Szakmai beszámoló

Hasonló dokumentumok
Kémiai Intézet Kémiai Laboratórium. F o t o n o k k e r e s z tt ü z é b e n a D N S

Félmerev és flexibilis molekulák rezgési-forgási állapotainak kvantumkémiai számítása és jellemzése

A kutatás időtartama: október szeptember 30. stúdiumokat folytattunk. A kutatási terv két fő pillére a soktest kölcsönhatást

Szakmai önéletrajz Szalay Péter

Szén nanoszerkezetek grafén nanolitográfiai szimulációja

BÍRÁLAT. Kállay Mihály Automatizált módszerek a kvantumkémiában című MTA doktori értekezéséről.

Szakmai önéletrajz Szalay Péter

Alapvető bimolekuláris kémiai reakciók dinamikája

Hatékony programozási módszerek a soktestproblémában

8. Egyszerû tesztek sûrûség funkcionál módszerek minõsítésére

Ponthibák azonosítása félvezető szerkezetekben hiperfinom tenzor számításával

Nukleinsav bázis-származékok és modellpeptidek szerkezetének és önszerveződésének vizsgálata

Irányítási struktúrák összehasonlító vizsgálata. Tóth László Richárd. Pannon Egyetem Vegyészmérnöki és Anyagtudományok Doktori Iskola

Adatfolyam alapú RACER tömbprocesszor és algoritmus implementációs módszerek valamint azok alkalmazásai parallel, heterogén számítási architektúrákra

Bevezetés a kvantum-informatikába és kommunikációba 2015/2016 tavasz

A Coupled-Cluster módszer alkalmazhatósága molekulák elektrongerjesztett állapotának leírására

Szakmai zárójelentés. A F68726 projektszámú OTKA keretében végzett kutatásokról.

Supporting Information

Makromolekulák fragmens alapú leírása

Degenerált állapotok és nemadiabatikus folyamatok molekuláris rendszerekben

Zárójelentés a Nagy pontosságú számítások az elméleti kémiában: módszerfejlesztés és alkalmazás című, D as számú OTKA szerződéshez

Fizikai kémia 2. Előzmények. A Lewis-féle kötéselmélet A VB- és az MO-elmélet, a H 2+ molekulaion

Mátyus Edit. Prof. Dr. Császár Attila. Molekulaspektroszkópiai Laboratórium, Kémiai Intézet

A HÉLIUM AUTOIONIZÁCIÓS ÁLLAPOTAI KÖZÖTTI INTERFERENCIA (e,2e) KÍSÉRLETI VIZSGÁLATA

ERD14: egy funkcionálisan rendezetlen dehidrin fehérje szerkezeti és funkcionális jellemzése

(8) Globális stabilitásvesztéséhez tartozó kritikus erő/nyomaték analitikus meghatározása felületmodell

Törés és fragmentáció statisztikus fizikája

Teller Ede ujjlenyomatai a molekulafizikában

Extraktív heteroazeotróp desztilláció: ökologikus elválasztási eljárás nemideális

4. Fejezet Csonka Gábor István MTA Doktori Értekezés

PAPP DÓRA. Amiloid szerkezetek stabilitásvizsgálata fehérjékben

MOLEKULÁRIS TULAJDONSÁGOK

Keménységmérés diszkrét elemes (DEM) modellezése

A Raman spektroszkópia alkalmazása fémipari kutatásokban Raman spectroscopy in metallurgical research Dénes Éva, Koós Gáborné, Kőszegi Szilvia

Searching in an Unsorted Database

Raman spektroszkópia. Történet Két leirás: Eldines, kvantumos Kiválasztási szabályok Szimmetriák Raman Intenzitás Rezonáns Raman

PLATTÍROZOTT ALUMÍNIUM LEMEZEK KÖTÉSI VISZONYAINAK TECHNOLÓGIAI VIZSGÁLATA TECHNOLOGICAL INVESTIGATION OF PLATED ALUMINIUM SHEETS BONDING PROPERTIES

Hasznos és kártevő rovarok monitorozása innovatív szenzorokkal (LIFE13 ENV/HU/001092)

Referenciaértékek származtatása a kísérleti és számításos kémiában. Barna Dóra

Emlékeztető. az ELTE Kémiai Doktori Iskola Tanácsának június 10-i üléséről

Munkabeszámoló. Sinkovicz Péter. Témavezető: Szirmai Gergely. Kvantumoptikai és Kvantuminformatikai Osztály. Lendület program

TÉMA ÉRTÉKELÉS TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KMR (minden téma külön lapra) június május 31

lásd: enantiotóp, diasztereotóp

A DNS molekulát felépítő egységek gerjesztett állapotainak elméleti vizsgálata

Biokatalitikus Baeyer-Villiger oxidációk Doktori (PhD) értekezés tézisei. Muskotál Adél. Dr. Vonderviszt Ferenc

Süle Zoltán publikációs listája

A kémiai kötés magasabb szinten

FAMILY STRUCTURES THROUGH THE LIFE CYCLE

([P2]: Eq.4) C N/[ [(+(discr(q 1 )) 1/2 -B)/(2A)] 3 dq 1 ],

Numerikus matematika vizsga

A Margit híd pillérszobrának 3D-s digitális alakzatrekonstrukciója Nagy Zoltán 1 Túri Zoltán 2

Kurzus neve. ETR-es kód. Oktatók (laboránsok) és %- os részvételük. Státusz

Császár Attila. Molekularezgések. kvantummechanikája

SOLiD Technology. library preparation & Sequencing Chemistry (sequencing by ligation!) Imaging and analysis. Application specific sample preparation

FOLYÓIRATOK, ADATBÁZISOK

CURRICULUM VITAE. Végzettség:

MŰSZAKI TUDOMÁNY AZ ÉSZAK-ALFÖLDI RÉGIÓBAN 2010

Unification of functional renormalization group equations

Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások Definíciók

IBM Brings Quantum Computing to the Cloud

The problem. Each unitary transform having eigenvector has eigenvalues in the form of. Phase ratio:

Földi lézerszkennelés mérnökgeodéziai célú alkalmazása PhD értekezés tézisei

Report on the main results of the surveillance under article 11 for annex II, IV and V species (Annex B)

Synchronization of cluster-firing cells in the medial septum

és alkalmazások, MSc tézis, JATE TTK, Szeged, Témavezető: Dr. Hajnal Péter

Városi légszennyezettség vizsgálata térinformatikai és matematikai statisztikai módszerek alkalmazásával

Numerikus módszerek. 9. előadás

LÉTRADIAGRAM FORDÍTÓK ELMÉLETE PLC VEZÉRLÉSEK SZÁMÁRA II.

DOKTORI (PHD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZAFNER GÁBOR

Az fmri alapjai Statisztikai analízis II. Dr. Kincses Tamás Szegedi Tudományegyetem Neurológiai Klinika

Baranyáné Dr. Ganzler Katalin Osztályvezető

Fázisátalakulások vizsgálata

KIRÁLIS I FORMÁCIÓK TERJEDÉSI MECHA IZMUSA ALKIL-KOBALT-TRIKARBO IL- FOSZFÁ KOMPLEXEKBE. Doktori (PhD) értekezés tézisei. Kurdi Róbert.

Intelligens Induktív Érzékelők

VALÓS HULLÁMFRONT ELŐÁLLÍTÁSA A SZÁMÍTÓGÉPES ÉS A DIGITÁLIS HOLOGRÁFIÁBAN PhD tézisfüzet

A dielektromos válasz vizsgálata, mint szigetelésdiagnosztikai módszer

Kutatási terület. Szervetlen és szerves molekulák szerkezetének ab initio tanulmányozása

SZÉN NANOCSŐ KOMPOZITOK ELŐÁLLÍTÁSA ÉS VIZSGÁLATA

Report on the main results of the surveillance under article 11 for annex II, IV and V species (Annex B)

Nukleotidbázisok gerjesztett állapotainak elméleti vizsgálata

Idegen atomok hatása a grafén vezet képességére

Theoretical study of charge transfer in ion-molecule collisions Töltésátviteli folyamatok elméleti vizsgálata ion-molekula ütközésekben

Röntgen sugárzás. Wilhelm Röntgen. Röntgen feleségének keze

A kémiai kötés magasabb szinten

Szilárdtestek el e ek e tr t o r n o s n zer e k r ez e et e e t

Folyadékok szerkezetének tanulmányozása klasszikus szimulációk segítségével

A Richardson-extrapoláció és alkalmazása a Dániai Euleri Modellben

Adatbázis alapú molekulaspektroszkópia

A FÓKUSZÁLT NAPENERGIA TÁROLÁSI ÉS HASZNOSÍTÁSI LEHETŐSÉGEI

Császár Attila. Molekulaforgások. kvantummechanikája

Bírálat. Czakó Gábor Kémiai reakciók dinamikája ab initio potenciális energia felületeken c. MTA doktori értekezéséről

Emlékeztető. az ELTE Kémiai Doktori Iskola Tanácsának december 14 ei üléséről

New York, március 12. Dr. Sugár István. Kritikai észrevételek

2010. január 31-én zárult OTKA pályázat zárójelentése: K62441 Dr. Mihály György

LEHET-E TÖKÉLETES NANOELEKTRONIKAI ESZKÖZÖKET KÉSZÍTENI TÖKÉLETLEN GRAFÉNBÔL?

TELJES PUBLIKÁCIÓS JEGYZÉK


A kutatás eredményei (záró beszámoló)

Előrenéző és paraméter tanuló algoritmusok on-line klaszterezési problémákra

Keverési modellek. Színkeverés Beton/aszfalt keverés Benzin keverés Gázkeverékek koncentrációjának a meghatározása

Átírás:

Szakmai beszámoló 2013-2015 Elméleti Kémiai Laboratórium Laboratórium vezetője: Dr. Szalay Péter, egyetemi tanár Az Elméleti Kémiai Laboratórium fő kutatási területe molekulák elektronszerkezetének leírására alkalmas kvantumkémiai módszerek fejlesztése és tesztelése, valamint ezek alkalmazása a kémia és fizika szempontjából érdekes rendszerekre. A módszerfejlesztés területén főleg a multireferenciás hullámfüggvényből kiinduló, perturbációs alapú megközelítések területén elértünk el eredményeket, melyek a következők: Kimutattuk, hogy a State-specific Multireference Perturbation Theory-vel számított potenciális energia felületeken megjelenő műtermék rücskök hátterében az elmélet spin adaptált verziójában fellépő redundancia áll. A lineárisan összefüggő vektorokból megfelelő számú, egymásra merőleges függvényt képezve a rücskök eltűntethetők. Megvalósítottuk az ún. unitér perturbációs elmélet (UPT) multireferenciás változatát. Az UPT előnye, hogy nem alkalmaz energianevezőket, így kiküszöböli az ún. kvázidegenerációs(intruder) problémát. Azonban a méretkonzisztencia sértése jelentős lehet, ezért az eljárást jelen formájában nem javasoljuk széles körű alkalmazásra. Kidolgoztuk a csatolt elektronpár közelítés legegyszerűbb verzióját a kétrészecske függvényekből, ún. geminálokból építkező referencia esetére. Diszperzív gerjesztésekre szorítkozva kvalitatíve helyes eredmény kapható, míg töltésátviteli gerjesztéseket is tekintve a potenciális energia görbe alakja rossz lehet. A jelenség gyökere a disszociáció során kialakuló fragmens helytelen spinje. A probléma kezelhető egyes diszperzív típusú gerjesztések model térbe gyűjtésével és ún. perturb then diagonalize eljárás alkalmazásával vagy szinglet-triplet kevert spinállapotú geminálok figyelembevétele és a teljes hullámfüggvény variációs optimálása, spinprojektálást követően. Az eljárások alkalmazhatóságát numerikus tesztekkel igazoltuk. Kidolgoztuk továbbá egy módszert szén nanoszerkezetek Raman Optikai Aktivitás spektrumvonalai intenzitásának számítására az effektív pí-elektron modellek keretében, valamint vizsgáltuk energia alsó korlát számításának lehetőségét ún. bracketing függvény használatával, melyre igazoltuk a variációs elvet és teszteltünk egy új módszert, mellyel az 1

ún. full configuration interaction iteráció lépéseiben a felső korláttal összemérhető költséggel és pontossággal energia alsó becslés is számítható. Másik aktív terület Coupled-Cluster (CC) módszerek használata biomolekulák gerjesztett állapotainak leírására. 2013 elején publikált cikkben nukleobázis dimerek gerjesztett állapotait vizsgáltuk és alapadatokat közöltünk e molekulák EOM-CCSD(T) szintű gerjesztett állapotaira vonatkozólag. Megállapítottuk, hogy a magas szintű CC módszerek alkalmasak ilyen nagy rendszerek leírására, még ha a számítások jelentős számítási kapacitást is igényelnek. Azt is megmutattuk, hogy az eddig használt közelítő módszerek (ADC(2), CC2), nem megfelelőek, mert alábecsülik a gerjesztési energiát. A cikk 2013 júniusában a JPC A legtöbbet olvasott cikke volt. Az eredmények alapján egy ún. "perspektív" cikket is írtunk a rangos IJQC folyóiratban, felvázolva azokat a területeket, ahol a DNS kutatásban a gerjesztett állapotokat leíró módszerek sikeresek lehetnek, mint pl. a töltésátmenettel kapcsolatos folyamatok, vagy a DNS esetleges elektromos vezetőképessége. Mivel a nukleobázis dimerek esetén a közelítő módszerek teljesítőképességére vonatkozó következtetések bizonyos értelemben ellentmondtak a korábbi tapasztalatnak, szisztematikus vizsgálatba kezdtünk. 28 molekula közel 150 szinglett állapotához tartozó gerjesztési energiáját számoltunk ki különböző módszerekkel. A tesztek középpontjában az ún. CCSD számítási szint szerepelt, ehhez viszonyítva vizsgáltuk a pontosabb, háromszoros gerjesztést is tartalmazó, valamint az alacsonyabb szintű módszerek teljesítőképességét. Megállapítottuk, hogy mind a CC2, mind pedig a CCSD módszerek nagyon pontosak, a gerjesztési energia CC3-hoz viszonyított hibája általában nem nagyobb 0.2-0.3 ev-nál. Míg a CC2 hibák átlaga nulla körüli, a CCSD szisztematikusan felülbecsüli a gerjesztési hibákat kb. 0.2 ev-tal. A szórás azonban lényegesen kisebb a CCSD esetén, azaz szisztematikusabbak. Jelentős eredményeket értünk el a töltésátmenettel kapcsolatos számítások terén is. Az egyik cikkben egy új lehetőséget tártunk fel a töltésátmeneti csatolás számítására analitikus gradiensek felhasználásával, a másikban pedig arról számolunk be, hogy másodrendű módszerekkel hogyan tudunk sokkal magasabb szintű számításokkal vetekedő pontosságú töltésátmeneti paramétereket számítani. Az alkalmazott trükk valószínűleg DFT módszerek esetében is használható lesz, megnyitva ezzel a lényegesen olcsóbb módszerek előtt az utat. Megemlítendő még az adenin molekula gerjesztett állapotairól, a citozin hidratált szerkezetiről és ezek viszonyított energiáiról, valamint - francia kollégákkal - a DFT módszerek ún. "long range" változatának analitikus gradiensét leíró cikkek. 2

A laboratórium megjelent közleményei - 2013-2015 1. Jeszenszki P, Surjan PR, Szabados A Spin Symmetry and Size Consistency of Strongly Orthogonal Geminals JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION 11:(7) pp. 3096-3103. (2015) 2. Jeszenszki Péter, Rassolov Vitaly, Surján Péter R, Szabados Ágnes Local spin from strongly orthogonal geminal wavefunctions MOLECULAR PHYSICS 113: pp. 249-251. (2015) 3. P R Surján, P Jeszenszki, Á Szabados Role of triplet states in geminal-based perturbation theory MOLECULAR PHYSICS 113: pp. 2960-2963. (2015) 4. Tóth Z, Nagy PR, Jeszenszki P, Szabados Á Novel orthogonalization and biorthogonalization algorithms: Towards multistate multiconfiguration perturbation theory THEORETICAL CHEMISTRY ACCOUNTS 134:(8) Paper 100. (2015) 5. Kalincsák F., Pongor G. Internal coordinates and orthogonality: features of the pseudoinverse of the Eliashevich Wilsonian B-matrix THEORETICAL CHEMISTRY ACCOUNTS 134:(8) Paper 108. (2015) 6. Pershin, A., Szalay, P. G. Development of highly accurate approximate scheme for computing the charge transfer integral. The Journal of Chemical Physics, 143, Paper 074109, (2015). 7. Pershin, A., Szalay, P. G. Improving the Accuracy of the Charge Transfer Integrals Obtained by Coupled Cluster Theory, MBPT (2), and TDDFT. Journal of Chemical Theory and Computation, 11, 5705 5711, (2015). 8. Tajti, A., Mück, L., Farkas, Á., Krebsz, M., Pasinszki, T., Tarczay, G., Szalay, P. G. Unraveling the photoisomerization mechanism of FCNS FC(NS). Journal of Molecular Spectroscopy, 310, 8 15, (2015). 3

9. Fogarasi, G., Szalay, P. G. Quantum chemical MP2 results on some hydrates of cytosine: binding sites, energies and the first hydration shell. Physical Chemistry Chemical Physics, 17, 29880 29890, (2015). 10. Delahaye, T., Nikitin, A. V., Rey, M., & Szalay, P. G. Accurate 12D dipole moment surfaces of ethylene. Chemical Physics, 639, 275 278, (2015). 11. Tóth Z, Szabados Á Energy error bars in direct configuration interaction iteration sequence JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 143:(8) Paper 084112. (2015) 2014 12. Jeszenszki P, Nagy PR, Zoboki T, Szabados A, Surján PR Perspectives of APSG-based multireference perturbation theories INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY 114: pp. 1048-1052. (2014) 13. Nagy PR, Biró L, Koltai J, Surján PR, Szabados A, Kürti J Theoretical vibrational optical activity of chiral carbon nanoparticles: Fullerenes and carbon nanotubes PHYSICA STATUS SOLIDI B-BASIC SOLID STATE PHYSICS 251:(12) pp. 2451-2456. (2014) 14. Péter R Nagy, Péter R Surján, Ágnes Szabados Vibrational optical activity of chiral carbon nanoclusters treated by a generalized π-electron method JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 140: Paper 044112. 12 p. (2014) 15. Szabados Ágnes, Tóth Zsuzsanna Löwdin s bracketing function revisited JOURNAL OF MATHEMATICAL CHEMISTRY 52: p. 1-12. (2014) 16. Kánnár, D., Szalay, P. G. Benchmarking coupled cluster methods on singlet excited states of nucleobases. Journal of Molecular Modeling, 20(11), Paper 2503. (2014). 17. Kánnár, D., Szalay, P. G. Benchmarking Coupled Cluster Methods on Valence Singlet Excited States. Journal of Chemical Theory and Computation, 10(9), 3757 3765. (2014). 18. Benda, Z., Szalay, P. G. Details of the Excited State Potential Energy Surfaces of Adenine by Coupled-Cluster Techniques. The Journal of Physical Chemistry A, 118(32), 6197 6207. (2014). 4

19. Dubrovay, Z., Szalay, P. G. NMR and quantum chemical analysis of 3-(2-methly-2- phenylhydrazinyl)cyclohex-2-en- 1-one. Journal of Molecular Modeling, 20(6), 2293. (2014). 20. Delahaye, T., Nikitin, A. V., Rey, M., Szalay, P. G., Tyuterev, V. G. A new accurate ground-state potential energy surface of ethylene and predictions for rotational and vibrational energy levels. The Journal of Chemical Physics, 141, 104301. (2014). 21. Mussard, B., Szalay, P. G., Angyan, J. G. Analytical Energy Gradients in Range- Separated Hybrid Density Functional Theory with Random Phase Approximation. Journal of Chemical Theory and Computation, 10(5), 1968 1979. (2014). 22. Rossi, E., Evangelisti, S., Laganà, A., Monari, A., Rampino, S., Verdicchio, M., et al. Code interoperability and standard data formats in quantum chemistry and quantum dynamics: The Q5/D5Cost data model. Journal of Computational Chemistry, 35(8), 611 621. (2014). 23. Jeszenszki P, Surjan PR, Szabados A Spin-adaptation and redundancy in state-specific multireference perturbation theory JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 138:(12) Paper 124110. 14 p. (2013) 24. Péter R Nagy, Ágnes Szabados Unitary perturbation theory applied to multiconfigurational reference functions INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY 113:(SI) pp. 230-238. (2013) 25. Tamas Zoboki, Peter Jeszenszki, and Peter R. Surjan Composite particles in quantum chemistry: from two-electron bonds to cold atom Int. J. Quantum Chem., 113: 185 189 (2013) 26. T Zoboki, Á Szabados, P R Surján Linearized Coupled Cluster Corrections to Antisymmetrized Product of Strongly Orthogonal Geminals: Role of Dispersive Interactions JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION 9: pp. 2602-2608. (2013) 5

27. Szalay, P. G., Watson, T. J., Jr., Perera, A., Lotrich, V. F., Bartlett, R. J. Benchmark Studies on the Building Blocks of DNA. 3. Watson Crick and Stacked Base Pairs. The Journal of Physical Chemistry A, 117(15), 3149 3157. (2013). 28. Szalay, P. G. Can Coupled-Cluster Methods Be Used to Describe Excited States of the Building Blocks of DNA? International Journal of Quantum Chemistry, 113(14), 1821 1827. (2013). 29. Watson, T. J., Jr., Lotrich, V. F., Szalay, P. G., Perera, A., Bartlett, R. J. Benchmarking for Perturbative Triple-Excitations in EE-EOM-CC Methods. The Journal of Physical Chemistry A, 117(12), 2569 2579. (2013). 30. Tyuterev, V. G., Kochanov, R. V., Tashkun, S. A., Holka, F., Szalay, P. G. New analytical model for the ozone electronic ground state potential surface and accurate ab initio vibrational predictions at high energy range. The Journal of Chemical Physics, 139(13), 134307. (2013). 6