ENZIMSZINTŰ SZABÁLYOZÁS

Hasonló dokumentumok
VEBI BIOMÉRÖKI MŰVELETEK KÖVETELMÉNYEK. Pécs Miklós: Vebi Biomérnöki műveletek. 1. előadás: Bevezetés és enzimkinetika

VEBI BIOMÉRÖKI MŰVELETEK

mérnöki tudományok biomérnöki vegyészmérnöki tudomány tudományok biotechno- lógia kémia biológia

Vegyipari és BIOMÉRNÖKI műveletek

BIOTECHNOLÓGIA - BIOMÉRNÖKSÉG. Vegyipari és BIOMÉRNÖKI műveletek. BIOMÉRNÖKI műveletek. Pécs Miklós: Biomérnöki műveletek 1. Bevezetés, enzimek

Az enzimműködés termodinamikai és szerkezeti alapjai

A glükóz reszintézise.

Fehérjék. SZTE ÁOK Biokémiai Intézet

A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.

Glikolízis. emberi szervezet napi glukózigénye: kb. 160 g

[S] v' [I] [1] Kompetitív gátlás

Reakciókinetika és katalízis

Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

BIOKÉMIA GYAKORLÓ TESZT 1. DEMO (FEHÉRJÉK, ENZIMEK, TERMODINAMIKA, SZÉNHIDRÁTOK, LIPIDEK)

A piruvát-dehidrogenáz komplex. Csala Miklós

Nem kell az egész tankönyvet megtanulni! Biomérnöki műveletek és folyamatok Környezetmérnöki MSc. 1. előadás: Enzimmérnöki alapok

Az enzimek katalitikus aktivitású fehérjék. Jellemzőik: bonyolult szerkezet, nagy molekulatömeg, kolloidális sajátságok, alakváltozás, polaritás.

Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

ZSÍRSAVAK OXIDÁCIÓJA. FRANZ KNOOP német biokémikus írta le először a mechanizmusát. R C ~S KoA. a, R-COOH + ATP + KoA R C ~S KoA + AMP + PP i

TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL

Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

A felépítő és lebontó folyamatok. Biológiai alapismeretek

TRANSZPORTFOLYAMATOK A SEJTEKBEN

Enzimaktivitás szabályozása

Szerkesztette: Vizkievicz András

A fehérjék harmadlagos vagy térszerkezete. Még a globuláris fehérjék térszerkezete is sokféle lehet.

Országos Középiskolai Tanulmányi Verseny 2010/2011. tanév Kémia I. kategória 2. forduló Megoldások

Mária. A pirimidin-nukleotidok. nukleotidok anyagcseréje

A felvétel és a leadás közötti átalakító folyamatok összességét intermedier - köztes anyagcserének nevezzük.

ENZIMKINETIKAI PARAMÉTEREK KÍSÉRLETI MEGHATÁROZÁSA

Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

Több szubsztrátos enzim-reakciókról beszélve két teljesen különbözõ rekció típust kell megismernünk.

Az sejt gépei az enzimek. Az enzimek ezt az aktivációs energiagátat csökkentik.

Kémiai átalakulások. A kémiai reakciók körülményei. A rendszer energiaviszonyai

BIOMOLEKULÁK KÉMIÁJA. Novák-Nyitrai-Hazai

ALLOSZTÉRIKUSAN SZABÁLYOZÓ METABOLITOK HATÁSA A PIRUVÁT-KINÁZ L és M IZOENZIMRE

Katalízis. Tungler Antal Emeritus professzor 2017

Növényélettani Gyakorlatok A légzés vizsgálata

Mikrobák táplálkozása, anyagcseréje

Tartalmi követelmények kémia tantárgyból az érettségin K Ö Z É P S Z I N T

Glikolízis. Csala Miklós

Kutatási programunk fő célkitűzése, az 2 -plazmin inhibitornak ( 2. PI) és az aktivált. XIII-as faktor (FXIIIa) közötti interakció felderítése az 2

09. A citromsav ciklus

Kémiai kötések. Kémiai kötések kj / mol 0,8 40 kj / mol

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

A METABOLIZMUS ENERGETIKÁJA

Osztályozó vizsgatételek. Kémia - 9. évfolyam - I. félév

Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus. Az energiaközvetítő molekula: ATP

ENZIM MODULÁCIÓ BIM SB 2001

ENZIMKINETIKAI PARAMÉTEREK KÍSÉRLETI MEGHATÁROZÁSA

Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015

Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak 8. hét

Reakciókinetika. Általános Kémia, kinetika Dia: 1 /53

c A Kiindulási anyag koncentrációja c A0 idő t 1/2 A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011

Intelligens molekulákkal a rák ellen

4. változat. 2. Jelöld meg azt a részecskét, amely megőrzi az anyag összes kémiai tulajdonságait! A molekula; Б atom; В gyök; Г ion.

Kinetika. Általános Kémia, kinetika Dia: 1 /53

Kémiai reakciók sebessége

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI A LIPIDEK 1. kulcsszó cím: A lipidek szerepe az emberi szervezetben

,:/ " \ OH OH OH / \ O / H / H HO-CH, O, CH CH - OH ,\ / "CH - ~(H CH,-OH \OH. ,-\ ce/luló z 5zer.~ezere

AMINOSAVAK, FEHÉRJÉK

A légzési lánc és az oxidatív foszforiláció

transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék

Kémiai átalakulások. A kémiai reakciók körülményei. A rendszer energiaviszonyai

Farmakológus szakasszisztens Farmakológus szakasszisztens 2/34

A biokémiai folyamatokat enzimek (biokatalizátorok) viszik véghez. Minden enzim. tartalmaz fehérjét. Két csoportjukat különböztetjük meg az enzimeknek

Acetil-kolin észteráz

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK BIOKÉMIA A SZÉNHIDRÁTOK ANYAGCSERÉJE 1. kulcsszó cím: A szénhidrátok anyagcseréje

neutrális zsírok, foszfolipidek, szteroidok karotinoidok.

Reakciókinetika. aktiválási energia. felszabaduló energia. kiindulási állapot. energia nyereség. végállapot

ENZIMKINETIKAI PARAMÉTEREK KÍSÉRLETI MEGHATÁROZÁSA

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

Enzimek. Enzimek! IUBMB: szisztematikus nevek. Enzimek jellemzése! acetilkolin-észteráz! legalább 10 nagyságrend gyorsulás. szubsztrát-specificitás

Az egyensúly. Általános Kémia: Az egyensúly Slide 1 of 27

II. Biomérnöki műveletek. 1. Bevezetés

A kémiai energia átalakítása a sejtekben

Szénhidrátok monoszacharidok formájában szívódnak fel a vékonybélből.

ENZIM SZINTŰ SZABÁLYOZÁS

, mitokondriumban (peroxiszóma) citoplazmában

A szénhidrátok lebomlása

A metabolizmus energetikája

Biotechnológiai alapismeretek tantárgy

Zsírsav szintézis. Az acetil-coa aktivációja: Acetil-CoA + CO + ATP = Malonil-CoA + ADP + P. 2 i

ORVOSI KÉMIA GYAKORLATOK 2014/2015, ÁOK, FOK, OLKDA 1.év/1. félév CSOPORT A GYAKORLATI TEREM CSOPORT B GYAKORLATI TEREM

Fémionok szerepe az élő szervezetben: a bioszervetlen kémia alapjainak megismerése

ENZIMKINETIKA. v reakciósebesség. 1 / v. 1. ábra. Michaelis-Menten ábrázolás 2. ábra. Lineweaver-Burk ábrázolás. Michaelis-Menten ábrázolás

A szénhidrátok lebomlása

Sörgyártás enzimes technológia

BIOGÉN ELEMEK Azok a kémiai elemek, amelyek az élőlények számára létfontosságúak

Az egyensúly. Általános Kémia: Az egyensúly Slide 1 of 27

POSZTTRANSZLÁCIÓS MÓDOSÍTÁSOK: GLIKOZILÁLÁSOK

TEMATIKA Biokémia és molekuláris biológia IB kurzus (bb5t1301)

Dr. Mandl József BIOKÉMIA. Aminosavak, peptidek, szénhidrátok, lipidek, nukleotidok, nukleinsavak, vitaminok és koenzimek.

A biokémia alapjai. Typotex Kiadó. Wunderlich Lívius Szarka András

MIÉRT KELL TÁPLÁLKOZNI?

Molekuláris biológiai alapok

Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék

Miért hasznos az enzimgátlások tanulmányozása?

Átírás:

ENZIMEK 1833.: Sörfőzés kapcsán kezdtek el vele foglalkozni (csírázó árpa vizsgálata) valamilyen anyag katalizátorként működik (Berzelius, 1835.) 1850. körül: ez valamilyen N-tartalmú szervesanyag 1874.: első enzimgyártó cég (rennin borjú gyomor enzimmel sav nélkül ki lehet csapni a tejfehérjét) nem tudták, de csinálták. 1878.: Kühne először használja az enzim fogalmat 1897.: Buchner megdönti Pasteur vitalisztikus elméletét (kvarchomokkal kivonta a sejtlevet az élesztőből, és működött az erjesztés) 1

ENZIMSZINTŰ SZABÁLYOZÁS Enzimek = biokatalizátorok Katalizátor: az aktiválási energia csökkentésével meggyorsítja kémiai reakciót. Csak termodinamikailag lehetséges reakciót gyorsít Az egyensúlyt nem befolyásolja Kis mennyiségben is hatékony, mert a reakció után változatlan formába visszaalakul Anyaguk: fehérje, bonyolult szerkezet (harmad-, negyedleges) 2

A reakció általános leírása: Fogalmak: Enzimes reakciók E + S [ES] E + P Szubsztrát (S): a reakcióban átalakuló molekula. Termék (P): a reakcióban keletkező molekula. Koenzim: olyan reakciópartner molekula, amely egyes enzimes reakcióhoz nélkülözhetetlen. Kötőhely, aktív centrum: az enzim felületének az a része, ahol a szubsztrát megkötődik, ill. átalakul (kb. 4-10 aminosavnyi régió) Egy enzim csak egyféle típusú reakciót katalizál. 3

Enzimes reakciók 2. A kötőhely specifikus: csak bizonyos molekulákat köt meg. A két molekula felülete (alakja, töltése) komplementer módon illeszkedik egymáshoz. (KULCS - ZÁR) Az enzim felületét az aminosav oldalláncok adják egy aminosav eltérés is elronthatja. 4

Enzimes reakciók 3. A specifitás szintjei: Csoportspecifitás: a szubsztrát egy bizonyos funkciós cso-portját köti meg és alakítja át, a molekula többi részét nem ismeri fel. (pl. lipáz: észterkötések) Régió-specifitás: molekula részletre specifikus Szubsztrát-specifitás: a teljes molekulát felismeri, csak egy-féle szubsztrátot alakít át Sztereo-specifitás: a királis (tükörkép) molekulák között is különbséget tesz, csak az egyik forma reakcióját katalizálja (az előző három mellett lehetséges) Az enzimes reakció sebessége függ: - hőmérséklet - ph - szubsztrát koncentráció - enzim koncentráció - inhibítorok 5

A hőmérséklet hatása A reakciósebesség exponenciális kapcsolatban van a hőmérséklettel (Arrhenius), tehát gyorsul a reakció. Magasabb hőmérsékleten viszont a fehérje denaturálódik, a reakció lassul. A két ellentétes folyamat eredőjeként az enzimes reakciók- nak vagy egy opti- mális hőmérsékle- te, ahol a reakció- sebesség a legna- gyobb. 6

eredő töltés A ph hatása az enzimaktivitásra A fehérjéken jó néhány karbonsav- és aminocsoportot tartalmazó oldallánc van. Ezek disszociáció-foka változik a ph-val: -COOH -COO - + H + -NH 3 + -NH 2 + H + Izoelektromos pont (IEP): az a ph érték, ahol a fehérje molekula eredő töltése nulla, kifelé semle- ges. (oldatból kicsaphatom a fehérjét) Kationos tartomány IEP ph anionos tartomány 7

A ph hatása az enzimaktivitásra 2. Az aktív centrumban a felületi töltésmintázat komplementer a szubsztrátéval. Ha ez megváltozik rosszabbul köti a szubsztrátot lassul a reakció. Szélsőséges ph-nál kicsi lesz a reakciósebesség (denaturálódás). Optimális ph érték/tartomány Eltérő ph a sejten belül: mitokondrium terei A szervezetben: gyomor 8

A szubsztrát koncentráció hatása Ha több a szubsztrát nagyobb valószínűséggel találkoznak az enzimmel több alakul át nagyobb reakciósebesség. De van ennek egy felső határa telítés Michaelis-Menten egyenlet (1913.) 9

Enzim koncentráció hatása Lineáris kapcsolat nx több enzim nx nagyobb v max Ha nagy szubsztrátkoncentrációnál mérjük a reakció-sebességet, akkor a mért reakciósebesség (v max ) arányos lesz az enzimkoncentrációval: 10

ENZIMMODULÁTOROK Az enzimes reakció sebességét befolyásoló kémiai anyagok. Lehetnek: Inhibitorok: reakciósebességet csökkentő, gátlóanyagok Aktivátorok: reakciósebességet növelő anyagok Az inhibitorok hatásmechanizmusa eltérő lehet: nem kompetitív inhibitor kompetitív inhibitor (a szubsztrát helyére kötődik) E S 11

Kompetitív inhibítorok 12

Kompetitív inhibítorok Ezek a molekulák nagyon hasonlítanak a szubsztráthoz, bekötődnek a helyére. Ezt a vegyületcsoportot kompetitív inhibítornak nevezzük, mivel az I és S egymással verseng az enzim aktív centrumához történő kapcsolódásban. Ezen belül lehet: Alternatív szubsztrát: az enzimes reakció végbemegy, alternatív termék keletkezik (Pl. alkohol-dehidrogenáz) Valódi (dead end) inhibítor: a szubsztráthoz hasonló szerkezetű molekula, ami bekötődik az enzim aktív centrumába, de a reakció nem játszódik le. Lehet: - reverzibilis, - irreverzibilis 13

Kompetitív inhibítorok 2. A gyógyszerek nagy része kompetitív inhibítorként hat: p-amino- szulfonamid Alanin Cikloszerin benzoesav (metabolit) (gyógyszer) (metabolit) (gyógyszer) 14

NEM KOMPETITÍV INHIBÍTOROK Nem az aktív centrumban kapcsolódik, hanem valahol az enzim egy másik részén. Az inhibitor nemcsak a szabad enzimmel, hanem az ES komplexszel is képes kombinálódni, ESI hármas komplexet hoz létre. Megváltoztatja a fehérjemolekula-láncok térszerkezetét megváltozik az aktív centrum szerkezete a szubsztrát nem tud elreagálni a reakció lelassul vagy leáll. Mérgezi az enzimet, mintha kevesebb enzim lenne jelen. Pl.: nehézfémek 15

ALLOSZTÉRIKUS SZABÁLYOZÁS Egyes enzim molekuláknak két, vagy több különböző aktivitású alakja lehetséges. Ezek reverzibilisen átalakulhatnak egymásba. Az átkapcsolást egy (vagy több) modulátor molekula kötődése hozza létre (harmadlagos, negyedleges szerkezet megváltoztatása) pozitív ill. negatív effektorok. Végtermék-gátlás (feed back inhibíció): egy reakciólánc végterméke visszahat és lefékezi saját termelődését, a legelső enzim működését: E 1 E 2 E n P 0 P 1 P 2 P n 16

Elágazó reakcióláncok szabályozása 17

Enzimek szabályozása kémiai módosítással Aktiválás a fehérjelánc hasításával: pepszinogén pepszin tripszinogén tripszin fibrinogén fibrin protrombin trombin Foszforilezés: aktivál és inaktivál ellentétes folyamatok E 1 GLÜKÓZ GLIKOGÉN (állati keményítő, májban) E 2 Aktív enzim Inaktív enzim E 1 - glikogén szintetáz -OH -O-P E 2 - glikogén foszforiláz -O-P -OH 18

IZOENZIMES SZABÁLYOZÁS Izoenzimek: azonos funkciójú, de eltérő szerkezetű enzimek. Mindegyik külön szabályozás alatt áll, így az eredő aktivitás finoman, fokozatmentesen szabályozható. E 1 S szubsztrát E 2 E 3 P termék 19

KOMPARTMENTÁCIÓ = térbeli szétválasztás, bezárás Az ellentétes biokémiai folyamatokat el kell választani, hogy ne használják el egymás intermedierjeit. Biológiai membránok, sejtorganellumok, vakuolumok. Pl.: Glikolízis glüko-neogenezis Zsírsavak lebontása zsírsav bioszintézis 20

KOENZIMEK 1. Az enzimek jelentős hányada összetett fehérje. A fehérjék mellett nem fehérje alkotórészt is tartalmaznak, ezeket koenzimeknek nevezzük. Az enzimaktivitáshoz általában a koenzimek sztöchiometrikus jelenlétére is szükség van. A koenzimek általában kisebb molekulatömegű szerves vegyületek, amelyek egyes esetekben fém atomot (iont) is tartalmaznak. A koenzimeket a sejt önmaga állítja elő (néhány esetben a táplálékkal felvett vitaminok segítségével). Általában gyenge kémiai kölcsönhatással (ritkán kovalens kötéssel) kapcsolódnak az enzimek aktív centrumához reverzibilisen disszociábilisek. 21

KOENZIMEK 2. Közvetlenül részt vesznek a katalitikus folyamatokban (elektronokat, atomokat, atomcsoportokat, gyököket képesek átvenni valamely S molekulától, amit ugyanazon vagy más E aktív centrumába kötötten atádnak más S molekuláknak). Csoportosításuk a katalizált enzimreakció típusa szerint történik (mint az E esetében is): Oxidoreduktázokhoz tartozó koenzimek Transzferázokhoz Liázokhoz Izomerázokhoz Ligázokhoz 22

KOENZIMEK 3. Oxidoreduktázokhoz tartozó koenzimek pl.: Nikotinsavamid-adenin-dinukleotid (foszfát) NAD +, NADP + Flavin-mononukleotid (FMN) Flavin-adenin-dinukleotid (FAD) Transzferázokhoz tartozó koenzimek pl.: Koenzim-A (CoA) Biotin (H-vitamin) Adenozin-trifoszfát (ATP) Ligázokhoz tartozó koenzimek pl.: NAD + ATP 23