A Drosophila melanogaster kalpainok és a sejtvándorlás

Hasonló dokumentumok
A határsejtvándorlás szabályozásában résztvevœ gének azonosítása és jellemzése ecetmuslicában

Fehérje módosító enzimek vizsgálata Drosophila fajokban

A TATA-kötő fehérje asszociált faktor 3 (TAF3) p53-mal való kölcsönhatásának funkcionális vizsgálata

Az anafázis promoting complex (APC/C) katalitikus modulja Drosophila melanogasterben. Nagy Olga

KALPAINOK SZABÁLYOZÁSA: AZ ENZIM AKTIVÁLÁSA IN VITRO ÉS IRÁNYÍTÁSA IN VIVO

Egy Polycomb Response Element (PRE) in situ vizsgálata Drosophila melanogaster-ben génkonverzió segítségével. Kozma Gabriella

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben

A DmUsp5 dezubikvitiláz fiziológiai funkciójának meghatározása Drosophila melanogasterben. Kovács Levente

Az ADA2b adaptor fehérjéket tartalmazó hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepének vizsgálata Drosophila melanogaster-ben

Kutatási beszámoló A p50gap intracelluláris eloszlásának és sejtélettani szerepének vizsgálata

A KALPAIN ÉS A PROTEIN KINÁZ/FOSZFATÁZ RENDSZEREK VIZSGÁLATA

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

Növényvédelmi Tudományos Napok 2014

Poligénes v. kantitatív öröklődés

A Drosophila melanogaster poszt-meiotikus spermatogenezisében szerepet játszó gének vizsgálata. Ph.D. értekezés tézisei.

Gyógyszerrezisztenciát okozó fehérjék vizsgálata

Dr. Máthé Endre

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA

A Drosophila mir-282 mikrorns gén szerkezeti és funkcionális jellemzése. Bujna Ágnes

Receptorok és szignalizációs mechanizmusok

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

A DAAM formin alcsalád szerepe az izomfejlődésben. A Ph.D. értekezés tézisei. Molnár Imre. Témavezető: Dr. Mihály József

TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)

A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER (Nyitrai Miklós, )

Intelligens molekulákkal a rák ellen

Tartalom. A citoszkeleton meghatározása. Citoszkeleton. Mozgás a biológiában A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 12/9/2016

A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban

Zárójelentés a Hisztamin hatása a sejtdifferenciációra, összehasonlító vizsgálatok tumor - és embrionális őssejteken című számú OTKA pályázatról

Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák

A humán P53 fehérje transzkripció elongációban betöltött, eddig nem azonosított szerepének jellemzése

Immunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer

A citoszol szolubilis fehérjéi. A citoplazma matrix (citoszol) Caspase /Kaszpáz/ 1. Enzimek. - Organellumok nélküli citoplazma

ÖNÉLETRAJZ. Gyermekei: Lőrinc (1993), Ádám (1997) és Árpád (1997) Középiskola: JATE Ságvári Endre Gyakorló Gimnáziuma,

Kutatási beszámoló ( )

2. A jelutak komponensei. 1. Egy tipikus jelösvény sémája 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék

A glükóz reszintézise.

A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D.

A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban

KIS GTP-KÖTŐ FEHÉRJE SZEREPE A NÖVÉNYI CIRKADIÁN ÓRA, STRESSZ-VÁLASZOK ÉS A FÉNYFÜGGŐ ENDOREDUPLIKÁCIÓ SZABÁLYOZÁSÁBAN

In vivo szövetanalízis. Különös tekintettel a biolumineszcens és fluoreszcens képalkotási eljárásokra

A Huntington kór patogenezisének vizsgálata Drosophila modell felhasználásával

Xenobiotikum transzporterek vizsgálata humán keratinocitákban és bőrben

Ph.D. disszertáció tézisei

Biomolekulák kémiai manipulációja

Tartalom. Javítóvizsga követelmények BIOLÓGIA...2 BIOLÓGIA FAKULTÁCIÓ...5 SPORTEGÉSZSÉGTAN évfolyam évfolyam évfolyam...

A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet. 9. A sejtmozgás mechanizmusai

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

A T sejt receptor (TCR) heterodimer

In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.

15. Fehérjeszintézis: transzláció. Fehérje lebontás (proteolízis)

A bírálatban felvetett kérdéseket a következőképpen válaszolom meg.

Hamar Péter. RNS világ. Lánczos Kornél Gimnázium, Székesfehérvár, október

AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA

Az enzimműködés termodinamikai és szerkezeti alapjai

Evolúcióelmélet és az evolúció mechanizmusai

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

Immunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer

Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben. Doktori tézisek. Dr. Szidonya László

~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

RÉSZLETES SZAKMAI BESZÁMOLÓ

Molekuláris genetikai vizsgáló. módszerek az immundefektusok. diagnosztikájában

Az anti-apoptózis mechanizmus vizsgálata agyi ischaemia/hypoxia modellekben

13. RNS szintézis és splicing

PROGRAMFÜZET. "GENETIKAI MŰHELYEK MAGYARORSZÁGON" XIII. Minikonferencia SZEPTEMBER 12.

Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése

Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék

Jelutak. 2. A jelutak komponensei Egy tipikus jelösvény sémája. 2. Ligandok 3. Receptorok 4. Intracelluláris jelfehérjék

Dr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai

Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

Spondylitis ankylopoeticahoz társuló osteoporosis

MULTICELLULÁRIS SZERVEZŐDÉS: SEJT-SEJT (SEJT-MÁTRIX) KÖLCSÖNHATÁSOK 1. Bevezetés (2.)Extracelluláris mátrix (ECM) (Kollagén, hialuron sav,

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

TUMORSEJTEK FENOTÍPUS-VÁLTOZÁSA TUMOR-SZTRÓMA SEJTFÚZIÓ HATÁSÁRA. Dr. Kurgyis Zsuzsanna

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Bioinformatika előadás

Zsírsav szintézis. Az acetil-coa aktivációja: Acetil-CoA + CO + ATP = Malonil-CoA + ADP + P. 2 i

TAF10 fehérjék szerepe Drosophila melanogaster-ben

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

transzporter fehérjék /ioncsatornák

A Thiocapsa roseopersicina[nife]- hidrogenázainak szerepe a sejt metabolikus folyamataiban

Az X kromoszóma inaktívációja. A kromatin szerkezet befolyásolja a génexpressziót

Ph.D. értekezés tézisei. A c-típusú citokrómok biogenezisében résztvevő fehérjék. szerepe és génjeik szabályozása Sinorhizobium meliloti-ban

Antiszenz hatás és RNS interferencia (a génexpresszió befolyásolásának régi és legújabb lehetőségei)

Biológiai módszerek alkalmazása környezeti hatások okozta terhelések kimutatására

Intézeti Beszámoló. Dr. Kovács Árpád Ferenc

KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára ROP GTPÁZOK ÁLTAL KÖZVETÍTETT JELÁTVITEL NÖVÉNYEKBEN

Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025)

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Tudománytörténeti visszatekintés

Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben

III. A tudományos tények, melyek ezt az áttörést visszafordíthatatlanná teszik

A Drosophila telomer védelmét szolgáló fehérjék fajképzésben betöltött lehetséges szerepének vizsgálata

Biokémiai kutatások ma

Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata

Silhavy Dániel. A növényi génexpresszió RNS-szintű minőségbiztosítási rendszereinek molekuláris biológiája. című Doktori Értekezésének bírálata.

Átírás:

Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei A Drosophila melanogaster kalpainok és a sejtvándorlás Páldy Ferencz Sándor Témavezetők: Prof.Dr. Gausz János Dr. Ádám Géza Biológia Doktori Iskola SZTE-TTIK 2013

1. Előzmények Az élővilágban a proteolítikus (fehérjebontó) enzimeknek kulcsszerepük van számos léfontosságú folyamatban, mint pl. a táplálékban található fehérjék lebontásában, a fehérjék szintézis utáni módosításában, a sejtciklus szabályozásában, a metasztázis kialakulásában stb. A proteázok kétféle módon fejthetik ki hatásukat: korlátozottan (főleg szabályozó proteázok) ill. korlátlanul (lebontó proteázok). Nagyfokú heterogenitásuk miatt az osztályozásuk több szempont alapján történik. A katalízis kémiai mechanizmusa szerint megkülönböztethetjük a szerin -, cisztein -, treonin -, aszpartát -, aszparagin - és metalloproteázokat. A katalízis lokalizációja szerint vannak exo-, endo- és omegapeptidázok. Rendellenes működésük súlyos betegségekkel van asszociálva. A mátrix metalloproteázok részt vesznek úgy a rákos daganatok kialakulásában, mint azok gátlásában is (pl. MMP9, MMP12, MMP26). A cisztein proteázok szerepet játszanak a heveny hasnyálmirigy-gyulladásban, maláriában. A szerin proteázok befolyásolják a trombózis, 2-es típusú cukorbetegség kialakulását. A kalpainok neutrális ph optimumon (ph 7,1-7,3), a citoszólban működő és Ca 2+ által aktivált cisztein proteázok. Valamennyi eukariótában, egyes baktériumokban és

növényekben is jelen vannak. Drosophilában 4 kalpain gén (CalpA, CalpB, CalpC, CalpD) található, amelyek közül csak 2 kódol egyszerre tipikus és működőképes fehérjéket (CalpA és CalpB). Mivel a Drosophila-ból hiányzik az emlős kalpainoknál jelen levő kis regulátor alegység, feltehetően monomerként működnek. A tipikus kalpainokon 4 domént (DI, DII, DIII, DIV) különböztethetünk meg, amelyek közül a DII tartalmazza a funkcióért felelős katalitikus aminosav triádot (Cys, His, Asn). Az aktivációhoz szükséges Ca 2+ -ot elsősorban a DIV köti meg. A kalpainok és a sejtvándorlás kapcsolatára már '90-es években fény derült. Kínai hörcsög - (CHO) és egér embrionális fibroblaszt sejtvonalakon kísérletezve kimutatták, hogy a kalpainok inhibíciója a sejtek vándorlását akadályozza. 2. Célkitűzések a Drosophila kalpainok összehasonlítása az emlős kalpainokkal a két típikus és működőképes Drosophila kalpain (CalpA, CalpB) szerepének vizsgálata

a CalpA és CalpB közötti feltételezhető funkcionális redundancia tanulmányozása in vivo tanulmányozni a kalpainok hatását a sejtvándorlásra lehetséges genetikai interakciós partnerek azonosítása a kalpainok hatásmechanizmusának részletesebb feltárása 3. Alkalmazott módszerek Ováriumok boncolása és festése Klónozás PCR RT-PCR SDS-PAGE és Western blot Immunprecipitáció Talin in vitro emésztése Általános kalpain aktivitás mérés

4. Eredmények a. A Drosophila kalpainok nem esszenciálisak. A CalpA génből a p{supor-p}kg 05080, míg a CalpB génből a p{epgy2}ey 08042 transzpozont remobilizáltuk. Mindkét esetben a P-elemek pontatlan kivágódásával deléciós vonalakat hoztunk létre. A CalpA 808 mutánsban egy 2.490 bp méretű deléciót képeztünk, amely a P-elemtől mindkét irányba terjedt. Így nem csak a CalpA génből hiányzott egy szakasz, hanem a szomszédos hts génből is. A CalpA-hts kettős mutánsok nőstényei sterilek voltak, de a hts gén részleges pótlása menekítette a fenotípust. A CalpA mutánsról nem képződött mrns (RT- PCR) ill. fehérje átíródása sem volt detektálható (SDS-PAGE és Western blot). A CalpB-nél több deléciós vonalat (CalpB 505, CalpB 502, CalpB 392, CalpB 389, CalpB 361 ) izoláltunk, mint a CalpA esetében. Ezek közül a CalpB 505 vonal egy 1.047 bp deléciót, míg a CalpB 361 egy 922 bp deléciót hordozott. A CalpB mutánsokról képződtek csonka mrns-ek, de ezekről semmilyen transzláció nem volt megfigyelhető. Úgy a CalpA, mint a CalpB deléciója életképességgel és fertilitással járt, ezért kijelenthetjük, hogy a gének nem esszenciálisak.

b. A CalpB deléciója következtében lecsökken az altalános kalpain aktivitás. A Dabcyl-TPLKSPPPSPRE-EDANS mesterségesen előállított általános kalpain szubsztrát hasítása az EDANS által kibocsátott fluoreszcens szignál növekedésével jár. Ez azért lehetséges, mivel az érintetlen szubsztrátmolekulákban a Dabcyl elnyeli az EDANS által kibocsátott energiát (FRET). Ennek a szubsztrátumnak a felhasználásával két különböző CalpB mutánsban is (CalpB 505, CalpB 502 ) kimutattuk, hogy a kalpain aktivitás az eredeti érték felére csökkent. Ez a reziduális aktivitás vagy a CalpA fehérjének vagy/és a mutánsokban jelen levő funkcionális CalpD-nek tulajdonítható. c. A CalpB részt vesz a határsejtek vándorlásának szabályozásában. Annak ellenére, hogy a CalpA és a CalpB deléciója nem okozott látható fenotípust, nem zárható ki, hogy valamilyen strukturális ill. funkcionális változás mégis bekövetkezett. Sejtvonalakon végzett kísérletekből már ismert volt a kalpainok hatása a sejtvándorlásra, ezért megvizsgáltuk, hogy a kalpain deléciós mutánsainkban történik-e valamilyen rendellenesség a határsejtek vándorlásában. Míg a CalpA 808 esetében nem tapasztaltunk semmilyen rendellenességet, a CalpB 505 és CalpB 361 mutánsokban a határsejtek már jelentős

mértékben késtek. A megvizsgált petekamrák 30-40%-ban volt különböző mértékű késés tapasztalható. A legnagyobb arányban azok a mutánsok voltak képviselve, amelyekben a határsejtek az út 75%-át teljesítették, míg a legkisebb arányban azok, amelyekben egyáltalán nem történt vándorlás. A megvizsgált CalpA- CalpB kettős mutánsokban a késést mutató petekamrák aránya ugyancsak 30-40% volt, ami csak a CalpB deléciójának köszönhető. Ez a fenotípus menekíthető volt, ha a szervezetbe visszajuttattuk a vad CalpB gént. A határsejtekben kifejeztetett (driver törzs slbo-gal 4 ) CalpA és CalpB RNS i (RNS interferencia) konstrukciók reprodukálták a deléciók által okozott fenotípust. d. A CalpA és CalpB gének funkcionálisan nem redundánsak. A redundancia hiányát több eredmény is alátámasztja: a CalpA-CalpB kettős mutánsok az egyes mutánsokkal összhangban, életképesek és fertilisek voltak a CalpA-CalpB kettős mutánsokban, csak a CalpB deléciójára jellemző 30-40%-os határsejt vándorlási késés volt tapasztalható

e. A CalpB a fokális adhézió egyes komponenseinek interakciós partnere. A genetikai interakciót vizsgáló kísérleteinket 3 fokális adhézió komponensre terjesztettük ki: a β-ps-integrint kódoló myospheroid (mys) génre, az α-ps2 integrint kódoló inflated (if) génre és a talint kódoló rhea génre. Mindhárom esetben a genetikai kölcsönhatás létrejött, amelynek következtében a CalpB deléciójára jellemző 30-40%-os arányú határsejt vándorlási késés 58-75%-ra emelkedett. A megemelkedett penetrancia mellett az expresszivitás is megnövekedett. f. A CalpB hasítja a talint és ezáltal integrin szabadul fel. Mivel a talin a CalpB szubsztrátja megvizsgáltuk, hogy az általunk alkalmazott rendszerben a két fehérje fizikai kölcsönhatásba lép-e egymással. Immunprecipitációval sikerült kimutatnunk, hogy a talin kölcsönhatásba lép a CalpB-vel és azt is sikerült bizonyítanunk (SDS Page, Western blot), hogy a CalpB hasítja a talint. Vad típusú legyekben, a vándorló határsejtek csoportja mögött integrin foltok figyelhetők meg. A fokális adhéziókban, a talin köti össze az integrin fehérjék egyik végét a sejtek aktin sejtvázával. Az integrinek másik vége azzal a felülettel érintkezik, amelyen a sejtek vándorolnak. Ahhoz, hogy az integrin a

vándorlás során felszabaduljon, a talinnak valószínűleg hasadnia kell. Ez biztosíthatja a vándorlási felület és a sejtek közötti kapcsolat fellazulását. A CalpB deléciós mutánsokban ezeknek az integrin foltoknak a képződése elmaradt. Ez talán annak tulajdonítható, hogy a hiányzó kalpain aktivitás miatt a talin nem hasad, aminek következtében az integrin nem tud felszabadulni. Ennek következtében a kapcsolat a sejtek és a vándorlási felület között stabilizálódik, ami a vándorló sejtek lemaradó végének a lassabb visszahúzódásához vezet. Ez pedig végeredményben a határsejtek vándorlásának a lelassulásával jár. Ha a mutánsokba visszajuttatuk a talin fehérje feji részét, az menekítette a fenotípust és a normális szintű integrin felszabadulás helyreállt. Munkánk során azonosítottuk a sejtvándorlás egy újabb regulátorát és ezzel eredményeink hozzájárulnak ennek a rendkívül fontos eseménynek a megismeréséhez.

Közlemények 1. Kókai E., Páldy * F. S., Somogyi K., Chougule A., Pál M., Kerekes É., Deák P., Friedrich P., Dombrádi V., Ádám G. CalpB modulates border cell migration in Drosophila egg chambers. BMC Dev Biol 12, 20 (2012). IF 2.79 2. Lovdok L., Bentele K., Vladimirov N., Müller A., Pop F. S., Liebidz D., Kollmann M., Sourjik V. Role of translational coupling in robustness of bacterial chemotaxis pathway. PLoS Biol 7 (2009). IF 12.91 * - névváltoztatás (Páldy, szül. Pop) - osztott elsőszerzősség Poszterek 1. Kókai Endre, Pappné Sinka Rozália, Ádám Géza, Pop Ferencz, Gausz János, Dombrádi Viktor: A Drosophila CG9238 gén terméke kölcsönhat a protein foszfatáz 1 enzimmel, VI. Magyar Genetikai Kongresszus és XIII. Sejt- és Fejlődésbiológiai Napok (2005. április 10-12), Eger

Előadások 1. Ferencz Pop, János Gausz, Viktor Dombrádi, Péter Friedrich, Géza Ádám: Genetic and molecular characterization of CalpA and CalpB genes in Drosophila, 12 th Regional Drosophila Meeting (24-25.11.2006), Vienna, Austria 2. Pop Ferencz, Molnár Imre, Kókai Endre, Dombrádi Viktor, Farkas Attila, Friedrich Péter, Gausz János, Ádám Géza: A Drosophila CalpA és CalpB gének genetikai és molekuláris jellemzése, VII. Magyar Genetikai Kongresszus és XIV. Sejt- és Fejlődésbiológiai Napok (2007. április 15-17), Balatonfüred, Magyarország 3. Pop Ferencz, Somogyi Kálmán, Kókai Endre, Dombrádi Viktor, Farkas Attila, Friedrich Péter, Gausz János, Ádám Géza: Drosophila kalpainok es a sejtvandorlas, VII. Genetikai Műhelyek Magyarországon, Minikonferencia (2008.09.07), Szeged, Magyarország