Molekuláris genetikai módszerek alkalmazása madárfajok esetében (irodalmi áttekintés)

Hasonló dokumentumok
A parlagi sas genetikai változatossága

A MAGYAR TÖRTÉNELMI TÁRSULAT KIADVÁNYAI

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú ni us 25., szerda. 93. szám. Ára: 2400, Ft

75. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú ni us 15., péntek TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 2478, Ft. Oldal

MESEBÁL 3.A hõs kisegér Huszti Zoltán

Bu da pest, au gusz tus 25. Ára: 1386 Ft 10. szám TARTALOMJEGYZÉK

Animal welfare, etológia és tartástechnológia

II. rész JOGSZABÁLYOK. A Kormány rendeletei. A Kormány 219/2004. (VII. 21.) Korm. rendelete M A G Y A R K Ö Z L Ö N Y 2004/102.

33. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, már ci us 27., hétfõ TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 3887, Ft

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA

Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics Április 8 Május 22 8th April 22nd May

79. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú ni us 14., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1472, Ft. Oldal

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, már ci us 17., hétfõ. 44. szám. Ára: 250, Ft

148. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, de cem ber 5., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1701, Ft. Oldal

KÖRNYEZETVÉDELMI ÉS VÍZÜGYI ÉRTESÍTÕ

38. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, áp ri lis 5., szerda TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1311, Ft. Oldal

LVII. ÉVFOLYAM 2. SZÁM ÁRA: 874 Ft ja nu ár 27.

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

GONDOLATOK AZ ISKOLASZÖVETKEZETEK JOGI SZABÁLYOZÁSÁRÓL

LIX. ÉVFOLYAM ÁRA: 1365 Ft 4. SZÁM TARTALOM MAGYARORSZÁG ALAPTÖRVÉNYE. Ma gyar or szág Alap tör vé nye (2011. áp ri lis 25.)...

TARTALOM. III. ÉVFOLYAM, 12. SZÁM Ára: 820 Ft JÚNIUS 8. oldal oldal

TARTALOMJEGYZÉK. Bu da pest, feb ru ár 14. Ára: 1518 Ft 3. szám évi CLXIII. tv.

147. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, no vem ber 10., csütörtök TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 2116, Ft. Oldal

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA

160. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, no vem ber 23., péntek TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 3801, Ft. Oldal

155. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, ok tó ber 31., péntek TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1110, Ft. Oldal

Bemutatkozás Dr. Lehoczky István december 4..

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA

AZ EGÉSZSÉGÜGYI MINISZTÉRIUM HIVATALOS LAPJA FELHÍVÁS!

Feltétel. Perfekt Vagyonés üzemszünet biztosítás. Érvényes: januártól

40. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, áp ri lis 7., péntek TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 207, Ft. Oldal

AZ EGÉSZSÉGÜGYI MINISZTÉRIUM HIVATALOS LAPJA

A Kormány rendeletei

Ajánlat. Gyertyaláng III. Érvényes: január 1-től

80. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú ni us 15., hétfõ TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 585, Ft

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA

III. Az Alkotmánybíróság teljes ülésének a Magyar Közlönyben közzétett végzése

12. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, február 3., péntek TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1311, Ft. Oldal

123. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, szep tem ber 21., péntek TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1155, Ft

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA

Ked ves Ta ní tók! Ked ves Szü lôk!

A SZOCIÁLIS ÉS MUNKAÜGYI MINISZTÉRIUM ÉS AZ ORSZÁGOS MUNKAVÉDELMI ÉS MUNKAÜGYI FÕFELÜGYELÕSÉG HIVATALOS LAPJA. Tartalom

2007. évi CXXIX. tör vény

PIAC- ÉS ORSZÁGTANULMÁNY

2007/9. szám TURISZTIKAI ÉRTESÍTÕ 401 AZ ÖNKORMÁNYZATI ÉS TERÜLETFEJLESZTÉSI MINISZTÉRIUM HIVATALOS ÉRTESÍTÕJE

122. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, ok tó ber 5., csütörtök TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1533, Ft. Oldal

A földmûvelésügyi és vidékfejlesztési miniszter 18/2009. (III. 6.) FVM rendelete. 2009/27. szám M A G Y A R K Ö Z L Ö N Y 5065

72. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, május 31., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 506, Ft. Oldal

166. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, de cem ber 22., csütörtök TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 2921, Ft. Oldal

A SZOCIÁLIS ÉS MUNKAÜGYI MINISZTÉRIUM ÉS AZ ORSZÁGOS MUNKAVÉDELMI ÉS MUNKAÜGYI FÕFELÜGYELÕSÉG HIVATALOS LAPJA FELHÍVÁS! Tartalom

ALAPÍTÓ OKIRAT módosítás egységes szerkezetben

6. szám. 2006/6. szám HATÁROZATOK TÁRA 51. Budapest, feb ru ár 13., hétfõ TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 414, Ft. Oldal

A MAGYAR KÖZLÖNY MELLÉKLETE T A R T A L O M

93. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú li us 6., szerda TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 667, Ft. Oldal

A földmûvelésügyi és vidékfejlesztési miniszter 61/2009. (V. 14.) FVM rendelete

84. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú ni us 30., szombat TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 399, Ft. Oldal

145. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, no vem ber 27., hétfõ TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 357, Ft. Oldal

2008. évi CVIII. tör vény. 2008/187. szám M A G Y A R K Ö Z L Ö N Y 24697

XV. ÉVFOLYAM, 6. SZÁM ÁRA: 1617 Ft június T A R T A L O M. Szám Tárgy Ol dal

XII. ÉVFOLYAM 2. SZÁM ÁRA: 598 Ft febru ár 1. TARTALOM. II. rész

136 Con Dolore. Tenor 1. Tenor 2. Bariton. Bass. Trumpet in Bb 2. Trombone. Organ. Tube bell. Percussions

A Kormány 58/2007. (III. 31.) Korm. rendelete

36. szám II. kötet A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, áp ri lis 3., hétfõ TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 4255, Ft

A környezetvédelmi és vízügyi miniszter 31/2008. (XII. 31.) KvVM rendelete

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, szep tem ber 12., péntek szám. Ára: 465, Ft

A MAGYAR KÖZLÖNY MELLÉKLETE T A R T A L O M

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA

FELHÍVÁS! Felhívjuk tisztelt Elõfizetõink figyelmét az értesítõ utolsó oldalán közzétett tájékoztatóra és a évi elõfizetési árainkra

24. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, február 28., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1127, Ft. Oldal

A SZOCIÁLIS ÉS MUNKAÜGYI MINISZTÉRIUM ÉS AZ ORSZÁGOS MUNKAVÉDELMI ÉS MUNKAÜGYI FÕFELÜGYELÕSÉG HIVATALOS LAPJA. Tartalom

150. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, no vem ber 15., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1633, Ft. Oldal

A MAGYAR KÖZLÖNY MELLÉKLETE T A R T A L O M

A SZOCIÁLIS ÉS MUNKAÜGYI MINISZTÉRIUM HIVATALOS LAPJA TARTALOM

135. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, no vem ber 6., hétfõ TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 189, Ft. Oldal

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. 2007: CXXVI. tv. Egyes adótör vények mó do sí tás áról

19. szám. II. rész JOGSZABÁLYOK. A Kormány tagjainak A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. A pénzügyminiszter 12/2005. (II. 16.

79. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú ni us 12., péntek TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1125, Ft. Oldal

Human genome project

34. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, már ci us 28., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1495, Ft. Oldal

TARTALOM. III. ÉVFOLYAM, 14. SZÁM Ára: 1700 Ft JÚLIUS 15. oldal oldal. A köz tár sa sá gi el nök 101/2011. (V. 20.) KE ha tá ro za ta

VII. Az Al kot m ny b r s g el n k nek v g z se

A földmûvelésügyi és vidékfejlesztési miniszter 86/2009. (VII. 17.) FVM rendelete

97. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú li us 12., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 506, Ft. Oldal

132. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, ok tó ber 4., csütörtök TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 966, Ft. Oldal

47. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, áp ri lis 14., szombat TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 966, Ft. Oldal

85. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, jú li us 1., vasárnap TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 210, Ft. Oldal

III. ÉVFOLYAM, 1. SZÁM Ára: 715 Ft JANUÁR 17.

Vili Nóra 1*, Horváth Márton B. 2, Kovács Szilvia 3, Jozef Chavko 4, Hornung Erzsébet 1, Kalmár Lajos 5. n ZOOLÓGIA

173. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, de cem ber 12., szerda TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 588, Ft. Oldal

TARTALOMJEGYZÉK. Bu da pest, március 30. Ára: 3310 Ft 4. szám. RENDELETEK 9/2009. (II. 27.) MNB rendelet

A LEGFÕBB ÜGYÉSZSÉG HIVATALOS LAPJA. BUDAPEST, áp ri lis 28. LIV. ÉVFOLYAM ÁRA: 575 Ft 4. SZÁM TARTALOM TÖRVÉNYEK SZEMÉLYI HÍREK UTASÍTÁSOK

115. szám 1. kö tet* A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, au gusz tus 31., péntek TARTALOMJEGYZÉK kö tet ára: 5124, Ft

A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. 2007: CXXIV. tv. A ter mõ föld rõl szó ló évi LV. tör vény mó do sí tá sá ról

(Margitszigeti sétány, 1940 körül; MNM) Copyright Márai Sándor jogutódai L. C. Gaal (Toronto)

2004. évi LXXXIV. törvény

Erzsébet-akna. Munkások a készülõ aknánál 1898-ban. A jobb alsó kép nagyított részlete. Az aknatorony egy régi képeslapon. Rajz a mûködõ aknáról

121. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, au gusz tus 19., kedd TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 250, Ft. Oldal

188. szám A MAGYAR KÖZTÁRSASÁG HIVATALOS LAPJA. Budapest, de cem ber 22., hétfõ TARTALOMJEGYZÉK. Ára: 1540, Ft. Oldal

A MAGYAR KÖZLÖNY MELLÉKLETE T A R T A L O M

Átírás:

BagiZ-KuszaSz:Layout 1 3/23/16 1:49 PM Page 1 Molekuláris genetikai módszerek alkalmazása madárfajok esetében (irodalmi áttekintés) Bagi Zoltán Kusza Szilvia Debreceni Egyetem Mezőgazdaság-, Élelmiszertudományi és Környezetgazdálkodási Kar, Állattudományi, Biotechnológiai és Természetvédelmi Intézet, Debrecen bagiz@agr.unideb.hu ÖSSZEFOGLALÁS A molekuláris genetikai módszerek alkalmazása kibővítette az ornitológiai kutatások eszköztárát. Dolgozatunkban a leggyakoribb felhasználási területeket vesszük számba. Alapvető célunk egy átfogó képet adni a madártani vizsgálatok során jelenleg leggyakrabban alkal mazott módszerek köréről, és az általuk elérhető eredményekről. Így tárgyaljuk a vizsgálatokhoz elengedhetetlen mintagyűjtési módszerek alkal maz - ha tóságát, valamint az egyedi azonosítás, ivar-meghatározás, DNS vonalkódolás módszertanát, továbbá a molekuláris módszerek szerepét a ve szélyeztetett fajok védelme során. Kitérünk az egyes módszerek előnyeire és hátrányaira, és az aktuális trendekre is. Kulcsszavak: mitokondriális DNS, genetikai diverzitás, DNS alapú fajazonosítás, hullatott tollak SUMMARY Ornithology studies have been extended by molecular genetic techniques. In this paper we are dealing with the most common use of areas. Our basic aim is to give a comprehensive view of the most commonly used methods in ornithological studies, including the available results by their use. We also deal with the following areas: an essential step during examination namely the applicability of sample collecting methods, and the unique identification, also the sex determination, methodology of DNA barcoding, as well as the role of molecular methods to protect endangered species. We discussed the advantages and disadvantages of the methods, such as the current trend for each method. Keywords: mitochondrial DNA, genomic diversity, DNA barcoding, moulted feathers BEVEZETÉS A molekuláris genetikai módszerek használata az ornitológiai kutatásokban viszonylag nagy múltra te kint vissza, azonban a módszerek fejlődésével és költsé geik csökkenésével alkalmazási körük jelentős bő vülésére lehet számítani. Ezért célszerűnek tartjuk a kü lön böző felhasználási célok és a leggyakrabban alkal mazott módszerek áttekintését. Ezen módszereknek a ta lán leggyakoribb felhasználási területe a madárfajok po puláció szintű vizsgálata. Eddig elsősorban termé szet védelmi kutatások élveztek előnyt a madarak ese té ben is, mivel a szűkös erőforrásokat a leginkább ve- szélyeztetett fajokra kell összpontosítani. Az ilyen vizsgálatok elsősorban a jelenkori genetikai struktúrákra összpontosítanak a fajok hosszú távú túlélésével kap cso latban (Wan et al. 2004). A módszerek szélesebb kö rű elterjedésével nem csak a vizsgált fajok köre bő vül het (pl. gazdasági, vadgazdálkodási, ökológiai szem- pontból jelentős fajok), hanem számos olyan tanul mányba is bevonhatóak az eredmények, melyeknek eredeti célja nem az egyedek vagy populációk genetikai jel lem zőinek feltárása, de remekül kiegészítik a más me to dika alapján gyűjtött adatokat, sokszor új meg világításba helyezve az eredményeket, ezáltal feltárva koráb ban nem ismert összefüggéseket. MINTAGYŰJTÉSI MÓDSZEREK A genetikai vizsgálatok alkalmazásának egyik első és legfontosabb kérdése a megfelelő mintavételi módszer kiválasztása. A vizsgálat célja, a vizsgált állatfaj, a rendelkezésre álló források, és eszközök közösen ha tá rozzák meg a végül alkalmazható eljárást. A minta - gyűj tési módszerek három fő csoportját Vili et al. (2007) ismerteti. A destruktív mintavételt gerinctelen szer ve ze tek vizsgálatánál alkalmazzák, ennek során a teljes egyedet felhasználják. Kevésbé drasztikus megoldást jelentenek a nem-destruktív mintavételi módszerek, mint például a vérvétel, biopszia, nyálkahártya vagy az ujjpercek lecsípése. Az ilyen eljárások során a vizsgálni kívánt állatok nagy valószínűséggel túlélnek, de jelentős stresszt kell elviselniük, ami tudományetikai és gya korlati okokból is kifogásolható. Mivel a mo le ku lá ris genetikai módszereket leggyakrabban természet védelmi és populációgenetikai vizsgálatokban alkal mazzák, nem fogadható el az egyedek ilyen mértékű zavarása, esetleges elhullása. Az ilyen kutatások ese té ben a megoldást a nem-invazív mintagyűjtési módszerek jelentik (Taberlet et al. 1999, Waits és Paetkau 2005), melyek során az állatok távollétében lehet a min tákhoz jutni, olyan, általuk hátrahagyott nyomokból, mint a szőr, pikkely, vedlett toll, nyál, ürülék, ved lett bőr vagy tojáshéj. A módszer előnyei közé tartozik, hogy viszonylag kis mennyiségű minta is elegendő genomiális DNS-t tartalmazhat, ami a vizsgálatok alap fel tétele. A kis mennyiség miatt a minták gyűjtése, tá ro lása, szállítása is könnyebb és olcsóbb. Azonban a módszer hátrányai is elsősorban a kis mintamennyi ség ből fakadnak, ugyanis olyan esetek is gyakran előfordulnak, hogy nem megfelelő a DNS minősége és/ vagy mennyisége, így a minták nagy része nem ad hasz nálható eredményt, emiatt jelentősen megnőhetnek a laborköltségek. Továbbá fennáll a minták szenynye ződésének a veszélye is (Taberlet et al. 1999, McDonald és Griffith 2011). A madarak esetében a legelterjedtebb nem-invazív mintavételi módszer a hullatott tollakon alapul. A ma dár- 37

BagiZ-KuszaSz:Layout 1 3/23/16 1:49 PM Page 2 tollból történő DNS-izolálás lehetősége viszonylag ré góta adott (Pearce et al. 1997, Taberlet et al. 1999, Eguchi 2000, Bello et al. 2001, Malagó et al. 2002). A tollak gyűjtése leg többször pihenő-, fészkelő-, etetőés itatóhelyek kö ze lében végezhető sikerrel. A módszer kezdeti alkal mazásakor a tollszár pulpáját, illetve bazális hegyét használták forrásként a DNS-kivo ná s hoz, de ennél az el járásnál a megbízható eredményhez egy egyedtől több, lehetőleg friss tollra van szük ség (Taberlet és Bouvet 1991), mivel a legfőbb problé mát a tollakban található DNS szabad környezetben történő gyors degradációja (mikrobiális tevékenység, uv sugárzás miatt) jelenti (McDonald és Griffith 2011). A DNS-izolálás hatásfokának jelentős javulása Horváth et al. (2005) módszere által volt elérhető. Ez a tollszárban található magvas vörösvérsejteket tartalmazó vérrögöt használja fel, így a kivont DNS elegen dő a mikroszatellitákon ala puló DNS-ujjlenyomat meg határozásához, illetve mitokondriális DNS-szakaszok szekvenálásához (Vili et al. 2007). Szintén a hullatott tollakon alapuló módszer hátrányai között kell megemlí teni, hogy gyakorlati tapasztalataink alapján bizonyos esetekben a tollakat hátrahagyó faj azonosítása is bizony talan lehet (Bagi és Kusza 2015). Mindent össze vetve, a hullatott tollak al kalmazása valódi alternatívát jelent a hagyományos (vér, szövet) mintavételi mód szerekkel szemben, mely egyúttal jelentősen kibő ví tet te a molekuláris genetikai módszerekkel végzett ter mészetvédelmi és populációgenetikai vizsgálatokba be von ható fajok körét (ritka, érzékeny, nehezen csap dáz ható és/vagy védett fajok). EGYEDI AZONOSÍTÁS A madártani kutatások egyik alapvető eszköze az egyedi jelölés, mely lehetővé teszi a későbbi vizsgálatokat, adatfelvételeket. Ezeket a jelöléseket általában különböző eszközök (gyűrűk, krotáliák, chipek) segítsé gével oldják meg. Az egyedek jelölése szükségessé teszi a madarak befogását, ami jelentős stresszel jár az állat számára. Ezen túl a felhelyezett eszközök za var hatják az állatot, például hátrányt is jelenthet számukra menekülés vagy párválasztás során. További problémát jelent a jelölések elvesztése, vagy kopása. A mole ku lá ris genetikai módszerek részben ki tudják küszöbölni ezeket a problémákat, mivel az egyedek eleve jelöltek, így a jelölés nem jelent további terhet, azaz nem befo lyásolja az egyed túlélését, eś az nem veszik el. Termé szetesen a téves azonosításokat ezzel a módszerrel sem lehet teljesen kizárni (Vili 2013). A molekuláris techni kák fejlődésével a genetikai módszerek alkalmassá váltak az egyedek azonosítására (Morin et al. 1994) is. A fejlődés folyamatos, így egyre bővül a rendelkezésre álló eszközök köre (Vili et al. 2007). Kezdetben az rflp (restriction Fragment length Polymorphism) és rapd (random Amplified Polymorphic DNA), módszereket részesítették előnyben, de manapság egyre in kább kiváltja őket a direkt-szekvenálás, illetve a DNSujjlenyomat készítése mini- és mikroszatellitek vizsgá lata alapján (Sunnucks 2000). A mini- és mikroszatellitek a nukleáris DNS nem kódoló régióiban található 2 6 bázispáros nukleotid ismétlődések. Az ismétlődő szakasz hossza alapján lehetnek di-, tri-, tetra-, pentaés hexanukleotidok. Nagy számuk, hosszbeli polimor- fiz musuk és jellemzően jó amplifikálhatóságuk miatt ezeket a lókuszokat régóta felhasználják egyedi szintű azonosításra (Jeffreys et al. 1985). A módszer azon alapul, hogy az egyes mikroszatellita szakaszok hossza egyedenként változó lehet, így több ilyen szakaszt vizsgálva, a bázispárokban megadott hosszuk egyedre jel lem ző mintázatot jelent (Vili 2013). Mivel a DNSprofil egyedi jelölésnek tekinthető, és az adott populáció ból évről évre standard módon lehet mintákat venni, ezért a módszer alkalmas a jelölés-visszafogásos vizsgá latokhoz hasonlóan akár az egyedek hosszú távú nyo mon követésére is (lukacs 2005, lukacs és Burnham 2005, Peakall és Smouse 2006). Így populáció olyan, más mó don nehezen becsülhető paraméterei is vizsgálha tó vá válnak, mint például az egyedszám, a mortalitás, vagy a migráció (Vili et al. 2007). A fentiekből követ ke zik, hogy a módszer elsősorban a fajvédelmi prog ra mok esetében jelent hasznos eszközt. Az így nyert ada tok segítik a hatékony programok kidolgozását, de a már futó projektek monitorozására is felhasználha tóak, ezáltal még időben végrehajthatóak az esetlegesen szükségessé váló módosítások. IVAR-MEGHATÁROZÁS A legtöbb madárfaj esetében könnyű feladat a ne mek felismerése, azonban sok olyan faj van, ahol az iva ri dimorfizmus nagyon kicsi, vagy nem is figyelhe tő meg. Esetleg olyan fiatal egyedek képezik a vizsgá lat tárgyát, ahol ezek a nemi jellegek még nem fejlőd tek ki. Ezekben az esetekben segítségül hívhatjuk a molekuláris módszereket. Ivar-meghatározásra több molekuláris módszer alkalmazható, például a karyo tipizálás, rapd, rflp, AFlP, hibridizálás, de a miniés mikroszatellit lókuszok vizsgálata is. Madaraknál a tojó a heterogametikus (Wz ivari kromoszómákkal rendelkező), míg a hím a homogametikus ivar (zz kromo szómák). Így a W kromoszóma vagy a W kromo szó mára specifikus szekvenciák kimutatása alkalmas az ivar-meghatározásra (Vili et al. 2007). Griffiths és Tiwari (1995) írta le az első W kromoszómához kötődő gént madarakban, mely a CHD1W jelölést kapta. Ez a gén felel a kromo-helikáz DNS-kötő fehérje kódo lá sá ért, és a legtöbb fajban előfordul. Míg a CHD1W gén csak tojókban fordul elő, a z kromoszómán található CHD1Z jelű változata mindkét ivarban megtalálható. Ezek a gének az ivari kromoszómák rekombinálódó pszeudoautoszomális régióin kívül helyezkednek el, ezért elég konzervatívak ahhoz, hogy alkalmasak le gye nek az ivarok azonosítására. Ellegren és Sheldon (1997), valamint Cerit és Avalus (2007) is összehasonlí totta a különböző módszereket. Mindkét szerzőpáros arra a megállapításra jutott, hogy az ivari kromo szó má kon található CHD1W és CHD1Z gének vizsgálata je lenti a legmegbízhatóbb és leggyorsabb módszert. DNS-ALAPÚ FAJAZONOSÍTÁS A fajok azonosításának egy viszonylag egyszerű módja a DNS-barcoding (nevezik még az élet vonal kódjának is). Alapelve egyszerű: egy olyan DNS-szakaszt kell választani, amely jelentősen eltér a fajok kö zött, de meglehetősen kis variabilitással rendelkezik egy fajon belül. Ennek a szakasznak a vizsgálatával el - 38

BagiZ-KuszaSz:Layout 1 3/23/16 1:49 PM Page 3 végezhető a vizsgált egyedek faji hovatartozásának meg állapítása. A madarak (és általában a gerinces fajok esetében) a mitokondriális DNS citokróm-oxidáz I-es (CoI) régiójának 650 bázispár-hosszúságú szakaszát használják erre a célra. A módszer sok esetben nagyon leegyszerűsítette a taxonómiai munkát, de ennek is van nak korlátai, így a hagyományos fajmeghatározási módszereket nem lehet teljesen kiváltani vele. Kritika éri a módszert, mert csupán egyetlen régió vizsgálata alapján von le következtetéseket. Ez példádul új fajok esetén nem feltétlenül elegendő, de akár a véletlen folytán is lehetnek egyezések két faj között a vizsgált szakaszon. ugyanígy problémákat vet fel az introgreszszió és a hibridizáció kérdése is. Hebert és Gregory (2005) észak-amerikai madárfajok vizsgálata során ki mutatta, hogy az esetek 96%-ában azonosítható volt az egyed faji hovatartozása DNS-vonalkódolással. ugyan akkor az is igaz, hogy ezek nagy része hagyományos mód szerekkel is elkülöníthető lenne. A fennmaradó 4% esetében azonban a faj kizárólag a DNS-szekvencián alapuló azonosítása sokak szerint elfogadhatatlanul ma gas hibaarányhoz vezethet. Meg kell azonban emlí te ni, hogy az ismert és kutatott rendszertani csoportok esetében a tévedés lehetősége sokkal kisebb. A ha tá ro zásbeli bizonytalanságok elsősorban kevésbé kutatott, esetleg még nem leírt fajok/rejtett fajok esetében jelen tő sek. Az adatbázisok fejlesztésével a bizonytalanság mér téke is csökkenthető (Meyer és Paulay 2005). Baker et al. (2009) megállapításai szerint is az olyan, rend szer tanilag kiforrott csoportokban, mint az emlősök vagy a ma darak, a fajok többsége jól elkülöníthető ezzel a módszerrel. Madarakat érintő barcoding vizsgálatokat leggyak rab ban azzal a céllal folytatnak, hogy egy meghatározott terület (ország, régió, város) madárközösségét le írják, esetleg múzeumi gyűjteményeket vizsgálja - nak ál tala (Schindel et al. 2011, lijtmaer et al. 2012, Aliabadian et al. 2013), de a már említett taxonómiai mun kában is hasznos eszköznek bizonyul a leszárma zási viszonyok tisztázásában és a korábbi besorolások felülvizsgálatakor (Hebert et al. 2004, Khan és Arif 2013, rudnick et al. 2007, Ferri et al. 2009). Nagy le he tőségeket rejt magában a módszer a természet védel mi károk azonosításában (mérgezés vagy orvvadászat esetében a bizonyításkor), vagy például lehetővé teszi a repülőgéppel ütköző madárcsapatok faji szintű azo no sítását is, így lehetővé téve a hatékony ellenintéz ke dések kidolgozását (Dove et al. 2008). VESZÉLYEZTETETT FAJOK VÉDELME A korábbi fejezetekben már utaltunk rá, hogy a mo lekuláris genetikai módszerek egyik legfontosabb felhasználási területe az ornitológián belül a védett fajokat érintő kutatások és védelmi programok. Ha kis popu lá ciók egymástól távol helyezkednek el, és nem jön lét re közöttük migráció, akkor genetikailag izolálódnak, és felbomlik a dinamikus metapopulációs szerkezet, ami természetvédelmi szempontból rendkívül hátrá nyos (Standovár és Primack 2001). A genetikai állapot minél pontosabb ismerete a súlyosan veszélyeztetett fajok populációiban jelentősen segítheti a hatékony faj védelmi munkát, hiszen a populációs szerkezet (gén áramlás, metapopulációk, genetikai sodródás révén) alap vetően meghatározza a fajok túlélési esélyeit, és így befolyásolhatja az alkalmazandó védelmi stratégiát is (Vili et al. 2007). A molekuláris genetikai módszerek meg kerülhetetlen eszközei lettek a veszélyeztetett fa jok védelmének is, mivel ezek segítségével gyorsan és pon tosan megállapítható a különböző populációk ge ne tikai polimorfizmusa és a populációk közötti gén áram lás mértéke, felderíthető az adott populáció popu lációgenetikai története, melyek alapján tervezhetővé vá lik a génmegőrzési munka. A napjainkban leggyak rab ban alkalmazott módszer a kizárólag anyai ágon öröklődő mitokondriális DNS kontroll régiójának vizsgá lata, amit számos gerinces fajnál használták már fajon belüli populációs összehasonlításokra (rawlings és Donellan 2002, li et al. 2004, Martínez-Cruz et al. 2004). Szintén ezt a módszert használják a fajok utolsó elje ge sedés alatti refúgium területeinek azonosítására, az onnan történt kiáramlások irányának és időbe li sé gének rekonstruálására. Egy másik gyakran alkalmazott módszer a mikroszatellit markerek használata. A mikro szatel lit vizsgálat az adott lókuszon jelenlévő ismét lő dő elemek varianciáját használja fel. Ismert még SSr (simple sequence repeats) néven is (ouborg et al. 2010). Számos tanulmányban alkalmazták ezeket a marke re ket természetvédelmi-genetikai összefüggésben a ge ne tikai variáció, a népesség szerkezete, a génáramlás mér tékének becslésére, valamint a demográfiai történet és a hibridizációs események feltárására (Verardi et al. 2006, Aspi et al. 2009, Wheeldon és White 2009). Egyre gyakrabban alkalmazott módszer az SNP-k (single nucleotide polymorphism) vizsgálata. Az SNP-k gyakorlatilag pontmutációk. Egy DNS szekvencia-variációt jelent, mely akkor jön létre, ha egy nukleo tid a genomban megváltozik. Az SNP-k segít sé gével a hagyományosan használt mikroszatelliteknél és AFlP-nél jóval reprezentatívabb képet kaphatunk az egyedek, a populációk, vagy akár a metapopulációk ge ne tikai változatosságáról is. Ez lehetővé teszi, hogy rész letesebb képet alkossunk a vizsgált populáció demog ráfiájáról, a génáramlásról, a beltenyésztettségről és a populáció történetéről, továbbá a populációk kö zötti genetikai távolságokról (ouborg et al. 2010). Bár a most bemutatott módszerek eredményes alkal mazására számos példa szolgált már, állandó vita tár gyát képezi, hogy csupán egy, esetleg néhány mar ker felhasználásával hiteles képet kaphatunk-e a vizsgált faj vagy populáció változatosságáról. logikus kö vetkeztetés, hogy törekedni kell a lehető legtöbb marker alkalmazására, de a források végessége nem te szi ezt lehetővé. Ezért folyamatosan keresik a leg in kább meg bízható módszereket. összehasonlító tanulmá nyo kat végeztek például mikroszatellitek és SNP-k felhasz nálásával, az eredmények pedig ellentmondáso sak. Míg az atlanti lazac (Salmo salar) esetében (ryynänen et al. 2007) erős korreláció mutatkozott a két marker kö zött, ugyanez nem volt kimutatható a farkasok (Canis lupus) és az észak-amerikai prérifarkasok (Canis latrans) esetében az egyedek szintjén (Väli et al. 2008). ugyan akkor az utóbbi vizsgálatban már kimutatható volt a korreláció, ha a populációk szintjén történt az összehasonlítás. látható tehát, hogy nem létezik univerzális marker. Az aktuálisan alkalmazandó marker kivá lasz tá sakor figyelemmel kell lenni az adott taxonómiai csoportra és vizsgálni kívánt szerveződési szintre is. 39

BagiZ-KuszaSz:Layout 1 3/23/16 1:49 PM Page 4 IRODALOM Aliabadian, M. Beentjes, K. K. roselaar, H. V. B. Nijman, V. Vonk, r. (2013): DNA barcoding of Dutch birds. zookeys. 365: 25. Aspi, J. roininen, E. Kiiskilä, J. ruokonen, M. Kojola, I. Bljudnik, l. Pulliainen, E. (2009): Genetic structure of the northwestern russian wolf populations and gene flow between russia and Finland. Conservation Genetics. 10. 4: 815 826. Bagi z. Kusza Sz. (2015): Tollból történő DNS izolálás a Debreceni Egyetem Állatgenetikai laboratóriumában. [In: Bodnár K. B. Erdős zs. Nemzetközi összefogás a jövő agrárkutatásáért.] 88. Baker, A. J. Tavares, E. S. Elbourne, r. F. (2009): Countering criticisms of single mitochondrial DNA gene barcoding in birds. Molecular Ecology resources. 9. s1: 257 268. Bello, N. Francino, o. Sánchez, A. (2001): Isolation of genomic DNA from feathers. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 13. 2: 162 164. Cerit, H. Avalus, K. (2007): Sex identification in avian species using DNA typing methods. World s Poultry Science Journal. 63. 1: 91 99. Dove, C. J. rotzel, N. C. Heacker, M. Weigt, l. A. (2008): using DNA barcodes to identify bird species involved in birdstrikes. The Journal of Wildlife Management. 72. 5: 1231 1236. Eguchi, T. Eguchi, y. (2000): High yield DNA extraction from the snake cast-off skin or bird feathers using collagenase. Biotechnology letters. 22. 13: 1097 1100. Ellegren, H. Sheldon, B. C. (1997): New tools for sex identification and the study of sex allocation in birds. Trends in Ecology & Evolution. 12. 7: 255 259. Ferri, G. Alu, M. Corradini, B. licata, M. Beduschi, G. (2009): Species identification through DNA barcodes. Genetic Testing and Molecular Biomarkers. 13. 3: 421 426. Griffiths, r. Tiwari, B. (1995): Sex of the last wild Spix s macaw. Nature. 375: 454. Hebert, P. D. Gregory, T. r. (2005): The promise of DNA barcoding for taxonomy. Systematic biology. 54. 5: 852 859. Hebert, P. D. Stoeckle, M. y. zemlak, T. S. Francis, C. M. (2004): Identification of birds through DNA barcodes. PloS Biology. 2. 10: e312. Horváth, M. B. Martínez-Cruz, B. Negro, J. J. Kalmár, l. Godoy, J. A. (2005): An overlooked DNA source for noninvasive genetic analysis in birds. Journal of Avian Biology. 36. 1: 84 88. Jeffreys, A. J. Wilson, V. Thein, S. l. (1985): Individual-specific fingerprints of human DNA. Nature. 316: 76 79. Khan, H. A. Arif, I. A. (2013): CoI barcodes and phylogeny of doves (Columbidae family). Mitochondrial DNA. 24. 6: 689 696. li, M. Wei, F. Goossens, B. Feng, z. Tamate, H. B. Bruford, M. W. Funk, S. M. (2004): Mitochondrial phylogeography and subspecific variation in the red panda (Ailurus flulgens): implications for conservation. Molecular Pylogenetics and Evolution. 36. 1: 78 89. lijtmaer, D. A. Kerr, K. C. Stoeckle, M. y. Tubaro, P. l. (2012): DNA Barcoding Birds: From Field Collection to Data Analysis. [In: Kress, W. J. Erickson, D. l. (eds.) DNA Barcodes: Methods and Protocols Methods in Molecular Biology.] Humana Press. 858: 127 152. lukacs, P. M. (2005): Statistical aspects of using genetic markers for individual identification in capture-recapture studies. Doktori (PhD) e rtekeze s. Colorado State university. Colorado. usa. lukacs, P. M. Burnham, K. P. (2005): review of capture recapture methods applicable to noninvasive genetic sampling. Molecular Ecology. 14. 13: 3909 3919. Malagó, W. Franco, H. M. Matheucci, E. Medaglia, A. Henrique- Silva, F. (2002): large scale sex typing of ostriches using DNA extracted from feathers. BMC Biotechnology. 2. 1: 19. Martínez-Cruz, B. Godoy, J. A. Negro, J. J. (2004): Population genetics after fragmentation: the case of the endangered Spanish imperial eagle (Aqila adalberti). Molecular Ecology. 13. 8: 2243 2255. McDonald, P. G. Griffith, S. C. (2011): To pluck or not to pluck: the hidden ethical and scientific costs of relying on feathers as a primary source of DNA. Journal of Avian Biology. 42. 3: 197 203. Meyer, C. P. Paulay, G. (2005): DNA Barcoding: error rates based on comprehensive sampling. PloS Biology. 3. 12: 2229. Morin, P. A. Moore, J. J. Chakraborty, r. Jin, l. Goodall, J. Woodruff, D. S. (1994): Kin selection, social structure, gene flow, and the evolution of chimpanzees. Science. 265. 5176: 1193 1201. ouborg, N. J. Pertoldi, C. loeschcke, V. Bijlsma, r. K. Hedrick, P. W. (2010): Conservation genetics in transition to conservation genomics. Trends in Genetics. 26. 4: 177 187. Peakall, r. Smouse, P. E. (2006): GENAlEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes. 6. 1: 288 295. Pearce, J. M. Fields, r. l. Scribner, K. T. (1997): Nest Materials as a Source of Genetic Data for Avian Ecological Studies (Material del Nido Como Fuente para obtener Datos Genéticos en Estudios Ecológicos). Journal of Field ornithology. 471 481. rawlings, l. H. Donellan, S. C. (2002): Phylogeographic analysis of the green python, Morelia viridis, reveals cryptic diversity. Molecular Pylogenetics and Evolution. 27. 1: 36 44. rudnick, J. A. Katzner, T. E. Bragin, E. A. DeWoody, J. A. (2007): Species identification of birds through genetic analysis of naturally shed feathers. Molecular Ecology Notes. 7. 5: 757 762. ryynänen, H. J. Tonteri, A. Vasemägi, A. Primmer, C. r. (2007): A comparison of biallelic markers and microsatellites for the estimation of population and conservation genetic parameters in Atlantic salmon (Salmo salar). Journal of Heredity. 98. 7: 692 704. Schindel, D. E. Stoeckle, M. y. Milensky, C. Trizna, M. Schmidt, B. Gebhard, C. Graves, G. (2011): Project description: DNA barcodes of bird species in the National Museum of Natural History. Smithsonian Institution. usa. zookeys. 152: 87. Standovár T. Primack r. B. (2001): A természetvédelmi biológia alapjai. Nemzeti Tankönyvkiadó. Budapest. 542. Sunnucks, P. (2000): Efficient genetic markers for population biology. Trends in Ecology & Evolution. 15. 5: 199 203. Taberlet, P. Bouvet, J. (1991): A Single Plucked Feather as a Source of DNA for Bird Genetic Studies. The Auk. 108. 4: 959 960. Taberlet, P. Waits, l. P. luikart, G. (1999): Noninvasive genetic sampling: look before you leap. Trends in Ecology and Evolution. 14. 8: 323 327. Väli, Ü. Einarsson, A. Waits, l. Ellegren, H. (2008): To what extent do microsatellite markers reflect genome wide genetic diversity in natural populations? Molecular Ecology. 17. 17: 3808 3817. Verardi, A. lucchini, V. randi, E. (2006): Detecting introgressive hybridization between free ranging domestic dogs and wild wolves (Canis lupus) by admixture linkage disequilibrium analysis. Molecular Ecology. 15. 10: 2845 2855. Vili N. Kalmár l. Kovács Sz. Horváth M. (2007): A parlagi sas ge ne tikai változatossága. [In: Forró l. (szerk.) A Kárpát-medence állatvilágának kialakulása.] Magyar Természettudományi Mú zeum. Budapest. 303 310. 40

BagiZ-KuszaSz:Layout 1 3/23/16 1:49 PM Page 5 Vili, N. (2013): Applicability of degraded biological remains in conservation genetic studies of birds. Case study of the Eastern Imperial Eagle (Aquila heliaca) population of the Carpathian Basin. Doktori (PhD) értekezés. Szent István Egyetem. Gödöllő. Waits, l. P. Paetkau, D. (2005): Noninvasive genetic sampling tools for wildlife biologists: a review of applications and recommendations for accurate data collection. Journal of Wildlife Management. 69. 4: 1419 1433. Wan, Q. H. Wu, H. Fujihara, T. Fang, S. G. (2004): Which genetic marker for which conservation genetics issue? Electrophoresis. 25. 14: 2165 2176. Wheeldon, T. White, B. N. (2009): Genetic analysis of historic western Great lakes region wolf samples reveals early Canis lupus/lycaon hybridization. Biology letters. 5. 1: 101 104. 41

BagiZ-KuszaSz:Layout 1 3/23/16 1:49 PM Page 6