ALLOSZTÉRIKUSAN SZABÁLYOZÓ METABOLITOK HATÁSA A PIRUVÁT-KINÁZ L és M IZOENZIMRE

Hasonló dokumentumok
A glükóz reszintézise.

Glikolízis. emberi szervezet napi glukózigénye: kb. 160 g

Glikolízis. Csala Miklós

A piruvát-dehidrogenáz komplex. Csala Miklós

Szénhidrátok monoszacharidok formájában szívódnak fel a vékonybélből.

SZABVÁNYMŰVELETI ELŐÍRÁS. A tejsavdehidrogenáz enzim izoenzimeinek vizsgálata című gyakorlat előkészítése

SZABVÁNYMŰVELETI ELŐÍRÁS

Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció

Készült:

A szénhidrátok anyagcseréje. SZTE AOK Biokémiai Intézet Gyógyszerész hallgatók számára 2014.

Növényélettani Gyakorlatok A légzés vizsgálata

A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.

ZSÍRSAVAK OXIDÁCIÓJA. FRANZ KNOOP német biokémikus írta le először a mechanizmusát. R C ~S KoA. a, R-COOH + ATP + KoA R C ~S KoA + AMP + PP i

Készült: Módosítva: július

Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak

TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL

09. A citromsav ciklus

5. Laboratóriumi gyakorlat

Zsírsav szintézis. Az acetil-coa aktivációja: Acetil-CoA + CO + ATP = Malonil-CoA + ADP + P. 2 i

Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

A metabolizmus energetikája

BIOKÉMIA GYAKORLÓ TESZT 1. DEMO (FEHÉRJÉK, ENZIMEK, TERMODINAMIKA, SZÉNHIDRÁTOK, LIPIDEK)

[S] v' [I] [1] Kompetitív gátlás

Enzimaktivitás szabályozása

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA A SZÉNHIDRÁTOK ANYAGCSERÉJE 1. kulcsszó cím: A szénhidrátok anyagcseréje

MINTAJEGYZŐKÖNYV A VÉRALVADÁS VIZSGÁLATA BIOKÉMIA GYAKORLATHOZ

1.1. Reakciósebességet befolyásoló tényezők, a tioszulfát bomlása

SZABVÁNYMŰVELETI ELŐÍRÁS

A légzési lánc és az oxidatív foszforiláció

Energiaforrásaink Szénvegyületek forrása

ENZIMSZINTŰ SZABÁLYOZÁS

SZÉRUM KOLESZTERIN ÉS TRIGLICERID MEGHATÁROZÁS

, mitokondriumban (peroxiszóma) citoplazmában

Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015

A KOLESZTERIN SZERKEZETE. (koleszterin v. koleszterol)

Természetvédő 1., 3. csoport tervezett időbeosztás

Az Etanol Metabolizmusa és az Alkoholos Májkárosodás Biokémiája

LIPID ANYAGCSERE (2011)

Mária. A pirimidin-nukleotidok. nukleotidok anyagcseréje

A felépítő és lebontó folyamatok. Biológiai alapismeretek

Szignalizáció - jelátvitel

Országos Középiskolai Tanulmányi Verseny 2009/2010. Kémia I. kategória II. forduló A feladatok megoldása

Receptorok és szignalizációs mechanizmusok

Integráció. Csala Miklós. Semmelweis Egyetem Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet

GLUCAGONUM HUMANUM. Humán glükagon

Az edzés és energiaforgalom. Rácz Katalin

A citoszolikus NADH mitokondriumba jutása

Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet. Mitokondrium. Fésüs László, Sarang Zsolt

A kálium-permanganát és az oxálsav közötti reakció vizsgálata

Az oxidatív foszforiláció és az elektrontranszportlánc egyes sajátságait a mitokondrium-szuszpenzió oxigénfogyasztásának mérésével vizsgáljuk.

ÖSSZ-TARTALOM. 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi kommunikáció 3.

ÖSSZ-TARTALOM 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás

Az egyensúly. Általános Kémia: Az egyensúly Slide 1 of 27

1. feladat Összesen: 10 pont. 2. feladat Összesen: 11 pont

Jelutak ÖSSZ TARTALOM. Jelutak. 1. a sejtkommunikáció alapjai

Általános Kémia GY, 2. tantermi gyakorlat

1. Egy ismeretlen só azonosítása (az anion és kation meghatározása).

5. Az adszorpciós folyamat mennyiségi leírása a Langmuir-izoterma segítségével

BIOTRANSZFORMÁCIÓS ENZIMEK VIZSGÁLATA BIOTRANSZFORMÁCIÓS ENZIMEK VIZSGÁLATA

Víztechnológiai mérőgyakorlat 2. Klórferőtlenítés törésponti görbe felvétele. Jegyzőkönyv

Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus. Az energiaközvetítő molekula: ATP

Az sejt gépei az enzimek. Az enzimek ezt az aktivációs energiagátat csökkentik.

2. A jelutak komponensei. 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék

jobb a sejtszintű acs!!

A biokémiai folyamatokat enzimek (biokatalizátorok) viszik véghez. Minden enzim. tartalmaz fehérjét. Két csoportjukat különböztetjük meg az enzimeknek

Modern Fizika Labor. 11. Spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: dec. 16. A mérés száma és címe: Értékelés: A beadás dátuma: dec. 21.

Vizes oldatok ph-jának mérése

OXIGÉNIGÉNY ÉS LEVEG ZTETÉS

O k t a t á si Hivatal

Országos Középiskolai Tanulmányi Verseny 2010/2011. tanév Kémia I. kategória 2. forduló Megoldások

VEBI BIOMÉRÖKI MŰVELETEK

VEBI BIOMÉRÖKI MŰVELETEK KÖVETELMÉNYEK. Pécs Miklós: Vebi Biomérnöki műveletek. 1. előadás: Bevezetés és enzimkinetika

Fehérjék. SZTE ÁOK Biokémiai Intézet

ENZIMKINETIKAI PARAMÉTEREK KÍSÉRLETI MEGHATÁROZÁSA

Kémiai átalakulások. A kémiai reakciók körülményei. A rendszer energiaviszonyai

6 Ionszelektív elektródok. elektródokat kiterjedten alkalmazzák a klinikai gyakorlatban: az automata analizátorokban

A biokémia alapjai. Typotex Kiadó. Wunderlich Lívius Szarka András

Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

CENTRIFUGA KATALÓGUS és CYTOSET ISmERTETô

Jelutak. 2. A jelutak komponensei Egy tipikus jelösvény sémája. 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék

6. változat. 3. Jelöld meg a nem molekuláris szerkezetű anyagot! A SO 2 ; Б C 6 H 12 O 6 ; В NaBr; Г CO 2.

1. feladat. Versenyző rajtszáma:

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

Dózis-válasz görbe A dózis válasz kapcsolat ábrázolása a legáltalánosabb módja annak, hogy bemutassunk eredményeket a tudományban vagy a klinikai

ENZIMKINETIKAI PARAMÉTEREK KÍSÉRLETI MEGHATÁROZÁSA

Minta feladatsor. Az ion neve. Az ion képlete O 4. Szulfátion O 3. Alumíniumion S 2 CHH 3 COO. Króm(III)ion

Célkitűzés: Célunk az ALP expressziója, tisztítása, katalitikus aktivitásának mérése és szerkezetének meghatározása.

Reakciókinetika és katalízis

A gyakorlat leírása. A mérési feladat

BIOKÉMIA GYAKORLATI JEGYZET

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA AZ AMINOSAVAK ANYAGCSERÉJE 1. kulcsszó cím: Az aminosavak szerepe a szervezetben

1. feladat Összesen: 15 pont. 2. feladat Összesen: 10 pont

1. feladat Összesen: 7 pont. 2. feladat Összesen: 16 pont

TRANSZPORTFOLYAMATOK A SEJTEKBEN

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

Biológus Bsc. Sejtélettan II. Szekréció és felszívódás a gasztrointesztinális tractusban. Tóth István Balázs DE OEC Élettani Intézet

ENZIM MODULÁCIÓ BIM SB 2001

TEJSAVAS (LAKTÁT) ACIDÓZIS Csala Miklós

Spontaneitás, entrópia

Átírás:

ALLOSZTÉRIKUSAN SZABÁLYOZÓ METABOLITOK HATÁSA A PIRUVÁT-KINÁZ L és M IZOENZIMRE A glukóz piruváttá (illetve laktáttá) történő átalakulása során (glikolízis), illetve a glukóz reszintézisben (glukoneogenezis) a részfolyamatok többsége reverzibilis. E reakciók iránya és sebessége a mindenkori szubsztrátok és termékek koncentrációitól függ. A glukóz lebontás illetve szintézis nettó irányát három irreverzibilis reakció szabja meg, és csak ezen átalakulások enzimjei különböznek a glikolízisben és glukoneogenezisben. Ez nyújt lehetőséget a folyamatok sebességének igen finom - az adott szerv feladatainak, valamint az egyedi sejt igényeinek megfelelő - szabályozására. A sejtekben regulációs mechanizmusok zárják ki, hogy a glukóz szintézise és lebomlása egyidejűleg folyjék. Az irreverzibilis lépések enzimjeinek aktivitása rövid és hosszú távú szabályozó mechanizmusok ellenőrzése alatt áll. A rövidtávú szabályozás az egyes enzimek hormon-mediált, camp- és/vagy Ca 2+ -függő foszforilációján, illetve defoszforilációján (prompt, külső igények megjelenítése kovalens módosítással), valamint intracellulárisan, az anyagcsere során képződő metabolitok allosztérikus hatásán alapul (pl. a sejt energiaállapotának hatására). A hosszabb távú szabályozás az egyes enzimek lebontásának, illetve szintézisének (főként az mrns szintézis sebességének) regulálásával valósul meg. A glukóz reszintézis további elkülönítését a glikolízistől a piruvátból történő foszfoenolpiruvát képződés eltérő kompartmentalizációja (mitokondrium mátrix és citoplazma) szolgálja. A piruvát kináz L, M és R típusú izoenzimjei szép példáját mutatják a szöveti funkció-függő allosztérikus szabályozásnak. A tetramer enzim (ATP:piruvát-foszfotranszferáz, EC 2.7.1.40.) molekulasúlya kb. 240 ezer. A katalizált reakció: - - COO COO piruvát-kináz 2- C O PO 3 + Mg 2+ + ADP C O Mg 2+ CH 2 CH 3 + + ATP foszfoenol-piruvát (PEP) piruvát E folyamat sebességét az L (máj-típusú) és R (vörösvértest-típusú) piruvát kináz izoenzimeknél az allosztérikusan kötődő ligandok a szubsztrát (PEP) iránti affinitás megváltoztatásával befolyásolják (1.ábra), míg az izom-eredetű izoenzimre ("M") nem hatnak. ATP és egyes aminosavak (pl. L-alanin) a PEP-re vonatkozó K M -et növelik, a fruktóz-1,6-biszfoszfát pedig csökkenti. Az L és R izoenzimet ezenkívül a camp-függő protein kináz foszforilálhatja, és ezáltal aktivitásuk szintén csökken. 17

MÉRÉSI MÓDSZER Mivel az enzimreakció során piruvát keletkezik, ez kapcsolt enzimreakcióval laktáttá alakítható (laktátdehidrogenázzal), és ekvimoláris mennyiségű NADH oxidálódik. A NADH oxidációja 340 nm-nél fotometrálva folyamatosan is mérhető. Extinkciós koefficiense, ε 340 = 6,22 cm 2 / µmól. Szükséges anyagok, oldatok 1. Mérési médium: 0,1 M KCl, 50mM TRIS, 10mM MgCl 2 ph 7,6. A többi törzsoldatot is ezzel készítjük és ph 7,6-ra állítjuk. 2. 10 mm NADH 3. 50 mm PEP 4. 400 U/ml laktát-dehidrogenáz (LDH): az L-izoenzim vizsgálatához piruvát kináz mentes LDH preparátum szükséges! (Ez kontroll-kísérletben ellenőrizhető.) 5. 100 mm ADP 6. 100 mm ATP 7. 50 mm L-alanin vagy 100 mm D,L-alanin 8. 2,5 mm fruktóz-1,6-biszfoszfát (FDP) 9. piruvát kináz-m (izom-típusú izoenzim): általában elég magas aktivitással tartalmazza a tisztítatlan, izomeredetű LDH (pl. Reanal-gyártmány), ez esetben külön piruvát kinázt a reakcióhoz nem kell adni. 10. piruvát kináz-l (máj-típusú izoenzim) A fenti enzim patkány májából preparálható. Használható a májból négyszeres térfogat "mérési médium"-mal készített posztmitokondriális felülúszó (10 000 x g, 20perc centrifugálás után a felülúszót 10 mm 2-merkaptoetanollal és 0,2 mm FDP-tal egészítjük ki és 0 o C-on ammóniumszulfáttal 33-45% telítés között frakcionáljuk. (33%-os telítés: minden 100 ml kivonathoz 50 ml 0 o C-on telített ammónium-szulfátot adunk, 30 percig jégben kevertetjük, majd a csapadékot centrifugálással eltávolítjuk. A felülúszó térfogatát feljegyezzük. 45%-os telítés: 7,5 g elporított ammónium-szulfátot szórunk lassan minden 100 ml felülúszóhoz, kevertetjük 30 percig (jégben hűtve), centrifugálás (J21, 16000 RPM) után a csapadékot szuszpendáljuk fel minimális térfogat 1,8 M ammónium-szulfát, 10 mm 2-merkaptoetanol, 0,2 mm FDP, 50mM TRIS-HCl, ph 7,6 oldatában). Az enzim 2-3 hétig stabil, ha ilyen körülmények között, 2-4 o C-on tároljuk. Az aktivitás méréséhez úgy kell a mérési médiummal meghígítani, hogy 20 µl-e NADH, PEP, LDH és ADP hozzáadása után kb. 0,05 Ext/perc sebességgel fogyasszon NADH-t (l. mérés). A preparátum előre elkészítve rendelkezésre áll. Eszközök 1. Fotométer 2. Rekorder (fotométer analóg kivezetéséhez kötve) 3. L-alakra meghajlított keverő botocska (30 µl folyadék elférjen rajta) 4. Mikropipetta (20-200 µl között mérjen) 18

A kísérlet kivitelezése 1. Az ATP és FDP szabályozó hatásának vizsgálata A törzsoldatokat és a kihígított enzimeket a mérési médium kivételével jégben tartjuk. Pipettázzuk a küvettába a reagenseket szobahőmérsékleten az alábbi sorrendben ("vak"=mérési médium): Médium: 0,82 ml PEP: 20 µl NADH: 20 µl Keverjük meg a küvetta tartalmát. Állítsuk a rekorder kijelzőjét kb. 90% állásba. Indítsuk el a rekordert 1 cm/perc sebességgel. Az anyagok hozzáadása során nem kell a rekordert leállítani. További hozzáadások: LDH: 20 µl PK-L: 20 µl (a kanálka fel-lefelé mozgatásával elkeverjük). Felvesszük kb. 2 percig az alapvonalat. A továbbiakban a reagenseket a kanálka tövéhez pipettázzuk és amikor szükséges, a fotométer fedelét felemelve gyors mozdulattal a küvettába juttatjuk; 2-3-szor fel-le mozgatva a kanálkát a küvetta tartalmát megkeverjük, a kanálkát kiemeljük és a küvettateret lecsukjuk. Start: (1): ADP: 20 µl Gyorsan elkeverjük. 2 percig mérjük a változást. (2): ATP: 20 µl Gyors keverés, további 2 percig mérés. (3): FDP: 20 µl Gyors keverés, mérés, amíg el nem fogy a NADH. Írjuk fel a műszerek beállítására (méréshatárára) vonatkozó adatokat. 2. Az L-alanin és FDP szabályozó hatása A mérést az előzőekben leírt módon kezdjük, és a start (1) utánig (ADP-adás) minden ugyanaz. A (2) lépésben azonban ATP helyett 20 µl alanint adunk. 3 perc után további 80 µl alanint adunk, és a reakciósebességet 3 percig mérjük. Végezetül 20 µl FDP-vel aktiválhatjuk az enzimet. Ismételjük meg a fenti reakciókat PK-M jelenlétében (PK-L helyett). A rekorderen kapott görbéket csatoljuk a jegyzőkönyvhöz. 19

Az eredmények értékelése Az enzimreakció sebessége, v (µmól képződött ATP/perc/ml enzimoldat = µmól NADH oxidáció/perc/ml enzim) a percenkénti extinkcióváltozásból: E V perc v = 6,22 0,22 ahol V a reakcióelegy térfogata (ml) az adott Ext/perc sebességet előidéző reagens hozzáadása után. A sebességek összehasonlítására az ADP-hozzáadás utáni értéket vehetjük 1,0-nek, és az allosztérikus effektorok jelenlétében mért sebességeket ehhez viszonyíthatjuk : "f", lásd Táblázat. Reakció sebesség PK-L PK-M Reagens Ext/perc µmól/p/ml f Ext/perc µmól/p/ml f ADP 1,0 1,0 ATP FDP Ala Következtetések és problémák 1. Keresse meg az 1. ábrán azt a foszfoenol-piruvát koncentrációt, melyet Ön a kísérlet során használt, és hasonlítsa össze eredményeit az ábrán látottakkal. Alátámasztják-e eredményei a piruvát-kináz izoenzimeknek a bevezetésben ismertetett allosztérikus sajátságait? Kapott-e különbséget az L és M izoenzim viselkedésében ATP, alanin és FDP jelenlétében? A kísérlet esetleges sikertelensége esetén hol követhetett el hibát? 2. Gondolja végig, milyen tényezők szabályozhatják a máj piruvát-kináz aktivitását, szénhidrátgazdagtáplálkozást követően. Milyen fiziológiai következményekkel jár az ilyen táplálkozás? Milyen fiziológiai jelentősége lehet a májban a piruvát kináz aminosavak által okozott gátlásának? 3. Az FDP stabilizálja a máj-izoenzimet. Milyen okra tudja ezt a jelenséget visszavezetni? 20

1. ábra: Piruvát kináz L izoenzim aktivitásának szubsztrát-koncentráció függése telítési ADPkoncentrációnál. Középső görbe: effektor nélkül, felső görbe: aktivátor, alsó görbe: inhibitor jelenlétében. 21