Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak. dr. Kiss Erzsébet. SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar Genetika és Biotechnológiai Intézet

Méret: px

Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak. dr. Kiss Erzsébet. SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar Genetika és Biotechnológiai Intézet"

Erika Dudásné
7 évvel ezelőtt
Látták:

1 Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak dr. Kiss Erzsébet SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar Genetika és Biotechnológiai Intézet

2 Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Szakvezető Dr. Kiss Erzsébet egyetemi tanár Szakvezető-helyettes Dr. Veres Anikó egyetemi docens

3 Genetika és Biotechnológiai Intézet Igazgató Dr. Varga László Egyetemi docens Titkár Katona Melinda

4 Genetika és Biotechnológiai Intézet Telefonszám /1691 Fax

5 Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Alapítás 2006 Dr. Heszky László MTA rendes tagja Genetika és Biotechnológiai Intézet akkori igazgatója

6 Genetika és Biotechnológiai Intézet A hazai nemesítő utánpótlás képzésének meghatározó bázisa; Három fő diszciplina oktatásának felelőse: Genetika Növénynemesítés Növénybiotechnológa

7 Genetika és Biotechnológiai Intézet Elsőként indított Magyarországon mezőgazdasági biotechnológus mesterképzést 2008-ban Nappali és levelező tagozaton Ez a mesterszak- az országban egyedülállóan két szakirányt foglal magában: növénybiotechnológia és állatbiotechnológia szakirányokat.

8 Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Hallgatószáma jelenleg 52 fő 49 fő diplomázott eddig Az Agricultural Biotechnology angol nyelvű MSc szakot külföldi hallgatókkal (12 fő) 2012-ben indította a genetika és Biotechnológiai Intézet. 14 új hallgató 2014-ben

9 A Mg. Biotech. MSc Szakon két szakirány között lehet választani Növénybiotechnológia Állatbiotechnológia

10 Program 1. félév: azonos tantárgyak 2. félév: szakirány-választás / diplomamunka 2-4. félév közös és szakirány-specifikus tantárgyak

11 Diplomamunka Saját kísérletek! Ízelítő a választható témákból Gyujtoványfű, cickafark, imola és csodatölcsér fajok molekuláris vizsgálata taxonómiai pontosítás céljából Az Orange gén öröklődése karalábé és karfiol hibridpopulációkban Emlős embriók in vitro előállítása vágóhídról származó petesejtekből Transzpozon alapú transzgenezissel előállított transzgénikus nyulak molekuláris jellemzése

12 Mikrobiológiai témát is lehet választani Szakirány -választás Az 1. szemeszter végén!

13 Molekuláris markerek alkalmazása szántóföldi és kertészeti növények nemesítésében Kiss E., Gyulai G., Veres A., Szőke A., Tóth-Lencsés K., Kerekes A., Heszky L.

14 Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Ízelítő a diplomamunka- témákból korábbi dolgozatok és publikációk alapján

15 Molekuláris markerek alkalmazása Genotipizálás Pedigré elemzés Hibridazonosítás Kapcsolt markerek

16 Miért van szükség a genotipizálásra? Nem elegendő a morfológiai összehasonlítás?

17 Perenne évelő rozs

18 Kárpát-medencei szőlőfajták mikroszatellit elemzése

19 Szőlő fajták összehasonlító elemzése mikroszatellit /SSR primerekkel

20 SSR allél adatok átalakítása vonalkóddá

21 MAGYAR SZŐLŐ MIKROSZATELLIT / SSR ADATBÁZIS HUNGARIAN VITIS MICROSATELLITE / SSR DATABASE KISS, Erzsébet; HALÁSZ, Gábor; *KOZMA, Pál; HESZKY, László Szent István Egyetem, Genetika és Növénynemesítés Tanszék Szent István University, Department of Genetics and Plant Breeding H-2103, Gödöllő, Magyarország / Hungary *FVM Szőlészeti és Borászati Kutatóintézet (FVM-SZBKI) Institute for Viticulture and Enology H-7634, Pécs, Magyarország / Hungary Primerek / Primers: Fajták / Varieties: A-B - C-CS - D-E - É-F - G-H - I-J - K - L- M - N-NY - O-Ó - Ö-Ő - P-Q - R-S - SZ-T - U-Ú - Ü-Ű - V-Z - ZS List of Varieties / Teljes fajtalista

22 European Vitis Database: közel fajta/klón mikroszatellit/ssr és ampelográfiai adata 259 magyarországi fajta/klón

23 European Vitis Database N-coded SSR values in 9 loci Accession name Allél_1 Allél_2 HUN045-P14#30 - APROFEHÉR N+8 N+18 HUN045-P14#49 - AGASFARK N+8 N+8 HUN045-P14#60 - BAJOR, KÉK N+8 N+8 HUN045-P14#61 - BAJOR, SZÜRKE N+8 N+8 HUN045-P14#62 - BAKARKA N+18 N+18 HUN045-P14#63 - BAKATOR, KÉK N+8 N+18 HUN045-P14#64 - BAKATOR, PIROS N+8 N+22 HUN045-P14#65 - BAKATOR, PIROS TÜDOSZINU * N+8 N+22 HUN045-P14#66 - BAKSZEM N+16 N+22 HUN045-P14#68 - BALAFANT N+18 N+18

24 Almafajták mikroszatellit mintázata és allélmérete a CH03G07 primerpárral

25 CULTIVARS CH03g07 CH04g10 CH04e03 CH05c02 CH05d11 CH05e03 Ozark Gold JerseyMac Piros Gala Pioana Gloster Julyred Wellspur Delicious Judeline Jonagold Jonathan Pinova kereskedelmi és 38 tájfajta Mutsu Akane Sampion Charden Jonager Summerred Goldstar Golden Delicious Angold Granny Smith Kró óriás Liberty Mizsei Reglindis Sir Prize Red Stayman Rewena Rubinola Braeburn Rajka Idared Fuji Florina Prima Elstar Remo Red Rome Van Well Topaz Pink Lady Relinda Greensleeves Reanda Pilot Fiesta

26 Dinnye genotipizálás

Szamócafajták molekuláris összehasonlítása RAPD M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11

27 Szamócafajták molekuláris összehasonlítása RAPD M M 3000 OPE AP-PCR WFRVC Génspecifikus Adh 1f/ Adh1r

28 Diploid, oktoploid szamóca fajták SSR adatai Fajta Fragaria vesca Rügen F. ananassa Hakras romata F. ananassa Avalon classique SSR / UDF-004 (bp) 133: : :131:137 F. ananassa Frapendula F. ananassa Fertődi 5 F. ananassa Gorella 125:129:143: :127:129:133: :129:133:139:143:149

Repce genotipizálás SSR markerekkel GKH 724

29 Repce genotipizálás SSR markerekkel GKH :166:174:192 TPES 7 166:192 TPR :174 Tetraploiditás repcében

30 Származás, pedigré Szőlő Alma Évelő rozs

31 Az SSR allélek méretezése /ALF-Express/

32 Lokusz Izsáki Mátrai muskotály Ottonel muskotály SSR allélek méretei bpban Scu08vv 185: : :185 Scu10vv 208: : :214 VVMD21 244: : :267 VVMD36 254: : :276 ssvrzag62 191: : :197 ssvrzag64 139: : :161 ssvrzag79 240: : :262 ssvrzag83 197: : :203 ssvrzag : : :245 VVMD5 226: : :228 VVMD7 242: : :246 VVMD32 258: : :266 ssvrzag21 208: : :208 Vmc4f3 170: : :204 VVMD28 234: : :269 VVMD31 206: : :210 VMC4c6 157: : :163 VMC4g6 123: : :135 VVS2 143: : :143

SSR lokusz Leányka Királyleányka Scu10vv 202:208

244:250 VVMD36 266:276 254:266 VrZag64 161:165

33 SSR lokusz Leányka Királyleányka Scu10vv 202: :214 Scu08vv 185: :185 VVMD21 250: :250 VVMD36 266: :266 VrZag64 161: :161 VrZag79 240: :254 VrZag62 195: :207

34 X Seyve-Villard Csabagyöngye NEM! Zalagyöngye

35 Perenne évelő rozs

36 Kapcsolt markerek Ivar kender Rezisztencia Paradicsom: nematóda Szőlő: lisztharmat és peronoszpóra Hímsterilitás repce Szín Karfiol: rózsa Szőlő: bogyó

37 Ivarspecifikus marker fejlesztése RAPD fragmentumból kenderben

38 Nematóda rezisztens paradicsom genotípusok azonosítása molekuláris markerekkel Rezisztens és fogékony genotípusok domináns markerrel A heterozigóta és homozigóta rezisztens genotípusok megkülönböztetése CAPS markerrel Restrikciós emésztés után a homozigóta és a heterozigóta rezisztens genotípusok elkülöníthetőek

39 RUN1, REN1 lisztharmat rezisztenciagénekkel kapcsolt SSR markerek alkalmazása szelekcióra Egyszeres PCR Multiplex PCR

40 A RUN1 gén jelenlétét a (RUN1+ növényeket) a 160 bp méretű csúcs jelzi 95 bp méretű külső, ill. belső sandard 275 bp méretű külső, ill. belső standard A BC 4, a Kismis vatkana (szülők) és érzékeny fajta (Cardinal) alléljei a VMC8g9 markerrel R: Run1+ Sz: run1-

Multiplex PCR 4%-os Metaphor agarózon (BMA) elválasztva 286 bp 286 bp 286 bp VMC9h4.2 160 bp 160 bp 160 bp VMC8g9 2.

41 Multiplex PCR 4%-os Metaphor agarózon (BMA) elválasztva 286 bp 286 bp 286 bp VMC9h bp 160 bp 160 bp VMC8g9 2. Kismis vatkana: Run1-/Ren1+ 3. BC4: Run+/Ren1-, Az utódpopuláció egyedei 601: Run1-/Ren1-90: Run1+/Ren1+, 6: Run1+/Ren1-, 36: Run1-/Ren1+

42 Hímsterilitás Csak a hímsteril növényekben jelenik meg a 278 bp fragmentum

43 Színes karfiol

44 Kárpát-medencei bogyószín variánsok Lisztes piro Lisztes fehér Bakator piros Bakator tüdőszínű Gohér piros Gohér fehér Gohér változó Piros Sárga muskotály muskotály Csíkos muskotály Furmint piros Furmint fehér

45 Antocyanin biosynthesis White berried grapes No UFGT expression Reason: Gret-1 insertion into the promoter of VvMybA1 transcription factor gene SNP a VvMybA2 kódoló szekvenciában

46 VvMybA1 allél-variációk VvMybA1a VvMybA1b VvMybA1c M: MW marker, 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Lisztes piros, 5. Lisztes fehér, 6. Bakator piros, 7. Bakator tüdőszínű, 8. Gohér piros, 9. Gohér fehér, 10. Gohér változó, 11. Piros muskotály, 12. Fekete muskotály, 13. Sárga muskotály, 14. Csíkos muskotály, 15. Furmint piros, 16. Furmint fehér, 17. Furmint változó, 18. Kék barátcsuha, 19. Szürke barátcsuha

47 20D18CB9 marker VvMybA1 linked CAPS marker M: molecular weight m., 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Bakator piros, 5. Bakator tüdőszínű, 6. Gohér piros, 7. Gohér fehér, 8. Gohér változó, 9. Sárga muskotály, 10. Csíkos muskotály, 11. Furmint fehér, 12. Furmint változó, 13. Kék barátcsuha, 14. Szürke barátcsuha PCR product 329 bp 329 bp 248 bp 248 bp 213 bp 329 bp 213 bp 329 bp 248 bp 329 bp 213 bp DdeI digestion

Munkatársak, együttműködők SZIE GBI Heszky László Gyulai Gábor Szőke Antal Veres Anikó Galli Zsolt Galbács Zsuzsanna Halász Gábor Katuláné Debreceni Diána Kerti Balázs Kovács László Lencsés Andrea

48 Munkatársak, együttműködők SZIE GBI Heszky László Gyulai Gábor Szőke Antal Veres Anikó Galli Zsolt Galbács Zsuzsanna Halász Gábor Katuláné Debreceni Diána Kerti Balázs Kovács László Lencsés Andrea Kitti Molnár Stella Pilinszky Katalin Wichmann Barnabás PTE SZBI Kozma Pál Hoffmann Sarolta GK Kht Falusi János Gyümölcskutató Fertőd Dénes Ferenc Proplant Kft Dánszentmiklós Sipos Elvíra Lehoczky Péter Gyümölcskutató Újfehértó Szabó Tibor Inántsy Ferenc MGSZH Budapest Pernesz György Harangozó Tamás

49 Köszönöm a figyelmet!

Hasonló dokumentumok

A SZIE, MKK GENETIKA ÉS BIOTECHNOLÓGIAI INTÉZETÉNEK EREDMÉNYEI A NÖVÉNYNEMESÍTÉS TUDOMÁNYOKBAN ÉS A NEMESÍTÉS UTÁNPÓTLÁS NEVELÉSBEN

A SZIE, MKK GENETIKA ÉS BIOTECHNOLÓGIAI INTÉZETÉNEK EREDMÉNYEI A NÖVÉNYNEMESÍTÉS TUDOMÁNYOKBAN ÉS A NEMESÍTÉS UTÁNPÓTLÁS NEVELÉSBEN Heszky László és Kiss Erzsébet Keszthely 2013 PARADIGMAVÁLTÁS AZ ÉLETTUDOMÁNYOKBAN