Modell és biológiai membránok Fourier transzformációs infravörös és elektronspin-rezonancia spektroszkópiai vizsgálata

Hasonló dokumentumok
K68464 OTKA pályázat szakmai zárójelentés

Szerkezet és funkció kapcsolata a membránműködésben. Folyadékkristályok típusai (1) Dr. Voszka István

MedInProt Szinergia IV. program. Szerkezetvizsgáló módszer a rendezetlen fehérjék szerkezetének és kölcsönhatásainak jellemzésére

ERD14: egy funkcionálisan rendezetlen dehidrin fehérje szerkezeti és funkcionális jellemzése

A zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban

ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.

Szerkezet és funkció kapcsolata a membránműködésben. Folyadékkristályok típusai (1) Dr. Voszka István

A felvétel és a leadás közötti átalakító folyamatok összességét intermedier - köztes anyagcserének nevezzük.

Oktatói önéletrajz Dr. Droppa Magdolna

Oktatói önéletrajz Dr. Droppa Magdolna

Szójabab és búza csírázási folyamatainak összehasonlítása NIR spektrumok segítségével

New York, március 12. Dr. Sugár István. Kritikai észrevételek

Fotoszintézis. fotoszintetikus pigmentek Fényszakasz - gránum/sztrómalamella. Sötétszakasz - sztróma

A fotoszintézis molekuláris biofizikája (Vass Imre, 2000) 39

FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

A citoszolikus NADH mitokondriumba jutása

Biológiai membránok és membrántranszport

Műszeres analitika. Abrankó László. Molekulaspektroszkópia. Kémiai élelmiszervizsgálati módszerek csoportosítása

Részletes zárójelentés a. Fehérjék membránba ágyazódásának, szerveződésének és lipidekkel való kölcsönhatásának biofizikája

Mágneses módszerek a műszeres analitikában

1. Előadás Membránok felépítése, mebrán raftok

Kötések kialakítása - oktett elmélet

Elektronegativitás. Elektronegativitás

Elméleti és kísérletes módszerek lipidek és membránfehérjék tanulmányozására

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

Modern Fizika Labor. 12. Infravörös spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: okt. 04. A mérés száma és címe: Értékelés:

Elméleti módszerek lipidek és membránfehérjék tanulmányozására

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Modern Fizika Labor. A mérés száma és címe: A mérés dátuma: Értékelés: Infravörös spektroszkópia. A beadás dátuma: A mérést végezte:

Az eukarióta sejt energiaátalakító organellumai

Hogyan bírhatjuk szóra a molekulákat, avagy mi is az a spektroszkópia?

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

SSL0.5 (HSPC:Chol:DSPE-PEG=3:1:0.5) SSL1 (HSPC:Chol:DSPE-PEG=3:1:1) SSL2 (HSPC:Chol:DSPE-PEG=3:1:2) 2.50

Folyadékkristályok; biológiai és mesterséges membránok

Mágneses módszerek a mőszeres analitikában

térrészek elválasztása transzport jelátvitel Milyen a membrán szerkezete? Milyen a membrán szerkezete? lipid kettısréteg, hidrofil/hidrofób részek

Víz. Az élő anyag szerkezeti egységei. A vízmolekula szerkezete. Olyan mindennapi, hogy fel sem tűnik, milyen különleges

A fotoszintézis molekuláris biofizikája (Vass Imre, 2000) 43. $ R[LJpQWHUPHO IRWRV]LQWHWLNX ]HUYH]HWHNEH p IRWRNpPLD UHQGV]H

Lipidek és karotinoidok szerepe a cianobakteriális fotoszintetikus makrokomplexek kialakulásában

Az infravörös spektroszkópia analitikai alkalmazása

Szegedi Biológiai Kutatóközpont Tudományos Diákkör. Dr. Kiss Antal. kiss.antal(at)brc.mta.hu.

Véletlen gráfok. Backhausz Ágnes Eötvös Loránd Tudományegyetem és MTA Rényi Alfréd Matematikai Kutatóintézet december 2.

2. Ismert térszerkezetű transzmembrán fehérjék adatbázisa: a PDBTM adatbázis. 3. A transzmembrán fehérje topológiai adatbázis, a TOPDB szerver

KÖLCSÖNHATÁS ÉS DINAMIKA. az NMR spektroszkópia, mint a modern szem. Bodor Andrea

Az NMR spektroszkópia a fehérjék szolgálatában. Bodor Andrea. ELTE Szerkezeti Kémia és Biológia Laboratórium Visegrád

Részletes zárójelentés az F67735 számú fiatal kutatói OTKA pályázathoz (Alfa-hélix és béta-hordó fehérjék membránba ágyazódása)

Biomolekuláris kölcsönhatások vizsgálata felületi plazmonrezonancia elvén működő Biacore keszülékkel

A sejtes szervezıdés elemei (sejtalkotók / sejtorganellumok)

MÉRÉSTECHNIKAI ÉS KEMOMETRIAI MÓDSZEREK

Biomolekuláris szerkezeti dinamika

Modern Fizika Labor. 11. Spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: dec. 16. A mérés száma és címe: Értékelés: A beadás dátuma: dec. 21.

Fehérjék nanomechanikai tulajdonságainak vizsgálata Atomi Er Mikroszkópiával NEMES CSILLA

Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése

Fotoszintézis. 2. A kloroplasztisz felépítése 1. A fotoszintézis lényege és jelentısége

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Farmakológus szakasszisztens Farmakológus szakasszisztens 2/34

Biomolekuláris nanotechnológia. Vonderviszt Ferenc PE MÜKKI Bio-Nanorendszerek Laboratórium

Egy antifungális diszulfid fehérje szerkezeti dinamikája és hideg/meleg kitekeredése (avagy PAF, a hűvös sárkány)

Hibrid mágneses szerkezetek

Mi mindenről tanúskodik a Me-OH néhány NMR spektruma

Koherens lézerspektroszkópia adalékolt optikai egykristályokban

Dér András MTA SZBK Biofizikai Intézet

A Ca 2+ szerepe a tormaperoxidáz enzim aktív szerkezetében. Szigeti Krisztián

OH ionok LiNbO 3 kristályban (HPC felhasználás) 1/16

FOTOSZINTETIKUSAN AKTÍV SUGÁRZÁS GLOBÁLSUGÁRZÁS

Antibakteriális hatóanyagot tartalmazó kapszulák előállítása, jellemzése és textilipari alkalmazása. Nagy Edit Témavezető: Dr.

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek

Modern Fizika Labor. Fizika BSc. Értékelés: A mérés dátuma: A mérés száma és címe: 12. mérés: Infravörös spektroszkópia május 6.

Transzporterek vizsgálata lipidmembránokban Sarkadi Balázs MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport, MTA-TTK Budapest

Ph.D. értekezés tézisei. Dürgő Hajnalka. Témavezető: Dr. Medzihradszky-Fölkl Katalin. Biológia Doktori Iskola. MTA SZBK Biokémiai Intézet SZTE TTIK

BIOFIZIKA. Metodika- 4. Liliom Károly. MTA TTK Enzimológiai Intézet

A LIPID-FEHÉRJE KÖLCSÖNHATÁSOK ÉS A

Polimerek alkalmazástechnikája BMEGEPTAGA4

Hidrogénezett amorf Si és Ge rétegek hőkezelés okozta szerkezeti változásai

A felépítő és lebontó folyamatok. Biológiai alapismeretek

Magmágneses rezonancia (NMR) és elektronspinrezonancia (ESR) alapjai

Evolúcióelmélet és az evolúció mechanizmusai

Röntgendiffrakció, tömegspektrometria, infravörös spektrometria.

sejt működés jovo.notebook March 13, 2018

A MITOKONDRIÁLIS CITOKRÓM C POSZTTRANSZLÁCIÓS ÉRÉSE. Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei. Tenger Katalin

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI A LIPIDEK 1. kulcsszó cím: A lipidek szerepe az emberi szervezetben

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

TRANSZPORTEREK Szakács Gergely

AZ AEROSZOL RÉSZECSKÉK HIGROSZKÓPOS TULAJDONSÁGA. Imre Kornélia Kémiai és Környezettudományi Doktori Iskola

Dóczy-Bodnár Andrea október 3. Magmágneses rezonancia (NMR) és elektronspinrezonancia (ESR) alapjai

~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:

2010. január 31-én zárult OTKA pályázat zárójelentése: K62441 Dr. Mihály György

Folyadékkristályok: szépek és hasznosak

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Sohár Pál Varázslat, amitől láthatóvá válnak és életre kelnek a molekulák: Az NMR spektroszkópia

Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére.

Membrántranszport. Gyógyszerész előadás Dr. Barkó Szilvia

Földminőség, fenntartható és környezetbarát gazdálkodás

Fehérjék nyomás által indukált szerkezetváltozásainak jellemzése infravörös és fluoreszcencia spektroszkópiai módszerekkel

Az élő sejt fizikai Biológiája:

Válasz. A kérdésekre, kritikai megjegyzésekre az alábbiakban válaszolok:

I./ A. A MAGÁTVITELI FERTŐZÉS HATÁSA AZ ETIOLÁLT ÁRPA MAGONCOK ZÖLDÜLÉSI FOLYMATAIRA

Átírás:

PhD értekezés tézisei Modell és biológiai membránok Fourier transzformációs infravörös és elektronspin-rezonancia spektroszkópiai vizsgálata Kóta Zoltán MTA Szegedi Biológiai Központ Biofizikai Intézet Szeged 2003

Bevezetés A biológiai membránoknak központi szerepük van a sejtek szerkezetének és funkciójának biztosításában, ezért nem meglep, hogy számos tudományág kezdve a biofizikától a molekuláris biológiáig jelent s kutatási területét képezik. A biológiai membránok többkomponens dinamikus rendszerek, melyek számos sejtfolyamat szabályozásában vesznek részt. F komponenseik a lipidek és a fehérjék. A lipidek els dleges szerepe a szerkezet biztosítása, míg a m ködésért els sorban a fehérjék felel sek. A lipid fehérje kölcsönhatásoknak ugyancsak fontos szerepe van mind a szerkezet, mind a m ködés vonatkozásában. A Földön egyik legnagyobb mennyiségben el forduló természetes membrán a tilakoid membrán, mely a fotoszintézis folyamatában a fény fizikai energiáját kémiai energiává, és így szerves vegyületekké képes alakítani. Ha egy növényt sötétben nevelünk, a proplasztisz etioplasztisszá alakul át, mely szerkezetében és összetételében is különbözik a kifejlett kloroplasztisztól. Fény hatására az etioplasztiszból kloroplasztisz lesz. Ezen átalakulás során klorofill molekulák és számos polipeptid szintézise, illetve a plasztisz szerkezetének nagymérték átrendez dése következik be (zöldülés). A specifikus fehérjék és pigmentek mellett a tilakoid membránok lipidösszetétele is meghatározó. A monogalaktozil-diacilglicerolról (MGDG) és még néhány más lipidr l kimutatták, hogy er s és specifikus lipid fehérje kölcsönhatásokban vesznek részt. Számos közlemény olvasható a foszfatidilglicerol (PG) mely a teljes lipidtartalomnak 5 12% -a tilakoid membránok szervez désében és m ködésében betöltött fontosságáról is. Például, számos magasabbrend növényben összefüggést találtak a fagyérzékenység és a telített, illetve egyszeresen telítetlen ( magas olvadáspontú -nak is nevezett) PG molekulák mennyisége között. A biológiai membránok jelent ségének megfelel en, nagyszámú tanulmány foglalkozik a szerkezet és dinamika, illetve a lipid fehérje kölcsönhatások vizsgálatával, melyhez különféle fizikai módszerek széles skálája áll rendelkezésre. Bár ilyen vizsgálatok révén már eddig is sok értékes eredmény látott napvilágot, számos részlet még felfedezésre vár. 2

Célkit zések Az értekezést képez munka során két egymást kiegészít spektroszkópiai módszert, a Fourier transzformációs infravörös (FTIR) és az elektronspin-rezonancia (ESR) spektroszkópiát alkalmaztuk különböz modell és tilakoid membránok szerkezetének és dinamikájának, illetve a lipid fehérje kölcsönhatások tanulmányozására. Célul t ztük ki a következ ket: 1. A spektroszkópiai technikák hatékonyságának növelése: a lipidek CH 2 vegyértékrezgéseinek, illetve a TEMPO spinjelz ESR spektrumának továbbfejlesztett analízisével, az egymást kiegészít spektroszkópiai adatok kombinálásával, 2. a tilakoid membrán szerkezeti átrendez désének részletesebb megismerése a zöldülés során, és 3. a PG szerkezeti szerepének tanulmányozása különböz fagyérzékenység, genetikailag módosított dohány tilakoidokban. Kísérleti módszerek A lipid acilláncok konformációjának és a fehérjék szerkezetének és dinamikájának tanulmányozására FTIR spektroszkópiát használtunk. Különböz modell (foszfatidilkolin) és tilakoid membránokat vizsgáltunk. Az infravörös spektrumokban mind a C H vegyértékrezgések tartományát, mind pedig az 1500 1750 cm -1 közötti tartományt (amid I II és lipid CO sávok) analizáltuk. Az ESR mérések során két spinjelz t (5-SASL és TEMPO) alkalmaztunk, és ezek spektrális paramétereinek analízisével nyertünk információt a membrán szerkezetére és dinamikájára vonatkozóan árpa tilakoidok esetén. A tilakoidok néhány biokémiai és funkcionális paraméterét (pl. klorofilltartalom, zsírsavösszetétel) irodalomban leírt módszerek alapján határoztuk meg. 3

Eredmények Módszertani eredmények 1. Spektrum-szimulációs és illesztési programot fejlesztettünk ki TEMPO spinjelz vel felvett ESR spektrumok analíziséhez. Az eljárással pontosan meghatározható a TEMPO molekula membránbeli relatív mennyisége, melynek segítségével a membrán pakoltságára, és a membrán fluiditására kaphatunk információt. A program alkalmas továbbá a TEMPO molekula rotációs dinamikájának tanulmányozására is. 2. Megmutattuk, hogy az FTIR spektrumok sym CH 2 sávja felbontható két komponensre, és hogy a sáv látszólagos h mérséklet-indukálta eltolódása leírható a két komponens versengésével. Az egyik komponenst a lipidek szénhidrogén láncainak rendezett, a másikat a rendezetlen szegmenseivel hoztuk kapcsolatba. A módszert sikeresen alkalmaztuk komplex biológiai membránok esetén is. Biológiai alkalmazások Zöldülés árpa tilakoidok 3. Sikeresen alkalmaztunk egy keresztkivonásos módszert az 5-SASL spinjelz vel felvett ESR spektrumokon. Eredményképpen hozzájutottunk egy immobilis és egy mobilis komponens spektrumhoz, melyek segítségével meg tudtuk határozni a fehérjékkel kölcsönhatásban lév lipidek relatív mennyiségét árpa tilakoidokban. 4. Adataink alapján nyilvánvalóvá vált, hogy egyre er söd csatolás alakul ki a zöldül membrán f lipid és fehérje komponensei között. A zsírsavösszetétel és az újonnan szintetizálódott fehérjék stabilitása összehangoltan változik: a többszörösen telítetlen lipidek felszaporodása megfelel környezetet biztosít a nagyobb stabilitással rendelkez, fotoszintetikusan aktív fehérjekomplexek kialakulásához. 5. Követtük a dönt en LHCII-vel kapcsolatos fehérjekomplexek képz dését. Megállapítottuk, hogy a fehérjék átlagos oligomer mérete kb. hétszeresére növekszik a zöldülés során. 6. A zöldülés molekuláris történéseinek sorozatát egy háromfázisú modellel írtuk le. A klorofill felhalmozódással összhangban a zöldülés egy kiindulási fázissal kezd dik, melyet a legnagyobb változásokat magába foglaló átrendez dési fázis követ. A funkcionális membrán az érési fázisban alakul ki teljesen. 4

7. Kimutattuk, hogy a fehérjekomplexek részleges h denaturációja a lipideknek egy jelent s szerkezeti átrendez dését kezdeményezi a tilakoid membránban. Ez valószín leg összefüggésben van az MGDG lipid molekulák kett sréteg inverz hexagonális fázisátmenetével. Genetikailag módosított dohány tilakoidok 8. A sym CH 2 sáv kétkomponenses analízisét felhasználva, a PG molekulák szerkezeti szerepét, illetve a PG telítetlenségének szerepét vizsgáltuk genetikailag módosított dohány növényekben. FTIR adataink alapján megállapítottuk, hogy a PG kapcsolatban van a membránfehérjékkel, biztosítja a fehérjék m ködéséhez szükséges lipidkörnyezet megfelel dinamikáját, de nem felel s a fehérjék szerkezeti stabilitásának fenntartásáért. Kimutattuk, hogy a PG-nek van szerkezeti szerepe, amit eddig biokémiai módszerekkel nem tudtak detektálni. Ez magyarázatot ad a vad típusú és genetikailag módosított dohány növények között megfigyelt fiziológiás különbségekre. Tudományos közlemények Az értekezés anyagát képez közlemények I. Droppa, M., Kóta, Z., Páli, T., Szalontai, B., Horváth, L. I., and Horváth, G. Structural functional organization of thylakoids in developing chloroplasts In The Chloroplasts: From Molecular Biology to Biotechnology, eds. Argyroudi-Akoyunoglou, J. H., Senger, H. (Kluwer Academic Publishers), pp. 55 60., 1999 II. Kóta, Z., Szalontai, B., Droppa, M., Horváth, G., and Páli, T. Fourier transform infrared and electron paramagnetic resonance spectroscopic studies of thylakoid membranes J. Mol. Struct. 480 481, 395 400, 1999 III. Kóta, Z., Debreczeny, M., Szalontai, B. Separable contributions of ordered and disordered lipid fatty acyl chain segments to CH 2 bands in model and biological membranes: A Fourier transform infrared spectroscopic study Biospectroscopy 5, 169 178, 1999 IV. Kóta, Z., Szalontai, B., Droppa, M., Horváth, G., and Páli, T. The formation of an inverted hexagonal phase from thylakoid membranes upon heating Cell. Mol. Biol. Lett. 7, 126 128, 2002 V. Kóta, Z., Horváth, L. I., Droppa, M., Horváth, G., Farkas, T., and Páli, T. Protein assembly and heat stability in developing thylakoid membranes during greening Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 12149 12154, 2002 VI. Szalontai, B., Kóta, Z., Nonaka, H., and Murata, N. Structural consequences of genetically engineered saturation of the fatty acids of phosphatidylglycerol in tobacco thylakoid membranes. An FTIR study Biochemistry 42, 4292 4299, 2003 5

Egyéb közlemények I. Kóta, Z., Páli, T., and Marsh, D. Orientation and lipid peptide interactions of gramicidin A in lipid membranes: polarised ATR infrared spectroscopy and spin-label electron spin resonance Biophys. J., In press II. Csányi, L. J., Jáky, K., Dombi, Gy., Evanics, F., Dezs, G., and Kóta, Z. Onium-decavanadate ion-pair complexes as catalysts in the oxidation of hydrocarbons by O 2 J. Mol. Cat. A 195, 101 111, 2003 III. Csányi, L. J., Jáky, K., Kóta, Z., and Páli, T. Oxidation of hydrocarbons by O 2 in the presence of onium salts and onium ion-pair complexes as catalysts J. Mol. Cat. A, In press IV. Páli, T., Garab, G., Horváth, L. I., and Kóta, Z. Functional significance of the lipid protein interface in photosynthetic membranes Cell. Mol. Life Sci. 60, 1591 1606, 2003 6