagok és a B sejt receptorok natív formában
Az addikció molekuláris neurobiológiája. Barta Csaba
Az addikció molekuláris neurobiológiája Barta Csaba Komplex jelleg: A szerfüggés etiológiája genetikai faktorok + környezeti tényezők és interakcióik családi halmozódás (Rounsaville, 1991; Luthar, 1992;
Phenotype. Genotype. It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? Remember the Goal. Infectious Disease Paradigm
It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? You need to know your data/input sources You need to understand your methods and their assumptions You need a plan to get from point
PhD ÉRTEKEZÉS TÉZISEI
PhD ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A kutya (Canis familiaris) mint a humán személyiségvizsgálatok egy lehetséges modellje: genetikai, kérdőíves és közvetlen megfigyeléses módszerek együttes alkalmazása Vas Judit Biológia
Tartalomjegyzék TARTALOMJEGYZÉK
Tartalomjegyzék TARTALOMJEGYZÉK Tartalomjegyzék... 1 Rövidítések jegyzéke... 3 Ábrák és táblázatok jegyzéke... 5 Ábrák... 5 Táblázatok... 5 Bevezetés... 6 Irodalmi háttér... 8 Komplex öröklõdésû jellegek
A sertések lágyék- és heresérv tünetegyüttesének genetikai háttere
Nagy Szabolcs 1 Benedek Zsuzsanna 2 Polgár J. Péter 3 Magnus Andersson 4 A sertések lágyék- és heresérv tünetegyüttesének genetikai háttere Genetic background of scrotal and inguinal hernia in swine nagy.szabolcs@georgikon.hu
A TAKARMÁNYOK FEHÉRJE TARTALMÁNAK ÉS AMINOSAV ÖSSZETÉTELÉNEK HATÁSA A TOJÓHIBRIDEK TELJESÍTMÉNYÉRE
A TAKARMÁNYOK FEHÉRJE TARTALMÁNAK ÉS AMINOSAV ÖSSZETÉTELÉNEK HATÁSA A TOJÓHIBRIDEK TELJESÍTMÉNYÉRE HORÁK A. P. HALAS V. CZÁR D. - TISCHLER A. TOSSENBERGER J. Összefoglalás A nagy teljesítményre képes genotípusok
Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)
Genomika Új korszak, paradigmaváltás, forradalom: a teljes genomok ismeretében a biológia adatokban gazdag tudománnyá válik. Új kutatási módszerek, új szemlélet. Hajtóerõk: Genomszekvenálási projektek
Natív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok
Natív antigének felismerése B sejt receptorok, immunglobulinok B és T sejt receptorok A B és T sejt receptorok is az immunglobulin fehérje család tagjai A TCR nem ismeri fel az antigéneket, kizárólag az
(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.
Immunbiológia II A T sejt receptor () heterodimer α lánc kötőhely β lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma 1 V α V β C α C β EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL αlánc: VJ régió β lánc: VDJ régió Nincs
Cserző Miklós Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Integrált biológiai adatbázisok
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Integrált biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás A genom annotálás jelentősége Genome Reference Consortium Gene Ontology Az ensembl pipeline
Populációgenetikai vizsgálatok eredményei hangulatzavarokban. Képalkotó vizsgálatok alkalmazása a neuropszichofarmakológiában
Populációgenetikai vizsgálatok eredményei hangulatzavarokban Képalkotó vizsgálatok alkalmazása a neuropszichofarmakológiában Juhász Gabriella Semmelweis Egyetem, GYTK, Gyógyszerhatástani Intézet Neuroscience
1.1. A Humán Genom Projekt A Humán Genom Projekt célja A humán genom elsõ munkapéldányából levonható következtetések
VIII. 1. A GENETIKAI POLIMORFIZMUSOK PSZICHOLÓGIAI ÉS PSZICHIÁTRIAI VONATKOZÁSAI Sasvári-Székely Mária 1, Székely Anna 2, Nemoda Zsófia 1 és Rónai Zsolt 1 1 Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt. SNP GWA Haplotípus: egy kromoszóma szegmensen lévő SNP mintázat
HAPMAP -2010 Nemzetközi HapMap Projekt A Nemzetközi HapMap Project célja az emberi genom haplotípus* térképének(hapmap; haplotype map) megszerkesztése, melynek segítségével katalogizálni tudjuk az ember
A hasonlóság és a vonzerő szerepe a párválasztásban
A hasonlóság és a vonzerő szerepe a párválasztásban Kocsor Ferenc 12 Juhász Szabolcs Rezneki Rita Bereczkei Tamás 1 1 PTE BTK, Pszichológiai Intézet 2 PTE ÁOK, Magatartástudományi Intézet 1 1 Vázlat A
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát
Személyiségvizsgálatok kutyán
Eötvös Loránd Tudományegyetem, Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola, vezetője: Dr. Erdei Anna Etológia Doktori Program, vezetője: Dr. Miklósi Ádám Személyiségvizsgálatok kutyán Doktori Értekezés
Correlation & Linear Regression in SPSS
Petra Petrovics Correlation & Linear Regression in SPSS 4 th seminar Types of dependence association between two nominal data mixed between a nominal and a ratio data correlation among ratio data Correlation
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
A SZEROTONIN-2 (5-HT 2 ) RECEPTOROK SZEREPE A SZORONGÁS ÉS ALVÁS SZABÁLYOZÁSÁBAN. Kántor Sándor
A SZEROTONIN-2 (5-HT 2 ) RECEPTOROK SZEREPE A SZORONGÁS ÉS ALVÁS SZABÁLYOZÁSÁBAN Ph.D. értekezés tézisei Kántor Sándor Témavezetők: Prof. Dr. Bagdy György és Prof. Dr. Halász Péter Semmelweis Egyetem Idegtudományok
Human Genome Project, 1990-2005 5 évvel a tervezett befezés előtt The race is over, victory for Craig Venter. The genome is mapped* - now what?
2000 június 26 Új út kezdete, vagy egy út vége? Human Genome Project, 1990-2005 5 évvel a tervezett befezés előtt The race is over, victory for Craig Venter. The genome is mapped* - now what? 2000 június
AZ OXITOCINRENDSZER ÉS A SZOCIÁLIS VISELKEDÉS KAPCSOLATA
Kubinyi et al. Az oxitocinrendszer AZ OXITOCINRENDSZER ÉS A SZOCIÁLIS VISELKEDÉS KAPCSOLATA Kubinyi Enikő tudományos főmunkatárs, MTA ELTE Összehasonlító Etológiai Kutatócsoport eniko.kubinyi@ttk.elte.hu
Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)
Zárójelentés Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata c. OTKA kutatási programról Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI) 2012 1 Az Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata c. programban azt
A MOLEKULÁRIS BIOLÓGIA ISMERETÁBRÁZOLÁSI PROBLÉMÁI
Magyar Tudomány 2005/4 A MOLEKULÁRIS BIOLÓGIA ISMERETÁBRÁZOLÁSI PROBLÉMÁI Pongor Sándor a biológiai tudomány doktora, MTA Biológiai Központ, Szeged International Centre of Genetic Engineering and Biotechnology,
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: Az orvosi biotechnológiai mesterképzés
THE RELATIONSHIP BETWEEN THE STATE OF EDUCATION AND THE LABOUR MARKET IN HUNGARY CSEHNÉ PAPP, IMOLA
THE RELATIONSHIP BETWEEN THE STATE OF EDUCATION AND THE LABOUR MARKET IN HUNGARY CSEHNÉ PAPP, IMOLA Keywords: unemployment, employment policy, education system. The most dramatic socio-economic change
Bioinformatika az élelmiszergyártásban és a táplálkozástudományban
ÉLELMISZERIPARI BIOTECHNOLÓGIÁK Bioinformatika az élelmiszergyártásban és a táplálkozástudományban Tárgyszavak: bioinformatika; genomika; proteomika; polimorfizmus; táplálkozástudomány; élelmiszer-minőség.
Bevezetés a bioinformatikába. Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék
Bevezetés a bioinformatikába Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék Bioinformatika Interdiszciplináris tudomány, amely magába foglalja a biológiai adatok gyűjtésének,feldolgozásának, tárolásának,
Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL
Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL KÖZÖS STRATÉGIA KIFEJLESZTÉSE MOLEKULÁRIS MÓDSZEREK ALKALMAZÁSÁVAL
The nontrivial extraction of implicit, previously unknown, and potentially useful information from data.
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Méréstechnika és Információs rendszerek Tanszék Adatelemzés intelligens módszerekkel Hullám Gábor Adatelemzés hagyományos megközelítésben I. Megválaszolandó
Human genome project
Human genome project Pataki Bálint Ármin 2017.03.14. Pataki Bálint Ármin Human genome project 2017.03.14. 1 / 14 Agenda 1 Biológiai bevezető 2 A human genome project lefolyása 3 Alkalmazások, kitekintés
Az érzelmi felismerés viselkedészavaros lányokban (Emotion recognition in girls with conduct problems)
Az érzelmi felismerés viselkedészavaros lányokban (Emotion recognition in girls with conduct problems) Christina Schwenck, Angelika Gensthaler Marcel Romanos Christine M. Freitag, Wolfgang Schneider, Regina
Doktori tézisek. Vereczkei Andrea. Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola
Heroinfüggőség és metadon terápia: a dopaminerg polimorfizmusok lehetséges szerepe Fibroblaszt modell alkalmazása a metabolikus stressz-kezelés expressziós hatásainak vizsgálatára Doktori tézisek Vereczkei
Új terápiás lehetőségek (receptorok) a kardiológiában
Új terápiás lehetőségek (receptorok) a kardiológiában Édes István Kardiológiai Intézet, Debreceni Egyetem Kardiomiociták Ca 2+ anyagcseréje és új terápiás receptorok 2. 1. 3. 6. 6. 7. 4. 5. 8. 9. Ca
trns-ek identitásvizsgálata új, in silico módszerrel
trns-ek identitásvizsgálata új, in silico módszerrel Doktori (PhD) értekezés tézisei Szenes Áron Témavezetők: Dr. Pál Gábor docens és Dr. Jakó Éena tudományos főmunkatárs Eötvös Loránd Tudományegyetem
Bioinformatika 2 6. előadás
6. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.10.08. PDBj: http://www.pdbj.org/ Fehérjék 3D szerkezeti adatbázisai - PDBj 2 2018.10.08.
Miskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet. Correlation & Linear. Petra Petrovics.
Correlation & Linear Regression in SPSS Petra Petrovics PhD Student Types of dependence association between two nominal data mixed between a nominal and a ratio data correlation among ratio data Exercise
A Humán Fenom Projekt
A személyiség genetikája Endofenotípusok Endofenotípusok Temperamentum Személyiségdimenziók pszichogenetikai elemzése A Humán Fenom Projekt Intelligencia Személyiségvonások Hangulatzavarok ADHD Genom Drogfüggőség
Az interdiszciplináris pszichogenetikai kutatócsoportunk: Szemléletmód. Miről szólnak az előadások?
Az interdiszciplináris pszichogenetikai kutatócsoportunk: PSZB09-109 Veres-Székely Anna Veres-Székely Anna Halmai Zsuzsa Varga Gábor Kótyuk Eszter Katonai Enikő Rózsa Viselkedéselemzők, műhelymunkások
A mai el!adás témája: Miklós István Állapot Emisszió Útvonal Legvalószín!bb útvonal (Viterbi path) Szuboptimális útvonal
Bioinformatika és genom analízis az orvostudományban (AOGENBIG_1M) Miklós István SOTE, 2008. november 6. A mai el!adás témája: Struktúrák predikciója Az összehasonlító bioinformatika alapelvei Rejtett
Agresszió. Interspecifikus agonisztikus viselkedés
Agresszió Interspecifikus agonisztikus viselkedés Az agresszió értelmezése Humán vs. etológiai (negatív/antiszociális vs. adaptív/természetes) Etológia vs. Viselkedésökológia vs. állatorvostudomány különböző
A gyermekkori kényszerbetegség. Gádoros Júlia Vadaskert Kórház Budapest
A gyermekkori kényszerbetegség Gádoros Júlia Vadaskert Kórház Budapest OCD és s a normál l fejlıdés Fokozatos kezdet, többnyire 7 éves kor körül serdülıkorra kiterjedtebb tünetek tic és OC tünetek együtt
A hangulati dimenziók és a glia-eredetű növekedési faktort kódoló gén polimorfizmusainak összefüggése depresszióval diagnosztizált mintán
A hangulati dimenziók és a glia-eredetű növekedési faktort kódoló gén polimorfizmusainak összefüggése depresszióval diagnosztizált mintán Kotyuk Eszter 1, Németh Nóra 2, Halmai Zsuzsa 3, Faludi Gábor 3,
SZAKMAI ÖNÉLETRAJZ. 6. viselkedéselemző/pszichológus (klinikai- és egészségpszichológia szakirány)
SZAKMAI ÖNÉLETRAJZ NÉV: Kékes Szabó Marietta E-MAIL: kszmarietta@jgypk.u-szeged.hu TEL.: (munkahelyi) 546-206, 105-ös tanszéki szoba MUNKAHELY, BEOSZTÁSOK: egyetemi tanársegéd TUDOMÁNYOS FOKOZAT: doktorjelölt
Genetikai vizsgálatok
Genetikai vizsgálatok Családvizsgálatok Bottom-up Top-down Ikertanulmányok Adoptációs vizsgálatok Molekuláris genetikai vizsgálatok 1 Depresszió-Családvizsgálatok Bottom-up tanulmányok (MDD-s gyermek proband
A fehérjék térszerkezetének jóslása (Szilágyi András, MTA Enzimológiai Intézete)
A fehérjék térszerkezetének jóslása (Szilágyi András, MTA Enzimológiai Intézete) A probléma bonyolultsága Általánosságban: találjuk meg egy tetszőleges szekvencia azon konformációját, amely a szabadentalpia
A regisztrált álláskeresők számára vonatkozó becslések előrejelző képességének vizsgálata
A regisztrált álláskeresők számára vonatkozó becslések előrejelző képességének vizsgálata Az elemzésben a GoogleTrends (GT, korábban Google Insights for Search) modellek mintán kívüli illeszkedésének vizsgálatával
A Hardy-Weinberg egyensúly. 2. gyakorlat
A Hardy-Weinberg egyensúly 2. gyakorlat A Hardy-Weinberg egyensúly feltételei: nincs szelekció nincs migráció nagy populációméret (nincs sodródás) nincs mutáció pánmixis van allélgyakoriság azonos hímekben
CNTF, COMT, DDR1, DISC1, DRD2, DRD3 és DTNBP1 kandidáns gének vizsgálata szkizofréniában: eredmények a Magyar SCHIZOBANK Konzorcium vizsgálatából
CNTF, COMT, DDR1, DISC1, DRD2, DRD3 és DTNBP1 kandidáns gének vizsgálata szkizofréniában: eredmények a Magyar SCHIZOBANK Konzorcium vizsgálatából Benkovits Judit 1, Magyarósi Szilvia 2, Pulay Attila 1,
Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome
Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome High Throughput Sequencing RN Example applications: Sequencing a genome (DN) Sequencing a transcriptome and gene expression studies (RN) ChIP (chromatin immunoprecipitation)
OROSZ MÁRTA DR., GÁLFFY GABRIELLA DR., KOVÁCS DOROTTYA ÁGH TAMÁS DR., MÉSZÁROS ÁGNES DR.
ALL RIGHTS RESERVED SOKSZOROSÍTÁSI CSAK A MTT ÉS A KIADÓ ENGEDÉLYÉVEL Az asthmás és COPD-s betegek életminõségét befolyásoló tényezõk OROSZ MÁRTA DR., GÁLFFY GABRIELLA DR., KOVÁCS DOROTTYA Semmelweis Egyetem
Etológia. a viselkedés biológiája. Barta Zoltán.
Etológia a viselkedés biológiája Barta Zoltán zbarta@delfin.unideb.hu Interdiszciplináris és komplex megközelítésű tananyag fejlesztés a természettudományi képzési terület alapszakjaihoz Debrecen 2010.
Kappelmayer János. Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere. MOLSZE IX. Nagygyűlése. Bük, 2005 szeptember
Kappelmayer János Malignus hematológiai megbetegedések molekuláris háttere MOLSZE IX. Nagygyűlése Bük, 2005 szeptember 29-30. Laboratóriumi vizsgálatok hematológiai malignómákban Általános laboratóriumi
mangalica sertésn Prof. dr. Bali Papp Ágnes TÁMOP-4.2.1/B Szellemi, szervezeti és K+F infrastruktúra fejlesztés a Nyugatmagyarországi
élelmiszer-előá őshonos mangalica sertésn Prof.dr. Bali Papp Ágnes TÁMOP-4.2.1/B Szellemi, szervezeti és K+F infrastruktúra fejlesztés a Nyugatmagyarországi Egyetemen c. kutatási projekt A SZÁNTÓFÖLDTŐL