PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM. Biológia Doktori Iskola Mikroorganizmusok életfolyamatainak molekuláris analízise
|
|
- Elvira Szilágyi
- 6 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Biológia Doktori Iskola Mikroorganizmusok életfolyamatainak molekuláris analízise Forminok hatása az aktin filamentum konformációs és dinamikai tulajdonságaira PhD értekezés tézisei Papp Gábor Témavezetők: Prof. Nyitrai Miklós egyetemi tanár Prof. Pesti Miklós egyetemi tanár PÉCS,
2 Bevezetés A sejtváz, vagy más néven citoszkeleton, az eukarióta sejtek citoplazmájában található fonalas és csőszerű struktúrákból felépülő hálózati rendszer. A citoszkeleton kapcsolatban van a sejthártyával és más sejtalkotókkal, így egyfajta térbeli keretet ad a sejtben játszódó fiziológiai folyamatok molekuláris eseményeinek. Az eukarióta sejt citoszkeletális hálózatát alapvetően három filamentális struktúra alkotja, ezek a mikrotubulusok, az intermedier filamentumok és a mikrofilamentumok rendszere. A mikrofilamentumok dinamikus átszerveződése alapoz meg olyan kritikus folyamatokat a sejtben, mint az endocitózis, sejtosztódás, vagy a morfogenezis, és ehhez köthető a sejt polarizáció meghatározása is. Ezeknek a sejtbeli történéseknek a koordinálása erősen konzerválódott aktin-kötő fehérjének, valamint sok sejtspecifikus aktin-kötő fehérjének, továbbá számos jeladó molekulának köszönhető. Ezeknek a faktoroknak a kombinált aktivitása tökéletes precizitással irányítja az aktin hálózat térbeli és időbeli szerveződését, és biztosítja a sejtre ható külső és belső ingereknek megfelelően a citoszkeleton gyors átrendeződését. Az aktin a mikrofilamentális hálózat fő alkotóeleme, amely az élő sejtben valamint in vitro körülmények között is két formában fordulhat elő. Az egyik a globuláris, vagy G-aktin, amely egy aktin monomer, a másik a filamentális, vagy F-aktin, amely a monomerek összekapcsolódásából kialakult polimer. Az aktin monomer szerkezetében két domén különíthető el, a közöttük elhelyezkedő hasadékban kation- (Mg 2+ és Ca 2+ ) és nukleotid kötő (ATP, ADP, vagy ADP+P i ) helyek találhatók. Az aktin filamentumok kialakulása három szakaszra osztható. Az első az úgynevezett nukleációs szakasz, amely néhány (kettő vagy három) aktin monomer összekapcsolódását jelenti. Az így kialakult mag (nukleusz) lesz a kiindulási pontja a filamentum kialakulás második szakaszának, a diffúziókontrollált elongációs fázisnak, amely folyamat során további monomerek beépülése történik meg. A harmadik szakaszra a környezet által meghatározott dinamikus egyensúly jellemező. Ebben az állapotban a filamentum mindkét végén megtörténik mind a monomerek asszociációja, mind a disszociációjuk, azonban a monomerek beépülése a filamentum szöges végén jellemzőbb, míg a monomerek leválása a hegyes végen gyakoribb. Mivel a filamentum két végén ezek a folyamatok eltérő kinetikával történnek, a filamentum hossza már nem változik, azonban a filamentumban egyfajta folyamatos belső mozgás tapasztalható (taposómalom, treadmilling ). Az aktin filamentumok kialakulását, egymáshoz viszonyított térbeli helyzetét számos aktin kötő fehérje határozza meg. Kötődésük során a filamentumban konformációs változás következik be és az így kiváltott hatás kihat a filamentumok mechanikai tulajdonságaira. 2
3 Az aktin monomer és polimer funkcionális tulajdonságait számos tényező befolyásolja, amelyek lehetnek különböző ionok, fémek, a kötött nukleotid hidrolitikus állapota, számos drog és aktinkötő fehérje jelenléte. A szabályozott és gyors nukleációt az aktin nukleációs faktorok határozzák meg, amelyek három csoporba sorolhatók. Az egyik csoport képviselője az Arp2/3 komplex, amely a filamentum oldalához kapcsolódik, majd az aktin plusz végének szerkezetét utánozva, egy sarjfilamentumot hoz létre, így egy elágazó filamentum hálózat alakul ki. A másik csoportot a Spire fehérje alkotja, amely 4 aktin monomerből alakít ki egy prenukleációs komplexet, amely a filamentum-növekedés kiindulási pontja. A harmadik csoportot a forminok képezik, amelyek elágazás nélküli filamentumokat alakítanak ki. A forminoknak kitüntetett szerepük van a sejtek aktin citoszkeletális rendszerének gyors újraszervezésében. Számos eukarióta szervezetben találtak forminokat, és három konzervatív régiót mutattak ki, amelyek nagyfokú homológiát mutattak a különböző eukarióta szervezetekben: a formin homologia FH1, FH2 és FH3 domént. A számos formin család közül talán a legjobban jellemzett a Diaphanous-related forminok (Dia), amelyek a fent említett domének mellett egyéb szabályozó régiókkal is rendelkeznek. A forminok funkcionális formája a két FH2 domén antiparalell módon történő összekapcsolódásából kialakuló FH2 dimer, amely aktin nukleáló hatással rendelkezik. A dimer kialakulásához szükség van egy az FH2 domén N-terminálisán elhelyezkedő linker régióra, amely az FH1 és FH2 doméneket köti össze és a dimer flexibilitását biztosítja. 3
4 Célkitűzések Munkánk első részében az mdia1-fh2 fragmentum előállítását terveztük elvégezni, ezért a rendelkezésre álló laboratórium feltételei alapján optimalizáltuk az adaptált expressziós rendszert. A munkánk második szakaszában a formin hatására az aktin filamentumban bekövetkező dinamikai változások vizsgálatát tűztük ki célul, melyhez fluoreszcencia spektroszkópiai módszereket alkalmaztunk. A kísérletek során vizsgálni kívántuk, hogy mely tényezők befolyásolják a forminaktin kölcsönhatás kialakulása után az aktin filamentumok konformációs változását, flexibilitását. Kísérleteinkben arra kerestük a választ, hogy milyen hatást gyakorol az mdia1-fh2 az IAEDANS (N-(iodoacetyl)-N -(5-sulfo-1-naphthyl)ethylenediamine) fluorofórral jelölt aktin filamentumok fluoreszcencia életidejére. Az aktin filamentumok flexibilitásának formin-koncentrációtól való függésének vizsgálatát tűztük ki célul. A flexibilitások mértékének változását az IAEDANS-jelölt F- aktin fluoreszcencia lecsengésének élettartamában történő eltérések révén terveztük kimutatni, amelynek mérésére a fázisfluorimetria módszere alkalmas. Arra a kísérletek során felmerült kérdésre kerestük a választ, hogy a rendszerben jelen lévő teljes formin koncentráció, vagy a formin:aktin koncentráció aránya határozza-e meg a kialakuló formin hatást. Korábbi kísérleteink alapján kimutattuk azt, hogy a filamentum közegének ionerőssége hatással van a filamentum konformációjára. Fluoreszcencia anizotrópia lecsengés vizsgálattal arra kerestük a választ, hogy befolyásolja-e a környezet ionerősség változása a formin hatására az aktin filamentumban kialakuló flexibilitás változást. 4
5 Alkalmazott módszerek A fehérjék előállítása Az aktin preparálás első lépésében házi nyúl (Oryctolagus cuniculus) vázizomból acetonextrahált izomforgácsot készítettünk. Ebből az aktin izolálása Spudich és Watt módszere alapján történt. Az emlős (házi egér (Mus musculus)) mdia1-fh2 fragmentumot rekombináns GST-fúziós fehérje-expressziós rendszerben állítottuk elő, prokarióta sejtekben. A DNS fragmentumot tartalmazó pgex-4-t3 típusú plazmidot E. coli BL21 (DE3)pLysS kompetens sejtekbe transzformáltunk. Az expressziót követően a GST-mDia fehérjefragmentumot affinitás kromatográfiás elválasztási módszert alkalmazva különítettük el, majd gélfiltrációs eljárással tisztítottuk, utána a fehérjét koncentráltuk. A G-aktin polimerizációját 10 mm KCl és 0,5 mm MgCl 2 (az ettől való eltérést jelezzük) hozzáadásával indítottuk el. Formint tartalmazó minta esetében a formint mindig a polimerizációt megelőzően adtuk a mintához. A formin tárolópufferének befolyásoló hatását kizárandó a tárolópuffer térfogatát mind a formint tartalmazó, mind a formin-mentes minták esetében a teljes térfogat 5 %-án tartottuk. Az aktin fluoreszcens jelölése Az aktin polimerizációs tesztek elvégzéséhez N-(1-pirén)jodacetamiddal, a fluoreszcencia élettartam és anizotrópia mérésekhez IAEDANS jelölővel jelöltük az aktin Cys 374 -es aminosavát. A jelölési hatékonyságot fotometriás módszerrel határoztuk meg. A fluoreszcencia élettartam és anizotrópia lecsengés mérése A fluoreszcencia élettartam és anizotrópia lecsengés méréseket ISS K2 típusú multifrekvenciás fázis-fluoriméterrel végeztük. A fluoreszcencia élettartam mérések során két-exponenciális lecsengés modellt és egykomponensű Gauss eloszlást használtunk, amelyeket a χ 2 -próbával határoztunk meg. A kettős exponenciális élettartam vizsgálat során az átlagos fluoreszcencia élettartamot a 2 2 α1τ 1 + α2τ 2 átl = (1) α1τ 1 + α2τ 2 τ 5
6 egyenlet alapján számítottuk, ahol τ átl az átlagos fluoreszcens életidő, α i és τ i az egyes amplitúdók és élettartamok. Az anizotrópia lecsengés mérése Az időfüggő anizotrópia r(t) értéke két exponenciális tag összegeként adható meg: r( t) t / φ1 t / φ2 = re 1 + r2e (2) ahol r 1 és r 2 a 0 időpontban mért anizotrópia értéke, φ 1 és φ 2 a fluorofór illetve az aktin molekula rotációs diffúzióját jellemző korrelációs idő. A határanizotrópia 0 időpontban számított értéke az alábbi összefüggéssel adható meg az egyes amplitúdók értékeiből: R = + (3) 0 r1 r2 Ha feltételezzük, hogy a fluorofór egy forgáskúpon belül mozoghat, akkor a forgáskúp félnyílásszöge (Θ) és az r 1 és r 2 amplitúdók viszonya az r r + r 1 cos = Θ(1 + cos Θ 2 ) 2 (4) egyenlettel jellemezhető, ahol r 1 a rövidebb, r 2 a hosszabb rotációs korrelációs időhöz tartozó amplitúdó. Az ilyen módon meghatározott félszög érték kapcsolatban van a fluorofór környezetében levő fehérjemátrix flexibilitásával, tehát alkalmas paraméter a fehérjének a fluorofór környezetét jellemző dinamikai sajátságainak a jellemzésére. 6
7 Eredmények és következtetések Az mdia1-fh2 hatása az IAEDANS-aktin fluoreszcencia élettartamára A fehérjékhez kötött fluoreszcens jelölők alkalmazásával lehetőség nyílik a fehérjék konformációs változásainak nyomonkövetésére. Kísérleteinkben az aktin Cys 374 aminosavjához kötött IAEDANS fluoreszcens jelölő fluoreszcencia élettartamát vizsgáltuk, amely információval szolgált az aktin filamentum szerkezetében bekövetkező mdia1-fh2 okozta változásokat illetően. A mérések során 20 µm aktint polimerizáltunk különböző koncentrációjú mdia1-fh2 jelenlétében (0-5 µm). A fluoreszcencia élettartam meghatározásánál a mérések során kapott adatok illesztéséhez egy-, két- és három exponenciális lecsengés modelleket, valamint Gauss-élettartam eloszlást használtunk, amelyek közül a két exponenciális lecsengés modell és a Gauss-élettartam eloszlás bizonyult a legpontosabbnak. Az eredmények mindkét analitikai módszerrel kiértékelveegybevágóan azt mutatták, hogy az IAEDANS jelölő fluoreszcencia élettartama mdia1-fh2 jelenlétében 20 ns-ról ~18,5 ns-ra csökkent. A fluoreszcencia élettartam csökkenése 500 nm mdia1-fh2 koncentrációig a formin koncentrációjától függőnek bizonyult, e fölött a koncentráció fölött azonban attól független volt. A formin hatására történt fluoreszcencia élettartamban bekövetkező változás szerint tehát az mdia1-fh2 megváltoztatta az aktin filamentum Cys 374 -jének a mikrokörnyezetét. Az mdia1-fh2 aktin filamentumok dinamikai tulajdonságaira gyakorolt hatása A filamentumokban lejátszódó, formin indukálta konformációs változások kimutatása céljából az IAEDANS-szel jelölt aktin filamentum jelölőinek fluoreszcencia anizotrópia lecsengését vizsgáltuk meg. Ezzel a vizsgálattal információt kaphattunk a filamentumban elhelyezkedő protomerek mozgásáról. A méréseket 2 és 100 MHz közötti tartományban végeztük. Az így nyert frekvenciafüggő fázis és moduláció értékeket kétkomponensű exponenciális illesztéssel vizsgáltuk (2. egyenlet). A vizsgálat során így két rotációs korrelációs időt határoztunk meg. A rövidebb korrelációs időhöz (φ 2 ) a jelölőnek a fehérjéhez viszonyított mozgását rendeltük hozzá, míg a hosszabb (φ 1 ) a fehérjemátrix szegmentális mozgására jellemző paraméter. A φ 2 -höz tartozó értékek a 2-4 ns-os tartományba estek és a méréseink alapján minimális formin koncentrációfüggést mutattak. A hosszabb rotációs korrelációs idő 700 ns volt a formin nélküli minták esetében, míg 500 nm formin jelenlétében 100 ns-ra csökkent és a formin koncentrációjától független maradt e felett a 7
8 koncentráció felett. A hosszabb rotációs korrelációs idő fordított arányban áll az aktin filamentumok flexibilitásával. Ezek alapján elmondható, hogy formin hatására a rotációs korrelációs időben bekövetkező csökkenés szabadabb szegmentális mozgást jelent, amelyet a szomszédos protomereket összetartó fizikai-kémiai kötések lazulása, gyengülése okozhat. A szomszédos protomerek között levő kapcsolat tehát lazábbá válik, amelynek következtében a filamentum flexibilitása megnövekszik. A rotációs korrelációs idők amplitúdói (r 1 és r 2 ) ugyancsak formin koncentrációfüggőnek bizonyultak, amely azt jelezte, hogy az anizotrópia lecsengés két rotációs módjának relatív eloszlása is megváltozott a formin kötődésének következtében. A mdia1-fh2 jelenlétében a 0 időpontban számított határanizotrópia (R 0 ) (3. egyenlet) alacsonyabb volt formin jelenlétében, mint annak hiányában. Az R 0 formin függése jól kifejezett volt 500 nm mdia1-fh2 koncentráció alatt, ahol az értéke 0,265-re csökkent. E felett a formin koncentráció felett azonban az értéke nem változott. A R 0 értékének csökkenése a fluorofór körüli fehérjeszerkezet flexibilisebbé válására utal, vagyis rámutat a formin okozta lazító hatásra a Cys 374 mikrokörnyezetében. A kúp félnyílásszöge (Θ), amelyben a Cys 374 -nél IAEDANS jelölő bolyongó mozgást végez (4. egyenlet), nagyobbnak bizonyult az mdia1-fh2 jelenlétében, mint anélkül, és formin koncentrációtól való függést mutatott, hasonlóan a hosszabb korrelációs idő, illetve a 0 időpontban számított határ anizotrópia (R 0 ) vizsgálata során tapasztaltakhoz. A formin jelenlétében mért nagyobb félnyílásszög értékek megerősítik a fluoreszcencia élettartamok és R 0 értékek formin függéséből származó következtetésünket, mely szerint az mdia1- FH2-vel együtt polimerizált aktin filamentumban elhelyezkedő fluoreszcens jelölő mikrokörnyezete flexibilisebbé vált. Az aktin koncentráció és a formin hatás kapcsolata A 20 µm aktin jelenlétében mért fluoreszcencia paraméterek ~500 nm mdia1-fh2 koncentrációig formin függőnek mutatkoztak, majd e fölött a koncentráció fölött attól függetlenek voltak. Felmerült a kérdés, hogy mi okozhatja ezt a függést: vajon a formin:aktin koncentráció aránya (1:40), vagy a teljes formin koncentráció (500 nm) lehet felelős a tapasztalt hatásért. Újabb fluoreszcencia kísérletek eredményei alapján kijelenthető, hogy 500 nm felett a fluoreszcencia paraméterek formin koncentráció függése elhanyagolhatónak bizonyult. A legnagyobb formin hatást okozó legkisebb formin koncentráció független volt az aktin koncentrációjától, ez azt mutatja, hogy maximális formin hatás érvényesülését nem a formin:aktin koncentráció aránya, hanem a teljes formin koncentráció határozza meg. 8
9 A formin hatás ionerősség függése Kimutattuk, hogy az mdia1-fh2 hiányában a hosszabb rotációs korrelációs idő független volt az ionerősségtől. Az mdia1-fh2 aktin filamentumhoz kötődése a hosszabb rotációs korrelációs idő csökkenését eredményezte, de ennek a paraméternek a magasabb ionerősség mellett tapasztalt változása csak a fele volt az alacsony sótartalom esetében mért értékeknek. Eredményeink alapján feltételezzük, hogy a formin-aktin kölcsönhatások kialakításában fontos szerepet tölthetnek be a fehérjék között kialakuló elektrosztatikus kölcsönhatások is. Magasabb ionerősség mellett feltételezhetően azért alakul ki gyengébb kötés, mert az oldat hatása leárnyékolja a fehérje csoportok elektrosztatikus kölcsönhatásait. Az eredményeink szerepe és jelentőssége az aktin citoszkeleton szabályozásában A forminok, mint aktin nukleációs faktorok, elsőként kerülnek kapcsolatba a kialakuló aktin filamentummal. Az egyes fehérje struktúrák térbeli és időbeli kialakításának szabályozásában meghatározó lehet a nukleációs faktorok kötődése során kifejtett konformáció módosító hatásuk. A szerkezeti módosulást a kötés következtében kialakuló allosztérikus hatás okozhatja. Így annak ellenére, hogy a nukleációs faktor a filamentum meghatározott pontjához kötődik, megváltoztatja az egész filamentum konformációs állapotát. Ebből következően az aktin filamentumok azon túl, hogy strukturális elemei a sejteknek, a továbbiakban információ továbbítására alkalmas csatornaként vesznek részt a sejtek működésében. 9
10 Összefoglalás A munkánk során az mdia1-fh2 fragmentum aktin filamentum flexibilitására gyakorolt hatásának vizsgálatát tűztük ki célul. Ennek első lépéseként a fehérjefragmentum előállítása során alkalmazott fehérjeexpressziós rendszert optimalizáltuk a helyi molekuláris biológiai labor adottságaihoz, mely során a rendszeren eszközölt változtatatások hatékonyabb expresszálást tettek lehetővé. Az mdia1-fh2-vel végzett vizsgálatok alkalmával kimutattuk, hogy az aktin filamentumhoz kötődő fluoreszcens jelölő fluoreszcencia élettartama a formin kötés hatására lecsökkent, amely szerint megváltozott a jelölő közvetlen mikrokörnyezete. Az anizotrópia lecsengés vizsgálatok alátámasztották, hogy a forminok az aktin filamentumok szegmentális mozgását befolyásolták. A szomszédos protomerek közti fizikokémiai kapcsolatok gyengülése révén az aktin filamentumok flexibilitása megnőtt. Kimutattuk, hogy ez a változás 500 nm-ig a formin koncentrációjától függő folyamatnak bizonyult. Ez a hatás 500 nm felett azonban független volt a formin koncentrációjától. Ezek alapján a fehérjének az aktin filamentum hegyes végéhez való kötődése az egész filamentumban, vagy annak számottevő részében konformációs változásokat okozott. Bebizonyítottuk, hogy a forminok aktin filamentumot rugalmasabbá tevő hatása független az aktin koncentrációjától. Ezt követően meghatároztuk egy mdia1-fh2 dimer molekula minimális hatótávolságát. E szerint egy formin dimer a forminnal kötött aktin filamentum szöges végétől számítva legalább 160 protomer konformációját volt képes megváltoztatni. Ez a változás a filamentum flexibilitásának növekedésében nyilvánult meg, amelyet a hosszú hatótávolságú allosztérikus kölcsönhatások okoztak. A környezet ionerősségét változtatva meghatároztuk a forminok hatásának ionerősségtől való függését, ennek alapján a forminok hatása magasabb ionerősség mellett kisebb volt. 10
11 Az értekezés alapjául szolgáló, nemzetközi folyóiratban megjelent tudományos közlemények Papp, G., Bugyi, B., Ujfalusi, Z., Barkó, Sz., Hild, G., Somogyi, B. and Nyitrai, M.: Conformational Changes in Actin Filaments Induced by Formin Binding to the Barbed End. Biophys. J. vol.:91, , IF: Bugyi, B., Papp, G., Hild, G., Lőrinczy, D., Nevalainen, E. M., Lappalainen, P., Somogyi, B. and Nyitrai, M.: Formins regulate actin filament flexibility through long-range allosteric interactions. J. Biol. Chem., Vol.:281, No.:16, , IF: 6,355 Az értekezéshez kapcsolódó poszterek, előadások Papp, G., Bugyi, B., Barkó, Sz., Ujfalusi, Z., Pesti, M., Nyitrai, M. és Somogyi, B.: A forminok hatása az aktin filamentum konformációs és dinamikai tulajdonságaira. 36. Membrán-transzport konferencia, Sümeg, május (Poszterszekcióból kiválasztva, előadás) Bugyi, B., Papp, G., Ujfalusi, Z., Barkó, Sz., Nyitrai, M. and Somogyi, B.: Formin caps and cramps on actin filaments: A possible mechanism to regulate the formation of cytoskeletal protein complexes. 8th International Symposium on Instrumental Analysis, Graz, Ausztria szeptember Bugyi, B., Papp, G., Barkó, Sz., Ujfalusi, Z., Nyitrai, M. és Somogyi, B.: A formin homológ 2 domén hatása az aktin filamentumok dinamikájára. A Magyar Biofizikai Társaság XXII. Kongresszusa, Debrecen, június Bugyi, B., Papp, G., Ujfalusi, Z., Hild, G. and Nyitrai, M.: The FH2 domain of Diaphanous Related formin mdia1 affects the dynamic properties of actin filaments. Meeting of International Research Scholars, Mérida, Mexikó, június Bugyi, B., Papp, G., Ujfalusi, Z., Barkó, Sz., Lőrinczy, D., Somogyi, B. és Nyitrai, M.: A forminok szerepe az aktin citoszkeleton szabályozásában. Magyar Biokémiai Egyesület évi Vándorgyűlése, Pécs, augusztus 30 - szeptember 2. Bugyi, B., Papp, G., Hild, G., Lőrinczy, D., Ujfalusi, Z., Barkó, Sz., Somogyi, B. and Nyitrai, M.: Formins regulate actin filament flexibility through long-range allosteric interactions. EMBO/HHMI Central European Scientists Meeting, Dubrovnik, Horvátország, június Bugyi, B., Papp, G., Lőrinczy, D., Vig, A., Kardos, R., Nevalainen, E. M., Lappalainen, P., Somogyi, B., Hild, G. and Nyitrai, M.: The effects of formins on the conformation of actin filaments. 51 st Annual Meeting of the American Biophysical Society, Baltimore, MD, Egyesült Államok, március 3-7. Bugyi, B., Papp, G., Lőrinczy, D., Vig, A., Kardos, R., Nevalainen, E. M., Lappalainen, P., Somogyi, B., Hild, G. and Nyitrai, M.: A possible novel mechanism for the regulation of the cytoskeleton by actin nucleation factors. Alpbach Workshop on Molecular Motors, Alpbach, Ausztria, március
12 Az értekezésben nem szereplő nemzetközi folyóiratban megjelent tudományos közlemények Papp, G., Bugyi, B., Ujfalusi, Z., Halasi, Sz. and Orbán, J.: The effect of ph on the thermal stability of α-actin isoforms. J. Therm. Anal. Cal. Vol.: , IF: 1,478 Bugyi, B., Papp, G., Halasi, Sz. and Visegrády, B.: The effect of toxins on the thermal stability of actin filaments by differential scanning calorimetry. J. Therm. Anal. Cal. Vol.: , IF: 1,478 Orbán, J., Halasi, Sz., Papp, G., Barkó, Sz. and Bugyi, B.: Thermodynamic characterization of different actin isoforms. J. Therm. Anal. Cal. Vol.: , IF: 1,478 Halasi, Sz., Papp, G., Bugyi, B., Barkó, Sz., Orbán, J., Ujfalusi, Z. and Visegrády, B.: The effect of pyrene labelling on the thermal stability of actin filaments. Thermochimica Acta , IF: 1,161 Blaskó, Á., Belágyi, J., Dergez, T., Deli, J., Papp, G., Vágvölgyi, Cs. and Pesti, M.: Effect of polar and non-polar carotenoids on Xanthophyllomyces dendrorhous membranes by EPR. Eur Biophys J. Vol.: , 2008 IF: 1,825 Az értekezéshez nem kapcsolódó poszterek, előadások Gazdag, Z., Bonnefoy, N., Belágyi, J., Papp, G. and Pesti, M.: The sensitivity of respiratorydeficient Schizosaccharomyces pombe mutants to heavy metal and oxidative stress. 13 th International Congress of the Hungarian Society for Microbiology, Balatonfüred, október Gazdag, Z., Farkas, N., Belágyi, J., Papp, G., and Pesti, M.: Alterations in the glutathione defence system of respiratory-deficient Schizosaccharomyces pombe mutants. XXXIth Annual Conference on Yeasts, SAS Congress Centre, Smolenice, Szlovákia, május Gazdag, Z., Farkas, N., Belágyi, J., Papp, G., Takács, K., Rácz, T. and Pesti, M.: Altered Cadmium sensitivity of respiratory deficient Schizosaccharomyces pombe mutant. 14 th International Congress of the Hungarian Society for Microbiology, Balatonfüred, október Orbán, J., Halasi, Sz., Papp, G., Barkó, Sz. and Bugyi, B.: Thermodynamic characterization of different actin isoforms. 16. Ulm-Freiberger Kalorimetrietage, Freiberg, Németország, március Papp, G., Bugyi, B., Ujfalusi, Z., Halasi, Sz. and Orbán, J.: The effect of ph on the thermal stability of α-actin isoforms. Ulm-Freiberger Kalorimetrietage, Freiberg, Németország, március Bugyi, B., Papp, G., Halasi, Sz. and Visegrády, B.: The effect of toxins on the thermal stability of actin filaments as revealed by differential scanning calorimetry. Ulm-Freiberger Kalorimetrietage, Freiberg, Németország, március
13 Halasi, Sz., Papp, G., Bugyi, B., Barkó, Sz., Orbán, J., Ujfalusi, Z. and Visegrády, B.: The effect of pirene labelling on the thermal stability of actin filaments. Ulm-Freiberger Kalorimetrietage, Freiberg, Németország, március Ujfalusi, Z., Barkó, Sz., Papp, G., Nyitrai, M. és Somogyi, B.: Élesztő aktin izolálása és karakterizálása spektroszkópiai módszerekkel. XXXV. Membrántranszport Konferencia, Sümeg, május Ujfalusi, Z., Barkó, Sz., Papp, G., Nyitrai, M. and Somogyi B.: The characterization of yeast actin by biophysical methods. EMBO Young Investigator Programme PhD Course, Heidelberg, Németország, szeptember Horváth, E., Papp, G., Blaskó, Á., Belágyi, J., Vágvölgyi, Cs. and Pesti, M.: Characterization of a carotenoid deficient mutant strain of Phaffia rhodozyma. Annual Meeting of the Hungarian Society for Microbiology, Keszthely, Magyarország, október (Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica, 53:276, 2006.) A cikkek összesített impakt faktora: 18,359 13
14 14
Nemzetközi folyóiratban megjelent tudományos közlemények, könyvfejezet
PUBLIKÁCIÓS LISTA Nemzetközi folyóiratban megjelent tudományos közlemények, könyvfejezet Papp, G., Bugyi, B., Ujfalusi, Z., Halasi, Sz. and Orbán, J.: The effect of ph on the thermal stability of α-actin
Tropomiozin és nehéz meromiozin hatása a formin által nukleált aktin filamentumok flexibilitására
Tropomiozin és nehéz meromiozin hatása a formin által nukleált aktin filamentumok flexibilitására Ujfalusi Zoltán Témavezető: PROF. DR. N YITRAI MIKLÓS Doktori iskola: I n t e r d i s z c i p l i n á r
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER FUTÓ KINGA 2013.10.09. CITOSZKELETON - DEFINÍCIÓ Fehérjékből felépülő, a sejt vázát alkotó intracelluláris rendszer. Eukarióta és prokarióta sejtekben egyaránt megtalálható.
Tartalom. A citoszkeleton meghatározása. Citoszkeleton. Mozgás a biológiában A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 12/9/2016
Tartalom A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER Nyitrai Miklós, 2016 november 29. 1. Mi a citoszkeleton? 2. Polimerizáció, polimerizációs egyensúly 3. Filamentumok osztályozása 4. Motorfehérjék A citoszkeleton meghatározása
A citoszkeletális rendszer
A citoszkeletális rendszer A citoszkeletális filamentumok típusai, polimerizációja, jellemzıik, mechanikai tulajdonságaik. Asszociált fehérjék 2013.09.24. Citoszkeleton Fehérjékbıl felépülı, a sejt vázát
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER (Nyitrai Miklós, )
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER (Nyitrai Miklós, 2010.11.30.) 1. Mi a citoszkeleton? 2. Polimerizá, polimerizás egyensúly 3. ilamentumok osztályozása 4. Motorfehérjék Citoszkeleton Eukariota sejtek dinamikus
2. AKTIN-KÖTŐ FEHÉRJÉK
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 2011. 02. 15. Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet 2. AKTIN-KÖTŐ FEHÉRJÉK Citoszkeletális aktin HEp-2 sejtekben - rodamin-falloidin jelölés forrás: Nyitrai Miklós, Grama László,
Citoszkeleton. Sejtek rugalmassága. Polimer mechanika: Hooke-rugalmasság. A citoszkeleton filamentumai. Fogászati anyagtan fizikai alapjai 12.
Fogászati anyagtan fizikai alapjai 12. Sejtek rugalmassága Citoszkeleton Eukariota sejtek dinamikus vázrendszere Három fő filamentum-osztály: A. Vékony (aktin) B. Intermedier C. Mikrotubulus Polimerizáció:
Biofizika I 2013-2014 2014.12.02.
ÁTTEKINTÉS AZ IZOM TÍPUSAI: SZERKEZET és FUNKCIÓ A HARÁNTCSÍKOLT IZOM SZERKEZETE MŰKÖDÉSÉNEK MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSA IZOM MECHANIKA Biofizika I. -2014. 12. 02. 03. Dr. Bugyi Beáta PTE ÁOK Biofizikai Intézet
Komplex egyszerű Aktin alapú mikrofilamentum rsz. Hogyan vizsgálhatunk folyamatokat? Komplex egyszerű S E J T
Biofizikai módszerek a citoszkeleton vizsgálatára I. Kinetikai, steady-state módszerek, spektroszkópiai vizsgálatok Komplex egyszerű S E J T A citoszkeletális rendszer Orbán József, 213 Április Aktin citoszkeleton
A forminok hatása az aktin filamentumok polimerizációs tulajdonságaira és dinamikai jellemzőire
PhD ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A forminok hatása az aktin filamentumok polimerizációs tulajdonságaira és dinamikai jellemzőire BUGYI BEÁTA Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar Biofizikai Intézet 2006.
Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek
Speciális fluoreszcencia spektroszkópiai módszerek Fluoreszcencia kioltás Fluoreszcencia Rezonancia Energia Transzfer (FRET), Lumineszcencia A molekuláknak azt a fényemisszióját, melyet a valamilyen módon
Sejt. Aktin működés, dinamika plus / barbed end pozitív / szakállas vég 1. nukleáció 2. elongáció (hosszabbodás) 3. dinamikus egyensúly
Biofizikai módszerek a citoszkeleton vizsgálatára I: Kinetikai és steady-state spektroszkópiai módszerek Sejt Citoszkeletális rendszerek Orbán József, 2014 április Institute of Biophysics Citoszkeleton:
11/15/10! A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER! Polimerizáció! Polimerizációs egyensúly! Erő iránya szerint:! 1. valódi egyensúly (aktin)" Polimer mechanika!
11/15/10! A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER! 1. Mi a citoszkeleton?! 2. Polimerizáció, polimerizációs egyensúly! 3. Filamentumok osztályozása! Citoszkeleton : Eukariota sejtek dinamikus vázrendszere! Három fő
Pécsi Tudományegyetem. Forminok hatása az aktin filamentum konformációs és dinamikai tulajdonságaira. Papp Gábor
Pécsi Tudományegyetem Biológiai Doktori Iskola Mikroorganizmusok életfolyamatainak molekuláris analízise program Forminok hatása az aktin filamentum konformációs és dinamikai tulajdonságaira Ph.D. értekezés
Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét. Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet
Sejtmozgás és adhézió Molekuláris biológia kurzus 8. hét Kun Lídia Genetikai, Sejt és Immunbiológiai Intézet Sejtmozgás -amőboid - csillós - kontrakció Sejt adhézió -sejt-ecm -sejt-sejt MOZGÁS A sejtmozgás
A citoszkeleton Eukarióta sejtváz
A citoszkeleton Eukarióta sejtváz - Alak és belső szerkezet - Rugalmas struktúra sejt izomzat - Fehérjékből épül fel A citoszkeleton háromféle filamentumból épül fel Intermedier filamentum mikrotubulus
BIOMECHANIKA 2 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben
BIOMECHANIKA 2 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben A MOZGÁS MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI MOLEKULÁRIS MOZGÁS MOTORFEHÉRJÉK DR. BUGYI BEÁTA - BIOFIZIKA ELŐADÁS PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet. 9. A sejtmozgás mechanizmusai
A CITOSZKELETÁLIS RENDSZER 2011. 05. 03. Bugyi Beáta PTE ÁOK, Biofizikai Intézet 9. A sejtmozgás mechanizmusai Sejtmozgás, motilitás 1. Sejten belüli, intracelluláris mozgás izom összehúzódás organellumok
2013. 09. 02. www.biofizika.aok.pte.hu Biofizika I. Kötelező tantárgy Tantárgyfelelős: Dr. Nyitrai Miklós Heti 2 óra előadás, 2 óra gyakorlat Félévközi számonkérés: Egy írásbeli dolgozat Félév végi vizsga:kollokvium
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék.
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék. Citoszkeleton: eukarióta sejtek dinamikus fehérjevázrendszere Három fő filamentum-osztály: A. Intermedier B. Mikrotubulus C. Mikrofilamentum SCIENCE PHOTO LIBRARY
Az aktin kölcsönhatása forminnal: EPR és DSC vizsgálatok
Ph.D. értekezés tézisei Az aktin kölcsönhatása forminnal: EPR és DSC vizsgálatok Horváth-Kupi Tünde Témavezetők: Dr. Nyitrai Miklós Dr. Belágyi József Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék.
A citoszkeletális rendszer, motorfehérjék. SCIENCE PHOTO LIBRARY Huber Tamás 2012. 10. 15. Citoszkeleton: eukarióta sejtek dinamikus fehérjevázrendszere Három fő filamentum-osztály: A. Intermedier B. Mikrotubulus
A citoszkeletális rendszer
A citoszkeletális rendszer Az eukarióta sejtek dinamikus fehérje-vázrendszere, amely specifikus fehérjepolimer filamentumokból épül fel. Mikrofilamentumok Mikrotubulusok Intermedier filamentumok Aktin
A citoszkeletális rendszer, a harántcsíkolt izom biofizikája.
A citoszkeletális rendszer, a harántcsíkolt izom biofizikája. SCIENCE PHOTO LIBRARY Kupi Tünde 2010. 10. 19. Citoszkeleton: eukarióta sejtek dinamikus fehérjevázrendszere Három fı filamentum-osztály: A.
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Modern Biofizikai Kutatási Módszerek 2012. 11. 08. Fotonok és molekulák ütközése Fény (foton) ütközése a molekulákkal fényszóródás abszorpció E=hν
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET)
Fluoreszcencia módszerek (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Biofizika szeminárium PTE ÁOK Biofizikai Intézet Huber Tamás 2014. 02. 11-13. A gerjesztett állapotú elektron lecsengési lehetőségei Gerjesztés Fluoreszcencia
BIOMECHANIKA 3 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben
BIOMECHANIKA 3 Erőhatások eredete és következményei biológiai rendszerekben A MOZGÁS MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI SZERVEZET SZINTŰ MOZGÁS AZ IZOMMŰKÖDÉS MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI DR. BUGYI BEÁTA- BIOFIZIKA
A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai
BIOLÓGIAI MOZGÁSOK A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai Kollektív mozgás Szervezet mozgása ( Az évszázad ugrása ) Szerv mozgás BIOLÓGIAI MOZGÁSOK BIOLÓGIAI MOZGÁSOK Ritmusosan összehúzódó szívizomsejt
A zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban
BEVEZETÉS ÉS A KUTATÁS CÉLJA A zsírszövet mellett az agyvelő lipidekben leggazdagabb szervünk. Pontosabban az agy igen gazdag hosszú szénláncú politelítetlen zsírsavakban (LCPUFA), mint az arachidonsav
tulajdonságaira és dinamikai jellemzőire
PhD ÉRTEKEZÉS A for minok hatása az aktin filamentumok polimerizációs tulajdonságaira és dinamikai jellemzőire BUGYI BEÁTA Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar Biofizikai Intézet 2006. Program:
Kollár Veronika
A harántcsíkolt izom szerkezete, az izommőködés és szabályozás molekuláris alapjai Kollár Veronika 2010. 11. 11. Az izom citoszkeletális filamentumok és motorfehérjék rendezett összeszervezıdésébıl álló
Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET)
Fluoreszcencia 2. (Kioltás, Anizotrópia, FRET) Gerjesztés A gerjesztett állapotú elektron lecsengési lehetőségei Fluoreszcencia 10-9 s k f Foszforeszcencia 10-3 s k ph 10-15 s Fizika-Biofizika 2. Huber
K68464 OTKA pályázat szakmai zárójelentés
K68464 OTKA pályázat szakmai zárójelentés A fehérjeaggregáció és amiloidképződés szerkezeti alapjai; a különféle morfológiájú aggregátumok kialakulásának körülményei és in vivo hatásuk vizsgálata Vezető
A citoszkeleton. A citoszkeleton, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása. A citoszkeleton. A citoszkeleton.
, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása PTE ÁOK Biofizikai Intézet Ujfalusi Zoltán 2012. január-február Eukarióta sejtek dinamikus vázrendszere Három fő filamentum-osztály: 1. Intermedier
Polarizáció fogalma. A polarizált fény. A fluoreszcencia alapvető paraméterei. Elektromágneses hullámok. Polarizált fény, polarizáció
Fluorescencia polariáció, aniotrópia FRAP A fluorescencia alapvető paraméterei Fluorescencia spektrum Intenitás Kvantumhatásfok Élettartam Polariáció 11..15. Polariált fén, polariáció Elektromágneses hullámok
Tudjunk Egymásról Bugyi Beáta 22/11/2012
Listeria monocytogenes Loisel, Boujemaa et al. Nature 1999 Összetett aktin hálózatok Spire/formin szinergia Reymann et al. Nature Materials 1 ADF/aktin Bosch, Bugyi B et al. Molecular Cell 7 Reymann et
Biokatalitikus Baeyer-Villiger oxidációk Doktori (PhD) értekezés tézisei. Muskotál Adél. Dr. Vonderviszt Ferenc
Biokatalitikus Baeyer-Villiger oxidációk Doktori (PhD) értekezés tézisei Készítette: Muskotál Adél Környezettudományok Doktori Iskola Témavezető: Dr. Vonderviszt Ferenc egyetemi tanár Pannon Egyetem Műszaki
Az aktin kölcsönhatása forminnal: EPR és DSC vizsgálatok
Ph.D. értekezés Az aktin kölcsönhatása forminnal: EPR és DSC vizsgálatok Horváth-Kupi Tünde Témavezetők: Dr. Nyitrai Miklós Dr. Belágyi József Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar Biofizikai
Lumineszcencia spektrometria összefoglaló
Lumineszcencia spektrometria összefoglaló Ismétlés: fény (elektromágneses sugárzás) elnyelés: abszorpció elektron gerjesztés: excitáció alap és gerjesztett állapot atomi energiaszintek, energiaszintek
Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium sejtjeiben
TÉMA ÉRTÉKELÉS TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KMR-2010-0003 (minden téma külön lapra) 2010. június 1. 2012. május 31. 1. Az elemi téma megnevezése Búza tartalékfehérjék mozgásának követése a transzgénikus rizs endospermium
Biomolekulák nanomechanikája A biomolekuláris rugalmasság alapjai
Fogorvosi Anyagtan Fizikai Alapjai Biomolekulák nanomechanikája A biomolekuláris rugalmasság alapjai Mártonfalvi Zsolt Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Semmelweis Egyetem Budapest Biomolekulák mint
MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI
DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK VIZSGÁLATA Péteri Adrienn Zsanett Témavezetők: Dr. Varga János, Egyetemi docens Dr. Vágvölgyi Csaba, Tanszékvezető egyetemi
a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál. Nyugalmi potenciál. 3 tényező határozza meg:
Egy idegsejt működése a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Nyugalmi potenciál Az ionok vándorlása 5. Alacsonyabb koncentráció ioncsatorna membrán Passzív Aktív 3 tényező határozza meg: 1. Koncentráció
A DAAM formin hatása az aktin dinamikájára
PhD értekezés A DAAM formin hatása az aktin dinamikájára Barkó Szilvia Témavezető: Dr. Nyitrai Miklós Pécsi Tudományegyetem Általános Orvostudományi Kar Biofizikai Intézet Pécs 2012 Interdiszciplináris
A motorfehérjék definíciója. A biológiai motorok 12/9/2016. Motorfehérjék. Molekuláris gépek. A biológiai mozgás
A motorfehérjék definíciója Motorfehérjék Nyitrai Miklós, 2016 november 30. Molekuláris gépek A molekuláris mozgások alapját gyakran motor fehérjék biztosítják. Megértésük a biológia egyik súlyponti kérdése;
Ph.D. disszertáció tézisei
Ph.D. disszertáció tézisei EGY ÚJ DROSOPHILA FORMIN SZÖVETSPECIFIKUS FUNKCIÓINAK GENETIKAI, SEJTBIOLÓGIAI, ÉS BIOKÉMIAI VIZSGÁLATA Matusek Tamás Témavezető: Dr. Mihály József Magyar Tudományos Akadémia
Tubulin, mikrotubuláris rendszer és mikrotubulus asszociált fehérjék
Tubulin, mikrotubuláris rendszer és mikrotubulus asszociált fehérjék Talián Csaba Gábor PTE ÁOK, Biofizika Intézet 2012. február 21. Transzmissziós elektronmikroszkópos felvétel egy Heliozoa axopódiumának
Egy idegsejt működése. a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál
Egy idegsejt működése a. Nyugalmi potenciál b. Transzport proteinek c. Akciós potenciál Nyugalmi potenciál Az ionok vándorlása 5. Alacsonyabb koncentráció ioncsatorna membrán Passzív Aktív 3 tényező határozza
Kábeldiagnosztikai vizsgálatok a BME-n
Budapesti i Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Kábeldiagnosztikai vizsgálatok a BME-n Tamus Zoltán Ádám tamus.adam@vet.bme.hu TARTALOM Szigetelőanyagok öregedése Kábelek öregedése Szigetelésdiagnosztika
A biológiai mozgások. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai. Motorfehérjék. Motorfehérjék közös tulajdonságai
A biológiai mozgások Molekuláris mozgás A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai Celluláris mozgás Mártonfalvi Zsolt Bakteriális flagellum Szervezet mozgása Keratocita mozgása felületen 1 Motorfehérjék
1. AKTIN CITOSZKELETON
A CITOSZKELETÁLIS REDSZER 20. 02. 08.. AKTI CITOSZKELETO Citozeletáli atin HEp-2 ejteben - rodamin-falloidin jelölé forrá: yitrai Miló, Grama Lázló, PTE ÁOK, Biofiziai Intézet CITOSZKELETO CITO : ejt /
Tubulin, mikrotubuláris rendszer és mikrotubulus asszociált fehérjék
Tubulin, mikrotubuláris rendszer és mikrotubulus asszociált fehérjék Talián Csaba Gábor PTE ÁOK, Biofizika Intézet 2011. február 22. Transzmissziós elektronmikroszkópos felvétel egy Heliozoa axopódiumának
A citoszkeleton. A citoszkeleton, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása. A citoszkeleton. A citoszkeleton. Az aktin.
, a motorfehérjék, az izom és működésének szabályozása PTE ÁOK Biofizikai Intézet Ujfalusi Zoltán 2011. január-február Eukarióta sejtek dinamikus vázrendszere Három fő filamentum-osztály: 1. Intermedier
A plazma membrán mikrodomének szabályzó szerepe a sejtek növekedési és stressz érzékelési folyamataiban. Csoboz Bálint
A PhD értekezés összefoglalása A plazma membrán mikrodomének szabályzó szerepe a sejtek növekedési és stressz érzékelési folyamataiban Csoboz Bálint Témavezető: Prof. László Vígh Biológia Doktori Iskola
Sejtciklus. Sejtciklus. Centriólum ciklus (centroszóma ciklus) A sejtosztódás mechanizmusa. Mikrotubulusok és motor fehérjék szerepe a mitózisban
A sejtosztódás mechanizmusa Mikrotubulusok és motor fehérjék szerepe a mitózisban 2010.03.23. Az M fázis alatti események: mag osztódása (mitózis) mitotikus orsó: MT + MAP (pl. motorfehérjék) citoplazma
Hemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly
Hemoglobin - myoglobin Konzultációs e-tananyag Szikla Károly Myoglobin A váz- és szívizom oxigén tároló fehérjéje Mt.: 17.800 153 aminosavból épül fel A lánc kb 75 % a hélix 8 db hélix, köztük nem helikális
Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól
Ragyogó molekulák: dióhéjban a fluoreszcenciáról és biológiai alkalmazásairól Kele Péter egyetemi adjunktus Lumineszcencia jelenségek Biolumineszcencia (biológiai folyamat, pl. luciferin-luciferáz) Kemilumineszcencia
Történeti áttekintés. Eukarióta. Prokarióta. A citoszkeletális rendszer. Motorfehérjék. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai.
A citoszkeletális rendszer. Motorfehérjék. A biológiai mozgás molekuláris mechanizmusai. Előadásvázlat TK. 345-353. oldal citoszkeleton története polimer mechanika vizsgálómódszerek polimerizáció aktin
A búza (Triticum aestivum L.) glutamin szintetáz enzim viselkedése abiotikus stresszfolyamatok (a szárazság- és az alumíniumstressz) során
Doktori (PhD) értekezés tézisei A búza (Triticum aestivum L.) glutamin szintetáz enzim viselkedése abiotikus stresszfolyamatok (a szárazság- és az alumíniumstressz) során Készítette: Nagy Zoltán Témavezető:
PhD DISSZERTÁCIÓ TÉZISEI
Budapesti Muszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Fizikai Kémia Tanszék MTA-BME Lágy Anyagok Laboratóriuma PhD DISSZERTÁCIÓ TÉZISEI Mágneses tér hatása kompozit gélek és elasztomerek rugalmasságára Készítette:
Lumineszcencia spektroszkópia
Lumineszcencia spektroszkópia Elektron+vibrációs+rotációs-spektroszkópia alapjai 213. február Fizika-Biofizika II. szemeszter Orbán József PTE ÁOK Biofizikai Intézet Definíciók, törvények SPEKTROSZKÓPIAI
Az Aktin Filamentumok Hosszát Szabályozó Fehérjék Szerkezeti Dinamikája és Élettani Szerepük
Az Aktin Filamentumok Hosszát Szabályozó Fehérjék Szerkezeti Dinamikája és Élettani Szerepük Szatmári Dávid Zoltán Témavezetők: Prof. Dr. Nyitrai Miklós, Prof. Dr. Robert C. Robinson Interdiszciplináris
FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,
FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium Alkímia Ma, Budapest, 2013.02.28. I. FEHÉRJÉK: L-α aminosavakból felépülő lineáris polimerek α H 2 N CH COOH amino
A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA
EGYETEMI DOKTORI (PH.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA Nagy Zoltán Témavezet : Dr. Biró Sándor Debreceni Egyetem Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék
A harántcsíkolt izom struktúrája általános felépítés
harántcsíkolt izom struktúrája általános felépítés LC-2 Izom LC1/3 Izom fasciculus LMM S-2 S-1 HMM rod Miozin molekula S-1 LMM HMM S-2 S-1 Izomrost H Band Z Disc csík I csík M Z-Szarkomér-Z Miofibrillum
Lumineszcencia spektrometria összefoglaló
Lumineszcencia spektrometria összefoglaló Ismétlés: fény (elektromágneses sugárzás) elnyelés: abszorpció elektron gerjesztés: excitáció alap és gerjesztett állapot atomi energiaszintek, energiaszintek
Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre
Semmelweis Egyetem Molekuláris Orvostudományok Tudományági Doktori Iskola Pathobiokémia Program Doktori (Ph.D.) értekezés Diabéteszes redox változások hatása a stresszfehérjékre dr. Nardai Gábor Témavezeto:
Toxinok által létrehozott konformációs és dinamikai változások az aktin filamentumban
Ph.D. értekezés tézisei Toxinok által létrehozott konformációs és dinamikai változások az aktin filamentumban Visegrády Baázs Program: Biokémia és molekuláris biológia Programvezető: Dr. Sümegi Balázs
A KAR-2, egy antimitotikus ágens egyedi farmakológiájának atomi és molekuláris alapjai
A KAR-2, egy antimitotikus ágens egyedi farmakológiájának atomi és molekuláris alapjai A doktori értekezés tézisei Horváth István Eötvös Loránd Tudományegyetem Biológia Doktori Iskola (A Doktori Iskola
GALAKTURONSAV SZEPARÁCIÓJA ELEKTRODIALÍZISSEL
PANNON EGYETEM VEGYÉSZMÉRNÖKI- ÉS ANYAGTUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA GALAKTURONSAV SZEPARÁCIÓJA ELEKTRODIALÍZISSEL DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI KÉSZÍTETTE: MOLNÁR ESZTER OKL. ÉLELMISZERMÉRNÖK TÉMAVEZETŐ:
Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék
Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék PATOGÉN MIKROORGANIZMUSOK KIMUTATÁSÁRA SZOLGÁLÓ GYORS MÓDSZEREK ÖSSZEHASONLÍTÓ VIZSGÁLATA Rohonczy Kata Doktori
Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025)
Részletes szakmai beszámoló Az erbb proteinek asszociációjának kvantitatív jellemzése című OTKA pályázatról (F049025) A pályázat megvalósítása során célunk volt egyrészt a molekulák asszociációjának tanulmányozására
Dinamikus fehérjerendszerek a sejtben
BIOLÓGIAI MOZGÁSOK Dinamikus fehérjerendszerek a sejtben Ritmusosan összehúzódó szívizomsejt Osztódó sejt Kellermayer Miklós Axon (neurit) növekedés Mozgó spermatociták BIOLÓGIAI MOZGÁSOK A citoszkeletális
TALAJVÉDELEM XI. A szennyezőanyagok terjedését, talaj/talajvízbeli viselkedését befolyásoló paraméterek
TALAJVÉDELEM XI. A szennyezőanyagok terjedését, talaj/talajvízbeli viselkedését befolyásoló paraméterek A talajszennyezés csökkenése/csökkentése bekövetkezhet Természetes úton Mesterséges úton (kármentesítés,
LTSÉG G ALATTI DIAGNOSZTIKAI PARAMÉTEREKRE. tamus.adam@vet.bme.hu. gtudományi Egyetem
Budapesti i Műszaki M és s Gazdaságtudom gtudományi Egyetem TERMIKUS ÉS S FESZÜLTS LTSÉG G ALATTI ÖREGÍTÉS S HATÁSA A DIAGNOSZTIKAI PARAMÉTEREKRE Tamus Zoltán Ádám, Cselkó Richárd, Németh N Bálint, B Berta
Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák
Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák hatása(i) a monocita sejt működésére Kovács Árpád Ferenc 1, Láng Orsolya 1, Kőhidai László 1, Rigó János 2, Turiák Lilla 3, Fekete Nóra 1, Buzás Edit 1,
Baranyáné Dr. Ganzler Katalin Osztályvezető
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Biokémiai és Élelmiszertechnológiai Tanszék Kapilláris elektroforézis alkalmazása búzafehérjék érésdinamikai és fajtaazonosítási vizsgálataira c. PhD értekezés
AZ AKTIN AKTIVÁCIÓ ÚJ MECHANIZMUSA: Gyimesi Máté
AZ AKTIN AKTIVÁCIÓ ÚJ MECHANIZMUSA: AZ AKTIN KÖZVETLENÜL AZ ERŐGENERÁLÓ LÉPÉST GYORSÍTJA MIOZIN II-BEN Gyimesi Máté Témavezető: Dr. Málnási-Csizmadia András Biológia Doktori Iskola, iskolavezető: Prof.
Érzékszervi receptorok
Érzékszervi receptorok működése Akciós potenciál Érzékszervi receptorok Az akciós potenciál fázisai Az egyes fázisokat kísérő ionáram változások 214.11.12. Érzékszervi receptorok Speciális sejtek a környezetből
A DAAM formin alcsalád szerepe az izomfejlődésben. A Ph.D. értekezés tézisei. Molnár Imre. Témavezető: Dr. Mihály József
A DAAM formin alcsalád szerepe az izomfejlődésben A Ph.D. értekezés tézisei Molnár Imre Témavezető: Dr. Mihály József SZTE Biológia Doktori Iskola Magyar Tudományos Akadémia, Szegedi Biológiai Kutatóközpont,
ANATÓMIA FITNESS AKADÉMIA
ANATÓMIA FITNESS AKADÉMIA sejt szövet szerv szervrendszer sejtek általános jellemzése: az élet legkisebb alaki és működési egysége minden élőlény sejtes felépítésű minden sejtre jellemző: határoló rendszer
Flagellin alapú filamentáris nanoszerkezetek létrehozása
Flagellin alapú filamentáris nanoszerkezetek létrehozása Vonderviszt Ferenc PE MÜKKI Bio-Nanorendszerek Laboratórium MTA Enzimológiai Intézete MTA MFA Bakteriális flagellumok Flagelláris filamentum: ~10
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM Kémia Doktori Iskola Fehérje szerkezet és működés c. program Glicerinezett izomrostok vizsgálata ATP hidrolízis köztes állapotaiban EPR és DSC technikával PhD értekezés Degez Tímea
Abszorpciós fotometria
abszorpció Abszorpciós fotometria Spektroszkópia - Színképvizsgálat Spektro-: görög; jelente kép/szín -szkópia: görög; néz/látás/vizsgálat Ujfalusi Zoltán PTE ÁOK Biofizikai Intézet 2012. február Vizsgálatok
Biológiai membránok és membrántranszport
Biológiai membránok és membrántranszport Biológiai membránok A citoplazma membrán funkciói: térrészek elválasztása (egész sejt, organellumok) transzport jelátvitel Milyen a membrán szerkezete? lipidek
kutatás során legfőbb eredményeinket a szerin proteázok aktiválódásának mechanizmusával és az aktiválódás fiziológiai következményeinek
Fehérjék konformációs flexibilitása mint a biomolekuláris felismerés és a jeltovábbítás alapvető eleme (OTKA NK 77978) Zárójelentés (2009. ápr. 1-től 2013. márc. 31-ig) A biológiai rendszerek önszerveződésének
Ph.D. értekezés. AZ IRSp53 FEHÉRJE SZEREPE A FILOPÓDIUM FORMÁLÁS FOLYAMATÁBAN
Ph.D. értekezés AZ IRSp53 FEHÉRJE SZEREPE A FILOPÓDIUM FORMÁLÁS FOLYAMATÁBAN FUTÓ KINGA Pécsi Tudományegyetem, Általános Orvostudományi Kar, Biofizikai Intézet 2014 10 Program: Doktori Program vezetője:
A DISHEVELLED-ASSOCIATED ACTIVATOR OF MORPHOGENESIS FORMIN SZEREPE AZ AKTIN ÉS MIKROTUBULUS SEJTVÁZ DINAMIKAI SZABÁLYOZÁSÁBAN.
PhD értekezés tézisei A DISHEVELLED-ASSOCIATED ACTIVATOR OF MORPHOGENESIS FORMIN SZEREPE AZ AKTIN ÉS MIKROTUBULUS SEJTVÁZ DINAMIKAI SZABÁLYOZÁSÁBAN Vig Andrea Témavezető: Dr. Bugyi Beáta Doktori iskola:
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
A módszerek jelentősége. Gyors-kinetika módszerek. A módszerek közös tulajdonsága. Milyen módszerekről tanulunk?
Gyors-kinetika módszerek módszerek jelentősége 2010. március 9. Nyitrai Miklós biológiai mechanizmusok megértése; iológiai folyamatok időskálája; Vándorló melanocita (Victor SMLL). ms skálán való mérések.
Kutatási beszámoló 2006-2009. A p50gap intracelluláris eloszlásának és sejtélettani szerepének vizsgálata
Kutatási beszámoló 6-9 Kutatásaink alapvetően a pályázathoz benyújtott munkaterv szerint történtek. Először ezen eredményeket foglalom össze. z eredeti tervektől történt eltérést a beszámoló végén összegzem.
transzláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015
Kollokviumi vizsgakérdések biokémiából humánkineziológia levelező (BSc) 2015 A kérdés 1. A sejtről általában, a szervetlen alkotórészeiről, a vízről részletesen. 2. A sejtről általában, a szervetlen alkotórészeiről,
MULTICELLULÁRIS SZERVEZŐDÉS: SEJT-SEJT (SEJT-MÁTRIX) KÖLCSÖNHATÁSOK 1. Bevezetés (2.)Extracelluláris mátrix (ECM) (Kollagén, hialuron sav,
MULTICELLULÁRIS SZERVEZŐDÉS: SEJT-SEJT (SEJT-MÁTRIX) KÖLCSÖNHATÁSOK 1. Bevezetés (2.)Extracelluláris mátrix (ECM) (Kollagén, hialuron sav, proteoglikánok) (3.)Multiadhéziós fehérjék és sejtfelszíni receptorok
Szakmai önéletrajz. Nyelvvizsga: Angol orvosi szaknyelv középfok (Bizonyítvány száma: D A 794/1997), orosz alapfok.
Szakmai önéletrajz Személyi adatok Név: Dr. Deli József Születési hely, idő: Baja, 1956. március 6. Állampolgárság: magyar Családi állapot: nős, 2 gyermek apja (Orsolya 1985, Kristóf 1988) Lakcím: 7634
A nukleotidok és az aktinkötő fehérjék szerepe az aktin funkcionális konformációváltozásaiban
A nukleotidok és az aktinkötő fehérjék szerepe az aktin funkcionális konformációváltozásaiban Türmer Katalin Erzsébet Témavezetők: Prof. Dr. Nyitrai Miklós, Prof. Dr. Belágyi József Pécsi Tudományegyetem,
A POLIELEKTROLIT/TENZID ASSZOCIÁCIÓ SZABÁLYOZÁSA NEMIONOS TENZIDEK ÉS POLIMEREK SEGÍTSÉGÉVEL
Doktori értekezés tézisei A POLIELEKTROLIT/TENZID ASSZOCIÁCIÓ SZABÁLYOZÁSA NEMIONOS TENZIDEK ÉS POLIMEREK SEGÍTSÉGÉVEL FEGYVER EDIT Témavezető: Dr. Mészáros Róbert, egyetemi docens Kémia Doktori Iskola
BME Department of Electric Power Engineering Group of High Voltage Engineering and Equipment
Budapest University of Technology and Economics A MECHANIKAI JELLEMZŐK MÉRÉSE AZ ATOMERŐMŰVI KÁBELEK ÁLLAPOTVIZSGÁLATÁBAN Zoltán Ádám TAMUS e-mail: tamus.adam@vet.bme.hu A MECHANIKAI JELLEMZŐK MÉRÉSE AZ
Biofizika I
ÁTTEKINTÉS AZ IZOM 9. A HARÁNTCSÍKOLT IZOM SZERKEZETE ÉS MECHANIKÁJA 10. AZ IZOMMŰKÖDÉS ÉS SZABÁLYOZÁS MOLEKULÁRIS ALAPJAI TÍPUSAI: SZERKEZET és FUNKCIÓ MŰKÖDÉSÉNEK MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSAI MECHANIKAI