DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI PANNON ÖKORÉGIÓBÓL SZÁRMAZÓ FÖLDIMOGYORÓ SATNYULÁS VÍRUS (PEANUT STUNT VIRUS, PSV) IZOLÁTUMOK JELLEMZÉSE.
|
|
- Éva Király
- 7 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI PANNON ÖKORÉGIÓBÓL SZÁRMAZÓ FÖLDIMOGYORÓ SATNYULÁS VÍRUS (PEANUT STUNT VIRUS, PSV) IZOLÁTUMOK JELLEMZÉSE Kiss László Budapest 2011
2 A doktori iskola megnevezése: tudományága: vezetője: Témavezetők: Kertészettudományi Doktori Iskola Növénytermesztési és kertészeti tudományok Dr. Tóth Magdolna egyetemi tanár, DSc Budapesti Corvinus Egyetem, Kertészettudományi Kar, Gyümölcstermő növények Tanszék Dr. Salánki Katalin tudományos főmunkatárs, PhD Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóközpont Dr. Balázs Ervin egyetemi tanár, MHAS Budapesti Corvinus Egyetem, Kertészettudományi Kar, Alkalmazott Növénybiológiai és Biogazdálkodási Kihelyezett Tanszék A jelölt a Budapesti Corvinus Egyetem Doktori Szabályzatában előírt valamennyi feltételnek eleget tett, az értekezés műhelyvitájában elhangzott észrevételeket és javaslatokat az értekezés átdolgozásakor figyelembe vette, ezért az értekezés nyilvános vitára bocsátható Dr. Tóth Magdolna Az iskolavezető jóváhagyása Dr. Salánki Katalin A témavezető jóváhagyása Dr. Balázs Ervin A témavezető jóváhagyása
3 1. A MUNKA ELŐZMÉNYEI, A KITŰZÖTT CÉLOK A vírusok gazdasági jelentősége több szempontból is meghatározó. Mivel a vírusfertőzött növény nem gyógyítható, ezért a védekezés elsődleges módja a megelőzés. Gazdanövényenként a tünetek meglehetősen eltérhetnek, sőt gyakran tünetmentesen vannak jelen a növényekben. A kórokozók pontos azonosításához legalább a részleges nukleinsav sorrend ismerete szükséges, amely alapján már számos adat áll birtokunkban a vírus faját, rokonsági és evolúciós viszonyait tekintve. Doktori témámban a földimogyoró satnyulás vírus (Peanut stunt virus, PSV) hazai izolátumainak vizsgálatát végeztem el. A rendkívül heterogén kórokozó jelentős károkat okozott Észak-Amerikában, Afrikában és Ázsiában a pillangósvirágú növényeken. Európából, illetve fehér akácról egyelőre nem ismert a kórokozó teljes nukleotid (nt) sorrendje. Magyarországi előfordulásáról viszonylag kevés irodalmi adat áll rendelkezésünkre, habár kora nyári sétáink közben éppúgy megpillanthatjuk mozaikos levéltüneteit a Roosevelt téri közel 200 éves öreg akácon, mint szántóföldek határoló akácsorán. Munkánk során a következő feladatokat tűztük ki doktori dolgozatom céljául: 1. Magyarországi fehér akácról származó PSV izolátum teljes hosszúságú genomi komplementer DNS (cdns) klónjainak előállítása; 2. A genomi cdns klónok teljes nukleotid szekvenciáinak (mint első európai PSV izolátum) meghatározása; 3. A nukleotid szekvenciák filogenetikai és rekombinációs elemzése. Rokonsági viszonyainak feltárása, a kórokozó evolúciójának pontosabb megismerése. Az első 3 pont eredményeinek tükrében: 4. További, a Pannon ökorégióból származó PSV izolátumok részleges RNS3 cdns klónjainak előállítása; 5. A részleges RNS3 cdns klónok nukleotid szekvenciáinak meghatározása; 6. Az új izolátumok filogenetikai és rekombinációs elemzése; 7. Az izolátumok gazdanövénykör és tünettani vizsgálata. 1
4 2. ANYAG ÉS MÓDSZER 2.1. A dolgozatban vizsgált vírusok és izolálásuk A PSV-Rp törzset 2002-ben Salamon Pál izolálta Gödöllőn fehér akácról és bocsátotta kutatócsoportunk rendelkezésére. A kutatásaink során vizsgált további kilenc PSV izolátumot a Pannon ökorégió területén, enyhe mozaik és levél deformáció tüneteket mutató fehér akác növényekről gyűjtöttük 2007 és 2008 években (1. táblázat). Az izolátumokat C. quinoa növényen történt passzálást követően N. benthamiana. tesztnövényeken szaporítottuk fel a további vizsgálatok elvégzéséhez. 1. táblázat. A vizsgált PSV izolátumok gyűjtési adatai Izolátum neve Gyűjtési hely Gyűjtési év Gyűjtötte PSV-B Budapest, Magyarország 2008 Kiss László PSV-Cs Mezőcsát, Magyarország 2008 Dr. Kondrák Mihály PSV-F Füzesgyarmat, Magyarország 2008 Kiss László PSV-Ljb Ljubljana, Szlovénia 2008 Kiss László PSV-Rp Gödöllő, Magyarország 2002 Dr. Salamon Pál PSV-Rp2 Gödöllő, Magyarország 2007 Kiss László PSV-Sz Szeghalom, Magyarország 2008 Kiss László PSV-T1 Tihany, Magyarország 2008 Dr. Salánki Katalin PSV-T2 Tihany, Magyarország 2008 Dr. Salánki Katalin PSV-Tev Tevel, Magyarország 2008 Antal Ferenc 2.2. Gazdanövénykör vizsgálatok A vizsgált PSV izolátumokkal a természetes és kísérletes gazdanövények közül 5 növénycsalád 16 faját fertőztük (2. táblázat). Minden esetben 3 8 növényt fertőztünk 2 8 leveles állapotban. A növényeket tünettanilag a fertőzést követő 1 hónapon keresztül vizsgáltuk vizuális módszerrel. Tünetmentes növények esetében a kórokozó lokális és / vagy szisztemikus terjedését Northern blot analízissel (Sambrook és mtsai., 1989) ellenőriztük. A Northern blot analízishez White és Kaper (1989) eljárásának alkalmazásával kivont teljes nukleinsav tartalmú mintákat formaldehid és formamid tartalmú pufferben denaturáltuk, majd szintén formaldehid tartalmú 1%-os agaróz gélben elektroforézissel frakcionáltuk. A nukleinsavakat Hybond-N membránra vittük át, majd UV fénnyel a membránhoz kötöttük. 2
5 2. táblázat. A gazdanövénykör vizsgálatokhoz használt növények Család Faj Fajta Család Faj Fajta Család Faj Fajta Chenopodiaceae Leguminosae Solanaceae Chenopodium amaranticolor Coste and Reyn. Arachis hypogea L. Lycopersicon esculentum Mill. Lens culinaris Medik. cv. Kecskeméti jubileum Compositae cv. Éva Nicotiana benthamiana Domin. Zinnia elegans Jacq. Medicago sativa L. N. clevelandii Gray. Phaseolus vulgaris L. N. debney Gray. Cucurbitaceae cv. Babilon N. glutinosa L. Cucumis sativus L. Pisum sativum L. N. tabacum L. cv. Xanthi cv. Delicates cv. Rajnai törpe Robinia pseudoacacia L. Vigna sinensis Savi et Hassk. cv. Black eye A nukleotid sorrend meghatározásához a N. benthamiana tesztnövényeken felszaporított izolátumokból Lot és mtsai. (1972) módszerével a PSV-Rp esetében vírust tisztítottunk, a további izolátumokkal fertőzött növényekből pedig teljes nukleinsav kivonást végeztünk az előbbiekben említett White és Kaper (1989) eljárásának alkalmazásával. Az RNS kivonására fenol-kloroformos extrakciót és etanolos kicsapást használtunk Molekuláris és bioinformatikai vizsgálatok A PSV-Rp törzs cdns klónjának előállítása A tisztított víruspartikulumokból fenol/sds kicsapással megkaptuk a cucumovírusokra jellemző három genomi és egy szubgenomi vírus RNS-t, melyet gélelektroforézissel detektáltunk. A cdns készítés során az RNS-ek 3 végeinek meghatározásához az RNS-eket poliadeniláltuk. Az első szál cdns-t ennek megfelelően az ellentétes (komplementer) nukleotid sorrendű oligo dt primerrel indítottuk. A második szál cdns készítése Gubler és Hoffman (1983) által leírt ribonukleáz H és DNS polimeráz I jelenlétében zajlott. A kapott cdns szakaszokat pbluescriptii SK+ fágemid klónozó vektorba ligáltuk. A cdns klónok felszaporítását Escherichia coli DH5-α és GM2163 törzseken végeztük. A vírus eredetű cdns klónok kiválasztása kolónia hibridizáció alkalmazásával történt tisztított vírus RNS jelölésével (Sambrook és mtsai., 1989). A kiválasztott cdns klónok nukleotid sorrendjének vírus eredetét automatizált fluoreszcens stopnukleotida módszerrel ellenőriztük (Applied Biosystems Gene Analyzer 3100). A három genomiális RNS 5 végének meghatározása a részlegesen ismert szekvenciákra alapozva az 5 Rapid Amplification of cdna Ends kit segítségével történt. A meghatározáshoz az általunk tervezett RNS1-( nt), RNS2-( nt), RNS3-( nt) vírusspecifikus antiszensz primereket használtuk. 3
6 A valós 5 és 3 végek ismeretében mindhárom vírus RNS esetében a teljes szál cdns készítést a PSV PstI oligonukleotid segítségével indítottuk el. A szintézist M-MuLV reverz transzkriptázzal végeztük. A keletkezett kettősszálú molekulákat PCR segítségével sokszoroztuk meg (Mullis és Faloona, 1987). Az RNS1 és RNS2 molekulák 5 végének homológiája lehetővé tette, hogy a PSV12-T7-BamHI indítószekvencia alkalmazásával, közös reakcióban szaporítsuk fel őket. Az RNS3 esetében a PSV3-T7-BamHI indítószekvenciát alkalmaztuk a molekula sokszorosítására. A PCR során az említett 5 és egységesen a cdns készítésnél használt 3 primerek segítségével Taq DNS polimeráz enzim jelenlétében felszaporítottuk a cdns molekulákat. A reakció az RNS1 és RNS2 esetében két fázisban ment végbe. Az RNS3 szintézise során a reakció egy fázisban 30 ciklus alatt történt. A kapott méret specifikus PCR termékeket 1%-os agaróz gélen detektáltuk, majd tisztítottuk (High Pure Purification Kit). A cdns molekulákat BamHI és PstI restrikciós endonukleázokkal hasítottuk, majd az ugyanezen enzimekkel vágott pbluescriptii SK+ vektorba ligáltuk. Az elkészült PSV-Rp RNS1, RNS2, RNS3 klónokat az Escherichia coli DH5α és GM2163 törzseiben tartottuk fenn. A klónok nukleotid sorrendjének meghatározását szubklónok és belső primerek segítségével határoztuk meg automatizált fluoreszcens stopnukleotida módszer alkalmazásával. A kapott részleges nukleotid sorrendek szekvencia adatait a Clone manager 7 (SciEd Central) és az Emboss-Align (Rice és mtsai., 2000) programok segítségével illesztettük össze, majd a GenBank nemzetközi adatbankban helyeztük el PSV izolátumok részleges cdns klónjainak előállítása A további 9 vizsgált PSV izolátum esetében fertőzött N. benthamiana növényekből teljes nukleinsav kivonást és reverz transzkripciót követően PCR technika segítségével felszaporítottuk az RNS3 egy meghatározott részét, mely tartalmazta a mozgási fehérje gén egy részét, a teljes intergénikus régiót, a köpenyfehérje gént és a 3 nem-kódoló régiót. A vizsgálatokhoz a GenBank-ban megtalálható PSV törzsek és az általunk meghatározott PSV- Rp RNS3 konzervatív régiójára tervezett degenerált unipsv5 és PSV123-PstI primerpárt használtuk. A heteroduplex specifikus szakaszok megsokszorozásához PCR technikát alkalmaztunk. A kapott PCR termékeket 1%-os agaróz gélen detektáltuk, majd tisztítottuk (High Pure Purification Kit, Roche). A DNS mintákat pgem-t-easy klónozó vektorba ligáltuk, ezzel elkészítve az izolátumok részleges RNS3 molekulájának cdns klónjait. A cdns-ek nukleotid sorrendjét automatizált fluoreszcens stopnukleotida módszerrel a plazmid specifikus M13 reverz és M13 forward primerek segítségével határoztuk meg. 4
7 2.4. Bioinformatikai vizsgálatok Nukleotid sorrend összehasonlítás és filogenetikai elemzés A kapott nukleotid és aminosav sorrendeket az Emboss-Align és a Clustal X (Thomson és mtsai.,1997) programcsomagok segítségével EMBL/NCBI nemzetközi adatbankban elérhető PSV szekvenciákkal hasonlítottuk össze, majd a Clustal X programmal Neighbor-Joining eljárással a TreeWiew (Page, 1996) felületén az adatokból filogenetikai törzsfát készítettünk Rekombinációs vizsgálatok A nemzetközi adatbankokban fellelhető PSV szekvenciákra épülő rekombinációs vizsgálatokhoz az általánosan használt és elfogadott TOPALi v2 (Milne és mtsai., 2004) programcsomag PDM (Probabilistic Divergence Measures) analízisét alkalmaztuk. 5
8 3. EREDMÉNYEK 3.1. A PSV-Rp cdns klónjainak molekuláris jellemzése Munkánk során elkészítettük az PSV-Rp izolátumnak elnevezett, hazai fehér akácról gyűjtött Peanut stunt virus 1-es, 2-es és 3-as RNS-einek cdns klónjait, majd meghatároztuk mindhárom klón teljes elsődleges szerkezetét. A kapott cdns szekvenciákat a GenBank nemzetközi adatbázisban helyeztük el az AM905353, AM905354, AM azonosító számok alatt. Az RNS nt, az RNS nt, az RNS nt hosszúságúnak bizonyult, mely adatok megközelítőleg megegyeznek az adatbankban található más PSV szekvenciák hosszával. A nukleotid sorrend megállapítása után azonosítottuk a cucumovírusokra jellemző öt nyílt leolvasási keretet (ORF). Az RNS1-ről átíródó 1a ORF a 85-ös nt-tól a 3078-as nt-ig terjed 998 aminosavat kódolva. A molekula N-terminális részén azonosítható a metiltranszferáz aktivitásra utaló H DxxR Y motívum. A C-terminális részében helikáz motívumok, illetve az aminosavak között prolin gazdag régió figyelhető meg. Az RNS2-ről átíródó 2a ORF a 80-as nt-tól a 2581-es nt-ig terjed 834 aminosavat kódolva. Az ORF aminosavai GDD motívumot kódolnak, amely az RNS függő RNS polimerázok (RdRp) Mg 2+ kötése szempontjából meghatározó jelentőségű. Az RNS2 szintén meghatároz egy, a 2a-val átfedő 2b ORF-et, amely a nt között helyezkedik el, és amelyről egy 93 aminosavat kódoló fehérje íródik át. Az RNS3 egy köztes, 257 nt hosszú IR-rel elválasztva kódolja a 3a és 3b nyílt leolvasási kereteket. Az IR nt-ig terjedő szakasza tartalmazza a 5 - GGTTCAATTC-3 konzervált motívumot. Az MP génje a 142-es nt-tól a 1011-es nt-ig terjed és 290 aminosavat kódol. A nukleotid sorrendből származtatott aminosav sorrend magába foglalja a 30K szupercsaládra jellemző 33 aa hosszú MSVPQVLCAITRTVMANAEGSIRIYLADLGDDE konzervált régiót, amely a PSV-Rp esetében 8 aminosavban térhet el a többi PSV izolátumtól (aláhúzott aa-k). Az RNS3 molekulára vetítve az ORF3b a 1269-es nt-tól a 1919-es nt-ig terjed, ami 217 aminosavat kódol. A CP N-terminális része (10 17 aa) argininban gazdag. A PSV-Rp teljes nukleotid sorrendjét, valamint az egyes ORF-ek nukleotid és a kódolt aminosav szekvenciáját összehasonlítottuk a nemzetközi adatbankban hozzáférhető néhány cucumovírus izolátum ugyanezen régióinak szekvencia adataival. A PSV-Rp RNS-einek teljes nukleotid sorrendje a különböző alcsoportokból származó PSV izolátumokkal összehasonlítva 74,1 84,6% azonosságot mutatott, míg a teljes genomra számítva az 6
9 azonosság: PSV-J esetében (79,5%), PSV-W esetében (83,1%), PSV-Mi esetében (78,2%). Az egyéb cucumovírus izolátumokkal mutatott azonosság ezen a szinten 56,8 68,1% között változott. A PSV-Rp RNS1 és RNS2 ORF1a, ORF2a, ORF2b és ORF3a tekintetében nukleotid szinten a legnagyobb azonosságot a II-es alcsoportba tartozó PSV-W-vel mutatta, míg az RNS3-at vizsgálva közel azonos mértékű azonosság volt megfigyelhető mindhárom alcsoport tekintetében (80,9 83,9%). A CP-t kódoló ORF3b esetében nukleotid szinten a PSV-J 83,3%, a PSV-Mi 83,2%, míg a PSV-W mindössze 78,8% azonosságot mutatott a PSV-Rp-vel. Aminosav szinten a legnagyobb azonosság a III. alcsoportba tartozó PSV-Mi esetében volt megfigyelhető (86,6%). Minden esetben a kapott nt értékek jócskán elmaradtak az egy alcsoportba tartozást jelentő 90%-os határtól. Az eredmények alapján izolátumunk jelentősen eltért a többi PSV izolátumtól és az ismert alcsoportok egyikébe sem volt besorolható. Az alacsony azonossági értékek egy új, IV. alcsoport létrehozását indokolják A PSV-Rp filogenetikai és rekombinációs elemzése A cucumovírus izolátumok génjeinek nukleotid sorrendjét alapul véve filogenetikai törzsfákat készítettünk. Az 1a, 2a és 3a fehérjéket kódoló gének esetében a PSV-Rp a legközelebbi filogenetikai rokonságot a PSV-W-vel mutatta, azonban alcsoport szinten jelentősen elkülönült attól. A CP-t kódoló 3b gén esetében azonban a legközelebbi rokonsági kapcsolat a PSV-Mi-vel volt megfigyelhető. Az eltérő filogenetikai eredmények, illetve az RNS-ek esetében megállapított alacsony szekvencia azonossági értékek egyértelműen egy, a PSV evolúciója során az RNS3 szintjén lejátszódott rekombinációs esemény jelenlétére utaltak. Ennek tisztázására a GenBank-ban elérhető teljes PSV RNS3 szekvenciákon rekombinációs vizsgálatokat végeztük. Az elemzés során 2 feltételezett rekombinációs, más néven forró pontot (hot spot) határoztunk meg 95%-os szignifikancia szinten az nt és az nt körüli régióban. Az első forró pont az IR-ben található, 70 nt-dal a ORF3a előtt, míg a másodikat a CP-t kódoló 3b gén stop kodonja előtt 47 nt-dal határoztuk meg. Az RNS3 molekulát 3 részre osztó rekombinációs pontok által meghatározott szakaszokkal ismételten filogenetikai elemzést végeztünk. Az első forró pont előtti, megközelítőleg 1200 nt hosszú régió és a második forró pont utáni 335 nt hosszú régió esetében a PSV-Rp a PSV-W-vel mutatta a legközelebbi rokonságot, míg a két forró pont közötti 674 nt hosszú nt szakasz a PSV-Mi-vel volt a legszorosabb rokonsági viszonyban. A kapott eredmények a középső régió eltérő eredetét bizonyítják, és összhangban vannak a nt sorrend azonosságok eredményeivel. 7
10 A filogenetikai törzsfák eredményei megerősítik, hogy a PSV evolúciója során az izolátumok között rekombináció történt. 3.3 A Pannon ökorégióból származó PSV izolátumok molekuláris jellemzése A PSV-Rp teljes molekuláris elemzését követően további 9, a Pannon ökorégió területéről, fehér akácról származó PSV izolátum jellemzését végeztük el. A molekuláris munkák során a N. benthamiana tesztnövényeken felszaporított PSV izolátumok RNS3 molekulájának részleges klónozását és nukleinsav sorrend meghatározását végeztük el. A meghatározott szekvencia adatokat a GenBank nemzetközi adatbázisban helyeztük el. A 9 meghatározott részleges MP-t kódoló gén, teljes IR, CP-t kódoló gén és 3 NCR régió nukleotid sorrendjének mérete nt között változott, kivéve az 1542 nt hosszúságú PSV-Cs izolátumot, amelynek a 3 NCR régiójában egy 196 nt hosszú szakasz megkettőződését (duplikációját) figyeltük meg. A vizsgált RNS3 szakaszok teljes egészében magukba foglalták azt a régiót is, mely a PSV-Rp esetében a két rekombinációs pontot és a CP gént tartalmazta (1.ábra) a CP gén 5 oligo 3 oligo 1. ábra. A PSV RNS3 molekula Zöld színnel a Pannon ökorégióból származó izolátumok esetében meghatározott nukleinsav szakasz látható. A piros nyilak és a felettük lévő számok a PSV-Rp-nél meghatározott rekombinációs pontokat jelölik. A vizsgált 9 izolátum CP régióinak nukleotid és a kódolt aminosav sorrendjét összehasonlítottuk egymással és néhány a nemzetközi adatbázisban hozzáférhető cucumovírus izolátum ugyanezen régiójának nukleotid és aminosav sorrendjével. A Pannon ökorégióból származó izolátumok nukleotid sorrendje 96,3 98,0%, míg aminosav sorrendje 98,1 100% azonosságot mutatott a PSV-Rp izolátuméval. Egyéb cucumovírus izolátumok esetében a következő azonosságokat állapítottuk meg: PSV-J (nt: 82,1 83,2%, aa: 81,1 82,9%), PSV-W (nt: 77,6 79,3%, aa: 70,5 72,8%), PSV-Mi (nt: 82,6 84,3%, aa: 85,3 86,6%), CMV-Trk7 (nt: 55,3 58,6%, aa: 49,3 50,2%), CMV-Fny (nt: 53,4 54,8%, aa: 47,5 8
11 49,3%), TAV-KC (nt: 65,2 66,7%, aa: 70,2 72,4%), GMMV (nt: 63,5 65,4%, aa: 70,5 72,4%). A fehér akácról származó izolátumok közötti nagyfokú azonossági értékek egyértelműen azt mutatják, hogy ezek az izolátumok egy alcsoportba tartoznak, míg az egyéb PSV izolátumokkal összehasonlítva kizárható a közeli rokonság. 3.4 A Pannon ökorégióból származó PSV-izolátumok filogenetikai vizsgálata A filogenetikai vizsgálatokat számos cucumovírust alapul véve, a PSV-Rp esetében megállapított 2 rekombinációs pont közötti szakaszra (2a. ábra) és a rekombinációs pontokat magában foglaló teljes klónozott régióra (2b. ábra) is elvégeztük. Az első esetben izolátumaink a III. alcsoporttal mutatták a legközelebbi rokonságot, míg a teljes régió elemzésekor a II. alcsoporttal bizonyult a legszorosabbnak ez a kapcsolat. Mindkét eredmény megegyezett a PSV-Rp esetében kapott korábbi eredményekkel, azaz a II. és III. alcsoport között rekombináció történt. A törzsfán látható, hogy a pannon régióból származó izolátumok egyértelműen elkülönülnek a többi vizsgált mintától és egy új, jól körülhatárolt alcsoportot alkotnak. a BMV-F b BMV-F 1000 CMV-Fny CMV-Trk CMV-Trk7 CMV-Fny TAV-KC TAV-KC PSV-J PSV-P I 1000 PSV-MI PSV-P III PSV-ER PSV-W PSV-Mi PSV-S PSV-Rp2 II III PSV-J PSV-Er PSV-W PSV-Cs I II PSV-T2 426 PSV-Rp 883 PSV-Tev PSV-T1 863 PSV-Ljb 622 PSV-F 545 PSV-B 538 PSV-Cs IV PSV-Sz PSV-B IV PSV-Sz 890 PSV-T PSV-T2 PSV-Rp2 428 PSV-F PSV-Tev PSV-Ljb 0.1 PSV-Rp 2 ábra. A cucumovírus RNS3 molekulák különböző régiójának filogenetikai vizsgálata a: A rekombinációs pontok közötti nt szakaszt, b: a részleges MP-t kódoló, a teljes IR, a teljes CP-t kódoló és a 3 NCR régiókat magába foglaló nt szakaszt vizsgálva. Az utóbbi a rekombináns régiót is magában foglalja. Az elágazásoknál feltüntetett számok a bootstrap-analízis eredményét mutatják, a BMV-F csoporton kívüli kontroll izolátum. A négyzetek és a római számok a PSV csoportok vizuális elkülönítését és azonosítását segítik. 9
12 3.5 A Pannon ökorégióból származó PSV-izolátumok gazdanövénykör vizsgálata és tünettani jellemzése A molekuláris és filogenetikai vizsgálatokat követően mind a 10 PSV izolátum fertőzési és tünettani sajátosságait megvizsgáltuk 5 növénycsalád 16 faján. Tünetmentes növények esetében a vírus jelenlétét az inokulált és a csúcsi levelekben is Northern blot-tal ellenőriztük, így döntve el, hogy az adott növény látensen fertőzött-e a kórokozóval, vagy sem. A vizsgált PSV izolátumok a földimogyorón a fertőzés hatására a növények satnyulását és a csúcsi levelek mozaikosodását okozták. A C. amaranticolor esetében mindegyik PSV izolátum az inokulált leveleken klorotikus lokális léziókat idézett elő, a növényben a vírus szisztemizálódott, majd a csúcsi leveleken mozaikosodást és levéldeformációt figyelhettünk meg. A fertőzést követően a lencsén és a borsón egyik esetben sem tapasztaltunk tüneteket, a Northern hibridizáció azonban kimutatta a kórokozó jelenlétét, a vírus minden esetben jelen volt látensen a növények csúcsi leveleiben. A mesterséges fertőzések során a magonc fehér akác növényeken enyhe mozaikot tapasztaltunk, amely néhány izolátum esetében (PSV-Rp, PSV-Rp2, PSV-T2) kiegészült gyűrű alakú foltokkal. Az egy hónapos vizsgálati időszak végén, a növényeken a tünetek teljes maszkírozódását figyeltük meg. A vizsgált Nicotiana-fajok közül tünettani szempontból csak a N. glutinosa tesztnövényeken tapasztaltunk jelentősebb eltérést. A kórokozók minden esetben tünetmentesen jelen voltak az inokulált levelekben, amelyet a fertőzést követő első héten vett mintákból készített Northern analízis is alátámasztott. A kórokozók szisztemikus mozgása azonban csak a PSV-Rp2, a PSV-F, a PSV-Sz és a PSV-Ljb esetében volt szabad szemmel megfigyelhető. Ekkor a csúcsi leveleken mozaikot és gyűrűsfoltosságot tapasztaltunk, míg a többi esetben a radioaktív jelölés sem mutatta a kórokozó szisztemikus terjedését. A Cucumis sativus cv. Delicates, Lycopersicon esculentum cv. Kecskeméti jubileum, a N. debney, a N. tabacum cv. Xanthi növényeknek sem az inokulált, sem a szisztemikusan fertőzött leveléből nem volt kimutatható egyik izolátum sem. 10
13 3.5 Új tudományos eredmények 1. Munkánk során elkészítettük a magyarországi, fehér akácról származó PSV-Rp izolátum mindhárom genomi RNS-ének cdns klónját. 2. Meghatároztuk a kórokozó genomi RNS-einek teljes elsődleges szerkezetét, és elhelyeztük azokat a nemzetközi adatbázisban. 3. A PSV-Rp izolátom szekvenciája az első ismert teljes PSV szekvencia Európából és fehér akác gazdanövényről egyaránt. 4. Meghatároztuk további 9, a Pannon ökorégió területéről származó fehér akácról gyűjtött PSV izolátum RNS3 molekulájának részleges nukleotid sorrendjét, valamint a származtatott CP aminosav szekvenciáját. Az összes gyűjtött PSV izolátum nukleotid sorrend alapján nagyfokú azonosságot mutatott egymással és jelentősen eltért a többi ismert alcsoport izolátumaitól. Ezek alapján egy új IV. alcsoport létrehozását indítványozzuk. 5. Elvégeztük a IV. alcsoport izolátumainak széleskörű gazdanövénykör és tünettani jellemzését, melynek során a gazdanövénykör szűkülését és látens fertőzések előfordulását tapasztaltuk. 6. A teljes nukleotid sorrend, valamint filogenetikai és rekombinációs vizsgálatok alapján megállapítottunk, hogy az általunk vizsgált PSV izolátumok evolúciója során egy 2 forró ponthoz kötött rekombináció történt. A rekombinációs pontok az IR-ben és a CP-t kódoló régióban történtek és nagy valószínűséggel a II. és a III. alcsoport izolátumai között mentek végbe. A PSV-Rp vizsgálata során tapasztalt rekombináció az első, pontosan jellemzett rekombinációs esemény természetes ökoszisztémából származó cucumovírusok esetén. 11
14 4. EREDMÉNYEK MEGVITATÁSA ÉS KÖVETKEZTETÉSEK Az eddigi eredmények tükrében az általunk izolált PSV-Rp nukleotid sorrend vizsgálatait követően az alábbi megállapításokat tettük: A teljes nukleotid sorrend meghatározását követően megállapítottuk, hogy a három genomi RNS hosszúsága megegyezett a cucumovírusoknál általánosan ismert genom méretekkel. Nukleinsav sorrendjében fellelhető volt mind az öt ORF, melyek elhelyezkedésüket tekintve is megegyeznek a cucumovírusoknál megszokottakkal. A PSV-Rp RNS-einek teljes nukleotid sorredje a különböző alcsoportokból származó PSV izolátumokkal 74,1 84,6% azonosságot mutatott. Ezek alapján és az ICTV cucumovírusokra megadott kritériumai alapján (Roosinck és mtsai., 2006) a PSV-Rp egyértelműen a Peanut stunt virus fajhoz tartozó izolátum. A fajon belüli hovatartozást tekintve Hajimorad és mtsai. (1999) szerint, egy alcsoportba azok az izolátumok tartoznak, amelyeknek nukleotid sorrend azonossága 90%-nál nagyobb, míg fajon belül az alcsoportok között ez az érték 70 80% közötti. A PSV-Rp egyértelműen távol esik mindhárom PSV alcsoporttól, hiszen nukleotid szinten egyedül a II. alcsoportba tartozó PSV-W-nél volt megfigyelhető mindhárom genomi RNS esetében 80 %-nál valamivel magasabb azonossági érték, mely értékek azonban messze elmaradnak az egy alcsoportba tartozást meghatározó 90%-os azonossági szinttől. Ezek alapján indokolt egy új IV. alcsoport létrehozása, melyben a fehér akácról származó PSV-Rp az alcsoportra jellemző típus-izolátumnak tekinthető Rekombináció szerepe a PSV evolúciójában A TOPALi v2 (Milne és mtsai., 2004) programcsomag segítségével két rekombinációs pontot azonosítottunk, amely a PSV-Rp CP génjének legnagyobb részét közre fogta. A rekombinációs régióban a III. alcsoport PSV-Mi izolátumával mutatta a legközelebbi rokonságot. A nukleotid sorrend azonossági, filogenetikai és rekombináció analitikai vizsgálatok során kapott eredmények egyaránt a PSV evolúciója során végbement rekombinációt bizonyítják. A Cucumovirus nemzetségben meglehetősen gyakori a rekombinációk előfordulásának aránya (Codoñer és Elena, 2008). Az esetek többségében ezek a rekombinációk az RNS3-ban alakulnak ki, mely adat megegyezik saját kutatási eredményeinkkel. Növényházi körülmények között kevert fertőzés hatására CMV és TAV izolátumok, illetve CMV izolátumok között is rekombinációk kialakulását figyelték meg. A rekombinációk az RNS3 szintjén az NCR, IR régiókban, valamint a CP-t és az MP-t kódoló 12
15 génben egyáránt kialakultak, azonban a rekombináns izolátumok általában kevésbé voltak életképesek, mint a szülői izolátumok, ezért rövid időn belül kiszelektálódtak (de Wispelaere és mtsai., 2005; Pierrugues és mtsai., 2007). Szabadföldön gyűjtött izolátumok vizsgálatai szintén a rekombináns izolátumok gyengébb életképességét és az izolátumok kontraszelekcióját bizonyították (Bonnet és mtsai., 2005; Escriu és mtsai., 2007). A PSV-Rp esetében történt rekombináció fennmaradása feltehetőleg annak köszönhető, hogy közel az egész CP gén kicserélődött, ugyanis ebben az esetben nagyobb a rekombináns kórokozó túlélési esélye (Bonnet és mtsai., 2005; Escriu és mtsai., 2007). Az eredmények tükrében megállapíthatjuk, hogy a PSV-Rp egy, az eddigi izolátumoktól elkülönülő IV. alcsoport izolátuma, amely egyben bizonyíték arra is, hogy egy rekombinációs esemény meghatározó szerepet játszott a PSV evolúciójában, habár azt jelenleg nem tudjuk, milyen evolúciós előnyt biztosított, amely a rekombináns vírus fennmaradását és elterjedését segítette elő A Pannon ökorégióból származó PSV-izolátumok molekuláris jellemzése A PSV-Rp molekuláris jellemzése után, számos kérdés merült fel vajon egy unikális izolátumról van-e szó, vagy hasonló genetikai állományú izolátumok találhatók a Kárpátmedencében. A hazai adatokat tekintve Beczner és Devergne (1979) által közölt, Putnok mellett, vörös heréről gyűjtött izolátum esetében bebizonyosodott, hogy a kórokozó egyik akkor ismert alcsoportba sem sorolható. Az akkori molekuláris technológia még nem tette lehetővé a nukleotid sorrend meghatározását, az izolátum elveszett, így jellemzése már nem történhet meg. A szerológiai és a gazdanövénykör eredményekből tudunk csak következtetni a PSV-Rp és a PSV-Tp közötti rokonsági kapcsolat fokára. Kutatásaink során további 9 fehér akácról gyűjtött PSV izolátum molekuláris és patológiai jellemzését végeztük el. Előállítottuk a részleges RNS3 cdns klónokat, melyek tartalmazták a PSV-Rp-nél meghatározott rekombinációs pontokkal közrefogott régiót is. A vizsgált szakaszok mérete közel azonos volt, kivéve a Mezőcsáton gyűjtött PSV-Cs izolátumot, ahol az RNS3 3 NCR régiójában egy196 nt méretű duplikációt azonosítottunk. Ez a jelenség PSV esetében eddig nem volt ismert, előfordulása a cucumovírusokon belül általában a TAV izolátumok sajátossága (Palukaitis és Garcia-Arenal; 2003). Mivel a vizsgált PSV izolátumok a PSV-Rp izolátummal a Hajimorad és mtsai. (1999) által megadott 90 %-os érték feletti azonosságot mutattak a vizsgált régiókban, ezért az izolátumok csoportbeli 13
16 hovatartozása egyértelmű. Ezek alapján a Pannon ökorégióból származó 9 izolátum a PSV- Rp-vel közeli rokon, a IV. alcsoportba tartozó izolátumoknak tekinthetők. A filogenetikai vizsgálatok megerősítették, hogy a többi vizsgált izolátum is magában hordozza a PSV-Rp esetében megfigyelt rekombinációt, tehát az nem csupán a PSV-Rp izolátumra jellemző egyedi sajátosság, hanem a fehér akácról gyűjtött minták esetében a Pannon ökorégió területén általánosan elterjedt a rekombináns izolátumok előfordulása A Pannon ökorégióból származó PSV-izolátumok gazdanövénykör vizsgálata, az okozott tünetek jellemzése Az eddigi ismeretek szerint a PSV sokkal változatosabb genetikai háttérrel rendelkezik, mint a CMV, mégis a CMV-nek több mint 1000 gazdanövénye van, míg a PSV mindösszesen 73 fajt fertőz. Kutatásaink során, a tünettani vizsgálatok is megerősítették, hogy a vizsgált 10 PSV izolátum a jelenleg ismert három PSV alcsoporttól nagymértékben eltér. Az izolátumok közel azonos tüneteket okoznak a vizsgált 16 gazdanövényen. Egyúttal az is megfigyelhető, hogy sok esetben az izolátumok nem, vagy csak nagyon enyhe tüneteket indukálnak a vizsgált növényeken. Az eredményeink alapján feltételezzük, hogy a kórokozó fehér akáchoz történt alkalmazkodása okozza a tünettani változásokat, melyről azonban biztosabb képet csak egyéb gazdanövényekről gyűjtött izolátumok vizsgálata után kaphatnánk. Eddigi irodalmi adatok szerint a C. amaranticolor fajt egyedül a III. alcsoport izolátumai fertőzték szisztemikusan. Egyéb esetben [pl. magyarországi PSV-Tp izolátum (Beczner és Devergne, 1979)] az izolátumok a fertőzött leveleken klorotikus (nekrotikus) lokális léziókat idéztek elő. Jelen kutatásunkban bebizonyosodott, hogy a IV. alcsoport izolátumai szintén szisztemizálódnak a fertőzött C. amaranticolor növényekben, e mellett azonban a csúcsi levelek erős deformációja is megfigyelhető. Mivel a filogenetikai és rekombinációs vizsgálatok PSV izolátumaink és a III. alcsoport között a CP-t kódoló régióban mutatták ki a legközelebbi evolúciós rokonságot, ezért feltételezzük, hogy a C. amaranticolor esetében a szisztemikus terjedés létrejöttében a CP gén is szerepet játszik. Ezt az eredményt támasztja alá számos korábbi kutatómunka is (Taliansky és Garcia-Arenal, 1995; Salánki és mtsai., 1997). A C. amaranticolor-t a megjelenő szisztemizálódás és a levéldeformáció tünetegyüttes alapján, a IV. alcsoport elkülönítésére ajánljuk. A különböző vizsgált PSV izolátumok által okozott tünetek jelentős mértékben csak a N. glutinosa tesztnövény esetében tértek el egymástól. Amíg az izolátumok többségét Northern blot során csak az inokulált levelekből lehetett kimutatni, addig 4 esetben a 14
17 kórokozó a csúcsi leveleken mozaikot és gyűrű alakú foltokat idézett elő. Du és mtsai. (2008) a már korábban említett CP-nek és a 2a fehérjének a vírus hosszú távú mozgásában, vagy éppen annak gátlásában betöltött szerepét emelik ki. Az eltérő tüneteket produkáló PSV-Rp és a PSV-Rp2 izolátumok CP-inek aa sorrendje 100%-ban azonos, tehát nagy valószínűséggel N. glutinosa esetében a 2a fehérje szerepe lehet meghatározó a PSV izolátumok hosszú távú mozgásában. Ennek tisztázására a 2a fehérjék aa sorrendjének elemzése kutatócsoportunkban folyamatban van. 15
18 5. FELHASZNÁLT IRODALOM 1. Beczner, L. and Devergne, J.C. (1979): Characterization of a New Peanut Stunt Virus Strain Isolated from Trifolium pratense L. in Hungary. Acta Phytopatologica Academiae Scientiarum Hungaricae, 14: Bonnet, J., Fraile, A., Sacristan, S., Malpica, J.M. and Garcia-Arenal, F. (2005): Role of recombination in the evolution of natural populations of Cucumber mosaic virus, a tripartite RNA plant virus. Virology, 332: Codoñer, F.M and Elena, S.F. (2008): The promiscuous evolutionary history of the family Bromoviridae. Journal of General Virology, 89: de Wispelaere, M., Gaubert, S., Trouilloud, S., Belin, C. and Tepfer, M. (2005): A map of the diversity of RNA3 recombinants appearing in plants infected with Cucumber mosaic virus and Tomato aspermy virus. Virology, 331: Du, Z., Chen, F., Zhao, Z., Liao, Q., Palukaitis, P., and Chen, J. (2008): The 2b protein and the C-terminus of the 2a protein of Cucumber mosaic virus subgroup I strains both play a role in viral RNA accumulation and induction of symptoms. Virology, 380: Escriu, F., Fraile, A. and García-Arenal, F. (2007): Constraints to genetic exchange support gene coadaptation in a tripartite RNA virus. PLoS Pathogenes, 3 e8. doi: /s Gubler, U., Hoffman, B.J. (1983): A simple and very efficient method for generating cdna libraries. Gene, 25: Hajimorad, M.R., Hu, C.C. and Ghabrial, S.A. (1999): Molecular characterization of an atypical old world strain of Peanut stunt virus. Archives of Virology, 144: Lot, H.W., Marrou J., Quiot J.B. and Esvan C. (1972): Contribution à l étude du virus de la mosaique du concombre (CMV). I. Méthode de purification rapide du virus. Annual Review of Phytopathology, 4: Milne, I., Wright, F., Rowe, G., Marshall, D.F., Hushmeier, D. and McGuire, G. (2004): TOPALi: software for automatic identification of recombinant sequences within DNA multiple alignments. Bioinformatics, 20: Mullis, K. B. and Faloona, F. A. (1987): Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction. Methods in Enzymology, 155:
19 12. Page, R. D. M. (1996): TreeView: An application to display phylogenetic trees on personal computers. Computer Applications in the Biosciences, 12: Palukaitis, P. and García-Arenal, F. (2003): Cucumoviruses. Advances in Virus Research, 62: Pierrugues, O., Guilbaud, L., Fernandez-Delmond, I., Fabre, F., Tepfer, M. and Jacquemond, M. (2007): Biological properties and relative fitness of inter-subgroup cucumber mosaic virus RNA 3 recombinants produced in vitro. Journal of General Virology, 88: Rice, P., Longden, I. and Bleasby, A. (2000): EMBOSS: the European molecular open software suite. Trends in Genetics, 16: Roosinck, M.J., Bujarski, J., Ding, S.W., Hajimorad, R., Hanada, K., Scott, S. and Tousgnant, M. (2006): Index of Viruses Bromoviridae In: ICTVdB The Universal Virus Database, version 4. Büchen-Osmond, C (Ed), Columbia University, New York, USA index.htm 17. Salánki, K., Carrére, I., Jacquemond, M., Balázs, E. and Tepfer, M. (1997): Biological properties of pseudorecombinant and recombinant strains created with cucumber mosaic virus and tomato aspermy virus. Journal of Virology, 71: Sambrook, J., Fritsch, E. F. and Maniatis, T. (1989): Molecular cloning: A laboratory manual (2nd edition). Cold Spring Harbor, N.Y: Cold Spring Harbor Laboratory. 19. Taliansky, M.E. and García-Arenal, F. (1995): Role of cucumovirus capsid protein in long-distance movement within the infected plant. Journal of Virology, 69: Thompson, J.D., Gibson, T.J., Plewniak, F., Jeanmougin, F. and Higgins, D.G. (1997): The Clustal X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools. Nucleic Acids Research, 24: White, J.L. and Kaper, J.M. (1989): A simple method for detection of viral satellite RNAs in small tissue samples. Journal of Virological Methods, 23:
20 6. AZ ÉRTEKEZÉS TÉMAKÖRÉBEN MEGJELENT PUBLIKÁCIÓK IF-es folyóiratcikk: Kiss, L., Sebestyén, E., László, E., Salamon, P., Balázs, E. and Salánki, K. (2008): Nucleotide sequence analysis of Peanut stunt virus Rp strain suggests the role of homologous recombination in cucumovirus evolution. Archives of Virology 153 (7) p (IF: 2,02) Kiss, L., Balázs, E. and Salánki, K. (2009): Characterisation of black locust isolates of Peanut stunt virus (PSV) from Pannon ecoregion show the frequent occurrence of the fourth taxonomic PSV subgroup. European Journal of Plant Pathology 125 (4) p (IF: 2,054) Nem IF-es folyóiratcikk: Kiss L. Salánki K. és Balázs E. (2008): Magyarországi, fehér akácról (Robinia pseudoacacia L.) származó földimogyoró satnyulás vírus (Peanut stunt virus, PSV) izolátumok jellemzése. Növényvédelem 44 (11) p Konferencia kiadványok (absztrakt) Kiss, L., Sebestyén, E., László, E., Salamon, P., Balázs, E., Salánki, K. (2007): Nucleotide sequence analysis of Peanut stunt virus Rp isolate, prove the role of recombination in Cucumovirus evolution, 15th International Congress of the Hungarian Society for Microbiology (July 18-20, Budapest), Book of Abstracts, p. 61. Kiss, L., Sebestyén, E., László, E., Salamon, P., Balázs, E., Salánki, K. (2008): Molecular characterization of a black locust strain of Peanut stunt virus, The 3rd Conference of the International Working Group on Legume and Vegetable Viruses (August 20-23, Ljubljana, Slovenia), Book of Abstracts, p. 61. Kiss L., Sebestyén E., László E., Salamon P., Balázs E., Salánki K. (2008): In vivo rekombináns földimogyoró satnyulás virus (Peanut stunt virus, PSV) izolátum molekuláris jellemzése, 54. Növényvédelmi Tudományos Napok, Növénykórtani szekció, (február 27-28, Budapest), Növényvédelmi Tudományos Napok 2008, p. 29. Kiss L., Salánki K., Balázs E. (2009): Pannon ökorégióból származó földimogyoró satnyulás vírus (Peanut stunt virus,psv) izolátumok jellemzése, 55. Növényvédelmi Tudományos Napok, Növénykórtani szekció, (február 23-24, Budapest), Növényvédelmi Tudományos Napok 2009, p
Salánki Katalin impakt faktorokat tartalmazó közlemény listája
Salánki Katalin impakt faktorokat tartalmazó közlemény listája Összegzett impakt faktor: 70,800 Várható IF-ek összege: 1,576 Összesen: 72,376 2015 1. Almási A, Csilléry G, Csömör Z, Nemes K, Palkovics
RészletesebbenDOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS PANNON ÖKORÉGIÓBÓL SZÁRMAZÓ FÖLDIMOGYORÓ SATNYULÁS VÍRUS (PEANUT STUNT VIRUS, PSV) IZOLÁTUMOK JELLEMZÉSE.
DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS PANNON ÖKORÉGIÓBÓL SZÁRMAZÓ FÖLDIMOGYORÓ SATNYULÁS VÍRUS (PEANUT STUNT VIRUS, PSV) IZOLÁTUMOK JELLEMZÉSE Kiss László Budapest 2011 A doktori iskola megnevezése: tudományága: vezetője:
RészletesebbenAkadémiai Doktori Értekezés Tézisei
Akadémiai Doktori Értekezés Tézisei A CUCUMOVÍRUSOK KÓRTANI VÁLTOZÉKONYSÁGA Salánki Katalin Gödöllő, 2012 BEVEZETÉS ÉS CÉLKITŰZÉS A növényi vírusok gazdasági jelentősége felbecsülhetetlen, egyes szerzők
RészletesebbenNEM HOMOLÓG MOZGÁSI FEHÉRJE HATÁSA AZ UBORKA MOZAIK VÍRUS MOZGÁSÁRA ÉS FERTŐZÉSI TULAJDONSÁGAIRA
Szent István Egyetem Gödöllő NEM HOMOLÓG MOZGÁSI FEHÉRJE HATÁSA AZ UBORKA MOZAIK VÍRUS MOZGÁSÁRA ÉS FERTŐZÉSI TULAJDONSÁGAIRA Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei HUPPERT EMESE Gödöllő 2004 A doktori iskola
RészletesebbenDNS-szekvencia meghatározás
DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer
Részletesebbena tekintetben, hogy a 2a fehérje átfedő, karboxi terminális 67 aminosavának milyen szerepe van a növények fertőzése során, mindkét CMV alcsoporthoz
Különböző földimogyoró satnyulás vírus (peanut stunt virus, PSV) izolátumok szisztemikus terjedésében Nicotiana glutinosa növények esetében megfigyelt eltérések vizsgálatához több izolátumot gyűjtöttünk
RészletesebbenZárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)
Zárójelentés Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata c. OTKA kutatási programról Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI) 2012 1 Az Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata c. programban azt
RészletesebbenA szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát
RészletesebbenFiatal kutatói beszámoló
Talajbiológiai- és biokémiai osztály Fiatal kutatói beszámoló Gazdag Orsolya tudományos segédmunkatárs Témavezető: Dr. Ködöböcz László 2013.12.03. Témacím: Különböző gazdálkodási módok hatása a talaj baktérium-közösségeinek
RészletesebbenEgy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a
Egy 10,3 kb méretű, lineáris, a mitokondriumban lokalizált DNS-plazmidot izoláltunk a Fusarium proliferatum (Gibberella intermedia) ITEM 2337-es törzséből, és a plazmidot pfp1- nek neveztük el. Proteináz
RészletesebbenA bioinformatika gyökerei
A bioinformatika gyökerei 1944: Avery a transforming principle a DNS 1952: Hershey és Chase perdöntő bizonyíték: a bakteriofágok szaporodásakor csak a DNS jut be a sejtbe 1953: Watson és Crick a DNS szerkezete
RészletesebbenAngéla Anda, DSc. Author(s), followed by an Abstract (not more than 200 words), Összefoglalás and
2017 2017 Angéla Anda, DSc 8360 Author(s), followed by an Abstract (not more than 200 words), Összefoglalás and J. Péter Polgár, PhD, Dean of the Faculty Angéla Anda, DSc Péter András Takács, PhD Éva Kormos
RészletesebbenMIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK VIZSGÁLATA Péteri Adrienn Zsanett Témavezetők: Dr. Varga János, Egyetemi docens Dr. Vágvölgyi Csaba, Tanszékvezető egyetemi
RészletesebbenNövényvédelmi Tudományos Napok 2014
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014 Budapest 60. NÖVÉNYVÉDELMI TUDOMÁNYOS NAPOK Szerkesztők HORVÁTH JÓZSEF HALTRICH ATTILA MOLNÁR JÁNOS Budapest 2014. február 18-19. ii Szerkesztőbizottság Tóth Miklós
RészletesebbenKOLUMBIAI DATURA VÍRUS (COLOMBIAN DATURA VIRUS, CDV): ÚJABB VESZÉLYES POTYVIRUS ELŐFORDULÁSA MAGYARORSZÁGON
KOLUMBIAI DATURA VÍRUS (COLOMBIAN DATURA VIRUS, CDV): ÚJABB VESZÉLYES POTYVIRUS ELŐFORDULÁSA MAGYARORSZÁGON Salamon P. 1 Palkovics L. 2 1 4521 Berkesz 2 Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóközpont 2100
RészletesebbenA doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.
A doktori értekezés tézisei A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. Bíró Judit Témavezető: Dr. Fehér Attila Magyar Tudományos Akadémia
RészletesebbenA PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA
EGYETEMI DOKTORI (PH.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA Nagy Zoltán Témavezet : Dr. Biró Sándor Debreceni Egyetem Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék
RészletesebbenÉter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése
Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése Doktori értekezés tézisei Szabó Zsolt Témavezető: Dr. Bihari Zoltán vezető kutató
RészletesebbenCLUSTALW Multiple Sequence Alignment
Version 3.2 CLUSTALW Multiple Sequence Alignment Selected Sequences) FETA_GORGO FETA_HORSE FETA_HUMAN FETA_MOUSE FETA_PANTR FETA_RAT Import Alignments) Return Help Report Bugs Fasta label *) Workbench
RészletesebbenKÜLÖNBÖZŐ TERMÉSZETES ÉS MESTERSÉGES REKOMBINÁNS SZILVA HIMLŐ VÍRUS (PLUM POX VIRUS, PPV) IZOLÁTUMOK JELLEMZÉSE
DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI KÜLÖNBÖZŐ TERMÉSZETES ÉS MESTERSÉGES REKOMBINÁNS SZILVA HIMLŐ VÍRUS (PLUM POX VIRUS, PPV) IZOLÁTUMOK JELLEMZÉSE Koósné Szathmáry Erzsébet Budapest 2009 A doktori iskola
RészletesebbenBakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
Részletesebben1.ábra Az intront tartalmazó génkonstrukció felépítése.
Korábbi kísérleteink során a szilva himlő vírus (PPV) köpenyfehérje (CP) génjével és 3 nem kódoló régióval sikeresen transzformáltunk növényeket, melyek rezisztensek voltak a felülfertőző vírussal szemben.
Részletesebbenc. Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei BUKOVINSZKI ÁGNES Eötvös Loránd Tudományegyetem, Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola
ELLENÁLLÓSÁG KIALAKÍTÁSA A BURGONYA Y VÍRUS (PVY) KÜLÖNBÖZŐ TÖRZSEI ÉS MESTERSÉGES HIBRIDJEI ELLEN BURGONYÁBAN SHOOTER MUTÁNS AGROBAKTÉRIUMON ALAPULÓ TRANSZFORMÁCIÓS RENDSZERBEN c. Doktori (Ph.D.) értekezés
RészletesebbenELTE Doktori Iskola Evolúciógenetika, evolúciós ökológia, konzervációbiológia program Programvezető: Dr. Szathmáry Eörs, akadémikus, egyetemi tanár
ELTE Doktori Iskola Evolúciógenetika, evolúciós ökológia, konzervációbiológia program Programvezető: Dr. Szathmáry Eörs, akadémikus, egyetemi tanár A CSIRKÉK FERTŐZŐ BURSITISÉT OKOZÓ VÍRUSTÖRZSEK GENETIKAI
RészletesebbenÚj temékek az UD- GenoMed Kft. kínálatában!
Új temékek az UD- GenoMed Kft. kínálatában! Szolgáltatásaink: Medical Genomic Technologies Kft. Betegtoborzás és biobanking Bioinformatika o Adatelemzés/adatbányászás o Integrált adatbázis készítés Sejtvonal
RészletesebbenMolekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
RészletesebbenAz uborka mozaik vírus (Cucumber mosaic virus) 2b fehérje funkcionális analízise
Szent István Egyetem Az uborka mozaik vírus (Cucumber mosaic virus) 2b fehérje funkcionális analízise Doktori (PhD) értekezés Nemes Katalin Gödöllő 2014 A doktori iskola neve: Tudományága: Vezetője: Biológia
RészletesebbenNEM HOMOLÓG MOZGÁSI FEHÉRJE HATÁSA AZ UBORKA MOZAIK VÍRUS MOZGÁSÁRA ÉS FERTŐZÉSI TULAJDONSÁGAIRA. Doktori (Ph.D.) értekezés HUPPERT EMESE.
Szent István Egyetem Gödöllő NEM HOMOLÓG MOZGÁSI FEHÉRJE HATÁSA AZ UBORKA MOZAIK VÍRUS MOZGÁSÁRA ÉS FERTŐZÉSI TULAJDONSÁGAIRA Doktori (Ph.D.) értekezés HUPPERT EMESE Gödöllő 2004 A doktori iskola neve:
RészletesebbenKutatási zárójelentés
Kutatási zárójelentés Az OTKA F043155 számú, A mézelő méh (Apis mellifera L.) vírusfertőzéseinek és a méhpatogén vírusok molekuláris szerkezetének tanulmányozása című ifjúsági OTKA pályázat keretében,
RészletesebbenAlgaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben Duleba Mónika Környezettudományi Doktori Iskola I.
RészletesebbenA géntechnológiát megalapozó felfedezések
2010. december BIOTECHNOLÓGIA Rova tvezető: Dr. Heszky László akadémikus A géntechnológia genetikai alapjai c. I. fejezet 1-5. részében azokat a tudományos eredményeket mutattuk be, melyek bizonyítják,
RészletesebbenDOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Hepatitiszt okozó vírusok molekuláris vizsgálata. N. Szomor Katalin. Budapest 2009.
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Hepatitiszt okozó vírusok molekuláris vizsgálata N. Szomor Katalin Budapest 2009. 2 1. BEVEZETÉS A világ legjelentősebb népegészségügyi problémái közé tartozik a vírusok által
RészletesebbenBaranyáné Dr. Ganzler Katalin Osztályvezető
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Biokémiai és Élelmiszertechnológiai Tanszék Kapilláris elektroforézis alkalmazása búzafehérjék érésdinamikai és fajtaazonosítási vizsgálataira c. PhD értekezés
RészletesebbenA basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan
A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan fehérjét (FC-1 killer toxint) választ ki a tápközegbe, amely elpusztítja az opportunista patogén Cryptococcus neoformans-t.
Részletesebben10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik
10. Genomika 2. 1. Microarray technikák és bioinformatikai vonatkozásaik Microarrayek és típusaik Korrelált génexpresszió mint a funkcionális genomika eszköze 2. Kombinált megközelítés a funkcionális genomikában
RészletesebbenHumán kórokozó vírusok előfordulása magyarországi felszíni- és fürdővizekben
Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Környezettudományi Doktori Iskola Humán kórokozó vírusok előfordulása magyarországi felszíni- és fürdővizekben Kern nita Témavezető: Dr. Vargha Márta,
RészletesebbenAkadémiai Doktori Értekezés
Akadémiai Doktori Értekezés A CUCUMOVÍRUSOK KÓRTANI VÁLTOZÉKONYSÁGA Salánki Katalin Gödöllő, 2012 0 TARTALOMJEGYZÉK 1. BEVEZETÉS 4 2. IRODALMI ÁTTEKINTÉS 6 2. 1. A cucumovírusok jelentősége 6 2. 2. A cucumovírusok
RészletesebbenFehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
RészletesebbenSOLiD Technology. library preparation & Sequencing Chemistry (sequencing by ligation!) Imaging and analysis. Application specific sample preparation
SOLiD Technology Application specific sample preparation Application specific data analysis library preparation & emulsion PCR Sequencing Chemistry (sequencing by ligation!) Imaging and analysis SOLiD
Részletesebbentranszláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
RészletesebbenTipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során Ungvári Erika, Tóth Ákos Magyar Infektológiai és Klinikai Mikrobiológiai
RészletesebbenOrvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014. Április 8 Május 22 8th April 22nd May
Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014 Április 8 Május 22 8th April 22nd May Hét / 1st week (9. kalendariumi het) Takács László / Fehér Zsigmond Magyar kurzus Datum/ido Ápr. 8 Apr. 9 10:00 10:45
RészletesebbenBiomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással
Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással Kovács Zoltán ügyvezető DEKUT Debreceni Kutatásfejlesztési Közhasznú Nonprofit Kft. Problémadefiníció Első generációs
Részletesebben5. Molekuláris biológiai technikák
5. Molekuláris biológiai technikák DNS szaporítás kémcsőben és élőben. Klónozás, PCR, cdna, RT-PCR, realtime-rt-pcr, Northern-, Southernblotting, génexpresszió, FISH 5. Molekuláris szintű biológiai technikák
RészletesebbenNÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A citológia és a genetika társtudománya Citogenetika A kromoszómák eredetét, szerkezetét, genetikai funkcióját,
RészletesebbenDOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI HÁROMFÁZISÚ MEGOSZLÁS ALKALMAZÁSA ÉLELMISZERFEHÉRJÉKVIZSGÁLATÁBAN
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI HÁROMFÁZISÚ MEGOSZLÁS ALKALMAZÁSA ÉLELMISZERFEHÉRJÉKVIZSGÁLATÁBAN Szamos Jenő KÖZPONTI ÉLELMISZER-TUDOMÁNYI KUTATÓINTÉZET Budapest 2004 A doktori iskola megnevezése: tudományága:
RészletesebbenA kvantitatív PCR alkalmazhatósága a fertőző bronchitis vakcinák hatékonysági vizsgálatában. Derzsy Napok, Sárvár, 2011 Június 2-3.
A kvantitatív PCR alkalmazhatósága a fertőző bronchitis vakcinák hatékonysági vizsgálatában Pénzes Zoltán PhD, Soós Pál PhD, Nógrády Noémi PhD, Varga Mária, Jorge Chacón PhD, Zolnai Anna PhD, Nagy Zoltán
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Sertés circovírusok járványtani vizsgálata
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Sertés circovírusok járványtani vizsgálata PhD dolgozat tézisei Készítette: Dr. Cságola Attila Témavezet : Dr. Tuboly Tamás 2009 Szent István Egyetem
RészletesebbenKlónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.
Növények klónozása Klónozás Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása. Görög szó: klon, jelentése: gally, hajtás, vessző. Ami
RészletesebbenELTE Biológia Doktori Iskola Klasszikus és molekuláris genetika program Programvezető: Dr. Orosz László, MTA levelező tagja. Tudományos előzmények
ELTE Biológia Doktori Iskola Klasszikus és molekuláris genetika program Programvezető: Dr. Orosz László, MTA levelező tagja GALAMB PARAMYXOVÍRUS-1 TÖRZSEK MOLEKULÁRIS GENETIKAI VIZSGÁLATA, FILOGENETIKÁJA
RészletesebbenNUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag
NUKLEINSAVAK Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag RNS = Ribonukleinsav DNS = Dezoxi-ribonukleinsav A nukleinsavak
RészletesebbenBioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Biológiai adatbázisok. Cserző Miklós 2018
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás Mi az adatbázis A biológia kapcsolata az adatbázisokkal Az adatbázisok típusai Adatbázis formátumok,
RészletesebbenAz örökítőanyag. Az élőlények örökítőanyaga minden esetben nukleinsav (DNS,RNS) (1)Griffith, (2)Avery, MacLeod and McCarty (3)Hershey and Chase
SZTE, Orv. Biol. Int., Mol- és Sejtbiol. Gyak., VIII. Az örökítőanyag Az élőlények örökítőanyaga minden esetben nukleinsav (DNS,RNS) (1)Griffith, (2)Avery, MacLeod and McCarty (3)Hershey and Chase Ez az
RészletesebbenA PNP kóroktanának molekuláris vizsgálata Dán Ádám és Rónai Zsuzsanna
A PNP kóroktanának molekuláris vizsgálata Dán Ádám és Rónai Zsuzsanna XXVI. Derzsy Napok 2018. június 7-8. Hajdúszoboszló 1 Marek betegség vírusa Vakcina vírustörzs Alphaherpesvirinae Mardivirus Gallid
RészletesebbenA búza (Triticum aestivum L.) glutamin szintetáz enzim viselkedése abiotikus stresszfolyamatok (a szárazság- és az alumíniumstressz) során
Doktori (PhD) értekezés tézisei A búza (Triticum aestivum L.) glutamin szintetáz enzim viselkedése abiotikus stresszfolyamatok (a szárazság- és az alumíniumstressz) során Készítette: Nagy Zoltán Témavezető:
RészletesebbenKészítette: Pintér Zsuzsanna (Biológia környezettan V.)
A hazai földalatti gombák elterjedésének természetvédelmi megítélése és a Gautieria nemzetséghez tartozó néhány faj ITS régiójának szekvenciaanalízise faj ITS régiójának szakdolgozat Készítette: Pintér
RészletesebbenTÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben
esirna mirtron BEVEZETÉS TÉMAKÖRÖK Ősi RNS világ RNS-ek tradicionális szerepben bevezetés BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek
RészletesebbenBudapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék
Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék PATOGÉN MIKROORGANIZMUSOK KIMUTATÁSÁRA SZOLGÁLÓ GYORS MÓDSZEREK ÖSSZEHASONLÍTÓ VIZSGÁLATA Rohonczy Kata Doktori
RészletesebbenKÓROKOZÓ VÍRUSOK ELŐFORDULÁSA MAGYARORSZÁGI FELSZÍNI- ÉS FÜRDŐVIZEKBEN. Doktori értekezés tézisei. Kern Anita
KÓROKOZÓ VÍRUSOK ELŐFORDULÁSA MAGYARORSZÁGI FELSZÍNI- ÉS FÜRDŐVIZEKBEN Doktori értekezés tézisei Kern Anita Eötvös Loránd Tudományegyetem, Környezettudományi Doktori Iskola, Környezetbiológia Program,
RészletesebbenA Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában
A Multi Locus Sequence Typing (MLST) alkalmazhatósága az élelmiszermikrobiológiában Sipos Rita, Lukács Alena, Simon Janka, Szántó-Egész Réka, Micsinai Adrienn 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu,
RészletesebbenMolekuláris biológiai módszerek alkalmazása a biológiai környezeti kármentesítésben
Molekuláris biológiai módszerek alkalmazása a biológiai környezeti kármentesítésben Dr. Kovács Tamás, Kovács Árpád László Kármentesítés Aktuális Kérdései 2013 Budapest, 2013.03.21-22 Bioremediáció során
RészletesebbenOktatói önéletrajz Dr. Király Zoltán
kutatóprofesszor Kertészettudományi Kar Növényélettan és Növényi Biokémia Tanszék Karrier Felsőfokú végzettségek: 1944-1948 Agrártudományi Egyetem, Gödöllő, agrármérnök Tudományos fokozatok, címek:: 1957,
RészletesebbenGabonacsíra- és amarant fehérjék funkcionális jellemzése modell és komplex rendszerekben
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Biokémiai és Élelmiszertechnológiai Tanszék Gabonacsíra- és amarant fehérjék funkcionális jellemzése modell és komplex rendszerekben c. PhD értekezés Készítette:
RészletesebbenÁllatorvos-tudományi Doktori Iskola. A vírusos lóarteritis hazai elterjedtségének és a vírus genetikai állományának vizsgálata
Állatorvos-tudományi Doktori Iskola A vírusos lóarteritis hazai elterjedtségének és a vírus genetikai állományának vizsgálata című doktori (Ph.D.) értekezés tézisei Készítette: Dr. Hornyák Ákos Budapest
RészletesebbenA fotodegradációs folyamat színváltoztató hatása a bútoriparban felhasználható faanyagoknál
DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A fotodegradációs folyamat színváltoztató hatása a bútoriparban felhasználható faanyagoknál Persze László Sopron 2014 Az értekezés Nyugat-magyarországi Egyetem Simonyi Károly
RészletesebbenA C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban
Ph.D. tézisek A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban Írta: Juhász Szilvia Témavezető: Dr. Haracska Lajos Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont Genetikai Intézet
RészletesebbenHuman genome project
Human genome project Pataki Bálint Ármin 2017.03.14. Pataki Bálint Ármin Human genome project 2017.03.14. 1 / 14 Agenda 1 Biológiai bevezető 2 A human genome project lefolyása 3 Alkalmazások, kitekintés
RészletesebbenGyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata AKI kíváncsi kémikus kutatótábor 2017.06.25-07.01. Témavezetők : Telbisz Ágnes, Horváth Tamás Kutatók : Dobolyi Zsófia, Bereczki Kristóf, Horváth Ákos Gyógyszerrezisztencia
RészletesebbenA humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások. Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék
A humán mitokondriális genom: Evolúció, mutációk, polimorfizmusok, populációs vonatkozások Egyed Balázs ELTE Genetikai Tanszék Endoszimbiotikus gén-transzfer (Timmis et al., 2004, Nat Rev Gen) Endoszimbiotikus
Részletesebbenavagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest
Iparilag alkalmazható szekvenciák, avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest Neutrokin α - jelentős kereskedelmi érdekek
RészletesebbenAZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA
AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA Gödöllő 2007. 1 A Doktori Iskola megnevezése: Szent István Egyetem Biológia Tudományi
RészletesebbenÚj temékek az UD-GenoMed Kft. kínálatában!
Új temékek az UD-GenMed Kft. kínálatában! Műanyag termékek: SARSTEDT műanyag termékek teljes választéka Egyszer használats labratóriumi műanyag eszközök szövet és sejttenyésztéshez Vérvételi és diagnsztikai
RészletesebbenNövényi sejtek által előállított monoklonális antitesttöredékek jellemzése
BIOTECHNOLÓGIÁK MŰSZAKI HÁTTERE Növényi sejtek által előállított monoklonális antitesttöredékek jellemzése Tárgyszavak: idegen fehérje; monoklonális antitest; fehérjestabilitás; növényisejt-szuszpenzió;
RészletesebbenNövényvédelmi Tudományos Napok 2014
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014 Budapest 60. NÖVÉNYVÉDELMI TUDOMÁNYOS NAPOK Szerkesztők HORVÁTH JÓZSEF HALTRICH ATTILA MOLNÁR JÁNOS Budapest 2014. február 18-19. ii Szerkesztőbizottság Tóth Miklós
RészletesebbenEgy szuperoxid (paraquat) toleráns, nagy antioxidáns kapacitású dohány fokozott fogékonysága szisztemikus vírusfertızéssel szemben
Egy szuperoxid (paraquat) toleráns, nagy antioxidáns kapacitású dohány fokozott fogékonysága szisztemikus vírusfertızéssel szemben 1, Nádai Tímea 2 és Künstler András 1 1 MTA ATK, Növényvédelmi Intézet,
RészletesebbenKülönbözı Mycoplasma gallisepticum törzsek összehasonlító vizsgálata több, döntıen PCR alapú molekuláris biológiai módszer segítségével
SZENT ISTVÁN EGYETEM ÁLLATORVOS-TUDOMÁNYI DOKTORI ISKOLA Különbözı Mycoplasma gallisepticum törzsek összehasonlító vizsgálata több, döntıen PCR alapú molekuláris biológiai módszer segítségével Doktori
RészletesebbenA termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.
OTKA K67808 zárójelentés 2012. A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish. A fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH) olyan technikai fejlettséget ért
RészletesebbenSzent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Az elmúlt 30 évben Magyarországon izolált EHV-1 vírustörzsek genetikai tulajdonságainak vizsgálata Malik Péter PhD értekezés tézisei 2012 Szent
RészletesebbenGENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN
GENOMIKA TÖBBFÉLE MAKROMOLEKULA VIZSGÁLATA EGYIDŐBEN Strukturális genomika Genomkönyvtárak DNS szekvenálás Genom programok Polimorfizmusok RFLP DNS könyvtár készítés humán genom 1. Emésztés RE-kal Emberi
RészletesebbenPosztvakcinációs rotavírus surveillance Magyarországon, 2007-2011
Egyetemi doktori (Ph.D.) értekezés tézisei Posztvakcinációs rotavírus surveillance Magyarországon, 2007-2011 Antalné László Brigitta Témavezetők: Dr. Bányai Krisztián és Dr. Kónya József DEBRECENI EGYETEM
RészletesebbenA HLTF koordinált fehérje és DNS átrendezése és aktivitásának összehasonlítása a Bloom szindróma helikáz fehérjével
A HLTF koordinált fehérje és DNS átrendezése és aktivitásának összehasonlítása a Bloom szindróma helikáz fehérjével Ph.D disszertáció tézisei Yathish Jagadheesh Achar Témavezető: Dr. Haracska Lajos Magyar
RészletesebbenÖsszehasonlító környezetmikrobiológiai. Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején
Összehasonlító környezetmikrobiológiai vizsgálatok a Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején Czeibert Katalin Témavezető: Dr. Borsodi Andrea Eötvös Loránd Tudományegyetem, Mikrobiológiai Tanszék
RészletesebbenSZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS OTKA T Erdei fákon kórokozó Phytophthora fajok molekuláris azonosítása
SZAKMAI ZÁRÓJELENTÉS OTKA T 049077 Erdei fákon kórokozó Phytophthora fajok molekuláris azonosítása Előzmények: Előző OTKA projektünk során (T-037352) a Phytophthora fajok erdei fákon való magyarországi
RészletesebbenMutagenezis és s Karcinogenezis kutatócsoport. Haracska Lajos.
Mutagenezis és s Karcinogenezis kutatócsoport SZBK Genetikai Intézete (429 dolgozó,, Tel: 62-599666) haracska@brc.hu Haracska Lajos www.brc.hu/lajoslab Evolúci ció és s karcinogenezis: közös k s gyökerek
Részletesebben12/4/2014. Genetika 7-8 ea. DNS szerkezete, replikáció és a rekombináció. 1952 Hershey & Chase 1953!!!
Genetika 7-8 ea. DNS szerkezete, replikáció és a rekombináció 1859 1865 1869 1952 Hershey & Chase 1953!!! 1879 1903 1951 1950 1944 1928 1911 1 1. DNS szerkezete Mi az örökítő anyag? Friedrich Miescher
RészletesebbenADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ADATBÁNYÁSZAT
RészletesebbenEngedélyszám: 18211-2/2011-EAHUF Verziószám: 1. 2460-06 Humángenetikai vizsgálatok követelménymodul szóbeli vizsgafeladatai
1. feladat Ismertesse a gyakorlaton lévő szakasszisztens hallgatóknak a PCR termékek elválasztása céljából végzett analitikai agaróz gélelektroforézis során használt puffert! Az ismertetés során az alábbi
RészletesebbenSupporting Information
Supporting Information Plasmid Construction DNA cloning was carried out according to standard protocols. The sequence of all plasmids was confirmed by DNA sequencing and amplified using the E. coli strain
RészletesebbenBAROMFIPESTIS VÍRUS (NDV) GENOTÍPUSOK FILOGENETIKÁJA ÉS EVOLÚCIÓJA
ELTE Biológia Doktori Iskola Klasszikus és molekuláris genetika program Programvezető: Dr. Orosz László, MTA levelező tagja BAROMFIPESTIS VÍRUS (NDV) GENOTÍPUSOK FILOGENETIKÁJA ÉS EVOLÚCIÓJA Doktori értekezés
RészletesebbenBUDAPESTI CORVINUS EGYETEM KERTÉSZETTUDOMÁNYI KAR
BUDAPESTI CORVINUS EGYETEM KERTÉSZETTUDOMÁNYI KAR ELTÉRŐ VIRULENCIÁJÚ FITOPLAZMA TÖRZSEK KÖLCSÖNHATÁSÁNAK SZEREPE A KERESZTVÉDETTSÉG KIALAKULÁSÁBAN Doktori értekezés tézisei Tibenszkyné Kiss Emese MTA
RészletesebbenMolekuláris biológiai technikák
Molekuláris biológiai technikák Wunderlich Lívius A Molekuláris biológiai technikák jegyzet igyekszik átfogó képet adni a jövő tudományának, a molekuláris biológiának a módszertanáról. A technikák elméleti
RészletesebbenBiológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek
Biológus MSc Molekuláris biológiai alapismeretek A nukleotidok építőkövei A nukleotidok szerkezete Nukleotid = N-tartalmú szerves bázis + pentóz + foszfát N-glikozidos kötés 5 1 4 2 3 (Foszfát)észter-kötés
Részletesebben11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban
11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban HIV fertőzés kimutatása - (fiktív) esettanulmány 35 éves nő, HIV fertőzöttség gyanúja. Két partner az elmúlt időszakban. Fertőzött-e
RészletesebbenOszvald Mária. A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro és in vivo vizsgálata rizs modell rendszerben
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék PHD ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Készítette: Oszvald Mária A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro
RészletesebbenEgy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése
Zárójelentés 76843 sz. pályázat 2009 2012 Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése A tervezett munka a kutatócsoportunkban korábban genetikai térképezésen
Részletesebben(11) Lajstromszám: E 008 532 (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA
!HU00000832T2! (19) HU (11) Lajstromszám: E 008 32 (13) T2 MAGYAR KÖZTÁRSASÁG Szellemi Tulajdon Nemzeti Hivatala EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA (21) Magyar ügyszám: E 03 783231 (22) A bejelentés
RészletesebbenDNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel
DNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel Gyakorlat helye: BIOMI Kft. Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4. (Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ épülete volt
RészletesebbenDI-, TETRA- ÉS HEXAPLOID TRITICUM FAJOK GENOMJAINAK ELEMZÉSE ÉS AZOK ÖSSZEHASONLÍTÁSA FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓVAL
Hagyomány és haladás a növénynemesítésben DI-, TETRA- ÉS HEXAPLOID TRITICUM FAJOK GENOMJAINAK ELEMZÉSE ÉS AZOK ÖSSZEHASONLÍTÁSA FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓVAL VARGA MÓNIKA, MOLNÁR ISTVÁN ÉS KOVÁCS
RészletesebbenKülönböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai vizsgálata
Élelmiszertudományi Kar, Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék, Budapest Különböző Capsicum annuum var. grossum paprikafajták endofita baktériumainak izolálása, jellemzése és molekuláris biológiai
RészletesebbenDOKTORI (PHD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZAFNER GÁBOR
DOKTORI (PHD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZAFNER GÁBOR MOSONMAGYARÓVÁR 2014 NYUGAT-MAGYARORSZÁGI EGYETEM Mezőgazdaság- és Élelmiszertudományi Kar Mosonmagyaróvár Matematika, Fizika és Informatika Intézet Ujhelyi
Részletesebben