A BAKTERIORODOPSZIN. Péter Imre AINLHQ

Hasonló dokumentumok
Abszorpció, emlékeztetõ

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

A citoszolikus NADH mitokondriumba jutása

INTEGRATED OPTICAL APPLICATIONS OF

A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.

Az eukarióta sejt energiaátalakító organellumai

OPTIKA. Fénykibocsátás mechanizmusa fényforrás típusok. Dr. Seres István

Bakteriorodopszin intermedierek. fotoelektromos válaszai

A maximum entrópia módszer alkalmazása abszorpciós kinetikai

2, = 5221 K (7.2)

Szerves oldott anyagok molekuláris spektroszkópiájának alapjai

A légzési lánc és az oxidatív foszforiláció

Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus. Az energiaközvetítő molekula: ATP

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Név... intenzitás abszorbancia moláris extinkciós. A Wien-féle eltolódási törvény szerint az abszolút fekete test maximális emisszióképességéhez

Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia

Atommodellek de Broglie hullámhossz Davisson-Germer-kísérlet

A fény a biológiában ORMOS PÁL

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Mire költi a szervezet energiáját?

Szalay Péter (ELTE, Kémia Intézet) Szentjánosbogár, trópusi halak, sarki fény Mi a közös a természet fénytüneményeiben?

Egy idegsejt működése. a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál

Műszeres analitika II. (TKBE0532)

A BIOFIZIKA ALAPJAI KEMIOZMOTIKUS ELMÉLET MEMBRÁNON KERESZTÜLI TRANSZPORT

Vizsgálatokat kezdtünk a bakteriorodopszinnál, hogyan befolyásolja a fotociklust, ha a két módon készült retinál hiányos, fehér membránokhoz

a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál. Nyugalmi potenciál. 3 tényező határozza meg:

Fényes élet: fényből élet életből fény

SPEKTROSZKÓPIA, ALGEBRA ÉS BIOENERGETIKA

A glükóz reszintézise.

Fotogerjesztett biofizikai rendszerek. Barócsi Attila

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

6. változat. 3. Jelöld meg a nem molekuláris szerkezetű anyagot! A SO 2 ; Б C 6 H 12 O 6 ; В NaBr; Г CO 2.

A felépítő és lebontó folyamatok. Biológiai alapismeretek

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Novák Béla: Sejtbiológia Membrántranszport

Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

Nukleinsavak építőkövei

Mézerek és lézerek. Berta Miklós SZE, Fizika és Kémia Tsz november 19.

Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata

ZSÍRSAVAK OXIDÁCIÓJA. FRANZ KNOOP német biokémikus írta le először a mechanizmusát. R C ~S KoA. a, R-COOH + ATP + KoA R C ~S KoA + AMP + PP i

BIOLÓGIAI PRODUKCIÓ. Az ökológiai rendszerekben végbemenő szervesanyag-termelés. A növények >fotoszintézissel történő szervesanyagelőállítása

NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag

A fény tulajdonságai

Lumineszcencia spektrometria összefoglaló

CD-spektroszkópia. Az ORD spektroskópia alapja

Abszorpciós spektrometria összefoglaló

sejt működés jovo.notebook March 13, 2018

Abszorpciós spektroszkópia

Hogyan bírhatjuk szóra a molekulákat, avagy mi is az a spektroszkópia?

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

4. Egy szarkomer sematikus rajza látható az alanti ábrán. Aktív kontrakció esetén mely távolságok csökkenése lesz észlelhető? (3)

Fotoszintézis. 2. A kloroplasztisz felépítése 1. A fotoszintézis lényege és jelentısége

Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet

Dr. JUVANCZ ZOLTÁN Óbudai Egyetem Dr. FENYVESI ÉVA CycloLab Kft

Lumineszcencia spektroszkópia

Szerkesztette: Vizkievicz András

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

9. Gyakorlat - Optoelektronikai áramköri elemek

Koherens lézerspektroszkópia adalékolt optikai egykristályokban

NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai

Kémiai Intézet Kémiai Laboratórium. F o t o n o k k e r e s z tt ü z é b e n a D N S

2. ZH IV I.

Atomfizika. Fizika kurzus Dr. Seres István

2.4. ábra Alkalmazási területek

A NÖVÉNYI SEJT FELÉPÍTÉSE

Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció

Spektroszkópiai módszerek 2.

Szemináriumi feladatok (alap) I. félév

Bevezetés a modern fizika fejezeteibe. 4. (a) Kvantummechanika. Utolsó módosítás: november 15. Dr. Márkus Ferenc BME Fizika Tanszék

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Rövid ismertető. Modern mikroszkópiai módszerek. A mikroszkóp. A mikroszkóp. Az optikai mikroszkópia áttekintése

Lumineszcencia alapjelenségek

Produkcióökológiai alapok

folsav, (a pteroil-glutaminsav vagy B 10 vitamin) dihidrofolsav tetrahidrofolsav N CH 2 N H H 2 N COOH

Concursul Preolimpic de Fizică România - Ungaria - Moldova Ediţia a XVIII-a, Cluj-Napoca Proba teoretică, 1 iunie II. Feladat: Lézer (10 pont)

Az atommag összetétele, radioaktivitás

1. mérés: Benzolszármazékok UV spektrofotometriás vizsgálata

1. változat. 4. Jelöld meg azt az oxidot, melynek megfelelője a vas(iii)-hidroxid! A FeO; Б Fe 2 O 3 ; В OF 2 ; Г Fe 3 O 4.

A felvétel és a leadás közötti átalakító folyamatok összességét intermedier - köztes anyagcserének nevezzük.

Cikloalkánok és származékaik konformációja

4.2. Az Al(III) kölcsönhatása aszparaginsav-tartalmú peptidekkel

OZMÓZIS, MEMBRÁNTRANSZPORT

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

FELADATMEGOLDÁS. Tesztfeladat: Válaszd ki a helyes megoldást!

A BIOLÓGIAI JELENSÉGEK FIZIKAI HÁTTERE Zimányi László

Koherens fény (miért is különleges a lézernyaláb?)

Kollár Veronika

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,

TRANSZPORTFOLYAMATOK A SEJTEKBEN

11.3. Az Achilles- ín egy olyan rugónak tekinthető, amelynek rugóállandója N/m. Mekkora erő szükséges az ín 2 mm- rel történő megnyújtásához?

Aromás: 1, 3, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 13, (14) Az azulén (14) szemiaromás rendszert alkot, mindkét választ (aromás, nem aromás) elfogadtuk.

Fizikai kémia és radiokémia labor II, Laboratóriumi gyakorlat: Spektroszkópia mérés

Abszorpciós spektrumvonalak alakja. Vonalak eredete (ld. előző óra)

Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék

Optika Gröller BMF Kandó MTI

Átírás:

A BAKTERIORODOPSZIN Péter Imre AINLHQ

BEVEZETÉS A napfény energiáját az élőlények (növények, algák) egy bonyolult folyamat, a fotoszintézis során alakítják át és tárolják. Létezik egy baktérium, a Halobacterium salinarium, melynek sejtmembránjában egy viszonylag egyszerű rendszer képes a napfény energiájának felhasználásával egy ionpumpát (protonpumpát) működtetni és ennek során a membrán két oldalán egy proton elektrokémiai potenciálkülönbséget létrehozni. (Az angol irodalomban ez a proton-motive force elnevezést kapta és pmf-ként rövidítjük.) A baktérium magas sókoncentrációjú vizeket kedvel. Sejtmembránjában három különböző tartomány, a sárga, piros és a bíbor színű különíthető el, melyek szeparálhatóak is. A bíbormembránba (purple membrane, pm) sűrű pakolással egy fehérje, a bakteriorodopszin (BR) épül be. Elektrondifrakciós vizsgálatok kimutatták, hogy a BR molekulák egy szabályos kétdimenziós kristályt alkotnak a membránban, olymódon, hogy a hexagonális rácspontok körül három BR helyezkedik el (a rácspontok távolsága kb. 6 nm). A BR 248 aminosavból és egy retinálból épül fel. A fehérje hétszer fonódik át a membránon helikális szerkezetben és a C végződés a citoplazma oldalon helyezkedik el. A hét hélix (A, B,...,G) egy belső csatornát képez (1. ábra) és ebbe nyúlik be a retinál. A retinál a G helixen lévő Lys216 oldalláncához kovalensen kapcsolódik egy C=N kötésen, a Schiff-bázison keresztül. A BR szerkezetében hasonlít a szemben lévő retinálhoz, funkciójában azonban lényegesen különbözik. A retinál erős abszorpciós sávval rendelkezik az 570 nm körül, így nyeri a bíbor színt. A retinál egy fotonos gerjesztésével a BR egy olyan fotociklusba léphet, melynek végeredményeképpen egy proton pumpálódik át a BR protoncsatornáján a citoplazmából a sejt külsejébe. Ebben a folyamatban a Schiff-bázis nitrogénjéhez kötött hidrogénnek fontos szerepe van. A fotociklus egy közbenső állapotában (M állapot) ez a proton indul el a sejt külső felé az un. primér proton akceptorhoz (mely feltehetőleg az Asp85 oldalláncán lévő deprotonált karboxil csoport). 1. ábra. A protoncsatorna és a retinálzsák térbeli sémája. A, B,...,G a hét helixet szemlélteti.

A bakteriorodopszin protonpumpa központjának részletei: proton aktív átvitele a membrán egyik oldaláról a másikra. Oxigén jelenlétében a halobaktérium oxidativ foszforilációval termeli az ATP-t. Ha kevés az oxigén, a baktérium átkapcsol a fotoszintetikus módusra. Fényenergia felhasználásával a BR a fotociklus során protonokat pumpál ki a sejtbõl. Az így felépülő pmf hajtja meg az ATP-ázt az ATP szintézishez (Mitchell kemiozmozis). Ezt a folyamatot mesterségesen is reprodukálták szintetikus vezikulákon, melyekbe csak BR-t és ATP-ázt építettek be.

A FOTOCIKLUS A retinál gerjesztése után a BR-ben egy sor molekuláris változás zajlik le. (Egy foton elnyelése után a retinál ill. a BR gerjesztett állapotba jut. Innen kb. 0,4 valószínűséggel visszatér az alapállapotba, a gerjesztési energia a környezetnek adódik át, élettani szempontból ez az energia elvész. A gerjesztett állapotból a BR kb. 0,6 valószínűséggel az un. fotociklusba lép.) Ezen molekuláris változások együttesét és időrendi sorrendjét fotociklusnak (2. ábra) nevezzük. A fotociklusban, melynek hossza szobahőmérsékleten néhány 10 ms (milliszekundum), viszonylag jól megkülönböztethető közbenső állapotok vannak. Ezeket a közbenső állapotokat, időben egymást követő sorrendben K, L, M, N, O betűkkel jelöljük. A BR a ciklus végén visszatér alapállapotba (ahonnan újra gerjeszthető egy fotonnal). A közbenső állapotok közötti átmenetek termikusan aktivált folyamatok, így erősen hőmérséklettől függőek. A fotociklus során a BR abszorpciós spektruma jelentős átmeneti változásokat mutat, tükrözve a BR-ben lezajló

molekuláris változásokat. A közbenső állapotokban a retinál abszorpciós sávjának maximuma lényeges eltolódásokat mutat (melyeket a 2. ábrán az alsó indexekben tüntettünk fel), mely lehetővé teszi a közbenső állapotok követését spektroszkópiai módszerekkel. A közbenső állapotokat betűk jelölik, melyek alsó indexében az adott közbenső állapotra jellemző abszorpciós spektrum maximumának hullámhosszát adtuk meg nm-ben. A nyilaknál feltüntetett idő az átmenet élettartamát adja meg. A K állapot a gerjesztés után rendkívül gyorsan (10 ps) kialakul, melynek során a retinálban egy konformációs átalakulás megy végbe: az alapállapotbeli all-transz konformációból egy 13-cisz konformáció alakul ki. Az L állapotba való átmenetnél feltehetőleg egy fehérje konformációs relaxáció zajlik le, melyet a 13-cisz retinál idéz elő. Az M állapotba való átmenetnél (kb. 80 µs) a Schiff-bázis deprotonálódik, protonját a közeli Asp85-nek adja át. Ezzel megkezdődik a proton pumpálása. (Az előző változások a Schiff-bázis pk-jában idéznek elő olyan változásokat, melyek ezt a protonátadást lehetővé teszik.) A Schiff-bázis deprotonálódása egy nagyon erős kékeltolódást vált ki a retinál abszorpciós spektrumában: a maximum 410 nm-re tolódik el. Ez a nagy eltolódás lényegében teljesen szeparálja az M közbenső állapot abszorpciós sávját a többi közbenső állapot és a BR alapállapot abszorpciós sávjaitól és lehetővé teszi az M állapot közvetlen megfigyelését. 2. ábra. A BR fotociklusa.

Alkalmazás Látható, hogy a bakteriorodopszin működése során különböző állapotaiban megváltoztatja színét. A reakciósor végén, amikor visszakerül alapállapotába, eredeti színét is visszanyeri. A színváltozások egyéb optikai tulajdonságok, például az optikai törésmutató változásával is járnak. Ha tehát a biológiai funkciótól eltekintünk, azt mondhatjuk a bakteriorodopszinról, hogy biológiai eredetű, fénygerjesztésre színét és egyéb optikai paramétereit átmenetileg megváltoztató anyag, vagyis nemlineáris optikai tulajdonságokkal rendelkezik. Ráadásul genetikai úton számos paramétere - színe, az alapállapotba való visszatérés ideje stb. - megváltoztatható. E tulajdonságok alapján felmerül annak a lehetősége, hogy filmként, optikai adathordozóként, optoelektronikai eszközök aktív elemeként használhassuk. A gyakorlati hasznosítást megkönnyíti, hogy előállítása igen egyszerű, az anyag pedig egyáltalán nem érzékeny, ugyanannyira tartós, mint bármely más szerves festék. A nemlineáris optikai anyagok fontos felhasználási területe az optikai kapcsolók fejlesztése. A jelenkor információs technikájában az adattovábbítás optikai kábeleken történik. A kábelek kapcsolását is tisztán optikai úton kellene megoldani: mozgó alkatrészt nem tartalmazó, fénnyel vezérelt optikai kapcsolók kifejlesztése volna a megoldás. Optikai tulajdonságai alapján a bakteriorodopszin alkalmas lehet e feladatok ellátására, mivel a törésmutató megváltozása elegendően nagy. Már készültek az ilyen kapcsolók működését demonstráló mintapéldányok. Persze a gyakorlati alkalmazás követelményei igen magasak, a valódi versenyképességet a jövő mutatja meg. Mindenesetre számos szabadalom tanúsítja az alkalmazási fejlesztéseket, már a piacon is kapható bakteriorodopszint használó holografikus mérőműszer. Fényvezérelt fénykapcsolók

Fény hajtotta gépek