Nukleinsav bázis-származékok és modellpeptidek szerkezetének és önszerveződésének vizsgálata

Átírás

1 TÉMA ÉRTÉKELÉS TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KMR (minden téma külön lapra) június május Az elemi téma megnevezése Nukleinsav bázis-származékok és modellpeptidek szerkezetének és önszerveződésének vizsgálata 2. A témavezető (neve, intézet, tanszék) Tarczay György, ELTE Kémiai Intézet, Molekulaspektroszkópiai Laboratórium 3. A téma oktatói-kutatói résztvevői az ELTÉ-ről (név, intézet, tanszék): Magyarfalvi Gábor, Vass Elemér, ELTE Kémiai Intézet, Molekulaspektroszkópiai Laboratórium 4. Hazai és nemzetközi együttműködők (személyek, intézmények, szerződések): informális együttműködés: Kamarás Katalin, MTA Wigner Fizikai Kutatóközpont, Szilárdtest-fizikai és Optikai Intézet 1

2 5. A témában elért eredmények (lehetőleg max karakter, szóközökkel együtt): - Szimuláltuk a citozin mátrixizolációs UV spektrumát a mátrixizolációs IR spektrumok konformációs-analíziséből adódó konformerarányok, és magas szintű EOMCC számítások segítségével. Megállapítottuk, hogy három tautomer jelenlétével számolva a szimulációk jól visszaadják a mért spektrumokat. - Uracilszármazékok mátrixizolációs és szilárd fázisú IR spektrumát vettük fel és értelmeztük. Vizsgáltuk a vegyületek önszerveződését, intermolekuláris hidrogénhidakat, valamint ezek hőmérsékletfüggését. - Nagymolekulák rezgési spektrumának számításához SQM skálafaktorokat határoztunk meg négyféle funkcionálra és kétféle bázisra. - A kiralitás transzfer jelenségének tanulmányozására, illetve a szolvatáció és a dimerképzés VCD spektrumokra gyakorolt hatásának jobb megértése érdekében felvettük királis karbonsavak monomereinek és dimereinek, valamint akirális karbonsavakkal alkotott dimereinek VCD spektrumát oldatokban és számítások segítségével értelmeztük ezeket. - Szelektív, közeli IR lézersugárzással által kiváltott konformációváltozásokat figyeltünk meg alacsony hőmérsékletű mátrixokban a klór-propionsav és a glicin esetében. Mindkét esetben a nagyenergiájú konformerek - egyes enzimreakciók esetében is fontos szerepet játszó - alagúthatással történő visszaalakulásának kinetikáját is vizsgáltuk. 6. A témáról írt közlemények (a formátum egyezzen meg a TÁMOP publikációs adatbázis formátumával - 2

3 G. Bazsó, G. Tarczay, G. Fogarasi, P. G. Szalay Tautomers of cytosine and their excited electronic states: a matrix isolation spectroscopic and quantum chemical study Phys. Chem. Chem. Phys. 13, 6799 (2011) DOI: S. Góbi, E. Vass, G. Magyarfalvi, G. Tarczay Effects of strong and weak hydrogen bond formation on VCD spectra: a case study of 2- chloropropionic acid Phys. Chem. Chem. Phys. (Weak Hydrogen Bonds - Strong Effects? Special Issie) 13, (2011) DOI: C. Fábri, T. Szidarovszky, G. Magyarfalvi, G. Tarczay Gas-Phase and Ar-Matrix SQM Scaling Factors for Various DFT Functionals with Basis Sets Including Polarization and Diffuse Functions J. Phys. Chem. A 115, 4640 (2011) DOI: Z. Szekrényes, K. Kamarás, G. Tarczay, A. Llanes-Pallas, T. Marangoni, M. Prato, D. Bonifazi, J. Björk, F. Hanke, M. Persson Melting of Hydrogen Bonds in Uracil Derivatives Probed by Infrared Spectroscopy and ab Initio Molecular Dynamics J. Phys. Chem. B 116, 4626 (2012) DOI: G. Bazsó, S. Góbi, G. Tarczay Near-Infrared Radiation Induced Conformational Change and Hydrogen Atom Tunneling of 2- Chloropropionic Acid in Low-Temperature Ar Matrix J. Phys. Chem. A 116, 4823 (2012) DOI: S. Góbi S, G. Magyarfalvi Reliability of computed signs and intensities for vibrational circular dichroism spectra. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011;13(36):16130 DOI: G. Bazsó, G. Magyarfalvi, G. Tarczay Near-Infrared Laser Induced Conformational Change and UV Laser Photolysis of Glycine in Low-Temperature Matrices: Observation of a Short-Lived Conformer J. Mol. Struct. (Light-Induced Processes in Cryogenic Matrices Special Issue) nyomtatásban (2012) DOI: 3

4 7. A téma eredményeinek közzététele konferencián (a formátum egyezzen meg a TÁMOP publikációs adatbázis formátumával - Előadó: Tarczay György (Tarczay György, Góbi Sándor, Magyarfalvi Gábor, Vass Elemér) Konferencia előadás - Rezgési optikai aktivitás - abszolút konfiguráció meghatározása és konformáció analízis Megjelenés: MTA Kémiai Tudományok Osztálya NMR Munkabizottsága MKE Analitikai Szakosztály NMR Szakcsoportja évi munkabizottsági ülés, Baltonszemes, nov URL: Megjelenés: A Magyar Tudományos Akadémia Kémiai Tudományok Osztálya A GYÓGYSZERKUTATÁS MŰSZERES MÓDSZEREI -ről tartott ünnepi tudományos ülése, MTA Székház, Nagyterem, Budapest V., Széchenyi István tér 9. II em., május 9. URL: Előadó: Bazsó Gábor (G. Bazsó, G. Tarczay, G. Fogarasi, P. G. Szalay): Tautomers of cytosine and their excited electronic states: a matrix isolation spectroscopic and quantum chemical study Megjelenés: The 66th OSU International Symposium on Molecular Spectroscopy, Columbus, Ohio, 2011, Június URL: Előadó: Góbi Sándor (Góbi Sándor, Vass Elemér, Magyarfalvi Gábor, Tarczay György): Klasszikus és nemklasszikus hidrogénkötésű komplexek kialakulásának hatása a 2-klórpropionsav VCD spektrumára Megjelenés: Az MTA Szervetlen és Fémorganikus Kémiai Munkabizottságának és a MTA Anyag- és Molekulaszerkezeti Munkabizottságának közös ülése, Demjén, 2011, március URL: 8. A téma eredményeinek közzététele ismeretterjesztő előadás, cikk, riport formájában (címe, helye, időpontja): 4

5 9. Felhasznált eszközök (kísérleti munka esetén): TÁMOP támogatásból beszerzett műszer nem került felhasználásra (Egyéb: mátrixizolációs berendezések, IR, UV és VCD spektrométerek, számítógép-klaszter) 10. A téma kapcsán bejelentett szabadalom: 11. Hallgatói részvétel a témában, doktorandusz hallgató (név, megvédett doktori disszertáció, szerző neve, témavezető, cím, védés dátuma. (Ha a beadás és védés a nyári hónapokra esik, akkor azt jelezni kell, és még értékelhető): Góbi Sándor, Bazsó Gábor 12. Hallgatói részvétel a témában, MSc és BSc részvevő hallgató (név, megvédett diplomamunka, szerző neve, témavezető, cím, dátum): 13. Eredményes TDK dolgozat: (szerző neve, témavezető, cím, dátum, eredmény): 14. A témára dedikáltan fordított támogatás teljes összege a témavezető saját nyilvántartása (ennek hiányában becslése) szerint (személyi költségek, utazások, konferencia részvétel, stb.): eft, vagy becsült: 1559 eft (többlet feladatra személyi kifizetés) 15. Megjegyzés, vélemény (a témavezető véleménye a pályázati munkáról, annak hasznosságáról és eredményességéről, a pályázati menedzsment munkájáról, a fenntarthatóságról, javaslatok a jövőre vonatkozóan stb.) Elképesztő, idióta bürokrácia. 5