Szakmai zárójelentés OTKA azonosító: PD 48537

Hasonló dokumentumok
KAROTINTERMELŐ JÁROMSPÓRÁS GOMBÁK

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Bevezetés

A VASFELVÉTELBEN SZEREPET JÁTSZÓ GÉNEK MOLEKULÁRIS. Nyilasi Ildikó DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A HMG-KOA REDUKTÁZ FUNKCIONÁLIS VIZSGÁLATA MUCOR CIRCINELLOIDES-BEN NAGY GÁBOR TÉMAVEZETŐ: DR. PAPP TAMÁS EGYETEMI DOCENS

MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

Az elért eredmények rövid ismertetése (T37471) 1. 2.:

A szamóca érése során izolált Spiral és Spermidin-szintáz gén jellemzése. Kiss Erzsébet Kovács László

KAROTINTERMELŐ JÁROMSPÓRÁS GOMBÁK

Kis molekulatömegű antimikrobiális fehérjék és kódoló génjeik vizsgálata

A KOLESZTERIN SZERKEZETE. (koleszterin v. koleszterol)

Nemzetközi folyóiratban megjelent tudományos közlemények, könyvfejezet

MTA DOKTORA PÁLYÁZAT DOKTORI ÉRTEKEZÉS A KAROTINOID-BIOSZINTÉZIS GENETIKAI HÁTTERE ÉS MÓDOSÍTÁSÁNAK LEHETŐSÉGEI JÁROMSPÓRÁS GOMBÁKBAN DR.

Fehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia

A növény inváziójában szerepet játszó bakteriális gének

Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.

Manuscript Title: Identification of a thermostable fungal lytic polysaccharide monooxygenase and

Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással

A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA

Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján

A koleszterin és az epesavak bioszintézise

SZENT ISTVÁN EGYETEM MIKOFENOLSAV MIKROBIOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA, A TERMELŐ MIKROORGANIZMUS JELLEMZÉSE. Doktori értekezés tézisei.

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

Fiatal kutatói beszámoló

A MIKROSZKOPIKUS GOMBÁK, MINT A MÁSODLAGOS

A Rhizomucor miehei járomspórás gomba HMG-koenzim A reduktáz génjének molekuláris és funkcionális vizsgálata

Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése

A Neosartorya fischeri által termelt defenzinszer antifungális protein azonosítása és jellemzése

Lignocellulóz bontó enzimek előállítása és felhasználása

Zárójelentés a Sonogashira reakció vizsgálata című 48657sz. OTKA Posztdoktori pályázathoz. Novák Zoltán, PhD.

4 vana, vanb, vanc1, vanc2

Oszvald Mária. A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro és in vivo vizsgálata rizs modell rendszerben

RIPORTER RENDSZER LÉTREHOZÁSA A TRICHODERMA REESEI PEPTAIBOL SZINTETÁZ EXPRESSZIÓJÁNAK ANALÍZISÉHEZ

A DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Sajben-Nagy Enikı Ilona

Egy új, a szimbiotikus gümőfejlődésben szerepet játszó ubiquitin ligáz funkcionális jellemzése

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI AZ OPPORTUNISTA HUMÁNPATOGÉN CANDIDA PARAPSILOSIS ÉLESZTŐGOMBA ELLENI TERMÉSZETES ÉS ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ VIZSGÁLATA

PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Biológiai Doktori Iskola Mikroorganizmusok életfolyamatainak molekuláris analízise

A HupSL és Hox1 NiFe hidrogenáz enzimek összehangolt szabályozásának vizsgálata Thiocapsa roseopersicina baktériumban. Ph.D.

A KUKORICA STRESSZREZISZTENCIA KUTATÁSOK EREDMÉNYEIBŐL

ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola vezető: Dr. Bánszki Tamás, MTA doktora. Témavezetők: mezőgazdaság-tudomány kandidátusa

Szakmai zárójelentés OTKA azonosító: NN 75255

ZAJÁCZ EDIT publikációs lista

Dr. Pesti Miklós publikációs listája

Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során

AZ ÁLLATGENETIKAI EROFORRÁSOKRA VONATKOZÓ GLOBÁLIS CSELEKVÉSI TERV és AZ INTERLAKENI NYILATKOZAT

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Hepatitiszt okozó vírusok molekuláris vizsgálata. N. Szomor Katalin. Budapest 2009.

Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék

Magyar Emlőstani Évkönyv. Szerzői tájékoztató (2016. február 27.)

Léptéknövelt Fehérje Expresszió Protein Expression Scale-up Servive (PRESS projekt)

ENZIMEK BIOTECHNOLÓGIAI ELŐÁLLÍTÁSA

2. Ismert térszerkezetű transzmembrán fehérjék adatbázisa: a PDBTM adatbázis. 3. A transzmembrán fehérje topológiai adatbázis, a TOPDB szerver

Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Háziállatokból izolált Histophilus somni törzsek összehasonlító vizsgálata

Károly Róbert Fıiskola Gazdaság és Társadalomtudományi Kar tudományos közleményei Alapítva: 2011

A preventív vakcináció lényege :

A HMG-KOA REDUKTÁZ FUNKCIONÁLIS DOKTORI ÉRTEKEZÉS NAGY GÁBOR TÉMAVEZETŐ: DR. PAPP TAMÁS EGYETEMI DOCENS BIOLÓGIA DOKTORI ISKOLA

Biogáz fermentáló rendszerek hatékonyságának mikrobiológiai fokozása

AZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, TILLING

Funkcionális halhús előállítása különböző olajok alkalmazásával

Hidrogenáz érés a Thiocapsa roseopersicina baktériumban

GYENIS B. SZIGETI J. MOLNÁR N. VARGA L.

University of Bristol - Explore Bristol Research

Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése

Növekvı arzén adagokkal kezelt öntözıvíz hatása a paradicsom és a saláta növényi részenkénti arzén tartalmára és eloszlására

NÖVÉNYÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Zárójelentés a PD OTKA pályázathoz

Irányítási struktúrák összehasonlító vizsgálata. Tóth László Richárd. Pannon Egyetem Vegyészmérnöki és Anyagtudományok Doktori Iskola

NiFe hidrogenázok és fotoszintetikus rendszer kifejeződését szabályozó szignál transzdukciós mechanizmusok Thiocapsa roseopersicina-ban

Bevezetés-Acinetobacter

Baranyáné Dr. Ganzler Katalin Osztályvezető

Magas fehérjetartalmú ipari hulladékok anaerob fermentációjának fokozása adaptált mikrobaközösség segítségével. Ph.D. Tézisek.

Dr. Fittler András, Ph.D március 03. Publikációk Összesített impakt faktor: 14,624 Összes független idézés: 17 Önidézés: 1

Szőke Péter Ádám Környezettudomány szak. Témavezető: Dr. Barkács Katalin

AZ ALACSONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN

Új genetikai stratégia kidolgozása az Arabidopsis stressz válaszát szabályzó gének azonosítására

A projekt tartalma és célja

Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén

III/3. Gének átvitele vektorokkal

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

A felgyorsult fehérje körforgás szerepe a transzlációs hibákkal szembeni alkalmazkodási folyamatokban

Rezisztens keményítők minősítése és termékekben (kenyér, száraztészta) való alkalmazhatóságának vizsgálata

Összefoglalás. Summary. Bevezetés

Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben

MÉLYFÚRÁSI GEOFIZIKAI ADATOK ÉRTELMEZÉSÉNEK MODERN INVERZIÓS MÓDSZEREI

OTKA ZÁRÓJELENTÉS

számú OTKA kutatás. Teljesítménymenedzsment rendszerek hatása az egyes szektorok és a gazdaság egészének teljesítőképességére

avagy az ipari alkalmazhatóság kérdése biotechnológiai tárgyú szabadalmi bejelentéseknél Dr. Győrffy Béla, Egis Nyrt., Budapest

Többgénes transzgénikus (GM) fajták előállítása

BIOTECHNOLÓGIÁK EGYÉB IPARÁGAKBAN. Pókselyemfehérjék előállítása dohányban és burgonyában


Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics Április 8 Május 22 8th April 22nd May

A gyümölcs érésének és a virág vázaélettartamának géntechnológiai módosítása

Supporting Information

A FOTOAKUSZTIKUS SPEKTROSZKÓPIA SZÉLESKÖRŰ ALKALMAZHATÓSÁGÁNAK ALÁTÁMASZTÁSA AZ IPARBAN, A BIOLÓGIÁBAN ÉS A KÖRMYEZETVÉDELEMBEN

EGYÜTTMŰKÖDŐ ÉS VERSENGŐ ERŐFORRÁSOK SZERVEZÉSÉT TÁMOGATÓ ÁGENS RENDSZER KIDOLGOZÁSA

TRANSZGÉNIKUS NIKUS. GM gyapot - KÍNA. GM szója - ARGENTÍNA

szakmai önéletrajz Bánhalmi András Személyes információk: Végzettségek, képzések: Idegen nyelv: Oktatás:

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A BIOAKTÍV LIPIDEK ÉS A ZSÍRSAV-BIOSZINTÉZIS SZEREPE A CANDIDA PARAPSILOSIS VIRULENCIÁJÁBAN GRÓZER ZSUZSANNA BARBARA

GAZDA - PATOGÉN KÖLCSÖNHATÁS VIZSGÁLATA CANDIDA FERTŐZÉSEK SORÁN

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

Ph.D. értekezés tézisei. A c-típusú citokrómok biogenezisében résztvevő fehérjék. szerepe és génjeik szabályozása Sinorhizobium meliloti-ban


Átírás:

ZÁRÓ SZAKMAI BESZÁMOLÓ A KAROTINOK TERMELTETÉSÉNEK BEFOLYÁSOLÁSA ÉS FOKOZÁSA JÁROMSPÓRÁS GOMBÁKBAN CÍMŰ POSZTDOKTORI OTKA PÁLYÁZATHOZ OTKA azonosító: PD 48537 Témavezető: Dr. Papp Tamás Kutatási időszak kezdete: 2004. 10. 01 Kutatási időszak vége: 2007. 09. 30. A pályázati program célja az volt, hogy rekombináns technikákat, valamint a genetikai transzformáció különféle eljárásait alkalmazva egyes karotintermelő járomspórás gombák, különösen a Mucor circinelloides, karotinoid bioszintézisét módosítsuk, továbbá, hogy az így létrehozott rendszerben vizsgáljuk a bioszintetikus út lefolyását és a karotintermelés mértékét. A kutatási program részeként munkatervben a következő konkrét célkitűzések szerepeltek: 1. A karotinoid termelés befolyásolása a mevalonsav-izoprén bioszintézis út genetikai módosításával (Mucor circinelloides genetikai transzformációja HMG-CoA reduktáz és carg géneket tartalmazó vektorok segítségével). 2. Heterológ gének (β-karotin hidroxiláz, β-karotin ketoláz) expressziója Mucor circinelloidesben, asztaxantin termelés lehetősége Mucorban 3. Transzformációs kísérletek egyéb karotintermelő járomspórás gombákkal. A pályázati időszak alatt elért eredmények: 1. Részletesen jellemeztük az általunk izolált Rhizomucor miehei HMG-KoA reduktáz gént (hmgr). Elvégeztük az izolált gén szekvencia és funkcionális elemzését, valamint kidolgoztunk egy erre a génre alapozott, direkt szelekciót biztosító transzformációs rendszert. Az azonosított gén nukleotidsorrendjét és a megfelelő fehérje aminosav sorrendjét depozitáltuk az EMBL Nucleotide Sequence Database adatbázisban (Accession no.: AJ568024). Vágvölgyi Cs, Lukács Gy, Nyilasi I, Papp T (2004) Development of a lovastatin resistance-based transformation system for Rhizomucor miehei. Clin. Microbiol. Inf. 10(S3), 507. Készítettünk a hmgr gént hordozó transzformáló vektorokat, melyekben a hmgr a saját, vagy Mucor szabályozó régiók kontrollja alatt áll. Heterológ transzformációval expresszáltattuk a hmgr gént M. circinelloidesben és sikerült fokozni a módosított Mucor törzsek sztatinokkal (HMG-KoA reduktáz gátlókkal) szembeni rezisztenciáját, jelezve a hmgr gén termékének kifejeződését. Ezen expressziós vizsgálatokból jelenleg egy publikáció áll összeállítás alatt, melyet még ez év első felében szeretnénk közlésre benyújtani. Lukács, Ács, Papp T, Somogyvári F, Csernetics Á, Vágvölgyi Cs (2008) The 3-hydroxi-3-methilglutharyl coenzyme A reductase gene of the zygomycete fungus, Rhizomucor miehei. (in preparation) 2. Izoláltuk a M. circinelloides izopentenil pirofoszfát izomeráz génjét (McIpp). Izoláltuk és meghatároztuk a Mucor izopentenil pirofoszfát izomeráz gén és a határoló szakaszainak szekvenciáját. Elvégeztük az McIpp gén részletes funkcionális elemzését, melynek során megállapítottuk, hogy szemben más eddig vizsgált szervezetekkel szemben (pl. módosított karotintermelő Candida, vagy Xanthophyllomyces) a gén terméke sebességmeghatározó a Mucor karotintermelése szempontjából. Az izolált génre alapozva transzformáló vektorokat szerkesztettünk a további, a karotin termelés módosítását célzó 1

kísérletekhez (lásd 3. pont), majd elvégeztük a transzformációs kísérleteket. A gén és a megfelelő fehérje szekvencia adatait elhelyeztük az EMBL nukleotid szekvencia adatbázisban (Accession no.: AM903092). A génizolálással és elemzéssel kapcsolatos eredményekről eddig nemzetközi konferencián számoltunk be, illetve jelenleg egy további publikáció áll benyújtás előtt: PappT; Iturriaga EA; Csernetics Á; Molina R; Álvarez MI; Eslava AP; Vágvölgyi Cs: Cloning and analysis of the gene isopentenyl pyrophosphate isomerase in Mucor circinelloides, ECFG-8. Vienna, Austria. Abstracts 229., 2006 3. A mevalonát-izoprén bioszintézis út géndózis hatáson alapuló túlműködtetésével karotintúltermelő M. circinelloides törzseket hoztunk létre. A mevalonsav-izoprén bioszintézis utak módosítását célzó kísérletekkel a M. circinelloides β- karotin termelésének fokozását kívántuk megvalósítani. A karotinoidok izoprénvázas vegyületek, specifikus bioszintézisük a közös izoprén útról ágazik le (1. Ábra). Acetil-KoA HMG-KoA Mevalonsav Izopentenil pirofoszfát (IPP) IPP izomeráz C 5 Dimetilalil pirofoszfát IPP C 5 Geranil pirofoszfát Monoterpének C 10 Szteridok Triterpének C 30 2 x IPP FPP Farnezil pirofoszfát Szeszkviterpének C 15 IPP GGPP Geranilgeranil pirofoszfát 2 x Diterpének C 20 Karotinoidok 1. Ábra. Az általános mevalonsav-izoprén bioszintézis út. Célunk az volt, hogy megvizsgáljuk, hogy ezen nem-specifikus izoprén út túlműködtetésével fokozható-e és milyen mértékben a karotinodiok termltetése a vizsgált gombákban. Számos az izoprén bioszintézis módosítását lehetővé tevő expressziós vektort készítettünk, az általunk izolált HMG-KoA reduktáz (hmgr), izopentenil pirofoszfát izomeráz (McIpp) és a Mucor farnezil pirofoszfát szintáz (isoa) és a geranilgeranil pirofoszfát szintáz (carg) génekre alapozva. Tanulmányoztuk a bioszintézis út módosításának hatását a karotintermelésre. Expressziós vizsgálatokat végeztünk az egyes részletesen analizált struktúrgénekkel, valamint különböző génkombinációkkal, különböző szabályozó szekvenciák alkalmazásával. Az egyes 2

gének kópiaszámának autoreplikatív plazmiddal történő emelése mintegy másfél-kétszeresére növelte az összkarotinoid produkciót. Megfelelő génkombinációk bevitelével azonban, az általunk előállított törzsekben, több mint háromszorosára sikerült a β-karotin tartalmat emelni az eredeti vad típusú törzshöz képest (2. Ábra). Papp T; Csernetics Á; Velayos A; Iturriaga EA; Eslava AP: Over-expression of isoprene biosynthetic enzymes in the b-carotene producer zygomycete Mucor circinelloides, J. Biotechnol. 118(S1): 153, 2005 Csernetics Á; Papp T; Velayos A; Iturriaga EA; Eslava AP; Vágvölgyi Cs: Carotene production with genetically modified Mucor circinelloides strains, Acta Microbiol. Hung. 52 (S): 22, 2005 Papp T; Iturriaga EA; Csernetics Á; Eslava AP; Vágvölgyi Cs: Improvement of the carotene production in Mucor circinelloides., Acta Microbiol. Hung. 53, 328, 2006 2. Ábra. Különböző autoreplikatív vektorkonstrukciókkal kapott transzformánsok összkarotinoid tartalma Szárazanyagtartalomra vonatkoztatva. Az egyes konstrukciók a következő géneket tartalmazzák: pavb160: isoa, pavb161: carg; pca6: carg; pca10: McIPP. Az említett izoprén szintézis gének felhasználásával, olyan plazmidokat is konstruáltunk, ahol a géneket a fokozottabb expressziót lehetővé tevő glicerinaldehid-3-foszfát dehidrogenáz 1 gén (gpd1) promóterrel és terminális régióval építettük össze. A Mucor gpd1 erősen kifejeződő gén, indukciója függ a tápközeg glükóz tartalmától. E transzformáló vektorokat is úgy építettük meg, hogy a géneket kombinációkban is be tudjuk vinni a recipiens törzsbe. A transzformációt minden lehetséges kombinációban elvégeztük. A transzformánsokban sikerült tovább emelni a karotinoid produckció mértékét (3. Ábra). Tanulmányoztuk továbbá a gpd1 promóter expresszióját (pl. a glükóz koncentráció változtatásának hatását a gének a fúziós gének expressziójára) és alkalmazhatóságát ebben a rendszerben. Génkombinációkkal végzett kísérletekkel elemeztük, hogy melyek a korai izoprén bioszintézis út a karotintermelés szempontjából legfontosabb sebesség-meghatározó lépései. Egy carg McIpp isoa sorrendet lehetett felállítani a karotintermelésre gyakorolt hatás alapján. Mindezen eredményekről, terveink szerint, még ebben az évben (az McIpp izolálásával együtt) egy folyóiratcikkben szeretnénk beszámolni. E a munkánkat az elmúlt évben egy szakmai konfenecián meghívott előadóként ismertethettem az Eurofung Project (http://eurofung.net) európai konzorcium gyűlésén: Papp T; Iturriaga EA; Csernetics Á; Eslava AP; Vágvölgyi Cs: Improvement of the carotene production in Zygomycetes fungi., Eurofungbase, Wageningen, The Netherlands, Abstracts 24., 2007 3

(µ/g) 2000 1500 1000 500 0 MS12 isoa McIpp carg isoa +carg McIpp +carg isoa +McIpp 1% 2,5% 5% (glükóz koncentráció a táptalajban) 3. Ábra. Különböző a gpd1 gén szabályozó régióival összeépített géneket tartalmazó vektorkonstrukciókkal kapott transzformánsok összkarotinoid tartalma szárazanyagtartalomra vonatkoztatva. (A gének rövidítései azt jelölik, hogy mely módosított géneket vittük be transzformációval az adott törzsbe.) 4. Heterológ génexpresszióval többféle megváltozott karotinoid összetételű Mucor circinelloides törzset hozunk létre. Autoreplikatív expressziós vektorokat hoztunk létre, amelyek lehetővé teszik az Agrobacterium aurantiacum asztaxantintermelő baktérium β-karotin-asztaxantin átalakulásért felelős génjeinek (β-karotin ketoláz, és β-karotin hidroxiláz, ) M. circinelloidesben történő kifejeződését. A 4. Ábra a β-karotin-asztaxantin konverzió lehetséges lefolyását és a keletkező köztitermékeket, az 5. Ábra pedig a transzformációs kísérletek stratégiáját szemlélteti. A bakteriális géneket a Mucor gpd1 szabályozó szakaszaival építettük össze. A létrehozott expressziós vektorokkal, különböző kombinációkban, transzformációs kísérleteket végeztünk autoreplikatív rendszerben. Sikerült a β-karotin értékes keto- (asztaxantin, kantaxantin, echinenon) és hidroxiszármazékainak (β-kriptoxantin, zeaxantin) termelődését kiválatni, illetve fokozni a transzformánsokban. Elsőként bizonyítottuk, hogy a β-karotin hidroxilációja Mucorban is lejátszódik, melynek során természetes körülmények közt is kimutatható mennyiségben termelődnek a hidroxilált származékok (a zeaxantin és a β- kriptoxantin). Tehát az asztaxantin termelés eléréséhez elegendő csak egy heterológ gént, a β- karotin ketolázt bevinni. Ezen eredményekről az Applied Microbiology and Biotechnology című folyóiratban számoltunk be: Papp T; Velayos A; Bartók T; Eslava AP; Vágvölgyi Cs; Iturriaga EA: Heterologous expression of astaxanthin biosynthesis genes in Mucor circinelloides, Applied Microbiology and Biotechnology 69: 526-531, 2006 4

β-karotin Echinenon β-kriptoxantin Kantaxantin 3 -hidroxiechinenon 3 -hidroxiechinenon Zeaxantin Phoenicoxanthin Adonixanthin Asztaxantin 4. Ábra. Az A. aurantiacum asztaxantin szintézisért felelős génjei által meghatározott átalakulási lépések és a lehetséges köztitermékek. (: β-karotin ketoláz gén; : β-karotin hidroxiláz gén) 5. Ábra. Az A. aurantiacum asztaxantin szintézisért felelős géneket tartalmazó Mucor expressziós vektorok szerkesztésének és a transzformációs kísérletek elve (MS12: a transzformációs kísérletekben recipiens törzsként használt M. circinelloides karotintermelő, uracil -, leucin - kettős auxotróf mutáns törzs; : β-karotin ketoláz gén; : β-karotin hidroxiláz gén). Megkezdtük a két párhuzamosan futó kutatási irány (i) a xantofilok termeltetését célzó heterológ expressziós kísérletek és (ii) az izoprén szintézis út fokozására irányuló kutatások egyesítését. Ennek érdekében olyan autoreplikatív transzformációs rendszereket hoztunk létre, melyekkel lehetővé vált a homológ izoprenoid gének, valamint a xantofillok termeléséért felelős módosított bakteriális gének együttes bevitele. Az így kapott xantofill termelő transzformánsokat részletesen jellemeztük, egyes törzsekben jelentős összkarotin szint emelkedést (6. Ábra) és azon belül is kiugró kantaxantin és echinenon szintet sikerült elérni. 5

E kísérleteket jelenleg is végezzük, az eddigi eredményeinkről a múlt évben egy szakmai konferencián számoltunk be: Papp T; Csernetics Á; Szekeres A; Iturriaga EA; Eslava AP; Vágvölgyi Cs: Modification of Mucor circinelloides for production of oxygenated beta-carotene derivatives., Power of microbes in industry and environment, Zadar, Croatia Abstracts 62., 2007 (µ/g) 2000 1500 1000 500 0 MS12 +McIpp +isoa +carg 1% 2,5% 5% (glükóz koncentráció a táptalajban) 6. Ábra. Az összkarotin szint növekedése a gén és az izoprén bioszintézis gének kominációival kapott kotranszformáns törzsekben, szárazanyagtartalomra vonatkoztatva. (A gének rövidítései azt jelölik, hogy mely módosított géneket vittük be transzformációval az adott törzsbe.) Olyan további vektorokat is szerkesztettünk, amelyek az A. aurantiacum génjének a Mucor genomba történő integrálását teszik lehetővé; ezekben a vektorokban is a Mucor gpd1 szabályozó régiói biztosítják az expressziót. Többféle vektort készítettünk, melyek a genom különböző helyeire történő integrációt biztosítják. Elvégezve a transzformációs kísérleteket, elemeztük a bevitt gének kifejeződésének mértékét a transzformánsokban, illetve vizsgáltuk karotinoid összetételüket, valamint a produkció mértékét. A 7. Ábra három integratív transzformáns telepet ábrázol, valamint az eredeti MS12 törzset. Több eltérő karotinoid összetételű transzformánst szelektáltunk, egyes transzformánsokban az oxigenált származékok szintjét sikerült több mint tízszeresre emelni. Ezek a kísérletek befejező szakaszukba jutottak, jelenleg az új transzformánsok termelőképességét, a tápközeg karotinoid összetételre gyakorolt hatását vizsgáljuk. Reményeink szerint eredményeinket a 2008-as év folyamán publikáljuk, illetve idén konferencián is szeretnénk eredményeinket ismertetni: Papp T; Iturriaga EA; Csernetics Á; Szekeres A; Eslava AP; Vágvölgyi Cs: Production of oxygenated betacarotene derivatives by modified Mucor circinelloides., ECFG-09 Edinburgh, United Kingdom (accepted), 2008 4. Vizsgáltuk a karotintermelés fokozására alkalmas tenyésztési, fermentációs körülményeket, valamint az eddig összegyűlt ismeretek alapján megkezdtük az izoprén bioszintézis gének, valamint a HMG-CoA gén karotintermelésre gyakorolt hatásának, valamint a termelés fokozására való felhasználhatóságának összehasonlító elemzését. A járomspórás gombák karotintermelésének befolyásolására, új törzsek előállítására vonatkozó 6

eredményeink egy részét és ismereteinket egy review jellegű könyvfejezetben is publikáltuk: Iturriaga EA; Papp T; Breum J; Arnau J; Eslava AP: Strain and culture conditions improvement for β-carotene production in Mucor, Microbial Processes and Products, Methods in Biothenology series Vol. 18, 2005 7. Ábra. Három integratív transzformációval előállított törzs (2-3) és az eredeti MS12 izolátum (1) telepszíne. 1: MS12; 2: MS12+pCA8/1; 3: MS12+pCA8/2; MS12+pCA9/1 5. Különböző járomspórás gombák karotinoid termelésének vizsgálata. Mivel a járomspórás gombák közül csak néhánynak ismerjük a részletes karotinoid összetételét, nagyszámú törzs bevonásával mintegy 30, a Mucor, Blakeslea, Backusella és a Gilbertella nemzetségekbe tartozó, járomspórás gombafaj karotinoid összetételét és termelőképességét elemeztük. Vizsgáltuk a különböző környezeti feltételek (fény, hőmérséklet, szénforrás) hatását is a karotinoid produkcióra. Sikerült az eddigi modellorganizmusokhoz képest eltérő karotinösszetételű, illetve intenzívebben termelő törzseket azonosítani. Több igen nagy produkcióra képes törzset találtunk, köztük olyanokat is, amelyek figyelemere méltó mennyiségben termelik az értékes zeaxanthint és β- kriptoxanthint is: Csernetics Á; Papp T; Barta K; Vágvölgyi Cs: Carotenoid production of different Zygomycetes fungi, Acta Microbiol. Hung. 53, 255-256, 2006 Papp T; Csernetics Á; Szekeres A; Vágvölgyi Cs: Carotenoid content of different species belonging to the class Zygomycetes., ECFG-09 Edinburgh, United Kingdom (accepted), 2008 E munka keretében egyes kiválasztott izolátumok karotinoid termelését részletesebben is megvizsgáltuk, valamint tanulmányozzuk, hogyan vonhatók be ezen új izolátumok a karotinoid termelés megváltoztatását célzó kísérletekbe. Ennek során izoláltuk és jellemeztük a Gilbertella persicaria farnezil pirofoszfát szintáz génjét, mely az izoprén bioszintézis egyik fontos kulcsenzimét kódolja. Az ezzel kapcsolatos eredmények egy részét már egy konferencián bemutattuk, de a közeljövőben folyóiratcikk formában is szeretnénk publikálni. Péteri Zs; Barta K; Csernetics Á; Vágvölgyi Cs; Papp T: Cloning and partial sequence analysis of the Gilbertella persicaria farnezyl pyrophosphate synthase gene., Acta Microbiol. Immunol. Hung. 54: 101, 2007 6. A transzformációs kísérletek kiterjesztése egyéb karotintermelő járomspórás gombákra; új integratív eljárások kifejlesztése. Transzformációs rendszereket köztük az integratív transzformációt biztosító Agrobacterium tumefaciens-mediált eljárás járomspórás gombákra adaptált változatát dolgoztunk ki és optimalizáltunk M. circinelloidesre és más eddig ilyen vizsgálatokra nem használt karotintermelőkre ilyen pl. a Backusella lamprospora, melynek karotintermelését szintén a 7

pályázati program keretében elemeztünk (lásd 5. pont). Új integratív transzformációs vektorokat és eljárásokat fejlesztettünk ki, illetve adaptáltunk járomspórás gombákra PEGmediált transzformációs rendszerekhez is. E munkákból a pályázat időtartama alatt több folyóiratcikk és konferencián bemutatott anyag született: Nyilasi I; Ács K; Papp T; Vágvölgyi Cs: Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of Mucor circinelloides, Folia Microbiologica. 50, 415-420, 2005 Nyilasi I; Papp T; Nagy E; Vágvölgyi Cs: Applicability of the Agrobacterium-mediated transformation in Zygomycetes, Acta Microbiol. Hung. 53, 324-325, 2006 Nyilasi I; Papp T; Csernetics Á; Vágvölgyi Cs: Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of the zygomycete fungus, Backusella lamprospora., J. Basic Microbiol. 48: 59-64., 2008 Nyilasi I; Papp T; Csernetics Á; Vágvölgyi Cs: Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation: a new technique for genetic modification of Zygomycetes, 4th Hungarian Mycological Conference, Debrecen, Hungary (accepted), 2008 Papp T; Csernetics Á; Nagy G; Szekeres A; Vágvölgyi Cs: Integrative transformation systems in Zygomycetes., 4th Hungarian Mycological Conference, Debrecen, Hungary (accepted), 2008 7. Egyéb eredmények. A járomspórás gombák karotin termelésének vizsgálata, a mutánsok előállítása során szerzett tapasztalatokat más karotinoid termelő gombákkal (pl. Phaffia, Xanthophyllomyces) kapcsolatos kutatásainkban is sikerrel fel tudtuk használni. Palágyi Zs; Papp T; Takó M; Nagy Á; Pesti M; Vágvölgyi C: Genetic variability of astaxanthin-producing yeasts: random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of Phaffia rhodozyma and Xanthopyllomyces dendrorhous, Acta Biol. Szeged. 48: 35-38, 2004 Lukács Gy; Kovács N; Papp T; Vágvölgyi Cs: The effect of vegetable oils on carotenoid production of Phaffia rhodozyma, Acta Microbiol. Hung. 52: 267, 2005 Takó M; Vágvölgyi Cs; Palágyi Zs; Linka B; Papp T: Characterization of carotenoid over-producing Xanthophyllomyces dendrorhous mutants, Acta Microbiol. Hung. 52 (S): 161, 2005 Vágvölgyi Cs; Lukács Gy; Takó M; Csernetics Á; Papp T: The effect of vegetable oils on astaxanthin production of Phaffia rhodozyma and Xanthophyllomyces dendrorhous, J. Biotechnol. 118(S1): 153, 2005 Palágyi Zs; Linka B; Papp T; Vágvölgyi Cs: Isolation and characterization of Xanthophyllomyces dendrorhous mutants with altered carotenoid content., Acta Aliment. Hung. 35, 223-228., 2006 Csernetics Á; Beáta L; Vágvölgyi Cs; Papp, T: Increased carotenoid content of Xanthophyllomyces dendrorhous cultivated in plant oil supplemented media., Acta Biol. Szeged. 51: 43-46, 2007 Blaskó A; Belágyi J; Dergez T; Deli J; Papp G; Papp T; Vágvölgyi Cs; Pesti M: Investigation of plasma membrane dynamics of Xanthophyllomyces dendrorhous by EPR and the effect of various carotenoids., Eur. Biophys. J. Biophy. (accepted, in press), 2008 Hasonlóképpen a járomspórás gombákkal kapcsolatosan, a génizolálásra, azok funkcionális elemzésére vonatkozó eredményeket és egyes a munka során előállított expressziós vektorokat más járomspórás gombákkal kapcsolatos munkákban is sikerrel alkalmaztuk: Linka B; Papp T; Nyilasi I; Vágvölgyi Cs: Cloning and molecular analysis of the catalase 1 gene from the opportunistic pathogen Rhizopus oryzae, Acta Microbiol. Hung. 53, 310., 2006 Takó M; Linka B; Papp T; Vágvölgyi Cs: A novel β-glucosidase gene from Rhizomucor miehei., ECFG-8. Vienna, Austria. Abstracts 257., 2006 Galgóczy L; Papp T; Leiter É; Pócsi I; Vágvölgyi Cs: Interactions between statins and Penicillium chrysogenum antifungal protein (PAF) to inhibit the germination of sporangiospores of different sensitive Zygomycetes., FEMS Microbiol. Lett. 270: 109 115, 2007 Vágvölgyi Cs; Manczinger L; Krisch J; Takó M; Papp T: New microbial enzymes: Clues for environment friendly biorefinery technologies., Acta Biol. Szeged. 51: 43-46, 2007 Nyilasi I; Papp T; Csernetics Á; Krizsán K; Nagy E; Vágvölgyi Cs: High-affinity iron permease (FTR1) gene sequences-based molecular identification of clinically important Zygomycetes., Clin Microbiol Inf (accepted, in press) Published online; doi: 10.1111/j.1469-0691.2007.01932.x, 2008 Összefoglalva a fentieket, elmondható, hogy a kitűzött célokat megvalósítottuk. A kutatási program eredményeként: 8

Több mint húsz megváltozott karotinösszetételű, asztaxantin és/vagy kantaxantin valamint más xantofillok termelésre képes, illetve karotinoid túltermelő M. circinelloides törzset állítottunk elő és jellemeztünk részletesen. Több eljárást dolgoztunk ki járomspórás gombák genetikai módosítására, valamint létrehoztunk egy módosított karotinoid termelésű mutánsparkot. Az eredmények felhasználhatók a további alap- és alkalmazott kutatásokban pl. ipari termelő törzsek kifejlesztésére. Azonosítottuk és részletesen jellemeztük a Rhizomucor miehei HMG-KoA reduktáz, valamint a Mucor circinelloides izopentenil pirofoszfát izomeráz génjét. Nagyszámú, a karotintermelés módosítását lehetővé tevő transzformációs vektort készítettünk, melyek a további törzsnemesítésben felhasználhatók. Mintegy 30 járomspórás gombafaj különböző törzseinek karotintermelését elemeztük különböző környezeti feltételek (fény, hőmérsékelt, szénforrás) mellett. Több új, nagy karotinoid produkcióra képes, illetve új karotinösszetételű törzset azonosítottunk, melyek a további munkákban felhasználhatók. A M. circinelloides genetikai transzformációja során alkalmazott technikák, vektorok, gének ezeknél a gombáknál is alkalmazhatók. Új, a későbbi alap- és alkalmazott kutatásokban is felhasználható eljárásokat, protokolokat dolgoztunk ki elsősorban a járomspórás gombák genetikai tramszformációjára, a karotin termeltetés körülményeire (tenyésztés, fermentáció) és a termelés fokozására vonatkozóan. Noha a kutatási szerződésben vállalt feladatokat teljesítettük, az eredmények egy részének publikálása áthúzódik a 2008. évre. Ez azért történt, mert eredményeinek szeretnénk nagyobb cikkekben, megfelelően rangos folyóiratban publikálni. Ugyanakkor fontos megemlíteni, hogy az OTKA pályázat keretében megvalósított kutatást elsősorban a túltermelő mutánsok előállítását és jellemzését folytatni szándékozzuk szélesebb, konzorciális keretek közt. Ehhez segítséget nyújtanak azok a nemzetközi együttműködések, melyek épp a jelen kutatási program megvalósítása során és a támogatás segítségével mélyültek el. Ezek közül is ki kell emelnünk Arturo Perez Eslava professzor (Salamancai Egyetem, Spanyolország) kutatócsoportját, amely a járomspórás gombák (azon belül is a karotinoid bioszintézis) kutatásának egyik legelismertebb csoportja Európában, valamint a járomspórás gombák transzformációjában és filogenetikai kapcsolatainak vizsgálatában szintén elismert Kerstin Voigt által vezetett csoportot (F. Schiller Egyetem, Jéna, Németország). 9