Az enzimek katalitikus aktivitású fehérjék. Jellemzőik: bonyolult szerkezet, nagy molekulatömeg, kolloidális sajátságok, alakváltozás, polaritás.



Hasonló dokumentumok
A fehérjék harmadlagos vagy térszerkezete. Még a globuláris fehérjék térszerkezete is sokféle lehet.

A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

A szénhidrátok lebomlása

3. Sejtalkotó molekulák III.

A szénhidrátok lebomlása

Az enzimműködés termodinamikai és szerkezeti alapjai

A fehérjék hierarchikus szerkezete

A fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások

I. Atomszerkezeti ismeretek (9. Mozaik Tankönyv: oldal) 1. Részletezze az atom felépítését!

AMINOSAVAK, FEHÉRJÉK

A sejtek élete. 5. Robotoló törpék és óriások Az aminosavak és fehérjék R C NH 2. C COOH 5.1. A fehérjeépítőaminosavak általános

A felvétel és a leadás közötti átalakító folyamatok összességét intermedier - köztes anyagcserének nevezzük.


Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015

Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek

,:/ " \ OH OH OH / \ O / H / H HO-CH, O, CH CH - OH ,\ / "CH - ~(H CH,-OH \OH. ,-\ ce/luló z 5zer.~ezere

Fehérjék. SZTE ÁOK Biokémiai Intézet

Vitaminok meghatározása és csoportosítása

Citrátkör, terminális oxidáció, oxidatív foszforiláció

kutatás során legfőbb eredményeinket a szerin proteázok aktiválódásának mechanizmusával és az aktiválódás fiziológiai következményeinek

KÉMIA 10. Osztály I. FORDULÓ

A piruvát-dehidrogenáz komplex. Csala Miklós

Szerkesztette: Vizkievicz András

Orvosi biokémia, molekuláris és sejtbiológia II. Az intermedier anyagcsere

Doktori értekezés. Kiss András László Témavezető: Polgár László professzor. 1. oldal


Az aminosav anyagcsere orvosi vonatkozásai Csősz Éva

ENZIMSZINTŰ SZABÁLYOZÁS

5. A talaj szerves anyagai. Dr. Varga Csaba

A kémiai energia átalakítása a sejtekben

1. Az élő szervezetek felépítése és az életfolyamatok 17

A tananyag felépítése: A BIOLÓGIA ALAPJAI. I. Prokarióták és eukarióták. Az eukarióta sejt. Pécs Miklós: A biológia alapjai

TRANSZPORTFOLYAMATOK 1b. Fehérjék. 1b. FEHÉRJÉK TRANSZPORTJA A MEMBRÁNONOKBA ÉS A SEJTSZERVECSKÉK BELSEJÉBE ÁLTALÁNOS

MÉRGEK SORSA AZ ÉLŐ SZERVEZETBEN ELŐADÓ DR. LEHEL JÓZSEF

Redoxi reakciók Elektrokémiai alapok Műszaki kémia, Anyagtan I előadás

Bevezetés a növénytanba Növényélettani fejezetek 2.

Azonosító jel: KÉMIA EMELT SZINTŰ ÍRÁSBELI VIZSGA október :00. Az írásbeli vizsga időtartama: 240 perc

A MITOKONDRIUMOK SZEREPE A SEJT MŰKÖDÉSÉBEN. Somogyi János -- Vér Ágota Első rész

Egy idegsejt működése


A nukleinsavak polimer vegyületek. Mint polimerek, monomerekből épülnek fel, melyeket nukleotidoknak nevezünk.

II. Grafikonok elemzése (17 pont)

A jel-molekulák útja változó hosszúságú lehet. A jelátvitel. hírvivő molekula (messenger) elektromos formában kódolt információ

4. FEHÉRJÉK. 2. Vázanyagok. Az izmok alkotórésze (pl.: a miozin). Inak, izületek, csontok szerves komponensei, az ún. vázfehérjék (szkleroproteinek).

XX. OXIGÉNTARTALMÚ SZERVES VEGYÜLETEK

A Ca 2+ szerepe a tormaperoxidáz enzim aktív szerkezetében. Szigeti Krisztián

Reakciókinetika és katalízis

4. SZERVES SAVAK. Az ecetsav biológiai előállítása SZERVES SAVAK. Ecetsav baktériumok. Az ecetsav baktériumok osztályozása ECETSAV. 04.

Ízérzet: az oldatok ingerkeltő hatása az agyközpontban.

9. előadás Sejtek közötti kommunikáció

Vitaminok csoportosítása

a NAT /2006 számú akkreditálási ügyirathoz

MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak

Kémia. Tantárgyi programjai és követelményei A/2. változat

Peptid- és fehérjék másodlagos-, harmadlagos- és negyedleges szerkezete

1. Tömegszámváltozás nélkül milyen részecskéket bocsáthatnak ki magukból a bomlékony atommagok?

A glükóz reszintézise.

A) Ásványi és nem ásványi elemek: A C, H, O és N kivételével az összes többi esszenciális elemet ásványi elemként szokták említeni.

1. előadás Membránok felépítése, mebrán raftok, caveolák jellemzője, funkciói

Affinitás kromatográfiai hordozók fejlesztése fehérjék szelektív elválasztására

Elektrokémia. A nemesfém elemek és egymással képzett vegyületeik

b./ Hány gramm szénatomban van ugyanannyi proton, mint 8g oxigénatomban? Hogyan jelöljük ezeket az anyagokat? Egyforma-e minden atom a 8g szénben?

DE Szerves Kémiai Tanszék

1. Lipidek, szénhidrátok, fehérjék felépítése, csoportosítása, jellemzése.

09. A citromsav ciklus

Vitaminok Ásványi anyagok

II. Biomérnöki műveletek. 1. Bevezetés

Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus. Az energiaközvetítő molekula: ATP

NE FELEJTSÉTEK EL BEÍRNI AZ EREDMÉNYEKET A KIJELÖLT HELYEKRE! A feladatok megoldásához szükséges kerekített értékek a következők:

Kevéssé fejlett, sejthártya betüremkedésekből. Citoplazmában, cirkuláris DNS, hisztonok nincsenek

3. Aminosavak gyártása

BIOLÓGIAI OXIDÁCIÓK BIOMIMETIKUS MODELLEZÉSE

Ásványi anyagok (trikalcium-citrát, trikalcium-foszfát, magnézium-citrát, vas-szulfát, cink-szulfát, rézszulfát,

NEM KONVENCIONÁLIS KÖZEGEKBEN LEJÁTSZÓDÓ ENZIMKATALITIKUS ÉSZTEREZÉSI REAKCIÓK VIZSGÁLATA

A fehérjék hierarchikus szerkezete

Az élelmiszerek mikrobiális ökológiája. Mohácsiné dr. Farkas Csilla

TAKARMÁNYOZÁSTAN. Az Agrármérnöki MSc szak tananyagfejlesztése TÁMOP /1/A

Bevezetés a biokémiába fogorvostan hallgatóknak 8. hét

KÉMIA évfolyam (Esti tagozat)

Bioinformatika előad

Biotranszformáció. Csala Miklós. Semmelweis Egyetem Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet

Az elemeket 3 csoportba osztjuk: Félfémek vagy átmeneti fémek nemfémek. fémek

Szén-dioxid semleges elektromos energia előállítása szerves szennyezőanyagokból mikrobiológiai üzemanyagcellákban

Aminosavak, peptidek, fehérjék

A vitaminok és az élelmiszerek kapcsolatáról

IX. Szénhidrátok - (Polihidroxi-aldehidek és ketonok)

Sporttáplálkozás. Étrend-kiegészítők. Készítette: Honti Péter dietetikus július

Enzimek. Enzimek! IUBMB: szisztematikus nevek. Enzimek jellemzése! acetilkolin-észteráz! legalább 10 nagyságrend gyorsulás. szubsztrát-specificitás

DER (Felületén riboszómák találhatók) Feladata a biológiai fehérjeszintézis Riboszómák. Az endoplazmatikus membránrendszer. A kódszótár.

Számolási feladatok. A = 17,5 % T = 17,5 % 32,5 % G és ugyanennyi C

R nem hidrogén, hanem pl. alkilcsoport

Bioaktív peptidek technológiáinak fejlesztése

KÉMIA ÍRÁSBELI ÉRETTSÉGI- FELVÉTELI FELADATOK 2001 (pótfeladatsor)

O 2 R-H 2 C-OH R-H 2 C-O-CH 2 -R R-HC=O

A bioenergetika a biokémiai folyamatok során lezajló energiaváltozásokkal foglalkozik.

INFORMATIKA EMELT SZINT%

3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)

BIOMOLEKULÁK KÉMIÁJA. Novák-Nyitrai-Hazai

MIÉRT KELL TÁPLÁLKOZNI?

TUMORELLENES ANTIBIOTIKUMOK

Átírás:

Enzimek

Az enzimek katalitikus aktivitású fehérjék Jellemzőik: bonyolult szerkezet, nagy molekulatömeg, kolloidális sajátságok, alakváltozás, polaritás.

Az enzim lehet: csak fehérje: Ribonukleáz A, lizozim, proteolitikus enzimek egy része koenzim és fehérje (apoenzim) szerves molekula fémion apoenzim + koenzim holoenzim Kofaktorok: Az enzimhez szorosan kapcsolódó fémion: Zn 2+, Ca 2+ (esetleg anion: Cl ) Szerves molekula: NAD +, NADP +, FMN.

KENZIMEK xido-reduktáz koenzimek Nikotinsavamid-adenin-dinukleotid (NAD + ) N C N 2 C C C N N N 2 ' C C 2 P P C 2 C C C C N 2 C + N C mononukleotid adenozin

Az oxidációs redukciós folyamat NAD+ + + ½ 2 NAD + / NAD+ + NAD + + 2 ΔGº = 221,1 kj/mol Eº = 0,32 V (standard redoxipotenciál) NAD + : lebontási és oxidációs folyamatokban, NAD+ + : szintézis és redukciós folyamatokban vesz részt

Flavin-mononukleotid; FMN és Flavin-adenin-dinukleotid; FAD 3 C C C C N C C N N C N 2 C C C N N C N C 2 P P C 2 3 C C C C C C C riboflavin N C 2 C N C Szoros kapcsolódás az apoenzimhez = prosztetikus csoport. NAD +, NADP +, FMN, FAD idrogénátvétel a tápanyag-molekulától, szállítás a terminális oxidáció felé.

Koenzim Q (Co-Q, ubikinon) 3 C C 3 3 C n = 5 10 n +2-2 + + kinon hidrokinon átalakulás

Szerep: hidrogének átvitele a flavoproteinektől, elektronok továbbítása a citokrom rendszerbe. Nincs fehérjerésze (apoenzimje). Citokromok: 4 pirrolgyűrű + 4 C = porfin. Szubsztituált származék = porfirin Citokrom a, b, c. Szerep: részvétel a terminális oxidáció és a fotoszintézis elektrontranszport rendszerében. Fe 2+ Fe 3+ ox. red.

Transzferáz (csoportátvivő) koenzimek Koenzim-A (Co-A, CoA-S) N C N 2 C C C N N N C P C 2 C 3 P P C 2 C C C N C 2 C 3 pantoténsav koenzim-a (CoA) C 2 C N C 2 C 2 S tioetanol-amin Szerep: acetilcsoport átvitel

Tiamin-pirofoszfát (TPP, tiamin, B 1 -vitamin) Szerep: acetaldehid átvitel Biotin (-vitamin) Szerep: karboxilcsoport átvitel Folsav, tetrahidrofolsav (TF, B 4 -vitamin) 2-N 2-4--6-metil-pteridin + p-amino-benzoesav + Glu Szerep: metil-, metilén-, formilcsoport szállítás

Piridoxál-foszfát (B 6 -vitamin) Transzaminázok, dezaminázok, AS-dekarboxilázok koenzimje Szerep: N 2 -csoport transzport Ciklikus-adenozin-monofoszfát (camp) Szerep: enzimműködés szabályozási mechanizmusa Adenozin-trifoszfát (ATP) Ciano-kobalamin (B 12 -vitamin) Szerep: metilcsoport áthelyezés ribóz dezoxiribóz átalakulás

Aszkorbinsav (C-vitamin) xido-reduktáz koenzim. Szerep: -csoport szállító (prolin hidroxilezése) idroláz, liáz, izomeráz, ligáz koenzimek

Fémionok szerepe az enzimműködésben Aktiválják az enzimet fehérje specifikusak Fémionok az enzimmolekula részei (fémionspecifikusak) Karboxipeptidáz (Zn 2+ ) fehérjehidrolízis. Piruvát karboxidáz (Mn 2+ ) cukorlebontás. β-amiláz (Ca 2+ ) glikogénlebontás. A fehérjék az α-aminosavakkal öttagú kelátokat képeznek.

Enzimek befolyása a kémiai reakciókra Reakció Katalizátor Akt. energ. (kj/mol) Sebess. állandó (sec 1 ) 75,6 2 2 2 + ½ 2 platinakorom 50,4 kataláz 8,4 sósav 103,3 karbamid 2 N 3 + C 2 ureáz 52,1 szacharóz glükóz + fruktóz sósav invertáz 109,2 48,3 10 4 10 5 3 C 2 + 2 C + + szénsav anhidratáz 3 10 2 6 10 5

Enzimreakciók kinetikája Az enzim: az aktiválási energiát csökkenti, új reakció utat nyit meg. E + S E = enzim S = szubsztrát P = termék k 1 k 2 k 3 ES E + P Az ES komplex keletkezésének sebessége: v 1 = k 1 [E] [S]

A bomlás (termékképződés, k 3 ; visszaalakulás, k 2 ) sebessége: v 2 = (k 2 + k 3 ) [ES] A termékképződés sebessége: v 3 = k 3 [ES] Stacionárius állapotban: v 1 = v 2 k 1 [E] [S] = (k 2 + k 3 ) [ES] ([ E] o [ ES] )[ S] [ ES] k 2 + k k = = K m, K m = Michaelis Menten-állandó K m 10 3 10 7 mol/dm 3 között A komplex stabilitása nő 1 3

Az enzimek hatása az aktivitási energiára ΔE = Az ES komplexet stabilizáló energia. ΔE* = Az átmeneti állapot energiacsökkenése. E a = A nem katalizált reakció aktiválási energiája. E a * = A katalizált reakció aktiválási energiája.

A koncentrációk változása az enzimreakciók során

A v reakciósebesség változása az [S] szubsztrátkoncentráció függvényében V max = k 3 [ES] max = k 3 [E o ]

Michaelis Menten-egyenlet: v = V max [ ] [ S] K S m + a [S] << K m a reakció a szubsztrátra nézve elsőrendű. a [S] >> K m a reakció sebessége a szubsztrátra nézve nulladrendű. K m = V max 2 szubsztrátkoncentráció V max /2-nél.

Az enzimreakciók sebességének kifejezése Katal vagy kat mol szubsztrát Kat = = 1 mol sec 1 sec 10 6 kat = mikrokatal 10 9 kat = nanokatal 10 12 kat = picokatal Molekuláris aktivitás MA = mol min 1 mol fehérje 1 (1 molekula enzim által időegység alatt átalakított szubsztrátmolekulák száma)

Molekuláris aktivitás Enzim Maximális MA Szénsav anhidráz Acetil-kolin észteráz Laktát dehidrogenáz Kimotripszin Triptofán szintetáz 600000 25000 1000 100 2

Az enzimreakciók sebességének hőmérséklet- (a) és p- (b) függése

Csoport xido-reduktázok Enzimek elnevezése, osztályozása atás, illetve szubsztrát oxidációs-redukciós reakciók >C--csoport >C=-csoport >C=C-csoport >C-N 2 -csoport >C-N-csoport NAD+ + és NADP+ + Transzferázok csoportok átvitele C 1 -csoport >C- vagy C-csoport acilcsoport glikozilcsoport foszfátcsoport kéntartalmú csoport

Csoport idrolázok Liázok Izomerázok Ligázok atás, illetve szubsztrát hidrolitikus folyamatok észterek glikozidkötés peptidkötés egyéb C N-kötés savanhidridek szubsztitúció kettős kötésre >C=C-csoporthoz >C=-csoporthoz >C=N-csoporthoz izomerizációs reakciók racemizációs reakciók kötésképzés ATP-energia rovására kötéstípus: C, C N, C S, C C.

Az enzimreakciók mechanizmusára kidolgozott elképzelések Kulcs zár-teória (Emil Fisher; 1890) Indukált illeszkedés (Koshland, 1920) Fluktuációs modell (Straub és Szabolcsi, ~1930) Aktív centrum = kötőhely + katalitikus hely

Kulcs zár-teória (E. Fisher) Az enzimmolekula felületi szakaszába a szubsztrát úgy illik, mint kulcs a zárba. Indukált illeszkedés (Koshland) Másodlagos kötőerőkkel (~ 50 kj/mol) (kovalens kötés: 100 200 kj/mol) Fluktuációs modell Szabad enzimmel: Relaxált (laza) ES-komplexben kötött: Tense (feszített)

Az enzim és szubsztrát kölcsönhatás a.) Kulcs-zár-elmélet, merev illeszkedés; b.) a szubsztrát inaktív hely konformációjának kialakulása (induced fit); c.) a szubsztrát az enzimmolekulák közül csak a megfelelő konfigurációjú alakkal reagál (fluktuációs fit).

A szerkezet és a működés kapcsolata a biokatalízisben Az aktív centrum szerepe: Az aktív centrum: kötőhely milyen szubsztráttal reagál koenzim (kofaktorok) kapcsolódása katalitikus hely milyen reakciót katalizál Az enzimmolekula csak kis részét foglalja el.

áromdimenziós szerkezetű Egymástól távoli részek közel kerülhetnek. Kölcsönhatások új tulajdonságokat alakíthatnak ki (Ser nukleofillé, reakcióképessé válik, Glu karoxilcsoportja semlegessé válhat). Az enzimmolekula és a szubsztrát közötti kapcsolat kulcs zár indukált illeszkedés fluktuációs kapcsolat

A szerin-proteinázok szerkezetének hasonlósága. A térszerkezet tekintetében különböző szakaszokat a fekete vonalak jelzik. a.) kimotripszin, b.) elasztáz

Proteolízis R 1 C C N R 2 C + 2 R 1 C C + 2 N R 2 C Észterolízis R 1 C R 2 + 2 R 1 C + R 2 A két reakciót általános alakban a következőképpen írhatjuk: R C X + 2 R C + X

Reakció a kimotripszin és a p-nitro-fenilacetát (pna) között C C 3 + enzim + enzim + 2 enzim + C C C 3 C 3 + acetát + N 2 p-nitro-fenil-acetát N 2 p-nitro-fenol neutrális közegben sárga

A pna két lépésben válik termékké E + S ES E EP 2 P 1 P 2 gyors lassú P 1 = az alkohol-, (peptidek esetében az amid) rész, P 2 = a szubsztrát savrésze, EP 2 = az acil enzim intermedier.

A katalitikus funkcióra való alkalmassá válás mechanizmusa C A s p C N N Ser 195 A sp C 102 C C 102 N C C N C Ser 195 is 57 is 57

Az oldalláncok kölcsönhatása a szerin-proteinázok aktív centrumában. A töltésrelé rendszer két oldalról is (Asp-102 és is-57, illetve Asp-194 és Ile-16) biztosítja, hogy a Ser-195 oxigénje nukleofil tulajdonságú lehessen.

idrogénkötés hálózat: A negatív Asp-102 a is-57 imidazolja segítségével protont von el a Ser-195- től a hidroxil oxigén nukleofillé válik támadhatja az észter- vagy peptidkötést. (A másik oldalról segít az Asp-194 és az Ile-16) Az enzim és a szubsztrát közti kötés: legtöbbször 12 50 kj mol 1 néha kovalens kapcsolat (200 450 kj mol 1 ) (ES komplex izolálható) Aktív centrum a felszín alatti mélyedésben. A poláros környezet segíti a szubsztrát megkötődését.

A katalízis mechanizmusa A szerin-proteinázok működése A proteinázok hidrolitikus reakciókat katalizálnak, peptid- vagy észterkötéseket hasítanak. A reakció mechanizmusa tanulmányozható a kimotripszin és a p-nitro-fenil-acetát között. A Ser-195 alkalmassá válása a reakció katalizálására. (A szomszédos aminosavak kémiai módosítása folytán.) Minden szerin-proteinázban megvan a töltésvándorlást elősegítő csoport. A cisztein-proteinázokban is azonos a mechanizmus (nukleofil atom a kén).

A szerin-proteinázok működésének mechanizmusa. Im: is-57 imidazolgyűrűje; TI és TI': tetraéderes intermedierek; P: távozó csoport, P': acilcsoport. (EP') (P') C R Im + - C R deacilálás (E) Im C N R' (S) R acilálás Im + - C R N R' (ES) (TI') Im + - C R 2 (P) R' N2 Im C R (ES') Im - C R + N R' (TI)

A hasítás mechanizmusának összefoglalása: Ser-195 nukleofil oxigénje támadja a szubsztrát elektrofil =C= csoportját. (1) Tetraéderes acil enzim-komplex, előmozdítja a protonelvonást. (2) A is-57 protont ad a peptidkötésnek kötés felszakad, aminrész a is-57-hez kapcsolódik. (3) Az aminrész a is-57-ről leszakad P 1 eldiffundál, helyét egy 2 foglalja el. (4) Töltésvándorlás + -t von el a víztől a Ser- 195-höz kapcsolódó =C= csoportot támadja. (5) Tetraéderes intermedier (lehetővé teszi a P 2 acilcsoport eltávolítását). (6) P 2 eldiffundál enzim eredeti állapotba kerül. (7)

A szerin-proteinázok és a szubsztrát kötőhely felépítése Kimotripszin: aromás oldalláncok karboxilját Pepszin: aromás oldallánc aminocsoportját Tripszin: bázikus oldalláncok karboxilját Elasztáz: csak kisméretű oldalláncok karboxilját hasítják legnagyobb sebességgel. A proteináz specificitását a kötőhely és a szubsztrátzseb szerkezete határozza meg. Pl. tripszin: nagyméretű szubsztrátzseb negatív töltésű aszparaginsavval a pozitív töltésű aminosav-oldalláncok C csoportját hasítja legnagyobb sebességgel.

A szerin-proteinázok szubsztrátkötő helyének felépítése. Az enzimek szubsztrátspecificitását a szubsztrátkötő zsebben lévő oldalláncok méretei és tulajdonságai szabják meg. N C C C 2 C 2 C 2 C 2 + N 3 - C C 2 C N C 2 Gly 216 Gly 226 Asp 189 is-57 Ser-195 Lizil- Tirozil- N C C 2 C C C C C C C 2 C C N C 2 Gly 216 Gly 226 Ser 189 is-57 Ser-195 Alanil-oldallánc N C 3 C 3 C 3 C 3 C 2 C C C C C N C 2 Val 216 Thr 226 Ser 189 is-57 Ser-195 a.) tripszin b.) kimotripszin c.) elasztáz

A karboxipeptidáz működése Exopeptidáz: a C-terminális aminosavakat hasítja. Karboxipeptidáz A: nagyméretű aromás, Karboxipeptidáz B: bázikus aminosavakat hasítja. Aktív centrum: Zn; is-69, is-196, Glu-72

A glicil-tirozin bontásának mechanizmusa 1. Szubsztrát C Arg-145 pozitív töltésű oldallánca. 2. Szubsztrát tirozil-része a zsebszerű mélyedésben. 3. Az N-csoport hidrogénkötést létesít a Tyr-248 -csoportjával. 4. A >C=-csoport oxigénje koordinációs kötésbe lép a cinkkel. 5. A szubsztrát terminális N-csoportja víz Glu-270. C-csoportjával. 6. Az enzim Tyr-248 -ja protont ad a hasítandó peptidkötésnek. 7. A Glu-270 támadja a szubsztrát karbonilcsoportját anhidrid-szerű kapcsolat. 8. Az anhidrid hidrolizál.

A cink szerepe: Zn hatására a peptidkötés C=-csoportja polarizálódik; elektrofilebb lesz érzékennyé válik a nukleofil támadásra. (A Glu-270 szintén besegít.) Csak a szabad C-terminális felől megy a reakció (kötés az Arg-145-tel).

A karboxipeptidáz működésének mechanizmusa glicil-tirozin hidrolízise alapján. A szubsztrát kötéseit vastagabb vonalak jelölik. a.) b.) is 196 Zn is 69 Glu 72 Glu 270 C - 2 N C 2 C C- 2 N C C 2 Arg + 145 Tyr 248 is 196 Glu 270 Zn Glu 72 - C is 69 C 2 - C C 2 C N 2 C N Arg+ 145 Tyr 248 2

A karboxipeptidáz működésének mechanizmusa glicil-tirozin hidrolízise alapján. (folyt.) A szubsztrát kötéseit vastagabb vonalak jelölik. c.) d.) is 196 Zn is 69 C 2 C C- Arg + 145 Glu 72 2 N Tyr 248 C 2 - Glu 270 C 2 C N is 196 Zn is 69 C 2 - C C Glu 72 N C Glu 270 C C N 2 2-2 Arg + 145 Tyr 248

Fémionok enzimműködés Szinergizmus = hatás erősítése Antagonizmus = hatás csökkentése Piruvát-kináz Mg 2+ Ca 2+ I Zn 2+ Cd 2+

A karboxipeptidáz A enzim térbeli lefutása (egy polipeptidlánc, 307 As)

A lizozim működése Glikozidbontó, a mureint hidrolizálja. (NAG: N-acetil-glükózamin) (NAM: N-acetil-muraminsav) Aktív centrum: Asp-52, Glu-35; hidrogéndonorok és akceptorok. at vagy több monoszacharidból álló részt hidrolizál a 4. és 5. cukorrész között. A 4. cukor csak torzulva fér el az aktív centrumban.

A katalízis mechanizmusa: 1. A Glu-35 + -t ad a C 1 -atomnak a kötés hasad. 2. A 4. cukor karbóniumionná (+) alakul. 3. 5. 6. cukorrész leszakad és eldiffundál. 4. Karbóniumion + 1 4 tetraszacharid eldiffundál. 5. Glu-35 protonálódik kész újabb glikozidkötés hasítására. (6. Asp-52: segíti a karbóniumalak stabilitását negatív töltésével).

Az enzim-szubsztrát komplex szerkezete a lizozim működése során. A szubsztrát az aktív centrummal kialakult árokban helyezkedik el; hasítása a D és E részek között történik az itt lévő glikozidkötés szomszédságában elhelyezkedő Asp-52 és Glu-35 oldalláncok közreműködésével

Enzimműködés és molekulaméret Enzim egy polipeptidláncból. Több polipeptidláncból: omooligomerek: azonos szerkezet, azonos funkció. eterooligomerek: azonos funkció, eltérő szerkezet (izoenzimek). Struktúrához (membránhoz) kötött enzimek; nem fehérjével alkotott molekuláris komplexek. Eltérő funkciójú polipeptidláncok: (katalitikus és regulációs alegység).

Enzimkomplexek: többféle funkciójú enzim kapcsolódása egy folyamatsor katalízisére. (Piruvát dehidrogenáz komplex: 24 molekula piruvát dehidrogenáz + 1 molekula 24 alegységből álló dihidrolipoil transzacetiláz + 12 molekula dihidrolipoil dehidrogenáz). Multifunkcionális fehérjék: az elkülönült láncszakasz funkcióképes, önálló enzim.

Az enzimműködés szabályozása A molekuláris szintű szabályozás feltételei: A fehérje szerkezete megváltozzék. A szabályozó anyagok nem szubsztrátok és nem koenzimek. Az enzimnek legalább két extrém konformációs (aktív inaktív) alakja van. Aktív inaktívvá, inaktív aktívvá alakulhat. Az enzim működésének be- és kikapcsolása: Allosztérikus szabályozás: szábályozó anyag laza kölcsönhatása az enzimmel. Posztszintetikus kémiai módosításon keresztül (kémiai kötések is megváltoznak).

Szabályozás kooperáció útján allosztérikus enzimek Effektor más helyen kapcsolódik, mint a szubsztrát más hely hatás. Enzim: páros számú polipeptidlánc 1-1 aktív centrummal (Szimmetrikus szerkezet). Két konformációs állapot: R laza: nagy az affinitása a szubsztráthoz. T feszített: kicsi az affinitása a szubsztráthoz. Mindkét alegység csak egyféle konformációban lehet: RR vagy TT.

A szubsztrát a T alakhoz nem kötődhet, R kettő szubsztrátot is köthet. Szubsztrát távollétében R és T egyensúlyban. allosztérikus egyensúlyi állandó L = [T o ]/[R o ] Aktivátor elősegíti az R, inhibitor stabilizálja a T konformációt.

Feed-back (visszacsatolás) szabályozás Lehet serkentő vagy gátló. L-treonin E 1 E 2 E 3 E 4 E 5 A B C D L-izoleucin treonin dehidratáz gátlása Negatív feed-back: a rendszert stabilizálja. Pozitív feed-back: a rendszert kimozdítja stabilitásából.

Szabályozás posztszintetikus módosítás útján A kovalens kötések irreverzíbilis megszüntetésével Előalakok aktiválása proteolitikus enzimekkel. Limitált proteolízis (csak kevés kötés hasítódik). Tripszinogén tripszin + hexapeptid * *négy Asp, erősen negatív Pepszinogén pepszin + 42 aminosavból álló peptid Nincs bázikus As Ip: 3,8 1,5 16 bázikus aminosavval

Limitált proteolízis: elektrosztatikus gát eltávolítása kialakul az aktív konformáció. Tripszinogén Kimotripszinogén Proelasztáz Karboxipeptidáz közös aktivátora a tripszin Proteináz inhibitorok 6000 850000 Da közötti molekulatömegű fehérjék. Igen szorosan kötődnek az enzim aktív centrumához. (ΔGº = 60 80 kj/mol) Igen hatékony szubsztrát analóg, de az enzim rendkívül nehezen alakítja át.

Enzim inhibitor komplex befagyasztott állapotban marad [EI]. Szoros kölcsönhatás, mert: az enzim és inhibitor fehérje között csaknem tökéletes a komplementaritás. Inhibitorok feladata: védik a sejtek fehérjéit az intracelluláris proteinázoktól, védik a szövetet a másik szövet proteolitikus enzimjeivel szemben. Antinutritív hatás: megakadályozzák a bélben a fehérje lebontását, akadályozzák az enzimek működését.

Inhibitorok Szója inhibitorai: Kunitz-inhibitor Bowman Birk-inhibitor Marhapankreász Kunitz-, Kazal-féle inhibitor Tyúktojás voinhibitor Tej inhibitorai Gátlás tripszin kimotripszin plazmin elasztáz trombin tripszin kimotripszin tripszin tripszin kimotripszin papain tripszin kimotripszin plazmin

Szabályozás reverzíbilis posztszintetikus módosítás útján Foszforilálás protein kinázokkal: Protein + ATP foszfoprotein + ADP Foszforilálás a Ser- és Thr-oldalláncokon keresztül. Lehet be- vagy kikapcsoló hatású. Defoszforilálás: Foszfoprotein + ADP protein + ATP

Az enzimreakciók gátlása Az enzimek irreverzíbilis gátlása A gátló anyag kovalensen kapcsolódik: megváltozik a konformáció inaktiválódás, a gátló anyag a katalitikus szakasz szerkezetét változtatja meg. A szabad szulfhidril-csoport módosítása: cisztein + jód-acetát karboximetil-cisztein C 2 S C 2 S C 2 C N C C + IC 2 C N C C + I ciszteinil- jód-acetát karboximetil-cisztein oldallánc

Szerin + diizopropil-fluoro-foszfát A szeril oldallánc módosítása diizopropil-fluorofoszfáttal: foszfo-diizopropilszármazék C ( C 3 ) 2 C(C 3 ) 2 P C 2 + F F P + C 2 C ( C 3 ) 2 N C C C (C 3 ) 2 N C C szeril-oldallánc diizopropil-fluoro-foszfát foszfo-diizopropil származék

Az enzimek reverzíbilis gátlása K I = [ E][ I] [ EI] E + I EI-komplex ahol: K I = inhibitor állandó Etilénglikol- és metanol-mérgezés elleni terápia: C 2 NAD + NAD + + C C C 2 C 2 C etilénglikol glicerinaldehid oxálsav etanol NAD + NAD + + C 3 C C metilalkohol formaldehid hangyasav etanol

Etanol a glikolaldehid (formaldehid) képződésének kompetitív inhibitora Nagymennyiségű alkohol = élet Absztinencia = mérgezés! Az enzimműködés gátlásai inhibitorok Lehet: reverzíbilis vagy irreverzíbilis Kompetitív (versengő) gátlás I EI ( E + T I ) E S ES E + T s I = inhibitor EI = enzim inhibitor komplex

Pl. szukcinát-dehidrogenáz borostyánkősav dehidrogénezés fumársav Inhibitor lehet: malonsav, oxálecetsav. (asonló szerkezetű molekulák.) Szulfonamid terápia: (folsav-szintézis gátlás) p-amino-benzoesav p-amino-szulfonsav-amid p-amino-szulfonsav Szubsztrátfelesleg-gátlás Tejsav (laktát) dehidrogenáz folsav folsav piroszőlősav

Unkompetitív gátlás E+S ES E + T ESI Szubsztrát inhibitor hármas komplex

Nem kompetitív gátlás S ES I E + T E I S ESI E + T + I EI Alkohol dehidrogenáz dimer Alkohol acetaldehid Zn 2+ -elvonás = reverzíbilis gátlás

Irreverzíbilis gátlás Pb 2+, g 2+, Ag +, Ca 2+ (~S, ~, ~N 2 ) konc. 2 S 4, konc. N 3, triklór-ecetsav, szulfo-szalicilsav fehérjekicsapók. CN F, S 2, C a fémeket blokkolják.

Enzimaktivitás gátlások Gátlás Vmax KM Specif. Megf. Kompetitív nem vált. e. nő sp. r. Unkompetitív e. csökk. csökk. ált. sp. ált. r. Nem kompetitív e. csökk. nem vált. ált. n. sp. r. v. ir. Nem változik Nem vált. Erősen csökken E. csökk. Specifikus Sp. Általában specifikus Ált. sp. Általában nem specifikus Ált. n. sp. Reverzíbilis r. Általában reverzíbilis Ált. r. Reverzíbilis vagy irreverzíbilis r. v. ir.

Az enzimműködést befolyásoló tényezők ENZIMMŰKÖDÉS KFAKTRK KENZIMEK EFFEKTRK KÖRNYEZETI TÉNYEZŐK AZ AKTIV CENTRUMBA ÉPÜLT SPECIÁLIS INK ATÁSFAKTRK p ŐMÉRSÉKLET AKTIVÁTRK EFFEKTRK ALLSZTÉRIKUS INIBITRK DENATURÁLÓ ANYAGK