PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
|
|
|
- Viktória Kisné
- 10 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Kémia Doktori Iskola Fehérje szerkezet és működés c. program Glicerinezett izomrostok vizsgálata ATP hidrolízis köztes állapotaiban EPR és DSC technikával PhD értekezés Degez Tímea Témavezető: Prof. Dr. Belágyi József Emeritus professzor PÉCS, 2006
2 Köszönetnyílvánítás Köszönetemet szeretném kifejezni témavezetőmnek, Prof. Dr. Belágyi József emeritus professzor úrnak munkám során nyújtott szakmai és erkölcsi támogatásáért, türelméért, bíztatásáért. Köszönöm Dr. Lőrinczy Dénes docens úrnak, a PTE-ÁOK Biofizikai Intézetében végzett DSC mérésekben való segítségét. Köszönöm Dr. Hartvig Nóra áldozatos munkáját, aki többször, lelkiismeretesen átolvasta disszertációmat, s építő kritikájával igyekezett jobbá tenni tartalmát. Köszönetet mondok Prof. Dr. Kilár Ferenc egyetemi tanárúrnak, a PTE-ÁOK Bioanalitikai Intézet igazgatójának, támogatásáért, tanácsaiért és hogy lehetővé tette számomra, hogy az intézetben dolgozzak Köszönöm Borbásné Dr. Farkas Kornélia segítségét, aki beavatott az EPR mérések rejtelmeibe, s egy-egy jó szóval mindig bíztatott a disszertációm írása során. Köszönettel tartozom a PTE-ÁOK Bioanalitikai Intézet valamennyi dolgozójának a mindennapokban nyújtott segítségért. 2
3 Tartalomjegyzék PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Bevezetés Irodalmi áttekintés Az izom A vékony filamentum tulajdonságai Az aktin monomer (G-aktin) Az aktin filamentum (F-aktin) Az aktin polimerizációja A vastag filamentum A miozin molekula Az izomrost működése Célkitűzések Anyagok és módszerek Izomrostok preparálása Izomrostok jelölése EPR méréshez Nukleotidcsere izomrostokon ATPáz aktivitás mérés Izomrost minták előkészítése DSC méréshez Mérési eljárások Az elektronparamágneses rezonancia spektroszkópia (EPR) Az EPR készülék működése Alkalmazott EPR mérési technika Az EPR spektrumok kiértékelése Differenciál pásztázó kalorimetria (DSC) Eredmények és megvitatás EPR mérések eredménye DSC mérések eredménye Hőmérsékleti átmenetek rigor állapotú izomrostban Nukleotidok hatása a hőátmenetekre Összefoglalás...67 Az értekezés alapjául szolgáló közlemények...80 Egyéb közlemények...80 Az értekezés alapjául szolgáló absztraktok...80
4 Rövidítések jegyzéke ADP AM AMP.PNP ATP DSC EDTA EGTA ELC ESR EPR DTNB F-aktin G-aktin HMM LC LMM MEA MOPS MSL NADH NEM Pi PMSF RLC S1 S2 SH1 SH2 SDS ST TCSL Trisz.HCl adenozin-5 -difoszfát aktomiozin adenozin-5 -β,γ-imidotrifoszfát adenozin-5 -trifoszfát differenciál pásztázó kalorimetria etilén-diamin-tetraecetsav etilénglikol-bisz-(β-aminoetil-éter)-n,n,n,n -tetraecetsav esszenciális könnyű lánc (essential light chain) elektronspin rezonancia spektroszkópia elektronparamágneses rezonancia spektroszkópia 5,5 -ditiobisz (2-nitrobenzoesav) filamentózus aktin globuláris aktin nehéz meromiozin (heavy meromyosin) könnyű lánc (light chain) könnyű meromiozin (light meromyosin) 2-merkapto-etanol 4-morfolin-propán-szulfonsav N-(1-oxil-2,2,6,6-tetrametil-4-piperidinil)maleimid spin jelölő nikotinamid-adenin-dinukleotid N-etil-maleimid anorganikus foszfát fenil-metil-szulfonilfluorid regulációs könnyűlánc (regular light chain) szubfragmentum-1 szubfragmentum-2 cisztein-707 cisztein-697 nátrium-laurilszulfát szaturáció transzfer 4-izotiocianát-2,2,6,6-tetrametilpiperidinoxil spin jelölő 2-Amino-2-hidroximetil-1,3-propándiol-hidroklorid 4
5 1. Bevezetés Az élő szervezetek alapvető jellegzetessége a mozgás, amely régóta kutatott területe a biológiának. A harántcsíkolt izom mint magasfokú szupramolekuláris rendezettséggel bíró rendszer tág lehetőségeket nyújt az orientációra érzékeny EPR technika önálló és más bioanalitikai módszerekkel kombinált alkalmazására. Értekezésemben újszerűen próbáltam alkalmazni együtt az EPR és DSC technikát annak érdekében, hogy a harántcsíkolt izom működéséről új ismereteket szerezzek. Az izomműködés során az ATP hidrolízist kísérő miozin szerkezeti módosulásainak pontos molekuláris mechanizmusa ma sem teljesen tisztázott kérdése az izomkutatásnak. Munkámban ezekre a tisztázatlan kérdésekre kerestem a választ, s próbáltam olyan modern technikákat alkalmazni, amelyekkel kapott eredmények jól összevethetők, egyedi eddig nem vizsgált szemszögből közelítik meg a problémát. Disszertációmat igyekeztem úgy felépíteni, hogy könnyen megérthető legyen, melyet a rövid irodalmi bevezető nagyban megkönnyít. Az anyagok és módszerek részletes leírásával szeretném elérni, hogy az egyes technikák alkalmazását más is hasznosítani tudja saját kutatási területén. A célkitűzésekben megfogalmazott elvárásaimra az eredmények részben igyekeztem részletes válaszokat adni, s egy összefoglalás részben mégegyszer szintetizálni az elért eredményeimet. 5
6 2. Irodalmi áttekintés 2.1. Az izom Az izomkontrakció, a citoplazma mozgása a növényekben, az amöboid mozgás, a citokinézis és más miozinfüggő mozgás az aktin és miozin közötti ciklikus kölcsönhatáson alapul. Az aktin és miozin közötti kölcsönhatások vizsgálatát eddig jórészt oldott állapotban lévő aktin és miozin motor domén fragmentumokon végezték, majd az eredményeket összehasonlították mechanikai, szerkezeti, optikai mérésekkel, melyeket intakt izomrostokon figyeltek meg [-]. 1. ábra. Az emberi vázizomzat felépítése. A mozgásformák vizsgálatához legrégebb óta használt rendszer a gerincesek akaratlagos mozgását létrehozó vázizomzat, melynek legfontosabb feladata a test vázát alkotó elemek (gerincesekben a csontok) egymáshoz képest való elmozdítása, ezáltal a test helyzetének, illetve helyének módosítása. Az egyedfejlődés során a vázizmot alkotó sejtek kezdetben különállóak, majd fúziójuk következtében hosszú, többmagvú egységek jönnek létre, amelyeket izomrostoknak nevezünk. A vázizomrostok miofibrillumokból épülnek fel, melyek sorban elrendezett szarkomer egységekből állnak. A vázizmok összehúzódásának szerkezeti alapját a kontraktilis fehérjék az aktin és miozin jelentik. Az aktin és miozin molekulák filamentumokat képeznek, amelyek sajátos rendezettsége adja, a mikroszkópos felvételeken jól látható, a vázizomzatra jellemző harántcsíkolatot (1. ábra). 6
7 2. ábra. Harántcsíkolt izomrost elektronmikroszkópos képe és szerkezete. A rajzolatot az eredményezi, hogy a rostok hossztengelye mentén szabályos rendben sötétebb anizotrop (A, kifejezetten kettőstörő) és világosabb izotrop (I, gyengén kettőstörő) szakaszok váltják egymást. Az izom hosszanti metszéslapján látható szakaszok közül az A-csík 1,5 2,0 µm hosszú, egymáshoz simuló aktin- és miozin filamentumokból áll, melynek közepén figyelhető meg egy keskeny, világosabb H-zóna az ún. M-zónával. Az I-csíkot csupán aktinfilamentumok alkotják, közepén található az igen kifejezett Z-lemez (telophragma). Az A-csíkban levő, harántirányú, sötét M-csíkot az aktin filamentumok 85 µm hosszú, orsószerű megvastagodása alkotja. Az aktin filamentumok kötegeinek két vége (az A-csík két végén) a vastagabb miozin filamentumok közé nyomul. Aktin filamentumoktól mentes a H-zóna (Hensen-zóna). A két Z-csík között lévő sarcomer az izomműködés egysége, melynek hossza az izom elernyedt állapotában 1,5-2,5 mm körüli. (2. ábra). A rostok alapvető működési formája az idegi utasításra bekövetkező összehúzódás (rángás, kontrakció). Az izom megrövidülését a vékony- és vastag filamentumok egymáson történő elcsúszása eredményezi, amelyet sliding mozgásként ír le a tudomány. [,]. Az elcsúszást a két filamentum rendszer között kapcsolatot teremtő kereszthidak aktivitása hozza létre. Az izom rövidülése tulajdonképpen a vastag filamentumból kinyúló miozin fejek és az aktin filamentum ciklikus kölcsönhatásának 7
8 az eredménye. A folyamathoz szükséges energiát a miozin molekula feji régiójában lejátszódó ATP hidrolízis szolgáltatja. Az ATP-ből felszabaduló kémiai energia egy része úgy alakul át mechanikai energiává, hogy az izom molekuláris rendszerében máig sem pontosan felderített szerkezeti változások következnek be. A hidrolízis során a miozin konformáció változások sorozatán megy át, amelynek során megváltozik a miozin aktinhoz viszonyított helyzete, s így létrejön a rost rövidülése. A ciklikus kölcsönhatás folyamatában a miozin molekula több állapota különböztethető meg. A vékony és vastag filamentumok mellett a szarkomerekben megtalálhatók a kontrakció szabályozásához szükséges fehérjék (tropomiozin és troponin) valamint olyan struktúrák, amelyek szerepe a szerkezet fenntartásában, illetve az izomszövet mechanikai jellegzetességeinek meghatározásában valószínű (pl. konnectin, α-aktinin). Jelen vannak a sejtplazmában mindazon elemek, amelyek a rost energatikai szükségleteinek biztosításához elengedhetetlenek (glikolitikus enzimek, mitokondriumok), valamint a sarcolemma alatt a sejtmagok A vékony filamentum tulajdonságai A vázizomrostok vékony filamentumainak felépítésében az aktin és a szabályozó fehérjék vesznek részt. Az aktin felfedezése Straub F. Brúnó nevéhez fűződik, aki ben Szegeden Szent-Györgyi Albert laboratóriumában izolálta [, ]. Az aktin a leggyakoribb fehérje a tipikus eukarióta sejtekben: akár az összes fehérjemennyiség 15%-át is kiteheti. Evolúciós szempontból meglehetősen konzervatív fehérjéről van szó, molekuláris biológiai vizsgálatok kimutatták, hogy a Gerinchúrosok törzsének (Chordata) és a Gerincesek törzsének (Vertebrata) több mint 90%-ban azonos az aktinjaik aminosav sorrendje []. Az eukarióta sejtekben az aktin két meghatározó formában található meg: alacsony ionerősségű oldatban globuláris monomerként (Gaktin), fiziológiás sóoldatban pedig fibrilláris polimer alakjában (F-aktin). 8
9 Az aktin monomer (G-aktin) Az aktin monomereket egyetlen, mintegy 375 aminosavból álló polipeptidlánc alkotja, melynek molekulatömege 43 kda-ra tehető. Háromdimenziós szerkezetét először Kabschnak és munkatársainak sikerült meghatároznia [] (3. ábra). szubdomén IV. szubdomén II. szubdomén III. szubdomén I. 3. ábra: Nyúl harántcsíkolt izomból preparált aktin monomer szerkezeti modellje (Kabsch 1990). Az aktin szerkezete két nagy alegységre bontható, melyek további két kisebb egységből, un. szubdoménből állnak. A nagy alegységek két egymáshoz közel húzódó polipeptidszálon keresztül kapcsolódnak össze az aktin monomer alsó részén. Ez a flexibilis kapcsolat teszi lehetővé, hogy a két alegység egymáshoz képest elmozduljon. A négy szubdomén elhelyezkedése egy meglehetősen nagy hasadékot képez a molekulán. Ez a hasadék egy kétértékű iont (leggyakrabban Mg 2+ iont) és egy nukleotidot (ATP vagy ADP) képes megkötni. Fiziológiás körülmények között a kötött kation Mg 2+ [-], amely jelenlétében polimerizál, filamentumokat hoz létre, ami funkcionális szempontból kiemelkedő jelentőségű tulajdonság. A monomerek képesek más egyértékű és kétértékű kationok megkötésére is. A kötött kation minősége jelentős mértékben befolyásolja az aktin tulajdonságait. Nyitrai M, Hild G, Belagyi J, Somogyi B (1997) Spectroscopic Study of Conformational Changes in Subdomain 1 of G-Actin: Influence of Divalent Cations. Biophys J. 73 (4): 2023:
10 Nyitrai M, Hild G, Lakos Zs, Somogyi B (1998) Effect of Ca2+ Mg2+ Exchange on the Flexibility and/or Conformation of the Small Domain in Monomeric Actin. Biophys J. 74(5): A nagy affinitású kationkötőhely nem egyforma erővel köti meg a kationokat, ezért meghatározott sorrend állítható fel közöttük [-]: Ca 2+ > Mn 2+ > Cd 2+ > Mg 2+ > Zn 2+ > Ni 2+ > Sr 2+ Emellett léteznek más, kisebb affinitású kötőhelyek is, de ezek nem mutatnak eltérő affinitást az egyes kationokra []. Az aktin kationkötő képessége a nukleotidkötő képességére is hatással van. Eltávolítva a kationt (például valamilyen kelátképző vegyülettel) az aktin affinitása a nukleotidokhoz drasztikusan lecsökken [-], a nukleotidok hiánya pedig, bizonyos körülmények között gyors denaturációhoz vezet []. Kísérletek során meghatározták az aktin monomerek kritikus koncentrációját, amely alatti érték esetén nem alakulnak ki filamentumok. Ca 2+ kötése esetén ez a koncentráció egy nagyságrenddel nagyobb, mint Mg 2+ -mal telített monomerek esetén. Ha Mg 2+ -ot kötnek a monomerek az ATP hidrolízis felgyorsul [] Az aktin filamentum (F-aktin) Az aktin monomerek nem kovalens összekapcsolódásával, a polimerizáció folyamatában filamentumokká alakulnak. A kialakult filamentumok szerkezeti és funkcionális tulajdonságait nagymértékben befolyásolja a kötött kation és nukleotid minősége valamint a környezet fiziko-kémiai tulajdonságai egyaránt. Hild G, Nyitrai M, Somogyi B (2002) Inter-monomer flexibility of Ca- and Mg-actin filaments at different ph values. Eur. J. Biochem. 269(3): Nyitrai M, Hild G, Hartvig N, Belagyi J and Somogyi B (2000) Conformational and Dynamic Differences between Actin Filaments Polymerized from ATP- or ADP-Actin Monomers. J. Biol. Chem. 275(4): Nyitrai M, Hild G, Belagyi J, Somogyi B (1999) The flexibility of actin filaments as revealed by fluorescence resonance energy transfer. The influence of divalent cations. J Biol Chem. 274(19):
11 A filamentumban a monomerek helikális elrendeződésűek, melyet kétféleképpen lehet leírni: egyrészt, mint egy egyszálú balmenetes hélixet, amelynek monomerenkénti emelkedése 2,75 nm, és egy teljes menet 36 nm, amit 13 monomer hoz létre, másrészt, mint egy kétszálú jobbmenetes hélixet, amelynek félperiódusa 36 nm hosszú. Ebben a modellben a filamentumok átmérője 9-10 nm []. A filamentumon belül a monomerek úgy helyezkednek el, hogy a két nagy alegység közül az I-es a periférián foglal helyet, a II-es a hélix belsejében. A szabályozó fehérjék közül a tropomiozin két, egymás köré csavarodott aminosavláncból álló, hosszúkás molekula, amelyik a két aktinlánc közötti árkokban helyezkedik el úgy, hogy egy tropomiozin molekula hét aktin monomert (G-aktint) fed le. Ennek az elhelyezkedésnek szerepe lehet a kontraktilis aktiválás során bekövetkező molekuláris történések hosszirányú szervezésében. A tropomiozin lokalizációjának igazi jelentősége abban áll, hogy lehetővé teszi a rost nyugalmi állapotában az aktin-miozin ciklikus kölcsönhatás gátlását. A másik szabályozó fehérje a troponin, három alegységből áll (troponin I, troponin T és troponin C). Egy tropomiozin molekulához egy troponin komplex csatlakozik Az aktin polimerizációja Az aktin, szerkezetének köszönhetően mind az izomban, mind a citoszkeletális rendszerben dinamikus átrendeződésre képes képletet alkot, amely lehetővé teszi, hogy az izom összehúzódásában, a különféle sejtek alakváltozásainak szabályozásában fontos szerepet töltsön be. Ehhez azonban a monomereknek először filamentális formába kell szerveződniük. A polimerizáció folyamatának modelljét először Hanson és Lowy írta le 1963-ban, majd a filamentum térszerkezetének modelljét Holmes és Milligan publikálta 1990-ben [-]. A polimerizáció a sejtekben igen nagy sebességgel végbemenő, dinamikus folyamat, melynek során a filamentumok folyamatosan átrendeződnek. Ezt a jelenséget írja le a treadmilling - mechanizmus, amelynek során a filamentum egyik végéhez asszociálnak ( barbed end, + vég), míg ellentétes végéről disszociálnak a monomerek 11
12 (pointed end, - vég) []. A G-aktin bizonyos fiziológiás feltételek mellett ATP hidrolízise közben polimerizálódik kettős-hélix szerkezetű F-aktinná (4. ábra). 4. ábra. Aktin polimerizációja. Fiziológiás körülmények között az asszociáló monomer egy MgATP-komplexet tart kötve. A növekvő véghez való asszociációt követően az ATP hidrolizálódik, majd az anorganikus foszfát polimerből való kilépése után [, ] a monomer a treadmilling mechanizmusnak köszönhetően végigérve a filamentumon disszociálódik a pointed végen [, ]. A kialakuló filamentumban a protomerek többsége (kivéve az éppen belépő, még ATP-t kötő, továbbá az ATP hidrolízis után a Pi-t még el nem eresztő monomereket) egységesen ADP-t tartalmaz. Létrehozható azonban aktin polimer úgyis, hogy kiinduláskor a monomerek ADP-t tartanak kötésben. Ilyen kiindulási feltételek mellett azonban a polimerizáció lassúbb folyamat, de a kialakult filamentumokban a protomerek ebben az esetben is ADP-t tartalmaznak. Janmey és munkatársai összehasonlították a különböző monomerekből polimerizált aktin filamentumok flexibilitását, és különbséget tapasztaltak a kétféle filamentum között. Így arra a következtetésre jutottak, hogy a polimerizáció során a hidrolízissel felszabaduló energia elasztikus energiaként tárolódik a filamentumban, és fontos szerepet játszhat a filamentum és az aktinkötő fehérjék kapcsolatának kialakulásában []. Az aktin polimerizációra való hajlama függ a különböző nukleotidot tartalmazó aktin monomerek filamentum végekhez való affinitásától, a két vég e tekintetben eltérést mutat. Az épülő vég az ATP-t, míg az ellentétes vég az ADP-t kötésben tartó monomerekhez mutat nagyobb affinitást. Ez a különbség biztosítja a filamentum épülését [], valamint jellemző polaritást ad a polimernek. Ismeretes, hogy van egy aktin 12
13 monomer koncentráció, amely alatt az aktin nem fog polimerizálódni. A monomerek kritikus koncentráció feletti értékén, az aktin polimerizálódik, míg a szabad monomer koncentráció egyenlő nem lesz a kritikus koncentrációval (0.2 µm). In vitro az aktin polimerizáció függ az egyéb környezeti paraméterektől is. Például 4 C-on, az aktin kritikus koncentrációja 0.03 mg/ml, 2mM Mg 2+ és 50mM KCl jelenlétében, amikor azonban ezen ionok nincsenek jelen, a kritikus koncentráció 3mg/ ml-re módosult. Tehát, a jelenlévő ionok minősége és mennyisége módosíthatja a polimerizált monomerek mennyiségét [, ]. Fiziológiás ionerősség mellett a monomerek spontán képesek polimerizációra. Ezzel szemben a nem izom-eredetű állati sejtben a monomer formában lévő aktin mennyisége a teljes aktin koncentráció 50%-át is meghaladhatja, ezért a sejtben jelen lévő aktinkötő fehérjék (pl.: profilin, timozin, kofilin, DNáz-I) a polimerizáció szabályozásában nagy szerepet játszhatnak azzal, hogy meggátolják, vagy éppen elősegítik a monomerek és filamentumok kapcsolódását [-]. 13
14 A vastag filamentum A miozin molekula A miozin molekulát több mint 100 évvel ezelőtt Wilhelm Kühne fedezte fel, 1864-ben []. Mára már a szekvencia analízisnek köszönhetően gyűjtőfogalommá vált az elnevezés. A miozin szupercsalád tagjai molekula motorok, vagyis olyan molekulák, amelyek képesek az aktin filamentumhoz kapcsolódni és azon elmozdulni. Homológ szekvenciáik alapján 16 családra különíthetők el, s az emberi szervezetben is több mint 40 féle miozin molekula ismeretes. Az egyik legjobban tanulmányozott, és legjobban ismert család a miozin II, amely családba a vázizomzat vastag filamentumát alkotó, általánosan miozinnak nevezett motorfehérje is tartozik. A vázizom miozin nagyméretű fehérjemolekula, megközelítőleg 520 kda tömegű, amely hat polipeptidláncból épül fel. Ezek közül kettő nehézlánc (220 kda), két pár pedig könnyű lánc (20 kda körüli); az utóbbiak további alcsoportokba oszthatók. A könnyű láncok jelentős szerkezeti hasonlóságot mutatnak olyan Ca 2+ -kötő fehérjékkel, mint a troponin, pravalbumin, kalmodulin []. A vázizomban található miozin polipeptidláncok, hasonlóan az aktinhoz, jelentős heterogenitást mutatnak (miozin izoformák). A miozin molekula szerkezete erőteljesen aszimmetrikus, alakját a két nehéz lánc határozza meg. Ezek C-terminális szakasza alfa-hélix szerkezetű, amelyek egymásba csavarodnak, és a mintegy 150 nm hosszú rúd régiót képezik. A rúdnak egy kb. 85 nm-es szakasza aggregálódik a többi miozinmolekula hasonló részével, és együtt alkotják a vastag filamentum gerincét. A rúd másik szakasza mozgékonyabb, ennek folytatása az ugyancsak a nehéz láncok N-terminálisával képzett két globuláris fej. A könnyű láncok (kettesével) a fejekhez kapcsolódnak. A miozinfejek a vastag filamentumból kinyúlnak a vékony filamentumok felé, létrehozva a mikroszkóposan is jól látható kereszthidakat, amelyek az aktin-miozin kölcsönhatásban tulajdonképpen részt vesznek. A vastag filamentum szerveződése olyan, hogy az alkotó miozin molekulák irányultsága a filamentum közepétől mindkét irányban szimmetrikus. Úgy kapcsolódnak egymáshoz, hogy a fejek a filamentum két vége felé egymással antiparallel helyezkednek el, míg a rúd részek egy fejmentes köztes régiót alakítanak ki. 14
15 A vastag filamentumok hossza gerincesek vázizomzatában meglehetősen egységes képet mutat, 294 vagy 300 miozin molekula alkotja [, ]. Alkalmas körülmények között, limitált proteolízissel a miozin két globuláris fejet tartalmazó, kis ionerősségnél is oldódó- nehéz meromiozinra (HMM) és- a molekula gerincét alkotó, kis ionerősségnél nem oldódó- könnyű meromiozinra (LMM) hasítható. A HMM további emésztésével megkapjuk a két miozin fejet, más néven szubfragmentum-1-et (S1), és a két fejet emésztése előtt összekapcsoló rövid rúd darabot, a szubfragmentum-2-t (S2) (4. ábra). 5. ábra. A miozin molekula limitált proteolízisével nyert termékek. További limitált proteolízissel az S1 három fragmentumra osztható, molekulatömegük alapján: 25 kda (N-terminális), 50 kda (középső) és 20 kda (Cterminális) fragmentum. A három fragmentum nem alkot külön működési egységeket, hanem közösen alakítják ki a miozin egyes funkcionális doménjeit (5. ábra). Krisztallográfiás módszerekkel megállapították az S1 működési egységeit. Az S1 két nagy doménre osztható, motor- és könnyűlánckötő doménre. A motor doménen aktin- és nukleotidkötő régió található, míg a könnyűlánckötő doménhez kapcsolódik az esszenciális (ELC) és regulációs (RLC) könnyűlánc. Az esszenciális könnyűlánc, nevét onnan kapta, hogy alkalikus körülmények között leválasztható volt a miozinról és így a miozin elvesztette ATP hidrolizáló képességét, tehát a könnyűlánc megléte a miozin ATP hidrolizáló működése szempontjából esszenciálisnak mondható. Idővel ez az állítás megdőlni látszott, de az 15
16 elnevezés mégis megmaradt [, ]. Ezt a láncot alkalikus könnyűláncnak is nevezik, utalva a miozintól való elválasztás körülményeire. Molekulatömegük alapján is megnevezték a könnyűláncokat, ekkor az LC1 és LC3 volt a két ELC izoforma és az LC2 a regulációs könnyűlánc. A regulációs könnyűlánc (RLC) nevét a simaizomban betöltött szabályozó szerepéről kapta, és mivel DTNB kezeléssel eltávolítható, DTNB könnyűláncnak is nevezték []. Röntgenkrisztallográfiás struktúrája alapján a motor domént 7 β-redő és hozzákapcsolt α hélixek építik fel, amelyek együttesen egy hasítékot hoznak létre az aktinkötő- és a nukleotidkötő hely között úgy, hogy az kettészeli az 50 kda-os fragmentumot. Így lesz egy ún. alsó 50 kda-os és egy ún. felső 50 kda-os fragmentum. Az alsó régiót aktinkötő régiónak is nevezik []. Az ATP kötőhely a hasadék csúcsához közel helyezkedik el, tartalmazza a P-hurok mintázatot, a switch 1 (SW1) és switch 2 (SW2) szegmentumokkal szegélyezve. Az ATP kötőhely fontos része a γ-foszfát kötőzseb, aminek jelentős szerepe van az ATP hidrolízis folyamatában []. 50 kda fölső fragmentum nukleotid kötőhely C terminális aktin kötőhely N terminális 50 kda alsó fragmentum regulációs könnyűlánc konverter régió esszenciális könnyűlánc 6. ábra. Csirke harántcsíkolt izom miozin S1 szerkezetének szalag modellje. A 20 kda-os fragmentum sötétzöld, az 50 kda-os fragmentum piros és a 25 kda-os fragmentum kék. (Rayment 1993.) Meg kell említenünk a miozin molekula spektroszkópiai szempontból is fontos régióját, a 25 kda-os fragmentumhoz tartozó megtört hélix (SH-hélix) struktúrát, 16
17 amelyen a miozin két igen reaktív ciszteinje található: az egymástól tíz aminosav távolságra levő cisztein-707 (SH1) és cisztein-697 (SH2). A két aminosav jelentősége helyzetében és reaktivitásában van, mert megfelelő körülmények között szelektíven jelölhetők és közel helyezkednek el az ún. konverter régióhoz. A konverter régió az SHhélix és a könnyűlánckötő domén között helyezkedik el, nevét az erőátvitelben betöltött kulcsfontosságú szerepéről kapta [, ]. A könnyűlánckötő, más néven regulációs domén a kontrakció során valószínűleg az erőkar szerepét tölti be. Az izomkontrakció legújabb modelljét is ez alapján nevezték el swinging lever arm, azaz magyarosan kilendülő emelőkar modellnek []. 17
18 2.2. Az izomrost működése Az izomrost működése során az aktin és a miozin szálai valamiképpen egymásba csúsznak. Az aktin szálai a tropomiozin és a troponin nevű fehérjéket is tartalmazzák az aktin mellett. Ez utóbbiak megakadályozzák, hogy a miozinmolekulák az aktinnal kötődni tudjanak: 7.1. ábra. A tropomiozin és troponin fehérjék elhelyezkedése az izomrostban. Megfigyelhetjük, hogy a miozinmolekulák feji vége képes ATP molekulák megkötésére, de a teljes ATP-hidrolízis létrejöttéhez kapcsolatba kell lépnie az aktinnal (az aktin tehát lényegében a miozin ATP-bontó hatását fokozó katalizátor). Az aktinmiozin kapcsolat azonban mindaddig nem jöhet létre, amíg a tropomiozin ki nem billen a helyéről. Ez akkor történik meg, amikor (idegingerület hatására) az izomrostok endoplazmatikus hálózatából az addig ott tárolódott Ca 2+ ionok felszabadulnak és a troponin kötőhelyére beépülve a fehérje szerkezetváltozását eredményezik (a tropomiozin lecsúszik az aktinszálban megfigyelhető hasadékba ). 18
19 7.2. ábra. Az aktomiozin komplex kialakulása. Az aktinnal való kötődés hatására (Mg 2+ ionok jelenlétében) a miozin elhasítja az ATP-t, s emiatt a saját térszerkezete is megváltozik. A miozin fej hajlásszöge a foszforsav leválásakor 90 -ról 50 -ra, majd az ADP ledisszociálásakor 50 -ról 45 -ra változik ("bólintás") és emiatt a miozin magával húzza az aktint Az aktomiozin komplex létrejöttének szerkezetbeli következményei. A 7.3. ábrán látható aktin-miozin kapcsolat csak egy újabb ATP molekula bekötődésével szűnik meg, ekkor ismét a 7.1-es ábrának megfelelő szituáció áll be, azzal a különbséggel, hogy a tropomiozin mindaddig a hasadékban marad, amíg az ingerhatás tart. A leírt folyamat többször, ciklikusan ismétlődik (egy másodperc alatt akár több százszor is), s ez a sok kis elmozdulás végülis az izom összehúzódását eredményezi. 19
20 Ha nincs több ATP, a miozin az utolsó ábrán látható módon, stabilan a miozinhoz kötve marad és az izom merevvé válik. Ilyenkor az aktin és a miozin között szoros kapcsolat alakul ki. Tulajdonképpen ez a rigor mortis (hullamerevség) létrejöttének is az oka, ezért ezt rigor állapotnak nevezzük. A hidrolízis egymást követő lépéseit leíró modellekben az egyes lépések a miozin egy-egy elkülöníthető konformációjának felelnek meg. Biokémiai módszerekkel több, mint hét állapot különíthető el. Az általunk használt EPR spektroszkópia és DSC technikákkal csak a hosszú ideig stabil, vagy stabilizálható lépések vizsgálatára van lehetőség, ezért az állapotok leírásához Trentham és Bagshaw [] modelljét alkalmaztuk. A modell a következő négy miozin állapotot különíti el: M+ATP M*.ATP M**.ADP.Pi M*.ADP+Pi M+ADP+Pi A modellben az M a miozint, a M*.ATP, M**.ADP.Pi és az M*.ADP pedig a hidrolízis ciklus köztes állapotait jelentik. A kontrakciós ciklus első lépéseként a miozin megköti az ATP-t és disszociál az aktintól. A szabad miozinfejek hidrolizálják az ATP-t, majd visszakötődnek az aktinhoz, először egy nem specifikus, gyenge (ún. weak binding) kötéssel, majd egy sztereospecifikus, erős (ún. strong binding) kötéssel, mindeközben elengedik a hidrolízis termékeit. A mechanizmus megértéséhez szükséges, hogy ismerjük az egyes állapotokhoz tartozó molekulaszerkezeteket. Az izomkutatás mai legfontosabb törekvése a különböző kutatási területek eredményeinek egységes modellbe való összefoglalása. A legújabb ilyen jellegű törekvés Geeves és munkatársai [] nevéhez fűződik. Modelljük párhuzamba állítható a klasszikus Lymn-Taylor ciklus állapotaival. A ciklus során két fő kötési állapotot különböztetnek meg a miozin fej és aktin kapcsolatában úgy, mint bekötött, azaz attached {rigorszerű (8.1. ábra) és gyenge/erős(8.4. ábra)} és lecsatolt azaz detached { poszt rigor (8.2. ábra) és gyenge (8.3. ábra)} állapotokat. 20
21 Bekötött állapot Lecsatolt állapot gyenge/erős gyenge rigorszerű gyenge 8.ábra. A miozin ATPáz ciklusa Geeves és munkatársai modellje alapján. A miozin háromdimenziós szerkezetének tanulmányozása során derült ki [], hogy a molekula működési szempontjából legfontosabb része, a katalitikus és regulációs domén, nem viselkedik merev alegységként, így az izomkontrakció fázisaiban jelentős belső konformációs változások várhatók. Különböző röntgenkrisztallográfiás és krio-elektronmikroszkópos eredmények szerint a kontrakciós ciklus konformációváltozásait az ATP megkötése indítja. Az ATP kötésekor a miozinfej γ-foszfát kötőzsebe rázáródik a terminális foszfátra (ún. closed állapot), ez az 50 kda-os fragmentum alsó és fölső részének részleges záródását eredményezi. Az alsó és fölső szegmens elfordul néhány fokkal az 50 és 25 kda-os szegmens határán lévő hélix körül, és ezzel záródik a nukleotid kötőhely. Ezzel egyidőben az 50 kda-os fragmentum alsó régiójában található hosszú α-hélix az un. switch-2 hélix, és a kifele eső végéhez kapcsolódó hurok (switch-2 hurok) 24 o -kal fordul el, a konverter domén elfordulása pedig 70 o -os [-]. Ez a felerősödött változás tevődik át a miozin regulációs doménjére és hozza létre az elmozdulást az aktin mentén. Ha aktin filamentumot izolált kereszthíd struktúrával inkubálunk, a rigor állapotot tudjuk modellezni, mely dekorált aktinként ismert komplex. Ez a dekorált aktin biztosítja, hogy az aktin és miozin közötti erős kötés kölcsönhatás állapotot 21
22 tanulmányozni tudjuk. A krio-elektronmikroszkópos eredmények nemrégiben úgy tűnik, megoldást szolgáltattak nyúl vázizom aktin feltérképezésére, amelyet csirke vázizomból származó S1 fragmentummal dekoráltak. Ezek a kísérletek azt az eredményt hozták, hogy az aktinkötő hasadék zárt állapotban található az aktin erős kötés állapotában [-]. Ebben az állapotban a felső 50 kda-os domén úgy mozdul el, hogy az aktin kötő hasadék zárt állapotban van, a nukleotidkötő zseb nyitott állapotba kerül. A zárás úgy tűnik, hogy együtt jár a felső 50 kda-os domén merevtestszerű mozgásával. A hasadék zárása együtt jár a switch1 mozgásával, távol a foszfát csoporttól, amely nyitja a nukleotidkötő zsebet. Ezzel szemben az ATP kötődése visszaállítja a switch1 eredeti állapotát, ezáltal az aktinkötő hasadék is újra nyitott állapotba kerül. Tehát az aktomiozin erős kötődés állapotát a felső 50 kda-os régió mozgása alapján lehet értelmezni. Valószínűsíthető, hogy az open closed átmenet indítja el az ATP hidrolízisét. Kísérletek azonban azt mutatják, hogy az átmenettel járó konformációváltozás és az ATP hidrolízis folyamata elkülönül egymástól []. 22
23 3. Célkitűzések A kilencvenes évek biofizikai és biokémiai vizsgálatai során megállapították, a kontraktilis vázizomrendszert alkotó két alapvető protein az aktin és a miozin molekuláris szerkezetét, továbbá azt, hogy az ATP hidrolíziséből származó kémiai energia konformáció változások sorozatával a katalitikus domén belső energiájává alakul, amely a regulációs domén és a katalitikus domén kölcsönhatásával a kétféle filamentumrendszer egymáson történő elmozdulását eredményezi. A vizsgálatok tisztázták a miozin szerkezeti doménjeinek térbeli elhelyezkedését, és valószínűsítették a motorikus rész működését. A belső szerkezet dinamikájában bekövetkező változásokról egyelőre kevés adat áll rendelkezésre, márpedig éppen ezen adatok adnának felvilágosítást az energiaátalakulás molekuláris hátteréről, az erőkifejtést kísérő konformációs, valamint a környezeti tényezők szerepéről. A molekuláris dinamikai kutatások folytatásához célul tűztük ki az izomkontrakció során létrejövő molekuláris szintű szerkezeti változások vizsgálatát és az izomrostokat felépítő komponensek dinamikai tulajdonságainak megismerését. Ehhez a számos kisérleti közelitési módszer közül az EPR módszert használtuk. Laboratóriumunkban folytatott előzetes kísérleteink alapján glicerinezett izomrostban lévő szelektív jelöléssel tanulmányoztuk a miozinfej belső dinamikáját. Az ATP hidrolízis közben létrejövő globális konformációs változások megfigyeléséhez a differenciál pásztázó kalorimétert (DSC) alkalmaztuk. 1. Az izomkontrakció során a miozin fejen jelentős mértékű szerkezeti változások játszódnak le. A dinamikai vizsgálat egyik lehetséges módja, hogy mozgásra érzékeny paramágneses szondákkal jelöljük a miozin molekula kitüntetett helyeit, amelyek olyan szerkezeti egységek közelében vannak, amelyek valószínűsíthetően jelentős változáson mennek keresztül az izomkontrakciós ciklus során. Munkánk során ilyen spektroszkópiai szondákkal (MSL és TCSL) jelöltük a miozin motor doménjének cisztein707-es aminosav oldalláncát. Izomrosttal végzett vizsgálatainkban célunk volt a kontrakció alatti ATP hidrolízis egyes lépései során a miozinfej belső szerkezetében bekövetkező konformációs változások detektálása az 23
24 erősen kötött ún. strong binding állapotban (rigor és ADP állapot) és a gyenge kötődésű ún. weak binding állapotokban (ATP, ADP.P i ) nukleotidok és analógjaik segítségével. 2. Az EPR mérésekkel párhuzamos DSC mérések görbéinek jelanalízise és a többkomponensű jelek dekompozíciója felvilágosítást ad a proteinszerkezet globális konformációs változásairól. Izomrostokon végzett DSC kísérletekre az irodalomban nem találtunk adatokat. Célunk volt, hogy a különböző köztes állapotokban mért termikus változásokat megkíséreljük olyan részfolyamatokra felbontani, melyek kapcsolatba hozhatók valamely domén mozgásával, végeredményben pedig, jól visszaadják a vizsgált jelenséget. Vizsgálataink arra irányultak, hogy nyomon kövessük a dinamikai változások globális hatásait, amelyek révén a kontrakciót elindító jel a regulációs doménről a katalitikus doménre terjed. 24
25 4. Anyagok és módszerek 4.1. Izomrostok preparálása A glicerinnel kezelt izomrost kötegeket nyúl musculus psoas-ból preparáltuk. Az izomrostok glicerinezése a rostkötegekben található membránstruktúrák csaknem teljes elroncsolódását eredményezi, s a kezelés végén csak az alapvető miofibrilláris fehérjék szupramolekuláris komplexe marad meg. Az izomrost ugyanakkor megtartja rendezett makroszkópos struktúráját []. A kb. 3mm széles és 4-5 cm hosszú rostokat hidegszobában (4 C-on) preparáltuk, majd üvegbotra kötve 0 C-on 30 percig áztattuk 0,1 mm PMSF tartalmú rigor oldatban (80 mm KCl, 5 mm MgCl 2, 2 mm EGTA, 25 mm Trisz.HCl, ph 7,0). Ezután 30 percig 50 V/V % glicerint tartalmazó rigor oldatba helyeztük át. Az oldatcserét háromszor ismételtük, végül a rostokat felhasználásukig (1-2 hónap) 50 V/V %-os glicerines rigor pufferben, - 20 C-on tároltuk Izomrostok jelölése EPR méréshez A glicerinben tárolt rostkötegeket jelölés előtt 60 percen át rigor pufferben mostuk. A rostkötegek spinjelölését ún. jelölő közegben végeztük (80 mm K-propionát, 25 mm Trisz.HCl, 5 mm MgCl 2, 2 mm EGTA, 2 mm pirofoszfát, ph 6,5). A jelölés specificitásának érdekében blokkoltuk a rostokat alacsony ionerősségű pufferben DTNB-vel [-], (1mM DTNB, 1mM EGTA, 5 mm MgCl 2, 20 mm MOPS, 1 óra, 0 C, ph 7,5). A felesleges blokkolót 4 x 10 perces rigoros mosással távolítottuk el (80mM K-propionát, 25 mm Trisz.HCl, 5 mm MgCl 2, 2 mm EGTA, ph 7,0). A jelölés 20 percen keresztül történt 0 -on. Jelöléskor a rost becsült miozintartalmára számított kétszeres moláris feleslegben MSL vagy TCSL paramágneses szondát használtunk (9. ábra) []. A felesleges jelölőt 4 x 10 perces rigoros mosással távolítottuk el a rostokról. A paramágneses szondák ilyen feltételek mellett a miozin fej cisztein-707-es (SH1) reaktív aminosav oldalláncához kapcsolódtak. 25
26 N-(1-oxil-2,2,6,6-tetrametil-4-piperidinil) maleimid spin jelölő (MSL) 4-izotiocianát-2,2,6,6- tetrametilpiperidinoxil spin jelölő 9. ábra. MSL és TCSL jelölők szerkezeti képlete Nukleotidcsere izomrostokon Az izomkontrakciós ciklus intermedier állapotainak vizsgálatához nukleotidokat és analógjaikat használtuk. A spinjelölés után a rostokat 15 percig rigor pufferben tartottuk. Ezt követően az ADP állapot kialakításához 5 mm MgADP-t tartalmazó, az ADP.Pi állapot mimikálásához 5 mm MgATP-t és 4 mm Na 3 VO 4 -ot tartalmazó míg az ATP állapot mimikálásához 5 mm AMP.PNP-t tartalmazó rigor oldatban újabb 15 percen keresztül inkubáltuk a rostokat, a méréseket megelőzően ATPáz aktivitás mérés A rostok ATPáz aktivitását az ATP hidrolízisekor keletkező anorganikus foszfát mennyiségének meghatározásával számítottuk. A mérésekhez Trentham és munkatársai által kidolgozott piruvát-kináz laktát-dehidrogenáz kapcsolt optikai módszert alkalmaztuk []. A reakciót NADH-t, foszfoenol-piruvátot, piruvát-kinázt és laktátdehidrogenázt tartalmazó közegben végeztük (100 mm KCl, 20 mm MOPS, 1 mm MgCl 2, 0,5 mm EGTA, 0,15 mm NADH, 1 mm foszfoenol-piruvát, 20 U/ml piruvátkináz, 40 U/ml laktát-dehidrogenáz, 0,5 mm ATP, ph 7,0, Mg +2 -ATPáz 26
27 meghatározáshoz; és a Ca 2+ - Mg +2 meghatározáshoz 1 mm CaCl 2 -ot is tartalmazott). A mérés során a NADH fogyását követtük nyomon 340 nm-en tíz percen keresztül fotométerrel. A méréshez használt megközelítőleg 8-10 mg nedves tömegű rostkötegek platina vázra voltak feltekerve úgy, hogy ne kerüljenek a fényútba, és enyhén megfeszüljenek. A mérés folytonos keverés mellett történt. A NADH fogyásának mértékében az abszorpciót az idő függvényében ábrázolva egy egyenest kaptunk, melynek meredekségéből határoztuk meg az ATP hidrolízis mértékét. A számolás során feltételeztük, hogy a rostok száraz tömegének 50 % -a miozin. A NADH abszorpciós koefficiensét 340 nm-en 6, M -1 cm-1 -nek tekintettük. A Mg 2+ -ATPáz aktivitás (Pi µmol/mg miozin.min) ± 0,718 Pi µmol/ mg miozin.min (n=4) volt. Az aktív rostkötegek ATPáz aktivitása 5,565 ± 0,816 Pi µmol/ mg miozin.min (n=4) volt 4.5. Izomrost minták előkészítése DSC méréshez A glicerinben tárolt rostokat 60 percig mostuk azzal a céllal, hogy eltávolítsuk belőlük a glicerint. Ez az állapot modellezi az izom rigor állapotát. Kísérleteinkben az ATP hidrolízis jellemző állapotait próbáltuk mimikálni, nukleotidokkal és analógjaikkal történő 15 perces kezelés segítségével, majd ezeket a mintákat DSC műszerrel vizsgáltuk meg. A miozin aktinhoz való erős kötés és gyenge kötés állapota esetén a szervetlen foszfátot (Pi) foszfát analóg ortovanadáttal, AlF 4 -gyel és BeF x -el helyettesítettük. Ha ATP-t és ortovanadátot együttesen adunk a rigor állapotban levő rosthoz, akkor annak állapota az ADP.P i állapotnak feleltethető meg, tartósan disszociáltathatjuk a miozin fejeket az aktin filamentumoktól. Abban az esetben, ha a rostokhoz AMP.PNP-t (nem hidrolizáló ATP) adtunk, az ATP állapotot modelleztük. AM.ADP.Pi állapotot ATP és BeF x vagy AlF 4 hozzáadásával modelleztük. A BeF x -ot és az AlF 4 -ot 10 mm NaF-ből és 3 mm AlCl 3 -ból és BeSO 4 -ből preparáltuk közvetlenül a kísérlet előtt. 27
28 4.6. Mérési eljárások Az elektronparamágneses rezonancia spektroszkópia (EPR) Az atommag és az elektronburok mágneses sajátosságainak tanulmányozása a biológiai anyagszerkezet kutatás és az orvosi diagnosztikai képalkotás szempontjából nagy jelentőségű fizikai vizsgálómódszerek kialakulásához vezetett. Az elektronburok mágneses vizsgálatát lehetővé tevő jelenséget elektronparamágneses rezonanciának vagy elektron spin rezonanciának nevezzük. Mint az elnevezése is mutatja, csak párosítatlan elektronnal vagy kompenzálatlan spinű elektronnal rendelkező rendszerek, szabad gyököt tartalmazó vizsgálati anyagok tanulmányozására alkalmas. Ezen anyagok konformációs és dinamikai tulajdonságai jól jellemezhetők a mágneses térben való viselkedésük alapján. A biológiai rendszerek legnagyobb része nem rendelkezik ilyen paramágneses centrumokkal, ezért közvetlen EPR mérésre nem alkalmasak. Ezért a szerves, vagy biomolekulák vizsgálatára a spinjelölés vagy spincsapdázás technikáját használjuk Az EPR készülék működése A kereskedelmi forgalomban kapható készülékekben monokromatikus elektromágneses sugárzást alkalmaznak, és a mágneses indukciót változtatják. A sugárforrás állandó frekvenciájú, melynek teljesítménye 10 mw és 320 mw között szabályozható, neve klisztron, újabban félvezető, gunn-dióda. A tudományos gyakorlatban kétféle frekvenciájú klisztron terjedt el, az egyik 9.5 GHz-es, a másik 34 GHz-es. Az általunk használt EPR készülék frekvenciája 9.5 GHz. A 10. ábrán látható egy EPR készülék felépítése. A sugárforrást, a mintát és a detektort fémből készült, belül üreges hullámvezető (csőtápvonal) köti össze, amelyben szabadon terjed a mikrohullámú sugárzás. A mérés során a mágneses indukciót változtatjuk, és annak függvényében kapjuk meg a spektrumot. 28
29 10. ábra. EPR-készülék felépítése. A paramágneses minta a rezonátor közepén helyezkedik el, ami a hullámvezetőnek egy mindkét végén kis nyílással (írisz blende) ellátott része, így alkalmas a mikrohullámú sugárzás átengedésére. A rezonátor falain többszörösen reflektálódott sugárzás felerősödik, és ez a koncentrálódott energiájú tér halad keresztül a rezonátorba elhelyezett mintán. A detektálás speciális szilícium diódával történik, ami a mikrohullámú sugárzást leválasztja az energiaelnyelésből adódó, lassan változó egyenáramú jelről. A paramágneses minta által elnyelt energiát elektronikus mérőrendszer dolgozza fel. A jel-zaj viszony javítása érdekében a mágneses tér egyenletes változtatása mellett még kismértékű szinuszos modulációt is alkalmazunk (11. ábra). Erre szolgálnak a modulációs tekercsek. A moduláció amplitúdója néhány µt, frekvenciája néhány száz Hz. A detektor jelét a rendszer, kapcsoló erősítővel (fázisérzékeny detektor) dolgozza fel. (A kapcsoló erősítő lényegében keskenysávú szűrő, csak a kiválasztott frekvenciájú jeleket erősíti.). A kapcsoló erősítő kimenetén derivált spektrum jelenik meg. 29
30 11. ábra. A mágneses indukció időbeli változása spektrumfelvételkor. A 12. ábrán felül az eredeti abszorpciós spektrum látható, három kiválasztott pontjában feltüntetve, hogy a mágneses tér adott amplitúdójú ingadozásához a jel milyen mértékű ingadozása tartozik. Az inflexiós pont közelében az ingadozás nagy, a maximum közelében kicsi, a görbe leszálló ágában a jel változása ellentétes előjelű B változásával. Az alsó ábrán a kapcsoló erősítő kimenő jelét látjuk, ami tipikus derivált spektrum. 12. ábra. Fázisérzékeny detektálás az EPR-ben. Fent: az abszorpciós sáv alakja és a kapcsoló erősítő által mért jel három pontban, lent: a kapcsoló erősítő kimenőjele (derivált spektrum). 30
31 Alkalmazott EPR mérési technika Az EPR spektroszkópia az elektromágneses kölcsönhatásokat vizsgáló spektroszkópiai módszerek egyike. Alkalmazása során a vizsgált rendszernek rendelkeznie kell párosítatlan spinű elektronnal. EPR módszerrel a biológiai rendszerek kevés kivételtől eltekintve közvetlenül nem vizsgálhatók, mivel általában nem rendelkeznek paramágneses centrumokkal. A kivételek közé egyes fémionokat tartalmazó fehérjék tartoznak pl.: hemoglobin, mioglobin, ceruloplazmin, szuperoxid dizmutáz, stb. A paramágneses centrummal nem rendelkező fehérjerendszerek vizsgálatához a spinjelölés vagy a spincsapdázás módszerét kell alkalmazni. Munkánkban spinjelölést alkalmaztunk, melynek során egy stabil paramágneses jelölőt kötöttünk kovalensen egy célzott aminosav oldallánchoz. Ezek a stabil paramágneses jelölők általában nitroxid szabadgyököt tartalmazó piperidin, pirrol, pirrolidin vagy oxazolin molekulák. A jelölő molekulán megkülönböztetjük a spektroszkópiailag aktív részt, amely a nitroxid csoport és a párosítatlan elektront tartalmazza, valamint a kémiailag aktív rész, amellyel a molekula a célzott aminosav oldallánchoz kapcsolódik. A jelölőn található párosítatlan elektron 2pπ molekulapályájának mágneses térhez viszonyított orientációja meghatározza a mágneses térrel való kapcsolatát. Ez tükröződik a detektált spektrum alakjában és a csúcsok helyében. Ha teljesül az, hogy a jelölő mereven kapcsolódik a fehérjéhez, akkor a kapott spektrumból azon molekulaszegmens mozgására, rendezettségére és mintán belüli irányítottságára lehet következtetni, amelyhez a jelölő kismolekula kötődött. A rendszer működésekor bekövetkező konformációváltozás megmutatkozik a szonda molekula viselkedésében. Ezzel a módszerrel sikerrel vizsgálhatjuk izomfehérjék, enzimek, membránba ágyazott integrális fehérjék, membránok szerkezetét, működését Az EPR spektrumok kiértékelése A jelölő molekula mágneses térben történő viselkedése alapján következtethetünk a biológiai anyagban uralkodó rendezettségre, a rendszer szerkezeti és dinamikai tulajdonságaira. Ez tükröződik a detektált spektrum alakjában és a csúcsok helyében [, ]. 31
32 Egész általánosan, az EPR technikában csaknem kizárólag alkalmazott nitrogénoxid szabad gyökök spektrumának leírására a spin Hamilton operátor egyenletét a következő formában szokták megadni: H =β H gs ~ + I ~ AS ahol az első tag írja le az elektron kölcsönhatását a külső mágneses térrel, a második tag a páratlan elektron és a nitrogén atommag mágneses csatolását. Az egyenletben S jelenti az elektronspin operátorát, I a magspin operátora, β az elektron Bohr magneton, ~ g és A ~ pedig a csatolásokat leíró tenzorok. A spin jelölés sikerét és fontosságát a makromolekulák és biológiai membránok tanulmányozásában az adja, hogy az A ~ és ~ g tenzorok anizotróp tulajdonsággal rendelkeznek (azaz függnek a párnélküli elektron 2pπ molekulapályájának és a külső H mágneses tér iránya által bezárt szögtől), az EPR spektrum kritikusan függ a spin label orientációjától a külső mágneses térhez viszonyítva. Sebességük alapján a mozgások három csoportba sorolhatók: - ha a spin label forgása igen gyors, a spektrumot három keskeny vonalszélességű spektrumvonal alkotja, a rotációs korrelációs idő (τ r ) sec közöttinek adódik, a gyök forgása izotróp. Ebben az esetben a spektrumból a rotációs korrelációs idő, a következő összefüggéssel számolható ki: I I τ 2 = H +1 ( 1 1 ) 1, ahol τ 2 a rotációs korrelációs idő, H +1 az alacsonyterű csúcs szélessége, I +1 az alacsonyterű és I -1 a magas terű csúcs intenzitása (13. ábra). - lassú mozgás (τ 2 > 5 nsec) esetén a spektrumvonalak kiszélesednek, a Goldmann közelítés alkalmazható a rotációs korrelációs idő kiszámítására []: ' ( zz zz ) τ 2 = a 1 2A 2A b 32
33 ahol a=5.4 * sec, b = , Brown diffúziót feltételezve. 2A zz a minta hiperfinom csatolási állandója, 2A zz pedig az EPR spektrumból kimérhető hiperfinom csatolási állandókat jelenti. 2A zz felel meg az u.n. rigid limit -nek, amelynél a rendszer makroviszkozitása a végtelenhez közelít. A rigid limitet extrapolációs módszerrel határozzák meg. A fehérje oldathoz változó mennyiségű cukrot (5-50 w/w %) adagolnak a viszkozitás (η) növelése céljából. Elméleti megfontolásból következik, hogy az immobilizálódott gyökök spektruma két szélső csúcsának távolsága (amelyet hiperfinom csatolási állandónak nevezünk és közelítőleg az A ~ tenzor A zz komponensével egyenlő) arányos a rotációs korrelációs idő 2/3 -dik hatványával. Ábrázolva az effektív hiperfinom csatolási állandót a (T/η) 2/3 függvényében, a végtelen viszkozitásra extrapolált csatolási állandó megadja 2A zz értékét. I +1 I 0 I-1 τ eff = 2.0 ns H +1 τ eff = 16.0 ns 2A' zz H 13. ábra. A felső ábrán a gyors, az alsón a lassú forgás tartományára jellemző konvencionális EPR spektrumok láthatók. A betű a rotációs korrelációs idő kiszámításához szükséges paramétereket jelölik. - az igen lassú forgás tartománya esetén (ST EPR) a rotációs korrelációs idő értéke sec közötti. Ebben az esetben a spektrumok detektálása és kiértékelése eltér a fent leírtaktól. Az ilyen minták mérése során a mikrohullámú teljesítményt úgy kell megválasztani, hogy létrejöjjön a spinrendszer részleges telítődése (félszaturációs érték). Ilyen körülmények között a második harmonikus 90 -os fázissal eltolt abszorpciós spektrumát detektáljuk. A rotációs korrelációs idő meghatározásához a 33
34 spektrumban megjelenő diagnosztikus csúcsok arányait (L /L, C /C és H /H) kell összehasonlítani a spinjelölt hemoglobin rendszer ST EPR spektrumainak segítségével készített kalibrációs diagrammok értékeivel (14. ábra). A kalibrációs diagrammok a hemoglobin rendszerre számított rotációs korrelációs időket tartalmazzák, feltételezve a hemoglobin gömbszimmetriáját [-]. C C' 10 mt L L'' H'' H H 14. ábra: Az igen lassú forgás tartományára jellemző szaturáció transzfer (ST) EPR spektrumok. L és L, C és C, H és H a rotációs korrelációs idő meghatározásához szükséges diagnosztikus csúcsokat jelölik. Spin szondával jelölt fehérjéinket Bruker ESP 300E típusú elektron paramágneses rezonancia spektrométerrel vizsgáltuk. Konvencionális EPR mérésekhez 100 khz modulációt, 0,1-0,2 mt modulációs amplitúdót és 20 mw mikrohullámú teljesítményt használtunk. 34
35 Differenciál pásztázó kalorimetria (DSC) A differenciál pásztázó kalorimetria (DSC) egy igen érzékeny és széles körben alkalmazott módszer fehérjék termikus denaturációjának vizsgálatára. A kiegészítő mikrokalorimetriás mérések a molekuláris folyamatok energetikai hátterének tisztázását segítik elő. Az EPR spektroszkópiai mérések során nyert eredményekből a riportermolekula környezetében végbemenő változásokra következtethetünk, de a globális változásokról nem ad információt (Hild G, Nyitrai M, Belagyi J, Somogyi B (1998) The Influence of Divalent Cations on the Dynamic Properties of Actin Filaments: A Spectroscopic Study. Biophys J. 75: ). Az ezzel párhuzamos DSC mérések viszont alkalmasak a globális változások jellemzésére. Az ezzel párhuzamos DSC mérések viszont alkalmasak globális és szub-molekuláris változások jellemzésére egyaránt. Levitsky, D.I., Nikolaeva, O.P., Orlov, V.N., Pavlov, D.A., Ponomarev, M.A, Rostkova, E.V. (1998) Differential scanning calorimetric studies on myosin and actin. Biochemistry (Mosc) 63, Visegrady B, Lorinczy D, Hild G, Somogyi B, Nyitrai M (2005) A simple model for the cooperative stabilisation of actin filaments by phalloidin and jasplakinolide. FEBS Lett. 579(1):6-10. Visegrady B, Lorinczy D, Hild G, Somogyi B, Nyitrai M (2004) The effect of phalloidin and jasplakinolide on the flexibility and thermal stability of actin filaments. FEBS Lett. 565(1-3): Az ATP hidrolízis köztes állapotaiban levő izomrostokat a Biofizikai Intézetben található SETARAM Micro DSC-II kaloriméterrel vizsgáltuk. A műszer a hőáram mérés elvén működik. Egy hűthető-fűthető hőelnyelő blokkban található az azonos térfogatú mérő- és referencia cella, amely a műszer egyik legfontosabb része. A cellák felfűtése ugyanazon időben ugyanolyan módon történik. A mért paraméterek a hőelnyelő, a mintatartó hőmérséklete és a minta-referencia cella közti hőmérséklet különbség. Mivel a két cella hőkapacitása közel azonos, a programozott fűtés során a két edény hőmérséklete azonos módon változik, hőmérsékletkülönbséget mindaddig nem tapasztalhatunk, amíg valamilyen hőmérséklet indukált változás nem jön létre valamelyik cellában. A termikus egyensúly fenntartása 35
36 érdekében a mérő vagy a referencia cellába kell energiát táplálnunk. A hőmérsékleti különbség előjelétől függően, a fűtőáramot I-vel annyira megnöveli, hogy a két cella közti hőmérsékletkülönbség kiegyenlítődjön. A hőteljesítmény (1 Watt= 1 J/s) a következő egyenlettel írható le: Q/t=R I 2 Ebből az következik, hogy azonos körülmények között elegendő csak a fűtőáramot ( I) detektálni []. Biológiai minták esetén először egy úgynevezett műszeralapvonal felvétele szükséges. Ekkor mind a referencia, mind a mintacellában az adott kísérlet jellegének megfelelő puffer található. Az így kapott alapvonal a műszerre jellemző. A DSC mérés eredményeként egy hőelnyelési görbét kapunk a hőmérséklet függvényében. A görbén látható negatív csúcsok, ahol a mintatartóba áramlott be kevesebb hő, hőtermelő, exoterm folyamatra utalnak, a pozitív csúcsok egy hőelvonó, endoterm folyamatot jeleznek. A görbéről leolvashatjuk a csúcsok helyét az x tengely mentén, ami az átalakulás hőmérsékletét mutatja, a csúcsok magassága az átalakulás sebességével áll összefüggésben, míg a csúcsok alatti terület megegyezik az átalakulási hővel (15. ábra). 0,12 Hőáram, mw 0,10 0,08 F-aktin (kontrol) 0,06 0,04 T m = 62.9 o C 0,02 0,00 30,0 40,0 50,0 60,0 70,0 T m Hőmérséklet, o C 15. ábra. F-aktin DSC termogramja. A tranzíció maximumához tartozó hőmérsékletet (T m ) tekintjük a termikus stabilitás mértékének 36
37 A differenciális pásztázó kaloriméterrel mért adatokat rendszerint a termodinamikában érvényesnek tartott van t Hoff egyenlet segítségével értékelik ki: δ ln K δ T P H = vh 2 RT, ahol K a folyamat egyensúlyi állandója, T az abszolút hőmérséklet és H vh pedig a van t Hoff entalpia, amely általában különbözik a valódi kalorimetriás entalpiától. Ha a vizsgált folyamat valóban leírható egy kétállapotú termikus átmenettel (N D), akkor a van t Hoff entalpiának meg kell egyeznie a kalorimetriás entalpiával, azaz H H cal vh = 4RT mq 1 2 C T ~1 fajhő értékét, ahol m jelenti a tömeg, C Τ a termikus átmenet T m hőmérsékleténél a járulékos T 2 1 Q t = T C T (T)dT a denaturációra jellemző átmenet teljes hőmennyisége a T 1 -T 2 tartományban. A tranzíció maximumához tartozó hőmérsékletet (T m ) tekintjük a termikus stabilitás mértékének (15. ábra). 37
38 5. Eredmények és megvitatás 5.1. EPR mérések eredménye Konvencionális és szaturáció transzfer EPR technikát alkalmazva vizsgáltuk a miozin fejen az ATP hidrolízis során bekövetkező konformációs változásokat. Az EPR technika csak a hosszú ideig stabil vagy stabilizálható lépések vizsgálatára alkalmas, ezért alkalmaztuk a spinjelölés technikáját. Kísérleteinkben a kontrakciós ciklus négy állapotát modelleztük, a nukleotidmentes rigor állapotot, a hidrolízist megelőző M*.ATP állapotot, a hidrolízist követő M**.ADP.Pi állapotot, valamint a rigort megelőző M*.ADP állapotot, nukleotidok és azok analógjai illetve szervetlen Pi segítségével (16. ábra). Az EPR spektroszkópiai mérési eredményeknek a jelenleg általánosan elfogadott szerkezet ismeretében a következő lehetséges értelmezést adhatjuk. Rayment és munkacsoportja ismerte fel először, hogy a neckless csonkított nyálkagomba miozin (Dyctiostelium discoideum miozin, Dd miozin II) könnyebben kristályosítható és egyszerűbben vizsgálható, mint a teljes szubfragmentum-1 []. A különböző nukleotidok és nukleotid analógok (ADP, ADP.BeF x, ADP.AlF 4 és ADP.V i ) jelenlétében végzett röntgendiffrakciós vizsgálatokkal megállapították, hogy egyes analógoknál a switch-2 hurok a nukleotid kötésekor az ATP molekula γ-foszfát kötőhelye felé mozdul el. Ezt a konformációváltozást a felső és alsó 50kDa-os domén közötti nyílás részleges záródása kíséri. Ezzel egyidejűleg a nukleotid-kötő zseb is zártabbá válik. A két konformációs állapot az open és closed elnevezést kapta. Valószínűsíthető, hogy ez a konformációváltozás indítja el az ATP hidrolízisét, azonban eddigi kísérletek azt mutatják, hogy az open-closed konformációváltozás és a hidrolízis folyamata elkülönül egymástól []. Irodalmi adatok szerint ATP és ADP állapotokban a konformáció open, míg ADP.Pi, ADP.AlF 4 és ADP.V i állapotokban a konformáció closed. AMP.PNP és ADP.BeF x állapotoban a konformáció heterogén, azaz a két konformáció között hőmérséklettől és ionerősségtől függő dinamikus egyensúly alakul ki []. 38
39 16. ábra. ATP hidrolízis ciklus intermedier állapotai. Az aktin-miozin kölcsönhatásra vonatkozó korábbi munkákban kimutatták, hogy szemben az MSL-lel egy izotiocianát alapú paramágneses szonda (TCSL), amely a miozin Cys-707 oldalláncához kapcsolható, alkalmas az erőgenerálásban kulcsszerepet játszó ATP hidrolízis ciklus strong binding állapotainak (rigor, ADP, AMP.PNP) kimutatására [63]. Ez a mérési tapasztalat tette lehetővé, hogy EPR spektroszkópiai módszerrel az intermedier állapotokat tovább vizsgáljuk. Az intermedier állapotok részletes vizsgálatával megismerhetjük azokat a konformációs változásokat, amelyek segítségével értelmezhető a miozin aktin irányában mutatott affinitása és ennek változása, továbbá melyek azok a konformációk, amelyek a hidrolízisből származó energia tárolását lehetővé teszik, és biztosítják a belső szerkezet olyan átalakulását, amely az izomösszehúzódáshoz vezet. Glicerinezett izomrostban a miozin katalitikus doménjén található legreaktívabb ciszteint, a cisztein-707-et jelöltük TCSL és MSL jelölővel. Maleimid EPR spektrumából a miozinfej globális orientációjára, míg TCSL jelölő használata esetén a lokális, interdomén változásokra következtethetünk. 39
40 H par. k H per. k H 17. ábra. MSL jelölt izomrostok konvencionális EPR spektrumai rigor állapotban. Az izomrostok hossztengelye párhuzamos (felső ábra) és merőleges (alsó ábra) állásban a mágneses tér irányára. Nukleotid mentes rigor állapotban az EPR spektrum orientációfüggő, a Cys 707- hez kapcsolt bármilyen SH jelölő esetén. A spektrum alakja az izomrost hossztengelye és a mágneses tér által bezárt szögtől függött, kitüntetett irányuk és szögszórásuk azonban különbözött. MSL jelölő használálata esetén a rost hossztengelye és a jelölő kitüntetett iránya által bezárt szög 82 és a hozzátartozó szögszórás 6 volt. Rigor állapotban a fejek csak egyféle módon kötődhetnek az aktin filamentumhoz [, ]. Méréseink alapján a fejek egységes irányítottságot, nagyfokú rendezettséget mutattak bizonyítva, hogy rigor stádiumban a miozin kereszthidak mereven és orientáltan kötődnek az aktin filamentumokhoz. (17. ábra) 40
41 H par k H per k H 18. ábra. TCSL jelölt izomrostok konvencionális EPR spektrumai rigor állapotban. Az izomrostok hossztengelye párhuzamos (felső ábra) és merőleges (alsó ábra) állású volt a mágneses tér irányára. Izotiocianát alapú jelölő használata esetén a szondamolekula a miozin katalitikus doménjén található Cys 707 tiol csoportjához kapcsolódik. A jelölők a rostban a mikroszekundumos időskálán immobilizálódnak, rotációs korrelációs idejük körülbelül 60µs rigor állapotban az ST EPR spektrum adataiból kiszámolva. Ha rigor állapotban lévő izomrost jelöléséhez TCSL jelölőt használtunk az EPR spektrumok szintén nagyfokú rendezettséget mutattak [] (18. ábra), de a jelölők kitüntetett irányának és a rost hossztengelyének bezárt szöge 75, a szögszórás pedig 16 volt. MSL és TCSL jelölők használata esetén a különbség magukban a jelölő molekulákban keresendő, hiszen azok kémiai szerkezete és kapcsolódási módja is eltérő. A spektrumok alakjából megállapítható, hogy a jelölők erősen immobilizált állapotban vannak. Szaturáció transzfer EPR méréseink bizonyították (21. ábra), hogy a két jelölő molekula kapcsolódása rigid volt. Mivel a jelölő molekula mozgásából a jelölt fehérjeszegmens mozgására következtethetünk megfigyeltük, hogy rigor állapotban minden miozin molekula aktinhoz kötődik és a kötés csakis egy módon valósulhat meg, azaz sztereospecifikus rigid kötés []. 41
42 rigor ADP H 19. ábra. TCSL jelölt izomrostok hossztengelyének a mágneses tér irányára párhuzamos állásban mért konvencionális EPR spektrumai rigor és ADP állapotban. MSL-harántcsíkolt izomroston és S-1 dekorált aktin filamentumon MgADP hozzáadása nem okoz mérhető változást sem a spektrumban, sem pedig az S-1 kapcsolódási szögében az EM vizsgálatok szerint, ami arra utal, hogy a kötés által indukált konformációs változás lokális. Ez a lokális konformációs változás azonban TCSL-rostokon megfigyelhető, de kis változás mérhető a tranzíciós hőmérsékletekben is DSC méréseknél, amelyet majd a későbbiekben a DSC eredmények fejezetben írok le. EPR kísérleti eredményeink alapján az MSL szondával jelölt rostokhoz MgADP-t adva, ezzel modellezve az AM.ADP állapotot nem tapasztalható változás, a miozinfejek globális orientációja változatlan marad a rigor állapotban mért eredményekhez képest. Ezzel szemben TCSL rostokat 5mM MgADP-vel kezelve szignifikánsan eltérőnek bizonyultak az eredmények (19. ábra). A jelölők kitüntetett iránya és a rosttengely által bezárt szög 75 -ról 56 -ra csökkent és a szögszórás 4 -kal megnőtt, viszont az irányfüggő rendezettség megmaradt a rostokban. Ez azt mutatja, hogy a miozin 27 kda-os szegmense a katalitikus doménben konformáció változást szenved MgADP hatására, mely konformációváltozás azonban csak a nukleotid kötőhely környezetét érinti. Ennek bizonyítéka, hogy ST EPR spektrumokból kapható rotációs korrelációs idők a milliszekundumos időtartományba esnek mindkét jelölő molekula esetén. A TCSL szonda molekula kapcsolódása valamivel flexibilisebb, mint az MSL szondáé, de úgy tűnik, hogy orientációja kedvezőbb a biofizikai vizsgálatok 42
43 szempontjából, így az előbbi szegmenshez kapcsolódó lokális konformációs változást és emellett az orientációban bekövetkező változást is érzékeli, míg MSL szonda erre nem alkalmas ATP.V i ADP.V i Diff. sp. H 20. ábra. MSL jelölt izomrostok konvencionális EPR spektrumai ATP.Vi és ADP.Vi állapotban, valamint a két állapot különbségi spektruma. Ha ADP-t és ortovanadátot (mint szervetlen foszfát analógot) együttesen adunk rigor állapotban levő rostokhoz, az AM.ADP.P i állapotot modellezzük, tartósan disszociáltathatjuk a miozin fejeket az aktin filamentumoktól. Amíg MSL jelölő használata esetén a rostok konvencionális EPR spektruma alig mutatott változást az előzőekben tárgyalt AM.ADP állapotban, addig jelentős változást figyeltünk meg az AM.ADP.V i állapotban MSL-lel jelölt rostok szögeloszlásában. Ugyanebben az állapotban TCSL jelölő használatával a konvencionális EPR spektrumok is lényegesen megváltoztak, és a random eloszlású jelölőkre jellemző populáció jelent meg. Jelentős azonban a spektrumok közötti eltérés, ha ADP helyett ATP-t használtunk, a random populáció utóbbi esetben szignifikánsan nagyobb, sőt legtöbb esetben ez az egyetlen populáció jelenik meg, míg ADP alkalmazása esetén ADP-orientált populáció is jelen van. A különbség összefüggésbe hozható a miozin, mint ATP-t hasító enzim backdoor sajátságával []. 43
44 Wells és Bagshaw [] egy korábbi tanulmányukban leírták, hogy vanadát és ATP indukálja a miozin SH1 oldalhoz kapcsolt MSL spin jelölők mobilitását. Izomroston végzett EPR kísérletek során sikerült bebizonyítanunk, hogy ebben az állapotban a spektrum nem orientációfüggő. Az általunk végzett kísérletekben tapasztalt és korábban már MgADP állapottal kapcsolatban közölt rigor állapottól eltérő orientáció arra enged következtetni, hogy valószínűleg két sztereospecifikus kötés létezik az ATP hidrolízis és erőgenerálás folyamatában vagy egy sztereospecifikus kötés létezik, de a spin-jel orientációja ADP állapotban eltérő. AM.ADP.V i állapotban a spektrum nagymértékű változása annak tulajdonítható, hogy a miozin fejek a rigor állapotban mérhető sztereospecifikus strong binding kötésből nem-sztereospecifikus weak binding kötésbe mennek át, vagy disszociálnak is az aktintól. Az így detektált spektrum egyetlen komponensből áll, amit a spinjelölők rendezetlen populációja alkot. A miozinfejek disszociációját az L /L és C /C diagnosztikus paraméterek csökkenése mutatja (21. ábra). TCSL ADP.V i C C' rigor MSL rigor L L'' H 21. ábra. TCSL és MSL jelölt izomrostok ST EPR spektrumai rigor és ADP.Vi állapotban. L és L, valamint C és C a rotációs korrelációs idő számolásához szükséges diagnosztikus csúcsokat jelölik. Az izomrostok hossztengelye a mágneses tér irányára merőleges állású volt. 44
45 Irodalmi adatok alapján ismeretes, hogy kristályos állapotú S-1.ADP.BeF x, valamint a komplex oldatrendszerben történő vizsgálat is arra utal, hogy az S- 1.ADP.BeF x komplex az M*.ATP és M**ADP.P i állapotokat egyaránt mimikálja [, ]. TCSL-rostokon végzett kísérleteink szerint az ADP.BeF x állapotra jellemző EPR spektrum egyránt eltér az ADP.AlF 4 és ADP.V i állapotokban mérhető spektrumtól. Spektrummanipuláció segítségével megállapítható, hogy ADP.BeF x állapot tulajdonképpen két állapot szuperpozíciója. Az egyik állapot az egyébként EPR spektroszkópiai szempontból teljesen azonos ADP.AlF 4 és ADP.V i állapotnak felel meg, míg a másik egy viszonylag gyorsabb rotációs korrelációs idővel jellemezhető állapotnak (22. ábra). A két konformáció aránya 60%:40%. A nagyobb populáció nagy valószínűséggel a M**.ADP.P i gyenge aktin kötő állapotot jellemzi. A kisebb populáció megfelelhet a szimulált M*.ATP állapotnak, amit EPR mérések is alátámasztanak, miszerint a MgATP és Ca-MgATP jelenlétében a Cys-707 oldallánchoz kapcsolt próba molekula mobilitása növekedik [, ]. ADP.BeF x Fraction: 0.4 : 0.6 ADP.V i ADP.AlF 4 H 22. ábra. ATP hidrolízis modellezett gyenge kötés állapotai. 45
46 EPR spektroszkópiai kísérleteink szerint különbség mutatható ki az ADP.AlF 4 és az ADP.BeF x állapotok között, sőt az utóbbi állapot két állapot szuperpozíciójának tűnik, amelyekhez eltérő rotációs korrelációs idő rendelhető. Hasonló következtetésre jutottak 19 F NMR kísérletek alapján is []. A vélt különbséget a későbbiek során megvitatandó DSC mérések is alátámasztani látszanak. A lassan hidrolízáló ATP analóg γatp alkalmas a miozin-aktin közötti gyenge kötés kialakulásának modellezésére. Brenner és munkatársai összehasonlították a kereszthidak mechanikai és szerkezeti jellemzőit relaxált rostokban és Mg.PP i jelenlétében [, ]. Ezek azt mutatták, hogy a kereszthidak γatp jelenlétében az ATP hidrolízis ciklus gyenge kötésű állapotában tapasztalható tulajdonságokkal rendelkeznek, de a kereszthíd aktintól való disszociációs állandója két nagyságrenddel csökkent. Méréseink szerint γatp jelenlétében a hiperfinom csatolási állandó (2A zz) 58.7 G-ig nőtt a rost párhuzamos orientációjában a rigor állapothoz képest, ugyanakkor az orientációs rend jól láthatóan csökkent; csak kis orientációfüggést lehetett kimutatni. A rendezettséget mutató populáció a γatp hidrolíziséből származó ADP-nek tulajdonítható. Digitális manipulációval kivonást alkalmazva a rost mindkét orientációja esetén ugyanazt a spektrumot figyeltük meg. Érdekes megjegyezni, hogy a γatp-vel kapott spektrum paraméterei közel egyeznek az ADP.BeFx állapotban detektált spektrummal. Fischer és munkatársai, később Geeves és Holmes kimutatták, hogy az ADP.BeF x állapot az ATP állapotot mimikálja [, ]. EPR eredményeink alapján úgy gondoljuk, hogy az ADP.BeF x illetve γatp jelenlétében a nyúl vázizomban ugyanazt az állapotot valószínűsíthetjük, természetesen ennek a hipotézisnek az igazolása további részletes kísérleti munkát igényel. 46
47 BeF x γ - ATP H 23. ábra. BeF x által mimikált állapot meghatározásaγ-atp segítségével. Jól látható, hogy a BeF x egyik populációja jó közelítéssel megfelel a γ-atpáltal szolgáltatott EPR spektrumnak. Kísérleteket végeztünk annak eldöntésére, hogy a γatp-vel kapott EPR spektrumaink milyen állapotot modelleznek. Összehasonlítottuk a TCSL jelölt izomrostok rigor- és ADP állapotú spektrumait a mágneses térrel való párhuzamos állás esetén. Mint várható, az EPR spektrum egy kevert állapotot mutat, egyaránt jelen lehet mind az erősen, mind pedig a gyengén aktinhoz kötött miozin fej (24. ábra). Rigor ADP 2A' zz γ - ATP H 24. ábra. TCSL jelölt izomrostok konvencionális EPR spektruma párhuzamos állásban rigor, ADP- és γatp állapotban. 47
48 Mivel a γatp lassan hidrolizál, ezért vizsgálható a konvencionális EPR időskáláján. Megvizsgáltuk, hogy orientációfüggőnek tekinthető-e a γatp jelenlétében mért mintánk spektruma. Eredményeinkből kiderült, hogy csak kis orientációfüggés tapasztalható, ha a párhuzamos és merőleges állás spektrumait összehasonlítjuk. A merőleges állású spektrum, mint minden köztes állapotban izotróp eloszlású jelölők (miozin fejek) spektrumát mutatta (25. ábra). H par. k H per. k H 25. ábra. TCSL jelölt izomrost γatp spektruma. A rosttengelyek párhuzamosan (felső ábra) és merőlegesen (alsó ábra) álltak a mágneses tér irányára Ηa a γatp-vel kezelt TCSL jelölt izomrost párhuzamos állású spektrumából kivontuk az ADP állapotú, hasonlóképpen TCSL jelölt rost spektrumát, akkor maradványként megkaptuk az izotróp eloszlást mutató merőleges állású γatp spektrumot (26. ábra). 48
49 γ -ATP ADP Maradvány spektrum H 26. ábra. A párhuzamos állású γatp spektrumból kivont ADP spektrum maradványa. Előzetes méréseink alapján ismeretes, hogy γatp és V i jelenlétében az izomrost nem relaxáltatható tökéletesen, hiszen a γatp lassú hidrolízise miatt az ATP mellett ADP is jelen van a rendszerben. Ebben az esetben a kiértékelésre két megoldás lehetséges: vagy valamely enzimmel hatástalanítjuk az ADP-t (például apiráz enzimmel, amely tulajdonképpen ATP difoszfohidroláz) vagy spektrummanipuláció segítségével egyszerűen levonjuk a γatp.v i spektrumból az ADP állapotban mért spektrumot. Mi az utóbbi megoldást választottuk. Ebben az esetben is hasonló eredményt kaptunk, hiszen a maradvány spektrum egy izotróp eloszlásra utaló spektrum lett (27. ábra). 49
50 γ - ATP.V i ADP Diff. spektrum H 27. ábra. γatp és V i együttes hatásának vizsgálata TCSL jelölt párhuzamos állású spektrummanipulációval, az eredeti spektrumból kivontuk az ADP állapot spektrumát. - Eredményeink szerint vázizom rostban BeF x vagy AlF 4 kötődése igazolja azt a - nézetet, hogy az ADP.BeF x és ADP. AlF 4 állapotok energetikája különbözik és különböző átmeneti állapotokat reprezentálnak. Az ADP.BeF x állapotban végzett mérés eredményei azt sugallták, hogy ez az állapot heterogén, az M*.ATP és AM**.ADP.P i - intermedier állapotok szuperpozíciója. Ezzel szemben ADP. AlF 4 állapotot nem lehetett megkülönböztetni az ADP.P i -től (AM.ADP.V i ). Kísérleteink azt mutatják, hogy ATP hidrolízis alatt a miozin fej egy nem specifikus gyenge kötésből egy specifikus erős kötésbe megy át és az EPR spektrumok többé-kevésbé visszatükrözik a funkcionálisan lényeges szerkezeti változásokat, amelyek az ATP hidrolízis során bekövetkeznek. EPR kísérleteink szerint Ca 2+ jelenlétében az AM.ADP.AlF 4 állapot is részben irányfüggő EPR spektrumot eredményez. A spektrum alakja összetett, de digitális manipulációval a komponensek szétválaszthatók. Az egyik komponens nem sztereospecifikus kötésű miozin fejekre utal, míg a másik komponens ADP-szerű, sztereospecifikus kötés. Ca 2+ távollétében azonban csak egyetlen populáció detektálható, ennek rotációs korrelációs ideje 10 és 100 µs közé esik, amit az ST EPR spektrumokból tudunk megállapítani. Ebből arra következtethetünk, hogy a miozin feji régió laza kapcsolatban áll az aktinnal, vagy disszociált az aktintól. Eltérő eredmény adódik BeF x használata esetén. Ebben az esetben mint tárgyaltuk - két populáció detektálható az EPR spektrum alapján, az egyik populáció megfelel az AM.ADP.AlF 4-50
51 nél mért populációnak, míg a dekompozícióval nyerhető másik populáció rotációs korrelációs ideje kb. 15 ns, egy lényegesen gyorsabb belső mozgásra utal. ADP.AlF 4 CaADP.AlF 4 L L'' H 28. ábra. ST EPR spektrumok ADP.AlF 4 és CaADP.AlF 4 izomrostokon. Abban az esetben, ha a rostokhoz AMP.PNP-t (nem hidrolizáló ATP analóg) adtunk, mimikálva ezzel az AM.ATP állapotot, az EPR spektrum H k irányban (függetlenül a jelölő fajtájától) megváltozott, ami a miozin fejek belső struktúrájában bekövetkezett konformációváltozásra, vagy a miozin fejek megváltozott eloszlására utal; a spektrum egy random és egy rendezett jelölő populáció együttes jelenlétét mutatta (30. ábra). A rendezett frakció megközelítőleg 50%-a volt a teljes jelölő koncentrációnak. A random frakció megfelel az ADP.Pi állapotot mimikáló ADP.Vi állapotnak, azonban a rendezett frakció, attól függően, hogy melyik jelölőt használtuk, eltérő rendezettséget mutatott. MSL jelölő esetén ez az állapot a rigor, TCSL jelölő esetén az ADP állapotban tapasztalt rendezettségének felelt meg. 51
52 AMP.PNP rigor maradvány spektrum H 29. ábra. MSL jelölt izomrostok AMP.PNP és rigor állapotban mért konvencionális EPR spektrumai. A rosttengelyek párhuzamosan álltak a mágneses tér irányára. A maradvány spektrum a rigor spektrum AMP.PNP spektrumból történt kivonásával jött létre. Digitális manipulációval kivonva a rendezetlen frakciót a spektrumokból, meghatározható a megmaradt komponens irányfüggése. Ez alapján tulajdonképpen két populációt különíthetünk el egymástól, a használt jelölő tulajdonságaitól függően. Az MSL jelölt rost esetén a rendezett frakció orientációja tökéletesen megfelelt a rigor állapotban megfigyelt orientációnak (29. ábra). Ezzel szemben TCSL rostok esetén a rendezett frakció orientációja az ADP állapotban megtalálható orientációval volt megegyező (30. ábra). Ez az eredmény megfelel annak a krisztallográfiai mérésből származó megállapításnak, hogy MgAMP.PNM jelenlétében az open és closed konformációk egyaránt előfordulnak. Az EPR spektrumok kettős integrálja a két populációra 50-50%- os eredményt adott, ami kitűnő egyezésben van a fluoreszcencia spektroszkópia módszerrel kapott eredményekkel. AMP.PNP-vel végzett EPR kísérleteink eredménye arra a jelenségre mutat rá, hogy a miozin molekula két feje nem viselkedik egyformán (sztérikus kényszer). AMP.PNP állapotban az elasztikus viselkedés eltér a strong binding (rigor) állapotban mérhetőtől; a sztatikus nyújtásban AMP.PNP állapotban a rugalmassági modulus csökken a rigor állapothoz képest, míg dinamikus nyújtás esetén az AMP.PNP 52
53 állapotban a rigorhoz képest nincs változás. Ez azt jelenti, hogy a miozin fejek 50%-a felelős az izomrost rugalmas tulajdonságaiért (pszeudorelaxáció). AMP.PNP ADP különbség spektrum maradvány spektrum H 30. ábra. TCSL jelölt izomrostok konvencionális EPR spektrumai. A különbség spektrum az ADP spektrum AMP.PNP spektrumból történt kivonásával jött létre, alakja random módon orientált spin jelölők jelenlétére utal. A maradvány spektrumot a különbség spektrumból az ADP.Vi spektrumot kivonva állítottuk elő. Kísérleteink alátámasztják azt a véleményt, hogy az ATP hidrolízis során a miozinfej egy nem-specifikus gyengén kötött állapotból egy specifikus erősen kötött állapotba megy át és erőkifejtés generálódik, továbbá a miozinfej rotációs mozgása funkcionálisan jelentős konformációváltozások sorozatán megy keresztül a működés során. A kétféle jelölőről megállapítottuk, hogy míg az MSL jelölő sajátos kapcsolódása és orientációja miatt a teljes miozin fej orientációjáról ad felvilágosítást, addig a TCSL jelölő kissé lazább kapcsolódása,de kedvezőbb orientációja miatt a belső struktúrában végbemenő változások követésére is alkalmas, és visszatükrözi, hogy a rigor és ADP állapotok egymástól különböznek. 53
54 5.2. DSC mérések eredménye Izomrostokon végzett DSC kísérleteink mérési tartománya 5-80 o C közötti volt. A felmelegítés sebessége C/perc volt minden esetben. A kaloriméterhez tartozó Hastelloy edényt használtuk a denaturációs kísérletek elvégzésére, amelyekbe úgy mértük be a mintát, hogy a két cella (minta és referencia cella) hőkapacitása közel azonos legyen. Az izom nedvestömege jellemzően mg közötti volt. Rigor oldatot vagy pufferoldatot használtunk referenciaként. A minta és a referencia edényeket ±0.1 mg pontossággal egyensúlyoztuk ki. Az általunk használt kaloriméter mérés előtti kalibrációt nem igényelt. A kalorimetriás entalpia kiszámolásához a SETARAM kétpontos illesztő programját használtuk. A fehérje denaturáció reverzibilitásának eldöntésére a mintát felmelegítettük, majd hűtés után ismételten denaturáltuk (felmelegítettük), s az eredményből következtettünk a denaturáció tulajdonságára. A kis molekulasúlyú globuláris fehérjék kivételével a biológiai rendszerek esetében a denaturáció irreverzibilis. A fehérjerendszerek irreverzibilis denaturációjának első modellje Lumry és Eyring nevéhez fűződik [], amelyet Sanchez-Ruiz és munkatársai fejlesztettek tovább [, ]. Egy egyszerű két-állapotú irreverzibilis denaturációs modell szolgál az eredmények kiértékelésére, ahol N a natív proteint, F a denaturált proteint, k app a reakció sebességi állandóját jelöli: app N k F Az elmélet feltételezi az úgynevezett sebesség-limitált reverzibilis kicsomagolás meglétét, amely két lépést foglal magában: N k1 2 k D F A natív protein (N) reverzibilis denaturációját (D) és a denaturált protein irreverzibilis átalakulását egy végső konformációba (F). Az irreverzibilitás mértékét az adott hőmérséklet és az idő határozza meg, azaz a második lépést nem a hőmérsékletfüggő egyensúlyi állandó, hanem a kinetikai folyamat sebességi állandója 54
55 szabja meg. Ennek bizonyítéka, hogy a denaturációs folyamat termikus átalakulási hőmérséklete a pásztázás sebességétől függ. Huber és munkatársai az annexin V E17G protein DSC vizsgálata nyomán megfigyelték, hogy a pásztázás sebességének növelésével elérhető, hogy a tranzíciós görbék alakja ne függjön a pásztázás sebességének nagyságától, ami azt jelenti, hogy a termikus denaturáció értelmezésére az egyensúlyi termodinamika módszerei is használhatók []. Ha a D állapot populációja szignifikánsan nem jelentős, az irreverzibilis denaturációt az egyszerű kétállapotú modellel írhatjuk le: app N k F A k app reakciósebességi állandó, ami az N F átalakulást írja le, erősen hőmérsékletfüggő. A teória a k app értékét is megállapítja: k app = k 1 k + 1 k 2 k 2 ahol k -1 a D N reverzibilis átmenet reakciósebességi állandója. A k app sebességi-állandó a hőmérséklet függvényében változik az Arrhenius egyenletnek megfelelően. A teoretikus elemzés azt is sugallja, hogy az irreverzibilis lépés a denaturált állapotból az irreverzibilis állapotba gyors. DSC kísérleteink rigor állapotú rostkötegeknél azt mutatják, hogy a tranzíciós hőmérsékletek a felfűtés sebességének függvényében változnak 1 o C/min felfűtési sebesség környékén a változás már igen csekély, ami az egyensúlyi termodinamika keretében alkalmazott dekompozíciós eljárást ez esetben jó közelítéssel teszi lehetővé (31. ábra). 55
56 Tranzíciós hõmérséklet, o C T m T m2 55 T m1 50 0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0 Szkensebesség, K/min 31. ábra. Szken sebesség hatása m.psoasból preparál tglicerinezett izomrostok DSC tranzíciós hőmérsékletére. Az ábra a három fő tranzíciós átmenetet mutatja. 0.5 K/min. szkensebességen felül a tranzíciós átmenet körülbelül eléri a határértéket. Sanchez-Ruiz és munkatársai által kidolgozott modell egyik következménye, hogy a scan-sebesség és a tranzíciós hőmérséklet négyzetének hányadosa (V/T 2 m), pontosabban ennek logaritmusa 1/T m függvényében egyenest ad, amelynek meredekségéből a reakciósebességi állandó aktivációs energiája kiszámolható. A 32. ábráról az átlagos aktivációs energiát lehet leolvasnia három fő átmenet esetén, 302, 636 és 328 kj/mol értékűek voltak egyenként. Az aktivációs energia megfelel az irreverzibilis lépésnek a termális denaturáció folyamatában. Az ábrán az is jól látható, hogy a reakciósebesség nagyobb a középső átmenet esetén, mint az első és harmadik tranzíció esetén. Ezt a középső termikus átmeneteket, a miozin rúd kompakt α helikális szerkezetével hozzák összefüggésbe. 56
57 ln{s r /(T m ) 2 } -11,5-12,0-12,5 E a = kj/mol -13,0-13,5-14,0 E a = kj/mol E a = kj/mol 2,94 2,96 2,98 3,00 3,02 3,04 3,06 3,08 3, /T m, K ábra. Az aktivációs energia értékei az első három fő tranzíciós hőmérséklet esetében. :Tm1 aktivációs energiája, : Tm2 aktivációs energiája, : Tm3 aktivációs energiája Hőmérsékleti átmenetek rigor állapotú izomrostban Mivel a harántcsíkolt izomrost szerkezetében bekövetkező globális változásokról DSC méréssel irodalmi adatokat nem találtunk, ezért a fehérjeoldatokon és egyéb miozinfajtákon végzett adatokra támaszkodtunk. A következőkben ezek rövid ismertetésére térnék ki. Korábbi mérések során szarvasmarha szívmiozinon végzett DSC kísérletekben legkevesebb 5 termikus átmenetet figyeltek meg C között [, ]. A közleményekkel egyetértésben a legmagasabb hőátmenet a fehérje rúd régiójának feltekeredett α- hélixéből származtatható, míg az alacsonyabb tranzíciós hőmérséklet a miozin feji régiójának tulajdonítható. Izolált miozin feji részén végzett korábbi kutatások eredményei alapján 3-6 átmeneti hőmérsékletet lehetett elkülöníteni C között. Izomrostok esetében, ha a filamentumokban direkt módon protein-protein kölcsönhatást generálunk, az növeli a szerkezeti stabilitást, és a szerkezet magasabb hőstabilitását eredményezi. E stabil szerkezet kialakulása módosítja a kontraktilis fehérjék dinamikáját és energetikai tulajdonságait, emiatt az olvadáspontok eltolódnak a magasabb hőmérsékleti tartományba. 57
58 Az aktin első termikus denaturációját G-aktinon végezték [], amely során legalább két egymással kölcsönhatásban lévő domén létezésére utaló DSC jelet kaptak. Ezt később, mások által végzett mérések és azok dekompozíciója is igazolta [-]. Szerkezeti igazolást a G-aktin atomi szerkezetének meghatározásakor nyert [], amely szerint egy mély zsebbel elválasztott két fő, és azok további két aldoménra oszthatók. F- aktin vizsgálata még egy további példa arra, hogy a DSC, mint módszer, alkalmas a polimerizáció következményeinek vizsgálatára is, amely F-aktin esetén a denaturációs hőmérséklet és kalorimetriás entalpia szignifikáns növekedésében és a DSC jel félérték szélességének csökkenésében nyilvánul meg [,, ]. Ezen irodalmi adatok figyelembevételével próbáltuk kísérleteinket megtervezni illetve eredményeinket értékelni. Célunk volt tehát, hogy az ATP hidrolízis köztes állapotaiban létrejövő globális változásokat tanulmányozzuk nyúl m. psoasából származó izomrostokon. Rigor állapotban lévő, tehát nukleotid mentes izomroston végzett DSC mérésünk eredményét tekintettük kiindulásnak, s ehhez hasonlítottuk a nukleotidokkal és analógjaikkal mimikált ATP hidrolízis ciklus köztes állapotainak egyes lépéseit Nukleotidok hatása a hőátmenetekre A glicerinezett izomrostok hőátmeneti görbéi a miozin aktinhoz való erős kötődésében a rigor és ADP állapotban nem mutattak szembetűnően nagy különbségeket Tris HCl puffer használata esetén. Hasonló eredményt figyeltek meg nukleotid mentes S1 és S1 ADP-vel történő kezelése esetén is [-, ]. Az MSL-rostok konvencionális EPR spektruma is alig mutatott változást az AM.ADP állapot és rigor állapot összehasonlítása esetén. Ezzel szemben TCSL-jelölt rostok mérési eredménye alapján a két állapotban szignifikáns eltérés mutatkozott []. EPR méréseink eredményei is alátámasztják, hogy a doménen belüli flexibilitás- vagy orientációváltozás lehet a magyarázata a rigor és ADP állapot eltérő termikus denaturációjának is. DSC mérések esetén ez a tranzíciós hőmérsékletekben lévő jelentős különbség figyelhető meg rigor és ADP állapot esetén, ha MOPS puffert használunk Tris.HCl helyett, hiszen ebben az esetben az utolsó tranzíciós hőmérséklet elmozdult körülbelül 3 C- kal a magasabb hőmérsékleti tartományba, 64,2 C- ról 66,7 C- ra (33. ábra). MOPS puffer használatát 58
59 az indokolta, hogy míg a Tris HCl nem hőstabil, a MOPS puffer jól bírja a hőmérséklet emelkedését a DSC mérések során, ph értéke stabilan a beállított értéken marad. Hasonló eredményt kaptak Dictyostelium discoideummal végzett kísérletek esetén, amikor feji részének az M761 és M754-es részeihez való ADP kötődése 2-3,5 C elmozdulást eredményezett a termikus átmenetekben, utalva a nagy konformációs változásra, amelyet a struktúra stabilizációja eredményezett []. Hőáram/mW T m = 57.8 o C 0,25 0,20 0,15 0,10 T m = 52.9 o C T m = 64.2 o C Rigor 0,05 T m = 53.6 o C T m = 67 o C ADP 0, Hőmérséklet/ o C 33. ábra. Az izomkontrakciós ciklus rigor és ADP állapotainak DSC görbéi, MOPS puffer használata esetén. A folytonos vonallal ábrázolt DSC diagram esetén a miozin rúdhoz és a T m =64.2 C-hoz tartozó átmeneteket az értékelhetőség növelése érdekében levontuk. Néhány újabb keletű munkában - amelyet Levitsky és munkatársai publikáltak - ADP és szervetlen foszfát analógok (BeF 3, AlF 4 és V i ) jelenlétében a tranzíciós hőmérséklet nagymértékű elmozdulását figyelték meg S1 és F-aktin oldat hőmérsékleti denaturációjának detektálása során. Muhlrad és munkatársai szintén kimutatták, hogy a szerkezeti változás kifejezetten az S1 50 kda-os régiójában az S1 ATPáz aktivitásának és triptikus érzékenységének megváltozásához vezet. Nukleotidok, ATP vagy ADP az 50 kda-os régiót kifejezetten ellenállóbbá teszik a hőkezeléssel szemben. Összehasonlítva a miozin aktinhoz való kötődésének DSC mintázatait rostkötegekben azt láthatjuk, hogy a gyenge kötésű állapotokban, a 2. és 3. átmenet tranzíciós hőmérséklete alig változott, míg az utolsó, 4. átmenet meglehetősen 59
60 változatos (34. ábra). Amikor 5 mm MgATP-t és 5 mm V i -ot adtunk a rostokhoz az AM.ADP.P i gyengén kötött állapot szimulálására, akkor az elmozdulás 67,5 -ról 71 -ra történt. Megjegyzendő, hogy MgADP és V i adása esetén a változás szignifikánsan kisebb volt. Anorganikus P i jelenléte a pufferben csupán csekély változást eredményez (35. ábra). A negyedik átmenet izomrost rendszerben a miozin motor domén és az ADP, BeF 3 vagy AlF 4 kötődésének lehet a következménye, más vélemények szerint az F-aktin egy második nukleotid kötő régiójához történő kapcsolódás a következménye. Ez utóbbi feltételezést Hozumi írta le [101], és 1997-ben Bombardier és munkatársai megerősíteni vélték méréseikkel megfigyeléseit []. Levitsky és munkatársai azonban ezt a lehetőséget a munkáikban nem említik, jól lehet számos mérést közöltek S -aktin rendszerben. 1,0 Hőáram, mw 0,8 0,6 0,4 0,2 AMP.PNPADP.AlF 4 ADP ADP.BeF x 0, Hőmérséklet, o C 34. ábra. ATP hidrolízis intermedier állapotainak DSC mintázata. Termikus denaturációs vizsgálataink szerint AM.ADP.Vi, AMP.PNP valamint - az ATP és BeF x vagy AlF 4 kötésekor keletkező állapotok konformációja különbözik a rigortól és az AM.ADP állapottól. A tranzíciós hőmérsékletek és kalorimetriás entalpiák szignifikáns különbségeket jeleznek a miozin belső szerkezetében és a nukleotid-miozin fej kölcsönhatásában (2. táblázat). A negyedik hőátmeneti csúcs a következő sorrendben nő az F-aktinra jellemző denaturációs csúcs határozott elkülönülésével 60
61 - együtt a hőkezelés során: Vi, AMP.PNP, AlF 4 és BeF x. Ebből a sorrendből arra következtethetünk, hogy az ATP hidrolízis mimikált köztes állapotaiban, az un. weak bindingban, a miozin aktinhoz való affinitása eltérő, termodinamikai szempontból az állapotok nem pontosan szimulálják az AM.ADP.P i állapotot. Egy másik értelmezési lehetőség az aktin szerepében keresendő. A röntgendiffrakciós szerkezetvizsgálatok szerint is a kísérletileg megvalósítható weak binding állapotok (AM.ADP.Vi, AM.AMP.PNP, AM.ADP.AlF 4 és AM.ADP.BeF x ) között a különbség kicsi, a konformációváltozás a nukleotid kötőhely közelében csupán néhány oldalláncra terjed ki. Hőáram, mw 0,4 0,3 0,2 0,1 T m = 52.3 o C T m = 61.5 o C T m = 65.0 o C 0, Hőmérséklet, o C 34. ábra. Anorganikus Pi (10mM) hatása izomrost DSC termogramjára. Feltevéseink bizonyítására többféle kísérletet végeztünk: 1. az egyik a rostkötegekből részlegesen extraháltuk a miozint és egymással szemben denaturáltuk a miozin extrahált és nem miozin extrahált mitáinkat. Mindkét rostköteg rigor állapotú, nedves tömegük egyenlő volt (36. ábra). 61
62 2. az izomrostokat eltérően kezeltük: az egyik rostköteget ADP.AlF4-gyel kezeltük, a másikat rigor állapotban hagytuk. A két rostköteg tömege azonos volt, tehát a miozin-aktin arány gyakorlatilag ugyanannyi volt. Ezt a két mintánkat denaturáltuk egymással szemben a DSC mérés során (37. ábra). Hőáram különbsége, mw 0,06 0,04 miozin rúd T m = 58.4 o C 0,02 miozin motor domén aktin kezeletlen rostok 0,00-0,02-0,04 T m = 52.8 o C T m = 66.1 o C miozin extrahált minta -0, Hőmérséklet, o C 36. ábra Miozin extrahált és kezeletlen rostok egymással szembeni denaturációjának DSC termogramja. Az első esetben azt tapasztaltuk, hogy a negyedik csúcs valóban az aktintól származik, hiszen abban a mintában láttunk változást, amelyikből részlegesen extraháltuk a miozint, vagyis arányait tekintve több aktin volt. Ebben az esetben az aktinhoz tartozó termikus átmenet 66.1 C volt. Az első átmenet a kezeletlen rostban jól mutatja, hogy termikus stabilitás szempontjából a miozin motor domén a legkevésbé stabil struktúra. 62
63 Hőáram különbsége, mw 0,05 miozin fej T T m = 53.5 o m = 49.8 o C C aktin: T m = 64.7 o C rigor 0,00-0,05 miozin rúd: T m = 58.4 o C -0,10 ADP.AlF 4-0,15 aktin: T m = 77.2 o C Hőmérséklet, o C 37. ábra. Izomrostok hőáramainak összehasonlítása rigor és ADP.ALF 4 állapotban. A második esetben, amikor különböző állapotú izomrost kötegeket egymással szemben denaturáltunk (rigor és AlF 4 ) a miozin motor domén tranzíciós hőmérséklete körülbelül 4 C-kal mozdult el, összehasonlítva a rigor állapotban lévő miozin motor doménnal, mialatt az F-aktin filamentumoké több mint 10 C-kal nőtt. DSC eredményeink értelmezésének egyik lehetősége a Hozumi, majd Bombardier és munkatársai által megalkotott elgondolás a második nukleotid kötő domén létezéséről [11, ]. Egy másik lehetőség, hogy egy nukleotid kötőhely létezik, de nukleotidok és nukleotid analógok jelenlétében az F-aktin molekuláknak két populációja van jelen, a Tm 3 és Tm 4 átmenetek egyaránt az aktinnak tulajdoníthatók. Rigor állapotban azonban csak egy populációt detektáltunk. A legmagasabb hőátmenet, Tm 4 függ a nukleotidoknak a nukleotid kötő helyre való kapcsolódásától, ahogy azt a 34. ábra, illetve az 1. táblázat mutatja. Hasonló méréseket F-aktin oldaton is végeztek, amelynek eredményei alátámasztották azt a nézetet, hogy BeF x és csekélyebb mértékben AlF 4 is jelentősen stabilizálja az F-aktint, és gátolja a hődenaturációt [, ]. Orlova és Engelman elektronmikroszkópos kísérleteikkel szintén kimutatták, hogy BeF x és P i hatására a flexibilis filametumok rigidizálódnak, ami alátámasztja a termális stabilitás növekedését [, ]. Egyik szerző sem tételez fel második nukleotid kötőhelyet. 63
64 0,4 Hőkapacitás változás, C p, J/K miozin rúd; T m = 57.4 o C 0,3 miozin motor domén T m = 57.4 o C aktin 0,2 T m = 63.4 o C T m = 74.8 o C 0,1 0, Hőmérséklet, o C 38. ábra. Izomrostok DSC tranzíciói ADP és AlF 4 jelenlétében (fekete vonal). Miozin rúd és aktin populáció kivont DSC görbéi (piros vonal). A különböző intermedier állapotok összehasonlítása végett, elvégeztük a DSC görbék dekomponálását. Az eredményeket az 1. táblázatban foglaltuk össze. 1. táblázat. ATP hidtolízis intermedier állapotainak hőátmenetei, a DSC görbék alapján. Kísérleti eredmények T 1 ( C) T 2 ( C) T 3 ( C) T 4 ( C) Rigor ADP AMP.PNP ATP.V i ATP.AlF ATP.BeF x
65 Összehasonlítottuk a Gauss görbék területének %-os eloszlását is. Az egyes görbék alatti terület nagysága megadja a tranzíció entalpiáját a teljes entalpia százalékos arányában. A harmadik és negyedik átmenetek entalpiájának összege eltérést mutatott az izomrostok különböző intemedier állapotaiban. A rostban lévő F-aktin molekuláknak két populációja lehetséges nukleotidok és nukleotid analógok jelenlétében; a Tm 3 és Tm 4 átmeneteket lehet ezeknek a populációknak tulajdonítani. A Tm 4 hőátmenet a különböző nukleotid analógok bekötődésétől függ, amely szignifikáns nukleotidindukált flexibilitásváltozásra utal (35. ábra). A nagyobb kalorikus entalpiához nagyobb tranzíciós hőmérséklet tartozik. Eltérés csak ADP.V i esetében volt mérhető. 2. táblázat. DSC mérés eredményei izomrostokon, a tranzíciós hőmérséklet C-ig terjedő tartományában. Dekompozíciós eredmények T 1 ( C) T 2 ( C) T 3 ( C) T 4 ( C) terület 3+ 4 (%) Rigor % terület ADP % terület AMP.PNP % terület ATP.V i % terület ATP.AlF % terület ATP.BeF x % terület A 38. ábra piros szaggatott vonallal jelölt görbéjének nagy aszimmetriája azt sugallja, hogy ez a miozin több feji doménjének szuperpozíciója. A szuperpozíció valószínűleg a miozin szubfragment-2 nek is köszönhető. Egy korábbi DSC kísérletben megvizsgálták a HMM összetett csúcsait, ahol az első endoterm csúcs 41 C-nál jelent meg, és megfelelt az S-2 olvadásának []. Nukleotidok kötődése hatására az átmenet a magasabb hőmérsékleti tartományba mozdult el. 65
66 A második csúcs entalpiája nem mutat nagy variációt, melyből az következik, hogy a miozin rúd termális átmenetére nincs hatással az ATP hidrolízis folyamata. Hasonló értékeket figyeltek meg miozin oldaton neutrális ph-n és magas ionerősségen is. 66
67 6. Összefoglalás 1) EPR mérések. Izomrostokon végzett EPR méréseinkkel az izomkontrakció ATP hidrolízis ciklusa hosszú élettartalmú köztes állapotainak szimulálásával az aktomiozin rendszerben a konformációváltozásokat vizsgáltuk paramágneses spektroszkópiai szondák beültetésének segítségével. a) Konvencionális EPR méréseink eredményeiből megállapítottuk, hogy rigor állapotban az izomrostokon mért EPR spektrumok nagyfokú irányfüggő rendezettséget mutattak mindkét jelölőnek (TCSL, MSL) a cys 707-hez való kapcsolódása esetén. Különbség csak a kitüntetett irányukban és a szögszórásban volt. Ez a különbség a jelölők eltérő tulajdonságaival magyarázható, hiszen különbözik kémiai szerkezetük és kapcsolódásuk módja is. A spektrumok alakjából arra következtettünk, hogy a labelek erősen immobilizált állapotban vannak a konvencionális EPR időskáláján. b) Szaturáció transzfer EPR méréseink bizonyították, hogy a két fehérje molekula kapcsolódása rigid, rigor állapotban minden miozin molekula aktinhoz kötődik; ez a kötődés sztereospecifikus rigid kötés, azaz a kötés egy és csakis egy módon valósulhat meg. c) ADP jelenlétében az EPR spektrum az AM.ADP köztes állapotnak felel meg. Összehasonlítva a rigor és ADP állapotra jellemző spektrumokat MSL szondamolekula használata esetén a miozinfejek orientációja változatlannak tűnt, ezzel szemben TCSL-rostok esetében szignifikánsan eltérőnek bizonyultak. d) MSL és TCSL szondákat használtunk a hidrolízis ciklus weak binding kötést modellező állapotainak vizsgálatához is. Ezek közül az AM.ADP.Pi állapotot ATP és ortovanadát segítségével modelleztük, tartósan disszociáltatva a miozin fejeket az aktin filamentumoktól. Ebben 67
68 az esetben mind MSL, mind pedig TCSL jelölő használata esetén jelentős változást figyeltünk meg az EPR spektrumokon a rigor és ADP állapotokhoz képest a miozin fejek szögeloszlásában. Mindkét jelölő esetén egy random eloszlású labelekre jellemző populációt azonosítottunk. Különbséget találtunk abban az esetben, ha ATP helyett ADP-t alkalmaztunk V i mellett; ATP esetén kizárólag csak a random populáció jelent meg, míg ADP esetén a random populáció mellett az ADP állapotra jellemző orientált populáció jelenlétét is detektáltuk. e) Weak binding állapot modellezésére ADP.AlF 4 és ADP.BeF x állapotú rostokat vizsgáltunk. Az EPR kísérleti eredményeinkből arra a következtetésre jutottunk, hogy ADP.BeF x állapotra jellemző spektrum eltér mind az ADP.AlF 4, mind az ADP.V i állapotokban mért spektrumtól. ADP.BeF x állapotban két konformációt azonosítottunk 60-40% arányban. A nagyobb arányban jelenlévő populációt az M.**ADP.P i weak binding állapotnak, míg a kisebb arányú populációt M.*ATP állapotnak feleltettük meg. Feltevéseinket γ ATP-t használva további kísérletekkel valószínűsítettük. EPR eredményeink alapján bebizonyítottnak véljük, hogy az ADP.BeF x és γ ATP valószínűleg ugyanazt az állapotot reprezentálja; míg az ADP.AlF 4 állapotban lévő izomrostok EPR spektrumai nem különböztethetők meg az ADP.Vi (ADP.Pi) állapotú izomrostokétól. f) ATP állapot modellezéséhez használt AMP.PNP esetén két miozin populációt detektáltunk egy random frakciót, amely az ADP.P i állapotot közelítő ADP.V i állapotnak felel meg, és egy rendezett, aktinhoz kötött állapotot. A rendezett állapot MSL jelölő használata esetén rigor állapotnak, TCSL jelölő esetén ADP állapotnak, tehát mindenképpen strong binding kapcsolatnak felelt meg. A rendezett állapotú frakció megközelítőleg 50%-a volt a teljes jelölő koncentrációnak. A különböző konformációs állapotokban bekövetkező globális változások tisztázására DSC mérést alkalmaztunk. A DSC nem szerkezeti vizsgáló módszer, az 68
69 általa szolgáltatott adatok csak közvetve engednek bepillantást a szerkezetbe, így a termogramokból csak kellő óvatossággal lehet következtetetéseket levonni, viszont kitűnő kiegészítője és megerősítője az EPR eredményeknek. Glicerinezett izomrostok hőátmeneti görbéit Gauss típusú függvényekkel leírható hőátmenetekre bontottuk fel, és az egyes átmenetekhez tartozó denaturációs folyamatokat a struktúraelemekhez rendeltük. Izomrostok esetén 4 fő komponensre bonható a mintázat. Az első átmenetet a miozin feji régiójának azonosítottuk; s valószínű, hogy a mért átmenet több jel szuperpozíciójából jön létre, magában foglalja a szubfragment-2 jelét is. A második átmenet reprezentálja a miozin rudat, a harmadik hőátmenet az aktintól származik. Az átmenetek gyakorlatilag csekély mértékben változnak nukleotidok jelenlétében a különböző intermedier állapotokban. A negyedik tranzíciós hőmérséklet esetében szignifikáns változás figyelhető meg a magasabb hőmérsékleti tartomány felé, ha a puffer oldat AMP.PNP-t, AM.ADP.V i -t, ADP.BeF x -t vagy ADP.AlF 4 -t tartalmazott. Valószínűsíthető, hogy ez az átmenet az ADP bekötődésének köszönhető a miozin nukleotid kötő doménjéhez és/vagy az aktinhoz. A változás mértéke függ a nukleotid analóg típusától. A nukleotid kötődése stabilitást eredményez a szerkezetben, amely nagyobb entalpiában és magasabb tranzíciós hőmérsékletben nyilvánul meg: a) Rigor és ADP állapotban csupán MOPS puffer használata esetén tapasztaltunk változást, mivel a ph stabilitás a denaturációs mérés során csak MOPS puffer használata esetén maradt változatlan. Az ADP bekötődése hőstabilitást eredményez az izomrostban, amelyet a negyedik hőátmenet közel 3 C-os emelkedése bizonyít. Nagy a valószínűsége annak, hogy ADP bekötődésére a doménen belüli flexibilitás-és/vagy orientációváltozás- lehet a magyarázata a rigor és ADP állapot eltérő termikus denaturációjának. b) A weak binding állapot (AM.ADP.P i ) modellezése ADP és ortovanadát segítségével a negyedik átmenet szignifikáns eltolódását eredményezte a magasabb hőmérsékleti tartományba. Ez az átmenet részben -a miozin nukleotid kötő doménje mellett- a miozin aktinkötő doménjének és az F-aktin olvadásának is tulajdonítható. A DSC görbe ezen komponensének kiszélesedése és a magasabb hőmérséklet felé tolódása a megnövekedett kalorimetriás entalpiával 69
70 együtt arra is utal, hogy a ligand kötés révén az aktinkötő domén stabilitása megnövekedett, a nukleotidkötő zseb környezete jobban csomagolt vanadát jelenlétében. Alternatív magyarázat lehet az aktin megnövekedett hőstabilitása. c) Megállapítottuk, hogy ADP.V i, AMP.PNP, valamint ATP és BeF x vagy AlF 4 kötésekor keletkező állapotok konformációja és energetikája egyaránt különbözik az erősen kötött állapottól. Az eltérő tranzíciós hőmérsékletek és kalorimetriás entalpiák szignifikáns különbségeket jeleznek a miozin fej belső szerkezetében és a nukleotid-miozinfej kölcsönhatásban, valamint az F-aktin szerkezetében: a negyedik átmenet hőmérséklete a V i, AMP.PNP, Al 4 és BeF x sorrendben nő az F-aktinra jellemző denaturációs csúcs határozott elkülönülésével. A megfigyelés arra enged következtetni, hogy vagy az ATP hidrolízis ciklus modellezett köztes állapotaiban a weak-binding állapotok nem szimulálják teljesen az ADP.P i állapotot, vagy a nukleotid- analóg F-aktin kölcsönhatás a domináns, amelyre a differencia DSC mérések utalnak. 70
71 Internetes ábrák jegyzéke kat=afbt&url=/eletestudomany/archiv/2000/0046/izom/izom.html and_cell_motility.html
72 Hivatkozások jegyzéke 1. Goldman YE (1975) Kinetics of actomyosin ATPase fibers. Ann Rev Physiology 49: Lombardi V, Piazzesi G, Ferenczi MA, Thirlwell H, Dobbie I and Irving M (1995) Elastic distortion of myosin heads and repriming of the working stroke in muscle. Nature 374: Piazzesi G, Reconditi M, Linari M, Lucii L, Sun YB, Narayanan et al. (2002) Mechanism of force generation by myosn heads in skeletal muscle. Nature 415: Bagshaw CR, Eccleston JF, Eckstein F, Goody RS, Goodfreund H and Trentham DR (1974) The magnesium ion-dependent adenosine triphosphate of myosin. Two-step processes of adenosine triphosphate association and adenosine diphosphate dissociation. Biochemistry Journal 141: Geeves MA, Goody RS and Goodfreund H(1984) Kinetics of acto-s1 interaction as a guide to a model for the crossbridge cycle. Journal of Muscle Research Cell Motility 5: Huxley AF, Niedergerke R (1954) Structural changes in muscle during contraction. Interference microscopy of living muscle fibres. Nature 173: Huxley HE, Hanson J (1954) Changes in the cross-striations of muscle during contraction and stretch and the structural interpretation. Nature 173: Banga I, Erdös T, Gerendás M, Mommaerts W, F., H., M., Straub F, B., Szent- Györgyi A (1941) Myosin and muscular contraction, vol 1, Szeged 9. Straub F, B., (1942) Actin. Stud. Szeged 2: Vandekerckhove J and Weber K (1984) Chordate muscle actins differ distinctly from invertebrate muscle actins. The evolutions of different vertebrate muscle actins. J Mol Biol 179: Kabsch W, Mannherz HG, Suck D, Pai EF, Holmes KC (1990) Atomic structure of the actin:dnase I complex. Nature 347: Kopp SJ, Barron JT, Tow JP (1990) Phosphatic metabolites, intracellular ph and free [Mg 2+ ] in single, intact porcine carotid artery segments studied by 31 P-NMR. Biochim Biophys Acta 1055:
73 13. Kushmerick MJ, Dillon PF, Meyer RA, Brown TR, Krisanda JM, Sweeney HL (1986) 31 P NMR spectroscopy, chemical analysis, and free Mg 2+ of rabbit bladder and uterine smooth muscle. J Biol Chem 261: Tsien RY, Pozzan T, Rink TJ (1982) Calcium homeostasis in intact lymphocytes: cytoplasmic free calcium monitored with a new, intracellularly trapped fluorescent indicator. J Cell Biol 94: Loscalzo J, Reed GH (1976) Spectroscopic studies of actin-metal-nucleotide complexes. Biochemistry 15: Strzelecka-Golaszewska H (1973) Effect of tightly bound divalent cation on the equilibria between G- actin-bound and free ATP. Eur J Biochem 37: Strzelecka-Golaszewska H, Prochniewicz E, Drabikowski W (1978a) Interaction of actin with divalent cations. 1. The effect of various cations on the physical state of actin. Eur J Biochem 88: Strzelecka-Golaszewska H, Prochniewicz E, Drabikowski W (1978b) Interaction of actin with divalent cations. 2. Characterization of protein-metal complexes. Eur J Biochem 88: Carlier MF, Pantaloni D, Korn ED (1986) Fluorescence measurements of the binding of cations to high-affinity and low-affinity sites on ATP-G-actin. J Biol Chem 261: Gershman LC, Selden LA, Estes JE (1991) High affinity divalent cation exchange on actin. Association rate measurements support the simple competitive model. J Biol Chem 266: Kuehl WM, Gergely J (1969) The kinetics of exchange of adenosine triphosphate and calcium with G- actin. J Biol Chem 244: Waechter F, Engel J (1977) Association kinetics and binding constants of nucleoside triphosphates with G-actin. Eur J Biochem 74: Kinosian HJ, Selden LA, Estes JE, Gershman LC (1993) Nucleotide binding to actin. Cation dependence of nucleotide dissociation and exchange rates. J Biol Chem 268: Kinosian HJ, Selden LA, Estes JE, Gershman LC (1991) Thermodynamics of actin polymerization; influence of the tightly bound divalent cation and nucleotide. Biochim Biophys Acta 1077: Holmes KC, Popp D, Gebhard W, Kabsch W (1990) Atomic model of the actin filament. Nature 347: Hanson J, Lowy J (1963) The structure of F-actin and of actin filaments isolated from muscle. J. Mol. Biol. 6:
74 27. Milligan RA, Whittaker M, Safer D (1990) Molecular structure of F-actin and location of surface binding sites. Nature 348: Wegner A (1976) Head to tail polymerization of actin. J Mol Biol 108: Korn ED, Carlier MF, Pantaloni D (1987) Actin polymerization and ATP hydrolysis. Science 238: Pollard TD, Weeds AG (1984) The rate constant for ATP hydrolysis by polymerized actin. FEBS Lett 170: Carlier MF (1987) Measurement of Pi dissociation from actin filaments following ATP hydrolysis using a linked enzyme assay. Biochem Biophys Res Commun 143: Carlier MF (1992) Nucleotide hydrolysis regulates the dynamics of actin filaments and microtubules. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 336: Janmey PA, Hvidt S, Oster GF, Lamb J, Stossel TP, Hartwig JH (1990) Effect of ATP on actin filament stiffness. Nature 347: Pollard TD (1986) Rate constants for the reactions of ATP- and ADP-actin with the ends of actin filaments. J Cell Biol 103: Gordon DJ, Yang YZ, Korn ED (1977) Polymerization of Acanthamoeba actin. Kinetics, thermodynamics, and co-polymerization with muscle actin. J Biol Chem 251(23): Cooper Ja and Pollard TD (1982) Methods ti measure actin polymerization. Methods in Enzymology 85: Hitchcock SE (1980) Actin deoxyroboncuclease I interaction. Depolymerization and nucleotide exchange. J Biol Chem 255: Nishida E (1985) Opposite effects of cofilin and profilin from porcine brain on rate of exchange of actin-bound adenosine 5'-triphosphate. Biochemistry 24: Polzar B, Rosch A, Mannherz HG (1989) A simple procedure to produce monospecific polyclonal antibodies of high affinity against actin from muscular sources. Eur J Cell Biol 50: Tellam RL (1986) Gelsolin inhibits nucleotide exchange from actin. Biochemistry 25: Frederick Crlscitelli (1977) Friederich Wilhelm Kühne Vision Research 17:
75 42. Fonyó A, Az orvosi élettan tankönyve, Medicina Könyvkiadó Rt, Kensler RW, Stewart M (1983) Frog skeletal muscle thick filaments are threestranded. J Cell Biol 96: Luther PK, Munro PM, Squire JM (1981) Three-dimensional structure of the vertebrate muscle A-band. III. M- region structure and myosin filament symmetry. J Mol Biol 151: Sivaramakrishnan M, Burke M (1982) The free heavy chain of vertebrate skeletal myosin subfragment 1 shows full enzymatic activity. J Biol Chem 257: Wagner PD, Giniger E (1981) Hydrolysis of ATP and reversible binding to F- actin by myosin heavy chains free of all light chains. Nature 292: Weeds AG (1969) Light chains of myosin. Nature 223: Rayment I, Holden HM, Whittaker M, Yohn CB, Lorenz M, Holmes KC, Milligan RA (1993) Structure of the actin-myosin complex and its implications for muscle contraction. Science 261: Geeves MA and Holmes KC (2005) The molecular mechanism of muscle contraction. Advances in Protein Chemistry 71: Houdusse A, Cohen C (1996) Structure of the regulatory domain of scallop myosin at 2 A resolution: implications for regulation. Structure 4: Xie X, Harrison DH, Schlichting I, Sweet RM, Kalabokis VN, Szent-Györgyi AG, Cohen C (1994) Structure of the regulatory domain of scallop myosin at 2.8 Å resolution. Nature 368: Bagshaw CR, Trentham DR (1974) The characterization of myosin-product complexes and of product-release steps during the magnesium ion-dependent adenosine triphosphatase reaction. Biochem Journal 141: Holmes KC (1996) Muscle proteins--their actions and interactions. Curr Opin Struct Biol 6: Holmes KC (1997) The swinging lever-arm hypothesis of muscle contraction. Curr Biol 7: Smith CA, Rayment I (1996) X-ray structure of the magnesium(ii) ADP.vanadate complex of the Dictyostelium discoideum myosin motor domain to 1.9 Å resolution. Biochemistry 35: Holmes KC, Angert I, Kull FJ, Jahn W and Shroder RR (2003) Electron cryomicroscopy show show strong binding of myosin to actin releases nucleotide. Nature 425:
76 57. Holmes KC, Schroder RR, sweeney HL and Houdusse A (2004) The Structure of the rigor complex and its implications for the power stroke. Philos. 359: Trentham DR, Bardsley RG, Eccleston JF, WeedsAG (1972) Elementary processes of the magnesium ion-dependent adenosine triphosphatase activity of heavy meromyosin. A transient kinetic approach to the study of kinases and adenosine triphosphatases and a colorimetric inorganic phosphate assay in situ. Biochem J 126: Málnási-Csizmadia A, Pearson DS, Kovács M, Woolley RJ, Geeves MA, Bagshaw CR (2001) Kinetic resolution of a conformational transition and the ATP hydrolysis step using relaxation methods with a Dictyostelium myosin II mutant containing a single tryptophan residue. Biochemistry 40: Rome E (1972) Relaxation of glycerinated muscle: low-angle X-ray diffraction studies. Journal of Molecular. Biology 65: Roopnarine O and Thomas DD (1994) A spin label that binds to myosin heads in muscle fibers with its principal axis parallel to the fiber axis. Biophys J 67: Zhao L, Naber N, Cooke R (1995) Muscle cross-bridges bound to actin are disordered in the presence of 2,3-butanedione monoxime. Biophys J 68: Belágyi J, Frey I, Pótó L (1994) ADP-induced changes in ordering of spinlabelled myosin heads in muscle fibres. Eur J Biochem 224: Poole CP (1967) Electron spin resonance. A comprehensive treatise on experimental techniques. Wiley, New York, London. 65. Berliner LJ (1976) Spin labeling-theory and Applications. Academic Press. 66. Goldman SA, Bruno GV, Polnaszek CF, Freed JH (1972) An ESR study of anisotropic rotational reorientation and slow tumbling in liquid and frozen media. J Chem Phys 56: Horváth L, Marsh D (1988) Improved Numerical Evaluation of Saturation Transfer Electron Spin Resonance Spectra. J of Magn Reson 80: Hyde JS, Dalton LR, (1979) Spin Labelling. Theory and Application. Vol 2. Academic Press, New York. 69. Marsh D (1981) In: Grell E (ed) Membrane Spectroscopy. Springer-Verlag, Berlin, Thomas DD, Seidel JC, Gergely J, Hyde JS (1975) The quantitative measurement of rotational motion of the subfragment-1 region of myosin by saturation transfer epr spectroscopy. J Supramol Struct 3:
77 71. Edidin M (1974) Rotational and translational diffusion in membranes. Annu Rev Biophys Bioeng 3: Lumry R and Eyring H (1954) Conformation changes of proteins. J Phys Chem 58: Conjero-Lara F, Mateo PL, Aviles FX and Sanchez-Ruiz JM (1991) Effect of Zn 2+ on the thermal denaturation of carboxypepdidase. B Biochemistry 30: Thorolfsson M, Ibarra-Molero B, Fojan P, Petersen SB, Sanchez-Ruiz JM and Martinez A (2002) L-Phenylalanine binding and domain organization in human phenylalanine hydroxylase: a differential scanning calorimetry study. Biochemistry 41: Vogl T, Jatzke C, Hinz HJ, Benz J and Huber R (1997) Thermodynamic stability of annexin V E17G: equilibrium parameters from an irreversible unfolding reaction. Biochemistry 36: Geeves MA, Holmes KC (1999) Structural mechanism of muscle contraction. Annu Rev Biochem 68: Fajer PG (1994) Determination of spin-label orientation within the myosin head. Proc Natl Acad Sci USA 91: Thomas DD and Cooke R (1980) Orientation of spin-labeled myosin heads in glycerinated muscle fibers. Biophys J 32: Weber S, Wolff T and Günther von Bünau (1996) Molecular Mobility in Liquid and in Frozen Micellar Solution: EPR Spectroscopy of Nitroxide Free radicals. Journal of colloid and Interface Science 184, Yount RG, Lawson D, Rayment I (1995) Is miosyn a back door enzyme? Biophys J 68: Wells C, Bagshaw CR (1984) The caracterization of vanadate-trapped nucleotide complexes with spin-labelled myosins. J Muscle res Cell Motil 5: Henry GD, Maruta S, Ikebe M, Sykes BD (1993) Observation of multiple myosin subfragment 1-ADP-fluoroberyllate complexes by 19F NMR spectroscopy. Biochemistry 32: Seidel JC and Gergely J (1971) The conformation of myosin during the steady state of ATP hydrolysis? Studies with myosin spin labelled at the S1 thiol groups. Biophys. Res. Commun 44: Thomas DD, Ishiwata S, Seidel JC, Gergely J (1980) Submillisecond rotational dynamics of spin-labelled myosin heads in myofibrils. Biophys J 32:
78 85. Brenner SL, Mitchell RS, Morrical SW, Neuendorf SK, Schutte BC, Cox MM (1988) reca protein-promoted ATP hydrolysis occurs throughout reca nucleoprotein filaments. J Biol Chem 262: Kraft T, Yu LC, Kuhn HJ, Brenner B (1992) Effect of Ca 2+ on weak cross-bridge interaction with actin in the presence of adenosine 5 -[gamma-thio] triphosphate. Proc Natl Acad sci USA 89: Fisher SA and Ikebe M (1995) Developmental and tissue distribution of expression of nonmuscle and smooth muscle isoforms of myosin light chain kinase. Biochem Biophys Res Commun 217: Tatunashvili LV and Privalov PL (1984) Calorimetric study of G-actin denaturation. Biofizika, Russian 29(4): Bertazzon A and Tsong TY (1990) Effect of ions and ph on the thermal stability of thin and thick filaments of skeletal muscle: high-sensitivity differential scanning calorimetric study. Biochemistry 29: Samejima K, Ischioroshi M and Yashui T (1983) Scanning calorimetric studies on thermal denaturation of myosin and its subfragments. Agric Biol Chem 47: Lőrinczy D and Belágyi J (1995) Effect of nucleotide on skeletal muscle myosin unfolding in myofibrils by DSC. Biochem Biophys Res Commun 217(2): Lőrinczy D, Könczöl F, Gaszner B, Belágyi J (1998) Structural stability of actin filaments as studied by DSC and EPR. Thermochimica Acta 322, Kabsch W, Mannherz HG, Suck D, Pai EF, Holmes KC (1990) Atomic structure of the actin filament: DNase I complex. Nature 347(6288): Levitsky DI, Nikolaeva OP, Orlov VN, Pavlov DA Ponomarev MA, Rostkova EV (1998) Differential scanning calorimetric studies on myosin and actin. Biochemistry (Mosc) 63(3): Levitsky DI, Khovorov NV, Shnyrov VL, Vedenkina NS, Permyakov EA, Poglazov BF (1990) Domain structure of myosin subfragment-1. FEBS Lettres 264: Bobkov AA, Bobkova EA, Homsher E, Reisler E (1997) Activation of regulated actin by SH1-modified myosin subfragment 1. Biochemistry 36: Golitsina NL, Kordowska J, Wang CLA and Lehrer SS (1996) Ca 2+ -Dependent Binding of Calcyclin to Muscle Tropomyosin. Biochemical and Biophysical Research Communications 220:
79 98. Hartvig N, Gaszner B, Kiss M, Lőrinczy D, Belágyi J (2002) Effect of nucleotides and their analogues on essential light chains in myosin head. J Biochem Biophys Methods 53(1-3): Ponomarev MA, Furch M, Levitsky DI, Manstein DJ (2000) Charge in loop 2 affect the thermal unfolding of the myosin motor domain bound to F-actin. Biochemistry 39: Setton A and Muhlrad A (1984) Effect of mild heat treatment on the ATPase activity and proteolytic sensitivity of myosin subfragment-1. Archieves of Biochemistry and Biophysics 235(29) Hozumi T (1998) Structural aspects of skeletal muscle F-actin as studied by tryptic digestion: evidence for a second nucleotide interacting site. J Biochemistry 104: Bombardier H, Wong P, Gicquaud C (1997) Effects of nucleotides on the denaturation of F actin: a differential scanning calorimetry and FTIR spectroscopy study. Biochem Biophys Res Commun 236(3): Combeau C and Carlier MF (1988) Probing the mechanism of ATP hydrolysis on F-actin using vanadate and the structural analogs of phosphate BeF-3 and AlF Dancker P and Fischer S (1989) Stabilization of actin filaments by ATP and inorganic phosphate. Z Naturforsch 44: Orlova A and Egelman EH (1992) Structural basis for the destabilization of F- actin by phosphate release following ATP hydrolysis. J Mol Biol 227(4): Orlova A and Egelman EH (1993) A conformational change in the actin subunit can change the flexibility of the actin filament. J Mol Biol 232(2): Shriver JW and Kamath U (1990) Differential scanning calorimetry of the unfolding of myosin subfragment 1, subfragment 2, and heavy meromyosin. Biochemistry
80 Az értekezés alapjául szolgáló közlemények Dergez T., Könczöl F., Farkas N., Belágyi J., Lőrinczy D., DSC study of glycerolextracted muscle fibers in intermediate states of ATP hydrolysis. J Thermal Anal Calorim 2005; 80: Dergez T., Könczöl F., Kiss M., Farkas N., DSC study on the motor protein myosin in fibre system. Thermochimica Acta 2006; 445: Dergez T., Lőrinczy D., Könczöl F., Farkas N., Belágyi J., Differential scanning calorimetric study of glycerinated muscle fibres in intermediate state os ATP hydrolysis. FEBS Lett című folyóirathoz közlésre elküldve. Egyéb közlemények Farkas N., Lőrinczy D., Dergez T., Kilár.F, Belágyi J., DSC and EPR study of effects of polycyclic aromatic hydrocarbons on erythrocyte membranes. Enviromental Toxicology and Pharmacology 2004; 16: Könczöl F., Farkas N., Dergez T., Belágyi J and Lőrinczy D., Effect of tetracaine on erythrocyte membrane by DSC and EPR. J Thermal Anal Calorim 2005; 82: Az értekezés alapjául szolgáló absztraktok Lőrinczy D., Dergez T., Belágyi J., Effect of free radicals on small globular proteins (BSA, HH). The 58 th Calorimetry Conference and The Japan Society of Calorimetry and Thermal Analysis, Brigham Young University-Hawaii, Lőrinczy D., Dergez T., Belágyi J., ATP hidrolízis intermedier állapotainak vizsgálata harántcsíkolt izomrostokon. Magyar Biofizikai Társaság XXI. Kongresszusa, Szeged, Lőrinczy D., Dergez T., Belágyi J., ATP hydrolysis intermediate states in psoas skeletal muscle fibres by DSC. 32 th European Muscle Conference, Montpellier, France, Journal of Muscle Research and Cell Motility 2003; 24(4-6): 329. Dergez T., Farkas N., Könczöl F., Belágyi J., Lőrinczy D., DSC study of glycerinated muscle fibres in intermediate states of ATP hydrolysis. 33 th European Muscle 80
81 Conference, Isola d Elba, Journal of Muscle Research and Cell Motility 2004; 25(3): 250. Kiss M., Könczöl F., Dergez T., Farkas N., Belágyi J. Lőrinczy D., Study of sitespecific oxidation of thiol groups in skeletal muscle actin. 18 th IUPAC Conference on Chemical Thermodynamics and The 12 th National Conference on Chemical Thermodynamics and Thermal Analysis, Beijing, China, Dergez T., Farkas N., Könczöl F., Belágyi J., Lőrinczy D., DSC study of glycerinated muscle fibres in intermediate states of ATP hydrolysis. ICTAC 13, 13 th International Congress on Thermal Analysis and Calorimetry, XXVI Conference AICAT-GICAT, Chia Laguna, 2004 Dergez T., Könczöl F., Belágyi J., Lőrinczy D., Intermediate states of ATP hydrolysis cycle in glycerinated muscle fibres by DSC. Biophysical Society 49 th Annual Meeting, Long Beach, California, Dergez T., Könczöl F., Kiss M., Farkas N., Analysis of intermediate states of ATP hydrolysis cycle in muscle fibres by DSC. 16 th Ulm-Freiberger Kalorimetrietage, Freiberg, Németország, Dergez T., Könczöl F., Farkas N., Belágyi J., Analysis of intermediate states of ATP hydrolysis cycle in muscle fibres by DSC. CEEPUS Summer School, Prague, Dergez T., Farkas N., Könczöl F., Belágyi J. Lőrinczy D., DSC study on the motor protein myosin. 15 th IUPAB & 5 th EBSA International Biophysics Congress, Montpellier, France, European Biophysics Journal with Biophysics Letters 2005, 34(6):
Biofizika I 2013-2014 2014.12.02.
ÁTTEKINTÉS AZ IZOM TÍPUSAI: SZERKEZET és FUNKCIÓ A HARÁNTCSÍKOLT IZOM SZERKEZETE MŰKÖDÉSÉNEK MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSA IZOM MECHANIKA Biofizika I. -2014. 12. 02. 03. Dr. Bugyi Beáta PTE ÁOK Biofizikai Intézet
MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA AZ IZOMMŰKÖDÉS 1. kulcsszó cím: A SZERVEZETBEN ELŐFORDULÓ IZOM- SZÖVETEK TÍPUSAI 1. képernyő cím: Sima izomszövet
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA AZ IZOMMŰKÖDÉS 1. kulcsszó cím: A SZERVEZETBEN ELŐFORDULÓ IZOM- SZÖVETEK TÍPUSAI 1. képernyő cím: Sima izomszövet G001 akaratunktól függetlenül működik; lassú,
BIOMECHANIKA 3 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben
BIOMECHANIKA 3 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben A MOZGÁS MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI SZERVEZET SZINTŰ MOZGÁS AZ IZOMMŰKÖDÉS MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI DR. BUGYI BEÁTA- BIOFIZIKA
Kollár Veronika
A harántcsíkolt izom szerkezete, az izommőködés és szabályozás molekuláris alapjai Kollár Veronika 2010. 11. 11. Az izom citoszkeletális filamentumok és motorfehérjék rendezett összeszervezıdésébıl álló
Tartalom. A citoszkeleton meghatározása. Citoszkeleton. Mozgás a biológiában A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 12/9/2016
Tartalom A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER Nyitrai Miklós, 2016 november 29. 1. Mi a citoszkeleton? 2. Polimerizáció, polimerizációs egyensúly 3. Filamentumok osztályozása 4. Motorfehérjék A citoszkeleton meghatározása
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA 2013.10.09. CITOSZKELETON - DEFINÍCIÓ Fehérjékből felépülő, a sejt vázát alkotó intracelluláris rendszer. Eukarióta és prokarióta sejtekben egyaránt megtalálható.
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Kémiai Doktori Iskola Fehérje szerkezet és működés c. program Glicerinezett izomrostok vizsgálata ATP hidrolízis köztes állapotaiban EPR és DSC technikával PhD értekezés tézisei Dergez
BIOMECHANIKA 2 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben
BIOMECHANIKA 2 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben A MOZGÁS MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI MOLEKULÁRIS MOZGÁS MOTORFEHÉRJÉK DR. BUGYI BEÁTA - BIOFIZIKA ELŐADÁS PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
A citoszkeleton. A citoszkeleton, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása. A citoszkeleton. A citoszkeleton. Az aktin.
, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása PTE ÁOK Biofizikai Intézet Ujfalusi Zoltán 2011. január-február Eukarióta sejtek dinamikus vázrendszere Három fő filamentum-osztály: 1. Intermedier
A citoszkeletális rendszer
A citoszkeletális rendszer Az eukarióta sejtek dinamikus fehérje-vázrendszere, amely specifikus fehérjepolimer filamentumokból épül fel. Mikrofilamentumok Mikrotubulusok Intermedier filamentumok Aktin
Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly
Hemoglobin - myoglobin Konzultációs e-tananyag Szikla Károly Myoglobin A váz- és szívizom oxigén tároló fehérjéje Mt.: 17.800 153 aminosavból épül fel A lánc kb 75 % a hélix 8 db hélix, köztük nem helikális
A citoszkeletális rendszer
A citoszkeletális rendszer A citoszkeletális filamentumok típusai, polimerizációja, jellemzıik, mechanikai tulajdonságaik. Asszociált fehérjék 2013.09.24. Citoszkeleton Fehérjékbıl felépülı, a sejt vázát
Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet
Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet Sejtmozgás -amőboid - csillós - kontrakció Sejt adhézió -sejt-ecm -sejt-sejt MOZGÁS A sejtmozgás
A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.
Nukleinsavak Szerkesztette: Vizkievicz András A nukleinsavakat először a sejtek magjából sikerült tiszta állapotban kivonni. Innen a név: nucleus = mag (lat.), a sav a kémhatásukra utal. Azonban nukleinsavak
Jellemzői: általában akaratunktól függően működik, gyors, nagy erőkifejtésre képes, fáradékony.
Izomszövetek Szerkesztette: Vizkievicz András A citoplazmára általában jellemző összehúzékonyság (kontraktilitás) az izomszövetekben különösen nagymértékben fejlődött ki. Ennek oka, hogy a citoplazma összehúzódásáért
Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek
Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek Fluoreszcencia kioltás Fluoreszcencia Rezonancia Energia Transzfer (FRET), Lumineszcencia A molekuláknak azt a fényemisszióját, melyet a valamilyen módon
Modern Fizika Labor. 5. ESR (Elektronspin rezonancia) Fizika BSc. A mérés dátuma: okt. 25. A mérés száma és címe: Értékelés:
Modern Fizika Labor Fizika BSc A mérés dátuma: 2011. okt. 25. A mérés száma és címe: 5. ESR (Elektronspin rezonancia) Értékelés: A beadás dátuma: 2011. nov. 16. A mérést végezte: Szőke Kálmán Benjamin
A harántcsíkolt izom struktúrája általános felépítés
harántcsíkolt izom struktúrája általános felépítés LC-2 Izom LC1/3 Izom fasciculus LMM S-2 S-1 HMM rod Miozin molekula S-1 LMM HMM S-2 S-1 Izomrost H Band Z Disc csík I csík M Z-Szarkomér-Z Miofibrillum
A citoszkeleton. A citoszkeleton, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása. A citoszkeleton. A citoszkeleton.
, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása PTE ÁOK Biofizikai Intézet Ujfalusi Zoltán 2012. január-február Eukarióta sejtek dinamikus vázrendszere Három fő filamentum-osztály: 1. Intermedier
Izomműködés. Az izommozgás. az állati élet legszembetűnőbb külső jele a mozgás amőboid, ostoros ill. csillós és izomösszehúzódással
Izomműködés Az izommozgás az állati élet legszembetűnőbb külső jele a mozgás amőboid, ostoros ill. csillós és izomösszehúzódással történő mozgás van Galenus id. II.szd. - az idegekből animal spirit folyik
Elektronspinrezonancia (ESR) - spektroszkópia
Elektronspinrezonancia (ESR) - spektroszkópia Paramágneses anyagok vizsgáló módszere. A mágneses momentum iránykvantáltságán alapul. A mágneses momentum energiája B indukciójú mágneses térben E m S μ z
A biológiai mozgások. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai. Motorfehérjék. Motorfehérjék közös tulajdonságai
A biológiai mozgások Molekuláris mozgás A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai Celluláris mozgás Mártonfalvi Zsolt Bakteriális flagellum Szervezet mozgása Keratocita mozgása felületen 1 Motorfehérjék
11/15/10! A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER! Polimerizáció! Polimerizációs egyensúly! Erő iránya szerint:! 1. valódi egyensúly (aktin)" Polimer mechanika!
11/15/10! A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER! 1. Mi a citoszkeleton?! 2. Polimerizáció, polimerizációs egyensúly! 3. Filamentumok osztályozása! Citoszkeleton : Eukariota sejtek dinamikus vázrendszere! Három fő
MOTORENZIMEK MŰKÖDÉSÉNEK SOKFÉLESÉGE
MOTORENZIMEK MŰKÖDÉSÉNEK SOKFÉLESÉGE MTA doktori értekezés Kovács Mihály Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológiai Intézet Biokémiai Tanszék 2010 Tartalomjegyzék 1. Összefoglalás 4
Műszeres analitika. Abrankó László. Molekulaspektroszkópia. Kémiai élelmiszervizsgálati módszerek csoportosítása
Abrankó László Műszeres analitika Molekulaspektroszkópia Minőségi elemzés Kvalitatív Cél: Meghatározni, hogy egy adott mintában jelen vannak-e bizonyos ismert komponensek. Vagy ismeretlen komponensek azonosítása
Citoszkeleton. Sejtek rugalmassága. Polimer mechanika: Hooke-rugalmasság. A citoszkeleton filamentumai. Fogászati anyagtan fizikai alapjai 12.
Fogászati anyagtan fizikai alapjai 12. Sejtek rugalmassága Citoszkeleton Eukariota sejtek dinamikus vázrendszere Három fő filamentum-osztály: A. Vékony (aktin) B. Intermedier C. Mikrotubulus Polimerizáció:
Abszorpciós spektroszkópia
Tartalomjegyzék Abszorpciós spektroszkópia (Nyitrai Miklós; 2011 február 1.) Dolgozat: május 3. 18:00-20:00. Egész éves anyag. Korábbi dolgozatok nem számítanak bele. Felmentés 80% felett. A fény; Elektromágneses
A citoszkeleton Eukarióta sejtváz
A citoszkeleton Eukarióta sejtváz - Alak és belső szerkezet - Rugalmas struktúra sejt izomzat - Fehérjékből épül fel A citoszkeleton háromféle filamentumból épül fel Intermedier filamentum mikrotubulus
A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai
BIOLÓGIAI MOZGÁSOK A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai Kollektív mozgás Szervezet mozgása ( Az évszázad ugrása ) Szerv mozgás BIOLÓGIAI MOZGÁSOK BIOLÓGIAI MOZGÁSOK Ritmusosan összehúzódó szívizomsejt
Biofizika I 2013-2014 2014.12.03.
Biofizika I. -2014. 12. 02. 03. Dr. Bugyi Beáta PTE ÁOK Biofizikai Intézet A KERESZTHÍD CIKLUSHOZ KAPCSOLÓDÓ ERŐKIEJTÉS egy kereszthíd ciklus során a miozin II fej elmozdulása: í ~10 nm 10 10 egy kereszthíd
Izomszövet eredetű aktin izoformák termodinamikai és spektroszkópiai vizsgálata
Izomszövet eredetű aktin izoformák termodinamikai és spektroszkópiai vizsgálata PhD értekezés Készítette: Orbán József Témavezetők: DR. LŐRINCZY DÉNES DR. HILD GÁBOR Doktori Iskola: Doktori Iskola vezető:
A biológiai mozgások. Motorfehérjék. Motorfehérjék közös tulajdonságai 4/22/2015. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai. Szerkezeti homológia
A biológiai mozgások Molekuláris mozgás A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai. Celluláris mozgás Mártonfalvi Zsolt Bakteriális flagellum Szervezet mozgása Keratocita mozgása felületen Motorfehérjék
Biofizika I
ÁTTEKINTÉS AZ IZOM 9. A HARÁNTCSÍKOLT IZOM SZERKEZETE ÉS MECHANIKÁJA 10. AZ IZOMMŰKÖDÉS ÉS SZABÁLYOZÁS MOLEKULÁRIS ALAPJAI TÍPUSAI: SZERKEZET és FUNKCIÓ MŰKÖDÉSÉNEK MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI MECHANIKAI
Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban A fény; Abszorpciós spektroszkópia
Tartalomjegyzék PÉCS TUDOMÁNYEGYETEM ÁLTALÁNOS ORVOSTUDOMÁNY KAR A fény; Abszorpciós spektroszkópia Elektromágneses hullám kölcsönhatása anyaggal; (Nyitrai Miklós; 2015 január 27.) Az abszorpció mérése;
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék.
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék. SCIENCE PHOTO LIBRARY Huber Tamás 2012. 10. 15. Citoszkeleton: eukarióta sejtek dinamikus fehérjevázrendszere Három fő filamentum-osztály: A. Intermedier B. Mikrotubulus
Modern Fizika Labor. Fizika BSc. Értékelés: A mérés dátuma: A mérés száma és címe: 5. mérés: Elektronspin rezonancia. 2008. március 18.
Modern Fizika Labor Fizika BSc A mérés dátuma: 28. március 18. A mérés száma és címe: 5. mérés: Elektronspin rezonancia Értékelés: A beadás dátuma: 28. március 26. A mérést végezte: 1/7 A mérés leírása:
A motorfehérjék hatékonyságának molekuláris háttere
A motorfehérjék hatékonyságának molekuláris háttere Szakdolgozat Biológia alapszak, biológus szakirány Készítette: IMRICH VANDA Témavezető: MÁLNÁSI-CSIZMADIA ANDRÁS Egyetemi docens Biokémia Tanszék EÖTVÖS
Tartalomjegyzék. Emlékeztetõ. Emlékeztetõ. Spektroszkópia. Fényelnyelés híg oldatokban 4/11/2016. A fény; Abszorpciós spektroszkópia
Tartalomjegyzék PÉCS TUDOMÁNYEGYETEM ÁLTALÁNOS ORVOSTUDOMÁNY KAR A fény; Abszorpciós spektroszkópia Elektromágneses hullám kölcsönhatása anyaggal; (Nyitrai Miklós; 2016 március 1.) Az abszorpció mérése;
A citoszkeletális rendszer, a harántcsíkolt izom biofizikája.
A citoszkeletális rendszer, a harántcsíkolt izom biofizikája. SCIENCE PHOTO LIBRARY Kupi Tünde 2010. 10. 19. Citoszkeleton: eukarióta sejtek dinamikus fehérjevázrendszere Három fı filamentum-osztály: A.
A fény tulajdonságai
Spektrofotometria A fény tulajdonságai A fény, mint hullámjelenség (lambda) (nm) hullámhossz (nű) (f) (Hz, 1/s) frekvencia, = c/ c (m/s) fénysebesség (2,998 10 8 m/s) (σ) (cm -1 ) hullámszám, = 1/ A amplitúdó
Az izommőködéssel járó élettani jelenségek
Az izommőködéssel járó élettani jelenségek Az izomszövet az egyetlen olyan szövet, amely hosszúságát változtatni tudja. Egy nem elhízott (non-obese) hölgyben az izomtömeg a testsúly 25-35 %-a, férfiben
2. AKTIN-KÖTŐ FEHÉRJÉK
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 2011. 02. 15. Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet 2. AKTIN-KÖTŐ FEHÉRJÉK Citoszkeletális aktin HEp-2 sejtekben - rodamin-falloidin jelölés forrás: Nyitrai Miklós, Grama László,
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek 2012. 11. 08. Fotonok és molekulák ütközése Fény (foton) ütközése a molekulákkal fényszóródás abszorpció E=hν
FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,
FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium Alkímia Ma, Budapest, 2013.02.28. I. FEHÉRJÉK: L-α aminosavakból felépülő lineáris polimerek α H 2 N CH COOH amino
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Biofizika szeminárium PTE ÁOK Biofizikai Intézet Huber Tamás 2014. 02. 11-13. A gerjesztett állapotú elektron lecsengési lehetőségei Gerjesztés Fluoreszcencia
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet. 9. A sejtmozgás mechanizmusai
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 2011. 05. 03. Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet 9. A sejtmozgás mechanizmusai Sejtmozgás, motilitás 1. Sejten belüli, intracelluláris mozgás izom összehúzódás organellumok
Az élő sejt fizikai Biológiája:
Az élő sejt fizikai Biológiája: Modellépítés, biológiai rendszerek skálázódása Kellermayer Miklós Fizikai biológia Ma már nem csak kvalitatív megfigyeléseket, hanem kvantitatív méréseket végzünk (biológiai
Emberi szövetek. A hámszövet
Emberi szövetek Az állati szervezetekben öt fı szövettípust különböztetünk meg: hámszövet, kötıszövet, támasztószövet, izomszövet, idegszövet. Minden szövetféleség sejtekbıl és a közöttük lévı sejtközötti
Abszorpciós fotometria
abszorpció Abszorpciós fotometria Spektroszkópia - Színképvizsgálat Spektro-: görög; jelente kép/szín -szkópia: görög; néz/látás/vizsgálat Ujfalusi Zoltán PTE ÁOK Biofizikai Intézet 2012. február Vizsgálatok
Modern Fizika Labor. 11. Spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: dec. 16. A mérés száma és címe: Értékelés: A beadás dátuma: dec. 21.
Modern Fizika Labor Fizika BSc A mérés dátuma: 2011. dec. 16. A mérés száma és címe: 11. Spektroszkópia Értékelés: A beadás dátuma: 2011. dec. 21. A mérést végezte: Domokos Zoltán Szőke Kálmán Benjamin
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék.
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék. Citoszkeleton: eukarióta sejtek dinamikus fehérjevázrendszere Három fő filamentum-osztály: A. Intermedier B. Mikrotubulus C. Mikrofilamentum SCIENCE PHOTO LIBRARY
Az izomszövet biokémiája. Izombetegségek. Szerkesztette: Fekete Veronika
Az izomszövet biokémiája. Izombetegségek Szerkesztette: Fekete Veronika Az izomtípusok jellemzői Simaizom lassú nincs rajzolat Szívizom gyors harántcsíkolt Harántcsíkolt izom belső szervek akaratlan nem
Polimerek fizikai, mechanikai, termikus tulajdonságai
SZÉCHENYI ISTVÁN EGYETEM ANYAGISMERETI ÉS JÁRMŰGYÁRTÁSI TANSZÉK POLIMERTECHNIKA NGB_AJ050_1 Polimerek fizikai, mechanikai, termikus tulajdonságai DR Hargitai Hajnalka 2011.10.05. BURGERS FÉLE NÉGYPARAMÉTERES
Abszorpciós fotometria
abszorpció A fény Abszorpciós fotometria Ujfalusi Zoltán PTE ÁOK Biofizikai Intézet 2013. január Elektromágneses hullám Transzverzális hullám elektromos térerősségvektor hullámhossz E B x mágneses térerősségvektor
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL Az egyes biomolekulák izolálása kulcsfontosságú a biológiai szerepük tisztázásához. Az affinitás kromatográfia egyszerűsége, reprodukálhatósága
Biomolekulák nanomechanikája A biomolekuláris rugalmasság alapjai
Fogorvosi Anyagtan Fizikai Alapjai Biomolekulák nanomechanikája A biomolekuláris rugalmasság alapjai Mártonfalvi Zsolt Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Semmelweis Egyetem Budapest Biomolekulák mint
transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
Az aktin kölcsönhatása forminnal: EPR és DSC vizsgálatok
Ph.D. értekezés tézisei Az aktin kölcsönhatása forminnal: EPR és DSC vizsgálatok Horváth-Kupi Tünde Témavezetők: Dr. Nyitrai Miklós Dr. Belágyi József Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar
Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)
Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Gerjesztés A gerjesztett állapotú elektron lecsengési lehetőségei Fluoreszcencia 10-9 s k f Foszforeszcencia 10-3 s k ph 10-15 s Fizika-Biofizika 2. Huber
Kötések kialakítása - oktett elmélet
Kémiai kötések Az elemek és vegyületek halmazai az atomok kapcsolódásával - kémiai kötések kialakításával - jönnek létre szabad atomként csak a nemesgázatomok léteznek elsődleges kémiai kötések Kötések
Abszorpciós fotometria
A fény Abszorpciós fotometria Ujfalusi Zoltán PTE ÁOK Biofizikai ntézet 2011. szeptember 15. E B x x Transzverzális hullám A fény elektromos térerősségvektor hullámhossz Az elektromos a mágneses térerősség
Fehérjék nyomás által indukált szerkezetváltozásainak jellemzése infravörös és fluoreszcencia spektroszkópiai módszerekkel
Fehérjék nyomás által indukált szerkezetváltozásainak jellemzése infravörös és fluoreszcencia spektroszkópiai módszerekkel Doktori tézisek Somkuti Judit Semmelweis Egyetem Elméleti Orvostudományok Doktori
MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak Egy átlagos emberben 10-12 kg fehérje van, mely elsősorban a vázizomban található.
11.3. Az Achilles- ín egy olyan rugónak tekinthető, amelynek rugóállandója 3 10 5 N/m. Mekkora erő szükséges az ín 2 mm- rel történő megnyújtásához?
Fényemisszió 2.45. Az elektromágneses spektrum látható tartománya a 400 és 800 nm- es hullámhosszak között található. Mely energiatartomány (ev- ban) felel meg ennek a hullámhossztartománynak? 2.56. A
TERMELÉSÉLETTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt
Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0010 projekt TERMELÉSÉLETTAN Debreceni Egyetem Nyugat-magyarországi Egyetem Pannon Egyetem A projekt az Európai Unió támogatásával,
Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015
Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015 A kérdés 1. A sejtről általában, a szervetlen alkotórészeiről, a vízről részletesen. 2. A sejtről általában, a szervetlen alkotórészeiről,
A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA BIOENERGETIKA I. 1. kulcsszó cím: Energia A termodinamika első főtétele kimondja, hogy a különböző energiafajták átalakulhatnak egymásba ez az energia megmaradásának
ahol m-schmid vagy geometriai tényező. A terhelőerő növekedésével a csúszó síkban fellép az un. kritikus csúsztató feszültség τ
Egykristály és polikristály képlékeny alakváltozása A Frenkel féle modell, hibátlan anyagot feltételezve, nagyon nagy folyáshatárt eredményez. A rácshibák, különösen a diszlokációk jelenléte miatt a tényleges
Elektronegativitás. Elektronegativitás
Általános és szervetlen kémia 3. hét Elektronaffinitás Az az energiaváltozás, ami akkor következik be, ha 1 mól gáz halmazállapotú atomból 1 mól egyszeresen negatív töltésű anion keletkezik. Mértékegysége:
Elektronspin rezonancia
Elektronspin rezonancia jegyzıkönyv Zsigmond Anna Fizika MSc I. Mérés vezetıje: Kürti Jenı Mérés dátuma: 2010. november 25. Leadás dátuma: 2010. december 9. 1. A mérés célja Az elektronspin mágneses rezonancia
Lépésről lépésre egy molekuláris motor működésének kinetikai megközelítése
Lépésről lépésre egy molekuláris motor működésének kinetikai megközelítése Doktori (Ph. D.) értekezés Kovács Mihály Témavezető: Dr. Nyitray László Külső témavezetők: Prof. Clive R. Bagshaw, Dr. Málnási-Csizmadia
Tropomiozin és nehéz meromiozin hatása a formin által nukleált aktin filamentumok flexibilitására
Tropomiozin és nehéz meromiozin hatása a formin által nukleált aktin filamentumok flexibilitására Ujfalusi Zoltán Témavezető: PROF. DR. N YITRAI MIKLÓS Doktori iskola: I n t e r d i s z c i p l i n á r
Kémiai kötések. Kémiai kötések. A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011
Kémiai kötések A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011 1 Cl + Na Az ionos kötés 1. Cl + - + Na Klór: 1s 2 2s 2 2p 6 3s 2 3p 5 Kloridion: 1s2 2s2 2p6 3s2 3p6 Nátrium: 1s 2 2s
E (total) = E (translational) + E (rotation) + E (vibration) + E (electronic) + E (electronic
Abszorpciós spektroszkópia Abszorpciós spektrofotometria 29.2.2. Az abszorpciós spektroszkópia a fényabszorpció jelenségét használja fel híg oldatok minőségi és mennyiségi vizsgálatára. Abszorpció Az elektromágneses
Szakértesítő 1 Interkerám szakmai füzetek A folyósító szerek viselkedése a kerámia anyagokban
Szakértesítő 1 Interkerám szakmai füzetek A folyósító szerek viselkedése a kerámia anyagokban A folyósító szerek viselkedése a kerámia anyagokban Bevezetés A kerámia masszák folyósításkor fő cél az anyag
LABORATÓRIUMI PIROLÍZIS ÉS A PIROLÍZIS-TERMÉKEK NÉHÁNY JELLEMZŐJÉNEK VIZSGÁLATA
LABORATÓRIUMI PIROLÍZIS ÉS A PIROLÍZIS-TERMÉKEK NÉHÁNY JELLEMZŐJÉNEK VIZSGÁLATA TOLNERLászló -CZINKOTAImre -SIMÁNDIPéter RÁCZ Istvánné - SOMOGYI Ferenc Mit vizsgáltunk? TSZH - Települési szilárd hulladék,
5. Laboratóriumi gyakorlat
5. Laboratóriumi gyakorlat HETEROGÉN KÉMIAI REAKCIÓ SEBESSÉGÉNEK VIZSGÁLATA A CO 2 -nak vízben történő oldódása és az azt követő egyensúlyra vezető kémiai reakció az alábbi reakcióegyenlettel írható le:
Az izomműködés élettana
Az izomműködés élettana 1./11 Somogyi Magdolna Az izomszövet kontraktilis szövet Az izomműködés élettana Tipikus működése szerint összehúzódásra és elernyedésre képes Ennek eredményeként mozgatható a test
Átmenetifém-komplexek ESR-spektrumának jellemzıi
Átmenetifém-komplexek ESR-spektrumának jellemzıi A párosítatlan elektron d-pályán van. Kevéssé delokalizálódik a fémionról, a fém-donoratom kötések meglehetısen ionos jellegőek. A spin-pálya csatolás viszonylag
Készítette: NÁDOR JUDIT. Témavezető: Dr. HOMONNAY ZOLTÁN. ELTE TTK, Analitikai Kémia Tanszék 2010
Készítette: NÁDOR JUDIT Témavezető: Dr. HOMONNAY ZOLTÁN ELTE TTK, Analitikai Kémia Tanszék 2010 Bevezetés, célkitűzés Mössbauer-spektroszkópia Kísérleti előzmények Mérések és eredmények Összefoglalás EDTA
Modern Fizika Labor. A mérés száma és címe: A mérés dátuma: Értékelés: Infravörös spektroszkópia. A beadás dátuma: A mérést végezte:
Modern Fizika Labor A mérés dátuma: 2005.10.26. A mérés száma és címe: 12. Infravörös spektroszkópia Értékelés: A beadás dátuma: 2005.11.09. A mérést végezte: Orosz Katalin Tóth Bence 1 A mérés során egy
Modern Fizika Labor. 17. Folyadékkristályok
Modern Fizika Labor Fizika BSc A mérés dátuma: 2011. okt. 11. A mérés száma és címe: 17. Folyadékkristályok Értékelés: A beadás dátuma: 2011. okt. 23. A mérést végezte: Domokos Zoltán Szőke Kálmán Benjamin
TRANSZPORTFOLYAMATOK A SEJTEKBEN
16 A sejtek felépítése és mûködése TRANSZPORTFOLYAMATOK A SEJTEKBEN 1. Sejtmembrán elektronmikroszkópos felvétele mitokondrium (energiatermelõ és lebontó folyamatok) citoplazma (fehérjeszintézis, anyag
1D multipulzus NMR kísérletek
D multipulzus NMR kísérletek Rohonczy János ELTE, Szervetlen Kémia Tanszék Modern szerkezetkutatási módszerek elıadás 202. . Protonlecsatolt heteronukleáris mérések Elv 3 C mag detektálása alatt a protoncsatornán
A nukleotidok és az aktinkötő fehérjék szerepe az aktin funkcionális konformációváltozásaiban
Ph.D. értekezés A nukleotidok és az aktinkötő fehérjék szerepe az aktin funkcionális konformációváltozásaiban Türmer Katalin Erzsébet Témavezetők: Prof. Dr. Nyitrai Miklós Prof. Dr. Belágyi József Pécsi
Nukleinsavak építőkövei
ukleinsavak Szerkezeti hierarchia ukleinsavak építőkövei Pirimidin Purin Pirimidin Purin Timin (T) Adenin (A) Adenin (A) Citozin (C) Guanin (G) DS bázisai bázis Citozin (C) Guanin (G) RS bázisai bázis
Egy idegsejt működése. a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál
Egy idegsejt működése a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál Nyugalmi potenciál Az ionok vándorlása 5. Alacsonyabb koncentráció ioncsatorna membrán Passzív Aktív 3 tényező határozza
Modern Fizika Labor. 12. Infravörös spektroszkópia. Fizika BSc. A mérés dátuma: okt. 04. A mérés száma és címe: Értékelés:
Modern Fizika Labor Fizika BSc A mérés dátuma: 011. okt. 04. A mérés száma és címe: 1. Infravörös spektroszkópia Értékelés: A beadás dátuma: 011. dec. 1. A mérést végezte: Domokos Zoltán Szőke Kálmán Benjamin
Sillabusz orvosi kémia szemináriumokhoz 1. Kémiai kötések
Sillabusz orvosi kémia szemináriumokhoz 1. Kémiai kötések Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar 2010-2011. 1 A vegyületekben az atomokat kémiai kötésnek nevezett erők tartják össze. Az elektronok
A kvantummechanika kísérleti előzményei A részecske hullám kettősségről
A kvantummechanika kísérleti előzményei A részecske hullám kettősségről Utolsó módosítás: 2016. május 4. 1 Előzmények Franck-Hertz-kísérlet (1) A Franck-Hertz-kísérlet vázlatos elrendezése: http://hyperphysics.phy-astr.gsu.edu/hbase/frhz.html
Az izomkontrakció szabályozása molekuláris szinten
Az izomkontrakció szabályozása molekuláris szinten Szakdolgozat Biológia alapszak, Biológus szakirány Készítette: RÁTI SZILVIA MARIANNA Témavezető: NYITRAY LÁSZLÓ, PhD, habil., DSc - Tanszékvezető Biokémia
Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól
Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól Kele Péter egyetemi adjunktus Lumineszcencia jelenségek Biolumineszcencia (biológiai folyamat, pl. luciferin-luciferáz) Kemilumineszcencia
a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál. Nyugalmi potenciál. 3 tényező határozza meg:
Egy idegsejt működése a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Nyugalmi potenciál Az ionok vándorlása 5. Alacsonyabb koncentráció ioncsatorna membrán Passzív Aktív 3 tényező határozza meg: 1. Koncentráció
Fehérjeszerkezet, és tekeredés
Fehérjeszerkezet, és tekeredés Futó Kinga 2013.10.08. Polimerek Polimer: hasonló alegységekből (monomer) felépülő makromolekulák Alegységek száma: tipikusan 10 2-10 4 Titin: 3,435*10 4 aminosav C 132983
A glükóz reszintézise.
A glükóz reszintézise. A glükóz reszintézise. A reszintézis nem egyszerű megfordítása a glikolízisnek. A glikolízis 3 irrevezibilis lépése más úton játszódik le. Ennek oka egyrészt energetikai, másrészt
Műszeres analitika II. (TKBE0532)
Műszeres analitika II. (TKBE0532) 7. előadás NMR spektroszkópia Dr. Andrási Melinda Debreceni Egyetem Természettudományi és Technológiai Kar Szervetlen és Analitikai Kémiai Tanszék NMR, Nuclear Magnetic
