Hazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok



Hasonló dokumentumok
A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,

Génmódosítás: bioszféra

Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik

Az emberi erőforrás értéke

Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)

DEBRECENI EGYETEM ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA. Doktori Iskola vezető: Dr. Kovács András egyetemi tanár, az MTA doktora

Szent István Egyetem. Az ivarérés idejét maghatározó QTL-ek genetikai térképezése tyúkban. Szabó Gyula Doktori értekezés

Tudományközi beszélgetések

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

Közös stratégia kifejlesztése molekuláris módszerek alkalmazásával a rák kezelésére Magyarországon és Norvégiában

A BÚZA SZEMFEJLŐDÉS KORAI LÉPÉSEINEK ÉS STRESSZÉRZÉKENYSÉGÉNEK VIZSGÁLATÁRA ALKALMAS cdns-chip KIFEJLESZTÉSE. GVOP Projekt Esettanulmány

BEVEZETÉS CÉLKITŰZÉS

A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)

A genetikai vizsgálatok jelene, jövője a Ritka Betegségek vonatkozásában

Nemzeti Közszolgálati Egyetem Hadtudományi és Honvédtisztképző Kar Hadtudományi Doktori Iskola

Napraforgó vetômag A termôterületnek, ahol a vetômagot elôállították, mentesnek kell lennie napraforgó

FŐÚRI LAKÁSKULTÚRA MAGYARORSZÁGON A DUALIZMUS IDŐSZAKÁBAN

VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE

10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai

A sejtek lehetséges sorsa. A sejtek differenciálódása. Sejthalál. A differenciált sejtek tulajdonságai

ŐSHONOS ÉS RÉGHONOSULT BAROMFIFAJOK FENNTARTÁSA A DEBRECENI AGRÁRTUDOMÁNYI CENTRUMBAN

NÖVÉNYNEMESÍTÉS. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

1./ A neuron felépítése. Típusai. A membrán elektromos tulajdonságai: a nyugalmi és akcióspotenciál kialakulása. Idegrostok és típusai.

Nagy Emese: Polimorfizmus és rokonsági körök vizsgálata kukoricában (Zea mays) Témavezetők: Cs. L. Marton G Gyulai

KOLESZÁR ÁGNES A VÁLLALKOZÓ EGYETEM BELSŐ IRÁNYÍTÁSÁNAK PH.D. ÉRTEKEZÉS TÉZISEI MISKOLC MISKOLCI EGYETEM GAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR

Proteomkutatás egy új tudományág születése

A Nyíregyházi Szakképzési Centrum Pedagógiai Programja 2015.

II. A rendelkezésre álló pénzügyi források és azok megoszlása

Élelmiszer az Életért. Európai Technológiai Platform. Megvalósítási Terv

A genomikai oktatás helyzete a Debreceni Egyetemen

Központi Statisztikai Hivatal. A gazdaság szerkezete az ágazati kapcsolati. mérlegek alapján

Mangalica specifikus DNS alapú módszer kifejlesztés és validálása a MANGFOOD projekt keretében

Egy Polycomb Response Element (PRE) in situ vizsgálata Drosophila melanogaster-ben génkonverzió segítségével. Kozma Gabriella

BIOTECHNOLÓGIA: a jövő slágerágazata. Megrendelő: INNOVA Észak-Alföld Regionális Fejlesztési és Innovációs Ügynökség Nonprofit Kft.

Kézben tartott nemlineáris mikroszkópia Szerző: Szegedi Imre

PROGRAMLEÍRÁS ÉS FELVÉTELI ELJÁRÁS

VIII. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Fény a kutatásban és a diagnosztikában

Az oktatásügy válaszai egy évtized társadalmi kihívásaira

A 2012/3. SZÁM TARTALMA. Hajtós I.: A schmallenbergvírus és az általa okozott betegség nyugateurópai

Védjegyoltalmak és a regionális innovációs aktivitás

AZ EMBERI MIKROBIOM: AZ EGYÉN, MINT SAJÁTOS ÉLETKÖZÖSSÉG Duda Ernő

Kutatási zárójelentés

DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS DR. KOMAREK LEVENTE

irányítószám: 7621 Telefon:

HELYZETE ÉS LEHETSÉGES JÖVŐBELI TRENDJEI A NYUGAT-DUNÁNTÚLI RÉGIÓBAN

NEMZETI STRATÉGIA A KÁBÍTÓSZER-PROBLÉMA VISSZASZORÍTÁSÁRA A KORMÁNY KÁBÍTÓSZER-ELLENES STRATÉGIÁJÁNAK KONCEPCIONÁLIS ALAPJAI

AZ ŐSHONOS KENDERMAGOS MAGYAR TYÚK TARTÁSA HÓDMEZŐVÁSÁRHELYEN A SZEGEDI TUDOMÁNYEGYETEM MEZŐGAZDASÁGI FŐISKOLAI KARÁNAK TANÜZEMÉBEN

A transzgénikus (GM) fajták fogyasztásának élelmiszer-biztonsági kockázatai

Tatai Kistérségi Többcélú Társulás Esélyegyenlőségi Programja

JEGYZŐ KÖNYV az EOQ MNB Közgyű lésérő l

Multiscript rekordok az ALEPH integrált könyvtári rendszerben: közös katalógus építése az ELTE Egyetemi Könyvtári Szolgálatában

A Szekszárdi I. Béla Gimnázium Helyi Tanterve

A HUMÁN GENOM PROJEKT Sasvári-Székely Mária* Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet

Szakmai zárójelentés A kutyaszemélyiség mint az emberi személyiségvizsgálatok modellje: etológiai, pszichológiai és genetikai megközelítés

ELSŐ IDEGEN NYELV évfolyam

J/55. B E S Z Á M O L Ó

1 Havasi: A magyarországi létminimum-számítás korszakai. című tanulmány melléklete

KÜLKERESKEDELMI FŐISKOLAI KAR

A VIDÉK JÖVÕJE AZ AGRÁRPOLITIKÁTÓL A VIDÉKPOLITIKÁIG

A szeretet intimitása

SZALAY SÁNDOR ÉS A DEBRECENI FIZIKA

++ mm. +m +m +m +m. Hh,fF Hh,fF hh,ff hh,ff. ff Ff. Hh hh. ff ff ff ff. Hh Hh hh hh

Csepeli György *, Prazsák Gergõ ** INTERNET ÉS TÁRSADALMI EGYENLÕTLENSÉG MAGYARORSZÁGON E-VILÁGI TRENDEK 7

Mélyi József A háló és a kamera szeme A jelenlegi fotográfiai intézményrendszerr l A fotográfia intézményrendszerér l tehát mint küls szemlél

ZAJÁCZ EDIT publikációs lista

Dr. Saxné Dr. Andor Ágnes Márta. Immateriális javak a számviteli gyakorlatban

A BIZOTTSÁG KÖZLEMÉNYE A TANÁCSNAK ÉS AZ EURÓPAI PARLAMENTNEK

5. HALANDÓSÁGI KÜLÖNBSÉGEK

AZ EURÓPAI KÖZÖSSÉGEK BIZOTTSÁGA A BIZOTTSÁG KÖZLEMÉNYE AZ EURÓPAI PARLEMENTHEZ ÉS A TANÁCSHOZ. Fenntartható jövő kialakítása az akvakultúra számára

Technológiai Elôretekintési Program EMBERI ERÔFORRÁSOK

MEZÕGAZDASÁGI BIOTECHNOLÓGIÁK

Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok

Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei A BÚZATERMELÉS, A TERMÉNYMANIPULÁCIÓ ÉS A LISZTGYÁRTÁS KOMPLEX ÜZEMTANI ELEMZÉSE.

152/2007. (XII. 22.) FVM rendelet

SZENT ISTVÁN EGYETEM GÖDÖLLŐ. DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS - TÉZISFÜZET

PEDAGÓGIAI PROGRAM SZOMBATHELYI ÉLELMISZERIPARI ÉS FÖLDMÉRÉSI SZAKKÉPZŐ ISKOLA ÉS KOLLÉGIUM

A BIZOTTSÁG 2009/120/EK IRÁNYELVE

Humánpolitika a dolgozó szegények munkahelyein*

XII. Földművelésügyi Minisztérium

ÖSSZEFOGLALÓ...3 I. BEVEZETÉS...5 II. A DAGANATOS MEGBETEGEDÉSEK TÁRSADALMI TERHE HELYZETKÉP...6 III. MIT TESZÜNK?...8

AZ MVM RT. ÁTVITELI HÁLÓZATÁNAK FEJLESZTÉSI STRATÉGIÁJA

EURÓPAI KÖZÖSSÉGEK BIZOTTSÁGA A BIZOTTSÁG KÖZLEMÉNYE

A cigányok foglalkoztatottságáról és jövedelmi viszonyairól A évi országos cigánykutatás alapján

Az összetett szavak orvosi és nyelvészszemmel

A jegybank a belföldi monetáris kondíciók változtatásával igyekszik megakadályozni

Hátterükben egyetlen gén áll, melynek általában számottevő a viselkedésre gyakorolt hatása, öröklési mintázata jellegzetes.

Szerkesztette: Tóth Lászlóné Vízvári László

Téma 2: Genetikai alapelvek, a monogénes öröklődés -hez szakirodalom: (Plomin: Viselekedésgenetika 2. fejezet) *

A replikáció mechanizmusa

Hídvégardói temető melletti földtani képződmény feltárása - természeti emlék természetvédelmi kezelési tervdokumentációja

Vállalkozás alapítás és vállalkozóvá válás kutatás zárójelentés

IDEGENFORGALMI RÉGIÓBAN. Bevezetés...2. Összefoglalás...2

14/2016. (I. 25.) XI.ÖK határozat melléklete. Újbudai Egészségügyi Koncepció Budapest Főváros XI. Kerület Újbuda Önkormányzata

Kokoly Zsolt. Az audiovizuális médiaszolgáltatók feletti területi joghatóság kérdése az Európai Unió médiaszabályozásában. A doktori értekezés tézisei

Ö s s z e f o g l a l á s

Javaslat AZ EURÓPAI PARLAMENT ÉS A TANÁCS RENDELETE. a vadon élő állat- és növényfajok számára kereskedelmük szabályozása által biztosított védelemről

Karmacsi Zoltán Márku Anita szerk., Nyelv, identitás és anyanyelvi nevelés a XXI. században Nemzetközi tudományos konferencia előadásainak gyűjteménye

Az AGNES-program. A program szükségessége

Hodosán Róza. Tízéves a szociális törvény

Átírás:

AKÁCKÖRÚTON Hazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok Előző cikkünkben arról írtunk, milyen új eszköztárral rendelkezünk a XXI. században a genetikai vizsgálatok területén, és mit adhat a molekuláris genetika a méhészeti ágazatnak. A folytatásban arról lesz szó, hogy eddig miféle vizsgálatokat végeztünk, s ezek konkrétan milyen téren lesznek hasznosíthatók a méhészet számára. 18 Méhészújság VERSENYKÉPESSÉG ÉS A HATÉKONYSÁG NÖVELÉSE A hazai méhészeti genomikai és genetikai kutatásokat a Magyar Méhészeti Nemzeti Program keretében a Vidékfejlesztési Minisztérium Mezőgazdasági Főosztálya és az OMME vezetése indította el. Tervezett kutatásaink célja, hogy a hazai méhészeket olyan újonnan kifejlesztett DNS-diagnosztikai eljárásokkal támogassuk, amelyek alkalmazásával versenyképesebbé és hatékonyabbá tehetjük a méhészeti ágazatot a jövőben. Az elsődleges célunk olyan genomi variációk feltérképezése, melyek a későbbiekben DNS-diagnosztikai markerek fejlesztését teszik lehetővé, s a méhek, illetve méhészeti termékek földrajzi eredetének, valamint faji, alfaji, esetleg populációs származásának meghatározásában segítenek. Hosszú távon az ilyen markerek alkalmazhatóak a méhnemesítésben, a méhegészségügyben, továbbá a méhészeti termékek eredetvédelmében. MAGYARORSZÁGI KEZDETEK A magyar méhészeti genetikai kutatások a kilencvenes évek közepén, Gödöllőn, az MBK-ban indultak el dr. Lados Miklós, dr. Borsics Tamás és dr. Ludányi István közreműködésével, akik az eltérő termelési színvonalú méhtájfajták genetikai profilját vizsgálták RAPD technika segítségével. További méhgenetikai kutatásokat folytatott dr. Révay Tamás és dr. Hidas András a KÁTKI-ban. A pannon méhpopuláció genetikai vizsgálatait pedig dr. Zakar Erika és dr. Kusza Szilvia kezdte el a Debreceni Egyetemen. A NAIK-MBK Mezőgazdasági Genomikai és Bioinformatikai Csoportja elsőként kezdte el a haszonállatok (mangalica, duroc) és vadak (gímszarvas, vaddisznó) A Festetics Imre Bio

A KUTATÁS ÚJ TÁVLATAI teljes genomanalízisét az országban; ennek segítségével sikerült olyan DNS-markereket fejlesztenünk, amelyekkel meg lehet határozni, hogy a húskészítmények milyen arányban tartalmaznak mangalicát. Kutatásainkban az az újdonság, hogy a teljes genomok in silico vizsgálatával azonosítani tudjuk az összes DNS-markert (SNP, mikroszatellit, inszerciók, deléciók), majd a változékony (polimorf) helyeket kiválasztva gyorsan olyan DNS-markereket tudtunk fejleszteni, amelyek segítségével az egyes fajokat, alfajokat, fajtákat, egyedeket is azonosítani tudjuk. A keszthelyi Georgikon Kar Biotechnológiai Csoportja már egy évtizede alkalmazza a modern markeralapú szelekciós (MAS) technikákat a gyakorlati nemesítési munkákban. A keszthelyi új burgonyafajták is ezekkel az eljárásokkal készültek a Burgonyakutatási Intézetben. Az előzetesen felhalmozott bioinformatikai és labortapasztalatokat szeretnénk a jövőben a méhészeti genetikai és genomikai kutatásokban kamatoztatni; ezt a gyakorlatban jártas méhészekkel, méhanyanevelőkkel, egyetemekkel együttműködve fogjuk végezni. A GENETIKAI KÓD FELTÖRÉSE A hetvenes években dolgozta ki Frederick Sanger és Alan Coulson azt a technikát, amellyel elsőként meghatározták az első genomot, egy vírusét: a phi X174 bakteriofág teljes genomját (Sanger és Coulson, 1975; Sanger et al., 1977). A Sanger-féle láncterminációs szekvenálási eljárás kidolgozásával pedig lehetővé vált a DNS bázissorrendjének meghatározása (Sanger et innovációs Központ a Georgikon Kar legújabb épülete al., 1977). Ma is használják ezt a módszert a pontossága miatt, rövidebb DNS-szakaszok esetén. A szekvenálás fejlődésével 1990-ben elindulhatott a Humán Genom Projekt, amely 2004-ben fejeződött be (International Human Genome Sequencing Consortium, 2004). A program lezárulása után egyre nagyobb igény mutatkozott az élőlények genomjának megismerésére. Ehhez új módszerek fejlesztésére volt szükség. 2000 után lehetővé vált a DNS-szakaszok párhuzamos meghatározása az új generációs szekvenálórendszerek (NGS-Next-Generation Sequencing) megjelenésével (Mardis, 2008; 2011). Noha már 1977-ben leolvasták, ez csupán 5400 bázisból állt ami akkor nagy áttörésnek számított. Sok idő telt el, míg ennél jóval nagyobb méretű genom leolvasása is megvalósulhatott: a 3,2 milliárd bázisból álló teljes emberi genomszekvenciát 2003-ban tették közzé. A korai szekvenálásokat még olyan technikával érték el, ami egyszerre csak néhány száz bázis leolvasását tette lehetővé. A Humán Genom Projekt több mint egy évtized munkája volt, és kb. 300 milliárd forintnak megfelelő összegbe került. A következő korszak kezdetét a 2000-es években az új generációs (NGS) genomszekvenáló gépek megjelenése jelentette; csak 2008 és 2012 között a költségek négy nagyságrenddel csökkentek. Ma a humán genom szekvenálása 1 millió forint alatt van. Egy kisebb genom szekvenálására, mint akár a házi méhé, már Magyarországon is vannak alkalmas eszközök. DNS: az élet adattárolója 2006-ban egy konzorcium (Honeybee Genome Sequencing Consortium) keretén belül került sor a házi méh (Apis mellifera) teljes genomszekvenciájának meghatározására. A teljes méhgenom mintegy 10 ezer gént tartalmazott, megközelítőleg 236 millió bázispárral. A továbbiakban elkészítettek egy továbbfejlesztett háziméh-referenciagenomot (Amel_4.5), ami jelöli a gének helyét a kromoszómákon. A referenciagenom nem más, mint az előző cikkben vázolt könyvkötetek, amelyek a kromoszómák genomszekvenciáját tartalmazzák. A referenciagenom verziószáma az újabb javításokkal, bővítésekkel nő, olyan, mint egy könyv újabb kiadása. Az első generációs genomszekvencia-összeillesztéseknek és -annotációknak jelentős szerepük volt a szekvenált fajok biológiájának, a fajok közötti filogenetikai kapcsolatoknak a megértésében, illetve a fajon belüli és fajok közötti populációs tanulmányokban. A továbbfejlesztett háziméh-génkészlet felbecsülhetetlen lesz a háziméh-kutató közösségeknek abban a törekvésükben, hogy megmagyarázzák az alapvető biológiai folyamatok mögötti mechanizmusokat, mint a rovarok euszociális viselkedése, valamint a mezőgazdasághoz kapcsolódó kérdéseket, mint például a beporzó egészsége és immunitása (Elsik et al., 2014). Wallberg és munkatársai (2014) az evolúció és az adaptáció genetikai alapjait vizsgálták házi méhben. Ennek során 8,3 millió genetikai eltérés változékonyságát elemezték, 140 Apis mellifera dolgozóméh 2015. november 19

A KUTATÁS ÚJ TÁVLATAI teljes genomszekvenálásával, melyek 14 elkülönült populációból származtak. Elemzésük azt mutatta, hogy a háziméh-populációk mérete sokat változott a múltban, valószínűleg az éghajlatváltozások miatt. Nem találtak bizonyítékot az Apis mellifera korábban feltételezett afrikai eredetére. Számos különbséget határoztak meg az immunitást magukban foglaló génekben az afrikai és európai házi méhek között, melyek megmagyarázhatják a különbségeket a betegségrezisztenciában, illetve -toleranciában. Az afrikai méhek ugyanis különböznek az európai méhektől abban, hogy képesek tolerálni és túlélni a varroaatka-fertőzést és valószínűleg más kórokozóét is. Az itt meghatározott gének és jelölt mutációk további vizsgálata hasznos lesz a háziméh-populációk védelmében a jelenlegi és jövőbeli kihívásokkal szemben, beleértve az éghajlatváltozást és a patogéneket (Wallberg et al., 2014). Összehasonlítva a nyugati mézelő méhet (Apis mellifera) az ázsai keleti mézelő méhvel (Apis cerana), utóbbinak számos megkülönböztető viselkedési jegye van. Képes alkalmazkodni a szélsőséges időjárási viszonyokhoz, hatékony a higénikus viselkedése. Egy jól ismert jelenség az ázsiai méhek körében az összetömörülés, amikor a kolónia veszélynek van kitéve (ragadozó, behatoló). A házi méhvel öszszehasonlítva az ázsiai méh eltérő biológiai tulajdonságai kulcsszerepet játszottak a biológiai sokféleség megőrzésében Kelet- és Dél-Ázsiában. Park és munkatársai (2015) új generációs szekvenálási technológiák segítségével előállították az ázsiai méh genomját nagy szekvencialefedettséggel. A fontos gének jellemzésére fókuszáltak, amelyek az immunitással és a kemoszenszoros vétellel kapcsolatosak. Ez a genomszekvencia felbecsülhetetlen információt jelent a Kelet- és Dél-Ázsiában őshonos méhfaj új jellemzése során. Az adatok forrásként szolgálhatnak az összehasonlító szociogenomikai vizsgálatokban a hét hangya- és a háziméh-fajnál, amelyek genomja már rendelkezésre áll (Park et al., 2015). Méh-DNS-diagnosztika Tömeges munkák pontos eszköze: pipettázó robot beállítása a keszthelyi biotechnológiai laborban A HAZAI MÉHEK GENOMIKAI VIZSGÁLATA A genetikáról már tudjuk, hogy a tulajdonságok öröklődésének törvényszerűségeivel foglalkozik. De mi genomika? A genom egy élőlény teljes tervrajzának az életéhez szükséges összes információját jelenti, ami a DNS-ben van tárolva. Ez a házi méh esetében a 236 millió, négyfajta betűből (bázisból: A; T; C; G) álló kód. A genomika tehát a teljes DNS-kód vizsgálatát jelenti, nem csupán kiválasztott DNS-szakaszokra, génekre korlátozódik. Különös figyelmet szentelnénk a pannon méh, valamint a hazai méhek teljes genomjainak a meghatározására, ami a fajta védelme és nyomon követhetősége érdekében fontos. A genomikai vizsgálatok a későbbiekben lehetőséget adnak arra, hogy egyes fontos gazdasági értékmérő tulajdonságokra (betegségrezisztencia, illetve -tolerancia, rajzási hajlam, higiénés tulajdonságok stb.) DNS-markerekkel szelektálni tudjunk. Az állattenyésztésben a fejlett országokban már áttértek a genetikai alapú tenyészértékbecslésre, amelynek a segítségével gyorsabban és hatékonyabban tudnak új, értékes tenyészállatokat szelektálni, így nucleuspopulációkat létrehozni. A méhészeti genomikai kutatások hosszú távú célja az, hogy az hazai méhanyanevelőket és -nemesítőket támogassa genetikai adatokkal (genetikai profilokkal), amelyek segítségével rövidebb idő alatt értékesebb állományok hozhatók létre. A nyugati mézelő méh referenciagenomja rendelkezésre áll, több mint 50 egyed teljes genomszekvenciája elérhető a DNS-bankból. A hazai méhek teljes genomszekvenciáinak elemzésével megtaláljuk azokat a pontokat a genomban, amelyek révén a továbbiakban meg tudjuk 20 Méhészújság

A KUTATÁS ÚJ TÁVLATAI határozni többek között a méhek földrajzi, rokonsági kapcsolatait. A méhfajták közti genetikai különbségek alapján a későbbiekben elsősorban a méz-dns-diagnosztikai eljárások fejleszthetők, aminek a segítségével eldönthető, hogy a méz tartalmaz-e más, idegen (ázsiai) mézet is. MINTAVÉTEL, DNS-IZOLÁLÁS Munkánk első lépéseként 12 méhcsaládból gyűjtöttünk Apis mellifera carnica-mintákat, összesen 267 méhegyedet Horváth János, Kiss Sándor és Sáfár András méhanyanevelők tenyészértékbecslésen minősített anyagából. Ezekből vontunk ki DNS-t, és szekvenáltuk le a krajnai méh teljes genomját. 5 család egyedeit választottuk ki a genomszekvenáláshoz. A kiválasztott minták ellenőrzött méhészetekből származtak. A megfelelő mennyiségű és minőségű DNS-mintákból történt a genomszekvencia meghatározása, ugyanis a megfelelő minőségű és mennyiségű DNS-alapanyag az érzékeny genomikai munkákhoz kulcsfontosságú. A kiválasztott méh-dns-minták minőségét (például: nem töredezett-e) egy térhálós szerkezetű gélben (agaróz) futtatva ellenőriztük. Ez a DNS-alapú munkák egyik kezdő lépése. A megfelelő minőségű mintákat ezután Debrencebe küldtük leolvasásra. Viszszakaptuk a teljes DNS-t több millió 100 bázis hosszúságú DNS-darabban. A mi szekvenálásunk lefedettsége több mint 12-szeres lett, ez azt jelenti, hogy mind az 5 genomszekvenált méhegyed teljes genomját átlagosan több mint 12-szer határoztuk meg. MIKROSZATELLITA MARKEREK ADAPTÁLÁSA, FEJLESZTÉSE A klasszikus populációgenetikai analízisekben leggyakrabban használt DNS-markerek a mikroszattelitek, amelyek bázisok tandem ismétlődését (például: ATATATAT) tartalmazzák, és sok alléljuk, variációjuk lehet. Bioinformatikai eljárásokkal (in silico) a méhgenomban 397 727 tandem módon ismétlődő szekvenciát (mikroszatellita) találtunk, melyekből 75 560 lókuszra terveztünk primert, azaz a méhgenomban átlagosan 3785 bázisonként található ismétlődés, melyek közül a polimorfnak bizonyuló lókuszok a jövőben mikroszatellita markerként Pollenvizsgálat; NAIK-MBK, Digitális Képalkotó Laboratórium használhatók lehetnek. Ismereteink szerint ez a legnagyobb (illetve idáig egyetlen) mikroszatellita- és primeradatbázis házi méhnél. Adatbázisunk feldolgozásával viszonylag gyorsan és egyszerűen lehet új mikroszatellita markereket fejleszteni, melyek gyakorlati alkalmazása egyrészt populációgenetikai markerként történhet, méhgenetikai diverzitásvizsgálatokban, illetve méhpopulációk/egyedek azonosítása, elkülönítése céljából. A Kárpát-medencében fel szeretnénk mérni a krajnai méh táj- vagy ökotípusainak előfordulását, ezeknek a populációnak a genetikai diverzitását meghatározni. A bővített genetikai markerszett a hazai méhtenyésztők vonalainak ellenőrzésére gyakorlati szempontból jól alkalmazható lenne az A. m. ligustica-, valamint a Buckfast-hibridek kiszűrésében. Konfokális lézer szkennelő mikroszkóppal készült pollenképek (630-szoros nagyítás) MIKROSZATELLITA MARKEREK KERESÉSE A TELJES HAZAI MÉHGENOMBAN A méh-referenciagenomban 397 727 tandem ismétlődő szekvenciát találtunk, melyek közül 138 945 darab 1 bázisos (mononukleotid) ismétlődés, 140 684 darab 2 bázisos (dinukleotid), 27 236 darab 3 bázisos (trinukleotid), 63 015 darab 4 bázisos (tetranukleotid), 20 763 darab 5 bázisos (pentanukleotid), 7084 darab pedig 6 bázisos (hexanukleotid) ismétlődés. A megtalált ismétlődések közül 75 560 lókuszra sikerült a primertervezés, azaz a méhgenomban átlagosan 3785 bázisonként találtunk olyan ismétlődést, amely a jövőben 2015. november 21

HAZAI KUTATÁSOK A higiénikus viselkedés öröklődése + + A sejtet kitisztítja, felnyitja domináns recesszív Kívánatos tulajdonság A kívánatos tulajdonságot hordozó anyát/herét visszük tovább. 1. Ezt fagyasztási kísérlettel megkeressük jó tulajdonságra, 2. DNS-markert tervezünk rá, 3. tömegesen, DNS-markerrel válogatjuk a jó méhanyákat. Higiénés viselkedésgenetikai program A genetikailag kódolt viselkedésformákat ösztönöknek nevezzük. Ez a legtöbb esetben öröklődik, mert genetikailag meghatározott. A méh tisztogató viselkedése is így működik: két fő gén felelős ezért a tulajdonságért. Az egyik azért felelős, hogy ha a megérzi a méh a beteg fiasítást a sejtben, akkor felnyitja azt. Viszont egy másik gén hatására távolítják el a beteg bábokat. mikroszatellita markerként használható lenne. Ezek közül számunkra a leginkább a tetranukleotid ismétlődések érdekesek, ugyanis ilyen mikroszatellitákat korábban még nem írtak le méhben. Az azonosított mikroszatelliták későbbi gyakorlati alkalmazásához, például a higiéniás viselkedéshez kapcsolt markerek fejlesztéséhez a mikroszatellita ismétlődések helyzetét összevetettük a higiéniás viselkedés kialakulásában feltételezetten fontos szerepet játszó genomi pozíciók (lókuszok) elhelyezkedésével. Az így feltárt mikroszatelliták a későbbiekben kapcsolt markerként alkalmazhatóak lennének az előnyös tulajdonságot hordozó vonalak és családok kiválasztásában. KÜLÖNBSÉGEK KERESÉSE A MÉH- GENOMSZEKVENCIÁKBAN A méh-referenciagenomszekvencia 236 millió bázisához képest megvizsgáltuk az általunk szekvenált és a nyilvános nemzetközi génbank (NCBI SRA) adatbázisából letöltött teljes genomszekvenciákat. A 1. táblázat tartalmazza a referenciaszekvenciához viszonyított egyedi szekvenciakülönbségeket. A különbségkeresés eredményeként kapott vcf-formátumú fájlokat (különbséglistákat) egy nagy adatbázissá A közeljövőben az örökítő anyag vizsgálatán fog alapulni a méhek nemesítése. fűztük össze, amely így 17 118 087 kromoszomális pozícióban található szekvenciakülönbséget tartalmaz. A szekvenciakülönbségek közül első körben a mitokondriális szekvenciákban talált eltéréseket ellenőriztük IGV segítségével. Így próbáltuk kiszűrni az Apis cerana- és Apis mellifera carnica-szekvenciák közötti fajspecifikus eltéréseket, melyekre a későbbiekben fajazonosításra alkalmas marker(ek) fejlesztését tervezzük. Mivel jelenleg csak egyetlen teljes Apis cerana-genomszekvencia áll rendelkezésünkre, ezen különbségek további ellenőrzéseket igényelnek, amelyeket a jövőben laboratóriumi módszerekkel tervezzük elvégezni. Azonban az NCBI adatbázisban elérhető két teljes Apis cerana-mitokondriumszekvencia is, amelyek feldolgozásával megerősítést nyert több olyan, bioinformatikailag prediktált szekvenciaeltérés, ami lehetővé teszi számunkra, hogy az ázsiai méh méztermékeinek kimutatására diagnosztikai eljárást fejlesszünk a közeljövőben. Méhgenomikai vizsgálataink alapján megállapítottuk, hogy a magyar méhek genomszekvenálásából származó szekvenciák, valamint a nemzetközi nyilvános génbank (NCBI-SRA) adatbázisából letöltött szekvenciák méh-referenciagenomra illesztése is megfelel az összehasonlító genomikai vizsgálatokhoz. Eredményeként összesen 17 118 087 kromoszomális pozícióban találtunk szekvenciakülönbséget, amelyek potenciálisan jók lehetnek gyakorlati alkalmazásra, faj-, illetve fajtaazonosítás céljából, valamint ezen eltérések között találhatjuk azokat a géneket, amelyek gazdaságilag értékesek lehetnek. A méhek teljes genomszekvenciáit összevetve 88 269 hazai krajnai méhre jellemző szekvenciakülönbséget azonosítottunk eddig. Ezen pozíciók alkalmasak lehetnek olyan markerek fejlesztésére, melyek a gyakorlatban alkalmazhatók a különböző méh-, illetve méztermékek földrajzi, faji vagy alfaji eredetének azonosítására. A HIGIÉNIÁS VISELKEDÉSHEZ KAPCSOLT MARKEREK FEJLESZTÉSE Már az 1960-as években leírták a méhek higiéniás viselkedésének öröklődését. Ezek közül 2 gén öröklődése a genetikatankönyvek anyagát is képezi. Kiderült, hogy ezen tulajdonságok megjelenése további génekkel is kapcsolatot mutat. A gyakorlati méhtenyésztési programokban folyékony nitrogénes fagyasztásos kísérletekkel tudják meghatározni a 24 órás tisztítás mértékét, ami jó felvilágosítást ad a kaptár méheinek higiéniás viselkedéséről. Nagyatádon Horváth János méhanyatenyésztő méhészetében elkezdtük a tenyészállomány szűrését is. 22 Méhészújság

HAZAI KUTATÁSOK A későbbiekben genomikai, genetikai módszerekkel össze szeretnénk hasonlítani a jól tisztító családokat a rosszul tisztító családokkal. Így lehetőségünk nyílik olyan DNS-markerek fejlesztésére, amelyek használatával az előnyös tulajdonságot hordozó vonalak és családok kiválogatása megtörténhet a fiasítás, herefiasítás vizsgálatával, így gyorsabban, olcsóbban, kevesebb élőmunka-ráfordítással (folyékony nitrogénes fagyasztások elhagyásával), közvetlenül alkalmazhatóak lehetnek a gyakorlatban. Hosszabb távon egy stabil, nagyszámú, kiváló higiéniás tulajdonsággal rendelkező törzsállomány hozható létre, amely mesterséges termékenyítéssel fenntartható. A törzsállományból származó méhanyák gazdasági előnyt jelentenének a magyar méhészeknek, mivel a leggyakoribb méhbetegségekkel szemben toleránsabb, erősebb családok kialakítására képesek. MÉZ-DNS-DIAGNOSZTIKA, KÓROKOZÓK KIMUTATÁSA Méhgenomikai vizsgálatokra alapozott DNS-markereket szeretnénk fejleszteni, amelyek segítségével azonosítható, milyen területről, milyen eredetű méhekből származik a méz (ázsiai-európai, illetve ezek keveréke). DNS-markerek fejlesztését is tervezzük az ázsiai és magyar méhekre, valamint a főbb fajtamézek (akác, repce, napraforgó) esetében annak meghatározását, hogy az összes növényi DNS-nek hány százalékát teszi ki a fajtamézre jellemző növény; ezt a hagyományos pollenvizsgálatok eredményeivel kívánjuk összevetni. A főbb méhkórokozókra ugyancsak szándékozunk DNS-markereket adaptálni, 3n 27,236 7% 4n 63,015 16% 5n 20,763 5% 2n 140,684 35% 6n 7,084 2% fejleszteni. A tenyésztők számára fontos, hogy a tenyészanyaguk az egyes kórokozóktól mentes legyen. GYAKORLATI ALKALMAZHATÓSÁG A mézből kivont DNS-ben minden élőlény DNS-e benne lesz, aminek a szövetével a méz érintkezett vagy érintkeznie kellett. Ha nincs a mézben méh-dns, akkor azt nem méh gyűjtötte. Ha van, és nem a hazai krajnai, akkor nem nálunk termelték. A DNS mennyiségét is meg lehet határozni. Ez lehetőséget ad a keverékek analízisére is. ATKATOLERÁNS EGYEDEK SZELEKTÁLÁSA Ha sikerül megtalálni azokat a régiókat, amelyeket eddig más méhfajtákból leírtak, gyors diagnosztikai eszköz kerülhet 1n 138,945 35% Ismétlődő motívumok a méhgenomban a kezünkbe a jó higiénikus viselkedésű és jó szociális tisztogató viselkedést mutató méhanyák kereséséhez. A HAZAI MÉHFAJTA GENETIKAI TISZTASÁGÁNAK MEGÓVÁSA, MEGŐRZÉSE DNS-teszt segítségével kiszűrhetők a nemkívánatos tájidegen fajtákkal párzott méhanyák, s azok is, amelyek kinézetre krajnai bélyegeket mutatnak, de rejtetten hordozzák a tájidegen fajták génjeit. TERMELÉSI TULAJDONSÁGOKRA TÖRTÉNŐ SZELEKTÁLÁS Két olyan DNS-régiót keresünk a hazai fajtában, melyet más méhfajtában már megtaláltak: ezek egyike a szelídséggel mutat összefüggést, illetve meghatározza, hogy az egyedek mikor lépnek gyűjtőkorba. Ezenkívül leírtak már régiókat is (például a méhek testméretével összefüggésben), illetve kereshetők egyéb szakaszok, amelyek más tulajdonsággal mutatnak kapcsoltságot (például: propoliszgyűjtés). Természetesen az út még hosszú ahhoz, hogy a fenti célokat maradéktalanul elérjük. Az elsődleges ebben a fázisban, hogy minél nagyobb kapcsoltsággal rendelkező szakaszokat tudjunk elkülöníteni a méh DNS-ében, s végül eljussunk a kódoló génekhez, amelyek az adott tulajdonságot meghatározzák. Dr. Kolics Balázs, Dr. Stéger Viktor Higiéniás teszt: fedett fiasítás fagyasztása folyékony nitrogénnel a sejtek érintése nélkül 2015. november 23