Géneltérések biológiai szerepe és prognosztikai jelentősége humán malignus melanomákban



Hasonló dokumentumok
Genomiális eltérések és génexpressszió közötti kapcsolat vizsgálata, melanomák metasztázisképzésére jellemző genetikai markerek kutatása

GÉNELTÉRÉSEK BIOLÓGIAI SZEREPE ÉS PROGNOSZTIKAI JELENTŐSÉGE HUMÁN MALIGNUS MELANOMÁKBAN

EGYETEMI DOKTORI (Ph.D) TÉZISEK

Xenobiotikum transzporterek vizsgálata humán keratinocitákban és bőrben

Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése

A rosszindulatú daganatos halálozás változása 1975 és 2001 között Magyarországon

eljárásokkal Doktori tézisek Szatmári Tünde Semmelweis Egyetem Klinikai Orvostudományok Doktori Iskola Sugárterápia Program

Her2 fehérje overexpresszió gyomorrákokban: Hazai tapasztalatok

II./3.3.2 fejezet:. A daganatok célzott kezelése


Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére.

Epithelialis-mesenchymalis átmenet vastagbél daganatokban

1. Az intracelluláris FXIII-A szerepe a makrofágok génexpressziójában

A magyar racka juh tejének beltartalmi változása a laktáció alatt

AZ ALACSONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA

E4 A Gyermekkori szervezett lakossági emlőszűrések hatása az emlőműtétek

MULTIDROG REZISZTENCIA IN VIVO KIMUTATÁSA PETEFÉSZEK TUMOROKBAN MOLEKULÁRIS LEKÉPEZÉSSEL

megerősítik azt a hipotézist, miszerint az NPY szerepet játszik az evés, az anyagcsere, és az alvás integrálásában.

Emlődaganatok gyógyszeres kezelés. Dr.Tóth Judit DE OEC Onkológiai Tanszék

AZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, TILLING

Chapter 10 Hungarian Summary. Az onkológiai gyógyszerfejlesztés eredetileg DNS-károsodást indukáló vegyületekre

Fehérjeglikoziláció az endoplazmás retikulumban mint lehetséges daganatellenes támadáspont

A csontvelői eredetű haem-és lymphangiogén endothel progenitor sejtek szerepe tüdőrákokban. Doktori tézisek. Dr. Bogos Krisztina

A nemi különbségek vizsgálatáról lévén szó, elsődleges volt a nemi hormonok, mint belső környezetbeli különbségeket létrehozó tényezők szerepének

Gottsegen National Institute of Cardiology. Prof. A. JÁNOSI

Tumorbiológia Dr. Tóvári József (Országos Onkológiai Intézet)

A munkáltató neve és címe Debreceni Egyetem Népegészségügyi Kar 4028 Debrecen Kassai út 26.

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

A stresszteli életesemények és a gyermekkori depresszió kapcsolatának vizsgálata populációs és klinikai mintán

A tüdő adenocarcinomák szubklasszifikációja. Dr. Szőke János Molekuláris Patológiai Osztály Budapest, 2008 december 5.

Tumor immunológia

Új diagnosztikus és terápiás lehetőségek a glioblastoma multiforme kezelésében

Jelátviteli uatk és daganatképződés

COOPERATION IN THE CEREAL SECTOR OF THE SOUTH PLAINS REGIONS STRÉN, BERTALAN. Keywords: cooperation, competitiveness, cereal sector, region, market.

Zárójelentés a Hisztamin hatása a sejtdifferenciációra, összehasonlító vizsgálatok tumor - és embrionális őssejteken című számú OTKA pályázatról

sikeresnek bizonyult, és ami a legfontosabb az onkoterápiában, hogy a vegyület nem toxikus, ezért igen magas dózissal is eredményesn alkalmazható.

Az anti-apoptózis mechanizmus vizsgálata agyi ischaemia/hypoxia modellekben

A sejtfelszíni FasL és szolubilis vezikulakötött FasL által indukált sejthalál gátlása és jellemzése

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik

Hibridspecifikus tápanyag-és vízhasznosítás kukoricánál csernozjom talajon

20 éves a Mamma Klinika

Szövettan kérdései Ami a terápiát meghatározza és ami segíti Dr. Sápi Zoltán

Szakmai zárójelentés

Miskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet. Correlation & Linear. Petra Petrovics.

A malignus melanóma új TNM-klasszifikációja (AJCC, 2009) és az őrszemnyirokcsomó-biopszia patológiai jelentősége

A tényeket többé senki sem hagyhatja figyelmen kívül

A DOHÁNYZÁS OKOZTA DNS KÁROSODÁSOK ÉS JAVÍTÁSUK VIZSGÁLATA EMBERI CUMULUS ÉS GRANULOSA SEJTEKBEN. Sinkó Ildikó PH.D.

Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata

Correlation & Linear Regression in SPSS

ZÁRÓJELENTÉS A MOLEKULÁRIS ONKOGENEZIS MECHANIZMUSAI GYAKORI DAGANATOKBAN C. PÁLYÁZAT TELJESÍTÉSÉRŐL

VIII. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Fény a kutatásban és a diagnosztikában

T-helper Type 2 driven Inflammation Defines Major Subphenotypes of Asthma

Hiperlipidémia okozta neurodegeneratív és vér-agy gát-elváltozások ApoB-100 transzgenikus egerekben

Multidrog rezisztens tumorsejtek szelektív eliminálására képes vegyületek azonosítása és in vitro vizsgálata

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

A KUKORICA STRESSZREZISZTENCIA KUTATÁSOK EREDMÉNYEIBŐL

Correlation & Linear Regression in SPSS

Curriculum Vitae. Margit Balázs

1. Bevezetés. 2. Anyag és módszer

A Fusarium solani-val szembeni ellenállóképesség vizsgálata különböző zöldborsó fajtákon és nemesítési kombinációkon

TDA-TAR ÉS O-TDA FOLYADÉKÁRAMOK ELEGYÍTHETŐSÉGÉNEK VIZSGÁLATA STUDY OF THE MIXABILITY OF TDA-TAR AND O-TDA LIQUID STREAMS

Rhinitis allergica elterjedésének vizsgálata hazánk gyermekpopulációjában között

Primer emlőcarcinomák és metasztázisaik immunfenotípusának vizsgálata

CSERNELY KÖZSÉG DEMOGRÁFIAI HELYZETE

Receptor Tyrosine-Kinases

A hazai és nemzetközi daganatos halálozási és megbetegedési mutatók alakulása

A PROTEIN KINÁZ C IZOENZIMEK SZEREPE HUMÁN HaCaT KERATINOCYTÁK SEJTM KÖDÉSEINEK SZABÁLYOZÁSÁBAN

A BÜKKI KARSZTVÍZSZINT ÉSZLELŐ RENDSZER KERETÉBEN GYŰJTÖTT HIDROMETEOROLÓGIAI ADATOK ELEMZÉSE

Bevezetés. A fejezet felépítése

Mely humán génvariációk és környezeti faktorok járulnak hozzá az allergiás megbetegedések kialakulásához?

A hem-oxigenáz/vegf rendszer indukciója nőgyógyászati tumorokban. Óvári László

Phenotype. Genotype. It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? Remember the Goal. Infectious Disease Paradigm

Az aminoxidázok és a NADPH-oxidáz szerepe az ér- és neuronkárosodások kialakulásában (patomechanizmus és gyógyszeres befolyásolás)

10. Tumorok kialakulása, tumor ellenes immunmechanizusok

Diagnosztikus problémák és prognosztikai faktorok prosztatarákban

Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben. Doktori tézisek. Dr. Szidonya László

Új diagnosztikai és prognosztikai vizsgálatok a húgyhólyag rosszindulatú daganatain

III. A tudományos tények, melyek ezt az áttörést visszafordíthatatlanná teszik

DI-, TETRA- ÉS HEXAPLOID TRITICUM FAJOK GENOMJAINAK ELEMZÉSE ÉS AZOK ÖSSZEHASONLÍTÁSA FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓVAL

Supplementary materials to: Whole-mount single molecule FISH method for zebrafish embryo

Óragén expresszió vizsgálata bőrgyógyászati biopsziás mintákon

Molekuláris terápiák

KORRÓZIÓS FIGYELÕ korrózióvédelmi mûszaki tudományos folyóirat. Szerkeszti: a szerkesztõbizottság. A szerkesztõbizottság elnöke: Zanathy Valéria

A nyomási fekély ellátásának vizsgálata a minőségi betegellátás kritériumai szerint

1. program: Az életminőség javítása

Összefoglalás. Summary

T Zárójelentés

Az immunválasz akadálymentesítése újabb lehetőségek a daganatok a immunterápiájában

Lohe mûtét hosszú távú eredményei a metatarsalgia kezelésében

AZ ERDÕ NÖVEKEDÉSÉNEK VIZSGÁLATA TÉRINFORMATIKAI ÉS FOTOGRAMMETRIAI MÓDSZEREKKEL KARSZTOS MINTATERÜLETEN

"A genius is one per cent inspiration and ninety nine per cent perspiration." Thomas A. Edison

Dr. Ottó Szabolcs Országos Onkológiai Intézet

FODOR MÓNIKA 1, RUDOLFNÉ KATONA MÁRIA 2, KARAKASNÉ MORVAY KLÁRA 3

Lázas beteg az intenzív osztályon: a differenciáldiagnosztika

Egy Polycomb Response Element (PRE) in situ vizsgálata Drosophila melanogaster-ben génkonverzió segítségével. Kozma Gabriella

Sutton naevust utánzó melanoma. Sutton naevus like melanoma

TIOLKARBAMÁT TÍPUSÚ NÖVÉNYVÉDŐ SZER HATÓANYAGOK ÉS SZÁRMAZÉKAIK KÉMIAI OXIDÁLHATÓSÁGÁNAK VIZSGÁLATA I

Népegészségügyi Szakigazgatási Szerve. Tájékoztató Hajdú-Bihar megye lakosságának egészségi állapotáról

A TALAJTAKARÁS HATÁSA A TALAJ NEDVESSÉGTARTALMÁRA ASZÁLYOS IDŐJÁRÁSBAN GYÖNGYÖSÖN. VARGA ISTVÁN dr. - NAGY-KOVÁCS ERIKA - LEFLER PÉTER ÖSSZEFOGLALÁS

Átírás:

268 Doktori tézisek Géneltérések biológiai szerepe és prognosztikai jelentősége humán malignus melanomákban Vízkeleti Laura Debreceni Egyetem, Egészségtudományok Doktori Iskola, Debrecen Témavezető: Prof. Dr. Balázs Margit A melanoma okozta halálozások legfőbb oka a metasztázisok megjelenése, mely a túlélésen túl jelentősen csökkenti az alkalmazott terápiák hatékonyságát is. Ezért szükséges olyan biomarkerek felkutatása, melyek hozzájárulnak a melanoma prognózisához, és sikeresen alkalmazhatók a terápiás hatékonyság növelésére. Számos jelátviteli útvonal szerepét bizonyították már a melanoma progressziójában. Ezek közül kiemelkedő jelentőségű a Ras/MAPK útvonal aktivációja. A BRAF- és NRAS-mutációk korai megjelenése mellett fontos, hogy az útvonal egyik fő célmolekulája a sejtciklus G1/S fázis átmenetét szabályozó CCND1. Vizsgálataink egyik részében a CCND1 genetikai és génexpressziós eltéréseit tanulmányoztuk a melanomaprogresszió során, figyelembe véve a BRAF és NRAS gének mutációs státuszát. Eredményeink a CCND1-kópiaszám eltéréseinek szignifikáns összefüggését tárták fel a kedvezőtlen klinikai kimenetellel primer melanomákban, mely összefüggést befolyásolta a BRAF és NRAS gének mutációs státusza a napsugárzásnak való kitettség függvényében. Génexpressziós vizsgálataink során a CCND1 mrns-szintjének szignifikáns csökkenését figyeltük meg a többszörös áttétképző primer tumorokban, mely korrelációt mutatott mind a BRAF és NRAS mrnsszintekkel, mind pedig ez utóbbi gének mutációs státuszával. A CCND1 protein fokozott expressziója pedig áttétképzéssel, rövidebb túléléssel és nagyobb Breslow-vastagsággal társult. A CCND1-et kifejező sejtek aránya azonban heterogén eloszlást mutatott, mely befolyásolta a klinikopatológiai paraméterekkel való összefüggést. Kísérleteinket ezért eltérő biológiai karakterű sejtvonalakon végzett vizsgálatokkal egészítettük ki. Ez alapján a progresszió előrehaladtával a CCND1-expresszió fokozódik, majd az áttétben lecsökken. További célunk volt az array komparatív genomhibridizációs (acgh) vizsgálatok során gyakori eltérést mutató 7q31-es régió szerepének vizsgálata a melanoma progressziójában. A lókusz rendkívül géndenz, mely magában foglalja a mutációs forrópontként működő FRA7G fragilis helyet. Ennek környezetében lokalizálódik a fokális adhéziók egy kulcsmolekuláját kódoló TES gén, valamint a membrán-lipidtutajok multifunkciós alapköve, a CAV1. Interfázisos FISH-vizsgálataink szignifikáns összefüggést mutattak a 7q31 kópiaszám-eltérései és a kedvezőtlen prognózis között. A CAV1 mrns-expresszió lecsökkent vastag melanomákban, mely változás fehérjeszinten is tapasztalható volt, míg a TES mrns-szint csökkenése a többszörös áttétképző primer mintákat jellemezte. Kulcsszavak: malignus melanoma, fluoreszcencia in situ hibridizáció, szöveti microarray, CCND1-eltérések, 7q31-amplifikáció, CAV1- és TES-expresszió, BRAF- és NRAS-mutáció Metastatic process accounts for the vast majority of melanoma associated mortality, and also results in difficulties in the effective treatment. Therefore, identification of novel biomarkers could contribute to melanoma prognosis, and may also provide new opportunities for efficient cancer treatment. Several signaling pathways have been identified as key regulators in melanoma progression, including the frequent activation of Ras/MAPK signaling pathway through the mutant BRAF or NRAS genes. Besides, Levelezési cím: Dr. Vízkeleti Laura, Debreceni Egyetem, Népegészségügyi Kar, Megelőző Orvostani Intézet, 4028 Debrecen, Kassai út 26. E-mail: laura.vizkeleti@gmail.com Közlésre érkezett: 2015. január 16. Elfogadva: 2015. február 20.

Géneltérések malignus melanomában 269 alterations of CCND1 may also be of great importance. The oncogene plays a significant role in the G1/S phase transition of the cell cycle, and its transcriptional activation is primarily carried out by the Ras/MAPK cascade. One of our aims was to determine the genetic and gene expression alterations of CCND1 during melanoma progression, considering the mutation status of BRAF and NRAS genes. Analysis of CCND1 copy number alterations revealed significant association with poor clinical outcome in primary melanomas, which was influenced by the mutation status of BRAF or NRAS in the term of sun exposure. Regarding gene expression, CCND1 mrna level decreased in lesions with multiple metastases and were correlated with both the mrna levels and mutation status of BRAF and NRAS. CCND1 protein expression was associated with Breslow thickness, metastasis formation and shorter survival time. However, the proportion of cells expressing the protein showed a heterogeneous distribution, influencing the association with clinical-pathological parameters. Therefore melanoma cell lines with different biological behavior were also analyzed for protein expression. These experiments revealed an increasing CCND1 protein level throughout primary cancer progression, which then decreased in the metastasis. The other purpose of our study was to determine the role of 7q31 region in melanoma progression, which was found frequently altered using array comparative genomic hybridization (acgh). 7q31 is a gene dense locus, including the FRA7G fragile site, which serves as a mutation hot spot. In its close vicinity TES (focal adhesions) and CAV1 (lipid rafts) genes are located. Using interphase FISH, significant associations were found between 7q31 copy number alterations and poor clinical outcome. Both mrna and protein levels of CAV1 decreased in thick lesions whereas primary melanomas forming multiple metastases were featured by decreased TES mrna level. Vízkeleti L. Biological role and prognostic significance of genetic alterations in human malignant melanomas. Hungarian Oncology 59:268 272, 2015 Keywords: malignant melanoma, fluorescence in situ hybridization, tissue microarray, CCND1 alterations, 7q31 amplification, CAV1 and TES expressions, BRAF and NRAS mutations BEVEZETÉS A heterogén fenotípusú malignus melanomát korai áttétképzés és gyorsan kialakuló terápiarezisztencia jellemzi. A bőrdaganatok okozta halálozások döntő többsége is az áttétes melanomáknak tulajdonítható. Multifaktoriális etio ló gia jellemzi, számos genetikai és környezeti tényező kölcsön hatása révén alakul ki. A melanoma nagyfokú genomiális heterogenitásáról ismert. Az eltérő útvonalak érintettsége és a közöttük fellépő interakciók komplexitása azt sugallja, hogy az egyedi genetikai és molekuláris eltérések önmagukban nem rendelkeznek döntő befolyással a betegség kialakulására és progressziójára. Azonban a különböző alterációk halmozódása, a tumorsejt és mikrokörnyezete közötti speciális párbeszéddel együtt már képes eltérő klinikai-biológiai kimenetelek kialakítására. Így a molekuláris tulajdonságok figyelembevétele segíthet a jelenleg létező klasszifikációs rendszerek pontosításában, jövőbeni terápiás módszerek kidolgozásában. Számos jelátviteli útvonal kulcsszerepét bizonyították már de novo melanomák progressziójában. Néhány közü lük régóta ismert, mint a Ras/MAPK útvonal, mely a tiro zinkináz receptor jelátvitel egyik fő célpontja. A jelátviteli út vezető szereppel bír a melanomagenezisben, sejt proli ferációban és a sejtek túlélésében egyaránt. Emellett más molekuláris kaszkáddal történő interakció révén tovább segít heti a tumorgenezist, sejtnövekedést, kemorezisztencia kialakulását, inváziót, migrációt és a sejtciklusszabályozás megváltozását. Leggyakoribb eltérései közé tartozik a BRAFV600 és NRASQ61 kodonok mutációja, mely az útvonal konstans aktiválódását eredményezi. Előzetes acgh-tanulmányaink számos kromoszomális régió, mint a 7q31 vagy 11q13 eltérésének a melanoma agresszív viselkedésében betöltött szerepére világítottak rá. A 7q31 lókusz magában foglalja a FRA7G törékeny pontot, melynek közvetlen közelében találhatók olyan gének (CAV1 és TES), amik lehetséges célpontjai a tumorgenezis során kialakuló genetikai alterációknak. A CAV1 a membrán lipidtutajok fő komponenseként különböző fehérje interakciók révén a sejt életének számos aspektusát befolyásolja. A daganatprogresszióban betöltött szerepe azonban vitatott; apoptotikus és anti-apoptotikus hatással egyaránt rendelkezik a daganattípus és stádium függvényében. A TES a fokális adhéziók kulcsmolekulájaként befolyásolhatja a tumorsejtek motilitását. A 11q13-as lókuszon található CCND1 onkogén a sejtciklus G1/S fázis átmenet fő szabályozó molekulája. Transzkripciós aktiválása elsősorban tirozinkináz receptorok közvetítésével, a Ras/ MAPK jelátviteli kaszkádon keresztül valósul meg. Emellett egyéb citokinek, transzkripciós faktorok és extracelluláris mátrix fehérjék PI3K Akt mtor kaszkád stimulációja, valamint a csökkent proteindegradáció szintén hozzájárul a megnövekedett CCND1-szinthez. Ezek alapján az új

270 Vízkeleti genetikai alterációk identifikálása és szerepének azonosítása a génexpresszió szabályozásában összehangoltan az epigenetikai folyamatokkal új távlatokat nyithat a daganatellenes terápiában is. CÉLKITŰZÉSEK 1. A 7q31-es lókusz genetikai eltéréseinek vizsgálata interfázisos FISH technikával primer melanoma szöveti mintákban és a kialakult nyirokcsomóáttétekben, valamint különböző biológiai viselkedésű melanoma-sejtvonalakban. A FISH-eredmények összevetése a tumorok klinikopatológiai paramétereivel. 2. A 7q31-en lokalizálódó CAV1 és TES mrns- és fehérjeszint változásainak meghatározása primer melanomákban és sejtvonalakban qrt-pcr és szöveti microarray-ken végzett immunhisztokémia alkalmazásával. Az expressziós eredmények összevetése a tumorok klinikopatológiai paramétereivel. 3. A 7q31-alterációk és génexpressziós változások közötti kapcsolat vizsgálata. 4. A CCND1 onkogén genetikai eltéréseinek vizsgálata interfázisos FISH technikával. A FISH-eredmények összevetése a tumorok klinikopatológiai paramétereivel, valamint a BRAF- és NRAS-mutációs státusszal. 5. A CCND1 mrns- és fehérjeexpressziós változások meghatározása primer melanomákban qrt-pcr és szöveti microarray-ken végzett immunhisztokémia alkalmazásával. Az expressziós eredmények összevetése a tumorok klinikopatológiai paramétereivel, valamint a BRAF és NRAS gének expressziós és mutációs státuszával. MÓDSZEREK A friss/fagyasztott melanomaszövetek a Debreceni Egyetem Bőrgyógyászati Klinikájáról származtak. A vizsgálatban szereplő betegek nem kaptak kezelést a primer tumorok sebészeti eltávolítását megelőzően. Kísérleteinket eltérő biológiai karakterű humán melanoma-sejtvonalakon (WM35, WM983A, WM983B, A2058, HT168, HT168-M1 és HT199) végzett vizsgálatokkal is kiegészítettük. A 7q31-es és 11q13-as régiók gyakori amplifikációját acgh segítségével mutattuk ki. Az eltérések sejtszintű vizsgálatát, valamint az acgh-eredmények validálását interfázisos fluoreszcencia in situ hibridizációval (FISH) végeztük gyári kettős jelzett próbákat (CEP7/7q31 és CEP11/CCND1) alkalmazva. A kiértékelést két módszerrel végeztük el: (1) kópiaszám-kategorizálás (deléció, látszólagos amplifikáció, kisés nagymértékű amplifikáció) és (2) kópiaszámindex (CNI) alapján kialakított csoportok ROC görbe analízissel meghatározott cut-off értéket alkalmazva. TaqMan egylépéses RT-PCR segítségével határoztuk meg a CAV1, TES, BRAF, NRAS és CCND1 mrns-szinteket. Az adatelemzést Livak módszerrel végeztük, ahol a belső kontroll gén GAPDH, a kalibrátor 3 különböző személytől származó naevusminta, illetve tenyésztett melanocita volt. A CAV1, TES és CCND1 immunhisztokémiai vizsgálatokat szöveti microarray-ken végeztük. A detektálás Envision/ HRP rendszerrel történt VIP peroxidáz szubsztrátot alkalmazva. A reakció pozitivitását 4 fokozatú skálán értékeltük (nincs, gyenge, közepes és erős festődés), valamint a CCND1 esetében a kiértékelést quickscore módszerrel is elvégeztük. A fehérjeexpressziós vizsgálatokat sejtvonalakon végzett Western blot analízissel egészítettük ki. A jel detektálására peroxidázkonjugált másodlagos antitesteket alkalmaztunk, és kemilumineszcenciával tettük láthatóvá. A kész immunblotokat denzitométerrel kvantifikáltuk. A BRAFV600 és NRASQ61 kodonok mutációs státuszát olvadáspont-analízissel detektáltuk fluoreszcens próbákat alkalmazva. Az így nyert eredményeket a PCR-termékek direkt szekvenálásával erősítettük meg. Valamennyi statisztikai analízist SPSS 19.0 és R-2.15.0 programcsomagok segítségével végeztük. EREDMÉNYEK A kalkulált 7q31 lókusz CNI jól korrelált a 7-es kromoszóma kópiaszám-eltéréseivel, és szignifikánsan magasabb volt azon primer daganatokban, melyeket metasztatizáló hajlam és kifekélyesedő felszín jellemzett. Fokozott CAV1 mrns-szint volt kimutatható a nagy Breslow-vastagságú daganatokban, míg a TES mrnsszintek eltérést mutattak a különböző helyen lokalizálódó átté tekkel rendelkező primer tumorokban. Fehérjeszinten a vizsgált naevusminták egyik fehérje esetében sem mutattak erős pozitivitást. A melanomaszövetek viszont általánosságban erős CAV1-membránfestődés mellett gyenge és diffúz cito plazmai festődést is mutattak, míg a TES fehérje gyakran képzett plakkokat a membránban. Ugyanakkor a CAV1 fehérje a primer melanomák 83%-ában volt csupán detektálható. A fennmaradó minták negatívak voltak. A vizsgált paraméterek közül a vastag melanomák csökkent CAV1-expresszióval voltak jellemezhetők; fontos azonban megjegyezni, hogy a vékony léziók egy alcsoportja szintén nem mutatott festődést. A TES fehérjét a primer tumorok 76%-a fejezte ki, egyetlen vizsgált klinikai-patológiai paraméterrel sem találtunk azonban szignifikáns összefüggést. A különböző szintek között végzett korrelációs analízis nem vagy csak gyenge korrelációt mutatott a 7q31-es lókusz amplifikációja és az itt lokalizálódó CAV1 és TES gének mrns- és fehérjeexpressziója között.

Géneltérések malignus melanomában 271 A kalkulált CCND1 CNI a 7q31-es régióhoz hasonlóan jól korrelált a 11-es kromoszóma kópiaszámával, és szignifikánsan alacsonyabb volt a végtagokon kialakuló és nem ulcerált melanomákban, míg magasabb kópiaszám jellemezte a távoli szervi, illetve többszörös áttétet képző primer daganatokat. A logisztikus regressziós analízis szintén gyakori CCND1-amplifikációt mutatott ki ulcerált felszínű és többszörös áttétképző tumorokban. A kedvezőtlen klinikai kimenetel ismert prediktoraira, mint az ulceráció, Breslowvastagság és metasztatizáló hajlam való korrekciót követően a CCND1-amplifikált melanomák mintegy 1,6-szer nagyobb eséllyel okozták az egyén betegségspecifikus halálát. Habár ez az összefüggés nem bizonyult szignifikánsnak, valószínűleg az adatszám növelésével ez megváltozna. Az általunk vizsgált melanomák 44%-a hordozott mutációt a BRAF 600-as kodonjában. Ezek többségében, közel 90%-ban V600E mutációt jelentettek, és csupán 2 tumorban fordult elő V600K és 1 melanomában V600R mutáció, így ezeket együtt kezeltük. Az NRAS 61-es kodon mutációi ugyanakkor a primer melanomák összesen 15%-ában fordultak elő, az alábbi típusmegoszlásban: 63% Q61K, 25% Q61R és 2% Q61L mutációt hordozó lézió. A BRAF- és NRAS-mutációk egyetlen vizsgált mintában sem fordultak elő együttesen. A mutációt hordozó minták viszonylag alacsony száma és ugyanazon útvonalra gyakorolt azonos hatása miatt a különböző BRAFV600 és NRASQ61 mutációkat együtt kezeltük az analízis során. A CCND1 kópiaszám-eltérései és a BRAF/NRAS-mutációk közötti interakciós vizsgálatok nem mutattak ki semmilyen módosító hatást a CCND1-eltéréseknek a primer melanomák klinikai-patológiai paramétereivel való összefüggéseiben, viszont korrigálva a BRAF- és NRAS-mutációkra, a CCND1- amplifikáció továbbra is összefüggésben állt a felszíni kifekélyesedéssel és a többszörös áttétképzéssel. Továbbá, a CCND1-amplifikációval rendelkező, de BRAF- vagy NRAS-mutációt nem hordozó primer melanomák 4,4-szer gyakrabban alakultak ki krónikus napsugárzásnak kitett bőrfelületeken. A CCND1 mrns-expresszió több mint 2-szeres csökkenését a melanomák 39%-ában, míg mrns-szint-növekedést a vizsgált tumorok csupán 18%-ában mutattuk ki. A génkifejeződés és a klinikai-patológiai paraméterek közötti össze függések analízise rávilágított arra, hogy a CCND1 mrns-expressziós mintázata primer melanomákban befolyásolhatja az áttétképzés helyét is. Többszörös áttétképző minták ugyanis csökkent CCND1 mrns-szinttel jellemezhetők, míg a csak kután és/vagy nyirokcsomó-metasztázist képző léziókban fokozott CCND1-expresszió figyelhető meg. Végül, a távoli szervi (tüdő, agy, csont vagy máj) áttéteket képző primer daganatok nem mutattak eltérést a CCND1 mrns-szintben a kontroll naevusmintákhoz képest. A CCND1-expressziós változások ugyanakkor közepes mértékű pozitív korrelációt mutattak a BRAF és NRAS mrns-szintekkel, és szignifikánsan összefüggtek a BRAF és NRAS gének mutációs státuszával is. A fenti mutációkat nem hordozó primer melanomák ugyanis megközelítőleg 2,3-szer nagyobb CCND1 mrns-expressziós értékekkel rendelkeztek a mutációt hordozó mintákhoz viszonyítva. A melanomák erős magi festődést és néhány esetben gyenge plazmapozitivitást is mutattak a CCND1 fehérjére. A kiértékelés során csak a magi festődést tekintettük specifikusnak, így a minták 87%-a bizonyult pozitívnak. Nagy intratumorális heterogenitás nem jellemezte a vizsgált mintákat. A CCND1 fehérje kifejeződésének mértéke szignifikánsan összefüggött a Breslow-vastagsággal, áttétképzéssel és a betegek túlélésével. A nagyméretű, metasztázisképző és a beteg halálát okozó primer tumorokat erősebb CCND1-festődés jellemezte, azonban a pozitív sejtek számát is figyelembe véve a tumorvastagsággal való összefüggés eltűnt. Ezért eltérő biológiai viselkedésű humán melanoma-sejt vonalak esetében is meghatároztuk a CCND1 fehérjeszinteket immunhisztokémia és Western blot technikák segítségével. A vizsgálat azt mutatta, hogy a progresszió előrehaladtával a CCND1-expresszió fokozódik, majd az áttétben lecsökken. A Western blot analízis eredményei is megerősítették ezen eredményeket. A különböző szintek közötti összefüggést vizsgálva, a CCND1 fehérje kifejeződésére nem volt szignifikáns hatással sem az mrns-szint, sem pedig az átlagos génkópiaszám. KÖVETKEZTETÉSEK 1. A 7q31 kópiaszám-eltéréseinek primer melanomákban végzett FISH-analízise szignifikáns összefüggést mutatott ki a kedvezőtlen klinikai kimenetellel. 2. A 7q31-es lókuszon elhelyezkedő CAV1 mrnsexpressziós analízise csökkent kifejeződést tárt fel vastag melanomákban, mely eltérés fehérjeszinten is kimutatható volt. 3. A TES mrns-szint csökkenését többszörös áttétképző primer melanoma mintákban figyeltük meg, míg azok a léziók, melyek csupán kután vagy nyirokcsomómetasztázissal rendelkeztek, emelkedett mrns-szinttel jellemezhetők. Ugyanakkor a TES fehérje expressziója nem mutatott összefüggést egyetlen vizsgált paraméterrel sem. 4. A CCND1 gén kópiaszám-eltérései összefüggést mutattak a kedvezőtlen klinikai kimenetellel primer melanomák ban. Ezt az összefüggést befolyásolta a BRAF és NRAS gének mutációs státusza a napsugárzásnak való kitettség függvényében. 5. CCND1 mrns-szint csökkenése figyelhető meg azokban a primer tumorokban, melyek többszörös áttétképzéssel jellemezhetők, és a génexpresszió korrelációt mutat

272 Vízkeleti mind a BRAF és NRAS mrns-szintekkel, mind pedig ez utóbbi gének mutációs státuszával. Továbbá a CCND1 protein fokozott expressziója áttétképzéssel, rövidebb túléléssel és nagyobb Breslow-tumorvastagsággal társul. KÖSZÖNETNYILVÁNÍTÁS Köszönetemet szeretném kifejezni témavezetőmnek, Prof. Dr. Balázs Margitnak, hogy a daganatkutatás csodálatos világába bevezetett és szakmai tanácsaival segítette PhD-munkámat. Ugyanakkor köszönettel tartozom Prof. Dr. Ádány Rózának is, hogy a Megelőző Orvostani Intézetben munkámat lehetővé tette. Külön köszönöm Dr. Emri Gabriella és a néhai Dr. Bégány Ágnes áldozatos segítségét a melanomaminták szövettani és klinikai értékelésében, dermatopatológiai karakterizálásában, valamint Koroknai Viktória és Kiss Tímea PhD-hallgatóknak a soha nem szűnő segítőkészséget. Végül külön köszönettel tartozom Dr. Ecsedi Szilviának, Dr. Tóth Rékának és Dr. Rákosy Zsuzsának a szakmai konzultációkért, folyamatos támogatásukért, valamint családomnak és barátaimnak, hogy a nehéz pillanatokban mindig mellettem álltak. A PhD-tézisekben szereplő publikációk elkészítését és a tézisek összeállítását az MTA-DE Népegészségügyi Kutatócsoport (2011 TKI 473), az OTKA K75191, a TÁMOP-4.2.2.A/11/1/KONV-2012-0031 és a TÁMOP- 4.2.2/B-10/1-2010-0024 számú projektek támogatták. A projekt az Európai Unió támogatásával, az Európai Szociális Alap társfinanszírozásával valósult meg. SAJÁT PUBLIKÁCIÓK JEGYZÉKE 1. Rákosy Z, Vízkeleti L, Ecsedi S, et al. EGFR gene copy number alterations in primary cutaneous malignant melanomas are associated with poor prognosis. Int J Cancer 121:1729 1737, 2007 2. Rákosy Z, Vízkeleti L, Ecsedi S, et al. Characterization of 9p21 copy number alterations in human melanoma by fluorescence in situ hybridization. Cancer Genet Cytogenet 182:116 121, 2008 3. Ecsedi S, Rákosy Z, Vízkeleti L, et al. Chromosomal imbalances are associated with increased proliferation and might contribute to bone destruction in cholesteatoma. Otolaryngol Head Neck Surg 139:635 640, 2008 4. Lázár V, Ecsedi S, Szollosi AG, et al. Characterization of candidate gene copy number alterations in the 11q13 region along with BRAF and NRAS mutations in human melanoma. Mod Pathol 22:1367 1378, 2009 5. Kitoh Y, Saio M, Gotoh N, et al. Combined GM-CSF treatment and M-CSF inhibition of tumor-associated macrophages induces dendriticcell-like signaling in vitro. Int J Oncol 38:1409 1419, 2011 6. Balázs M, Ecsedi S, Vízkeleti L, et al. Genomics of human malignant melanoma. In: Breakthroughs in melanoma research. Ed. Tanaka Y, In- Tech, Rijeka 2011. pp. 237 263 7. Vízkeleti L, Ecsedi S, Rákosy Z, et al. Prognostic relevance of the expressions of CAV1 and TES genes on 7q31 in melanoma. Front Biosci 4:1802 1812, 2012 8. Lázár V, Ecsedi S, Vízkeleti L, et al. Marked genetic differences between BRAF and NRAS mutated primary melanoma as revealed by array comparative genomic hybridization. Melanoma Res 22:202 214, 2012 9. Vízkeleti L, Ecsedi S, Rákosy Z, et al. The role of CCND1 alterations during the progression of cutaneous malignant melanoma. Tumor Biol 33: 2189 2199, 2012 10. Rakosy Z, Ecsedi S, Toth R, et al. Integrative genomics identifies gene signature associated with melanoma ulceration. PLoS One 8: e54958, 2013 11. Ecsedi S, Hernandez-Vargas H, Lima CS, et al. DNA methylation characteristics of primary melanomas with distinct biological behaviour. PLoS One 9: e96612, 2014 12. Mezey G, Treszl A, Schally AV, et al. Prognosis in human glioblastoma based on expression of ligand growth hormone-releasing hormone, pituitary-type growth hormone-releasing hormone receptor, its splicing variant receptors, EGF receptor and PTEN genes. J Cancer Res Clin Oncol 140:1641 1649, 2014 13. Szalóki G, Krasznai TZ, Tóth Á, et al. The strong in vivo anti-tumor effect of the UIC2 monoclonal antibody is the combined result of Pgp inhibition and antibody dependent cell-mediated cytotoxicity. PLoS One 9: e107875, 2014