Semmelweis Egyetem / Élettani Intézet / Budapest. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Szekvenciaelemzés. Cserző Miklós 2017
|
|
|
- Máté Dudás
- 6 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Szekvenciaelemzés Cserző Miklós 2017
2 A mai előadás Szekvencia analízis statisztikus szempontból Annotálás homológia alapján Az annotálás szempontjai Annotálás térszerkezet szerint Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 2
3 Megfontolandó szempontok DNS 4 betűs ABC Hosszú szekvenciák Szekezet nem annyira fontos RNS kivétel Elsődleges adatok fehérje 20 betűs ABC Tömör információ A szerkezet nagyon fontos Származtatott adatok Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 3
4 Informatikai vs. biológiai elemzés A szekvencia betűsorozat Statisztikus módszerekkel vizsgálható Nem használunk biológiai információt Az eredményt utólag kell értelmezni Egyszrű, viszonylag hatékony, de pontatlan Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 4
5 Az összetétel elemzése C/G vs. A/T tartalom A gének promóter szakasza gyakran C/G-ben gazdag Csúszó-ablakban megjelenített összetétel Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 5
6 CpG szigetek A DNS képes metilálódni a CG dinukleotidok C -jén A metilált állapot öröklődik osztódás után A metilált DNS szakaszon a gének kifejeződése tartósan megváltozik Epigenetikus génszabályozás Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 6
7 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 7
8 CpG bioinformatikai megközelítés A szekvenciát csúszóablakban vizsgáljuk A C/G tartalom legyen magas A tartalom alapján megbecsüljük a CG dinukleotid tartalmat Ezt összevetjük a talált CG tartalommal Ha ez magasabb a vártnál találtunk egy CpG szigetet Az ablakméret bázis Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 8
9 És mennyire jó ez? Vegyünk egy 350 bázis hosszú darabot Ebben legyen 35 CG (10%) A maradék szekvenciában egyenlően van a négy bázisból Rögzitjük az eredeti szekvencia CG -it A maradékot összekeverjük Visszatesszük a CG -et a helyükre Mindegyik szekvencia CpG-sziget lesz Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban - 8 9
10 Tanulság Összesen lehetséges varians van Ezek mind legalabb olyan jó CpG-szigetek, mint az eredeti Teljesen kizárt, hogy funkcióra nézve is egyenértékűek legyenek A modell mégsem tud különbséget tenni köztük Egyszerű modelltől nem várhatunk sokat Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
11 Szekvenciák komplexitása A szekvenciát rövid motívumokra bontjuk A motívumok hosszával 4 hatványai szerint nő a lehetőségek száma Egy szekvencia komplex, ha jól kihasználja a lehetőségeket Viszont az alacsony komplexitású szekvencia kevés motívumot használ nagy számban Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
12 Pl. TACAATGGCCTTCCCCATCCTACCTCTGCCCTGGCTTG TAACTTGGGGAGACCTTCACTTTGGGGGCGTCGGCCCT TTCCAAGTCAGGAGTGGAAATGGAAGGAGAGGCTGGGA ATCCCCTCCCACAAACATGAAGTGGTCTCCTGGTACTG TACGAACGAACGAACGTAGCCTTGGGCTTGGAGCTCAG AGCCCCCACGTTTCCCGTTGCCTCTGTGGTTTTCTTTC CCACCACTACCCCCACCCTGCACCTCCCCACCAAAGAA TTCTCAACTGGAAAAGCCAGGAGGCGGTTCTGACAAAA GGCAGGGGCTCCAGGGGAGACTCCGCCCGTCCCTGGGT GGCTGGCTGTATCGCAGAGCTGGCTTTGCGATTGCGTG TCCGCAATTGTGCCCATCAGAGTGTGAATGTATTGATA TTTCTTTAAGGATGCTCTTTCGTTCTTCCAAGCCCGAG GTACCTTAGGGGAGGGACTTAGAACTTATTGGCATTGC ATCACTTTAGTTTTCAACCTGCTTGCATAAGAATTAAG AGCGAATAAATATTAGTGTGGGGGGAGGGGAAGCTAAG CAAAATATGAATTCCTCTCTCTCTCCCCACCTCCTTTG AGATTTCTGAGCTGCCAATCTCCCAGCCAATTCTAGAC TTTCTGAAACTCCATGCACGTATAACTGAAGCCAGAAA TGGGTTTCCTTGCAAATATAGGTCAACATCCTTTTTAT TGCCCTATTAAAATATTCAAGTCCTACCTTTAGGGCTA GGTGCGTACAGCGGCTGATGGAGTGGCGCTGGTGGGGC GCAAGTGCAGGGGGAGGGTACTGACGGCAGAGAGAGAG GAGCTACCTCCGTGCCGCCCTGCTTCCCGACCCGATTC CCAGGCTTGCTTGAGGCCGAGAAAGGCGAGGGGCAGGC ATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTA GGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCG TAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTG CGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGAT TGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGG ATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTA GGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCG TAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTG CGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGAT TGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGG ATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTA GGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCG TAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTG CGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGAT TGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGG ATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTA GGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCG TAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTG CGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGAT TGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGG ATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTA GGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCG TAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTG CGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGATTGCGTAGGAT Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
13 Komplex szekvencia AAA 16; AAC 11; AAG 16; AAT 16; ACA 6; ACC 13; ACG 7; ACT 13; AGA 18; AGC 14; AGG 24; AGT 9; ATA 9; ATC 7; ATG 9; ATT 16; CAA 16; CAC 11; CAG 14; CAT 8; CCA 20; CCC 30; CCG 10; CCT 25; CGA 10; CGC 6; CGG 4; CGT 10; CTA 8; CTC 19; CTG 22; CTT 26; GAA 19; GAC 7; GAG 26; GAT 6; GCA 14; GCC 17; GCG 10; GCT 20; GGA 18; GGC 23; GGG 31; GGT 11; GTA 10; GTC 7; GTG 15; GTT 7; TAA 8; TAC 10; TAG 9; TAT 11; TCA 9; TCC 25; TCG 3; TCT 17; TGA 12; TGC 19; TGG 24; TGT 9; TTA 10; TTC 21; TTG 18; TTT 21; Repetitív szekvencia AGG 76; ATT 76; CGT 76; GAT 75; GCG 76; GGA 75; GTA 76; TAG 76; TGC 76; TTG 76; Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
14 Repetitív DNS tandem repeat DNS a kis komplexitású DNS alesete Ugyan az a motívum ismétlődik egymás után sokszor Jellemzés: elemi motívum ismétlésszám konzerváltság Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
15 Repetitív DNS a másik típus Ez komplex DNS-ből áll A genomban sok példányban fordul elő Nem egymás után helyezkednek el a példányok A példányok töredékesek Millió éves virusfertőzések maradványai Igazából nem szerencsés az elnevezése Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
16 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
17 Fehérje kódoló szakaszok A lehetséges 64 kódonból 3 stop-jel Véletlen esetben kb. minden 21. Open Reading Frame ORF: hosszú, stopjel nélküli szakasz 3 lehetséges olvasási keretben és mindkét szálon lehet Rövid szakaszokra bizonytalan Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
18 Prokarióták és eukarióták Prokariótákban: A kódoló szakaszok egy darabban vannak Kapcsolódó gének operonokba rendeződnek A gének átfedhetnek Eukariótákban: A kódoló szakasz nem folytonos (exon/intron) Az mrns a splicing soran alakul ki A gének átfedése ritkább Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
19 Génpredikció az ensembl példája A tisztán statisztikai alapú predikció gyenge Fel kell használni külső adatokat is EST adatbázis cdns adatbázis Humán és egyébb (gerinces) adatok Fehérje adatbázis Humán és egyébb (gerinces) adatok Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
20 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
21 Statisztikus megközelítés fehérjék A szekvenciák komplexitása alapján a fehérjék is elemezhetők Transzmembrán fehérjék: Sok hidrofób aminósav egymás után Torzított összetétel Alacsony szekvencia-komplexitás Szerkezet nélküli fehérjék: Hidrofil aminósavak csoportjai Torzított összetétel, stb. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
22 Transzmembrán fehérjék Kapcsolat a külvilággal: Anyagforgalom, jelátvitel Érdekes kérdések: A fehérje membrán kötött vagy nem? Hol vannak benne a TM szakaszok? Milyen a topológiája? Szignál peptid: Teljes értékű TM szakasz, csak nem állandó Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
23 Szerkezet nélküli fehérjék (IUP) Sok hidrofíl aminósav jellemzi Nagyon jól oldódik vízben, ezért nincs stabil szerkezete Stabil szerkezetű fehérjével képes kölcsönhatásba lépni Rugalmas kötőelemek Fehérje-fehérje kölcsönhatások résztvevői Kölcsönhatási hálózatok csomópontjai Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
24 Kapcsolódó web-helyek DisProt adatbázis részben vagy egészben szerkezet nélküli fehérjék Web: IUPred: online szolgáltatás szerkezet nélküli fehérjék elemzéséhez Web: Dosztányi, Tompa, Simon Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
25 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
26 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
27 Annotálás homológia alapján Alapelv: ami fontos az konzervált Már ismert szekvenciák alapján annotáljuk az újakat Szerkezeti szempontból Funkció szempontjából Szabályozás szempontjából Kölcsönhatás szempontjából Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
28 Moduláris fehérjék A BLAST-találatok nem egyenletesen oszlanak el a szekvencia mentén Egyes szakaszokból sok van egy genomon belül Fehérje domén egységek: Génszerkezeti Fehérje térszerkezeti Funkcionális értelemben Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
29 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
30 Kapcsolódó adatbázisok Pfam Protein Family Többszörös illesztés alapján készült Web: UniProt Fehérjék általános adatbázisa Web: Nemzetközi konzorciumok üzemeltetik Nagyon megbízhatóak Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
31 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
32 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
33 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
34 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
35 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
36 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
37 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
38 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
39 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
40 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
41 Mit kereshetünk még homológia alapján Poszt-transzlációs módosítások Glikozilálás Palmitálás, mirisztoilálás Egyébb módosítások Foszforilálás Ligandok kötése Aktív helyek azonosítása Hasítóhelyek azonosítása Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
42 A módszerek Kisérletes adatok gyüjtése Statisztikus modell építése A modell tanítása a kisérletes adatbázis alapján A modell alkalmazása az adott szekvenciára Másik lehetőség: szekvenciaillesztés az ismert szekvenciák ellenében Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
43 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
44 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
45 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
46 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
47 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
48 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
49 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
50 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
51 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
52 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
53 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
54 RNS szerkezet Az RNS képes meghatározott térszerkezetet felvenni A szerkezet léte nagyban befolyásolja az RNS stabilitását Az RNS szerkezete miatt enzimatikus aktivitást is képes ellátni ribozim Funkcionális komplexeket tud alkotni fehérjékkel riboszóma Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
55 RNS folding Az egyszálú RNS saját magával alkot szerkezetet reverz komplement bázispárok alapján A lehetséges topológiákhoz energetikai értékek tartoznak Ez nagyon bonyolult problémát eredményez Web: Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
56 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
57 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
58 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
59 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
60 Fehérjék szerkezeti osztályozása A szekvencia alapján a szerkezet megbecsülhető A szerkezet és a funkció szorosan összefügg Kell egy szerkezet-központú adatbázis A szerkezet hierarchhikus megközelítése SCOP: CATH: Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
61 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
62 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
63 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
64 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
65 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
66 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
67 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
68 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
69 Mit tanultunk ma? A szekvenciák elemzése önmagukban lehetséges, de pontatlan eredményt ad a fontos dolgok evolúciósan konzerváltak Szekvenciák annotálása homológia alapján Gyors, pontos, hatékony De azért csak óvatosan. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
70 Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
71 Feladat 8. A 6. feladatban használt kedvenc fehérjédet elemezd funkció és szerkezet alapján. A következő órán gyakorlat! Aki tud, hozzon magának laptopot. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban
Name Sequences* Length (mer) NHT-1 attcgctgcctgcagggatccctattgatcaaagtgccaaacaccg 48
1. Plasmids and their source: - par3283 (Dr. Studier F.W., Brookheaven National laboratory, NY, USA) - pff19g ( Dr. Messing J Waksman Institute, Rutgers University, USA) - pbin-hygtx and pbin-tetr (Prof.
Cserző Miklós Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Integrált biológiai adatbázisok
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Integrált biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás A genom annotálás jelentősége Genome Reference Consortium Gene Ontology Az ensembl pipeline
MIKROSZATELIT DNS- VIZSGÁLATOK A MOCSÁRI TEKNŐS NÉGY DUNÁNTÚLI ÁLLOMÁNYÁN
MIKROSZATELIT DNS- VIZSGÁLATOK A MOCSÁRI TEKNŐS NÉGY DUNÁNTÚLI ÁLLOMÁNYÁN Molnár Tamás 1, Lanszki József 1, Magyary István 1, Jeney Zsigmond 2, Lehoczky István 2 1 Kaposvári Egyetem Állattudományi Kar,
Supplementary: A strategy to optimize the generation of stable chromobody cell lines for
Supplementary: A strategy to optimize the generation of stable chromobody cell lines for visualization and quantification of endogenous proteins in living cells Bettina-Maria Keller 1, Julia Maier 1, Melissa
A TARTÁS- ÉS FEJÉSTECHNOLÓGIA HATÁSA A NYERS TEHÉNTEJ MIKROBIOLÓGIAI MINŐSÉGÉRE
DEBRECENI EGYETEM AGRÁR- ÉS MŰSZAKI TUDOMÁNYOK CENTRUMA MEZŐGAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR ÉLELMISZERTUDOMÁNYI, MINŐSÉGBIZTOSÍTÁSI ÉS MIKROBIOLÓGIAI INTÉZET ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Biológiai adatbázisok. Cserző Miklós 2018
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás Mi az adatbázis A biológia kapcsolata az adatbázisokkal Az adatbázisok típusai Adatbázis formátumok,
SEJTVONAL SPECIFIKUS MONOKLONALITÁS VIZSGÁLATOK MIELODISZPLÁZIÁBAN ÉS MIELOPROLIFERATÍV BETEGSÉGEKBEN. Jáksó Pál
Doktori (PhD) értekezés tézisei SEJTVONAL SPECIFIKUS MONOKLONALITÁS VIZSGÁLATOK MIELODISZPLÁZIÁBAN ÉS MIELOPROLIFERATÍV BETEGSÉGEKBEN Jáksó Pál Doktori Iskola: Klinikai Orvostudományok Doktori Iskola vezetője:
first base of sequence is at -32 with respect to the ATG of start site of At1g10010 start site of At1g10010
Plantegenet, Weber et al., 5 sequence alignments for stably heritable ELP and control genes. Sequences represent the Crick strand for the 5 region of the respective genes, i.e. they start with the base
FEHÉRJESZINTÉZIS: a transzláció mechanizmusa és a polipeptidlánc további sorsa. Bay Péter
FEHÉRJESZINTÉZIS: a transzláció mechanizmusa és a polipeptidlánc további sorsa Bay Péter Fehérjeszintézis és poszttranszlációs módosítások A kódszótár A riboszóma szerkezete A fehérjeszintézis (transzláció)
FEHÉRJESZINTÉZIS: a transzláció mechanizmusa és a polipeptidlánc további sorsa. Gergely Pál 2009
FEHÉRJESZINTÉZIS: a transzláció mechanizmusa és a polipeptidlánc további sorsa Gergely Pál 2009 Fehérjeszintézis és poszttranszlációs módosítások A kódszótár A riboszóma szerkezete A fehérjeszintézis (transzláció)
A tárgy címe: Bioinformatika
A tárgy címe: Bioinformatika Kötelezően választható tárgy IV. és V. évfolyamos biológus hallgatók számára; heti 2+3 óra Előkövetelmény: Biokémia főkollégium; genetika főkollégium; alapszintű számítógépes
Semmelweis Egyetem / Élettani Intézet / Budapest. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Bevezetés. Cserző Miklós 2018
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Bevezetés Cserző Miklós 2018 A mai előadás A kurzus menete Hol találkozunk bioinformatikával Mi a bioinformatika Miért van bioinformatika A számítógépekről
Emésztőszervi betegségek (PEC/PEMS) járványtani és virológiai vizsgálata pulykaállományokban
Emésztőszervi betegségek (PEC/PEMS) járványtani és virológiai vizsgálata pulykaállományokban Rusvai Miklós, Demeter Zoltán, Coman Alina, Palade Alina Emésztőszervi betegségek (enteric diseases, ED) pulykaállományokban
Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)
Genomika Új korszak, paradigmaváltás, forradalom: a teljes genomok ismeretében a biológia adatokban gazdag tudománnyá válik. Új kutatási módszerek, új szemlélet. Hajtóerõk: Genomszekvenálási projektek
A D vitamin, ösztrogén és calcium sensing receptor genotípusainak valamint a szérum kalciumnak a prosztatarák kialakulásában betöltött szerepe
A D vitamin, ösztrogén és calcium sensing receptor genotípusainak valamint a szérum kalciumnak a prosztatarák kialakulásában betöltött szerepe Bevezetés: A prosztatarák (PCA) az egyik leggyakoribb rosszindulatú
Perinatális mortalitás kóroktani és immunológiai vizsgálata, illetve prevenciója Holstein-fríz állományokban. A projekt címe
A projekt címe Perinatális mortalitás kóroktani és immunológiai vizsgálata, illetve prevenciója Holstein-fríz állományokban A projekt nyilvántartási száma: GAK-CALVES05 OMFB-00173/2006 OMFB-00174/2006
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika A ~20 ezer fehérje-kódoló gén a 23 pár kromoszómán A kromoszómán található bázisok száma: 250M
transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
Transzláció. Szintetikus folyamatok Energiájának 90%-a
Transzláció Transzláció Fehérje bioszintézis a genetikai információ kifejeződése Szükséges: mrns: trns: ~40 Riboszóma: 4 rrns + ~ 70 protein 20 Aminosav aktiváló enzim ~12 egyéb enzim Szintetikus folyamatok
Semmelweis Egyetem / Élettani Intézet / Budapest. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Bioinformatikai modellek. Cserző Miklós 2017
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Bioinformatikai modellek Cserző Miklós 2017 A mai előadás A predikció jelentősége a biológiában Egyszerű statisztikai modellek Kyte-Doolittle hidrofóbicitás
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
13. RNS szintézis és splicing
13. RNS szintézis és splicing 1 Visszatekintés: Az RNS típusai és szerkezete Hírvivő RNS = mrns (messenger RNA = mrna) : fehérjeszintézis pre-mrns érett mrns (intronok kivágódnak = splicing) Transzfer
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola Enteropathogen Escherichia coli (EPEC) baktériumok genotípusa/fenotípusa és pathogenitása választott malacokban PhD értekezés Készítette: Dr. Malik
Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK
Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK Fehérjét kódol? Tulajdonságai? -Hol lokalizálódik? -Oldható? -3D szerkezete? -Accession #? -Annotációja elérhető? Már benne
NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag
NUKLEINSAVAK Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag RNS = Ribonukleinsav DNS = Dezoxi-ribonukleinsav A nukleinsavak
Bioinformatika 2 6. előadás
6. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.10.08. PDBj: http://www.pdbj.org/ Fehérjék 3D szerkezeti adatbázisai - PDBj 2 2018.10.08.
RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek
RNS-ek RNS-ek 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek 3. Egy újonnan felfedezett RNS Világ: - szabályozó RNS-ek 4. Transzkripció Ősi
2. Ismert térszerkezetű transzmembrán fehérjék adatbázisa: a PDBTM adatbázis. 3. A transzmembrán fehérje topológiai adatbázis, a TOPDB szerver
A 2005 és 2007 között megvalósított project célja transzmembrán fehérjék vizsgálata és az ehhez szükséges eljárások kifejlesztése volt. Ez utóbbi magába foglalta új adatbázisok és szerkezet becslő módszerek
BIOINFORMATIKA Ungvári Ildikó
1 BIOINFORMATIKA Ungvári Ildikó Az elmúlt évtizedekben a molekuláris biológiai, genomikai technológiák robbanásszerű fejlődése a biológiai adatok mennyiségének exponenciális növekedéséhez vezetett. Ebben
TÉMAKÖRÖK. Ősi RNS világ BEVEZETÉS. RNS-ek tradicionális szerepben
esirna mirtron BEVEZETÉS TÉMAKÖRÖK Ősi RNS világ RNS-ek tradicionális szerepben bevezetés BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek BIOLÓGIAI MOLEKULÁK FEHÉRJÉK NUKLEINSAVAK DNS-ek RNS-ek
Bioinformatika előadás
10. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat Genomika vs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket vizsgáljuk,
Egy új DNS motívum típus in silico jellemzése és szerepe a génszabályozásban Zárójelentés - OTKA # PD73575, BIOIN Cserző Miklós
Egy új DNS motívum típus in silico jellemzése és szerepe a génszabályozásban Zárójelentés - OTKA # PD73575, BIOIN Cserző Miklós A kutatás első évében az előzetes tervnek megfelelően tudtunk haladni. Kidolgoztunk
PhD TÉZISEK. Dr. Talabér Gergely. PTE KK Immunológiai és Biotechnológiai Intézet. Témavezetők: Dr. Boldizsár Ferenc, Dr.
PhD TÉZISEK A glukokortikoid hormon indukálta thymocyta apoptózis mechanizmusának vizsgálata: A mitokondriális glukokortikoid receptor transzlokáció és a thymus epithelsejtek szerepe Dr. Talabér Gergely
Flowering time. Col C24 Cvi C24xCol C24xCvi ColxCvi
Flowering time Rosette leaf number 50 45 40 35 30 25 20 15 10 5 0 Col C24 Cvi C24xCol C24xCvi ColxCvi Figure S1. Flowering time in three F 1 hybrids and their parental lines as measured by leaf number
I. A sejttől a génekig
Gén A gének olyan nukleinsav-szakaszok a sejtek magjainak kromoszómáiban, melyek a szervezet működését és növekedését befolyásoló fehérjék szabályozásához és előállításához szükséges információkat tartalmazzák.
A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.
Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak
Crash Course in Omics Terminology and Concepts. Genome assembly. Clone-by-Clone Genome Sequencing. Shotgun DNA Sequencing (Technology)
Bacterial Viral Parasitic Host Genomics Crash Course in Omics Terminology and Concepts Jessica Kissinger June 4, 2007 Microarray Proteomic Genetics Immunology Genome assembly 5X random genome shotgun Library
NON-HLA HAJLAMOSÍTÓ GÉNEK ÉS POLIMORFIZMUSAIK VIZSGÁLATA MAGYAR RHEUMATOID ARTHRITIS BETEGPOPULÁCIÓBAN. Ph.D. értekezés tézisei FARAGÓ BERNADETT
NON-HLA HAJLAMOSÍTÓ GÉNEK ÉS POLIMORFIZMUSAIK VIZSGÁLATA MAGYAR RHEUMATOID ARTHRITIS BETEGPOPULÁCIÓBAN Ph.D. értekezés tézisei FARAGÓ BERNADETT Témavezető: Dr. MELEGH BÉLA Pécsi Tudományegyetem, Általános
Fehérje szintézis 2. TRANSZLÁCIÓ Molekuláris biológia kurzus 7. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt- és immunbiológiai Intézet
Fehérje szintézis 2. TRANSZLÁCIÓ Molekuláris biológia kurzus 7. hét Kun Lídia Genetikai, Sejt- és immunbiológiai Intézet Gén mrns Fehérje Transzkripció Transzláció A transzkriptum : mrns Hogyan mutatható
Zárójelentés. 1. Bevezetés és célkitűzés
Zárójelentés a "Molekuláris genetikai és szövettenyésztési módszerekkel előállított növények herbicid- és nehézfém-tűrőképességének, illetve biotikus stresszekkel szembeni ellenállóképességének vizsgálata"
EGFR Pyro beépülő modul Rövid útmutató
2017. február EGFR Pyro beépülő modul Rövid útmutató A 2.0-s verziójú PyroMark Q24 szoftvert futtató PyroMark Q24 készülékeken való telepítésre és használatra Sample to Insight Az EGFR Pyro beépülő modul
Bioinformatika 2 10.el
10.el őadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 04. 24. Genomikavs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket
Klonális szelekció a follikuláris lymphomák csontvelői terjedése során
Klonális szelekció a follikuláris lymphomák csontvelői terjedése során Doktori értekezés Dr. Bognár Ágnes Semmelweis Egyetem Patológiai Doktori Iskola Témavezető: Dr. Szepesi Ágota egyetemi adjunktus,
1) A PIBF molekula különböző részeit reprezentáló konstrukciókat állítottunk elő
Beszámoló Korábbi években nyert eredményeink arra utalnak, hogy a Progesteron-indukált Blokkoló Factor (PIBF) terhességben és malignus daganatok kialakulását követően jelenik meg, és immunológiai hatásai
A replikáció mechanizmusa
Az öröklődés molekuláris alapjai A DNS megkettőződése, a replikáció Szerk.: Vizkievicz András A DNS-molekula az élőlények örökítő anyaga, kódolt formában tartalmazza mindazon információkat, amelyek a sejt,
Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
DNS-szekvencia meghatározás
DNS-szekvencia meghatározás Gilbert 1980 (1958) Sanger 3-1 A DNS-polimerázok jellemzői 5'-3' polimeráz aktivitás 5'-3' exonukleáz 3'-5' exonukleáz aktivitás Az új szál szintéziséhez kell: templát DNS primer
TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)
Biokémia és molekuláris biológia I. kurzus (bb5t1301) Tematika 1 TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301) 0. Bevezető A (a biokémiáról) (~40 perc: 1. heti előadás) A BIOkémia tárgya
Lymphomák molekuláris patológiai diagnosztikája
OTKA nyilvántartási szám:t/f 043323 Lymphomák molekuláris patológiai diagnosztikája ZÁRÓJELENTÉS A lymphomák diagnosztikája és klasszifikációja az elmúlt 10 évben jelentősen átalakult. A jelenlegi osztályozás
Biológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek
Biológus MSc Molekuláris biológiai alapismeretek A nukleotidok építőkövei A nukleotidok szerkezete Nukleotid = N-tartalmú szerves bázis + pentóz + foszfát N-glikozidos kötés 5 1 4 2 3 (Foszfát)észter-kötés
Crash Course in Omics Terminology and Concepts
Bacterial Viral Parasitic Host Genomics Crash Course in Omics Terminology and Concepts Jessica Kissinger June 8, 2008 Microarray Proteomic Genetics Immunology Genome assembly 5X random genome shotgun Library
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások) 3.1 Fehérjék, enzimek A genetikai információ egyik fő manifesztálódása
Genetikai marker-vizsgálatok fej-nyaki daganatokban
Genetikai marker-vizsgálatok fej-nyaki daganatokban Eredeti közlemény Csuka Orsolya 1, Olasz Judit 1, Juhász Alíz 1, Hargitai Árpád 1, Remenár va 2, Kásler Miklós 2 Országos Onkológiai Intézet, Pathogenetikai
DNS, RNS, Fehérjék. makromolekulák biofizikája. Biológiai makromolekulák. A makromolekulák TÖMEG szerinti mennyisége a sejtben NAGY
makromolekulák biofizikája DNS, RNS, Fehérjék Kellermayer Miklós Tér Méret, alak, lokális és globális szerkezet Idő Fluktuációk, szerkezetváltozások, gombolyodás Kölcsönhatások Belső és külső kölcsöhatások,
A rendőrség keresi a tettest
A rendőrség keresi a tettest Az ügy: Police released surveillance image of the suspect. A rendőrség keresi azt a személyt, aki hétfőn reggel betört az Intézetbe és dulakodás közben több késsel megölt egy
RNS-ek. 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán. 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek
RNS-ek RNS-ek 1. Az ősi RNS Világ: - az élet hajnalán 2. Egy már ismert RNS Világ: - a fehérjeszintézis ben résztvevő RNS-ek 3. Egy újonnan felfedezett RNS Világ: - szabályozó RNS-ek 4. Transzkripció 5.
Rendezetlen fehérjék kölcsönhatásainak vizsgálata: elmélet, predikciók és alkalmazások
Rendezetlen fehérjék kölcsönhatásainak vizsgálata: elmélet, predikciók és alkalmazások Doktori (PhD) értekezés tézisei Mészáros Bálint Témavezetők: Dr. Dosztányi Zsuzsanna, PhD és Prof. Simon István, PhD,
Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei. Új utak keresése a neuro-onkológiai kórképek kezelésében. Dr. Mezey Géza
Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei Új utak keresése a neuro-onkológiai kórképek kezelésében Dr. Mezey Géza Témavezető: Prof. Dr. Bognár László DEBRECENI EGYETEM Idegtudományi Doktori Iskola Debrecen,
Bevezetés a bioinformatikába. Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék
Bevezetés a bioinformatikába Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék Bioinformatika Interdiszciplináris tudomány, amely magába foglalja a biológiai adatok gyűjtésének,feldolgozásának, tárolásának,
Bioinformatika 2 4. előadás
4. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.09.24. Biológiai adatbázisok Felhasználó Keresõprogram BLAST Biológiai adatbázisok
NÖVÉNYGENETIKA. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A
NÖVÉNYGENETIKA Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 A NÖVÉNYI TÁPANYAG TRANSZPORTEREK az előadás áttekintése A tápionok útja a növényben Növényi tápionok passzív és
Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
EGYETEMI DOKTORI (PH.D.) ÉRTEKEZÉS A C. ELEGANS PROTEIN DISZULFID IZOMERÁZ TRANSZGLUTAMINÁZ AKTIVITÁSÁNAK VIZSGÁLATA.
EGYETEMI DOKTORI (PH.D.) ÉRTEKEZÉS A C. ELEGANS PROTEIN DISZULFID IZOMERÁZ TRANSZGLUTAMINÁZ AKTIVITÁSÁNAK VIZSGÁLATA Blaskó Bernadett DEBRECENI EGYETEM ORVOS-ÉS EGÉSZSÉGTUDOMÁNYI CENTRUM BIOKÉMIAI ÉS MOLEKULÁRIS
DOKTORI (PHD)-ÉRTEKEZÉS TÉZISEK. Non-HLA hajlamosító gének és polimorfizmusaik vizsgálata magyar rheumatoid arthritis betegpopulációban
DOKTORI (PHD)-ÉRTEKEZÉS TÉZISEK Non-HLA hajlamosító gének és polimorfizmusaik vizsgálata magyar rheumatoid arthritis betegpopulációban FARAGÓ BERNADETT Témavezető: Dr. MELEGH BÉLA Pécsi Tudományegyetem,
Bioinformatika előadás
Bioinformatika 2 11. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2016.11.28. Bioinformatics Szerkezeti genomika, proteomika, biológia
TRANSZLÁCIÓ és fehérje transzport Hogyan lesz a DNS-ben kódolt információból fehérje? A DNS felszínén az aminosavak sorba állnak?
TRANSZLÁCIÓ és fehérje transzport Hogyan lesz a DNS-ben kódolt információból fehérje? A DNS felszínén az aminosavak sorba állnak? mrns, trns, riboszómák felfedezése A GENETIKAI KÓD 20 AS és csak 4 bázis,
avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest
Iparilag alkalmazható szekvenciák, avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest Neutrokin α - jelentős kereskedelmi érdekek
DNS replikáció. DNS RNS Polipeptid Amino terminus. Karboxi terminus. Templát szál
DNS replikáció DNS RNS Polipeptid Amino terminus Templát szál Karboxi terminus Szuper-csavarodott prokarióta cirkuláris DNS Hisztonok komplexe DNS hisztonokra történő felcsvarodása Hiszton-kötött negatív
3. Sejtalkotó molekulák III.
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, posztszintetikus módosítások). Enzimműködés 3.1 Fehérjék A genetikai információ egyik fő manifesztálódása Számos funkció
A molekuláris biológia eszközei
A molekuláris biológia eszközei I. Nukleinsavak az élő szervezetekben Reverz transzkripció replikáció transzkripció transzláció DNS DNS RNS Fehérje DNS feladata: információ tárolása és a transzkripció
A VASZKULÁRIS ENDOTELIÁLIS NÖVEKEDÉSI
A VASZKULÁRIS ENDOTELIÁLIS NÖVEKEDÉSI FAKTOR SZINTÉZISÉNEK ÉS SZEREPÉNEK VIZSGÁLATA HIPOXÁS ÁLLAPOTOKBAN Dr. Vannay Ádám Doktori értekezés Budapest, 2004 Témavezeto: Dr. Szabó András, egyetemi docens Készült
Supplemental table 1: Composition of the diets Chow diet (Teklad 2018, HFHS diet
Supplemental table 1: Composition of the diets Chow diet (Teklad 2018, HFHS diet HARLAN) Ingredients (g/100g) Crude protein 19 Casein high nitrogen 20 Fat (Soybean oil) 6.2 Lcysteine 0.18 Carbohydrate
PhD értekezés Írta: Juhász Szilvia Témavezető: Dr. Haracska Lajos Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont Genetikai Intézet
A C1orf124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban PhD értekezés Írta: Juhász Szilvia Témavezető: Dr. Haracska Lajos Magyar Tudományos Akadémia Szegedi Biológiai Kutatóközpont Genetikai Intézet
Jelentés. OTKA KON T/F nyilvántartási számú
Jelentés OTKA KON T/F 046427 nyilvántartási számú Peroxisoma proliferációt aktíváló receptorok (PPAR intron 7 2498 G/C, PPAR Pro12Ala és C161T) génpolimorfizmusainak vizsgálata és összefüggésük a tumor
A fibroblastok szerepe az implantátumok körüli csontfogyásban. Ph.D. értekezés tézisei. Dr. Koreny Tamás
A fibroblastok szerepe az implantátumok körüli csontfogyásban Ph.D. értekezés tézisei Dr. Koreny Tamás Doktori iskola vezetője: Prof. Dr. Komoly Sámuel DSc. Programvezető: Prof. Dr. Bellyei Árpád DSc.
A fehérjék szerkezeti hierarchiája. Fehérje-szerkezetek! Klasszikus szerkezet-funkció paradigma. szekvencia. funkció. szerkezet! Myoglobin.
Myoglobin Fehérje-szerkezetek! MGLSDGEWQLVLNVWGKVEADIPGGQEVLIRLFK GPETLEKFDKFKLKSEDEMKASE DLKKGATVLTALGGILKKKGEAEIKPLAQSA TKKIPVKYLEFISECIIQVLQSK PGDFGADAQGAMNKALELFRKDMASNYKELGFQG Fuxreiter Mónika! Debreceni
11. előadás: A génektől a fehérjékig A genetikai információ áramlása
11. előadás: A génektől a fehérjékig A genetikai információ áramlása A DNS információtartalma specifikus nukleotidsorrend formájában van jelen Az átörökített DNS fehérjék szintézisét szabályozva tulajdonságok
Gerinces és növényi ortológ promóter adatbázisok fejlesztése és elemzése. Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola
Doktori értekezés tézisei Gerinces és növényi ortológ promóter adatbázisok fejlesztése és elemzése Sebestyén Endre Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola Vezetője:
A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata
Ph.D. ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata Buzás-Bereczki Orsolya Témavezetők: Dr. Bálint Éva Dr. Boros Imre Miklós Biológia
Receptorok és szignalizációs mechanizmusok
Molekuláris sejtbiológia: Receptorok és szignalizációs mechanizmusok Dr. habil Kőhidai László Semmelweis Egyetem Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet Sejtek szignalizációs kapcsolatai Sejtek szignalizációs
Fehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis
Szerkezet Protein Data Bank (PDB) http://www.rcsb.org/pdb ~ 35 701 szerkezet közepes felbontás 1552 szerkezet d 1.5 Å 160 szerkezet d 1.0 Å 10 szerkezet d 0.8 Å (atomi felbontás) E globális minimum? funkció
Hajlamosító gének vizsgálata magyar morbus Crohnos és colitis ulcerosás betegpopulációban. PhD értekezés tézisei. Magyari Lili
Hajlamosító gének vizsgálata magyar morbus Crohnos és colitis ulcerosás betegpopulációban PhD értekezés tézisei Magyari Lili PTE ÁOK Orvosi Genetikai és Gyermekfejlıdéstani Intézet Témavezetı: Dr. Melegh
Escherichia coli aminosav-transzporterek vizsgálata
Doktori (Ph.D) értekezés tézisei Escherichia coli aminosav-transzporterek vizsgálata Készítette: Szvetnik Attila Témavezetı: Dr. Kálmán Miklós egyetemi docens Biológia Doktori Iskola Szegedi Tudományegyetem
Epigenetikai mintázatok biomarkerként történő felhasználási lehetőségei a toxikológiában
Epigenetikai mintázatok biomarkerként történő felhasználási lehetőségei a toxikológiában Czimmerer Zsolt, Csenki-Bakos Zsolt, Urbányi Béla TOX 2017 Tudományos Konferencia 2017.10.12. Bükfürdő A sejtek
Gyakorlati bioinformatika
Gyakorlati bioinformatika Szekvenciaillesztés PhD kurzus 2. Szekvenciaillesztés Bagossi Péter Fajtái: - egyszer ill. többszörös illesztés - globális ill. lokális illesztés Alkalmazása: - adatbázisokban
15. Fehérjeszintézis: transzláció. Fehérje lebontás (proteolízis)
15. Fehérjeszintézis: transzláció Fehérje lebontás (proteolízis) 1 Transzláció fordítás A C G T/U A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y 4 betűs írás (nukleinsavak) 20 betűs írás (fehérjék) 2 Amit már
A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise. Doktori értekezés tézisei.
A C. elegans TRA-1/GLI/Ci szex-determinációs faktor célgénjeinek meghatározása és analízise Doktori értekezés tézisei Hargitai Balázs Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori
Összefoglalás első fejezete
Összefoglalás Az utóbbi években a transzkriptómikai vizsgálatokban alkalmazott technológiák fejlődésének köszönhetően a genom kutatás területén jelentős előrehaladás figyelhető meg. A disszertáció első
1b. Fehérje transzport
1b. Fehérje transzport Fehérje transzport CITOSZÓL Nem-szekretoros útvonal sejtmag mitokondrium plasztid peroxiszóma endoplazmás retikulum Szekretoros útvonal lizoszóma endoszóma Golgi sejtfelszín szekretoros
A T sejt receptor (TCR) heterodimer
Immunbiológia - II A T sejt receptor (TCR) heterodimer 1 kötőhely lánc lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma V V C C EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL lánc: VJ régió lánc: VDJ régió Nincs szomatikus
Human genome project
Human genome project Pataki Bálint Ármin 2017.03.14. Pataki Bálint Ármin Human genome project 2017.03.14. 1 / 14 Agenda 1 Biológiai bevezető 2 A human genome project lefolyása 3 Alkalmazások, kitekintés
Biokémiai kutatások ma
Nyitray László Biokémiai Tanszék Hb Biokémiai kutatások ma Makromolekulák szerkezet-funkció kutatása Molekuláris biológia minden szinten Redukcionista molekuláris biológia vs. holisztikus rendszerbiológia
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola
Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola A mézelő méh (Apis mellifera L.) egyes kórokozóinak vizsgálata különös tekintettel a vírusfertőzésekre PhD értekezés Tapaszti Zsuzsanna 2010. Témavezető
7. Fehérjeszekvenciák és térszerkezetek analízise.
7. Fehérjeszekvenciák és térszerkezetek analízise. 1. Egyszerû elemzések 2. Térszerkezet predikció 2.1. A probléma bonyolultsága 2.2. A predikció szintjei 2.3. 1D predikciók (másodlagos szerkezet, hozzáférhetõség,
(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.
Immunbiológia II A T sejt receptor () heterodimer α lánc kötőhely β lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma 1 V α V β C α C β EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL αlánc: VJ régió β lánc: VDJ régió Nincs
Dr. Ottó Szabolcs Országos Onkológiai Intézet
Nemzeti Kutatási és Fejlesztési Program 1. Főirány: Életminőség javítása Nemzeti Onkológiai Kutatás-Fejlesztési Konzorcium a daganatos halálozás csökkentésére 1/48/2001. Részjelentés: 200. November 0.-2004.
Transzgénikus technológiák az orvostudományban A kövér egerektől a reumás betegségek gyógyításáig
Transzgénikus technológiák az orvostudományban A kövér egerektől a reumás betegségek gyógyításáig ELTE TTK Biológiai Intézet Budapest, 2015. okt. 7. Dr. Mócsai Attila Semmelweis Egyetem ÁOK Élettani Intézet
Supplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit.
Supplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit. MYB Primer pairs TC AtMYB Forward Reverse TC199266 MYB12 AGGCTCTTGGAGGTCGTTACC CAACTCTTTCCGCATCTCAATAATC
Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót
Az X kromoszóma inaktívációja A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Férfiak: XY Nők: XX X kromoszóma: nagy méretű több mint 1000 gén Y kromoszóma: kis méretű, kevesebb, mint 100 gén Kompenzációs
Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék. elrendeződés, rend, rendszer, periodikus ismétlődés
Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék Agócs Gergely 2013. december 3. kedd 10:00 11:40 1. Mit értünk élő anyag alatt? Az élő szervezetet felépítő anyagok. Az anyag azonban nem csupán