Válasz. A kérdésekre, kritikai megjegyzésekre az alábbiakban válaszolok:



Hasonló dokumentumok
Válasz. 6) Több helyen is ír (pl. 16. oldal) cisztein csoportról, ami bizonyára a tiolát vagy tiolcsoportot jelenti, csak kevésbé szabatosan.

MTA Doktori értekezés tézisei

4.2. Az Al(III) kölcsönhatása aszparaginsav-tartalmú peptidekkel

XXXVII. KÉMIAI ELŐADÓI NAPOK

Oldalláncban kelátképző donorcsoportot tartalmazó aminosavszármazékok átmenetifém-komplexeinek egyensúlyi vizsgálata

A kutatás célja. A projekt eredményei

KELÁTKÉPZŐ DONORCSOPORTOT TARTALMAZÓ PEPTIDSZÁRMAZÉKOK ÁTMENETIFÉM-KOMPLEXEI

4.3. Az AcLysSerProValValGluGly heptapeptid Al(III)-kötő sajátságának jellemzése

MTA Doktori értekezés

Tioéter- és imidazolcsoportot tartalmazó peptidek fémkomplexeinek vizsgálata

I. BEVEZETÉS ÉS CÉLKITŐZÉSEK

Szakmai zárójelentés

OLDALLÁNCBAN KARBOXIL- ÉS IMIDAZOLIL- CSOPORTOT TARTALMAZÓ AMINOSAV- ÉS PEPTIDSZÁRMAZÉKOK ÁTMENETIFÉM-KOMPLEXEI. Doktori (PhD) értekezés

Tioéter- és imidazolcsoportot tartalmazó peptidek fémkomplexeinek vizsgálata

ESR-spektrumok különbözı kísérleti körülmények között A számítógépes értékelés alapjai anizotróp kölcsönhatási tenzorok esetén

Átmenetifém-ionok kölcsönhatása kis biomolekulákkal. Újabb eredmények a ligandumok fémion szelektivitásában.

Doktori (Ph.D.) értekezés tézisei A réz-efflux szabályzó CueR fehérje fémkötő sajátságainak tanulmányozása modellpeptideken keresztül

Oldatokban végbemenő folyamatok egyensúlyi és kinetikai vizsgálata

XL. KÉMIAI ELŐADÓI NAPOK

Fáriné Turi Ildikó Margit

NAPJAINK KOORDINÁCIÓS KÉMIÁJA II *

Inzulinutánzó vanádium-, és cinkkomplexek kölcsönhatásának vizsgálata vérszérum fehérjékkel

Közös elektronpár létrehozása

Aminosavak, peptidek, fehérjék

A K sz. OTKA szerződés záró beszámolója

TERMÉSZET IHLETTE HISZTIDINGAZDAG LIGANDUMOK KÖLCSÖNHATÁSA CINK(II)-, RÉZ(II)- ÉS NIKKEL(II)IONOKKAL. Doktori (Ph.D.) értekezés.

Doktori (Ph.D.) értekezés. Simon Ida Noémi FEHÉRJÉK FÉMKÖTŐ TULAJDONSÁGAINAK MODELLEZÉSE TÖBBCÉLÚ FELHASZNÁLÁSRA ALKALMAS PEPTIDEK FÉMKOMPLEXEIVEL

A fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások

XXXVI. KÉMIAI ELŐADÓI NAPOK

Oldalláncban funkciós csoportot tartalmazó peptidek protonálódási és komplexképződési folyamatai. Makro- és mikroállandók meghatározása.

Kémiai reakciók. Közös elektronpár létrehozása. Általános és szervetlen kémia 10. hét. Elızı héten elsajátítottuk, hogy.

HISZTIDINTARTALMÚ OLIGOPEPTIDEK KOMPLEXKÉPZİ SAJÁTSÁGAI. A PRION PROTEIN PEPTIDFRAGMENSEI FÉMION-SZELEKTIVITÁSÁNAK VIZSGÁLATA.

R R C X C X R R X + C H R CH CH R H + BH 2 + Eliminációs reakciók

CATALYTIC FUNCTION. Témavezetők: DR. GAJDA TAMÁS egyetemi tanár. DR. FLORENCE DUMARÇAY Maître de Conférences HDR

A Szervetlen és Analitikai Kémiai Tanszéken a 2017/2018. tanév II. félévére meghirdetett diplomamunka, szakdolgozati és projektmunka témákörei

Sav bázis egyensúlyok vizes oldatban

Készítette: NÁDOR JUDIT. Témavezető: Dr. HOMONNAY ZOLTÁN. ELTE TTK, Analitikai Kémia Tanszék 2010

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Szintay Gergely. Veszprémi Egyetem. Általános és Szervetlen Kémia Tanszék

Általános kémia vizsgakérdések

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

A Szuperstabil Pd(0) katalizátor vizsgálata és alkalmazása C-C kötés kialakítási reakciókban

Új oxo-hidas vas(iii)komplexeket állítottunk elő az 1,4-di-(2 -piridil)aminoftalazin (1, PAP) ligandum felhasználásával. 1; PAP

Vegyesligandumú palládium(ii)komplexek termodinamikai, szerkezeti és kinetikai vizsgálata

Fémionok szerepe az élő szervezetben: a bioszervetlen kémia alapjainak megismerése

METALLOENZIMEK SZERKEZETI ÉS FUNKCIONÁLIS MODELLEZÉSE ÁTMENETIFÉM-KOMPLEXEKKEL. Paksi Zoltán

évi OTKA jelentés Vezető kutató: Brücher Ernő K-69098

3. Sejtalkotó molekulák III.

Tartalmi követelmények kémia tantárgyból az érettségin K Ö Z É P S Z I N T

1. Bevezetés és célkitűzések

XXXVII. KÉMIAI ELŐADÓI NAPOK

This section is limited in length, as described in the Instructions. The list of references is not included in the limited length.

Zárójelentés az OTKA K sz. pályázat eredményeiről

SZERVES KÉMIAI REAKCIÓEGYENLETEK

Reakciókinetika és katalízis

FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,

INZULINUTÁNZÓ FÉMKOMPLEXEK BIOSPECIÁCIÓJA A SEJTEN KÍVÜLI ÉS A SEJTEN BELÜLI TÉRBEN OTKA PÁLYÁZAT ZÁRÓJELENTÉS T

Kelátképző ligandumot tartalmazó aminosavszármazékok előállítása és átmenetifém-komplexeik vizsgálata

Nitrogéntartalmú szerves vegyületek. 6. előadás

Spektroszkópiai módszerek 2.

XXXVI. KÉMIAI ELŐADÓI NAPOK

NEHÉZFÉMEK ELTÁVOLÍTÁSA IPARI SZENNYVIZEKBŐL Modell kísérletek Cr(VI) alkalmazásával növényi hulladékokból nyert aktív szénen

A nappali tagozatra felvett gépészmérnök és műszaki menedzser hallgatók informatikai ismeretének elemzése a Budapesti Műszaki Főiskolán

Vízoldható foszfint tartalmazó ródium- és ruténium-katalizátorok működési mechanizmusának vizsgálata

Bioinformatika előad

METALLOENZIMEK SZERKEZETI ÉS FUNKCIONÁLIS MODELLEZÉSE. Szilágyi István

Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny

SZAK: KÉMIA Általános és szervetlen kémia 1. A periódusos rendszer 14. csoportja. a) Írják le a csoport nemfémes elemeinek az elektronkonfigurációit

Etán- és propánvázon szubsztituált oligofoszfonátok és oligofoszfono-karboxilátok protonálódásának és fémkomplexeinek vizsgálata

XI. Fémorganikus fotokémia. A cisz-cr(co) 4 (CH 3 CN) 2 előállítása és reaktivitása

C-Glikozil- és glikozilamino-heterociklusok szintézise

Elektronspinrezonancia (ESR) - spektroszkópia

Katalízis. Tungler Antal Emeritus professzor 2017

CO 2 aktiválás - a hidrogén tárolásban

3.1.5 megint nincs megcímezve, a megfelelő négy al-alfejezet sav-bázis egyensúllyal és a vas ionok hatásával foglalkozik.

Anaerob fermentált szennyvíziszap jellemzése enzimaktivitás-mérésekkel

Átmenetifém-komplexek ESR-spektrumának jellemzıi

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

NMR a peptid- és fehérje-kutatásban

SZENNYVÍZKEZELÉS NAGYHATÉKONYSÁGÚ OXIDÁCIÓS ELJÁRÁSSAL

Válasz Tombácz Etelkának az MTA doktorának disszertációmról készített bírálatában feltett kérdéseire és megjegyzéseire

Többértékű savak és bázisok Többértékű savnak/lúgnak azokat az oldatokat nevezzük, amelyek több protont képesek leadni/felvenni.

A sejtek élete. 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék R C NH 2. C COOH 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános

A fehérjék térszerkezetének jóslása (Szilágyi András, MTA Enzimológiai Intézete)

5. Az adszorpciós folyamat mennyiségi leírása a Langmuir-izoterma segítségével

Reakciókinetika és katalízis

EÖTVÖZET III. Az Eötvös József Collegium és az Eötvös Loránd Kollégium III. közös konferenciáján elhangzott előadások

Koordinációs vegyületek (komplexek)

KELÁTKÉPZŐ DONORCSOPORTOT TARTALMAZÓ PEPTIDSZÁRMAZÉKOK ÁTMENETIFÉM-KOMPLEXEI

1. feladat. Versenyző rajtszáma:

4.Gyakorlat Oldatkészítés szilárd sóból, komplexometriás titrálás. Oldatkészítés szilárd anyagokból

Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly

BIOLÓGIAILAG AKTÍV HIDROXÁMSAVAK ÉS MODELLJEIK KÖLCSÖNHATÁSA KÉTÉRTÉKŰ FÉMIONOKKAL. doktori (PhD) értekezés tézisei.

Aromás: 1, 3, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 13, (14) Az azulén (14) szemiaromás rendszert alkot, mindkét választ (aromás, nem aromás) elfogadtuk.

A hulladék alapjellemzés során nyert vizsgálati eredmények értelmezési kérdései Dr. Ágoston Csaba

Mágneses módszerek a mőszeres analitikában

AMINOSAVAK, FEHÉRJÉK

1. feladat. Versenyző rajtszáma: Mely vegyületek aromásak az alábbiak közül?

ÁGAZATI SZAKMAI ÉRETTSÉGI VIZSGA KOZMETIKAI ISMERETEK KÖZÉPSZINTŰ SZÓBELI VIZSGA MINTAFELADATOK ÉS ÉRTÉKELÉSÜK

OLDALLÁNCBAN KARBOXIL- ÉS IMIDAZOLILCSOPORTOT TARTALMAZÓ AMINOSAV- ÉS PEPTIDSZÁRMAZÉKOK ÁTMENETIFÉM-KOMPLEXEI

Szerkesztette: Vizkievicz András

Átírás:

Válasz Kiss Tamás egyetemi tanárnak Az Imidazolgyűrű szerepe a fémionmegkötésben: oldalláncban több donorcsoportot tartalmazó peptidek és származékaik átmenetifém komplexeinek egyensúlyi és redoxi sajátságai című MTA doktori értekezésemről írt bírálatára Mindenekelőtt nagyon köszönöm Bírálómnak a doktori értekezés és a tézisek alapos áttanulmányozását és köszönöm a dolgozatról és a munkámról írt elismerő szavait. Ugyancsak köszönöm, hogy felhívta a figyelmemet a dolgozatban előforduló magyartalan kifejezésekre és pontatlan megfogalmazásokra, amelyeket természetesen elfogadok. A kérdésekre, kritikai megjegyzésekre az alábbiakban válaszolok: Eredményeit jól felépített, arányos és annak ellenére, hogy egy nagy témakörrel foglalkozik eléggé olvasmányos értekezésbe foglalta össze. Ezt a sok magyarázó ábra segíti, de az, hogy a szerző az összefoglaló stabilitási állandó táblázatokat a dolgozat végén a mellékletben közli kifejezetten gátolják. A dolgozat összeállítása során igyekeztem az eredményeket összefoglaló ábrák és az adatok összehasonlító elemzésével bemutatni, így a Kísérleti eredmények és értékelésük fejezetben általában a stabilitási állandókból származtatott adatok szerepelnek szemléltetésül, a meghatározott stabilitási állandók ezért kerültek a Mellékletek részbe. Elfogadom, hogy ez nehezítette a dolgozat olvasását. Nem hiszem, hogy a PSEQUAD és a SUPERQUAD számítógépes programok egymás továbbfejlesztett változatai volnának. Mindkettő ugyanarról az alapról a SCOGS programról indult és párhuzamosan fejlődtek a 7-es években. Köszönöm az észrevételt, és teljesen egyetértek vele. A PSEQUAD programot 97 ban írta meg Zékány László és Nagypál István és 9 ban fejlesztették ki az első központi számítógépre alkalmazható verzióját (L. Zékány, I. Nagypál, in Computational Methods for the Determination of Formation Constants, ed.d. Leggett, Plenum Press, New York, 9, p. 9.). A SUPERQUAD programot 9 ben Peter Gans, Antonio Sabatini és Alberto Vacca fejlesztette ki és hozta nyilvánosságra (P. Gans, A. Sabatini and A. Vacca, J. Chem. Soc., Dalton Trans., 9, 9.). Bár mindkét program ugyanazon alapprogramból (SCOGS) indult ki, és a stabilitási állandók meghatározásának elve is gyakorlatilag azonos, a két programot alkotóik egymástól függetlenül hozták létre.. Nem teljesen világos, hogy a Cu(II)-BPMA és Cu(II)-BIMA komplexek jelentősen eltérő log(k /K ) értékeire vonatkozó értelmezés. Valószínűleg a szerző jót gondolt a ligandumok koordinációs fogszámáról, de pontatlanul fogalmazott. Elmondaná helyesen a koordinációs viszonyokat.

Mindkét ligandumnak három koordinálódásra képes donorcsoportja van (két aromás N és egy amino N), így mind a BIMA, mind a BPMA háromfogú koordinációval kötheti a réz(ii)iont. A bisz(imidazol il) metilamin (BIMA) esetén a savas tartományban képződő [CuHL] +, illetve [CuH L ] + komplexekben a fémion a két, illetve négy imidazolgyűrűn keresztül kötődik, az aminocsoport protonált, a, illetve imidazolgyűrű a réz(ii)ion körül ekvatoriálisan helyezkedik el. Az ammóniumcsoport deprotonálódásával képződő [CuL] + komplexben azonban az egyik imidazolnitrogén kiszorul az ekvatoriális síkból, a fémion körül egy síkban az amino és az egyik imidazolnitrogén található, míg a másik imidazol gyenge axiális koordinációja jön létre. A [CuL ] + komplexben szintén megváltozik a ekvivalens imidazol nitrogénen keresztüli koordináció, a spektrális adatok alapján legalább az egyik ligandum háromfogú koordinációját feltételeztük. Így mind a [CuHL] +, mind a [CuH L ] + deprotonálódását és [CuL] +, illetve [CuL ] + komplex képződését a réz(ii)ion körüli koordináció és a komplex geometria jelentős mértékű változása kíséri. A bisz(piridin il) metilamin esetén protonált komplexek képződése nem volt kimutatható, a gyengén savas tartományban képződő [CuL] + és [CuL ] + komplexben az ekvatoriális síkban az amino és piridin N koordinációját mutattuk ki, míg a másik piridin axiális koordinációja feltételezhető egy torzult oktaéderes geometriát eredményezve. Ennek kialakulását a szilárd biszkomplex röntgendiffrakciós vizsgálatai igazolták, az oldategyensúlyi vizsgálatok ugyanakkor azt tükrözik, hogy legfeljebb egy piridin axiális koordinációja valósul meg. A lg(k /K ) értékekben mutatkozó különbséghez nagymértékben az járul hozzá, hogy a BIMA [CuL] + és [CuL ] + komplexeinek képződését jelentős geometriaváltás kíséri.. A Zn(II) komplexek NMR spektrális viselkedésénél lehetett-e a lassú csere tartományba eső folyamatokat megfigyelni, ami az NMR spektrumban egyértelműen megfigyelhető lett volna. A képződő Zn(II) komplexeket H NMR spektroszkópiával a Gly BPMA, a GlyGlyHis BIMA, valamint a hisztidin analóg aminosavat tartalmazó di és tripeptid származékok esetén vizsgáltuk, valamennyi esetben annak eldöntése volt a cél, hogy a lúgos tartományban lejátszódó extra lúgfogyasztó folyamat a fémion indukálta amidnitrogén deprotonálódáshoz vagy a fémion hidrolíziséhez rendelhető e. Az amidnitrogén deprotonálódást a fenti ligandumok közül csak a Gly BPMA esetén igazoltuk. A cink(ii)iont tartalmazó rendszerekben felvett spektrumok valamennyi esetben azt tükrözték, hogy a gyors csere tartományba eső folyamatok játszódnak le. Így a Zn(II) hozzáadására jelek kiszélesedése volt tapasztalható, ligandumfelesleg sem tapasztaltuk a jelek kettőződését, a szabad ligandum és a komplexben kötött ligandum jele nem különült el. A Zn(II) Gly BPMA rendszerben az amidcsoporthoz kapcsolódó CH proton (és az aromás protonok) jelének kiszélesedéséből és eltolódásából következtettünk a koordinációs módra (. ábra).

Gly-BPMA ph=, ph=, ph=, 9 7 Zn(II)-Gly-BPMA ph=, ph=7, ph=9, 9 7. ábra A Gly BIMA és a Zn Gly BIMA rendszerben felvett H NMR spektrumok a ph függvényében kémiai eltolódás [ppm]. A szerző részletesen tanulmányozta a CuZnSOD enzim szerkezeti modelljét, szerkezet kialakulását befolyásoló alapvető tényezőket releváns fémionok komplexeinél. Meglepőnek tartom ugyanakkor, hogy még csak kísérletet sem tett legalább is értekezésében nem említi hogy heterodinukleáris imidazoláto-hidas komplexek előállításával illetve oldatbeli vizsgálatával próbálkozott volna. Miért? A legígéretesebb szerkezeti SOD modell a His BIMA [Cu L H ] + és a dipeptid BIMA (GlyLeu BIMA, LeuGly BIMA) [Cu L H ] komplexe volt. Így a GlyLeu BIMA ligandum esetén vizsgáltuk a vegyes Cu(II) Zn(II) ligandum rendszert. Bár a potenciometriás titrálási görbe (. ábra) illeszthető olyan modellel, amelyben a törzskomplexek mellett egy [Cu ZnL H ] összetételű komplex is van, de ha keletkezne is, átfedésben lenne a cink(ii)ion hidrolízisével. Ugyanakkor a tömegspektrometriás vizsgálatok csak a Cu(II) GlyLeu BIMA törzsrendszerben képződő komplexekkel azonos részecskék megjelenését igazolták (. ábra), tehát a vegyes Cu(II),Zn(II) komplex keletkezését nem tudtuk igazolni. Így ilyen irányban a vizsgálatainkat nem folytattuk.

9 ph 7 GlyLeu-BIMA GlyLeu-BIMA +. Cu(II) GlyLeu-BIMA +. Zn(II) +. Cu(II) ekvivalens.ábraaglyleu BIMA(kék),aCu(II) GlyLeuBIMA:(fekete)ésaCu(II) Zn(II) GlyLeu BIMA::(sárga) titrálásigörbéi(cl=,m) Cu(II)-Zn(II)-GlyLeu-BIMA :: Cu(II)-GlyLeu-BIMA : Cu(II)-Zn(II)-GlyLeu-BIMA :: Cu(II)-GlyLeu-BIMA : 7 7 9 9.ábraACu(II) GlyLeu BIMA:(kék)rendszerbenésaCu(II) Zn(II) GlyLeu BIMA::(ciklámen) rendszerbenrögzítetttömegspektrumok([cuznlh ]komplexre:chcunozn:m:,)

. Azt találták, hogy a csak oldalláncon keresztüli koordináció esetén a koordinálódó imidazol- N-ek számának növekedésével nő ezen komplexek stabilitása és Im-N esetén ez már a fiziológiás ph-n lejátszódik. Az. ábra szerint a többi komplex esetén pedig már savas phn. Nem világos a megfogalmazás, hiszen a nagyobb stabilitás kisebb ph-n való komplexképződésnek kedvez Egyetértek, hogy valóban pontatlan a megfogalmazás. A dolgozat. ábráján (.a ábra) két peptid, az Ac HisAlaHisValHis NH (szaggatott vonal) és az Ac HisSarHisSarHisSarHis NH (SH, folytonos vonal) réz(ii)ionnal alkotott komplexeinek koncentráció eloszlása látható. Az ábra azt is mutatja, hogy mindkét ligandum esetén lépcsőzetesen képződik két, illetve három imidazol N koordinációjú komplex, amelynek a megjelenése a hisztidint tartalmazó molekula esetén valamivel kisebb ph n figyelhető meg. Az SH ligandumnál e két komplexképződési folyamatot követi a imidazol N koordinációjú komplex megjelenése. A hisztidinek számának növekedésével így az a ph tartomány növekszik, ahol az imidazol N koordinációjú komplexek vannak jelen.,, Cu + Im(N) Im(N) MH - L,, Cu + - Im(N) MH - L, Im(N),, MH - L,,, MH - L,,, 7pH Cu + Im(N) (a) MH - L, 7 ph,, Cu + (b) - Im(N) MH - L, Im(N),, MH - L,,, MH - L, 7 ph (c), 7 ph (d). ábra A Cu(II) Ac HisAlaHisValHis NH (szaggatott vonal) és a Cu(II) Ac HisSarHisSarHisSarHis NH (folytonos vonal) rendszerben képződő komplexek eloszlása (a), (b); valamint a Cu(II) Ac HisHisGlyHis NH (szaggatott vonal) és a Cu(II) Ac HisAlaHisValHis NH (folytonos vonal) rendszerben képződő komplexek eloszlása (c), (d); Talán még szemléletesebben mutatja ezt a.b ábra, ami az eloszlásban összegezve mutatja az imidazol koordinációjú komplexeket, tükrözve, hogy a hisztidinek számának növekedésével egyre

szélesebb ph tartományban uralkodó a csak az oldalláncon keresztüli koordinációs mód, és egyre nagyobb ph felé tolódik az [CuH L] + komplex képződése. Összehasonlításként a.c és.d ábra az eltérő helyzetben hisztidint tartalmazó két peptidre, az Ac HisHisGlyHis NHCH (szaggatott vonal) és az Ac HisAlaHisValHis NH (folytonos vonal) mutatja be a keletkező komplexek eloszlását külön külön, illetve összegezve az imidazol koordinációjú komplexeket. A kedvezőbb HXH szekvenciát tartalmazó peptid esetén a és imidazol nitrogén koordinációjú komplex képződése kisebb ph n kezdődik és nagyobb arányban jelenik meg a komplex, mint az Ac HisHisGlyHis NHCH peptid esetén. Így az imidazol koordinációjú komplexek az Ac HisAlaHisValHis NH ligandumnál szélesebb ph tartományban vannak jelen, és az amidnitrogének deprotonálódása nagyobb ph nál játszódik le. Végezetül még egyszer köszönöm Prof. Kiss Tamásnak a dolgozatom bírálatának elkészítését és azt, hogy az értekezés nyilvános vitára való bocsátását javasolja. Debrecen,. július. Dr. Várnagy Katalin