A Szegedi Biológiai Központban a 2007/2008-es tanévre meghirdetett szakdolgozati témák A lista elérhetı az interneten: http://www.szbk.hu/oktatas, Farmakogenomikai kutatások Puskás László (Funkcionális Genomika Csoport) Fehérjeanalízis tömegspektrometriával Medzihradszky Katalin (Proteomika Csoport) Géncsaládok bioinformatikai megközelítéssel történı jellemzése Hegedős Zoltán (Bioinformatikai Csoport) Mintázatfelismerés biológiai makromolekulákban Hegedős Zoltán (Bioinformatikai Csoport) Hidrogenázok specificitását és funkcióit befolyásoló molekuláris biológiai vizsgálatok Hidrogenáz enzimek és mutáns hidrogenázok biokémiai jellemzése Thiocapsa roseopersicina genom analízise Redox metalloenzimek proteomikai vizsgálata, Medzihradszky Katalin (Proteomika Csoport ) Hidrogenázok transzkripciós regulációja Hidrogenázok érési folyamatának molekuláris jellemzése Molekuláris biológia termofil mikroorganizmusokkal A bioremediáció biotechnológiája Perei Katalin és Kovács Kornél (Biofizikai Intézet és SzTE Biotechnológiai Tanszék) Szubsztituált aromás vegyületek biológiai lebontásának molekuláris biológiai jellemzése Rákhely Gábor, Perei Katalin és Kovács Kornél (Biofizikai Intézet és SzTE Biotechnológiai Tanszék) Biogáz fermentáció intenzifikálása termofil körülmények között Perei Katalin és Kovács Kornél (Biofizikai Intézet és SzTE Biotechnológiai Tanszék) Bioaktív peptidek molekuladinamikai jellemzése Kinetikai mérések autokatalitikus enzimeken Bagyinka Csaba (Biofizikai Intézet)
Konformációs változások fémtartalmú fehérjékben Bagyinka Csaba (Biofizikai Intézet) Membrándinamika tanulmányozása Fourier transzformációs infravörös spektroszkópiával Szalontai Balázs (Biofizikai Intézet) A vakuólum membrán proton-atpáza - egy protont pumpáló molekuláris motor biofizikája A fehérjehajtogatódás vizsgálata fizikai- és molekula-modellezéssel Fehérjék biomembránokban való gombolyodásának és szervezıdésének spektroszkópiai vizsgálata Membránfehérjék molekulamechanikai modellezése Az emberi szervezetbe jutó szabadgyökök meghatározása Kombinált spektroszkópiai módszerek kifejlesztése biomembránok molekuláris szinten való tanulmányozásához Membránfizikai spektroszkópiai adatok szimulációja és analízise Femtoszekundomos kinetikai vizsgálatok makromolekulákon Groma Géza (Biofizikai Intézet) Egyrészecske manipuláció lézercsipesszel Ormos Pál (Biofizikai Intézet) Fényvezérelt mikrofluidikai eszközök a biológiában Kelemen Lóránd (Biofizikai Intézet) Integrált optikai eszközök a biológiában: biológiai detektorok, fehérjékkel mőködı optoelektronikai eszközök Valkai Sándor, Dér András (Biofizikai Intézet) Élı sejtek atomerımikroszkópos vizsgálata Váró György (Biofizikai Intézet) Oligonukleotidok önszervezıdésének vizsgálata atomerımikroszkóppal Váró György (Biofizikai Intézet) A nemi hormonok szerepe az idegrendszeri plaszticitásban (finomszerkezeti, immuncitokémiai és molekuláris biológiai vizsgálatok) Párducz Árpád (Biofizikai Intézet) Idegrendszeri állapotok, folyamatok és pszichiátriai kórképek jellemzése, diagnosztizálása videopupillometriával, és szemen történı más mérésekkel 2
Tokaji Zsolt (Biofizikai Intezet) Pszichoaktív anyagok hatásának vizsgálata egészséges és beteg személyeken biofizikai/élettani mérésekkel Tokaji Zsolt (Biofizikai Intezet) Légzési betegségek (asztma, COPD) biofizikája Tokaji Zsolt (Biofizikai Intezet) Intercelluláris kapcsolatok szerepe az idegrendszer fiziológiás és patológiás mőködésében Krizbai István (Biofizikai Intézet) A vér-agy gát mőködésének molekuláris alapjai Krizbai István (Biofizikai Intézet) A vér-agy gát permeabilitásának és transzportfolyamatainak vizsgálata fiziológiás és pathológiás körülmények között Deli Mária (Biofizikai Intézet) Gyógyszerek bejuttatása a központi idegrendszerbe a vér-agy gáton át új transzportrendszerek segítségével Deli Mária (Biofizikai Intézet) Akut sérülést követı gyulladásos reakciók immunhisztokémiai vizsgálata gerincvelıben. Különbözı agytörzsi motoros magok motoneuronális axotómiát követı lokális gyulladásos reakciójának vizsgálata. Különbözı agytörzsi motoros magok mozgató idegsejtjeinek elektronmikroszkópos jellemzése és a kalcium háztartásuk vizsgálata axotómia után. Neuronális sérülés és gyulladásos reakció mikroszkópos vizsgálata a Huntington betegség transzgenikus modelljében. Az immun/inflammatorikus reakció regionális különbségeinek vizsgálata agyban és gerincvelıben a motoneurons betegség transzgenikus modelljében. Az ideg-izom szinapszis sérüléseinek ultrastrukturális (elektronmikroszkópos) jellemzése a motoneuron betegség transzgenikus modelljében. Stresszindukált génexpresszió vizsgálata cianobaktériumokban Kós Péter és Vass Imre (Növénybiológiai Intézet) Bakteriális genomi szekvenciák összehasonlító vizsgálata Kós Péter és Vass Imre (Növénybiológiai Intézet) Ultraibolya sugárzás által indukált fotoszintézis- és DNS károsítás cianobaktériumokban 3
Vass Imre, Kós Péter és Nagy László (Növénybiológiai Intézet, SZTE Biofizikai Tanszék) Fotoszintetikus elektron transzport vizsgálata genetikailag módosított cianobaktériumokban Vass Imre és Deák Zsuzsanna (Növénybiológiai Intézet) Digitális növényi képek elemzése Vass Imre és Sass László (Növénybiológiai Intézet) Fotoszintetikus fényhasznosítást csökkentı oxidatív stresszhatások növényekben Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Gazdasági haszonnövények stressz-tőrı képességének összehasonlító vizsgálata Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Reaktív oxigénszármazékok közvetlen kimutatása Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Fotoszintézis vizsgálatok klorofill fluoreszcencia képalkotó (imaging) vizsgálatok alapján Hideg Éva (Növénybiológiai Intézet) Mekkora rend van a sejtekben? Anizotrop biológiai szerkezetek keresése és leképezése lézersugárpásztázó mikroszkópban Steinbach Gábor és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Cd-toxicitás cianobaktériumok fotoszintézise, Cd-kötı fehérjék keresése és analízise Kovács László, Kis Mihály és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Miért vannak nem lamelláris lipidek biológiai membránokban? Lipid-hiányos mutánsok tilakoid membránjai szerkezet és funkció Kovács László, Gombos Zoltán és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Helyettesíthetı-e a vízbontó komplex? A második fotokémiai rendszer alternatív elektrondonorai Tóth Szilvia Zita és Garab Gyızı (Növénybiológiai Intézet) Lipidek szerepe membrán-fehérje struktúrák kialakításában és a hozzájuk kapcsolódó fotoszintetikus funkciók vizsgálata Gombos Zoltán, Kis Mihály (Növénybiológiai Intézet) A lipid-karotinoid kölcsönhatás szerepe az alacsony hımérséklet és a magas fényintenzitás okozta stressz elleni védekezésben Kis Mihály (Növénybiológiai intézet) A foszfatidil-glicerol membránalkotó lipid szerepe a cianobaktériumok sejtosztódásában Gombos Zoltán, Kis Mihály (Növénybiológiai intézet) A növényi sejtosztódási ciklus szabályozása Dudits Dénes, Györgyey János, Horváth V. Gábor (Növénybiológiai Intézet) Modus vivendi: a hosszútávú szárazság-adaptáció molekuláris alapjai gabonafélékben Györgyey János (Növénybiológiai Intézet) A szervhatárokat meghatározó LOB-domén transzkripciós faktorok szerepe a növényi sejtciklus és a szervfejlıdés összehangolásában Györgyey János (Növénybiológiai Intézet) 4
A szálkaperje (Brachypodium distachion), a gabonafélék új molekuláris genetikai modellnövénye Györgyey János (Növénybiológiai Intézet) Célzott génexpresszió-gátlás antiszenz oligonukleotidok és sirns alkalmazása révén növényi szervezetekben Bottka Sándor (Növénybiológiai Intézet) Új szintetikus módosításokat tartalmazó oligonukleotidok elıállítása és alkalmazási lehetıségeik kiterjesztése Bottka Sándor (Növénybiológiai Intézet) Aldo/keto reduktázok szerepe a növényi stresszválaszban Horváth V. Gábor (Növénybiológiai Intézet) A növényi retinoblasztóma-homológ fehérjék funkciói a sejtosztódás és differenciálódás szabályozásában Horváth V. Gábor (Növénybiológiai Intézet) A reaktív karbonil vegyületek és a környezeti stresszhatások kapcsolata növényekben Horváth V. Gábor (Növénybiológiai Intézet) A növényi egyedfejlıdés rugalmasságának molekuláris és sejtbiológiai vizsgálata Fehér Attila, Ötvös Krisztina (Növénybiológiai Intézet) Kinázok és GTPázok: egy új jelátviteli kapcsolat a növényi sejtek morfológiájának és életfolyamatainak szabályozásában Fehér Attila (Növénybiológiai Intézet) Legyen rózsa tövis nélkül: a rózsa biotechnológiája Fehér Attila (Növénybiológiai Intézet) Cirkadian óra elemek azonosítása és jellemzése Arabidopsisban Kozma-Bognár László, Nagy Ferenc (Növénybiológiai Intézet) Fitokróm fotoreceptoroktól kiinduló jelátviteli lánc vizsgálata Ádám Éva, Nagy Ferenc (Növénybiológiai Intézet) A cirkadián óra fényszabályozásának molekuláris szintő vizsgálata Arabidopsisban Kozma-Bognár László, Nagy Ferenc (Növénybiológiai Intézet) Egy, az abszcizinsav (ABA) jelátvitelben szerepet játszó Arabidopsis gén analízise Szabados László (Növénybiológiai Intézet) A környezeti stresszhez való alkalmazkodást elısegítı növényi gének jellemzése Szabados László (Növénybiológiai Intézet) Molekuláris biodiverzitás szerepe a növények környezeti stresszhez való alkalmazkodása során Szabados László (Növénybiológiai Intézet) Stressz elleni védekezés a membrán szemszögébıl: Mire képes egy "mikroemlıs" modell (Schizosaccharomyces pombe)? Glatz Attila (Biokémiai Intézet) 5
Membrán mikrodomén-lokalizált receptorfehérjek vizsgálata Duda Ernı (Biokémiai Intézet) Tumorsejtek immunrendszerre gyakorolt hatásának gátlása Duda Ernı (Biokémiai Intézet) Gyulladás és fájdalom Vizler Csaba (Biokémiai Intézet) Az intracelluláris fehérjebontás mechanizmusa és szabályozása Udvardy Andor (Biokémiai Intézet) Összefüggés a matrilin-2 szerkezete és mőködése között Deák Ferenc (Biokémiai Intézet) A sejtközötti állomány egyes fehérjéit kódoló gének molekuláris klónozása és kifejezıdésének vizsgálata Deák Ferenc (Biokémiai Intézet) A porcsejtek differenciálódása és génmőködésük változása egészséges és kóros körülmények között Deák Ferenc (Biokémiai Intézet) A gerincesek szövetspecifikus génregulációjában szerepet játszó molekuláris mechanizmusok tanulmányozása modern módszerekkel Kiss Ibolya, Kénesi Erzsébet (Biokémiai Intézet) Porcspecifikus vektorok készítése és gyulladásgátló gyógyszerek tesztelésére alkalmas transzgenikus állatmodell létrehozása. Extracelluláris mátrix fehérje gének funkciójának vizsgálata transzgénikus egerekben. Kiss Ibolya (Biokémiai Intézet) Génexpresszió vizsgálata differenciálódási modellrendszerekben és izomregeneráció során Kiss Ibolya (Biokémiai Intézet) G protein-kapcsolt receptorok szerkezete és mőködése Szőcs Mária (Biokémiai Intézet) A drog addikció molekuláris mechanizmusai Szőcs Mária (Biokémiai Intézet) Opioid (morfin) receptorok funkcionális biokémiai vizsgálata Borsodi Anna és Benyhe Sándor (Biokémiai Intézet) Endogén opioid és antiopiát peptidek: a heterogenitás molekuláris alapjai Benyhe Sándor és Borsodi Anna (Biokémiai Intézet) Neurodegeneráció modellezése transzgénikus egerekben Sántha Miklós (Biokémiai Intézet) A p53 tumorszupresszor mőködésének vizsgálata genetikai és molekuláris módszerekkel Boros Imre (Biokémiai Intézet és Genetikai és Mol. Biol Tanszék) 6
Kromatinszerkezetet módosító transzkripció-szabályozó fehérjekomplexek szerkezet- és mőködésvizsgálata Boros Imre (Biokémiai Intézet és Genetikai és Mol. Biol Tanszék) Az ép telomer kialakulásához és fenntartásához nélkülözhetetlen gén analízise Drosophilában genetikai és molekuláris módszerekkel Boros Imre (Biokémiai Intézet) A nukleoszóma szerkezet módosulásának szerepe onkogének aktivációjában és a drog-rezisztencia kialakulásában Boros Imre (Biokémiai Intézet) Ubiquitin-függı fehérjelebontásban szerepet játszó gének genetikai és molekuláris biológiai vizsgálata Deák Péter (Biokémiai Intézet) Késıi mitotikus eseményeket szabályozó gének azonosítása és genetikai jellemzése Deák Péter (Biokémiai Intézet) Mikrobiális genomika: tervszerő genomevolúció megvalósítása szintetikus biológiai módszerekkel. Pósfai György (Biokémiai Intézet) Minimálgenomok vizsgálata számítógépes rendszerbiológiai eszközökkel Papp Balázs (Biokémia Intézet) Restrikciós endonukleázok és DNS-metiltranszferázok szekvenciaspecifikus DNS-felismerése Kiss Antal (Biokémiai Intézet) Kvantitatív szerkezet-aktivitási módszer fejlesztése flexibilis gyógyszermolekulákra Ötvös Ferenc (Biokémiai Intézet) Fehérjék specifikus módosítása kémiai biológiai módszerekkel Tömböly Csaba (Biokémiai Intézet) Fiziológiás körülmények között alkalmazható kemoszelektív reakciók Tömböly Csaba (Biokémiai Intézet) Rövid bioaktív peptidek oldatbeli szerkezetének számítógépes modellezése Borics Attila (Biokémiai Intézet) A vérsejtképzés és a veleszületett immunitás vizsgálata Drosophila modellszervezetben Andó István (Genetikai Intézet) Vérsejtantigének azonosítása és molekuláris jellemzése Drosophilában Andó István (Genetikai Intézet) A galektin-1 gyulladáscsökkentı hatásának mechanizmusa, avagy T sejt válasz szabályozása apoptózissal Monostori Éva (Genetikai Intézet) Egy immunreguláló emberi lektin intracelluláris funkciója, molekuláris kölcsönhatások Monostori Éva (Genetikai Intézet) A galektin-1 struktúra-funkció vizsgálata rekombináns mutáns fehérjékkel 7
Monostori Éva (Genetikai Intézet) Egy Drosophila mikrorns gén vizsgálata Vilmos Péter (Genetikai Intézet) Az ivarsejtek kialakításában szerepet játszó gének azonosítása Drosophilában Jankovics Ferenc (Genetikai Intézet) Foszfatáz regulátor gének azonosítása és genetikai jellemzése Drosophilában Ádám Géza, Gausz János (Genetikai Intézet) Drosophila kalpain gének szerepe a sejtadhézióban Ádám Géza, Gausz János (Genetikai Intézet) Bal-jobb aszimmetria modellezése Drosophilában Ádám Géza (Genetikai Intézet) Ivarsejtkialakulás genetikája Drosophilában Erdélyi Miklós (Genetikai Intézet) A szöveti polaritás vizsgálata Drosophilában: a frizzled, JNK és Notch szignál-transzdukciós utak molekuláris genetikai vizsgálata Mihály József (Genetikai Intézet) Aktin-polimerizáció és idegsejt nyúlványok növesztése a muslica központi idegrendszerében Mihály József (Genetikai Intézet) Egy Drosophila formin szerepe a hím genitális lemezek rotációjában Mihály József (Genetikai Intézet) Magasabbrendő kromatinszerkezeti elemek in situ analízise Drosophilaban Sípos László (Genetikai Intézet) Távoli promóter-enhanszer kapcsolat tanulmányozása ecetmuslicában Sípos László (Genetikai Intézet) Helyspecifikus mutagenezis-módszerek fejlesztése muslicában Sípos László (Genetikai Intézet) A Polycomb regulált elemek (PRE) párosodás-függı inaktivációjának vizsgálata Drosophilában Bajusz Izabella (Genetikai Intézet) A SET-domént tartalmazó hiszton-metiltranszferázok szerepének vizsgálata az epigenetikus génaktivitás regulációjában Bajusz Izabella (Genetikai Intézet) A dsfmbt : egy epigenetikus regulátor szerepe a haemocyta differenciálódásban Bajusz Izabella (Genetikai Intézet) Genetikai térképezés Medicago növényeken Endre Gabriella (Genetikai Intézet) 8
Szimbiotikus gének kifejezıdésének vizsgálata: riportergének és növénytranszformáció Endre Gabriella (Genetikai Intézet) Génexpressziós vizsgálatok lucernában DNS-chip technikával Endre Gabriella, Kiss Ernı (Genetikai Intézet) Egy toxin-antitoxin rendszer funkciójának vizsgálata Dusha Ilona (Genetikai Intézet) A chaperoninok szerepe a szimbiózis kialakulásában Dusha Ilona ( Genetikai Intézet) A human 15-ös kromoszóma rövid karja Cserpán Imre ( Genetikai Intézet) A megacinogénia molekuláris mechanizmusának vizsgálata Bacillus megateriumban Alföldi Lajos (Genetikai Intézet), Kiss Antal és Balikó Gabriella (Biokémiai Intézet) A mutagenezis és karcinogenezis szabályozásában szerepet játszó humán gének molekuláris analízise (Haracska Lajos, Genetikai Intézet) Új élesztı- (Saccharomyces cerevisiae) és humán DNS reparációs gének azonosítása és jellemzése (Haracska Lajos, Genetikai Intézet) Posztreplikációs DNS-javítás Unk Ildikó (Genetikai Intézet) A mutagenezis szabályozása élesztıben Unk Ildikó (Genetikai Intézet) Szeged, 2007. október 1. Kiss Antal TDK felelıs MTA SZBK Biokémiai Intézet 9