Képelemzési módszerek. Automatikus retina képelemzési módszerek 3/3/2011. MI módszerek a képelemzésben. A retina analízis digitális képei



Hasonló dokumentumok
Hadházi Dániel.

Képfeldolgozó eljárások áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 9. ea ősz

Mit látnak a robotok? Bányai Mihály Matemorfózis, 2017.

CARE. Biztonságos. otthonok idős embereknek CARE. Biztonságos otthonok idős embereknek Dr. Vajda Ferenc Egyetemi docens

Sergyán Szabolcs szeptember 21.

Távérzékelés a precíziós gazdálkodás szolgálatában : látvány vagy tudomány. Verőné Dr. Wojtaszek Malgorzata

Képfeldolgozó eljárások áttekintés. Orvosi képdiagnosztika

Képfeldolgozó eljárások áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 9. ea ősz

6. Éldetektálás. Kató Zoltán. Képfeldolgozás és Számítógépes Grafika tanszék SZTE (

Képszegmentáló eljárások. Orvosi képdiagnosztika 2018 ősz

Időskori makula degeneráció kvantitatív jellemzése SD-OCT képek automatikus elemzésével

Képfeldolgozó eljárások áttekintés. Orvosi képdiagnosztika 9. ea ősz

DIGITÁLIS KÉPANALÍZIS KÉSZÍTETTE: KISS ALEXANDRA ELÉRHETŐSÉG:

Önálló labor beszámoló Képek szegmentálása textúra analízis segítségével. MAJF21 Eisenberger András május 22. Konzulens: Dr.

éve fennálló diabétesz esetén 80% DR Tünetek az esetek 90%-ában kezelhetőek (visszafordítható v. stabilizálható) Jelentős betegségteher

Grafikonok automatikus elemzése

A Képfeldolgozás és Számítógépes Grafika Tanszék kutatási témáiból

Városi környezet vizsgálata távérzékelési adatok osztályozásával

Intelligens Rendszerek Elmélete. Versengéses és önszervező tanulás neurális hálózatokban

Kutatás-fejlesztési eredmények a Számítógépes Algoritmusok és Mesterséges Intelligencia Tanszéken. Dombi József

Képfeldolgozás Szegmentálás Osztályozás Képfelismerés Térbeli rekonstrukció

Számítógépes döntéstámogatás. Bevezetés és tematika

Szenzorcsatolt robot: A szenzorcsatolás lépései:

Regresszió. Csorba János. Nagyméretű adathalmazok kezelése március 31.

The nontrivial extraction of implicit, previously unknown, and potentially useful information from data.

Termék modell. Definíció:

Adatelemzési eljárások az idegrendszer kutatásban Somogyvári Zoltán

Rendszámfelismerő rendszerek

Digitális képek szegmentálása. 5. Textúra. Kató Zoltán.

Modellkiválasztás és struktúrák tanulása

Képrekonstrukció 3. előadás

Méréselmélet MI BSc 1

Mesterséges neurális hálózatok II. - A felügyelt tanítás paraméterei, gyorsító megoldásai - Versengéses tanulás

Képfeldolgozás jól párhuzamosítható

7. Régió alapú szegmentálás

Számítógépes képelemzés 7. előadás. Dr. Balázs Péter SZTE, Képfeldolgozás és Számítógépes Grafika Tanszék

Láthatósági kérdések

Képszűrés II. Digitális képelemzés alapvető algoritmusai. Laplace-operátor és approximációja. Laplace-szűrő és átlagolás. Csetverikov Dmitrij

GENERALI EGÉSZSÉGBUSZ

3D számítógépes geometria és alakzatrekonstrukció

VIII. Népegészségügyi Konferencia, Megnyitó 2017.

Különböző hagyományos és nem-hagyományos eljárások kombinálása: miért és hogyan? április 16.

Mérési struktúrák

BAGME11NNF Munkavédelmi mérnökasszisztens Galla Jánosné, 2011.

Automatikus irányzás digitális képek. feldolgozásával TURÁK BENCE DR. ÉGETŐ CSABA

3D Számítógépes Geometria II.

A médiatechnológia alapjai

Képfeldolgozás. 1. el adás. A képfeldolgozás alapfogalmai. Mechatronikai mérnök szak BME, 2008

Összeállította Horváth László egyetemi tanár

DIGITÁLIS TEREPMODELL A TÁJRENDEZÉSBEN

Miről lesz szó? Videó tartalom elemzés (VCA) leegyszerűsített működése Kültéri védelem Közúthálózat megfigyelés Emberszámlálás

Keresés képi jellemzők alapján. Dr. Balázs Péter SZTE, Képfeldolgozás és Számítógépes Grafika Tanszék

Éldetektálás. Digitális képelemzés alapvető algoritmusai. Képi élek. Csetverikov Dmitrij. A Canny-éldetektor Az éldetektálás utófeldolgozása

T E R M É K T Á J É K O Z TAT Ó

ÉRZÉKELŐK ÉS BEAVATKOZÓK I. 3. MÉRÉSFELDOLGOZÁS

Gépi tanulás a gyakorlatban. Bevezetés

Funkcionális konnektivitás vizsgálata fmri adatok alapján

Statisztikai eljárások a mintafelismerésben és a gépi tanulásban

FEGYVERNEKI SÁNDOR, Valószínűség-sZÁMÍTÁs És MATEMATIKAI

3D számítógépes geometria és alakzatrekonstrukció

SZTE Eötvös Loránd Kollégium. 2. Móra György: Információkinyerés természetes nyelvű szövegekből

7. Előadás tartalma. Lineáris szűrők: Inverz probléma dekonvolúció: Klasszikus szűrők súly és átviteli függvénye Gibbs jelenség

Óbudai Egyetem Neumann János Informatikai Kar. Intelligens Mérnöki Rendszerek Intézet

TEXTÚRA ANALÍZIS VIZSGÁLATOK LEHETŐSÉGEI A RADIOLÓGIÁBAN

Digitális képek feldolgozása Előfeldolgozás Radiometriai korrekció Geometriai korrekció Képjavítás Szűrők Sávok közötti műveletek Képosztályozás Utófe

Dr. Kóti Tamás, Soós Mányoki Ildikó, Dr. Daróczi János

3D - geometriai modellezés, alakzatrekonstrukció, nyomtatás

Intelligens adatelemzés

Wavelet transzformáció

Intelligens Rendszerek Gyakorlata. Neurális hálózatok I.

Példák jellemzőkre: - minden pixelérték egy jellemző pl. neurális hálózat esetében csak kis képekre, nem invariáns sem a megvilágításra, sem a geom.

Hibadetektáló rendszer légtechnikai berendezések számára

Orvosi képdiagnosztika

Mérés és modellezés Méréstechnika VM, GM, MM 1

Intelligens Rendszerek Elmélete

3D-s számítógépes geometria és alakzatrekonstrukció

Képfeldolgozás jól párhuzamosítható

Térinformatika és Geoinformatika

Mérés és modellezés 1

Nem roncsoló tesztelés diszkrét tomográfiával

A fotogrammetria ismeretek és a szakmai tudás fontossága

EEE Kutatólaboratórium MTA-SZTAKI Magyar Tudományos Akadémia

Spektrográf elvi felépítése. B: maszk. A: távcső. Ø maszk. Rés Itt lencse, de általában komplex tükörrendszer

MULTIPARAMETRIKUS MR VIZSGÁLATOK SZEGMENTÁLÁSA NYAKI RÉGIÓBAN

Statisztika I. 12. előadás. Előadó: Dr. Ertsey Imre

Fotódokumentáció. Projektazonosító: KMOP /

Vizuális adatelemzés - Gyakorlat. Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Méréstechnika és Információs Rendszerek Tanszék

Az Implantológia radiológiai vonatkozásai Dr. Ackermann Gábor

ÉRZÉKELŐK ÉS BEAVATKOZÓK I. 0. TANTÁRGY ISMERTETŐ

Work measurement. Mozgáskódokra épülő folyamatfelmérés. Lengyel Kristóf CMC jelölt prezentáció

Máté: Számítógépes grafika alapjai

Kurzus címe, típusa (ea, sz, gy, lab, konz stb.) Tárgyfelelős Előfeltétel (kurzus kódja) Előfeltétel típusa

Közúti forgalomszámlálás e_sensor rendszerrel Budapest dugódíj projekt (sajtóanyag)

Piacszegmentálás - termékek Az ajánlat készítése

BIG DATA ELEMZÉSEK LEHETŐSÉGEI

Antropogén eredetű felszínváltozások vizsgálata távérzékeléssel

Óbudai Egyetem. Doktori (PhD) értekezés. Adatpárhuzamos sejtmagkeresési eljárás fejlesztése és paramétereinek optimalizálása Szénási Sándor

FEGYVERNEKI SÁNDOR, Valószínűség-sZÁMÍTÁs És MATEMATIKAI

Multimédiás adatbázisok

Sztereó kamerarendszerre alapozott gyalogos felismerés Kornis János*, Szabó Zsolt**

Átírás:

Képelemzési módszerek Mesterséges Intelligencia II. előadás Dr. Nyúl László Szegedi Tudományegyetem Képeld 2011.03.01. MI módszerek a képelemzésben Képjavítás Képszegmentálás Alakelismerés Képleírás (jelenet leírás) Tudás reprezentáció Osztályozás Döntés támogatás Klasszikus döntések Statisztikai módszerek Neurális hálózatok Gráelméleti megközelítések k Fuzzy elmélet 1 2 Automatikus retina képelemzési módszerek A retina analízis digitális képei Digitális színes undus ényképek Scanning Laser Ophtalmoscopy (SLO) Optical Coherence Tomography (OCT) 3 4 Vizsgált betegségek és szemenék régiók Diabéteszes retinopátia (DR) Mikroaneurizmák, bevérzések, exudátumok Időskori makula-degeneráció (AMD) Makula (sárgaolt) régió Krónikus magas vérnyomás Vérerek alakja, görbületei HT DR [Court. MedicineNet.com] AMD Automatikus glaukóma detektálás színes undus képekből Glaukóma (zöldhályog) Artériás/vénás erek viszonya Papilla (vakolt, látóidegő) környéke Szemenék sejtrétegeinek változása GL 5 6 1

Motiváció A glaukóma világviszonylatban a vakság 2. vezető oka (50 év alattiaknál 1:200, 80 év elettieknél 1:10) A glaukóma nem gyógyítható, de ha időben diagnosztizálják, lassítható az előrehaladása A undus képeken már a unkcionális zavarok megjelenése előtt láthatók elváltozások Fontos szempont: megelőző v. gyógyító orvostan Hatékony szűrővizsgálatok csökkenthetik a szakorvosok terhelését a szükségtelen vizsgálatok kiszűrésével Elképzelés Olyan szűrővizsgálati rendszer, amely lehetővé teszi a glaukóma speciikus elváltozások gyors, robusztus, automatikus detektálását, képes megbecsülni a glaukóma rizikó ikó nagyságát, hétköznapi környezetben is alkalmazható (pl. bevásárló központokban). 7 8 Digitális undus kamera [Court. NIH National Eye Institute] [Court. Kowa Company Ltd.] A jelen technikák problémái A legtöbb glaukóma értékelés retina struktúrák szegmentálásán és a szegmenseken végzett méréseken alapul A szegmentálás gyakran manuális! Az ilyen technikák továbbviszik a lokalizálás és/vagy körülhatárolás hibáit a mérési eredményekbe és így a diagnózisba is Nem glaukóma Glaukóma eset 9 10 Képek szegmentálása Struktúrák automatikus szegmentálására esetenként szükség van A eladatok egy része könnyű a szakértőnek mégis nehéz rá számítógépes algoritmust készíteni Képalkotó modalitásoktól és a vizsgált struktúráktól üggően eltérő módszerekre van szükség Fontos: kétirányú kapcsolat A szakértő tudás reprezentálása számítógépes algoritmusokban alkalmazható módon A kiszámított eredmények / értékek segíthetik a szakértőket diagnosztikai / döntéshozó munkájukban A javasolt rendszer Digitális undus ényképeket alkalmaz automatikus glaukóma szűrésre Eddig nem igazán alkalmazták erre a eladatra A vizuális értékelés természetes bemenete, eleve rendelkezésre álló képek Utánozza (számítógépes algoritmusokkal) a szakorvos értékelési módszerét A lényeges struktúrákat (pl. látóidegő) úgy vizsgálja, hogy más részleteket (pl. véredények, zaj, megvilágítási artiaktumok) implicit igyelmen kívül hagy Nehéz eladat 11 12 2

Megjelenés-alapú osztályozás Adat-vezérelt megközelítés Teljes régiókat, a pixel értékeket és számított textúra jellemzőket használ Nem ügg konkrét struktúra-szegmentálástól és méréstől Magas dimenziójú tulajdonságtereken robusztus osztályozás Az automatikusan kiszámított paraméterek, mint új jellemzők alkalmazhatók a szokásos szűrővizsgálati protokollokban Automatikus Glaukóma Rizikó Index kiszámítási olyamata 13 14 Az előeldolgozás lépései Megvilágítás korrekció Véredények eltávolítása Papilla normalizálás Megvilágítás korrekció (, ) (, ) (, ) log (, ) = log ( (, ) (, )) = log (, ) + log (, ) = ( ) I x y = L x y R x y I I xy Lxy Rxy L xy R xy i W S c log log ( ) { } N 15 15 S N n m c W w w, =,, = diag, 0,1 r = i S c log n m N 15 16 Véredények eltávolítása Területi jellemzők (adaptív küszöbölés) Határ jellemzők (Canny éldetektor) Struktúrális jellemzők (vékony, hosszú, párhuzamos élekkel határolt, ) Validálás (illesztett szűrő válasza alapján) Morológiai igazítások Véredények beestése Eredeti színes undus énykép 17 18 3

Eredeti zöld színcsatorna Adaptív küszöbölés és Canny éldetektálás 19 20 Kis objektumok elhagyása Objektumoktól távoli éldarabok elhagyása 21 22 Élekkel nem jól határolt objektumok elhagyása Több irány szerint illesztett szűrők válasza 23 24 4

Potenciális véredény kezdő pontok Validált potenciális véredény pontok 25 26 Rekonstruált objektum morológiai zárás után Képek beestése (inpainting) Nem kívánatos objektumok, artiaktumok eltávolítása Eredetileg a képrestaurálásban és videoeldolgozásban használták Ötlet: a hiányzó adatok helyére iteratívan inormációt szivárogtatni a környező régiókból Matematikai háttér Magasabb rendű parciális dierenciálegyenletek Textúra szintézis Térbeli diúzió 27 28 Eredeti színes undus énykép Durván szegmentált véredény maszk 29 30 5

Véredény régiók beestve Eredeti kép a látható véredényekkel 31 32 Papilla normalizálás A detektált papilla 3-szoros sugarú négyzetes környezete 128x128 pixelre skálázva Tulajdonságvektorok Pixel intenzitás (128x128 kép) FFT együtthatók (valós rész) B-spline együtthatók (4. okú) raw t spline Dimenzió csökkentés PCA-val 30 őkomponens mindegyik tulajdonságvektorból 33 34 FFT együtthatók M N ux vy j2 M N ( x, y) F( u, v) e π + = u= 0 v= 0 B-spline együtthatók n m d pxy (, ) = ckl (, ) β ( x ky, l) k= 0 l= 0 T 1 1 ( xy, ) < 2 0 1 T 1 β ( xy, ) = ( xy, ) = 2 2 0 otherwise d 0 0 0 β ( x k, y l) = β β β ( x, y) ( d + 1) times 35 36 6

Osztályozás Support Vector Machines (Bayes és knn osztályozókat is próbáltuk) 2-lépcsős osztályozás (Tulajdonság kiválasztást (pl. AdaBoosting) is próbáltuk) 1. lépcső: = ( p ( G), p ( G), p ( G) ) prob raw t spline Validálás / Kiértékelés A javasolt módszert az egyes komponensek és különéle kombinációik részletes vizsgálatával alakítottuk ki Először az előeldolgozást vizsgáltuk, majd rögzítettünk egy elogadható műveletsort Kiválasztottuk a legbíztatóbb jellemzőket Összehasonlítottunk különéle osztályozási módszereket 2. lépcső: GRI = p ( G) prob Több száz valódi undus képen teszteltük A valós ( ground truth ) osztályozást szakorvos végezte a standard glaukóma szűrés összes paraméterének igyelembevételével 37 38 Eredmények Új automatikus glaukóma osztályozó rendszer, kizárólag kép-alapú jellemzőket használ A GRI siker rátája (86%) összemérhető a szakértők teljesítményével hasonló körülmények között Alkalmas lehet széleskörű szűrővizsgálatokra (automatikus és egy egyszerű, olcsó modalitás) Az automatikusan kiszámított jellemzők az adatok újszerű reprezentációját adják, ami az orvosok számára új és segíthet a betegség megértésében Erlangen Glaucoma Matrix 39 40 Erlangen Glaucoma Matrix Amiről szó esett... MI módszerek a képelemzés területén Képszegmentálási és osztályozási eladatok a retina analízis körében Papilla, vérerek, idegrost réteg, makula, mikroaneurizmák, exudátumok,... Fontos dolgok! Módszerek kvantitatív kiértékelése nagy adathalmazokon Automatikus tulajdonság kinyerők Megbízható, automatikus osztályozók Szűrővizsgálati protokollok Komoly párbeszédek orvos és inormatikus között 41 42 7