Atomi, illetve molekuláris kölcsönhatások és alkalmazásaik Példaként: atomi erő mikroszkópia

Hasonló dokumentumok
Atomi, illetve molekuláris kölcsönhatások és alkalmazásaik

Atomi, illetve molekuláris kölcsönhatások és alkalmazásaik Példaként: atomi erő mikroszkópia

Anyagszerkezet, anyaghullámok, atomi és molekuláris kölcsönhatások Példaként: atomi erő mikroszkópia

Anyagszerkezet, anyaghullámok, atomi és molekuláris kölcsönhatások Példaként: atomi erő mikroszkópia

Atomi és molekuláris kölcsönhatások. Pásztázó tűszondás mikroszkópia.

Kémiai kötések. Kémiai kötések kj / mol 0,8 40 kj / mol

Kötések kialakítása - oktett elmélet

Elektronegativitás. Elektronegativitás

Atomszerkezet. Atommag protonok, neutronok + elektronok. atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok

A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás

3. A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás

Atomszerkezet. Atommag protonok, neutronok + elektronok. atompályák, alhéjak, héjak, atomtörzs ---- vegyérték elektronok

A kovalens kötés polaritása

Sillabusz orvosi kémia szemináriumokhoz 1. Kémiai kötések

Általános és szervetlen kémia 3. hét Kémiai kötések. Kötések kialakítása - oktett elmélet. Lewis-képlet és Lewis szerkezet

Szalai István. ELTE Kémiai Intézet 1/74

A kovalens kötés elmélete. Kovalens kötésű molekulák geometriája. Molekula geometria. Vegyértékelektronpár taszítási elmélet (VSEPR)

FELADATMEGOLDÁS. Tesztfeladat: Válaszd ki a helyes megoldást!

Energiaminimum- elve

Kémiai kötések és kristályrácsok ISMÉTLÉS, GYAKORLÁS

Az anyagszerkezet alapjai. Az atomok felépítése

A periódusos rendszer, periodikus tulajdonságok

Az anyagszerkezet alapjai. Az atomok felépítése

Kolloidkémia 1. előadás Első- és másodrendű kémiai kötések és szerepük a kolloid rendszerek kialakulásában. Szőri Milán: Kolloidkémia

Folyadékok és szilárd anyagok

20/10/2016 tema04_biolf_

Altalános Kémia BMEVESAA101 tavasz 2008

Az anyagszerkezet alapjai

tema04_

Periódusos rendszer (Mengyelejev, 1869) nemesgáz csoport: zárt héj, extra stabil

A hidrogénmolekula. Emlékeztető: az atompályák hullámok (hullámfüggvények!) A hullámokra érvényes a szuperpozíció (erősítés és kioltás) elve!

A hidrogénmolekula. Energia

Kémiai kötések. Kémiai kötések. A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011

Az anyagi rendszer fogalma, csoportosítása

AZ ANYAGI HALMAZOK ÉS A MÁSODLAGOS KÖTÉSEK. Rausch Péter kémia-környezettan

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Bevezetés a lézeres anyagmegmunkálásba

5. elıadás KRISTÁLYKÉMIAI ALAPOK

Adatgyűjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb műszerei

I. Atomszerkezeti ismeretek (9. Mozaik Tankönyv: oldal) 1. Részletezze az atom felépítését!

Pásztázó mikroszkópiás módszerek

4. Molekulák, ionok, kémiai alapelvek, a kémiai kötés típusai. Kémiai kötés kialakulásának oka: energianyereség.

Kémiai kötés: több atom reakcióba lépése során egy közös, stabil (telített) külső elektronhéj alakul ki.


Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

Az elektronpályák feltöltődési sorrendje

Atomszerkezet, kötések

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39

A SZILÁRDTEST FOGALMA. Szilárdtest: makroszkópikus, szilárd, rendezett anyagdarab. molekula klaszter szilárdtest > σ λ : rel.

Kolloid állapotjelzők. Molekuláris kölcsönhatások. Határfelületi jelenségek: fluid határfelületek

Vezetők elektrosztatikus térben

Általános és szervetlen kémia 3. hét. Kémiai kötések. Kötések kialakítása - oktett elmélet. Az elızı órán elsajátítottuk, hogy.

Vegyületek - vegyületmolekulák

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39

Kémiai kötés Lewis elmélet

Az atom- olvasni. 1. ábra Az atom felépítése 1. Az atomot felépítő elemi részecskék. Proton, Jele: (p+) Neutron, Jele: (n o )

A kémiai kötés magasabb szinten

Bevezetés az anyagtudományba II. előadás

A kémiai kötés magasabb szinten

Kémiai alapismeretek 3. hét

Adatgyűjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb műszerei

ORVOSI KÉMIA. Az anyag szerkezete

az Anyagtudomány az anyagok szerkezetével, tulajdonságaival, az anyagszerkezet és a tulajdonságok közötti kapcsolatokkal, valamint a tulajdonságok

Atomfizika. Az atommag szerkezete. Radioaktivitás Biofizika, Nyitrai Miklós

Víz. Az élő anyag szerkezeti egységei. A vízmolekula szerkezete. Olyan mindennapi, hogy fel sem tűnik, milyen különleges

1. SI mértékegységrendszer

Kolloid állapotjelzık. Molekuláris kölcsönhatások. Határfelületi jelenségek: fluid határfelületek

dinamikai tulajdonságai

8. AZ ATOMMAG FIZIKÁJA

Thomson-modell (puding-modell)

Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése

Az elektromágneses tér energiája

Periódusosság. Általános Kémia, Periódikus tulajdonságok. Slide 1 of 35

Előtétszó Jele Szorzó milli m 10-3 mikro 10-6 nano n 10-9 piko p femto f atto a 10-18

Jegyzet. Kémia, BMEVEAAAMM1 Műszaki menedzser hallgatók számára Dr Csonka Gábor, egyetemi tanár Dr Madarász János, egyetemi docens.

Atomok. szilárd. elsődleges kölcsönhatás. kovalens ionos fémes. gázok, folyadékok, szilárd anyagok. ionos fémek vegyületek ötvözetek

Mechanika, dinamika. p = m = F t vagy. m t

Anyagtudomány ANYAGSZERKEZETI ALAPISMERETEK GERZSON MIKLÓS

Az átlagok jelentése és haszna

Stern Gerlach kísérlet. Készítette: Kiss Éva

Röntgensugárzás az orvostudományban. Röntgen kép és Komputer tomográf (CT)

Equation Chapter 1 Section 1AZ ANYAGOK TULAJDONSÁGAIT BEFOLYÁSOLÓ TÉNYEZŐK. 1. ábra Az anyagok tulajdonságait befolyásoló tényezők

Orvosi Biofizika I. 12. vizsgatétel. IsmétlésI. -Fény

Bevezetés az általános kémiába

Katalízis. Tungler Antal Emeritus professzor 2017

Bevezetés a részecske fizikába

1.2. A szilárd testek szerkezete

Molekulák világa 2. kémiai szeminárium. Szilágyi András

Az elemek rendszerezése, a periódusos rendszer

ATOMMODELLEK, SZÍNKÉP, KVANTUMSZÁMOK. Kalocsai Angéla, Kozma Enikő

Az elemeket 3 csoportba osztjuk: Félfémek vagy átmeneti fémek nemfémek. fémek

Periódusosság. Általános Kémia, Periódikus tulajdonságok. Slide 1 of 35

Biomolekuláris rendszerek. vizsgálata. Semmelweis Egyetem. Osváth Szabolcs

Anyagtudomány. Anyagszerkezeti alapismeretek

Sugárzások kölcsönhatása az anyaggal

Anyagszerkezet és vizsgálat Fémtan, anyagvizsgálat

Az elektromos kettősréteg. Az elektromos potenciálkülönbség eredete, értéke és az azt befolyásoló tényezők. Kolloidok stabilitása.

Tartalom Az atom szerkezete Atom. Részecske. Molekula Atommodellek A.) J. Thomson féle atommodell...4 B.) A Rutherford-féle vagy

Az atomhéj (atommag körüli elektronok) fizikáját a kvantumfizika írja le teljes körűen.

Átírás:

Áttekintés Atomi, illetve molekuláris kölcsönhatások és alkalmazásaik Példaként: atomi erő mikroszkópia Bozó Tamás Nanobiotechnológia és Molekuláris Biofizika Munkacsoport Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet bozo.tamas@med.semmelweis-univ.hu 2015 október 20. 1 Témakörök: alapvető kölcsönhatások atomi és molekuláris kölcsönhatások pásztázó próbamikroszkópiák atomi erő mikroszkópia kontakt mód oszcilláló mód erőspektroszkópia Tankönyvi részek: I/2, VIII/4.2.1., X/2 Kapcsolódó gyakorlat: Rezonancia Kollokviumi tétel: 8. Hogyan értelmezhetőek az atomok közötti kölcsönhatások, kötéstípusok? Atomi kölcsönhatások Alapvető kölcsönhatások a fizikában Kölcsönhatás Mire hat? Hatótávolság Relatív erősség Gravitáció Elektrosztatikus (Coulomb) minden részecske töltött részecskék végtelen ( ~1/r 2 ) 10-40 végtelen (~1/r 2 ) 10-2 Erős nukleáris nukleonok 10-15 m 1 Gyenge nukleáris minden részecske 10-18 m 10-13 3 Coulomb kölcsönhatás Gravitáció F C = k Q A Q B F g = G m A m B r 2 r 2 (k = 9 10 9 Nm2 m3 C2 ) (G = 6,67 10 11 kg s 2) Atomi kölcsönhatások általános leírása m A Q A F F m B Q B 0 A és B: kölcsönhatásokra jell. állandók n < m r: atomok távolsága r 0 : kötéstávolság E k : kötési energia 1

I. Kovalens kötés Atomokat közös elektronpályák: molekulapályák tartják össze Vegyértékelektronok szerepe Elektrosztatikus komponens is jelen lehet Erős kötés: E k >1 ev (1 ev = 1,6*10-19 J = 96 kj/mol ~ 100 kj/mol) H 3 C-CH 3 etán H 2 C=CH 2 etén (etilén) HC CH etin (acetilén) szén-szén kötéshossz kötési energia 154 pm -331 KJ mol -1 139,9 pm -590 KJ mol -1 120,3 pm -812 KJ mol -1 Kvantált atomi elektronállapotok (ismétlés) Az elektron állapota kvantumszámokkal (4db) írható le: kvantumszám lehetséges értékei Mit jellemez? Mit ad meg? fő n=1,2,3...7 elektronhéj energiaszint mellék mágneses l=0,1,2,...(n-1) or: s, p, d, f m l =-l,...0,...+l spin m s =±1/2 alhéj orbitál (elektronpálya) az alhéjon elektron saján perdületét (spinjét) impulzusmomentum (perdület) nagysága impulzusmomentum (perdület) iránya spin iránya (nagysága konstans) Elektronpálya (orbitál): n, l, ml kvantumszámokkal jellemezhető állapot. Rajta max. 2 db, ellentétes spinű elektron tartózkodhat. 8 I. Kovalens kötés I. Kovalens kötés Apoláris (homeopoláris) (+) és (-) töltések súlypontja egybeesik kötőelektronok egyenletes eloszlása tiszta kovalens Pl.: H 2, Cl 2, O 2 Poláris (heteropoláris) töltések súlypontja eltolódik polarizált elektronfelhő elektromos dipólus elektrosztatikus komponens megjelenik Pl.: HCl, HF, H 2 O Elektromos dipólus momentum: a töltésszétválás mértéke. Vektor! p = Qd p: dipólusmomentum Q: töltés értéke d: töltések súlyponti távolsága [D, debye] (1D = 3,34*10-30 Cm) I./b Fémes kötés Atomokat közös elektronpályák tartják össze Vegyértékelektronok (itt energiasávot alkotnak) Erős kötés: E k >1 ev Nincs értelmezve két atomra, sokatomos rendszerek I./b Fémes kötés + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Fémrács: pozitív fémionok kristályos rendben, körülöttük közös pályát kialakító, delokalizált elektronrendszer. Fizikai tulajdonságok: fémes szín nyújthatóság, alakíthatóság elektromos vezetés hővezetés 2

elektonegativitás-különbség 10/20/2015 II. Elektrosztatikus kölcsönhatáson alapuló kötések Elektronegativitás fogalma Meghatározza, milyen erővel vonzza az atom a (kovalens) kötésben lévő elektronokat. Egysége önkényes (Pauling, Mulliken, Sanderson és más skálák) EN E ionizációs + E elektronaffinitás Kötött állapotú atomi elektronok (ismétlés) 1. Atommag elektromos erőtere hat rájuk. 2. Az állapotfüggvényt saját irányába tereli (torzítja). 3. Az elektronok impulzusa határozatlan a szétterülés érvényben marad. 4. Nincs elég energiájuk az atom elhagyására kötött állapot. Következmény: Dinamikus egyensúly (magvonzás és szétterülés között). Szimmetrikus alak (állóhullámszerű) Stacionárius függvény Ψ(x) Mivel Δt teljesen határozatlan E teljesen határozot diszkrét energiaszintek. 14 II. Elektrosztatikus kölcsönhatáson alapuló kötések Elektronegativitás L. Pauling szerint (relatív egységekben) II. Elektrosztatikus kölcsönhatáson alapuló kötések Elektronegativitás különbség: < 0,6 (apoláris kovalens) 0,6 2,1 ( poláris kovalens) 2,1 < (ionos) fémes ionos kovalens elsődleges kémiai kötések elektonegativitás-összeg II. Elektrosztatikus kölcsönhatáson alapuló kötések Példa: (Ez a modell (N. C. Norman) nem a Pauling skála szerinti EN értékeket használja!) II./a Ionos kötés (+) és (-) ponttöltések között Coulomb erők Heteropoláris kötések határesete Nagy EN különbségű atomok között (pl. NaCl, DEN=3-0,9=2,1) Általában sokatomos kristályok, de értelmezhető két atomra is Hosszú hatótávú kh., de ez a közegtől is függ (lsd. hidratáció) Erős kölcsönhatás (E k > 1 ev) Ionrács: a pozitív és negatív ionok kristályos rendben helyezkednek el sztöchiometriai arányú halmazban. 3

Példa: Na Na + + e - E i = 496 kj/mol II./a Ionos kötés Ionizációs energia: kationok létrehozásához (elektronok kiszakításához) befektetendő energia. II./b Dipól-dipól kölcsönhatás (+) és (-) atomcsoportok/molekularészek között Coulomb erők Permanens dipólus jellegű töltéseloszlás Intra/intermolekuláris kölcsönhatás Gyenge kölcsönhatás (E k = 0,003-0,02 ev) + e - Cl Cl - E aff = -349 kj/mol E rács = -788 kj/mol Elektronaffinitás: anionok képződése (elektronfelvétel) során történő energiafelszabadulás. (Olykor E befektetést igényel) Rácsenergia: az ellentétes töltésű ionok kristályrácsba rendeződésekor felszabaduló energia. (E pot csökken) A dipólusok közti vonzás és taszítás: E vonzó = p E p: dipólusmomentum E: környező partnerek által keltett elektromos térerősség E taszító : partnerek elektronfelhőjének taszítása II./b Dipól-dipól kölcsönhatás d + d - d + d - III. Van der Waals-kölcsönhatások Példa: Apoláris molekulákban/molekularészekben időlegesen kialakuló dipólus egy másik apoláris molekulában dipólust indukál dipól-dipól kölcsönhatás Közöttük vonzó (diszperziós, vagy London-féle) erők lépnek fel Inter/intramolekuláris kölcsönhatás Nagy jelentőség biokémiai reakciókban, szerkezetstabilizálásban Gyenge kölcsönhatás (E k ~ 0,02 ev) r 0 : kötéshossz poláris kovalens kötés poláris kovalens kötés r A és r B : az A és B atom Van der Waals sugara Atomi méretek fogalma Elektrosztatikus kölcsönhatáson alapuló kötések Kölcsönhatás E pot távolságfüggése E k Van der Waals sugár ionos sugár kovalens sugár fémes sugár Ion-ion 1/r 2-3 ev Ion-dipólus 1/r 2 0,1-0,2 ev Dipólus-dipólus (rögzített partnerek) Dipólus-dipólus (hőmozgás mellett) 1/r 3 0,02 ev 1/r 6 0,003 ev Diszperziós 1/r 6 0,02 ev 4

Két nagy elektronegativitású atom között létrejövő H-híd Általában F, N, O atomok között Intermolekuláris / intramolekuláris kölcsönhatás Kötéstáv ált.: 0,23 0,35 nm A kötés térben irányított Nagy jelentőség biokémiai reakciókban, szerkezetstabilizálásban Közepes erősségű kölcsönhatás (E k ~ 0,2 ev) acceptor atom IV. Hidrogénkötés donor atom V. Hidrofób kölcsönhatás Vizes közegben értelmezhető (pl. biológiai rendszerek) Hidrofób molekulák/molekularészek asszociációja, cél a víz kiszorítása Nem csak Van der Waals alapú Hajtóereje a apoláros rész - víz határfelület csökkentése, ezzel a vízmolekulák rendezettségének csökkentése (lsd. termodinamika 2. főtétele) Intra/intermolekuláris kölcsönhatás Nagy jelentőség biokémiai reakciókban, szerkezetstabilizálásban Gyenge kölcsönhatás Pásztázó próbamikroszkópiák (Scanning Probe Microscopy, SPM) Vasatomok rézen, STM kép Változatos szerkezetvizsgáló eljárások, melyek egy vékony szonda és valamely felület között létrejövő atomi szintű kölcsönhatások detektálásán alapulnak. Egy felületet tapogatunk le pontrólpontra, akár atomról-atomra. Nem diffrakció-limitált módszerek. Néhány pm-es pásztázási pontosság. Elnevezés: kölcsönhatás szerint. Atomok egy szilíciumlapkán Scanning Tuneling Microscope (STM) 1981 Pásztázó alagút-mikroszkóp Heinrich ROHRER és Gerd BINNING Nobel díj: 1986 5

A szonda: piciny tű Egy kb. 100-500 mm hosszú laprugóhoz (vagy rugólapkához) kapcsolva. Anyaga: ált. szilícium-nitrid Általában fémbevonat (Au, Cu, Ni...) Tűhegy sugara: 0.1 nm 100 μm Rugóállandó: k 0.1-10 N/m f 0 50-500 khz Atomi kölcsönhatások a tűhegy és a minta között: Vonzás és taszítás Eredőjük távolságfüggő Nagyobb távolságoknál: elektrosztatikus vonzás (van der Waals erők) Közel érve: Coulomb taszítás 31 Pásztázás alapja: Piezoelektromos effektus : Bizonyos anyagokban (pl. kvartz) deformáció hatására feszültség lép fel. Inverz piezoelektromos hatás: Feszültség hatására deformáció jelentkezik (~1nm/Volt) (Bővebben: TK.: VIII/4.2.1., Ultrahang ea., 2. félév) A szonda egy rugalmas, mikroszkópikus méretű laprugóra szerkesztett parányi tű. A tűhegy atomjai és a minta felületének atomjai között taszítóvonzó kölcsönhatások a rugólapka elhajlását okozzák. X-Y irányban vonalanként pásztázzuk a felületet. Vertikális felbontóképesség akár 10 pm, a horizontális ennél rosszabb. Levegőben és folyadékban (fiziológiás közeg) is működőképes Szinte mindenféle felületen alkalmazhatók. nm-mm nagyságú objektumok szkennelhetők. Natív minták vizsgálhatóak: nem kíván fixálást, festést vagy jelölést. Kontakt mód: (Contact mode) A tű folyamatos kapcsolatban van a felszínnel. A felszínre kifejtett erőt (a rugólapka elhajlását) konstans értéken tartjuk a tű és a felszín távolságának szabályozásával (feedback rendszer) Pontról pontra regisztráljuk az ehhez szükséges Z irányú elmozdulást. Oszcilláló mód: (Tapping mode, Non-contact mode) Rezonancia: kényszerrezgés, f f 0, nagy amplitúdók Hátrány: jelentős perturbáció lehet vertikális és horizontális irányban. (Lsd. még: Rezonancia gyakorlat) 6

Oszcilláló mód: (Tapping mode, Non-contact mode) A tűt a rezonanciafrekvenciájához közeli frekvencián rezegtetjük. A felszínnel való kölcsönhatás miatt a rezgés amplitúdója megváltozhat. Az amplitúdót a tű és a felszín távolságának szabályozásával tartjuk állandó értéken. Pontról pontra regisztráljuk az ehhez szükséges Z irányú elmozdulást. magasság kontraszt amplitúdó-kontraszt fázis-kontraszt Előnye: elvileg kiküszöbölt laterális erőkifejtés, érzékeny minták vizsgálatára is alkalmas. Példák: http://www.youtube.com/watch?v=brsos5e39h8 Pentacén molekula AFM képe Hidrogénkötések 8-hidroxiquinolin molekulák között (AFM felvétel) Nature Chemistry 3, 273 278 (2011) Science 26, 611-614 (2013) Példák: Példák: NaCl kristály AFM képe Humán metafázisos kromoszóma AFM képe Egyedi aktinpolimer AFM képe HeLa sejtek AFM képe 7

Erőspektroszkópia: a mintát érő nyomási és húzási ciklusok során regisztrált erőválaszok. (erő távolság függvény) ~10 pn érzékenység Erőspektroszkópia: Hook törvény: A rugólapka elhajlása (Δx) arányos az erővel (F): (Rezonancia gyak.) F = k x k : rugóállandó Átszúrási, szakítási, doménkitekeredési és más erők, viszkózus és elasztikus tulajdonságok mérhetőek így. 44 MFP-3D AFM Köszönöm a figyelmet! 500 nm 8