Dudits Dénes Növénybiológiai Intézet, MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont Szeged dudits.denes@brc.mta.hu



Hasonló dokumentumok
ÚJ GÉNSEBÉSZETI MÓDSZEREK A NÖVÉNYI GÉNEK ÉS GENOMOK CÉLZOTT SZERKESZTÉSÉBEN

Génmódosítás: bioszféra

Transzgénikus növények előállítása

A géntechnológia genetikai alapjai (I./3.)

Egy Polycomb Response Element (PRE) in situ vizsgálata Drosophila melanogaster-ben génkonverzió segítségével. Kozma Gabriella

A BIZOTTSÁG 2009/120/EK IRÁNYELVE

A transzgénikus (GM) fajták fogyasztásának élelmiszer-biztonsági kockázatai

A replikáció mechanizmusa

A HLTF koordinált fehérje és DNS átrendezése és aktivitásának összehasonlítása a Bloom szindróma helikáz fehérjével

A modern biotechnológia növénynemesítési eljárásai mindenkor megfelelnek a kötelező gondosság elvének?

Proteomkutatás egy új tudományág születése

Imidazolinon-toleráns nem transzgénikus(!) fajták előállítása és termesztése

A C1 orf 124/Spartan szerepe a DNS-hiba tolerancia útvonalban

A búza termőterülete és termésátlaga között a Világon

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

BIOTECHNOLÓGIÁK EGYÉB IPARÁGAKBAN. Pókselyemfehérjék előállítása dohányban és burgonyában

TÁPLÁLKOZÁSI AKADÉMIA

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

A gyümölcs érésének és a virág vázaélettartamának géntechnológiai módosítása

BIOLÓGIA és BIOTECHNOLÓGIA 3. rész

(11) Lajstromszám: E (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA

A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

Polimeráz láncreakció a géntechnológia nélkülözhetetlen eszköze

AZ EMBERI MIKROBIOM: AZ EGYÉN, MINT SAJÁTOS ÉLETKÖZÖSSÉG Duda Ernő

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

Ésszerű és korszerű táplálkozás élelmiszer általi fertőzésveszély és egyéb kockázatok társadalmi reagálás

Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése

,:/ " \ OH OH OH / \ O / H / H HO-CH, O, CH CH - OH ,\ / "CH - ~(H CH,-OH \OH. ,-\ ce/luló z 5zer.~ezere

A kémiai energia átalakítása a sejtekben

Gelencsér Tímea. Peszticidek alkalmazása helyett ellenálló GMO-k létrehozásának lehetőségei. Készítette: Budapest, 2004

BIOLÓGIA és BIOTECHNOLÓGIA 3. rész

Molekuláris terápiák

Növényi sejtek által előállított monoklonális antitesttöredékek jellemzése

J/4723. számú JELENTÉS

A DOHÁNYZÁS OKOZTA DNS KÁROSODÁSOK ÉS JAVÍTÁSUK VIZSGÁLATA EMBERI CUMULUS ÉS GRANULOSA SEJTEKBEN. Sinkó Ildikó PH.D.

2. évf /2. szám

A KUKORICA STRESSZREZISZTENCIA KUTATÁSOK EREDMÉNYEIBŐL

Genomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik

A zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban

Klónozás: tökéletesen egyforma szervezetek csoportjának előállítása, vagyis több genetikailag azonos egyed létrehozása.

A közlekedés társadalmi költségei és azok általános és közlekedési módtól függő hazai sajátosságai

AZ ALACSONY HŐMÉRSÉKLET HATÁSÁRA BEKÖVETKEZŐ REDOX ÉS GÉNEXPRESSZIÓS VÁLTOZÁSOK GABONAFÉLÉKBEN

Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)

Génátvitel magasabb rendű állatokba elméleti megfontolások, gyakorlati eredmények és génterápiás lehetőségek

MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

NÖVÉNYNEMESÍTÉS. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Molekuláris biológiai technikák

JÁNOSHALMA VÁROS TELEPÜLÉSFEJLESZTÉSI KONCEPCIÓJA. Projekt azonosító: DAOP-6.2.1/13/K

Hazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok

1.ábra A kadmium felhasználási területei

Az emberi erőforrás értéke

Génszerkezet és génfunkció

DNS, RNS, Fehérjék. makromolekulák biofizikája. Biológiai makromolekulák. A makromolekulák TÖMEG szerinti mennyisége a sejtben NAGY

Bakteriofág és bakteriális represszor vizsgálata in vivo és in vitro módszerekkel

A FENNTARTHATÓ FEJLŐDÉS LEHETŐSÉGEI ÉS KORLÁTAI GLOBÁLIS ÉS KONTINENTÁLIS SZINTEN, A FÖLDRAJZTUDOMÁNY SZEMSZÖGÉBŐL A

Géntechnológia és fehérjemérnökség

AZ IS30 BAKTERIÁLIS INSZERCIÓS ELEM CÉLSZEKVENCIA VÁLASZTÁSÁNAK MOLEKULÁRIS TÉNYEZŐI DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI SZABÓ MÓNIKA

Az endomembránrendszer részei.

(11) Lajstromszám: E (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA

Kulcsszavak: Zöld fluoreszcens fehérje, helyspecifikus mutáció, kromofor, hisztidin

a III. kategória ( évfolyam) feladatlapja

BIOLÓGIA JAVÍTÁSI-ÉRTÉKELÉSI ÚTMUTATÓ

Tárgyszavak: hemofilia; terápia; vértranszfúzió; vérplazma; krioprecipitátum; VIII. faktor; tisztítás; rekombináns DNS-technika; génterápia.

Vírusok Szerk.: Vizkievicz András

Előadások témája: Elsősorban a DNS, a gének és genomok molekuláris biológiája. Tételsorok mindenkinek a honlapon:

Nemzeti Stratégia. a kábítószer-probléma kezelésére

Útmutató a Kutatási (K, NN, ANN) és a Fiatal kutatói (PD) alapkutatási pályázatokhoz 2013

NUKLEINSAVAK. Nukleinsav: az élő szervezetek sejtmagvában és a citoplazmában található, az átöröklésben szerepet játszó, nagy molekulájú anyag


Tudományközi beszélgetések

5.10. GYÓGYSZERANYAGOK SZENNYEZÉSVIZSGÁLATA

A baktériumok genetikája

T Zárójelentés

ZOMÁNCOZOTT ACÉLLEMEZ SZEGMENSEK- BL CSAVARKÖTÉSSEL SZERELT TARTÁ- LYOK ÉS SILÓK: MÚLT ÉS JÖV

Vastagréteg hangfrekvenciás oszcillátorok

Napraforgó vetômag A termôterületnek, ahol a vetômagot elôállították, mentesnek kell lennie napraforgó

AZ APERIODIKUSAN ALKALMAZOTT KATONAI BERENDEZÉSEK ELLENŐRZŐ TESZTJEINEK HATÁSA A MEGBÍZHATÓSÁG ÁLLAPOTVEKTORRA

Új irányok a biomolekuláris felismerés detektálásában

A BÚZA SZEMFEJLŐDÉS KORAI LÉPÉSEINEK ÉS STRESSZÉRZÉKENYSÉGÉNEK VIZSGÁLATÁRA ALKALMAS cdns-chip KIFEJLESZTÉSE. GVOP Projekt Esettanulmány

Városi Önkormányzat július hó. Kazincbarcika város Településrendezési tervének K-10 jelű módosítása 1

Oszvald Mária. A búza tartalékfehérjék tulajdonságainak in vitro és in vivo vizsgálata rizs modell rendszerben

A régió gazdaságfejlesztését alakító főbb szereplők és együttműködésük

A LISZTHARMAT ÉS A FOGÉKONY SZŐLŐ KÖZÖTTI MOLEKULÁRIS KAPCSOLAT. Tóth Zsófia 1 -Kiss Erzsébet 2

Nagy Emese: Polimorfizmus és rokonsági körök vizsgálata kukoricában (Zea mays) Témavezetők: Cs. L. Marton G Gyulai

SZAPORODÁSBIOLÓGIAI KUTATÁSOK A NÖVÉNYNEMESÍTÉS SZOLGÁLATÁBAN

Transzgénikus (GM) fajták globális termesztésének eredményei és következményei

Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok

tárgyú találmányok szabadalmaztatásában

Téma 2: Genetikai alapelvek, a monogénes öröklődés -hez szakirodalom: (Plomin: Viselekedésgenetika 2. fejezet) *

Biokatalízis, biokonverziók, biotranszformációk Rákhely, Gábor

(11) Lajstromszám: E (13) T2 EURÓPAI SZABADALOM SZÖVEGÉNEK FORDÍTÁSA

(Nem jogalkotási aktusok) RENDELETEK

Az örökítőanyag. Az élőlények örökítőanyaga minden esetben nukleinsav (DNS,RNS) (1)Griffith, (2)Avery, MacLeod and McCarty (3)Hershey and Chase

AZ EURÓPAI KÖZÖSSÉGEK BIZOTTSÁGA. Javaslat: A TANÁCS RENDELETE

Nukleinsavak. Szerkezet, szintézis, funkció

Az idősek alábecsülik saját számítástechnikai ismereteiket?

Közegészségügy természettel kapcsolatos perspektívái: a természet fiziológiai hatásainak számbavétele A publikálás időpontja: május19.

A évi integritásfelmérések céljai, módszertana és eredményei

Átírás:

ÚJ GÉNSEBÉSZETI MÓDSZEREK NÖVÉNYI GÉNEK ÉS GENOMOK ÉLZOTT SZERKESZTÉSÉBEN Dudits Dénes Növénybiológiai Intézet, MT Szegedi Biológiai Kutatóközpont Szeged dudits.denes@brc.mta.hu GMO-k (Genetikailag Módosított Szervezetek) kapcsán folytatott viták hevében gyakran találkozhatunk kényszeredett kifogásokkal mint azzal a kritikával, hogy az eddig használt tradicionális génbeépítési módszerekkel genetikai transzformáció nem lehet irányítani a transzgének beépülésének helyét. z elfogultak szerint ez a bizonytalanság megkérdőjelezi a géntechnológiával végzett nemesítés létjogosultságát és az eddig előállított GM fajták mint félkész termékek használhatóságát. z aggodalmaskodó GMOellenzők szemet hunynak a felett, hogy a hagyományos nemesítési módszerek, mint a keresztezés vagy a mesterséges mutációk használata során sincs mód specifikus genetikai változások előre megtervezett kialakítására. genomi folyamatok véletlenszerűen zajlanak, és csak utólag, a növények tulajdonságainak értékelésével lehet kiválasztani a kívánt genetikai eseményt. Lényegében hasonló, de nagyságrendekkel célzottabb beavatkozásra ad lehetőséget az izolált génekkel végzett génnemesítés. Ilyenkor a GM növény több tízezer génje közé épül be egyetlen, a kívánt hatást biztosító transzgén, ezzel szemben keresztezést követően a szülői gének tízezrei kombinálódnak ellenőrizhetetlenül. transzgenikus technológia nyújtotta nagyobb irányítottság ellenére intenzív kutatás és fejlesztés folyik annak érdekében, hogy egy kiválasztott célgént specifikusan lehessen módosítani és ezzel javítani a növények tulajdonságait. Mint oly gyakran az innováció világában, a zöld biotechnológia területén is tanúi lehetünk annak, hogy a tudományt nem lehet határok közé szorítani, ezért születhetnek rendre az újabb és újabb technológiák. European ommission's Joint Research entre (JR) Institute részletes tanulmányt készített: Lusser és mtsai (2011): New Plant Breeding Techniques: State-of-the-rt and Prospects for ommercial Development címmel. z Új nemesítési módszerek előtérbe kerülését indokolja, hogy az élelmiszerigény jelentős növekedésével kell számolni. Tester és Langridge (2010) elemzése szerint a gabonafélék termésének évi növekedési üteme 2010 előtt 32 millió tonna volt. hhoz, hogy a 2050-ig terjedő időszakban a 37%-os szükségletnövekedést ki lehessen elégíteni, a növekedés mértékét 44 tonna/év szintre kell emelni. termésbiztonság genetikai alapjának kialakítása mellett, ehhez a termesztési technológiák fejlesztésére és a használt fajták termőképességének folyamatos növelésére van szükség. JR tanulmány a következő nyolc módszert tekinti kiemelten fontosnak: 1. ink-ujj nukleáz technológia 2. Szintetikus oligonukleotidokkal indukált helyspecifikus mutagenezis 3. faj saját (ciszgenikus), illetve a befogadó fajjal keresztezhető faj génjeinek átvitele 4. RNS-függő DNS-metiláció 5. GM alanyra történő oltás 6. Elit heterozigóta növények reprodukálása fordított nemesítéssel 7. grobacterium-infiltrációval időleges génkifejeztetés 8. Szintetikus genomikával mesterséges biológiai rendszerek, elsősorban mikroorganizmusok létrehozása fenti módszerek közül az 1. cink-ujj nukleáz technológia és a 2. szintetikus oligonukleotidokkal indukált helyspecifikus mutagenezis ad lehetőséget egy kiválasztott gén- vagy DNS-szakasz célzott szerkesztésére. jelen elemzés részletesen ezeket a megközelítéseket mutatja be kiegészítve két újabb technológiával, amelyek a TLE nukleázokra, illetve a RISPR/as rendszerre épülnek. z 1. és 2. módszer leírásakor felhasználjuk a korábban készített elemzésünket, amelyeket a Zöld GMO-k (Dudits Dénes és Györgyey János, kadémiai Kiadó 2014) című könyvben ismertettünk. 1

1. cink-ujj nukleázok felhasználása a génspecifikus genetikai beavatkozásokban cink-ujj nukleázok ( Zinc-finger nucleases, ZFN) olyan mesterségesen kialakított fúziós fehérjék, amelyek kétféle feladatot betöltő egységgel rendelkeznek (1 ábra). cink-ujj fehérjestruktúrák felismernek egy meghatározott DNS-szekvenciát, és kötődésük szelektivitását több, általában 3-4 cink-ujj fehérjeegység együttese biztosíthatja. Egy kiválasztott célgén DNS-szekvenciáját informatikai programok analizálják, hogy meghatározzák azt a 9-12 bázisnyi DNSrégiót, amelyhez a cink-ujj egységek megbízhatóan kapcsolódni képesek. Mint a 1/ ábra szemlélteti, a komplexhez tartozik a FokI endonukleáz. Ez az enzim képes a DNS-molekula mindkét szálán törést okozni. z ábra azt is bemutatja, hogy a ZFN-komplexek egy jobb és egy bal oldali egységből állnak. Ezek között található egy 5-7 bázis nagyságú elválasztó szakasz, amely lehetővé teszi, hogy a két nukleázalegység öszszekapcsolódhasson, és kialakulhasson a hasításra képes fehérjeszerkezet. Minden egyes célgén esetében külön-külön tervezik meg a cink-ujj egységeket, hogy a DNS felnyitása a kívánt helyen következzen be. nukleázenzim által okozott DNS-hasítás működésbe hozza a sejtek kijavító folyamatait. két DNS-szálon bekövetkezett hiba kijavítása többféle módon játszódhat le. Ezek a folyamatok alapvetően különböző DNS-szerkezetet alakíthatnak ki (1/B ábra). cink-ujj fehérjeegységek N 5' 3' 5' 3' B N cink-ujj fehérjeegységek élgén Kettős szálú törés Beépítendő DNS Eredmény kijavítás típusa - nem homológ mutáció génbeépülés nem homológ végek összekapcsolása célgénnel homológ génkijavítás allélkicserélés homológ rekombináció 1. ábra cink-ujj nukleázok kiválasztott szekvenciaszakaszokon okoznak törést a DNS-molekulában, így a hiba javítása során génspe-cifikus mutációk keletkeznek, illetve irányítható az idegen DNS-molekula beépülésének helye (Davis és ui 2010 nyomán) : cink-ujj fehérjeegységek biztosítják a DNS-szekvencia-szakasz felismerését, míg a FokI nukleáz törést okoz a DNS-molekula mindkét szálában B: Mutáció, illetve DNS-szakasz beépülése történhet a törési hiba kijavítása során 2

nem homológ végek összekapcsolása ( nonhomologous end-joining NHEJ) során a törés két vége mintaszekvencia nélkül kapcsolódik össze. Eközben azonban gyakran vesznek el DNS-nukleotidbázisok vagy akár kisebb méretű szakaszok. Így ez a kijavítási folyamatsor a kiválasztott génben mutációt okozhat. Ennek a megközelítésnek a használhatóságát növényekkel is igazolták. Zhang és mtsai. (2010) a lúdfű alkohol dehidrogenáz enzim génjében (DH1) hoztak létre génspecifikus mutációkat. z DH1 gén szekvenciájának elemzésével meghatározták a lehetséges ZNF kötőhelyeket. Ezek ismeretében meg lehetett tervezni az azokhoz kapcsolódó cink-ujj fehérjeegységeket, amelyek a nukleázalegységekkel egészülnek ki. Informatikai programok segítik az említett fehérjék szintézisét biztosító DNS-szakaszok kialakítását, amelyeket aztán a növényi transzformációs vektorba kell építeni. z idézett kísérletben a ZFN-komplex kifejeztetése indukálható promóterrel történt. z első generációs T1 csíranövények DH1 génjének szekvenciaanalízise 16%-os gyakorisággal mutatta ki a különböző típusú mutációk jelenlétét ebben a génben. 1-142 bázisméretű hiányok vagy beépülések történtek. mutációk öröklődtek az utódnövényekben. ZFN okozta kettős szálú DNS törésének kijavítása történhet szekvenciaazonosságot mutató homológ DNS-szakaszok közötti rekombinációval (1/B ábra). Ezzel lehetővé válik a kiválasztott DNS-szakaszok vagy akár működésre képes génkonstrukciók elhelyezése a kromoszóma egy adott helyén. Erre szolgáltat példát Shukla és mtsai (2009) közleménye, amikor a ZFN technológiával irányítottan építették be a bakteriális foszfinotricin acetiltranszferáz (PT) herbicidrezisztencia gént a kukorica IPK1 génjébe, amely kulcsszerepet játszik a fitátszintézisben és így a szemek foszforfelhalmozásában. PT gén beépülése folytán az IPK1 gén meghibásodik, ezért csökken a fitátmennyiség, ami mind takarmányozási, mind a környezet foszforszennyeződésének mérséklése szempontjából kedvező hatású. 2. TLE nukleázok a specifikus génmérnökségben célzott génátalakítás elsődleges feltétele, hogy egy adott DNS-szekvenciához specifikusan, ugyanakkor variálhatóan lehessen DNS-kötést létrehozni, ami lehetővé teszi a célgén felismerését. Hasonlóan a ZFN technológiához a DNS-szekvencia-motívum felismerése más típusú megtervezett fehérjékre is alapozható, mint például a TLE ( transcription activator-like effectors) fehérjékre, amelyek a Xanthomonas növényi patogén fertőzése során számos gén kifejeződését szabályozzák. Közös jellemzője a TLE fehérjéknek, hogy nagymértékben konzervált középső régióval rendelkeznek, amelyekben 34 aminosavból álló szakaszok ismétlődnek. Ezek a szerkezeti egységek, ismétlődések egy-egy nukleotid megkötéséért felelősek, attól függően, hogy a 12. és 13. helyen milyen aminosavak találhatók. Mint a 2/ ábra szemlélteti az ismétlődések sorrendjével egy ismert DNS-szekvencia-szakaszhoz kötődő TLE fehérje építhető fel, amihez FokI endonukleáz kapcsolódik (2/B ábra). z így kialakított rekombináns fehérje a kívánt helyen hasítja a DNS mindkét szálát és az 1/B ábrán bemutatott rekombinációs eseményekre nyílik lehetőség. B 2. ábra kiválasztott DNS-szakaszok felismerésében résztvevő TLE fehérjék konzervált aminosav-ismétlődései, és a FokI nukleáz, amely a DNS-en kettősszálú törést hoz létre. specifikus nukleotid felismerésért felelős aminosavpárosok: aszparagin-glicin (NG) timin (T); hisztidin-aszparaginsav (HD) citozin (); aszparagin-izoleucin (NI) adenin (); aszparagin-aszparagin (NN) guanin (G) vagy adenin () TLeffector Resources enter ( www.taleffectors.com ). 3

Példaként egy nemesítési szempontból is fontos eredményt érdemes megemlíteni, amikor a TLE nukleáz technológiával a rizs bakteriális levélfoltosság elleni rezisztenciáját alakították ki (Li és mtsai 2012). Xanthomonas oryzae pv. oryzae baktérium fertőzésekor az Os11N3 érzékenységi gén promóterének irányított megváltoztatásával lehetőség nyílt tünetmentes rizsnövények előállítása (3. ábra). Ennél a megközelítésnél az embriogén rizssejteket grobacte- rium tumefaciens segítségével kellett transzformálni ahhoz, hogy mind a TLEn, mind a szelekciós markergén beépüljön és kifejeződjön a T0 növényekben. Ezektől a transzgénektől azonban a későbbi hasadó populációkban meg lehetett szabadulni, és így azonosítottak olyan a mutáns növényeket, amelyek már nem hordoztak idegen gént, és így nem tekinthetők GM növényeknek. 3. ábra z Os11N3 gén promóterében a TLEn technológiával specifikusan létrehozott mutáció tünetmentes rizsnövényeket eredményezett (felső levelek) a Xanthomonas oryzae bakté-riummal történt fertőzést követően. mutációt nem hordo-zó alsó levélen láthatóak a fertőzésből származó tünetek. 3. RNS-vezérelt genomszerkesztés a RISPR/as technológiával fentiekben bemutatott két módszeren túl nagy érdeklődés kíséri azt a megközelítést, amelyben RNSmolekula irányítja a célszekvencia felismerését. RISPR/as rendszer a növények esetében is lehetővé teszi az irányított mutagenezist (összefoglaló cikk: Belhaj és mtsai 2013). Mint a 4. ábra szemlélteti, a kívánt DNS-szakasz hasítását a két alegységből (HNH és Ruv) felépülő as9 nukleáz végzi, amely mindkét DNS-szálat elvágja. Ez a nukleáz komplexet képez az ún. egyszálú irányító RNS-molekulával (sgrns/single-guide RN), amely két elemből tevődik össze. 20 nukleotid nagyságú a cél DNS-szakasszal komplementer crrns-molekulából (RISPR- RN), illetve az azzal kölcsönható váz tracrrns-ből, ami elősegíti a as9 fehérje célba juttatását és a DNSszálak hasítását. Mint a 4. ábra is jelzi, a cél DNSszakasznak további három nukleotiddal (NGG) is ki kell egészülnie (PM), amiből a két utolsó guanin (G). 4. ábra RISPR/as9 komplex képes a crrns közvetítésével felismerni a cél DNS 20 nukleotidját, amely kiegészül az NGG nukleotidokkal (PM). tracrrns segíti a crrns érését, továbbá a szekvencia felismerést, illetve a as9 nukleáz két alegységének (HNH és Ruv) működését, amelyek a DNS mindkét szálát hasítják (Shan és mtsai 2013 nyomán). 4

RISPR/as9 módszer használatának feltétele, hogy a as9 nukleáz két fehérjealegysége, illetve az sgrns a növényi sejtekben szintetizálódjon. z 5. ábra bemutatja egy ilyen vektormolekula főbb komponenseit, amelyeket az grobacterium Ti plazmid két határszekvenciája (LB és RB) fog közre. Ebben a példában a as9 fehérje génjét egy ubiqutin promóter (PcUbi4-2) működteti. Indokolt lehet a növényi kódhasználat szerint megszintetizálni a as9 cdns-t és ellátni sejtmagi lokalizációs jellel, továbbá szükség van terminációs szignálra (T) is. kiméra sgrns (crrns+tracrrns) szintézisét az RNS polimeráz III promóter (U6) biztosítja a cél és váz DNSszekvenciákról. mennyiben stabil transzformáns előállítására kerül sor, akkor indokolt a szelekciós markergén, mint például a PT gén kifejeztetése, amely gyomirtószer-rezisztenciát biztosít a transzformánsok számára. Sok esetben mellőzhető a GM növények felnevelése, elegendő időlegesen, a génkonstrukció beépülése nélkül kifejeztetni a as9 fehérjét és az as9 nukleáz T sgrns Ubi HHN U6 LB promóter promóter PT RB 5. ábra Növényi genom szerkesztésére használható RISPR/as vektormolekula főbb elemei (részletek a szövegben, Fauser és mtsai 2014 nyomán) RISPR/as technológia sikeres alkalmazására példaként szolgál Shan és mtsai (2013) kísérlete, amikor albinó rizsmutánsokat hoztak létre a fitoén deszaturázenzim génjének ( OsPDS) célzott megváltoztatásával. 4. ábrán már bemutattuk az ebben a kísérletben használt mutagenezis alapmechanizmu- sát. rizskalluszokba génbelővéssel jutatták be a vektormolekulákat és antibiotikum-szelekcióval azonosították a transzformánsokat. Közel 10%-os gyakorisággal hoztak létre albinó, illetve törpe mutánsokat (6. ábra). Deléciókat és beépüléseket egyaránt visszaigazolt a mutánsok DNS-ének szekvenálása. 6. ábra rizs fitoénszintáz (OsPDS) génjében specifikusan indukált mutációk következtében albinó, illetve törpe növényeket lehetett regenerálni (Shan és mtsai 2013). génspecifikus mutagenezisen túl a RISPR/ as technológia felhasználható a kiválasztott gén kifejeződésének fokozására, illetve mérséklésére is. Ehhez olyan as9 fehérjevariánst használnak, amelynek nincs nukleázaktivitása, viszont rendelkezik az sgrns-en keresztül specifikus DNS-kötő képességgel. mennyiben ezt az inaktív as9 fehérjét fuzionáltatjuk akár a transzkripciót aktiváló, akár gátló regulátorfehérjével, akkor lehetővé válik egy kiválasztott gén kifejeződésének szabályozása. 5

4. Génspecifikus mutációk indukálása szintetikus oligonukleotidokkal Hagyományos módon a DNS-szerkezet megváltoztatását ionizáló sugárkezeléssel vagy mutagén hatású vegyületekkel végzik. Ezek a beavatkozások teljesen véletlenszerűen változtathatják meg egy vagy több gén nukleotidsorrendjét. Általában a növények magjait kezelik mutagénekkel, majd az első generációs M1 növényekről utódokat gyűjtenek, aztán az M2 generáció növényein megjelenhetnek az ismeretlen gének által okozott fenotípusos változások. Bár felismerhetők az új tulajdonságok, a mutációs programokban nem lehet tudni, hogy melyik gén megváltozása felelős annak kialakulásáért. Régi álma a mutációs megközelítést használó genetikusoknak és növénynemesítőknek, hogy célzottan, egyetlen kiválasztott génben hozzanak létre egy meghatározott szekvenciaszakaszon nukleotidbázis-cserét, ami aminosav-változást eredményez a kódolt fehérjében. genomszekvenálási programoknak köszönhetően tervezhetővé váltak a gén- és helyspecifikus beavatkozások, a fehérjék struktúrájának alakítása és ezzel a kívánt funkció létrehozása. Míg alsóbb rendű szervezetekben a homológ DNS-szakaszok közötti rekombináció megbízhatóan alkalmazható, a növények esetében nincs igazán lehetősége a megfelelő hatékonyságú célzott mutagenezis megvalósításának. Ezért a szintetikus oligonukleotidok által irányított mutagenezis ( Oligo Directed Mutagenesis, ODM) módszerének kidolgozása kiemelt figyelmet érdemel, mint azt összefoglalják Breyer és mtsai (2009). z első közleményben Beetham és mtsai (1999) szintetikus RNS/DNS kiméramolekulát lőttek be tenyészett dohánysejtekbe azért, hogy az acetolaktáz-szintáz enzim génjében okozott nukleotidcserével az enzimet rezisztenssé alakítsák a klórszulfuron herbiciddel szemben. Mint a 7. ábra bemutatja szintetikus egyszálú DNS-oligonukleotid (single stranded DN oligonucleotid, SDO) molekulával is megvalósítható egyetlen nukleotid kicserélése, amivel megváltoztatható egy gén működése vagy a kódolt fehérjében egyetlen új aminosav jelenik meg. génben kialakított stopkód a gén kikapcsolásához vezethet. z aminosav kicserélése jelentős hatással lehet a fehérje működésére. z SDO fragmentnukleotid szekvenciája komplementer (összekapcsolódásra képes) a célgén valamelyik DNS-szálának szekvenciájával, és a közöttük kialakuló kötés biztosítja a célgén felismerését. Ugyanakkor a SDO szintézise során beépíthető az az új nukleotid, amelyre ki kívánjuk cserélni a célgén kiválasztott nukleotidját. 7. ábra azt is szemlélteti, hogy a gazdasejt DNS-ének replikációja során kialakuló átmeneti D-hurok struktúra ad lehetőséget arra, hogy az SDO hibridizáljon a célgén komplementerszakaszával. nukleotidcseréhez szükség van sejt DNS-ének replikációs apparátusára, illetve a hibajavító folyamatok működésére. SDO-molekulákat a nukleázok degradálják, míg a kialakított új génszekvencia stabil és öröklődik a sejtek osztódása során. 50-80 nukleotidból álló szintetikus egyszálú DNS Szensz T vagy ntiszensz Párosodás Párosodás élszekvencia G G T G DNS-kijavító vagy -átmásoló rendszer T 7. ábra Szintetikus oligonukleotid beépítésével létrehozott nukleotidcsere a célgén szekvenciájában. (Bottka Sándor nyomán) 6

z ODM módszer széles körű használatához jelentősen növelni kell a jelenleg ismert hatékonyságot, ami több tényező optimalizálásával érhető el. z SDO-molekulák kémiája egy fontos faktor. Leghatékonyabbak a 30-60 nukluotidból felépülő molekulák. Ezeket a sejtekben meg kell védeni a nukleázoktól. stabilitást növeli a 3' végen foszforotioát internukleotid kötés kialakítása. zárt nukleinsav ( Locked Nucleic cid LN) struktúra N-alkil nukleotidokkal javíthatja a kettős DNS-szál, a duplex képződését. hatékonyság szempontjából meghatározó szerepe van annak, hogy milyen módszerrel juttatjuk be az SDO-molekulákat a sejtekbe, illetve a sejtmagokba. Erre a célra gyakran haszálnak génpuskát (9/B ábra), de a mesterséges membrángolyókba, az ún. liposzómákba csomagolt DNS-molekulák a növényi protoplasztokkal a sejtfaluktól megfosztott növényi sejtekkel történt fúzióval is bevihetők a sejtekbe. Ezt láthatjuk a 8. ábrán, ahol fluoreszcens jelöléssel ellátott SDO sejtmagi jelenlétét igazolja a citológiai felvétel lucernasejtekben. 8. ábra Fluoreszcens jelölést hordozó szintetikus DNS-molekulák kimutatása a lucernasejtek sejtmagjában liposzóma közvetítette felvétel után (Fodor és mtsai, nem közölt eredmény) z ODM módszer tökéletesítését segítheti egy olyan tesztrendszer kidolgozása, amellyel könnyen követhető az irányított mutációk bekövetkezése. Erre kínál lehetőséget a zöld fluoreszcens fehérje ( Green Fluorescent Protein, GFP) használata, amelynek mutáns változata nem fluoreszkál. Ha ezt a hibát korrigáljuk SDO-molekulával, akkor zölden fluoreszkáló sejteket kaphatunk. Ezek száma adja a specifikus mutációk gyakoriságát. z alábbi összeállítás bemutatja a vad típusú GFP aminosav- és nukleotidszekvenciáját, a hibát eredményező nukleotidszekvenciát, ami STOP jelként működik, illetve megadja a GFP-SDO nukleotidsorrendjét. Vad típusú GFP fehérje M V S K G E E L P T G V Vad típusú GFP gén... TG GTG G G GG GG GG TG TT GGG GTG... GFP-SDO 5' TG GTG G G GG GG GG TG TT GGG GTG-3' Mutáns GFP gén... TG GTG G G GG GG TG TG TT GGG GTG... Mutáns GFP fehérje M V S K G E STOP L P T G V kísérleti rendszer kialakításának első lépéseként olyan kukorica-sejtvonalat kellett létrehozni, amely hordozza a mutáns GFP gént. Ezért Dr. Tiricz Hilda szerkesztett egy transzformációs vektort, ami a mgfp génen kívül rendelkezik a bar rezisztenciagénnel, mint azt a 9/ ábra szemlélteti. z ábrán látható a génpuska, amellyel a ph25 vektort be lehetett lőni kukoricasejtekbe, majd a foszfinotricin herbiciddel kiszelektálni a transzformált szöveteket (9. ábra ), amelyek sejtjei hordozzák a mutáns GFP gént is. 7

HindIII HindIII SacI EcoRI BamHII EcoRI B ubi nos ubi bar nos ph25 9. ábra mutáns GFP (mgfp) gént hordozó kukorica-sejtvonal előállítása az ODM korrekciós kísérletekhez. (Dr. Tiricz Hilda és munkatársai kísérlete, nem közölt). transzformációs vektor a mgfp és a bar szelekciós markergénnel B. génpuska, amit használhatunk mind a transzgén, mind a SDO-molekulák sejtbe juttatására. mgfp és bar géneket hordozó rezisztens kukorica-kalluszszövet (jobb oldalon) a foszfinotricin herbicid szelekció során. bal oldali szenzitív szövetben nincsenek meg a transzgének. z ODM technológia működőképességét tesztelni lehetett azzal, ha a korrigáló SDO-molekulákat a mgfp gént hordozó transzgenikus kukoricasejtekbe génbe- lövéssel bejuttatjuk és zölden fluoreszkáló sejteket kapunk. Ilyen eseményeket mutat be a 10. ábra. 10. ábra mutáns GFP gén korrekciója folytán zölden fluoreszkáló sejtek azonosíthatók az SDO-molekulák GM kukoricasejtekbe történt belövése után. (Tiricz és mtsai nem közölt eredmény) : Kontroll kukorica tenyészett sejtek; B,, D.: Működő GFP fehérjét szintetizáló sejtek a mutáns GFP gén korrekciója után 8

Tekintettel a 7. ábrán vázolt folyamatokra az ODM technológia hatékonyságának növelését eredményezheti, ha a DNS-replikáció fázisában lévő sejtekbe juttatjuk be a SDO-molekulákat. kromatin szerkezetének fellazítása szintén megnövelheti a célszekvencia megtalálását, illetve a homológ szekvenciák közötti kicserélődést. korábban említett tanulmány, amelyet az European ommission's Joint Research entre (JR) Institute készített New Plant Breeding Techniques: State-of-the-rt and Prospects for ommercial Development címmel (2011) nagyszámú (22) ODM technológiával kapcsolatos szabadalmat sorol fel. Ezek elsősorban gyomirtószer-ellenálló növények előállításával kapcsolatosak. 5. Kitekintés fenti tanulmányban bemutatott lehetőségek elég meggyőzően tanúsítják, hogy igen jelentős előrehaladás történt a növényi gének, genomok irányított szerkesztésében (Puchta and Fauser 2013). Nehéz megjósolni, hogy melyik módszer fog elsősorban elterjedni a növénybiológiai kutatásban és természetesen a növénynemesítésben. RISPR/as technológia bizonyos előnyt élvez, mivel a rendszer egyszerűbb. z egyes módszerek jövőbeni használata erősen függ attól, hogy az uniós szabályozás melyik technológiával előállított növényeket mentesíti a GMO státusztól, és így a bonyolult és költséges engedélyezési eljárástól. Breyer és mtsai (2009) részletesen elemzik, hogy például az ODM technológia miért más, mint az EU irányelvekben definiált folyamat, ami GMO-kat eredményez. Lényeges szempont, hogy a bemutatott eljárások termékeit nem lehet megkülönböztetni azoktól a növényektől, amelyeket keresztezéssel vagy hagyományos mutagenezissel állítottak elő. Mint oly gyakran az EU-ban, bizottságok sora elemzi az új helyzetet és a döntés nehezen születik meg. z azonban kétségtelen, hogy ezek a bemutatott új technológiák igen jelentős szerepet töltenek be mind a tudományos kutatásban, mind a biotechnológiában és a növények nemesítésében. F elhasznált irodalom Beetham PR, Kipp PB, Sawycky XL, rntzen J, May GD (1999) tool for functional plant genomics: chimeric RN/DN oligonucleotides cause in vivo gene-specific mutations. Proc Natl cad Sci US 96: 8774 8778. Belhaj K, haparro-garcia, Kamoun S, Nekrasov V. (2013) Plant genome editing made easy: targeted mutagenesis in model and crop plants using the RISPR/as system. Plant Methods 9(1): 39. Breyer D, Herman P, Brandenburger, Gheysen G, Remaut E, Soumillion P, Van Doorsselaere J, usters R, Pauwels K, Sneyers M, Reheul D (2009) Genetic modification through oligonucleotide-mediated mutagenesis. GMO regulatory challenge? Environmental Biosafety Research 8(2): 57 64. Davis GD, ui X. (2010) Zinc finger nucleases for genome editing. GEN Genetic Engineering and Biotechnology News 30 (13): 1 2. Fauser F, Schiml S, Puchta H. (2014) Both RISPR/as-based nucleases and nickases can be used efficiently for genome engineering in rabidopsis thaliana. Plant Journal 79(2): 348 359. Li T, Liu B, Spalding MH, Weeks DP, Yang B. (2012) High-efficiency TLEN-based gene editing produces disease-resistant rice. Nature Biotechnology 30(5): 390 392. Lusser M, Parisi, Plan D, Rodríguez-erezo E. (2011) New Plant Breeding Techniques: State-of-the- rt and Prospects for ommercial Development European ommission's Joint Research entre (JR) Institute Puchta H, Fauser F (2013) Gene targeting in plants: 25 years later. The International Journal of Deveopmental Biology 57(6-8): 629 637. Shan Q, Wang Y, Li J, Zhang Y, hen K, Liang Z, Zhang K, Liu J, Xi JJ, Qiu JL, Gao (2013). Targeted genome modification of crop plants using a RISPR- as system. Nature Biotechnology (8): 686-688. Shukla VK, Doyon Y, Miller J, DeKelver R, Moehle E, Worden SE, Mitchell J, rnold NL, Gopalan S, Meng X, hoi VM, Rock JM, Wu YY, Katibah GE, Zhifang G, Mcaskill D, Simpson M, Blakeslee B, Greenwalt S, Butler HJ, Hinkley SJ, Zhang L, Rebar EJ, Gregory PD, Urnov FD. (2009) Precise genome modification in the crop species Zea mays using zincfinger nucleases. Nature 459: 437 441. Tester M, Langridge P (2010) Breeding technologies to increase crop production in a changing world. Science. 12: 327 (5967) Zhang F, Maeder ML, Unger-Wallace E, Hoshaw JP, Reyon D, hristian M, Li X, Pierick J, Dobbs D, Peterson T, Joung JK, Voytas DF (2010) High frequency targeted mutagenesis in rabidopsis thaliana using zinc finger nucleases. Proc Natl cad Sci US 107(26):12028 12033. 9