A SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE KÉNMETABOLIZMUSÁNAK FIZIOLÓGIAI ÉS MOLEKULÁRIS BIOLÓGIAI VIZSGÁLATA. SIMONICS TIBOR doktori értekezés tézisei
|
|
- Márk Hajdu
- 6 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 A SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE KÉNMETABOLIZMUSÁNAK FIZIOLÓGIAI ÉS MOLEKULÁRIS BIOLÓGIAI VIZSGÁLATA SIMONICS TIBOR doktori értekezés tézisei Budapest, 2004
2 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata A doktori iskola megnevezése: tudományága: vezetője: Témavezető: Élelmiszertudományi Doktori Iskola Élelmiszertudományok Dr. Fekete András egyetemi tanár Budapesti Corvinus Egyetem Dr. Maráz Anna egyetemi tanár Mikrobiológia és Biotechnológia Tanszék Élelmiszertudományi Kar Budapesti Corvinus Egyetem A doktori iskola- és a témavezető jóváhagyó aláírása: A jelölt a Budapesti Corvinus Egyetem Doktori Szabályzatában előírt valamennyi feltételnek eleget tett, a műhelyvita során elhangzott észrevételeket és javaslatokat az értekezés átdolgozásakor figyelembe vette, ezért az értekezés nyilvános vitára bocsátható Az iskolavezető jóváhagyása A témavezető jóváhagyása 2
3 Simonics Tibor 1. Bevezetés 1.1. A munka előzményei A kén az összes élőlény számára létfontosságú elem, elengedhetetlen része az életnek, a növekedésnek. Az élőlények a környezetükből a ként különböző formában vehetik fel, majd metabolizmusuk során átalakítják, illetve beépítik szerves molekuláikba. A legtöbb élőlény számára a környezetben legnagyobb mennyiségben előforduló egyik anion, a szulfát jelenti a legfőbb szervetlen kénforrást. Mint más szervetlen anion, a szulfát is egy specifikus membrán transzport segítségével jut be a sejtbe. A szulfát transzportja energiaigényes folyamat és általában több permeázt vesz igénybe. A szulfát redukció egy ősi, szinte valamennyi élőlény esetében azonos enzimes folyamatok segítségével végbemenő katabolikus út, az evolúció során viszonylag kevesett változott. A szulfát redukciója szulfittá egy többlépcsős enzimrendszeren keresztül valósul meg: először a szulfát ion az ATP-szulfuriláz enzimnek köszönhetően egy ATP mokelulához kötődik bisofoszfát leválása közben. Az így keletkezett 5 -adenililszulfát (másnéven 5 -adenozin-foszfo-szulfát=aps) molekulához az APS-kináz enzim egy foszfocsoportot kapcsol, majd a PAPS-reduktáz az újonnal kelezkezett 3 -foszfo-5 -adenilil-szulfát (másnéven foszfoadenozin-foszfo-szulfát=paps) molekulát szulfittá redukálja. A szulfit a szulfit-reduktáz hatására egy lépésben szulfiddá redukálódik. A szulfid a különböző mikroorganizmusoknál különböző úton épül be a sejt szerves molekuláiba. 3
4 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata A S. cerevisiae-nél a szulfid az O-acetilhomoszerinen keresztül épül be a sejt kéntartalmú aminosavaiba, amelynek során homocisztein keletkezik. A homociszteinből vagy metionin, vagy pedig a cisztationon keresztül cisztein keletkezik. Mivel a ciszteinből az S- adenozil-metioninen keresztül és a metioninből az S-adenozilhomociszteinen keresztül képződhet homocisztein, ezért bármelyik két kéntartalmú aminosav elegendő egyedüli kénforrásként (Thomas és Surdin-Kerjan, 1997). A Schiz. pombe-nél a szulfid az O-acetilszerinnel reagál, majd cisztein keletkezik. A cisztein O-acetilhomoszerinnel való reakciójából cisztation szabadul fel, ezt követően pedig a cisztationból homociszteinen keresztül metionin keletkezik. Homocisztein ezenkívül két másik reakciónál keletkezhet: a szulfid és az O-acetilhomoszerin reakciójából, valamint metioninből S-adenozil-metioninen és S- adenozil-homociszteinen keresztül. Az Aspergillus nidulans-nál és Neurospora crassa-nál a szulfid beépülése az aminosavakba nagyon hasonlít a Schiz. pombe-nél leírtakkal. Azonban a fonalas gombáknál a homociszteinből a cisztationon keresztül keletkezhet cisztein, viszont az ehhez szükséges enzimek (cisztation-β-szintáz és cisztation-γ-liáz) a hasadó élesztőgombánál hiányoznak, így a metioninből homociszteinen és cisztationon keresztül nem keletkezhet cisztein (Brzywczy és Paszewski, 1994). Az egyik legintenzívebben kutatott gombafaj, a Schizosaccharomyces pombe fiziológiájáról és genetikájáról már sokat 4
5 Simonics Tibor tudunk, azonban kénmetabolizmusa kevésbé ismert. Kutatásaim kezdetéig egyetlen, a szulfát asszimilációban szerepet játszó gént sem írtak le. Kutatásaimmal párhuzamossan egy berni kutatócsoport (Schweingruber és mtsi) a kén szerves molekulákba való beépülését katalizáló enzimek közül négyet (sam1, met25, met9,met11) publikált. Kohli és mtsi (1975) 5 metionin auxotróf törzset izoláltak, amelyeket véletlenszerűen neveztek el (met1-met5) és klasszikus módszerrel a kromoszómákra térképezték. Kutatócsoportunknak szelenát-rezisztens/szulfátot nem hasznosító törzsek vizsgálatával sikerült bizonyítani, hogy a Schiz. pombe a metionint úgy tudja ciszteinné alakítani, hogy a metionint először teljesen lebontja, így SO 2-4 keletkezik, majd a szulfát anionból a szulfát redukciós úton keresztül képződik cisztein. Ennek tulajdonítható, hogy a szulfát asszimilációs útban sérült szelenát-rezisztens/szulfátot nem hasznosító törzsek a metionint egyedüli kénforrásként nem képesek hasznosítani (Bánszky és mtsi, 2003). Sejten belüli kénfelesleg esetén a kén kén-hidrogén formájában kijut a sejtből. Ez a jelenség komoly íz- és aroma problémákat okozhat a sörgyártás, illetve a borászat területén. A borban található almasav nagy hatásfokú mikrobiológiai lebontása elvileg kétféleképpen lehetséges: 1., a tejsavbaktériumok (elsősorban az Oenococcus oenos) a malolaktikus fermentációja során az almasavból tejsav keletkezik 2., a Schizosaccharomyces pombe élesztőgomba maloetanolos fermentációja során az almasavból alkohol és CO 2 képződik. Manapság a borászatban a malolaktikus fermentáció terjedt el. Ennek az eljárásnak a hátránya, 5
6 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata hogy magas SO 2 koncentrációnál, alacsony ph-nál, alacsony hőmérsékleten és magas alkohol tartalomnál nem megy végbe, míg a maloetanolos fermentáció alacsony ph-nál és magas SO 2 koncentrációnál is folyik. A maloetanolos eljárás hátránya viszont, hogy az almasav lebontása során a bor gyümölcsös íze is eltűnik, valamint, hogy a fermentáció során nemkívánatos kéntartalmú íz- és aromaanyagok keletkeznek, többek között kén-hidrogén. A gyümölcsös íz megtartására megoldást jelentene az ún. rögzített sejtek alkalmazása. A szulfát asszimilációs út első lépéseinek enzimeit a szulfát toxikus analógjai (pl. szelenát, kromát, molibdenát) is igénybe veszik, amelyek bizonyos koncentráció felett a sejtek számára toxikus hatásúak lehetnek. A szelenát ion S. cerevisiae-re gyakorolt toxikus hatásának mechanizmusa már jól ismert. A szelenát ion a sejtben a szulfát asszimilációs úton keresztül a sejt számára toxikus hatású szelenitté (SeO 2-3 ) redukálódik. A szelenit toxikus hatása a redukciós út - során keletkezett nagy mennyiségű H 2 O 2 illetve O 2 ionnak tulajdonítható (Pinson és mtsi, 2000). A szelenit ion tolerancia a sejt detoxikációs mechanizmusától függ. E folyamat során a szelenit ion nem enzimatikus úton a redukált glutationnal lép reakcióba, amelynek során elemi szelén (Se 0 ) keletkezik (Gharieb és mtsi, 1995). A szelén általános toxicitása abból adódik, hogy a kéntartalmú aminosavakba beépül a kénatom helyére. A szelént tartalmazó aminosavak megváltoztathatják a fehérjék harmadlagos szerkezetét, így az adott fehérje (enzim) inaktiválódhat (Lauchi, 1993). 6
7 Simonics Tibor Az eukarióta mikoorganizmusoknál a szulfát hasznosítás és a szelenát érzékenység közötti szoros kapcsolatra először 1968-ban Arst mutatott rá Aspergillus nidulans-sal végzett kísérletei során. A szulfátot hasznosító törzsek szaporodását a szelenát gátolja, a szulfátot hasznosítani nem képes törzsek viszont szelenát-rezisztenssé váltak. Surdin-Kerjan és csoportja eredményei szerint a Saccharomyces cerevisiae szulfát asszimilációs génjeiben sérült összes mutánsa különböző fokú szelenát-rezisztenciával rendelkezik. Schizosaccharomyces pombe-nél először kutatócsoportunk izolált majd jellemzett szelenát-érzékeny mutánsokat. Értekezésem fő célja ezeknek a szelenát-rezisztens/szulfátot nem hasznosító törzseknek fiziológiai és molekuláris biológiai jellemzése volt, majd pedig annak vizsgálata, hogy ezek a mutánsok rögzített sejtes rendszerben kevesebb kénhidrogént termelnek-e, mint a vad típusú törzsek Célkitűzések 1. A tanszéki munkacsoport által korábban izolált szelenátrezisztens/szulfátot nem hasznosító mutánsoknál a sérült gén azonosítása klónozással. Ennek érdekében ki kellett dolgozni egy nagyhatékonyságú transzformációs eljárást, amely a mutánsnak Schiz. pombe génbankkal való transzformálását szolgálta. 2. A szulfát redukciós út sérült enzimét kódoló gén izolálása, szubklónozása, azonosítása majd jellemzése. 3. A klónozott gén S. cerevisiae-ben való kifejeződésének vizsgálata. 7
8 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata 4. A klónozott gén szelekciós markerként való felhasználhatóságának vizsgálata klónozó vektor kifejlesztéséhez. 5. Annak vizsgálata, hogy a vad típusú és a szelenát-rezisztens törzsek ATP-szulfuriláz enzimaktivitása és kén-hidrogén termelése változott-e. 6. A szelenát-rezisztens mutánsok inaktivált génjének lokalizálása a Schiz. pombe géntérképén, annak vizsgálata, hogy allélikus lehet-e a korábban Kohli és mtsi (1975) által térképezett Schiz. pombe met1-met5 gének valamelyikével. 7. Rögzített sejtes rendszerben megvizsgálni a szelenát-rezisztens mutánsok borászatban biológiai almasavbontásra való alkalmazhatóságát. 2. Anyagok és módszerek 2.1. A vizsgált törzsek A munkám során használt törzsek: -Schiz. pombe törzsek a., szelenát-rezisztens törzsek: 0-82 h - ade5 - Se R -2; B-579 h - Se R -2; h - trp1arg1 Se R -2; L-972 h - Se R -2 b., metionin auxotróf törzsek : h - met1-1; h + met2-2; h + met3-1; h + met4-6; h - met5-1 c., klónozó törzs: D-18 ura4 - -S. cerevisiae ATP-szulfurilázban sérült törzs: CC371-4B Matα his3 leu2 ura3 met3 8
9 Simonics Tibor 2.2. A felhasznált plazmidok, génbankok A klónozási kísérletekhez a Schiz. pombe pur18n shuttle vektort, és az ezzel kialakított génbankokat használtam. A klónozott génnek S. cerevisiae-ben való klónozásához a Yeplac181 autonóm replikációjú vektort használtam A kísérleti módszerek rövid bemutatása A vizsgálati módszerek kiválasztásánál egyrészt az irodalomban közölt vizsgálati módszereket alkalmaztam, másrészt ezeket továbbfejlesztettem, illetve újakat dolgoztam ki. A Schiz. pombe génbank szűréshez a Benkő Zsigmond és mtsi által készített és publikált (Benkő és mtsi, 1998) génbankokat használtam. Mivel egyik általunk izolált szelenát-rezisztens törzs sem hozdozta az ura4 - auxotrófia mutációt, ezért első lépésként egy ura4 -, szelenát-rezisztens törzs előállítása volt a cél, amelyet a 0-82 ade5 - Se R - 2 és a D-18 ura4 - törzsek protoplaszt fúziója, majd ezt követően benomilt tartalmazó táptalajon való mitotikus szegregáció után izoláltam. Az irodalomban közölt Schiz. pombe transzformációs eljárás nem bizonyult elég hatékonynak, ezért új eljárás kidolgozására volt szükség. A nagyhatékonyságú elektro-transzformációs eljárás kidolgozásánál a következő kezeléseknél kaptam a legnagyobb hatékonyságot: 1., 10 mm ditiotreitol, 0,1 M lítium-acetát, 100 mm Tris, 5 mm EDTA (ph8,5) 2., 100 µg/ml sejtfalbontó enzim (lysing enzyme, Sigma). 9
10 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata A klónozott DNS szakasz nukleotid sorrendjét Perkin-Elmer automatikus DNS szekvenátor (ABI373 model) segítségével, a dideoxi láncterminációs módszerrel a Szegedi Biológiai Központban határozták meg. A szekvenálás során használt primereket mindig a már megszekvenált DNS szakasz nukleotid sorrendje alapján szintetizáltattam. A szekvenciát a BLASTN, BLASTX ( a FramePlot ( Ishikawa és Hotta, 1999), valamint a ClustralW ( Thompson és mtsi, 1994) programok segítségével értékeltem ki. Mind a Schiz. pombe-ben, mind pedig a S. cerevisiae-ben történő klónozásnál a plazmid izolálásához az Escherichia coli-ban való felszaporítást használtam, amely a Schiz. pombe esetében sokkal kisebb hatékonyságúnak bizonyult. A kén-hidrogén termelés mérés esetében (Jiránek és mtsi, 1995) a tápközegből felszabaduló kén-hidrogént kadmium-hidroxidot tartalmazó csapdába vezettem el. A kén-hidrogén és a kadmiumhidroxid reakciójából felszabaduló kadmium-szulfid mennyiségére a kék színreakció után a kékszín intenzitásából következtettem. Az ATP-szulfuriláz enzimaktivitás mérésére a Segel és mtsi (1987) által leírt módszert használtam. Ennek a lényege, hogy az ATPszulfuriláz az ATP molekulából pirofoszfátot szabadít fel, amelyet a pirofoszfatáz enzim tovább hidrolizál. A felszabadult foszfátot színreakcióval mutattam ki, és mennyiségét fotométerrel mértem. A 10
11 Simonics Tibor színreakció stöchiometrikus, így a színképzés arányos az enzimaktivitással. A rögzített sejtek készítésénél a sejtszuszpenziót 1:3 arányban Na-alginát oldattal összekevertem, majd 0,2 M-os CaCl 2 oldatba csepegtetve megszilárdítottam. Két órás várakozást követően a rögzített sejteket steril desztillált vízzel átmostam. A borból illetve az almasav táplevesből kivett minták almasav tartalmát L-almasav teszttel (Boehringer Mannheim) a gyártó utasítása szerint határoztam meg. 3. Az eredmények összefoglalása Munkám elején egy szelenát rezisztens/szulfátot nem hasznosító mutáns (0-82 h - ade5 - Se R -2) és egy ura4 - mutációt hordozó transzformálható törzs (D-18 ura4 - ) fúzióját követően benomilos táptalajon szelenát-rezisztens, uracil hiányos rekombináns törzset (S ura4 - Se R -2) izoláltam, amely alkalmas volt ura4 szelekciós markert hordozó vektorral való transzformációra. A Schiz. pombe élesztőgombánál leggyakrabban használatos és legnagyobb hatékonysággal működő transzformációs eljárás a lítium-acetátos transzformáció. Mivel az újonnal izolált törzs esetében nem sikerült elég nagy transzformációs gyakoriságot elérnem, ezért elektroporációval próbálkoztam. A klónozó gazdaként alkalmazni kívánt S ura4 - Se R -2 törzsre kidolgoztam egy nagyhatékonyságú transzformációs eljárást. Elektroporáció előtt a sejtfal szerkezetének fellazítása érdekében a sejteket detergens, sejtfaloldó enzim és lítiumacetát különböző kombinációival kezeltem. A lítium-acetátos 11
12 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata transzformációhoz képest valamennyi kezelés esetében nagyobb hatékonyság növekedést értem el. A legjobb eredményt adó kezelés a transzformációs gyakoriságot transzformáns/µg DNS értékre növelte, amely már elegendőnek tekinthető a génbankkal való transzformációhoz. A két legnagyobb transzformációs gyakoriságot biztosító elektrokompetens sejteket három különböző inzert méretű Schiz. pombe génbankkal transzformáltam, majd egyedüli kénforrásként szulfátot tartalmazó minimál táptalajon pozitív transzformánsokat izoláltam. A transzformánsoknál a komplementálódott szulfát hasznosításért felelős gén expressziója biztosította a jó szaporodást. A transzformánsok szelenát-érzékenysége megegyezett vad típus szelenát-érzékenységével. Az egyik pozitív transzformánsból (C7 klón) plazmidot izoláltam, majd megszekvenáltattam a klónozott genomiális DNS szakaszt. Homológ szekvenciákat keresve a klónozott DNS szakasz szekvenciáját összevetettem a BLASTN, BLASTX adatbázisokban található Schiz. pombe szekvenciákkal. Az említett adatbázisokban egy homológ DNS szekvenciát találtam (kozmid 1228), amely teljes hosszúságban (4477 bp) tartalmazta a C7-es plazmidban klónozott genomiális DNS szakaszt. A kozmid 1228 a a Schiz. pombe GENOM PROJECT részeként lett megszekvenáltatva (Woods és mtsi, 2002). A homológia alapján talált kozmidok kromoszómán való elhelyezkedéseiből megállapítható, hogy a C7 klónban klónozott DNS szakasz közel a centromérához a II. kromoszóma bal karján található. 12
13 Simonics Tibor A C7-es plazmidban klónozott, közel 4,5 kbp hosszú DNS szakaszon két ORF-et találtam. Szubklónozással bebizonyítottam, hogy a két ORF közül a más élőlények ATP-szulfurilázaival nagyfokú homológiát mutató gén felelős a szulfátot nem hasznosító/szelenátrezisztens fenotípusért. A Schiz. pombe ATP-szulfuriláz génjét sua1 génnek neveztem el. Az 1473 bp hosszú sua1 gén ORF szekvenciája egy 490 aminosavból álló fehérje kódolására képes. A gén kezdő kodonja a metionint kódoló ATG, STOP kodonja pedig a TAA. A gén intront nem tartalmaz. Az sua1 gén 3 végén egy adeninben (A) és timinben (T) gazdag szakasz található: a gént követő 210 nukleotid hosszú szakasz A+T tartalma 73 %. A gén STOP kodonja (TAA) után 17 bp-ra egy 11- szer ismétlődő AT szakasz található. Az Sua1p-ben megtalálhatók azok a szubsztrát kötésében szerepet játszó konzervatív szekvenciák ( 190 VxAFQxRNP, GRDloop ), amelyeket más élőlényeknél jellemzett ATP-szulfuriláz enzimek is tartalmaznak. Az sua1 génnél viszont a GRD szakaszt megelőző aminosavban (V-valin) eltérés figyelhető meg: a legtöbb eukarióta élőlényeknél leírt ATP-szulfuriláz enzimekhez képest az sua1 génben a 286-os pozícióban valin helyett izoleucin (I) található. Az sua1 gén által kódolt fehérjének nagysága 54,7 kda. A szelenát-rezisztens törzsek gyakorlatilag nem mutattak ATP-szulfuriláz enzimaktivitást, míg a transzformánsoknál az enzimaktivitás a vad típusra jellemző értékre nőtt. 13
14 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata Az sua1 - mutációt hordozó Schiz. pombe törzseket az sua1 gént tartalmazó vektorral transzformáltam. A transzformáció sikeres volt, ami azt bizonyítja, hogy az sua1 gén mint egyedüli szelekciós marker használható klónozó vektorokban. Ennek előnye, hogy a klónozó cisztein auxotróf gazdák tetszőleges törzsekből pozitív szelekcióval szelenát-rezisztencia alapján izolálhatók, a komplementációval kapott transzformánsok pedig ugyancsak pozitív szelekcióval szulfátot, mint egyedüli kénforrást tartalmazó minimál táptalajon izolálhatók. A transzformánsok nem szelektív kürölmények között történő szaporítása során a plazmidvesztés a szelenátrezisztencia megjelenésével kimutatható, illetve kvantitatívan is meghatározható. A klónozott sua1 gént S. cerevisiae bifunkcionális vektorba vittem át, amellyel az ATP-szulfuriláz génben sérült S. cerevisiae met3 mutáns törzset transzformáltam. A heterológ transzformáció sikeres volt, a Schiz. pombe ATP-szulfuriláz génje képes volt komplementálni a S. cerevisiae ATP-szulfuriláz génben sérült mutánst, terminációs szignáljai biztosították a szaporodáshoz szükséges génexpressziót. Az első kénmetabolizmusban sérült mutánsokat Kohli és mtsi izolálták 1975-ben, akik 5 lókuszhoz térképezték a mutánsokat. Az 5 különböző metionin hiányos törzsnél megvizsgáltam, mely kénforrásokat képesek egyedüli kénforrásként hasznosítani. Ezek, valamint a kromoszómákon elfoglalt helyük, a Schiz. pombe publikált genom szekvencia adatok alapján megállapítottam, hogy egyik sem allélikus az sua1 génnel. 14
15 Simonics Tibor Az eredmények alapján valószínű, hogy a met1 és met2 mutánsoknál a két különböző homocisztein-metiltranszferáz, a met3-nál a cisztation-γ-szintáz, a met4 mutánsnál a homoszerin-oacetiltranszferáz a met5-nél pedig a metil-tetrahidrofolát-reduktáz gént inaktiválták. Valószínű, hogy az utóbbi a Naula és mtsi (2002) által met9-ként leírt génnel allélikus. Doktorandusz társam, Bánszky Luca doktori munkája során szabad sejtes kísérletekkel vizsgálta a szelenát-rezisztens és szelenátérzékeny törzsek almasavbontó képességét illetve kén-hidrogén termelését. A szabad sejtes eljárás hátránya, hogy az almasavtartalom kívánt szintre csökkentése után a Schiz. pombe sejteket a borból nehéz eltávolítani, így a borban nem kívánatos minőségi elváltozásokat okozhatnak. Ezen akadály kiküszöbölésére rögzített sejtes rendszerben vizsgáltam egy sua1 mutáns almasavbontását, illetve kén-hidrogén termelését. Szerves és szervetlen kénforrást tartalmazó tápközegben kimutattam, hogy a mutánsok a vad törzsekkel ellentétben nem termeltek mérhető mennyiségű kén-hidrogént. Az almasavbontó képességben és a bor aromaspektrumának változásában nem volt kimutatható különbség a mutáns és a vad típusú törzsek között. 15
16 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata 4. Új tudományos eredmények Sikerült a Schiz. pombe gombára kidolgoznom egy nagyhatékonyságú transzformációs eljárást, amely génbank szkrínelésére is használható. Elsőként sikerült klónozni és jellemezni a Schiz. pombe ATPszulfuriláz enzimét kódoló gént, amelyet sua1-nek neveztem el. Az sua1 génnek szelekciós markerként való alkalmazásával egy olyan vektort sikerült létrehozni, amely kettős pozitív szelekciót tesz lehetővé: mind a szelenát-rezisztens klónozó gazdatörzsek, mind pedig a prototróf transzformánsok pozitívan szelektálhatók, valamint a transzformánsok plazmidvesztése is egyszerűen és mennyiségileg meghatározható. Az sua1 gén S. cerevisiae-ben való klónozásával bizonyítottam, hogy a Schiz. pombe sua1 génje képes komplementálni a S. cerevisiae met3 mutánst. Ez az ATP-szulfuriláz gének konzervatív létét mutatja. Sikerült megállapítanom, hogy a Kohli és mtsi által leírt metionin auxotróf törzsek egyikében sem az ATP-szulfuriláz gént inaktiválták. Kén-hidrogén termelés mérésével bizonyítottam, hogy a szelenátrezisztens törzsek a vad típusú párjukkal ellentétben sem szerves vagy szervetlen kénforrást tartalmazó táptalajban, sem pedig borban nem termelnek kimutatható mennyiségben kén-hidrogént. Rögzített sejtekkel elvégzett kísérletekkel bizonyítottam, hogy a rögzített sejtek mind szerves vagy szervetlen kénforrást tartalmazó táptalajban, mind pedig borban jobban bontják az L-almasavat mint a szabad sejtek. 16
17 Simonics Tibor 5. Az eredmények továbbfejlesztési és hasznosítási lehetőségei Olyan Schiz. pombe klónozó vektorok készítése, amelyek szelekciós markerként csak az sua1 gént tartalmazzák. Ezek a vektorok használhatók lehetnének Schiz. pombe génbankok készítésénél is. Az sua1 gén promóter részének és az enzim szubsztrátkötésben szerepet játszó motívumainak további jellemzése. Az sua1 - mutáns törzsek jól bontották az almasavat és nem termeltek mérhető mennyiségű kén-hidrogént, ezért ezeket a törzseket a borászatban magas almasavtartalmú borok L- almasavtartalmának a csökkentésére lehetne alkalmazni. A borászatban rögzített sejtes sua1 - mutánsok alkalmazása javasolandó, ugyanis a rögzített sejtek a szabad sejtekkel ellentétben jobban bontották az L-almasavat és a borból való eltávolításuk is könnyeben megoldható. Mivel a sejtek rögzítése költséges, ezért flokuláló sua1 - mutánsok izolálásával ez a lépés is leegyszerűsíthető. A borászati alkalmazhatóságot laboratóriumi, félüzemi, majd üzemi léptékben szükséges vizsgálni. 17
18 Schizosaccharomyces pombe kénmetabolizmusának fiziológiai és molekuláris biológiai vizsgálata 6. Tudományos közlemények Impakt faktoros folyóiratcikkek Simonics T, Kozovska Z, Michalkova-Papajova D, Delahodde A, Jacq C, Subik J (2000): Isolation and molecular characterization of the carboxy-terminal pdr3 mutants in S. cerevisiae. Curr Genet 38: Bánszky L, Simonics T, Maráz A (2003): Sulphate metabolism of selenate-resistant Schizosaccharomyces pombe mutants. J Gen Appl Microbiol 49: Sreedhar AS, Mihaly K, Pato B, Schnaider T, Stetak A, Kis-Petik K, Fidy J, Simonics T, Maraz A, Csermely P (2003): Hsp90 inhibition accelerates cell lysis. Anti-Hsp90 ribozyme reveals a complex mechanism of Hsp90 inhibitors involving both superoxide- and Hsp90-dependent events. J Biol Chem 278: Simonics T, Maráz A: Cloning of the ATP sulphurylase gene of Schizosaccharomyces pombe by functional complementation (in press) Impakt faktor nélküli folyóiratcikkek Simonics T, Bánszky L, Maráz A (2001): A Schizosaccharomyces pombe élesztőgomba kénmetabolizmusának genetikai vizsgálata. Rodosz-tanulmányok II: Simonics T, Bánszky L, Maráz A (2002): Genetics of sulphate assimilation in Schizosaccharomyces pombe. Acta Microbiol. Hung 49: Konferenciakiadvány, magyar nyelvű, összefoglaló Simonics T, Maráz A (2000): High frequency electro-transformation for Schizosaccharomyces pombe. Magyar Mikrobiológiai Társaság éves közgyűlése-keszthely Simonics T, Maráz A (2000): Szulfát hasznosításban szerepet játszó gén klónozása Schizosaccharomyces pombe-ben. Lippay-Vas Tudományos Ülésszak Simonics T, Maráz A (2001): Szelenát rezisztens törzsek genetikai vizsgálata Schizosaccharomyces pombe élesztőgombánál. Kempelen Farkas Társaság I. találkozója Simonics T (2001): Almasavbontó élesztőgomba kén hidrogén termelésének vizsgálata. Tavaszi Szél-Gödöllő 18
19 Simonics Tibor Simonics T, Bánszky L, Maráz A (2001): Genetical analysis of sulphate metabolism of the Schizosaccharomyces pombe. RODOSZ II. tudományos konferenciája Simonics T, Maráz A (2001): A Schizosaccharomyces pombe szulfát metabolizmusában szerepet játszó gén molekuláris vizsgálata. Magyar Mikrobiológiai Társaság éves közgyűlése- Balatonfüred Simonics T, Bánszky L, Maráz A (2002): A Schizosaccharomyces pombe élesztőgomba ATP szulfuriláz génjének klónozása. Kempelen Farkas Társaság II. találkozója Simonics T, Bánszky L, Maráz A (2002): A Schizosaccharomyces pombe szulfát hasznosításának genetikai vizsgálata. Magyar Mikológiai Társaság II. konferenciája-szeged Simonics T, Bánszky L, Maráz A, Magyar I, Tóth-Márkus M (2002): Szulfát hasznosításban sérült Schizosaccharomyces pombe mutánsok malo-etanolos fermentációjának vizsgálata. Magyar Mikrobiológiai Társaság éves közgyűlése-balatonfüred Konferenciakiadvány, nemzetközi konferencia, összefoglaló Simonics T, Maráz A (2001): Cloning of a Schizosaccharomyces pombe gene, having role in sulphate utilization. XXIXth Annual Conference on Yeasts, Smolenice (Szlovákia) Simonics T, Maráz A (2001): Genetic background of sulphate utilization at Schizosaccharomyces pombe. XXth International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology Maráz A, Simonics T, Bánszky L, Geleta A (2002): Development of fission yeast strains fro wine deacidification. Yeast in food processing-tradition and future. Wroclaw (Lengyelország) Maráz A, Bánszky L Simonics T, Geleta A (2002): Potential application of fission yeast in biotechnology. Power of microbes in industry and enviroment-opatija (Horvátország) Simonics T, Bánszky L, Maráz A (2002): Molecular and physiological characterization of selenate resistant mutanz strains of Schizosaccharomyces pombe. Power of microbes in industry and enviroment-opatija (Horvátország) Simonics T, Bánszky L, Maráz A (2002): Cloning and functional analysis of ATP-sulphurylase gene of Schizosaccharomyces pombe. IUMS konferencia-párizs 19
IRODALMI ÁTTEKINTÉS A A A
Tartalomjegyzék 1 BEVEZETÉS... 4 2 IRODALMI ÁTTEKINTÉS... 6 2.1 Kénmetabolizmus a mikroorganizmusoknál... 6 2.1.1 A szervetlen kénvegyületek felvétele különböző mikroorganizmusoknál... 6 2.1.2 Kéntartalmú
Kén-anyagcserében sérült szelenát rezisztens. Schizosaccharomyces pombe mutánsok előállítása és vizsgálata
Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológia és Biotechnológia Tanszék Kén-anyagcserében sérült szelenát rezisztens Schizosaccharomyces pombe mutánsok előállítása és vizsgálata Doktori
Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK VIZSGÁLATA Péteri Adrienn Zsanett Témavezetők: Dr. Varga János, Egyetemi docens Dr. Vágvölgyi Csaba, Tanszékvezető egyetemi
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László
A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése Kiss Erzsébet Kovács László Bevezetés Nagy gazdasági gi jelentıségük k miatt a gyümölcs lcsök, termések fejlıdésének mechanizmusát
Kén-anyagcserében sérült szelenát rezisztens. Schizosaccharomyces pombe mutánsok előállítása és vizsgálata
Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológia és Biotechnológia Tanszék Kén-anyagcserében sérült szelenát rezisztens Schizosaccharomyces pombe mutánsok előállítása és vizsgálata Doktori
Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.
Növények klónozása Klónozás Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása. Görög szó: klon, jelentése: gally, hajtás, vessző. Ami
MIKROBIOLÓGIA. Dr. Maráz Anna egyetemi tanár. Mikrobiológia és Biotechnológia Tanszék Élelmiszertudományi Kar Budapesti Corvinus Egyetem
ERJEDÉSIPARI MIKROBIOLÓGIA Dr. Maráz Anna egyetemi tanár Mikrobiológia és Biotechnológia Tanszék Élelmiszertudományi Kar Budapesti Corvinus Egyetem Ipari fermentációk Sejtek (általában mikroorganizmusok)
A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének
A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének merisztéma korai szimbiotikus zóna késői szimbiotikus zóna öregedési zóna gyökér keresztmetszet NODULÁCIÓ növényi jel Rhizobium meliloti rhizobium
A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA
EGYETEMI DOKTORI (PH.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA Nagy Zoltán Témavezet : Dr. Biró Sándor Debreceni Egyetem Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással
Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással Kovács Zoltán ügyvezető DEKUT Debreceni Kutatásfejlesztési Közhasznú Nonprofit Kft. Problémadefiníció Első generációs
Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése
Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése Doktori értekezés tézisei Szabó Zsolt Témavezető: Dr. Bihari Zoltán vezető kutató
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata
Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata AKI kíváncsi kémikus kutatótábor 2017.06.25-07.01. Témavezetők : Telbisz Ágnes, Horváth Tamás Kutatók : Dobolyi Zsófia, Bereczki Kristóf, Horváth Ákos Gyógyszerrezisztencia
transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
4. SZERVES SAVAK. Az ecetsav biológiai előállítása SZERVES SAVAK. Ecetsav baktériumok. Az ecetsav baktériumok osztályozása ECETSAV. 04.
Az ecetsav biológiai előállítása 4. SZERVES SAVAK A bor után legősibb (bio)technológia: a bor megecetesedik borecet keletkezik A folyamat bruttó leírása: C 2 H 5 OH + O 2 CH 3 COOH + H 2 O Az ecetsav baktériumok
III/3. Gének átvitele vektorokkal
III/3. Gének átvitele vektorokkal Vektor: (molekuláris) biológiai rendszer, amely képes új/idegen genetikai információt bejuttatni egy sejtbe. Független szaporodásra képes. Fajtái: Plazmidok (1-10 kb)
A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai
A BIOLÓGIA ALAPJAI A tananyag felépítése: Környezetmérnök és műszaki menedzser hallgatók számára Előadó: 2 + 0 + 0 óra, félévközi számonkérés 3 ZH: október 3, november 5, december 5 dr. Pécs Miklós egyetemi
Glikolízis. emberi szervezet napi glukózigénye: kb. 160 g
Glikolízis Minden emberi sejt képes glikolízisre. A glukóz a metabolizmus központi tápanyaga, minden sejt képes hasznosítani. glykys = édes, lysis = hasítás emberi szervezet napi glukózigénye: kb. 160
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben
A genetikai lelet értelmezése monogénes betegségekben Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika A ~20 ezer fehérje-kódoló gén a 23 pár kromoszómán A kromoszómán található bázisok száma: 250M
Lignocellulóz bontó enzimek előállítása és felhasználása
Lignocellulóz bontó enzimek előállítása és felhasználása Ph.D. ÉRTEKEZÉS TÉZISEI Juhász Tamás Témavezető: Dr. Réczey Istvánné 2005 Mezőgazdasági Kémiai Technológia Tanszék Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi
DER (Felületén riboszómák találhatók) Feladata a biológiai fehérjeszintézis Riboszómák. Az endoplazmatikus membránrendszer. A kódszótár.
Az endoplazmatikus membránrendszer Részei: DER /durva (szemcsés) endoplazmatikus retikulum/ SER /sima felszínű endoplazmatikus retikulum/ Golgi készülék Lizoszómák Peroxiszómák Szekréciós granulumok (váladékszemcsék)
Tejsavasan erjesztett savó alapú ital kifejlesztésének membrán-szeparációs és mikrobiológiai alapjai
Hungalimentaria 217 217.4.27. Tejsavasan erjesztett savó alapú ital kifejlesztésének membrán-szeparációs és mikrobiológiai alapjai Pázmándi Melinda 1,2, Kovács Zoltán,2, Maráz Anna 1, SZIE, ÉTK 1 Mikrobiológiai
Szénhidrátok monoszacharidok formájában szívódnak fel a vékonybélből.
Vércukorszint szabályozása: Szénhidrátok monoszacharidok formájában szívódnak fel a vékonybélből. Szövetekben monoszacharid átalakítás enzimjei: Szénhidrát anyagcserében máj központi szerepű. Szénhidrát
A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA
A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA Futó Kinga 2014.10.01. Metabolizmus Metabolizmus = reakciók együttese, melyek a sejtekben lejátszódnak. Energia nyerés szempontjából vannak fototrófok ill. kemotrófok. szervesanyag
A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA
A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA Futó Kinga 2013.10.02. Metabolizmus Metabolizmus = reakciók együttese, melyek a sejtekben lejátszódnak. Energia nyerés szempontjából vannak fototrófok ill. kemotrófok. szervesanyag
A replikáció mechanizmusa
Az öröklődés molekuláris alapjai A DNS megkettőződése, a replikáció Szerk.: Vizkievicz András A DNS-molekula az élőlények örökítő anyaga, kódolt formában tartalmazza mindazon információkat, amelyek a sejt,
Glikolízis. Csala Miklós
Glikolízis Csala Miklós Szubsztrát szintű (SZF) és oxidatív foszforiláció (OF) katabolizmus Redukált tápanyag-molekulák Szállító ADP + P i ATP ADP + P i ATP SZF SZF Szállító-H 2 Szállító ATP Szállító-H
NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag
NUKLEINSAVAK Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag RNS = Ribonukleinsav DNS = Dezoxi-ribonukleinsav A nukleinsavak
A BIOTECHNOLÓGIA TERMÉSZETTUDOMÁNYI ALAPJAI
A BIOTECHNOLÓGIA TERMÉSZETTUDOMÁNYI ALAPJAI Műszaki menedzser MSc hallgatók számára Előadó: 2 + 0 + 0 óra, félévközi számonkérés 3 ZH: március 06?, április 10?, május 02?. dr. Pécs Miklós egyetemi docens
A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish.
OTKA K67808 zárójelentés 2012. A termesztett búza diploid őseinek molekuláris citogenetikai elemzése: pachytén- és fiber-fish. A fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH) olyan technikai fejlettséget ért
Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában
Molekuláris genetikai vizsgáló módszerek az immundefektusok diagnosztikájában Primer immundefektusok A primer immundeficiencia ritka, veleszületett, monogénes öröklődésű immunhiányos állapot. Családi halmozódást
ANATÓMIA FITNESS AKADÉMIA
ANATÓMIA FITNESS AKADÉMIA sejt szövet szerv szervrendszer sejtek általános jellemzése: az élet legkisebb alaki és működési egysége minden élőlény sejtes felépítésű minden sejtre jellemző: határoló rendszer
ENZIMEK BIOTECHNOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ENZIMEK BIOTECHNOLÓGIAI
A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D.
A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban Ph.D. értekezés tézisei Készítette: Nagy Ildikó Katalin Témavezetők: Dr. Maróti Gergely
A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan
A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM 40078 törzse egy olyan fehérjét (FC-1 killer toxint) választ ki a tápközegbe, amely elpusztítja az opportunista patogén Cryptococcus neoformans-t.
BIOLÓGIA és BIOTECHNOLÓGIA 3. rész
BIOLÓGIA és BIOTECHNOLÓGIA 3. rész Előadók: Ballagi András, c. egyetemi tanár Richter Gedeon NyRt. - BME Írásos segédanyag található a: http://oktatas.ch.bme.hu /oktatas /konyvek /mezgaz /Biol-biotech-vegyész-MSc
BIOLÓGIA és BIOTECHNOLÓGIA 3. rész
BIOLÓGIA és BIOTECHNOLÓGIA 3. rész Előadók: Ballagi András, c. egyetemi tanár Richter Gedeon NyRt. - BME Írásos segédanyag található a: http://oktatas.ch.bme.hu /oktatas /konyvek /mezgaz /Biol-biotech-vegyész-MSc
A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.
Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak
Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására
Szalma Katalin Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására Témavezető: Dr. Turai István, OSSKI Budapest, 2010. október 4. Az ionizáló sugárzás sejt kölcsönhatása Antone
I. A sejttől a génekig
Gén A gének olyan nukleinsav-szakaszok a sejtek magjainak kromoszómáiban, melyek a szervezet működését és növekedését befolyásoló fehérjék szabályozásához és előállításához szükséges információkat tartalmazzák.
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014
Növényvédelmi Tudományos Napok 2014 Budapest 60. NÖVÉNYVÉDELMI TUDOMÁNYOS NAPOK Szerkesztők HORVÁTH JÓZSEF HALTRICH ATTILA MOLNÁR JÁNOS Budapest 2014. február 18-19. ii Szerkesztőbizottság Tóth Miklós
A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban
A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban Ph.D. értekezés tézisei Kalapis Dorottya Témavezető: Dr. Pál Csaba tudományos főmunkatárs Biológia
A molekuláris biológia eszközei
A molekuláris biológia eszközei I. Nukleinsavak az élő szervezetekben Reverz transzkripció replikáció transzkripció transzláció DNS DNS RNS Fehérje DNS feladata: információ tárolása és a transzkripció
A mikroorganizmusok szerepe a borászatban
A mikroorganizmusok szerepe a borászatban Alkoholos erjedés Almasavbontás Borkezelések Borbetegségek kialakulása Az alkoholos erjedés legfontosabb hatásai. cukor Must Anaerobiózis Almasav Borkősav Aminosav,
13. RNS szintézis és splicing
13. RNS szintézis és splicing 1 Visszatekintés: Az RNS típusai és szerkezete Hírvivő RNS = mrns (messenger RNA = mrna) : fehérjeszintézis pre-mrns érett mrns (intronok kivágódnak = splicing) Transzfer
Borászati starterkultúrák fejlesztésének irányai
Borászati starterkultúrák fejlesztésének irányai Dr. Magyar Ildikó Szent István Egyetem Borászati Tanszék Borélesztők: Saccharomyces cerevisiae és Saccharomyces uvarum Saccharomyces sensu stricto fajok:
Talaj mikrobiális biomasszatartalom. meghatározásának néhány lehetősége és a módszerek komparatív áttekintése
Talaj mikrobiális biomasszatartalom mennyiségi meghatározásának néhány lehetősége és a módszerek komparatív áttekintése A talajminőség és a mikrobiális biomassza kapcsolata A klasszikus talajdefiníciók
A szénhidrátok lebomlása
A disszimiláció Szerk.: Vizkievicz András A disszimiláció, vagy lebontás az autotróf, ill. a heterotróf élőlényekben lényegében azonos módon zajlik. A disszimilációs - katabolikus - folyamatok mindig valamilyen
Intelligens molekulákkal a rák ellen
Intelligens molekulákkal a rák ellen Kotschy András Servier Kutatóintézet Rákkutatási kémiai osztály A rákos sejt Miben más Hogyan él túl Áttekintés Rákos sejtek célzott támadása sejtmérgekkel Fehérjék
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
Inzulinutánzó vanádium-, és cinkkomplexek kölcsönhatásának vizsgálata vérszérum fehérjékkel
Inzulinutánzó vanádium-, és cinkkomplexek kölcsönhatásának vizsgálata vérszérum fehérjékkel Mivel a vizsgált komplexek inzulinutánzó hatása összetett és a hatásmechanizmusuk csak részben feltárt az irodalomban,
T-2 TOXIN ÉS DEOXINIVALENOL EGYÜTTES HATÁSA A LIPIDPEROXIDÁCIÓRA ÉS A GLUTATION-REDOX RENDSZERRE, VALAMINT ANNAK SZABÁLYOZÁSÁRA BROJLERCSIRKÉBEN
T-2 TOXIN ÉS DEOXINIVALENOL EGYÜTTES HATÁSA A LIPIDPEROXIDÁCIÓRA ÉS A GLUTATION-REDOX RENDSZERRE, VALAMINT ANNAK SZABÁLYOZÁSÁRA BROJLERCSIRKÉBEN Mézes Miklós a,b, Pelyhe Csilla b, Kövesi Benjámin a, Zándoki
A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)
Az I./2. rész (Gének és funkciójuk) rövid összefoglalója A gének a DNS információt hordozó szakaszai, melyekben a 4 betű (ATCG) néhány ezerszer, vagy százezerszer ismétlődik. A gének önálló programcsomagként
(11) Lajstromszám: E 006 472 (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA
!HU000006472T2! (19) HU (11) Lajstromszám: E 006 472 (13) T2 MAGYAR KÖZTÁRSASÁG Magyar Szabadalmi Hivatal EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA (21) Magyar ügyszám: E 04 788982 (22) A bejelentés napja:
GMO = genetikailag módosított organizmusok. 1. Gének megváltoztatása. Gének megváltoztatása. Pécs Miklós: A biológia alapjai
GMO = genetikailag módosított organizmusok A gének megváltoztatása, vagy átvitele egyik organizmusból a másikba. 1 1. Gének megváltoztatása indukált mutáció + szelekció (mikroorganizmusoknál, alacsonyabb
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
3. Sejtalkotó molekulák III.
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, posztszintetikus módosítások). Enzimműködés 3.1 Fehérjék A genetikai információ egyik fő manifesztálódása Számos funkció
Tárgyszavak: fermentálás; optimálás; méretnövelés; szakaszos üzem; folyamatos üzem.
A BIOTECHNOLÓGIA MÛSZAKI HÁTTERE Nagyüzemi fermentálási eljárások optimálása Tárgyszavak: fermentálás; optimálás; méretnövelés; szakaszos üzem; folyamatos üzem. A fermentációs folyamat optimálása beletartozik
Anaerob fermentált szennyvíziszap jellemzése enzimaktivitás-mérésekkel
Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Környezettudományi Centrum Anaerob fermentált szennyvíziszap jellemzése enzimaktivitás-mérésekkel készítette: Felföldi Edit környezettudomány szakos
2. Aminosavak - Treonin
Az aminosavak felhasználása nátrium-glutamát ízfokozó (Delikát, Vegeta) lizin, metionin, treonin, triptofán takarmány- és élelmiszerkiegészítő aszparaginsav és fenilalanin aszpartám édesítőszer gyártásához
Klímaváltozás és borászat, alkalmazkodás a mindennapi gyakorlatban. Nyitrainé dr. Sárdy Diána SZIE, Borászati Tanszék Tanszékvezető, egyetemi docens
Klímaváltozás és borászat, alkalmazkodás a mindennapi gyakorlatban Nyitrainé dr. Sárdy Diána SZIE, Borászati Tanszék Tanszékvezető, egyetemi docens Klímaváltozás Milyen terméket szeretnénk készíteni? Megszokott
Kromoszómák, Gének centromer
Kromoszómák, Gének A kromoszóma egy hosszú DNS szakasz, amely a sejt életének bizonyos szakaszában (a sejtosztódás előkészítéseként) tömörödik, így fénymikroszkóppal láthatóvá válik. A kromoszómák két
6. Zárványtestek feldolgozása
6. Zárványtestek feldolgozása... 1 6.1. A zárványtestek... 1 6.1.1. A zárványtestek kialakulása... 2 6.1.2. A feldolgozási technológia... 3 6.1.2.1. Sejtfeltárás... 3 6.1.2.2. Centrifugálás, tisztítás...
A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA BIOENERGETIKA I. 1. kulcsszó cím: Energia A termodinamika első főtétele kimondja, hogy a különböző energiafajták átalakulhatnak egymásba ez az energia megmaradásának
ÖSSZETETT ÉS SPECIÁLIS SZÍNEZÉSI ELJÁRÁSOK
ÖSSZETETT ÉS SPECIÁLIS SZÍNEZÉSI ELJÁRÁSOK Molnár Mónika, Tolner Mária, Nagy Zsuzsanna Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi
Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót
Az X kromoszóma inaktívációja A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót Férfiak: XY Nők: XX X kromoszóma: nagy méretű több mint 1000 gén Y kromoszóma: kis méretű, kevesebb, mint 100 gén Kompenzációs
BIOGÉN ELEMEK Azok a kémiai elemek, amelyek az élőlények számára létfontosságúak
BIOGÉN ELEMEK Azok a kémiai elemek, amelyek az élőlények számára létfontosságúak A több mint száz ismert kémiai elem nagyobbik hányada megtalálható az élőlények testében is, de sokuknak nincsen kimutatható
Az anafázis promoting complex (APC/C) katalitikus modulja Drosophila melanogasterben. Nagy Olga
Ph.D. értekezés tézisei Az anafázis promoting complex (APC/C) katalitikus modulja Drosophila melanogasterben Nagy Olga Témavezető: Dr. Deák Péter MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont Biológia Doktori Iskola
A biotechnológia alapjai A biotechnológia régen és ma. Pomázi Andrea
A biotechnológia alapjai A biotechnológia régen és ma Pomázi Andrea A biotechnológia fogalma Alkalmazott biológia A fogalom állandó változásban van A biológia és a biotechnológia közötti különbség a méretekben
Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre
Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola Pathobiokémia Program Doktori (Ph.D.) értekezés Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre dr. Nardai Gábor Témavezeto:
A szénhidrátok lebomlása
A disszimiláció Szerk.: Vizkievicz András A disszimiláció, vagy lebontás az autotróf, ill. a heterotróf élőlényekben lényegében azonos módon zajlik. A disszimilációs - katabolikus - folyamatok mindig valamilyen
A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.
A doktori értekezés tézisei A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban. Bíró Judit Témavezető: Dr. Fehér Attila Magyar Tudományos Akadémia
(11) Lajstromszám: E 007 751 (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA
!HU000007751T2! (19) HU (11) Lajstromszám: E 007 751 (13) T2 MAGYAR KÖZTÁRSASÁG Magyar Szabadalmi Hivatal EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA (21) Magyar ügyszám: E 04 810619 (22) A bejelentés napja:
Vízben oldott antibiotikumok (fluorokinolonok) sugárzással indukált lebontása
Vízben oldott antibiotikumok (fluorokinolonok) sugárzással indukált lebontása Doktori beszámoló 5. félév Készítette: Tegze Anna Témavezető: Dr. Takács Erzsébet ÓBUDAI EGYETEM ANYAGTUDOMÁNYOK ÉS TECHNOLÓGIÁK
Ismert molekula új lehetőségekkel Butirát a modern baromfitakarmányozásban
Ismert molekula új lehetőségekkel Butirát a modern baromfitakarmányozásban Dr. Mátis Gábor, PhD SZIE Állatorvos-tudományi Kar Élettani és Biokémiai Tanszék CEPO Konferencia Keszthely, 213. október 18.
Escherichia coli aminosav-transzporterek vizsgálata
Doktori (Ph.D) értekezés tézisei Escherichia coli aminosav-transzporterek vizsgálata Készítette: Szvetnik Attila Témavezetı: Dr. Kálmán Miklós egyetemi docens Biológia Doktori Iskola Szegedi Tudományegyetem
IPARI ENZIMEK 2. Proteázok. Alkalikus proteázok. Pécs Miklós: Biotermék technológia 1. 6. fejezet: Ipari enzimek 2.
IPARI ENZIMEK 2 Proteázok A proteázok az ipari enzimek egyik legfontosabb csoportja (6200 t tiszta E/év) Peptid kötéseket bont (létrehoz) (hidrolízis, szintézis) Fehérje lebontás: élelmiszer, tejalvadás,
Készítette: NÁDOR JUDIT. Témavezető: Dr. HOMONNAY ZOLTÁN. ELTE TTK, Analitikai Kémia Tanszék 2010
Készítette: NÁDOR JUDIT Témavezető: Dr. HOMONNAY ZOLTÁN ELTE TTK, Analitikai Kémia Tanszék 2010 Bevezetés, célkitűzés Mössbauer-spektroszkópia Kísérleti előzmények Mérések és eredmények Összefoglalás EDTA
AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA
AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA Gödöllő 2007. 1 A Doktori Iskola megnevezése: Szent István Egyetem Biológia Tudományi
A glükóz reszintézise.
A glükóz reszintézise. A glükóz reszintézise. A reszintézis nem egyszerű megfordítása a glikolízisnek. A glikolízis 3 irrevezibilis lépése más úton játszódik le. Ennek oka egyrészt energetikai, másrészt
A nitrogén körforgalma. A környezetvédelem alapjai május 3.
A nitrogén körforgalma A környezetvédelem alapjai 2017. május 3. A biológiai nitrogén körforgalom A nitrogén minden élő szervezet számára nélkülözhetetlen, ún. biogén elem Részt vesz a nukleinsavak, a
Bioinformatika - egészséges környezet, egészséges élelmiszer
CESCI - III. SZENTGOTTHÁRDI SZLOVÉN MAGYAR FÓRUM Bioinformatika - egészséges környezet, egészséges élelmiszer Pannon Bio-Innováció Kft Taller János, PhD ügyvezető Szentgotthárd, 2017. május 23. 1 Pannon
Mikrobiális fitáz enzim előállítása és jellemzése
Mikrobiális fitáz enzim előállítása és jellemzése Doktori értekezés tézisei BUJNA ERIKA Budapest 2014 A doktori iskola megnevezése: tudományága: vezetője: Témavezető: Élelmiszertudományi Doktori Iskola
Borászati mikrobiológia és kémia vizsgakérdések 2012.
Borászati mikrobiológia és kémia vizsgakérdések 2012. Egy vizsgán feltett kérdések pontértéke: Összesen 60 pont >52 pont: jeles (5) 44-51 pont: jó (4) 38-43 pont: közepes (3) 30-37 pont: elégséges (2)
Kevéssé fejlett, sejthártya betüremkedésekből. Citoplazmában, cirkuláris DNS, hisztonok nincsenek
1 A sejtek felépítése Szerkesztette: Vizkievicz András A sejt az élővilág legkisebb, önálló életre képes, minden életjelenséget mutató szerveződési egysége. Minden élőlény sejtes szerveződésű, amelyek
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során Ungvári Erika, Tóth Ákos Magyar Infektológiai és Klinikai Mikrobiológiai
Kereskedelmi forgalomban lévő rekombináns gyógyszerkészítmények
Kereskedelmi forgalomban lévő rekombináns gyógyszerkészítmények Írta: Barta Zsolt Biomérnök hallgató 2007 Tartalomjegyzék 1 Rekombináns inzulin [1]... 3 2 A humán növekedési hormon rekombináns módon történő
A GENOM MEGISMERÉSÉNEK MÓDSZEREI
A GENOM MEGISMERÉSÉNEK MÓDSZEREI 20 GENETIKA ALAPOK 3-1 Jóslatok és a valóság a molekuláris biológiában. Mennyire látható előre a tudomány fejlődése? 1968 Simone de Beauvoir "Minden ember halandó" 1-2
Az örökítőanyag. Az élőlények örökítőanyaga minden esetben nukleinsav (DNS,RNS) (1)Griffith, (2)Avery, MacLeod and McCarty (3)Hershey and Chase
SZTE, Orv. Biol. Int., Mol- és Sejtbiol. Gyak., VIII. Az örökítőanyag Az élőlények örökítőanyaga minden esetben nukleinsav (DNS,RNS) (1)Griffith, (2)Avery, MacLeod and McCarty (3)Hershey and Chase Ez az
ZSÍRSAVAK OXIDÁCIÓJA. FRANZ KNOOP német biokémikus írta le először a mechanizmusát. R C ~S KoA. a, R-COOH + ATP + KoA R C ~S KoA + AMP + PP i
máj, vese, szív, vázizom ZSÍRSAVAK XIDÁCIÓJA FRANZ KNP német biokémikus írta le először a mechanizmusát 1 lépés: a zsírsavak aktivációja ( a sejt citoplazmájában, rövid zsírsavak < C12 nem aktiválódnak)
Bevezetés a rendszerbiológiába
Bevezetés a rendszerbiológiába Papp Balázs http://group.szbk.u-szeged.hu/sysbiol/ MTA Szegedi Biológiai Központja Biokémiai Intézet Alapprobléma Ma a biológiában rengeteg adat termelődik és áll rendelkezésre.
A MITOKONDRIUMOK SZEREPE A SEJT MŰKÖDÉSÉBEN. Somogyi János -- Vér Ágota Első rész
A MITOKONDRIUMOK SZEREPE A SEJT MŰKÖDÉSÉBEN Somogyi János -- Vér Ágota Első rész Már több mint 200 éve ismert, hogy szöveteink és sejtjeink zöme oxigént fogyaszt. Hosszú ideig azt hitték azonban, hogy
4.4 BIOPESZTICIDEK. A biopeszticidekről. Pécs Miklós: A biotechnológia természettudományi alapjai
4.4 BIOPESZTICIDEK A mezőgazdasági termelésnél a kártevők irtásával, távoltartásával növelik a hozamokat. Erre kémiai szereket alkalmaztak, a környezeti hatásokkal nem törődve. pl. DDT (diklór-difenil-triklór-etán)
Egy új toxin-antitoxinszerű modul nem tipikus transzkripciós szabályozása és funkciója Bradyrhizobium japonicumban. Miclea Sebastian Paul
Ph.D disszertáció tézisei Egy új toxin-antitoxinszerű modul nem tipikus transzkripciós szabályozása és funkciója Bradyrhizobium japonicumban Miclea Sebastian Paul Témavezető: Dr. Dusha Ilona Genetikai
Antibakteriális hatóanyagot tartalmazó kapszulák előállítása, jellemzése és textilipari alkalmazása. Nagy Edit Témavezető: Dr.
Antibakteriális hatóanyagot tartalmazó kapszulák előállítása, jellemzése és textilipari alkalmazása Nagy Edit Témavezető: Dr. Telegdi Judit Megvalósítás lépései Oligomer és polimer előállítás, jellemzése
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben Duleba Mónika Környezettudományi Doktori Iskola I.
In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra
In vivo szövetanalízis Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra In vivo képalkotó rendszerek Célja Noninvazív módon Biológiai folyamatokat képes rögzíteni Élő egyedekben
SZENT ISTVÁN EGYETEM MIKOFENOLSAV MIKROBIOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA, A TERMELŐ MIKROORGANIZMUS JELLEMZÉSE. Doktori értekezés tézisei.
SZENT ISTVÁN EGYETEM MIKOFENOLSAV MIKROBIOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA, A TERMELŐ MIKROORGANIZMUS JELLEMZÉSE Doktori értekezés tézisei Kónya Attila Gödöllő 2001 SZENT ISTVÁN EGYETEM MIKOFENOLSAV MIKROBIOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA,