A Szegedi Biológiai Központban a 2009/2010-es tanévre meghirdetett szakdolgozati témák A lista elérhetı az interneten: http://www.szbk.hu/oktatas, vagy http://www.brc.hu/pub/edu Farmakogenomikai kutatások Puskás László (Funkcionális Genomika Csoport) Fehérjeanalízis tömegspektrometriával Hunyadi-Gulyás Éva és Darula Zsuzsanna (Proteomika Csoport) Géncsaládok bioinformatikai megközelítéssel történı jellemzése Hegedős Zoltán (Bioinformatikai Csoport) Mintázatfelismerés biológiai makromolekulákban Hegedős Zoltán (Bioinformatikai Csoport) Hidrogenázok specificitását és funkcióit befolyásoló molekuláris biológiai vizsgálatok Hidrogenáz enzimek és mutáns hidrogenázok biokémiai jellemzése Thiocapsa roseopersicina genom analízise Redox metalloenzimek proteomikai vizsgálata, Medzihradszky Katalin (Proteomika Csoport ) Hidrogenázok transzkripciós regulációja Hidrogenázok érési folyamatának molekuláris jellemzése Molekuláris biológia termofil mikroorganizmusokkal A bioremediáció biotechnológiája Perei Katalin és Kovács Kornél (Biofizikai Intézet és SzTE Biotechnológiai Tanszék) Szubsztituált aromás vegyületek biológiai lebontásának molekuláris biológiai jellemzése Rákhely Gábor, Perei Katalin és Kovács Kornél (Biofizikai Intézet és SzTE Biotechnológiai Tanszék) Biogáz fermentáció intenzifikálása termofil körülmények között Perei Katalin és Kovács Kornél (Biofizikai Intézet és SzTE Biotechnológiai Tanszék) Bioaktív peptidek molekuladinamikai jellemzése
Kinetikai mérések autokatalitikus enzimeken Bagyinka Csaba (Biofizikai Intézet) Konformációs változások fémtartalmú fehérjékben Bagyinka Csaba (Biofizikai Intézet) Lipid-fehérje kölcsönhatások tanulmányozása modell és biológiai membránokban Fourier transzformációs infravörös spektroszkópiával. Szalontai Balázs (Biofizikai Intézet) A vakuólum membrán proton-atpáza - egy protont pumpáló molekuláris motor biofizikája A fehérjehajtogatódás vizsgálata fizikai- és molekula-modellezéssel Fehérjék biomembránokban való gombolyodásának és szervezıdésének spektroszkópiai vizsgálata Membránfehérjék molekulamechanikai modellezése Az emberi szervezetbe jutó szabadgyökök meghatározása Kombinált spektroszkópiai módszerek kifejlesztése biomembránok molekuláris szinten való tanulmányozásához Membránfizikai spektroszkópiai adatok szimulációja és analízise Femtoszekundomos kinetikai vizsgálatok makromolekulákon Groma Géza (Biofizikai Intézet) Egyrészecske manipuláció lézercsipesszel Ormos Pál (Biofizikai Intézet) Fényvezérelt mikrofluidikai eszközök a biológiában Kelemen Lóránd (Biofizikai Intézet) Integrált optikai eszközök a biológiában: biológiai detektorok, fehérjékkel mőködı optoelektronikai eszközök Valkai Sándor, Dér András (Biofizikai Intézet) Élı sejtek atomerımikroszkópos vizsgálata Váró György (Biofizikai Intézet) Oligonukleotidok önszervezıdésének vizsgálata atomerımikroszkóppal Váró György (Biofizikai Intézet) Hordozott membránok vizsgálata atomerımikroszkóppal Szegletes Zsolt (Biofizikai Intézet) 2
Citokróm c érése: molekuláris biológiai és biofizikai vizsgálatok Zimányi László (Biofizikai Intézet) A citokróm b561 fehérjék tisztítása és jellemzése Bérczi Alajos (Biofizikai Intézet) A nemi hormonok szerepe az idegrendszeri plaszticitásban (finomszerkezeti, immuncitokémiai és molekuláris biológiai vizsgálatok) Párducz Árpád (Biofizikai Intézet) Idegrendszeri állapotok, folyamatok és pszichiátriai kórképek jellemzése, diagnosztizálása videopupillometriával, és szemen történı más mérésekkel Tokaji Zsolt (Biofizikai Intezet) Pszichoaktív anyagok hatásának vizsgálata egészséges és beteg személyeken biofizikai/élettani mérésekkel Tokaji Zsolt (Biofizikai Intezet) Légzési betegségek (asztma, COPD) biofizikája Tokaji Zsolt (Biofizikai Intezet) Intercelluláris kapcsolatok szerepe az idegrendszer fiziológiás és patológiás mőködésében Krizbai István (Biofizikai Intézet) A vér-agy gát mőködésének molekuláris alapjai Krizbai István (Biofizikai Intézet) A vér-agy gát permeabilitásának és transzportfolyamatainak vizsgálata fiziológiás és pathológiás körülmények között Deli Mária ésveszelka Szilvia (Biofizikai Intézet) Gyógyszerek bejuttatása a központi idegrendszerbe a vér-agy gáton át új transzportrendszerek segítségével Deli Mária (Biofizikai Intézet) és Sipos Péter (SZTE Gyógyszertechnológiai Intézet) Intranazális gyógyszerbejuttatás modellezése sejttenyészettel Deli Mária (Biofizikai Intézet) A mitokondriális károsodás strukturális tanulmányozása a motoneuron betegség modelljében. Glia sejtes reakciók és a motoneuronális károsodás. A mozgató idegsejtek kalcium háztartásának mikroszkópos jellemzése kalcium csatorna blokkolóval történ? kezelés után a motoneruon betegség modelljében. A vér-agy gát sérülésének ultrastrukturális jellemzése a motoneuron betegség transzgenikus modelljében. 3
Az immun/inflammatorikus reakció regionális különbségeinek vizsgálata agyban és gerincvel?ben a motoneurons betegség transzgenikus modelljében. Az ideg-izom szinapszis sérüléseinek ultrastrukturális (elektronmikroszkópos) jellemzése a motoneuron betegség transzgenikus modelljében. Stresszindukált génexpresszió vizsgálata cianobaktériumokban Kós Péter és Vass Imre (Növénybiológiai Intézet) Bakteriális genomi szekvenciák összehasonlító vizsgálata Kós Péter és Vass Imre (Növénybiológiai Intézet) Ultraibolya sugárzás által indukált fotoszintézis- és DNS károsítás cianobaktériumokban Vass Imre és Kós Péter (Növénybiológiai Intézet) Fotoszintetikus elektron transzport vizsgálata genetikailag módosított cianobaktériumokban Vass Imre és Deák Zsuzsanna (Növénybiológiai Intézet) Digitális növényi képek elemzése Vass Imre és Sass László (Növénybiológiai Intézet) Cianobakteriális bioszenzorok kifejlesztése és alkalmazása nehézfémek és más abiotikus környezeti stressztényezõk kimutatására Vass Imre és Kós Péter (Növénybiológiai Intézet) Fotoszintetikus fényhasznosítást csökkentı oxidatív stresszhatások növényekben Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Gazdasági haszonnövények stressztőrı képességének összehasonlító vizsgálata Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Reaktív oxigénszármazékok közvetlen kimutatása növényekben Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Fotoszintézis vizsgálatok klorofill fluoreszcencia képalkotó (imaging) eljárással Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Mekkora rend van a sejtekben? Anizotrop biológiai szerkezetek keresése és leképezése lézersugárpásztázó mikroszkópban Steinbach Gábor és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Cd-toxicitás cianobaktériumok fotoszintézise, Cd-kötı fehérjék keresése és analízise Kovács László, Kis Mihály és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Tilakoid membránok szupramolekuláris szervezıdése. Kovács László és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Miért vannak nem lamelláris lipidek biológiai membránokban? Lipid-hiányos mutánsok tilakoid membránjai szerkezet és funkció Kovács László, Gombos Zoltán és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) 4
Helyettesíthetı-e a vízbontó komplex? A második fotokémiai rendszer alternatív elektrondonorai Tóth Szilvia Zita és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Anionos lipidek (PG és SGDG) szerepe fotoszintetikus prokarióták sejtfunkcióiban (fotoszintézis, fehérjeaggregáció, sejtosztódás). Gombos Zoltán (Növénybiológiai Intézet) Karotenoidok résztvétele a fotoszintetikus folyamatokban és a reakciócentrumok fehérjéinek összeszerelésében. Gombos Zoltán (Növénybiológiai Intézet) Modus vivendi: a hosszútávú szárazság-adaptáció molekuláris alapjai gabonafélékben Györgyey János (Növénybiológiai Intézet) A szervhatárokat meghatározó LOB-domén transzkripciós faktorok szerepe a növényi sejtciklus és a szervfejlıdés összehangolásában Györgyey János (Növénybiológiai Intézet) A szálkaperje (Brachypodium distachion), a gabonafélék új molekuláris genetikai modellnövénye Györgyey János (Növénybiológiai Intézet) Célzott génexpresszió-gátlás antiszenz oligonukleotidok és sirns alkalmazása révén növényi szervezetekben Bottka Sándor (Növénybiológiai Intézet) Új szintetikus módosításokat tartalmazó oligonukleotidok elıállítása és alkalmazási lehetıségeik kiterjesztése Bottka Sándor (Növénybiológiai Intézet) Reaktív karbonil vegyületek hatása a Calvin-ciklus enzimeire Horváth V. Gábor (Növénybiológiai Intézet) A növényi retinoblasztóma-homológ fehérjék funkciói a sejtosztódás és differenciálódás szabályozásában Horváth V. Gábor (Növénybiológiai Intézet) A reaktív karbonil vegyületek és a környezeti stresszhatások kapcsolata növényekben Horváth V. Gábor (Növénybiológiai Intézet) A rugalmas növényi egyedfejlıdést szabályozó molekuláris jelátviteli hálózatok vizsgálata Fehér Attila (Növénybiológiai Intézet) A Rho GTPáz-mediált jelátvitel növényspecifikus vonásai Fehér Attila (Növénybiológiai Intézet) A rózsa biotechnológiája: legyen rózsa tövis nélkül! Fehér Attila (Növénybiológiai Intézet) Cirkadian óra elemek azonosítása és jellemzése Arabidopsisban Kozma-Bognár László, Nagy Ferenc (Növénybiológiai Intézet) Fitokróm fotoreceptoroktól kiinduló jelátviteli lánc vizsgálata Ádám Éva, Nagy Ferenc (Növénybiológiai Intézet) 5
A cirkadián óra fényszabályozásának molekuláris szintő vizsgálata Arabidopsisban Kozma-Bognár László, Nagy Ferenc (Növénybiológiai Intézet) Az abszcizinsav (ABA) jelátvitelben szerepet játszó Arabidopsis gének analízise Szabados László (Növénybiológiai Intézet) A környezeti stresszhez való alkalmazkodást elısegítı növényi gének jellemzése Szabados László (Növénybiológiai Intézet) A molekuláris biodiverzitás szerepe az extrém környezeti viszonyokhoz történö alkalmazkodásban. Szabados László (Növénybiológiai Intézet) A prolin bioszintézis szabályozása és a szárazságtőrés. Szabados László (Növénybiológiai Intézet) Stressz elleni védekezés a membrán szemszögébıl: Mire képes egy "mikroemlıs" modell (Schizosaccharomyces pombe)? Glatz Attila (Biokémiai Intézet) Látástól vakulásig - hogyan lehetne megelızni a retina degenerációját? Duda Ernı (Biokémiai Intézet) Gyulladás és fájdalom Vizler Csaba (Biokémiai Intézet) Összefüggés a matrilin-2 szerkezete és mőködése között Deák Ferenc (Biokémiai Intézet) Matrilinok és más ECM marker gének szerepének vizsgálata váz- és szívizom differenciálódása és mőködése során Deák Ferenc (Biokémiai Intézet) Matrilinok és más ECM marker gének szerepének vizsgálata tumorképzıdésben Deák Ferenc (Biokémiai Intézet) Matrilinok szövetspecifikus génregulációjában szerepet játszó molekuláris mechanizmusok tanulmányozása modern módszerekkel Kiss Ibolya (Biokémiai Intézet) Porcspecifikus vektorok készítése és gyulladásgátló gyógyszerek tesztelésére alkalmas transzgenikus állatmodell létrehozása. Kiss Ibolya (Biokémiai Intézet) Génexpresszió vizsgálata differenciálódási modellrendszerekben és izomregeneráció során Kiss Ibolya (Biokémiai Intézet) Biológiai membránok nanoszervezıdésének vizsgálata ultraszenzitív fluoreszcencia mikroszkópiával. Török Zsolt (Biokémiai Intézet) Opioid (morfin) receptorok funkcionális biokémiai vizsgálata Borsodi Anna és Benyhe Sándor (Biokémiai Intézet) Endogén opioid és antiopiát peptidek: a heterogenitás molekuláris alapjai Benyhe Sándor és Borsodi Anna (Biokémiai Intézet) 6
Gly5-endomorphinok és Dmt-analógjaik szintézise és biokémiai jellemzése. Tóth Géza és Keresztes Attila (Biokémiai Intézet) Neurodegeneráció modellezése transzgénikus egerekben Sántha Miklós (Biokémiai Intézet) Szív- és érrendszeri elváltozások modellezése transzgenikus egerekben Sántha Miklós (Biokémiai Intézet) A p53 tumorszupresszor mőködésének vizsgálata genetikai és molekuláris módszerekkel Boros Imre (Biokémiai Intézet és Genetikai és Mol. Biol Tanszék) Kromatinszerkezetet módosító transzkripció-szabályozó fehérjekomplexek szerkezet- és mőködésvizsgálata Boros Imre (Biokémiai Intézet és Genetikai és Mol. Biol Tanszék) Az ép telomer kialakulásához és fenntartásához nélkülözhetetlen gén analízise Drosophilában genetikai és molekuláris módszerekkel Boros Imre (Biokémiai Intézet) A nukleoszóma szerkezet módosulásának szerepe onkogének aktivációjában és a drog-rezisztencia kialakulásában Boros Imre (Biokémiai Intézet) Ubiquitin-függı fehérjelebontásban szerepet játszó gének genetikai és molekuláris biológiai vizsgálata Deák Péter (Biokémiai Intézet) Késıi mitotikus eseményeket szabályozó gének azonosítása és genetikai jellemzése Deák Péter (Biokémiai Intézet) Mikrobiális genomika: tervszerő genomevolúció megvalósítása szintetikus biológiai módszerekkel. Pósfai György (Biokémiai Intézet) Az Escherichia coli baktérium új tulajdonságokkal való felruházása molekuláris biológiai, metagenomikai és mikrofluidikai technikák ötvözésével Fehér Tamás (Biokémiai Intézet) Génkölcsönhatások rendszerbiológiája Papp Balázs (Biokémia Intézet) Bakteriális genomok egyszerősödésének evolúciója Pál Csaba (Biokémiai Intézet) Restrikciós endonukleázok és DNS-metiltranszferázok szekvenciaspecifikus DNS-felismerése Kiss Antal (Biokémiai Intézet) Irányított DNS-metiláció Kiss Antal (Biokémiai Intézet) Kvantitatív szerkezet-aktivitási módszer fejlesztése flexibilis gyógyszermolekulákra Ötvös Ferenc (Biokémiai Intézet) 7
Statisztikai modellel szőrhetı, általánosított molekuláris ujjlenyomat rendszeren alapuló kemo-bioinformatikai adatbázis fejlesztése gyógyszertervezéshez. Ötvös Ferenc (Biokémiai Intézet) Fehérjék specifikus módosítása kémiai biológiai módszerekkel Tömböly Csaba (Biokémiai Intézet) Bioortogonális kémiai reakciók kutatása Tömböly Csaba (Biokémiai Intézet) Rövid bioaktív peptidek oldatbeli szerkezetének számítógépes modellezése Borics Attila (Biokémiai Intézet) A vérsejtképzés és a veleszületett immunitás vizsgálata Drosophila modellszervezetben Andó István (Genetikai Intézet) Vérsejtantigének azonosítása és molekuláris jellemzése Drosophilában Andó István (Genetikai Intézet) A galektin-1 gyulladáscsökkentı hatásának mechanizmusa, avagy T sejt válasz szabályozása apoptózissal Monostori Éva (Genetikai Intézet) Egy immunreguláló emberi lektin intracelluláris funkciója, molekuláris kölcsönhatások Monostori Éva (Genetikai Intézet) A galektin-1 struktúra-funkció vizsgálata rekombináns mutáns fehérjékkel Monostori Éva (Genetikai Intézet) A galektin-1 szerepe a tumorfejlıdésben és metasztázisban: analízis in vivo és in vitro modellrendszerekben Monostori Éva (Genetikai Intézet) A Drosophila embrio háti zárodásában résztvevı gének azonosítása és vizsgálata Jankovics Ferenc (Genetikai Intézet) Bal-jobb aszimmetria modellezése Drosophilában Ádám Géza (Genetikai Intézet) Ivarsejtkialakulás genetikája Drosophilában Erdélyi Miklós (Genetikai Intézet) A szöveti polaritás vizsgálata Drosophilában: a frizzled, JNK és Notch szignál-transzdukciós utak molekuláris genetikai vizsgálata Mihály József (Genetikai Intézet) Aktin-polimerizáció és idegsejt nyúlványok növesztése a muslica központi idegrendszerében Mihály József (Genetikai Intézet) Egy Drosophila formin szerepe a hím genitális lemezek rotációjában Mihály József (Genetikai Intézet) 8
Magasabbrendő kromatinszerkezeti elemek in situ analízise Drosophilaban Sipos László (Genetikai Intézet) A Polycomb regulált elemek (PRE) párosodás-függı inaktivációjának vizsgálata Drosophilában Bajusz Izabella (Genetikai Intézet) A dsfmbt : egy epigenetikus regulátor szerepe a Drosophilában hemocyták differenciálódásában. Bajusz Izabella (Genetikai Intézet) Polycomb regulált elemek (PRE) és Trithorax regulált elemek (TRE) térképezése az iab7 ciszregulátor régióban Drosophilában. Bajusz Izabella (Genetikai Intézet) A lozenge gén szerepe a Drosophila vérsejtek sorsának determinációjában. Bajusz Izabella (Genetikai Intézet) Genetikai térképezés Medicago növényeken Endre Gabriella (Genetikai Intézet) Szimbiotikus gének kifejezıdésének vizsgálata: riportergének és növénytranszformáció Endre Gabriella (Genetikai Intézet) Génexpressziós vizsgálatok lucernában DNS-chip technikával Endre Gabriella, Kiss Ernı (Genetikai Intézet) Bakteriális toxin-antitoxin modulok szerepe a stressztőrésben és a baktérium-növény kölcsönhatásban Dusha Ilona ( Genetikai Intézet) Transzdukálható humán karboxilészteráz enzim elıállítása és alkalmazása daganatterápiás modellkísérletekben Katona Róbert ( Genetikai Intézet) A humán akrocentrikus kromoszómák rövid karja Cserpán Imre ( Genetikai Intézet) A megacinogénia molekuláris mechanizmusának vizsgálata Bacillus megateriumban Alföldi Lajos (Genetikai Intézet), Kiss Antal és Balikó Gabriella (Biokémiai Intézet) A karcinogenezis és mutagenezis szabályozásában szerepet játszó emberi gének molekuláris analízise (Haracska Lajos, Genetikai Intézet) Új élesztı- (Saccharomyces cerevisiae) és humán DNS-reparációs gének azonosítása és jellemzése (Haracska Lajos, Genetikai Intézet) Irányított génmanipulációt befolyásoló genetikai faktorok térképezése emberi sejtekben (Haracska Lajos, Genetikai Intézet Posztreplikációs DNS-javítás Unk Ildikó (Genetikai Intézet) 9
A mutagenezis szabályozása élesztıben Unk Ildikó (Genetikai Intézet) Szeged, 2009. szeptember 29. Kiss Antal TDK felelıs MTA SZBK Biokémiai Intézet 10