Hasonló dokumentumok
AKADÉMIAI DOKTORI ÉRTEKEZÉS

Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025)

Az Oxidatív stressz hatása a PIBF receptor alegységek összeszerelődésére.

Az ABCG2 multidrog transzporter fehérje szerkezetének és működésének vizsgálata

Daganat immunterápia molekuláris markereinek tanulmányozása biofizikai módszerekkel. Áramlási és képalkotó citometria

Egyetemi doktori (Ph.D.) értekezés tézisei. Receptor-orientált daganatterápia vizsgálata ErbB fehérjéket kifejező humán tumorokban

A zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban

ADATÉRTÉKEL ELJÁRÁSOK SEJTFELSZÍNI FEHÉRJEMINTÁZATOK ANALÍZISÉRE SZENTESI GERGELY

ZÁRÓJELENTÉS. Összefoglalás

MULTIDROG REZISZTENCIA IN VIVO KIMUTATÁSA PETEFÉSZEK TUMOROKBAN MOLEKULÁRIS LEKÉPEZÉSSEL

Válasz Dr. Kellermayer Miklós egyetemi tanár bírálatára:

Az AT 1A -angiotenzinreceptor G-fehérjétől független jelátvitelének vizsgálata C9 sejtekben. Doktori tézisek. Dr. Szidonya László

A doktori értekezés tézisei. A növényi NRP fehérjék lehetséges szerepe a hiszton defoszforiláció szabályozásában, és a hőstressz válaszban.

Biomolekuláris szerkezeti dinamika


Modern mikroszkópiai módszerek

Az ErbB receptorok konstitutív és ligand indukált asszociációinak kvantitatív jellemzése

Bírálat. Nagy Péter: Az ErbB fehérjék klaszterizációjának biofizikai karakterizálása és biológiai jelentősége című MTA doktori értekezésére

Her2 fehérje overexpresszió gyomorrákokban: Hazai tapasztalatok

Konfokális mikroszkópia elméleti bevezetõ

Vércsoport szerológiai kompatibilitás Választott vörösvérsejt készítmények indikációja. Dr. Csépány Norbert Transzfúziós tanfolyam Debrecen

A PROTEIN KINÁZ C IZOENZIMEK SZEREPE HUMÁN HaCaT KERATINOCYTÁK SEJTM KÖDÉSEINEK SZABÁLYOZÁSÁBAN

Két kevéssé ismert humán ABCG fehérje expressziója és funkcionális vizsgálata: ABCG1 és ABCG4 jellemzése

Molekuláris terápiák

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

Doktori tézisek. Dr. Turu Gábor Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Doktori Iskola

II./3.3.2 fejezet:. A daganatok célzott kezelése

OTKA nyilvántartási szám: K48376 Zárójelentés: A pályázat adott keretein belül az alábbi eredményeket értük el:

BIOFIZIKA. Metodika- 2. Liliom Károly. MTA TTK Enzimológiai Intézet

ZÁRÓJELENTÉS A MOLEKULÁRIS ONKOGENEZIS MECHANIZMUSAI GYAKORI DAGANATOKBAN C. PÁLYÁZAT TELJESÍTÉSÉRŐL

Diagnózis és prognózis

Transzgénikus növények előállítása

Szakmai zárójelentés

Fehérjeglikoziláció az endoplazmás retikulumban mint lehetséges daganatellenes támadáspont

Vakcinák / 9. Immunológiai és Biotechnológiai Intézet PTE KK

Kutatási beszámoló A p50gap intracelluláris eloszlásának és sejtélettani szerepének vizsgálata

A hem-oxigenáz/vegf rendszer indukciója nőgyógyászati tumorokban. Óvári László

Receptor-orientált daganatterápia vizsgálata ErbB fehérjéket kifejező humán tumorokban

ANTICORPORA MONOCLONALIA AD USUM HUMANUM. Monoklonális antitestek, embergyógyászati célra

eljárásokkal Doktori tézisek Szatmári Tünde Semmelweis Egyetem Klinikai Orvostudományok Doktori Iskola Sugárterápia Program

Immunológiai módszerek a klinikai kutatásban

Molekuláris biológiai technikák

A KAQUN-víz hatása onkológiai kezelés alatt álló betegeken. Randomizált vizsgálat.

Új irányok a biomolekuláris felismerés detektálásában

A KUTATÁS EREDMÉNYEI.

Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei. Gyulladásos szöveti mediátorok vazomotorikus hatásai Csató Viktória. Témavezető: Prof. Dr.

A sejtmembrán molekuláris szerveződése, membrán mikrodomének

10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik

Xenobiotikum transzporterek vizsgálata humán keratinocitákban és bőrben

A transzgénikus (GM) fajták fogyasztásának élelmiszer-biztonsági kockázatai

1. A kutatás célja, a munkatervben vállalt kutatási program ismertetése

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

A jel-molekulák útja változó hosszúságú lehet. A jelátvitel. hírvivő molekula (messenger) elektromos formában kódolt információ

ZÁRÓJELENTÉS. A pályázat címe: Az MHC I. sejtfelszíni szerveződése. OTKA ny. sz.: T Témavezető: Dr. Mátyus László. Magyar nyelvű összefoglalás

VIII. Magyar Sejtanalitikai Konferencia Fény a kutatásban és a diagnosztikában

Multidrog rezisztens tumorsejtek szelektív eliminálására képes vegyületek azonosítása és in vitro vizsgálata

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai alkalmazások. Emlékeztető: az abszorpció definíciója. OD = A = - log (I / I 0 ) = ε (λ) c x

Lumineszcencia. Dr. Vámosi György

Egy vörösbor komponens hatása az LPS-indukálta gyulladásos folyamatokra in vivo és in vitro

Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek

Tudományos publikációk:

A kapcsolófehérjék szerepe és lokalizációja a térdízület poszttraumás synovitisében

Az ErbB receptorok konstitutív és ligand indukált asszociációinak kvantitatív jellemzése

Inzulinutánzó vanádium-, és cinkkomplexek kölcsönhatásának vizsgálata vérszérum fehérjékkel

Genomiális eltérések és génexpressszió közötti kapcsolat vizsgálata, melanomák metasztázisképzésére jellemző genetikai markerek kutatása

Emlődaganatok gyógyszeres kezelés. Dr.Tóth Judit DE OEC Onkológiai Tanszék

Mikroorganizmusok patogenitása

EGYETEMI DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI. Áramlási citometriás FRET mérések optimalizálása és alkalmazása a majdnem teljes

Biomolekuláris kölcsönhatások vizsgálata felületi plazmonrezonancia elvén működő Biacore keszülékkel

2. Két elírás: 9. oldal, 2. bekezdés - figyelembe, fegyelembe, 57. oldal első mondat - foglalkozok, foglalkozom.

Lumineszcencia Fényforrások

ZÁRÓJELENTÉS. Fény hatására végbemenő folyamatok önszerveződő rendszerekben

A DOHÁNYZÁS OKOZTA DNS KÁROSODÁSOK ÉS JAVÍTÁSUK VIZSGÁLATA EMBERI CUMULUS ÉS GRANULOSA SEJTEKBEN. Sinkó Ildikó PH.D.

A KAR-2, egy antimitotikus ágens egyedi farmakológiájának atomi és molekuláris alapjai

Lymphoma sejtvonalak és gyerekkori leukémia (ALL) sejtek mikro RNS (mir) profiljának vizsgálata

Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen

K68464 OTKA pályázat szakmai zárójelentés

Röntgendiffrakció, tömegspektrometria, infravörös spektrometria.

PLASMA HUMANUM COAGMENTATUM CONDITUMQUE AD EXSTIGUENDUM VIRUM. Humán plazma, kevert, vírus-inaktiválás céljából kezelt

TRANSZPORTFOLYAMATOK 1b. Fehérjék. 1b. FEHÉRJÉK TRANSZPORTJA A MEMBRÁNONOKBA ÉS A SEJTSZERVECSKÉK BELSEJÉBE ÁLTALÁNOS

Fluazinam és klórthalonil gombaölő szerek okozta foglalkozási asztma

A BIZOTTSÁG 2009/120/EK IRÁNYELVE

3 He ionokat pedig elektron-sokszorozóval számlálja. A héliummérést ismert mennyiségű

Glikohisztokémiai és mikrovaszkularizációs prognosztikai faktorok tüd rákban. Doktori (Ph.D) értekezés tézisei. Készítette:

Dr. Csanády László: Az ioncsatorna-enzim határmezsgye: egyedi CFTR és TRPM2 csatornák szerkezete, működése c. MTA doktori értekezésének bírálata

Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól

A membránpotenciál. A membránpotenciál mérése

Betegséget okozó V2 vazopresszin receptor mutációk vizsgálata

Pécsi Tudományegyetem Egészségtudományi Kar Egészségtudományi Doktori Iskola Pécs Doktori Iskola vezetője: PROF. DR. BÓDIS JÓZSEF egyetemi tanár

A nemzetközi sportrendezvény-szervezési projektek sikertényezői és a siker megítélésének kritériumai

A CIKLONOK SZEMLÉLETES TANÍTÁSA KÖZÉPISKOLÁBAN THE SUGGESTIVE TEACHING OF THE CYCLONES IN A SECONDARY SCHOOL

1. EGFP transzfektált HEK sejtek sortolása NFAT jelátviteli vizsgálatokhoz.

Gyógyszervegyületek elektrofiziológiai szűrése nagy hatáskereszt-metszetű ( semi high-troughput ) rendszereken

Készítette: Futóné Szabó Margit Karcag, március 29.

I. MELLÉKLET ALKALMAZÁSI ELŐÍRÁS

Nemszinaptikus receptorok és szubmikronos Ca2+ válaszok: A két-foton lézermikroszkópia felhasználása a farmakológiai vizsgálatokra.

Liposzómák diagnosztikai és terápiás alkalmazásai I.

Az aminoxidázok és a NADPH-oxidáz szerepe az ér- és neuronkárosodások kialakulásában (patomechanizmus és gyógyszeres befolyásolás)

A pulzáló és folyamatos norfloxacin itatás összehasonlító vizsgálata csirkében és pulykában. Sárközy Géza

mintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6

Átírás:

RÉSZLETES BESZÁMOLÓ Az OTKA által támogatott konzorcium működésében az Uzsoki utcai Kórház feladata a szövetminták gyűjtése, előzetes feldolgozása, ill. a betegek utánkövetése, valamint az utánkövétésre alkalmas informatikai háttér megteremtése és fejlesztése volt. A Debreceni Egyetemen történt a metszetek jelölése, mikroszkópos elemzése és kiértékelése, valamint az egyéb sejtbiológiai és biofizikai kísérletek végrehajtása. A részletes beszámolót a két kutatóhelyre vonatkozóan elkülönítve mutatjuk be. Debreceni Egyetem 1. A pericelluláris hialuronsav humán emlőtumor sejtekben is gátolja a trastuzumab kötődését Korábbi kutatásaink során megállapítottuk, hogy a trastuzumab rezisztencia egyik oka az ErbB2 antitestkötő epitópjának maszkírozása lehet, és in vitro és állatkísérletek alapján a MUC 4 transzmembrán mucinról és a hialuronsavról kimutattuk, hogy részt vesz a maszkírozásban. Jelen vizsgálatainkban a hialuronsav ezen szerepét kívántuk humán emlőtumor mintákon megerősíteni. Ehhez kifejlesztettünk egy olyan képanalízis eljárást, amely képes a sejtmembrán azonosítására, és a membránon belül az ErbB2 re normalizált trastuzumab kötődés meghatározására, amit korreláltat a környező pericelluláris hialuronsav mennyiségével. A Matlab ban írt program felhasználásával az Uzsoki utcai Kórháztól kapott emlőtumor mintákon bizonyítottuk, hogy a hialuronsav denzitás negatívan korrelál a trastuzumab kötődés mértékével (1. ábra). 1. ábra. A hialuronsav gátolja a trastuzumab kötődését. Az emlőtumor metszeteket fluoreszcens jelöltünk háromféle antigén ellen: ErbB2 intracelluláris doménje (amely az ErbB2 mennyiségét jelentette), a fluoreszcens trastuzumab és fluoreszcens HABC (hyaluronic acid binding complex). A metszetek konfokális mikroszkópos vizsgálata és a képek kiértékelése után korreláltattuk egymással az ErbB2 re normalizált trastuzumab kötődést és a pericelluláris hialuronsav mennyiséget. A piros vonal a pontokra illesztett egyenes jelöli. A maszkírozás további bizonyítására a metszeteket hialuronidáz emésztésnek vetettük alá, ami a trastuzumab kötődésének fokozódásához vezetett. További kísérletekben bizonyítottuk, hogy az 1. ábrán látható negatív korreláció nem lehet spektrális átfedés vagy fluoreszcencia rezonancia energiatranszfer (FRET) következménye. Az eredmények összességében meggyőzően bizonyították, hogy a pericellulárisan elhelyezkedő hialuronsav gátolja a trastuzumab kötődését az antitest kötő epitóp maszkírozása által [1]. 2. Az elisidepsin támadáspontja a sejtmembrán lipid tutaj komponense Sikeresen tanulmányoztuk spanyol kollaborációs partnerünk (C. Galmarini, Pharmamar, Spanyolország) által rendelkezésünkre bocsátott, új támadáspontú kemoterápiás szer, az elisidepsin (Irvalec ) hatásmechanizmusát. Korábbi irodalmi adatok közvetetten arra utaltak, hogy a gyógyszer az ErbB fehérjékre, elsősorban az ErbB3 ra hat. Ezért az ErbB fehérjéket ki nem fejező CHO sejtekbe stabilan transzfektáltunk ErbB2 t és

ErbB3 at (az így létrehozott sejtvonalak: CHO ErbB2, CHO ErbB2 ErbB3), és összevetettük elisidepsin iránti érzékenységüket. Nem találtunk statisztikailag szignifikáns eltérést az IC50 értékekben. Szintén nem volt hatása az ErbB2 vagy ErbB3 expressziónak akkor, ha A431 sejtekbe (melyek jelentős endogén ErbB1 expresszióval rendelkeznek) transzfektáltuk őket. A431 és SKBR 3 sejtek ErbB3 expressziójának RNS interferencia segítségével történő gátlása szintén nem befolyásolta számottevő mértékben a sejtek elisidepsin iránti érzékenységét. Ezért következtetésünk szerint az ErbB1 3 fehérjék expressziója nem befolyásolja jelentősen a sejtek elisidepsin iránti érzékenységét. Ugyanakkor az elisidepsin az ErbB3 sejten belüli eloszlását módosítja. Ha ErbB3 citrine nel transzfektált A431 sejteket vagy CHO ErbB2 ErbB3 sejteket (amin később az ErbB3 t immunfluoreszcenciásan festettük) elisidepsinnel kezeltünk, a gyógyszer az ErbB3 klaszterizációját és internalizációját váltotta ki. Ugyanakkor az elisidepsin sem az ErbB1, sem az ErbB2 eloszlására nem volt semmilyen hatással. Az elisidepsin jelentősen befolyásolta a lipid tutajok struktúráját és eloszlását. Erre a következő bizonyítékok utalnak: a. A431 sejtekbe transzfektált, lipid tutajokban dúsuló GPIkapcsolt GFP gyorsan klaszterizálódott és internalizálódott elisidepsin kezelést követően. b. Hasonló viselkedést mutatott az A431 sejtek egyik endogén, lipid tutaj asszociált fehérjéje (PLAP placental alkaline phosphatase). c. A431 és SKBR 3 sejteket TMA DPH fluoreszcencia anizotrópia próbával jelöltünk meg. Elisidepsin kezelést követően a sejtmembránban a TMA DPH fluoreszcencia anizotrópiája csökkent. d. A membrán hidratáltságát jellemző Laurdan fluoreszcens próba GP (generalizált polarizáció) paramétere a fenti két sejttípusban elisidepsin hatására növekedett (2. ábra). A c d. pontokban leírt változások az elisidepsin mintához adása után 1 2 perccel megjelentek, utalva arra, hogy ezek lehetnek a gyógyszer által okozott elsődleges változások (és a többi, pl. általunk is tapasztalt, ErbB3 ra kifejtett hatások csak másodlagosak). Az anizotrópia csökkenése és a GP paraméter növekedése együttesen a lipid tutajok indukciójára, szerkezetük átalakulására utal. Ezek alapján azt a hipotézist állítottuk fel, hogy az elisidepsin elsődleges támadáspontja a sejtmembrán lipid tutaj mikrodoménje [2]. 2. ábra. A TMA DPH anizotrópia és a Laurdan GP értékének változása elisidepsin hatására A431 és SKBR 3 sejteken. A TMA DPH fluoreszcencia anizotrópiáját (A,C) és a Laurdan generalizált polarizációját (B,D) mértük a két feltüntetett sejtvonalon 10 M elisidepsinnel történő kezelést követően. Kontrollként az elisidepsin oldószerét, a DMSO t használtuk. Az átlag±sem értékeket tüntettük fel három független mérés alapján.

3. A lipid tutajok magas denzitása gátolja a lipofekció hatékonyságát Vizsgálatainkhoz gyakran van szükség fluoreszcens fehérjék nehezen transzfektálható primér sejtekbe ill. sejtvonalakba történő bevitelére. Ezért részletesen megvizsgáltuk, hogy milyen okok állhatnak ezen sejtek nehéz transzfektálhatósága mögött. A sejteket Lipofectamine2000 traszfekciós ágens segítségével transzfektáltuk GFP t kódoló plazmiddal, majd két nap múlva a lipid tutajok GM1 gangliozid tartalmát a kolera toxin B alegységének (CTX B) fluoreszcensen jelölt változatával festettük meg. Eredményeink szerint a sejtek lipid tutaj tartalma (ill. GM1 gangliozid tartalma) negatív korrelációt mutat a sejtek lipid segítségével történő transzfektálhatóságával (3. ábra). Ez a korreláció mind egy sejtvonal esetében sejtenként, mind az egyes sejtvonalak összehasonlításakor megnyilvánult, de elektroporáció esetén nem volt jelen. Fluoreszcens plazmiddal végzet kísérleteink szerint a magas lipid tutaj tartalmú sejtekben a lipoplex (plazmid és transzfekciós ágens komplexe) felvétele blokkolt. Ezen eredményeink rávilágítottak arra, hogy bár a legtöbb esetben az elfogadott elmélet szerint a transzfekció sikerét meghatározó lépés a DNS endoszómából történő kiszabadulása, abban az esetben, ha a plazmid felvétele jelentős mértékben gátolt, ez is lehet a sebesség meghatározó lépés [3]. 3. ábra. A sejtek CTX B festődése szigorú antikorrelációt mutat a GFP transzfekció hatékonyságával. A sejtek GFP expresszióját (A) és CTX B (B) festődését, a fázis kontraszt képet (C) és ezek egymásra rétegzését (D) mutatja az ábra. A sejteket (E) és membránjukat (F) Matlab alatt futó, vízfeltöltéses ( watershed ) algoritmust használó eljárással azonosítottuk. A képek két nappal a transzfekció után készültek. A méret indikátor 10 m nek felel meg. 4. FRET alapú módszer kidolgozása és alkalmazása ErbB fehérjék klasztereinek sztöchiometriájának meghatározására Jelentős előrehaladást értünk el az ErbB fehérjék klaszterizációjának kvantitatív leírásában. Egyrészt kifejlesztettünk egy új módszert (FSAB FRET sensitized acceptor bleaching), amellyel az asszociációban részt vevő fehérjék hányada meghatározható. A módszer alapja az, hogy fotolabilis akceptor és fotostabil donor közötti FRET kölcsönhatás esetében a donor gerjesztése az akceptor kiégetéséhez vezet. Mivel a donorral FRET kölcsönhatásban nem levő, tehát tőle messze található akceptor molekulák nem égnek ki, a

donorral kölcsönható akceptor aránya meghatározható. Az expressziós szintek ismeretében a heteroklaszterben levő molekulák átlagos sztöchiometriája is meghatározható. A módszer segítségével vizsgáltuk az ErbB1 és ErbB2 receptorokat nyugvó és EGF fel stimulált SKBR 3 sejteken. Megállapítottuk, hogy a receptorok már a stimuláció előtt is alkotnak heteroasszociátumokat, és az ErbB2 ErbB1 gyel heteroasszociáló hányada jelentősen megnő EGF stimulációt követően (10% ról 21% ra). A heteroklaszterben levő ErbB1 ErbB2 arány 1:1,5 volt stimulálatlan sejtekben, és ezt az EGF kezelés 1:4 re növelte. Ezen vizsgálatok megerősítették korábbi eredményeinket, ill. kvantitatív jellegük folytán hozzájárulnak az asszociációk jobb megértéséhez [4]. 5. Number and brightness mérések szerint az ErbB1 és ErbB2 eltérő klaszterizációs tulajdonságokat mutat Adaptáltuk a nemrég leírt number and brightness (N&B) módszert az ErbB1 és ErbB2 fehérjék homoklasztereinek tanulmányozására. A módszer által szolgáltatott legfontosabb paraméter a molekuláris klaszterek fényessége, ami a klaszterben levő molekulák számával arányos. Először az ErbB1 homoklasztereit vizsgáltuk ErbB1 egfp t különböző szinten kifejező stimulálatlan és EGF fel kezelt sejteken. Megállapítottuk, hogy az ErbB1 receptor csak magas expresszió esetén alkot molekuláris dimereket stimulálatlan sejtekben, azonban EGF hatására csaknem teljes mértékben dimerizálódik. EGF kezelést követően azonban nemcsak dimerek, hanem átlagosan 5 6 ErbB1 receptort tartalmazó klaszterek is megjelennek, melyek kolokalizálnak a klatrin burkú gödrökkel. Ezzel ellentétben az ErbB2 már nyugvó sejtekben is homoklasztereket alkot, amit ErbB2 myfp t kifejező sejteken vizsgáltunk. Az ErbB2 molekuláris szintű homoklaszterei mellett azonosítottunk olyan klasztereket is, melyek mérete a több száz nanométert is elérte. Ezen mikroszkopikus klaszterek részleges kolokalziációt mutattak a kaveolákkal. EGF kezelést követően az ErbB2 molekuláris homoklasztereinek mérete jelentősen csökkent, de ez a változás csak a mikroszkópikus klaszterekben volt kimutatható (4. ábra). Előállítottunk egy olyan ErbB2 variánst, amelyből a PDZ domén kötő régiót deletáltuk. Mivel ezen ErbB2 variáns asszociációs tulajdonságai a vad típuséhoz hasonlóak voltak, a PDZ domén kötő régió nem játszik jelentős szerepet az ErbB2 nagy homoasszociációs készségében [5]. 4. ábra. Az ErbB2 myfp homoklaszterizációs tulajdonságai nyugalomban levő és EGF stimulált sejteken. Szérum éheztetett (A) és 100 nm EGF fel stimulált (B) sejtek fényesség átlag intenzitás pontgrafikonja látható az ábrán. A fényesség értékeket külön külön értékeltük ki a mikroszkopikus klasztereken belül (szaggatott vonal) és kívül (folytonos vonal) kezeletlen (fekete) és EGF kezelt (piros vonal) sejteken (C).

6. A proximitás ligációs vizsgálat nem alkalmas a receptor klaszterizáció kvantitatív mérésére A fehérjeasszociációk mérésére általunk korábban alkalmazott módszerek (pl. FRET, N&B) nem vagy nehézkesen alkalmazhatóak szövetmetszeteken a rossz jel/zaj arány miatt. A nemrégiben kifejlesztett PLA (proximity ligation assay) módszer viszont használható szövetmetszeteken is, azonban kvantitatív jellegét még nem vizsgálták. Ezért a PLA módszert a fehérje klaszterek kvantitatív vizsgálatára már régen alkalmazott FRET tel vetettük össze. Főbb megállapításaink a következők voltak: a. Mind molekuláris asszociációk, mind intramolekuláris távolságok mérése esetén a FRET szignál az expressziós szinttől a várható lineáris összefüggést mutatta, míg a PLA esetében telítési effektust vettünk észre (5. ábra). b. A telítési effektus részben a PLA reakcióban részt vevő polimeráz enzim használatával magyarázható. c. Jelentős mértékű eltérést találtunk a PLA és a FRET mérések eredményei között, amikor különböző mintákon (pl. kontroll és növekedési faktor stimulált) hasonlítottuk össze a vizsgált receptorok (pl. ErbB1) asszociációit. Le kellett vonnunk azt a következtetést, hogy bár a PLA módszer az irodalomban igen érzékeny eljárásként kezd közismertté válni, kvantitatív mérések végzésére nem alkalmas, és az eredmények interpretációja csak igen gondosan megtervezett és kivitelezett kontroll kísérletek után lehetséges [6]. 5. ábra. Telítési effektus a PLA ban az antitest denzitás függvényében. A. SKBR 3 sejteken az ErbB2 két epitópja közötti proximitást mértük PLA segítségével. Az egyik epitóphoz kötődő oligonukleotiddal jelölt antitestet (pertuzumab) telítési koncentrációban adtuk, míg a másik epitóphoz kötődő, oligonukelotiddal jelölt antitestet (trastuzumab priming, trastuzumab P) különböző arányban kevertük jelöletlen trastuzumabbal. A PLA jel erősségét a trastuzumab priming antitest denzitása függvényében ábrázoltuk. B. Ugyanazon két epitóp közötti proximitást becsültük meg FRET segítségével. A donorral jelölt antitestet (AlexaFluor488 pertuzumab) telítő koncentrációban adtuk, míg az akceptorral jelölt antitestet (AlexaFluor546 trastuzumab) jelöletlen trastuzumabbal kevertük, és ábrázoltuk a FRET hatásfokot az akceptor denzitás függvényében. Uzsoki utcai Kórház 1. Minták feldolgozása és transzportja a Debreceni Egyetemre A Debreceni Egyetem Biofizikai és Sejtbiológiai Intézete számára készítettünk szövetmetszeteket ErbB2 t fokozottan expresszáló emlőtumoros mintákból és a mintákat szárazjégen elszállították Debrecenbe, ahol a mintákat további feldolgozásnak vetették alá. Ezen beteganyag klinikai feldolgozását elvégeztük és szintén a debreceni kooperáló munkacsoport rendelkezésére bocsátottuk. Azonban a trastuzumab kezelés hatásosságára vonatkozóan ezen adatokból nem várható statisztikailag értékelhető információ, mert a

betegek töredéke kapott csak trastuzumab kezelést. Az OTKA pályázat utolsó két évében tovább gyűjtöttük a szövet és a hozzájuk tartozó szérummintákat, és elkezdtük az utánkövetési adatok gyűjtését is, amelyek az idő rövidsége miatt csak korlátozott mennyiségben állnak rendelkezésre. 2. A sebészeti mintavétel folytatása Már az OTKA pályázat indulása előtt is végeztünk mintagyűjtést tumor miatt operált betegekből, de a jelen pályázat alatt tökéletesítettük a mintavétel technikáját és logisztikáját. A transzportlánc hatékonyabbá tétele során a mintavételt a patológus végzi, ezáltal maradéktalanul teljesül az az elv, hogy a tudományos célú mintavétel nem befolyásolja a rutin diagnosztikát. A minták életképessége, felhasználhatósága ezáltal tovább javult. Az utóbbi időben vett szövetminták mellé vérminta levétele és tárolása is megtörténik. 3. Betegdokumentáció, informatikai rendszer A klinikai adatok tárolására és a betegek követésére korábban általunk kifejlesztett MS Access alapú informatikai rendszert tökéletesítettük, funkcióit bővítettük. A rendszer emlődaganatok szempontjából fontos új prognosztikai faktorokkal történő kiegészítése megtörtént. A beteg klinikai adatainak rendszerbe történő bevitele kb. 3 4 héttel a mintavétel után történik, ugyanis ekkora realizálódik biztosan a szövettani lelet, valamint a perioperatív szövődmény megléte vagy hiánya is. Az adatbázis a beteg személyes adatait, előzményadatait, a mintavétel körülményeit, a minta számát és egyéb jellemzőit, az eltávolított daganatos szövet patológiai tulajdonságait, a szövetminta nyerése közben végzett műtét klinikai adatait és követési adatokat tartalmaz. A beteg személyes azonosítására szolgáló adatok és a klinikai adatok szétválasztását a rendszer képes megvalósítani. 4. Betegek követése A mintavételen átesett betegeink követését folyamatosan végeztük. A követés egy speciális ambuláns rendelés formájában történik, a klinikai adatokat az általunk kifejlesztett informatikai rendszeren rögzítjük. A betegkövetést szervezett, OEP által nem finanszírozott ambulancia keretében valósítjuk meg a kórház egyik rendelőjét használva. A követés adatait a saját informatikai rendszerünkben rögzítjük, melyek szintén titkosítva kerülnek a rendszerbe, a betegadatoktól elkülönülten. Az OTKA pályázat feltüntetésével született, a beszámolóban tárgyalt cikkek: 1. Váradi T, Mersich T, Auvinen P et al. Binding of Trastuzumab to ErbB2 Is Inhibited by a High Pericellular Density of Hyaluronan, J Histochem Cytochem 2012;60:567 575. 2. Váradi T, Roszik J, Lisboa D et al. ErbB protein modifications are secondary to severe cell membrane alterations induced by elisidepsin treatment, Eur J Pharmacol 2011;667:91 99. 3. Kovács T, Kárász A, Szöllősi J et al. The density of GM1 enriched lipid rafts correlates inversely with the efficiency of transfection mediated by cationic liposomes, Cytometry A 2009;75:650 657. 4. Szabó A, Szöllősi J, Nagy P. Coclustering of ErbB1 and ErbB2 revealed by FRETsensitized acceptor bleaching, Biophys J 2010;99:105 114.

5. Nagy P, Claus J, Jovin TM et al. Distribution of resting and ligand bound ErbB1 and ErbB2 receptor tyrosine kinases in living cells using number and brightness analysis, Proc Natl Acad Sci U S A 2010;107:16524 16529. 6. Mocanu MM, Váradi T, Szöllősi J et al. Comparative analysis of fluorescence resonance energy transfer (FRET) and proximity ligation assay (PLA), Proteomics 2011;11:2063 2070.