Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

Hasonló dokumentumok
Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció

A fehérjék hierarchikus szerkezete

A gázcsere alapjai, a légzési gázok szállítása

A fehérjék hierarchikus szerkezete

Fehérjeszerkezet, és tekeredés

Hiperbár oxigénkezelés a toxikológiában. dr. Ágoston Viktor Antal Péterfy Sándor utcai Kórház Toxikológia

3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)

A fehérjék szerkezeti hierarchiája. Fehérje-szerkezetek! Klasszikus szerkezet-funkció paradigma. szekvencia. funkció. szerkezet! Myoglobin.

3. Sejtalkotó molekulák III.

A kristálytérelmélet alapjai

A fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások

Szerkesztette: Vizkievicz András

A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA

4. változat. 2. Jelöld meg azt a részecskét, amely megőrzi az anyag összes kémiai tulajdonságait! A molekula; Б atom; В gyök; Г ion.

A citoszkeletális rendszer

Nukleinsavak építőkövei

Az sejt gépei az enzimek. Az enzimek ezt az aktivációs energiagátat csökkentik.

Bioinformatika 2 6. előadás

Natív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok

Biopolimer 12/7/09. Makromolekulák szerkezete. Fehérje szerkezet, és tekeredés. DNS. Polimerek. Kardos Roland DNS elsődleges szerkezete

A fehérjék hierarchikus szerkezete. Szerkezeti hierarchia. A fehérjék építőkövei az aminosavak. Fehérjék felosztása

Porfin vázas vegyületek (PORFIRINEK)

A glükóz reszintézise.

Közös elektronpár létrehozása

Általános Kémia. Sav-bázis egyensúlyok. Ecetsav és sósav elegye. Gyenge sav és erős sav keveréke. Példa8-1. Példa 8-1

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Fehérjeszerkezet, fehérjetekeredés


ph jelentősége a szervezetben

Membrántranszport. Gyógyszerész előadás Dr. Barkó Szilvia

Peptidek és fehérjék 1. Fehérjék Fehérjetekeredés. Fehérje (protein) Fehérje (protein) Aminosavak. Aminosavak

TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL

Kémiai reakciók Műszaki kémia, Anyagtan I. 11. előadás

Légzés. A gázcsere alapjai

Fehérjeszerkezet, és tekeredés. Futó Kinga

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39

Az elemeket 3 csoportba osztjuk: Félfémek vagy átmeneti fémek nemfémek. fémek

Immunológia alapjai előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B-sejt receptorok:

Kémiai kötések. Kémiai kötések. A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011

FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,

Róka András

b./ Hány gramm szénatomban van ugyanannyi proton, mint 8g oxigénatomban? Hogyan jelöljük ezeket az anyagokat? Egyforma-e minden atom a 8g szénben?

Víz. Az élő anyag szerkezeti egységei. A vízmolekula szerkezete. Olyan mindennapi, hogy fel sem tűnik, milyen különleges

Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus. Az energiaközvetítő molekula: ATP

A Ca 2+ szerepe a tormaperoxidáz enzim aktív szerkezetében. Szigeti Krisztián

Kémiai reakciók. Közös elektronpár létrehozása. Általános és szervetlen kémia 10. hét. Elızı héten elsajátítottuk, hogy.

Kémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

3. A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás

Kémiai kötések. Kémiai kötések kj / mol 0,8 40 kj / mol

Fémorganikus kémia 1

Jedlovszky Pál Eszterházy Károly Egyetem, Kémiai és Élelmiszerkémiai Tanszék Tanszék, 3300 Eger, Leányka utca 6

Adatgyőjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb mőszerei

Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése

KÉMIA. Kiss Árpád Országos Közoktatási Szolgáltató Intézmény Vizsgafejlesztő Központ 2003

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Biofizika I

Biológia 3. zh. A gyenge sav típusú molekulák mozgása a szervezetben. Gyengesav transzport. A glükuronsavval konjugált molekulákat a vese kiválasztja.

Tartalom. A citoszkeleton meghatározása. Citoszkeleton. Mozgás a biológiában A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 12/9/2016

Immunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői

BIOMOLEKULÁK KÉMIÁJA. Novák-Nyitrai-Hazai

A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER (Nyitrai Miklós, )

Kémiai kötések és kristályrácsok ISMÉTLÉS, GYAKORLÁS

Dózis-válasz görbe A dózis válasz kapcsolat ábrázolása a legáltalánosabb módja annak, hogy bemutassunk eredményeket a tudományban vagy a klinikai

Sillabusz orvosi kémia szemináriumokhoz 1. Kémiai kötések

Szakközépiskola évfolyam Kémia évfolyam

Peptid- és fehérjék másodlagos-, harmadlagos- és negyedleges szerkezete


Összefoglalók Kémia BSc 2012/2013 I. félév

Fehérjék felépítése és struktúrája. Aminosav oldalláncok. A fehérjék királis elemekből (α-l-aminosavakból) épülnek fel

A kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás

(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.

I. Atomszerkezeti ismeretek (9. Mozaik Tankönyv: oldal) 1. Részletezze az atom felépítését!

KÉMIA I. RÉSZLETES ÉRETTSÉGIVIZSGA-KÖVETELMÉNY A) KOMPETENCIÁK

KÉMIA I. RÉSZLETES ÉRETTSÉGI VIZSGAKÖVETELMÉNY A) KOMPETENCIÁK

KÉMIA Kiss Árpád Országos Közoktatási Szolgáltató Intézmény Vizsgafejlesztő Központ 2003

4. FEHÉRJÉK. 2. Vázanyagok. Az izmok alkotórésze (pl.: a miozin). Inak, izületek, csontok szerves komponensei, az ún. vázfehérjék (szkleroproteinek).

Oldódás, mint egyensúly

Kémiai kötés Lewis elmélet

ALLOSZTÉRIKUSAN SZABÁLYOZÓ METABOLITOK HATÁSA A PIRUVÁT-KINÁZ L és M IZOENZIMRE

A fehérjék harmadlagos vagy térszerkezete. Még a globuláris fehérjék térszerkezete is sokféle lehet.

Dér András MTA SZBK Biofizikai Intézet

A TESTFOLYADÉKOK SAV BÁZIS ÁLLAPOTA ÉS SZABÁLYOZÁSA

Oldódás, mint egyensúly

Fény kölcsönhatása az anyaggal:

Röntgen sugárzás. Wilhelm Röntgen. Röntgen feleségének keze

Biokémia II. Biokémiai szabályozás Szarka, András

Az élethez szükséges elemek

Adatgyűjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb műszerei

Sav bázis egyensúlyok vizes oldatban

Folyadékkristályok; biológiai és mesterséges membránok

A víz kondicionálása. Dr. İsz János, BME EGR Tsz. Tajti Tivadar, LG Energia Kft Atomerımővek BME NTI

A légzés. Dr. Oláh Attila. DEOEC Élettani Intézet

Adatgyűjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb műszerei

Országos Középiskolai Tanulmányi Verseny 2009/2010. Kémia I. kategória II. forduló A feladatok megoldása

Peptid- és fehérjék másodlagos-, harmadlagos- és negyedleges szerkezete

Fémionok szerepe az élő szervezetben: a bioszervetlen kémia alapjainak megismerése

Átírás:

Hemoglobin - myoglobin Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

Myoglobin A váz- és szívizom oxigén tároló fehérjéje Mt.: 17.800 153 aminosavból épül fel A lánc kb 75 % a hélix 8 db hélix, köztük nem helikális szerkezetek I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin

I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 3

Myoglobin A fehérje centrumában apoláros oldalláncok Kivéve két His (F8 & E7) Az ionos és poláros oldalláncok a felszín felé orientáltak. A felszínen poláros és apoláros R Hem F8 proximális His E7 disztális His N terminális I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 4

Myoglobin Prosztetikus csoportja Hem (protoporfirin IX. Fe + ) A hem apoláros oldalláncai: metil, vinil a myoglobin apoláros magjával apoláros kölcsönhatást létesítenek Fe + nem oxidálódik A két propionát oldallánc a molekula felszíne felé orientált Fe + I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 5

Myoglobin A hem Fe + ionja hat lingandummal képez komplexet 4 ligandum: pirrol N 1 ligandum: F8 His 1 ligandum: O Fe + F8 His felé kiemelkedik a hem síkjából (0,3 0,4 Ǻ) I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 6

Myoglobin Fe: 3d 6 4s Fe + : 3d 6 I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 7

I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 8

Myoglobin E7 His kívül van a koordinációs szférán 5,000-szer 00-50-szer erősebb kötés (stabilabb komplex), mint az O -nel képzett komplex His E7 a CO-hem komplex stabilitását 100-szoros mértékben csökkenti. I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 9

A myoglobin oxigén telítése A myoglobin hem komplexének 6. liganduma: O M K K d d' O Kd M O MO M po MO MO M: myoglobin MO : myoglobin O komplex [O ] po [O ] vizes oldatban a po függvénye I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 10

A myoglobin oxigén telítése T Ha MO MO M T: myoglobin O telítettsége MO M K D ' po (P 50 ) T 0,5 K D : az a po érték, amely mellett a myoglobin félig telített O -nel I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 11

A myoglobin oxigén telítése K D' M po MO egyenletből MO T T M po MO MO M M M K D' K D' po po K K D' D' M egyenletbe [MO ] t helyettesítve I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 1

A myoglobin oxigén telítése T po po K D' y x x K Hiperbola egyenlete A mioglobin O telítettsége a po -től hiperbolikusan függ I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 13

I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 14

Hemoglobin A vörös vértestekben az O transzportot ellátó globuláris protein (3*10 8 /vvt) HbA (felnőtt humán) a és ß alegységből álló tetramer (a & ß ) I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 15

Hemoglobin Perutz Mt.: 64500 a 141 aminosav 7 a hélix ß 146 aminosav 8 a helix I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 16

Hemoglobin Myoglobinban, hemoglobinban a és ß monomerekben 5 aminosav azonos, azonos helyeken. Tercier struktúrák nagyon hasonlóak a: C term. aminosav Arg ß: C term. aminosav His I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 17

Hemoglobin Kvaterner szerkezete: α és ß alegység alkot egy kb. gömb alakú tetramert (6,5x5.5x5 nm) Az alegységek között Apoláros kölcsönhatás H-hidak Ionpárok Kovalens kötés nincs (a konformáció flexibilis) Valamennyi alegység tartalmaz hem prosztetikus csoportot. Egy Hb molekula 4 O ligandumot képes megkötni I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 18

A myoglobin és hemoglobin O telítési görbéje Myoglobin P 50 = 1 Hgmm Hemoglobin P 50 = 6 Hgmm A hemoglobin O telítési görbéje szigmoid Az első O ligandum hemhez kötése megkönnyíti a második, ez utóbbi a harmadik stb O ligand kötését A jelenség: kooperativitás K K D1 > K D > K D3 > K D1 D4 ~ 300 K I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 19 D4

Hemoglobin oxigén telítési görbéje Myoglobin P 50 = 1 Hgmm Hemoglobin P 50 = 6 Hgmm Biológiai jelentősége: A tüdőben megkötött O leadása a szövetekben I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 0

Hemoglobin oxigén telítési görbéje I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 1

A hemoglobin O telítési görbéje A hemoglobin tetramer O kötő képessége (affinitása) alapvetően eltér a monomerek (illetve myoglobin) O affinitásától Negyedleges szerkezet működésváltozás Alegységek közötti kölcsönhatás Allosztérikus kölcsönhatás (nem a ligandum kötő helyét érinti) A hemoglobin allosztérikus protein I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin

A hemoglobin O telítési görbéje Allosztérikus effektor: nem fehérje molekula, amely a fehérjéhez kapcsolódva befolyásolja annak működését (aktivitását). Lehet fokozó (aktivátor) gátló (inhibitor) Nem kapcsol be vagy ki! I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 3

Az allosztérikus kölcsönhatás Szekvenciális model Szimmetrikus model csak T és R nincs átmeneti konformációs állapot I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 4

T% HbF (ag) magzati Hb I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 5

Ionpárok a hemoglobin monomerek között T konf. a c term. Arg ß c term. His A C terminális aminosavak két ionpárt alakítanak ki. Összesen 8 ionpár vesz részt A T konformációban. I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 6

Dezoxihemoglobin A hemoglobin feszes (T) állapotát a négy alegység C terminális ionpárjai eredményezik. A konformációt a két ß alegység közötti,3 BPG tovább stabilizálja. Az alfa monomerekben a C és N terminális végek is ionpárokat alkotnak. 91 I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 7

I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 8

I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 9

I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 30

Az O által indukált komformációváltozás a negyedleges szerkezetben Az oxihemoglobin a 1 ß 1 dimerje 15 o -kal elfordul az a ß dimerhez képest. A két ß monomer közelebb kerül egymáshoz I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 31

A dezoxi oxi hemoglobin konformáció változás F hélix (prox. His révén) elmozdul Fe + - O Fe + a hem síkjába merül FG Tyr a C terminális ionpárokat szétszakítja (ß C term., His H + ) ß 1 -ß közötti távolság csökken (a 1 ß 1 dimer elfordulása),3 BPG ionkötés (ß 1 -ß ) gyengül majd a,3 BPG disszociál I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 3

Bohr-effektus I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 33

Bohr effektus po Hgmm Hemoglobin O telítése különböző ph értékek mellett Hasonló folyamat az a monomer N-terminális a NH -nél. I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 34

A CO transzportja Szövetekben karboanhidráz (vvt) CO H O H CO 3 HCO - 3 H Tüdő H HCO - H CO H O CO 3 3 I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 35

A CO kisebb hányada: N-terminális R-NH + O=C=O O R1 N H C O Karbamát I. éves konzultációk: Hemoglobin & myoglobin 36