TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK 2013 TDK, szakdolgozat diplomamunka Témáink Szerkezeti biológia Transzgénikus Drosophila törzsek vizsgálata A genomi integritás és dinamika meghatározó tényezői Genom Metabolizmus és Kémiai Biológia csoport Humán ráksejtek DNS-javító útvonalai Molekuláris biológiai eszközök Karcinogenezis és fertőző betegségek elleni védekezés További info: www.enzim.hu - Research Vértessy Beáta www.biostruct.org, PubMed, Google Scholar
Módszerek és problémák Szerkezeti biológia Mechanizmusok vizsgálata Fajspecificitás Folding Enzimkinetika (stacioner és tranziens) Konformációk spektroszkópiai módszerek (CD, fluorimetria) Fehérje-röntgenkrisztallográfia PDB ID: 4GV8 in 2013 Objektumok: Genom metabolizmus/integritás rendszerei
dutpáz dutpáz Módszerek és problémák Élettani szerep vizsgálata Fejlődésbiológia, sejtciklus szabályozás Humán sejtvonal, Mycobacterium, Drosophila DNS javítás / sejthalál Timinmentes sejthalál mechanizmusa Kifejeződési mintázatok Sejten belüli lokalizáció Proteomika: kölcsönhatási hálózatok Transzgén élőlények Knock-out / RNS interferencia Magi/citoplazmás transzport Objektumok: Genom metabolizmus/integritás rendszerei
Jelentkezz önéletrajzzal vertessy@mail.bme.hu További info: www.enzim.hu - Research Vértessy Beáta www.biostruct.org, PubMed, Google Scholar
Bioinformatika TDK lehetőség - Lendület Membránfehérje Bioinformatika Kutatócsoport Témavezető neve: Tusnády Gábor Transzmembrán fehérjék elméleti szerkezet meghatározása, szerkezet modellezése, modern bioinformatikai eszközökkel a genom által kódolt fehérjék 25-30%-a transzmembrán fehérje a transzmembrán fehérjék szerkezetmeghatározása csak nagyon speciális körülmények oldhatók meg alig 1000 transzmembrán fehérje szerkezetét határozták már meg kísérleti eszközökkel de a ma kereskedelemben kapható gyógyszerek mintegy fele transzmembrán fehérjéken fejti ki a hatását ezért a transzmembrán fehérjék elméleti szerkezet meghatározása modern statisztikai, számítástechnikai, illetve bioinformatikai eszközökkel rendkívül fontos feladat! Elérhetőségek: Honlap: http://mbk.enzim.hu Telefon: 061-382-6709 e-mail: tusnady.gabor@ttk.mta.hu
Dr. Reményi Attila kutatócsoportja 1. Kutatási téma címe: Fehérje szerkezet alapú hatóanyag tervezés 3D fehérje térszerkezetek meghatározása A szerkezetek segítségével fényt derítettünk arra, hogy néhány aminosavból álló peptidek hogyan képesek akár nagyon hasonló fehérjekötő felszínekhez specifikus módon kötődni szintetikus vegyületek létrehozása, amik a peptidekhez hasonló módon szelektíven kötnek az ERK, p38 és JNK nevű fehérjékhez ERK, p38 és JNK: a sejt jelátviteli folyamataiban foszforilációs enzimek (kinázok) szintetikus vegyületekkel ezen kinázoknak a fehérje-fehérje kölcsönhatásait szeretnék gátolni Ezen szintetikus vegyületek élettani szerepe: a rákos és gyulladásos betegségek gyógyítása Elérhetőségek: Tanszék/ Munkahely: MTA TTK, Enzimológiai Intézet Telefon: 06 1 3826613 e-mail: remeny.attila@ttk.mta.hu
Dr. Reményi Attila kutatócsoportja 2. Kutatási téma címe: Jelátviteli fehérje komplexek szerkezete Sejtek a környezetükből érkező ingerekre válaszolnak, ennek egy lépése: fehérje foszforilációra képes enzimek makromolekuláris komplexet hoznak létre A komplexeken belül kialakuló kölcsönhatások határozzák meg, hogy egy adott környezeti ingerre (pl. egy másik sejt jelenléte, hormonok, stressz, stb) milyen konkrét biológiai program (pl. sejtmozgás, osztódás, sejthalál, stb) valósul meg. Cél: olyan fehérje-fehérje komplexek térbeli szerkezetének feltárása, melyek biokémiai analízise megtörtént, de a komplexek kialakításában fontos kötőfelszínek térbeli struktúrája még nem ismert farmakológiai jellegű kutatások kiindulópontja Elérhetőségek: Tanszék/ Munkahely: MTA TTK, Enzimológiai Intézet Telefon: 06 1 3826613 e-mail: remeny.attila@ttk.mta.hu