Tudjunk Egymásról Bugyi Beáta 22/11/2012

Hasonló dokumentumok
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet. 9. A sejtmozgás mechanizmusai

Biofizika I

2. AKTIN-KÖTŐ FEHÉRJÉK

A citoszkeletális rendszer

BIOMECHANIKA 3 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben

Tartalom. A citoszkeleton meghatározása. Citoszkeleton. Mozgás a biológiában A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 12/9/2016

A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER (Nyitrai Miklós, )

A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai

BIOMECHANIKA 2 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben

A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék.

Citoszkeleton. Sejtek rugalmassága. Polimer mechanika: Hooke-rugalmasság. A citoszkeleton filamentumai. Fogászati anyagtan fizikai alapjai 12.

A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA

Biofizika I

Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet

A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék.


Komplex egyszerű Aktin alapú mikrofilamentum rsz. Hogyan vizsgálhatunk folyamatokat? Komplex egyszerű S E J T

Kollár Veronika

A citoszkeleton Eukarióta sejtváz

Biofizika I

Sejt. Aktin működés, dinamika plus / barbed end pozitív / szakállas vég 1. nukleáció 2. elongáció (hosszabbodás) 3. dinamikus egyensúly

11/15/10! A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER! Polimerizáció! Polimerizációs egyensúly! Erő iránya szerint:! 1. valódi egyensúly (aktin)" Polimer mechanika!

Vezikuláris transzport

Biomolekulák nanomechanikája A biomolekuláris rugalmasság alapjai

1. AKTIN CITOSZKELETON

A citoszkeletális rendszer

VILÁGÍTÓ GYÓGYHATÁSÚ ALKALOIDOK

A harántcsíkolt izom struktúrája általános felépítés

Dinamikus fehérjerendszerek a sejtben

Citoszkeleton Sejtmozgás

Tropomiozin és nehéz meromiozin hatása a formin által nukleált aktin filamentumok flexibilitására

A citoszkeleton. A citoszkeleton, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása. A citoszkeleton. A citoszkeleton.

Modern mikroszkópiai módszerek

Jellemzői: általában akaratunktól függően működik, gyors, nagy erőkifejtésre képes, fáradékony.

2011. október 11. Szabad János

Transzporterek vizsgálata lipidmembránokban Sarkadi Balázs MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport, MTA-TTK Budapest

A citoszkeletális rendszer, a harántcsíkolt izom biofizikája.

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

PROGRAMFÜZET. "GENETIKAI MŰHELYEK MAGYARORSZÁGON" XIII. Minikonferencia SZEPTEMBER 12.

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

Dinamikus fehérjerendszerek a sejtben. Kellermayer Miklós

Maléth József. Az endoplazmás retikulum - plazma membrán mikrodomének szerepe az intracelluláris Ca 2+ szignalizáció szabályzásában

A biológiai mozgások. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai. Motorfehérjék. Motorfehérjék közös tulajdonságai


Oktatói önéletrajz Dr. Droppa Magdolna

Oktatói önéletrajz Dr. Droppa Magdolna

Membrántranszport. Gyógyszerész előadás Dr. Barkó Szilvia

Történeti áttekintés. Eukarióta. Prokarióta. A citoszkeletális rendszer. Motorfehérjék. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai.

A DAAM formin alcsalád szerepe az izomfejlődésben. A Ph.D. értekezés tézisei. Molnár Imre. Témavezető: Dr. Mihály József

A biológiai mozgások. Motorfehérjék. Motorfehérjék közös tulajdonságai 4/22/2015. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai. Szerkezeti homológia

Makromolekulák. Fehérjetekeredé. rjetekeredés. Biopolimer. Polimerek

Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék

ÖSSZ-TARTALOM. 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás 4. Idegi kommunikáció 3.

Tubulin, mikrotubuláris rendszer és mikrotubulus asszociált fehérjék

A citoszkeleton. A citoszkeleton, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása. A citoszkeleton. A citoszkeleton. Az aktin.

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA AZ IZOMMŰKÖDÉS 1. kulcsszó cím: A SZERVEZETBEN ELŐFORDULÓ IZOM- SZÖVETEK TÍPUSAI 1. képernyő cím: Sima izomszövet

Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015

Immunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer

INTRACELLULÁRIS PATOGÉNEK

Biofizika I. DIFFÚZIÓ OZMÓZIS

Tubulin, mikrotubuláris rendszer és mikrotubulus asszociált fehérjék

A motorfehérjék definíciója. A biológiai motorok 12/9/2016. Motorfehérjék. Molekuláris gépek. A biológiai mozgás

ÖSSZ-TARTALOM 1. Az alapok - 1. előadás 2. A jelutak komponensei 1. előadás 3. Főbb jelutak 2. előadás

A DISHEVELLED-ASSOCIATED ACTIVATOR OF MORPHOGENESIS FORMIN SZEREPE AZ AKTIN ÉS MIKROTUBULUS SEJTVÁZ DINAMIKAI SZABÁLYOZÁSÁBAN.

Jelutak ÖSSZ TARTALOM. Jelutak. 1. a sejtkommunikáció alapjai

Izomműködés. Az izommozgás. az állati élet legszembetűnőbb külső jele a mozgás amőboid, ostoros ill. csillós és izomösszehúzódással

MULTICELLULÁRIS SZERVEZŐDÉS: SEJT-SEJT (SEJT-MÁTRIX) KÖLCSÖNHATÁSOK 1. Bevezetés (2.)Extracelluláris mátrix (ECM) (Kollagén, hialuron sav,

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

A MASP-1 dózis-függő módon vazorelaxációt. okoz egér aortában

Peptid- és fehérjék másodlagos-, harmadlagos- és negyedleges szerkezete

Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet

Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

-Két fő korlát: - asztrogliák rendkívüli morfológiája -Ca szignálok értelmezési nehézségei

Biofizika (molekuláris biofizika és biológiai anyagtan) 2014, tavaszi szemeszter

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

Sejtváz Sejtek mozgása

MedInProt Szinergia IV. program. Szerkezetvizsgáló módszer a rendezetlen fehérjék szerkezetének és kölcsönhatásainak jellemzésére

Hámszövet, mirigyhám. Dr. Katz Sándor Ph.D.

A Földön előforduló sejtek (pro- és eukarioták) közös és eltérő tulajdonságai. A sejtes szerveződés evolúciója.

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése

Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Az Alapozó modul tárgyai (kötelező tárgyak és kritérium kötelemények)

K68464 OTKA pályázat szakmai zárójelentés

Biomolekuláris nanotechnológia. Vonderviszt Ferenc PE MÜKKI Bio-Nanorendszerek Laboratórium

FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,

Retinoid X Receptor, egy A-vitamin szenzor a tüdőmetasztázis kontrolljában. Kiss Máté!

Sejtmag, magvacska magmembrán

Fényérzékeny amorf nanokompozitok: technológia és alkalmazásuk a fotonikában. Csarnovics István

A sejtváz. Mikrotubulusok (25 nm átmérő) Mikrofilamentumok (7 nm átmérő) Intermedier filamentumok (8-12 nm átmérő)

Miben különbözünk az egértől? Szabályozás a molekuláris biológiában

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

Epigenetikai Szabályozás

Elméleti és kísérletes módszerek lipidek és membránfehérjék tanulmányozására

Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)

Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák

Ciklodextrinek alkalmazási lehetőségei kolloid diszperz rendszerekben

Ph.D. disszertáció tézisei

Átírás:

Listeria monocytogenes Loisel, Boujemaa et al. Nature 1999 Összetett aktin hálózatok Spire/formin szinergia Reymann et al. Nature Materials 1 ADF/aktin Bosch, Bugyi B et al. Molecular Cell 7 Reymann et al. MBC 1 Lamellipodium/lamella Akto miozin kontraktilitás PTE ÁOK Biofizikai Intézet beata.bugyi@aok.pte.hu Bugyi B et al. EMBO Journal 1 "Tudjunk Egymásról - Magyar Tudomány Ünnepe - 1. november. Reymann et al. Science 1 AKTIN LENYŰGÖZŐ FUNKCIONÁLIS POLIMORFIZMUS mechanikai stabilitás polaritás alak sejtmozgás fillopodium lamellipodium lamella stressz rostok intracelluláris pathogének mozgása sejtosztódás sejt-sejt kapcsolatok kontraktilitás fagocitózis endocitózis endoszóma podoszóma Golgi sejtmag és AKTIN-SZABÁLYOZÓ FEHÉRJÉK TÁRHÁZA Renault L., Bugyi B. és mtsai. Trends in Cell Biology 9, Hild G., Bugyi B. és mtsai. Cytoskeleton 1 1

FUNKCIÓ vizsgálatok küvettában EGYEDI FEHÉRJÉKEN MESTERSÉGES-EGYSZERŰ KEVÉS ÖSSZETEVŐ ISMERT KOMPONENSEK eredmény: GÖRBÉK vizsgálatok ÉLŐ SEJTBEN TERMÉSZETES-KOMPLEX SZÁMTALAN ÖSSZETEVŐ ISMERETLEN KOMPONENSEK eredmény: KÉP ISMERT KOMPONENSEK sejtmentes, tisztított komponensek, fehérjék szabályozott biokémiai környezet TERMÉSZETES-KOMPLEX lépésről-lépésre növelve a rendszer minőségi/mennyiségi összetettségét (fehérjék, izoformák, mutációk, kémiai komponensek) a fehérjerendszerek közötti (antagonisztikus/szinergikus) komplex hatások eredményeképpen a rendszer önszerveződése révén a sejten belüli környezet rekonstruálása eredmény: KÉP szerkezet dinamika molekuláris összetétel R. P. Feynman

mikrogyöngy KÖZEG funkcionalizált mikrogyöngyök aktin + szabályozó fehérjék ATP katalizátor Arp/3 komplex aktivátor (N-WASP) FORMIN (mdia1, DAAM) + F-aktin sapka fehérje ADP Arp/3 profilin ADF + ATP ATP aktin monomer GYÖNGYFELSZÍN aktin filamentum képződés aktin hálózat AKTIN CSÓVA Arp/3 aktiváció elágazó filamentumok GYÖNGYMOZGÁS Bugyi B. és mtsai. FEBS Letters 8 3

N GENETIKAI aspektus gén (TPM1-) alternativ splicing >izoformaemlősökben HMW: 1a/1b LMW: a/b SZERKEZETI aspektus alfa-helikális polipeptid lánc, coiled-coil elrendezésben kooperatív aktin filamentum kötés head-to-tail (C-N) kölcsönhatás FUNKCIONÁLIS aspektus FUNKCIONÁLIS DIVERZITÁS C Schevzov és mtsai. Bioarchitecture11. Whitby és mtsai. Proteins. PDB: 1C1G kontroll endogén tropomiozin MEMBRÁN KITÜREMKEDÉSEK LAMELLIPODIUM Arp/3 komplex LAMELLA? Stephanie Gupton és mtsai. Journal of Cell Biology 5

kontroll endogén tropomiozin MEMBRÁN KITÜREMKEDÉSEK többlet tropomiozin mikroinjektált PtK1 epitéliális sejtek Stephanie Gupton és mtsai. Journal of Cell Biology 5 MEMBRÁN KÖZELI AKTIN HÁLÓZAT MOLEKULÁRIS ÖSSZETÉTEL Arp/3 komplex és cofilin tropomiozin DINAMIKA aktin turnover polimerizációra képes filamentum végek SZERKEZET egyenletes fűrészfogszerű LAMELLIPODIUM LAMELLA Stephanie Gupton és mtsai. Journal of Cell Biology 5 5

pyrenyl fluorescence, a.u. 35.5 μm actin 97 nm His-VCA 3 5 nm Arp/3 5 15 [sktm], μm 1.7.1 5 control:.9 actin.99 + His-VCA.1 1 3 time, s [filament end], nm,3,,1 LASSABB filamentumképződés,,,5 1, 1,5,,5 [sktm], μm TROPOMIOZIN egyedi fehérje: lassabb filamentumképződés Arp/3 komplex gátlása? sejtben: gyorsabb kitüremkedések 6

alacsony Arp/3 - N-WASP sűrűség (d = 6 nm) bead velocity, μm / min 8 6 ALACSONY Arp/3 - N-WASP low N-WASP 1 3 [sktm], μm scale bar: μm LASSABB MOZGÁS alacsony Arp/3 - N-WASP sűrűség (d = 6 nm) GYORSABB MOZGÁS magas Arp/3 - N-WASP sűrűség (d = 3 nm) scale bar: μm bead velocity, μm / min 8 6 MAGAS high N-WASP Arp/3 - N-WASP ALACSONY Arp/3 - N-WASP low N-WASP 1 3 [sktm], μm LASSABB MOZGÁS 7

GYÖNGY AKTIN HÁLÓZAT branching disszociáció növekedés kötött filamentum ATTACHMENT FORCE szabad filamentum POLYMERISATION FORCE ALACSONY Arp/3-N-WASP SŰRŰSÉG distance between N-WASP molecules, nm 16 6 6 MAGAS Arp/3-N-WASP SŰRŰSÉG az elágazások létrejöttének alacsony frekvenciája korlátozza a mozgást bead velocity, μm / min 5 3 1 elágazások létrejöttének magas frekvenciája korlátozza a mozgást 5 1 15 [N-WASP], nm 8

ALACSONY Arp/3-N-WASP SŰRŰSÉG distance between N-WASP molecules, nm 16 6 6 MAGAS Arp/3-N-WASP SŰRŰSÉG az elágazások létrejöttének alacsony frekvenciája korlátozza a mozgást + TROPOMIOZIN LASSABB bead velocity, μm / min 5 3 1 [sktm], μm:,.87 5 1 15 [N-WASP], nm elágazások létrejöttének magas frekvenciája korlátozza a mozgást + TROPOMIOZIN GYORSABB 6. 16.1 [ADF].5 [tropomiozin] az aktin hálózat kezdeti pozíciója [c], μm 9

[tropomiozin], μm.7 sktm Arp/3 merge.5 1.1 7 "half distance" "half time" 5 [sktm],μm:.7,.56, 1.9 6 35 sktm : Arp/3 3 1 6 8 1 1 distance, μm L 1/, μm 5 3 1 t 1/, min,,5,5,75 1, [sktm], μm 3 5 15 1 5,,5,5,75 1, [sktm], μm t 1/ = 1 ± 1 min tropomiozin kötés: t 1/ = 1 ± 1 min ~ elágazások disszociációja oldatban: t 1/ = 13.3 min (Le Clainche és mtsai. PNAS 3) 1

KONTROLL TÖBBLET TROPOMIOZIN KONTROLL TÖBBLET TROPOMIOZIN Bugyi B. és mtsai. EMBO Journal 1 SEJT MOLEKULÁRIS MODELL LAMELLIPODIA LASSÚ KITÜREMKEDÉSEK GÁTOLT LAMELLIPODIA GYORS KITÜREMKEDÉSEK BIOMIMETIKUS RENDSZER WAVE-Arp/3 LASSÚ MOZGÁS KONTROLL GÁTOLT WAVE-Arp/3 GYORS MOZGÁS TÖBBLET TROPOMIOZIN 11

Marie-France Carlier Cytoskeleton dynamics and motility group LEBS CNRS, Gif sur yvette, France Nyitrai Miklós PTE ÁOK Biofizikai Intézet Vig Andrea Huber Tamás Tóth Mónika Erostyák János PTE TTK Kísérleti Fizika Intézet Peter Gunning Department of Pharmacology, Sydney, Ausztrália Mihály József SZBK, Szeged Jan Faix Hannover Department of Biophysical Chemistry, Medizinische Hochschule, Hannover, Németország OTKA-PD8368 NKTH-REG-DD-9-1-9-9-Tirfm_9 Bolyai János Posztdoktori Ösztöndíj, MTA PTE ÁOK Posztdoktori Ösztöndíj European Molecular Biology Organisation La Ligue contre le Cancer TÁMOP-... B-1/1-1-9 TÁMOP-..1. B-1//KONV-1- TÁMOP-..-8/1-8-11 1