A Biokémia szigorlat írásbeli esszékérdései (ÁOK)/ Essay questions of the written part of the biochemistry final exam (Gen.Med.) 2012/2013.

Átírás

1 A Biokémia szigorlat írásbeli esszékérdései (ÁOK)/ Essay questions of the written part of the biochemistry final exam (Gen.Med.) 2012/2013. ****************** Molekuláris Biológia/Molecular Biology ****************** Az eukariota sejtek és organellumok eredete, kompartmentek a sejtekben Origin of eukaryotic cells and organelles, compartments in the cells. ************** A fehérje domén, 3 példa. Definition of protein domain and 3 examples. ************** Az átmeneti állapot (transition state) fogalma; jelentősége enzimreakciókban. Transition state: what is its role in an enzyme raction; how the enzymes are involved to reach the transition state. ************** A lizozim katalitikus működése. Basic features of the catalytic mechanism of lysozyme. ************** A ribonukleáz A működési mechanizmusának jellemzői. Basic features of the catalytic mechanism of ribonuclease A. ************** Enzimek kompetitív és nem-kompetitív gátlásának elvi alapjai. Példák. Competitive and non-competitive inhibition of enzymes. Examples. ************** Az aktív kromatin leírása. Description of activ chromatin. ************** A promóter és enhanszer értelmezése. Definition of promoters and enhancers. ************** Transzkripciós faktorok értelmezése Transcription factors (definition, function, structure) ************** Az egynukleotidás polimorfizmusok jelentősége és a fehérje polimorfizmus. Significance of single nucleotide polymorphisms and their significance in the medical sciences. ************** A DNS replikáció proteinjei és mechanizmusa eukariótákban Mechanism and proteins of DNA replication in eukariotes ************** Az eukarióta RNS polimerázok működése Mode of action of eukaryotic RNA polymerases. ************** Az mrns prekurzorok processzálása Processing of mrna precursors ************** Telomeráz enzim és biológiai szerepe Telomerase enzyme and its biological role ************** DNS repair DNA repair ************** 1

2 Fehérje szintézis, transzláció elindítása. Protein synthesis, initiation of translation. ************** Fehérje szintézis, elongáció és termináció. Protein synthesis, elongation and termination ************** DNS chip technikák. Principle of DNA chip techniques. ************** A gének klónozásának lényege. Principle of gene cloning. ************** PCR és annak újabb alkalmazásai. Principle and application of PCR. ************** ****************** Anyagcsere/Metabolism ****************** Írja le a protongradiens kialakulását a mitokondriumban, annak jeletőségét és csökkenésének módjait. Terjen ki az elhízással való kapcsolatokra is. Describe how the protongradient is formed in the mitochondria. What is its importance, how can the protongradient decrease and how is this connected to obesity. Irja le a mitokondriális genom működését, genetikai tartalmát és betegségek kialakulásában betöltött szerepét. Describe how the mitocondrial genome works. What is it coding for and what is its role in the development of specific diseases. A glükóz sorsa különböző szövetekben The fate of glucose in various tissues A glikolízis reakciói és jelentősége The glycolytic pathway and its significance Glükoneogenezis laktátból: enzimatikus lépések és lokalizációjuk Enzymatic steps and their localization in the gluconeogenesis, from lactate A glikogén szintézis reakciói, szabályozása Enzymatic steps of the synthesis of glycogen, regulation Glikogén lebontása (glikogenolízis) májban és izomban; a glikogén foszforiláz szabályozása Degradation of glycogen Glycogenolysis) in liver and muscle; regulation of glycogen phosphorylase Pentóz foszfát útvonal, jelentősége, lehetséges irányai Significance of the pentose phosphate pathway, possible directions A karbamoil foszfát szintáz I. reakció és az urea ciklus. The carbamoyl phosphate synthase I. reaction and the urea cycle. C-1 transzfer, transzmetiálás C-1 transfer, transmethylation B 12 -vitamin-függő reakciók az emberi szervezetben, B 12 vitamin hiány következményeinek molekuláris értelmezése Vitamin B12-dependent reactions in the human body, consequences of the vitamin B12 deficiency Aminosav anyagcsere enzimhiányai (PKU, MSUD..., legalább 3 példa, molekuláris értelmezéssel) Inborn errors of enzymes of aminoacid metabolism (PKU, MSUD, at least 3 examples with molecular interpretation) 2

3 Páros szénatomszámú, telített zsirsavak lebontása. Lépések, enzimek, kofaktorok. Degradation of fatty acids of even number carbon atoms. Steps, enzymes and cofactors. Ketontestek keletkezése és felhasználása. Milyen körülmények között fokozódik a szintézisük? Formation and consumption of ketone bodies. Under which conditions will the rate of their synthesis increase? Anyagcsere folyamatok a májban tartós éhezéskor. Biochemical events in liver under starvation. Biokémiai történések a májban és a zsírszövetben szénhidrát-dús táplálkozás esetén Biochemical events in liver and in adipose tissue in case of carbohydrate - rich diet. A koleszterol-szintézis fontosabb lépései. Main steps of cholesterol biosynthesis. Regulation. Irja le a vér plazma koleszterol szint és az arterioszklerózis összefüggését és a jelenleg használatos plazmakoleszterol szint csökkentő módszerek molekuláris mechanizmusait. Describe the relationship between the plasma cholesterol level and arteriosclerosis, and the molecular basis of the currently used ways to decrease plasma cholesterol concentration. Jellemezze az LDL receptort. Irja le a szerepét, lokalizációját, formáit, mutációit és szerepét a plazmakoleszterol szint szabályozásában. Describe the LDL receptor. Its function, localisations, forms, mutations and the role in the plasma cholesterol level maintenance. Irja le a ciklooxigenáz és lipoxigenáz útvonalak közötti különbségeket. Hogyan befolyásolhatjuk gyógyszeresen ezeket az útvonalakat? Magyarázza el ezen útvonalak és szabályozásuk orvosi jelentőségét. Describe the differences between the cyclo-oxigenase and lipo-oxigenase pathways and the ways to modulate them. Explain the medical relevance of these pathways and of the modulation of these pathways. A purin nukleotidok szintézisének prekurzorai, a szintézis szabályozása. Precursors of the purin nucleotide synthesis, regulation of the synthesis. Mentési reakciók, és jelentőségük a nukleotid anyagcserében Salvage pathways for purines and pyrimidines Purin nukleotid anyagcserével összefüggő betegségek: Lesch-Nyhan szindróma, köszvény, immunhiányos betegségek. Disorders of purin nucleotide metabolism: Lesch-Nyhan syndrome, gout, immunodeficiency diseases Pirimidin nukleotidok szintézisének főbb lépései Main steps of the synthesis of pyrimidine nucleotides Dezoxiribonukleotidok és timidilát szintézise. Deoxyribonucleotide and thymidylate synthesis Az aktív D vitamin szintézise, hatásai, D vitamin hiánya. Synthesis of active vitamin D, its biochemical effects, vitamin D deficiency ** Az A és az E vitamin biokémiája Biochemistry of vitamin A and E. ********************************************************** A fólsav biokémiája és hiányának tünetei Biochemistry of folic acid. 3

4 ****************** Sejt- és szervbiokémia/ Cell and organ biochemistry ************** A szteroidok által kiváltott transzkripció-aktiválás mechanizmusa Biochemical explanation of the steroid-induced transcriptional activation. Az aktív kromatin: definíció, létrehozó tényezők, kialakulásának eredménye The active chromatin: definíció, biochemical elements, the result of its formation A transzkripció szabályozása (DNS szekvenciák és szabályozó fehérjék) Regulation of transcription (DNA sequences and regulatory proteins) A sejtciklus szabályozásának biokémiai értelmezése. Az M fázis kináz működése. Biochemical interpretation of the cell cycle and its regulation. The M phase kinase. A ras proliferaciós szignálútvonal The ras signal pathway of cell proliferation Az apoptózist kiváltó és végrehajtó molekuláris folyamatok. Molecular mechanisms in the induction and execution of apoptosis. A P53 fehérje biológiai funkciója Biological function of P53 A foszfolipázok szerepe a szignálátviteli folyamatokban Role of phospholipases in the signal transduction Az inzulin: receptora, szignálútvonala, általános szerepe az anyagcsere szabályozásában Receptor, signalling pathway of insulin, general role in the control of metabolism DNS károsodás jelátviteli útvonala. Signal transduction pathway of DNA damage. Magreceptorok felépítése, csoportjai és működésük. Nuclear receptors replace with: Structure, classification and function of nuclear receptors. A NO szignál útvonala és biológiai szerepe The NO signalling pathway, its biological role G fehérjék: szerkezet, funkció, aktiváció, példák a G fehérjéken keresztül történő jeltovábbításra G proteins; structure, function, activation, examples of signalling through G proteins Az adenilát cikláz szignálútvonal felépítése, példák The adenylate cyclase signalling pathway, examples Hsp 70 stressz fehérjék: a molekuláris chaperonok működésének lényege. Hsp 70 stress proteins: function of the molecular chaperones. A stresszválasz molekuláris szabályozása. Molecular regulation of the stress response. Az etanol metabolizmusa az emberi májban Metabolism of ethanol in the human liver Az akut fázis reakció biokémiai értelmezése Biochemical interpretation of the acut phase reaction A biotranszformáció során működő monooxigenázok; jelentőségük és működésük Biotransformation; definition, detailed description of conjugation reactions (three examples), origine of conjugated compounds 4

5 A biotranszformáció lényege, konjugációs reakciók (legalább 3 példa), a konjugálódó vegyületek eredete. Monooxygenases functioning during the biotransformation reactions; mechanism of function, significance A hem szintézisének főbb lépései. A szintézis szabályozása a májban. Major steps of the heme synthesis (enzymes, localization). Regulation of the synthesis in the liver. A hem lebontása és kiürítése az emberi szervezetből. Főbb lépések, enzimek, lokalizáció. Degradation and excretion of heme. (Steps, enzymes, localization). A vas felszívódása, szállítása és tárolása. Absorption of the iron. Proteins of the iron transport and storage. Vastartalmú fehérjék az emberi szervezetben; azok főbb funkciói. Iron containing proteins in the human body; their major functions. A transzferrin receptor és ferritin szint molekuláris szabályozása. Molecular regulation of the transferrin receptor and ferritin level. Érett kollagén rost szerkezete és keletkezése; posztszintetikus módosítások. Structure and formation of the mature collagen fiber; postsynthetic modifications. Integrin receptorok: felépítésük, tulajdonságaik és szerepük az extracelluláris matrix szerveződésében. Integrin receptors: structure, properties and theit role in the organization of the extracellular matrix. Glükózaminoglikánok és proteoglikánok szerepe az extracelluláris matrix felépítésében és funkcióiban (képletek nélkül). Role of the glycosaminoglycans and proteoglycans in the specific structure and functions of the extracellular matrix (without structural formulas). Az edzés biokémiai hatása az izom glükóz felvételére és a lipid metabolizmusra az AMP aktivált protein kináz aktiválása által. Biochemical effects of exercise on glucose uptake to muscles and on lipid metabolism by activating the AMP activated protein kinase. ** Hatásuk alapján csoportosítsa a dopping szereket, és röviden jellemezze azokat. Please classify the doping agents according to their effects and characterize them briefly. Az izom energiaellátása különböző intenzitású munka esetén, az IRISIN hormon termelése fizikai aktivitás során és hatása. Energy metabolism of the muscle in various intensity of work; production of IRISIN by physical activity and its effects. Trombociták adhéziójának és aggregációjának mechanizmusa. Adhesion and aggregation of platelets K-vitamin függő karboxiálás, K-vitamin függő faktorok szerepe a véralvadásban. Role of Vitamin K dependent carboxylation and vitamink dependent factors in blood coagulation A véralvadás korai fázisa emberben és kémcsőben. Early stage of blood coagulation in test tubes and in the body Véralvadás késői fázisa. Advanced stage of blood coagulation A trombociták és az érfal szerepe a véralvadásban. Role of platelets and blood vessel wall in blood coagulation A vörösvértest anyagcseréjének jellemzői Metabolism of red blood cells A hemoglobin oxigénkötését befolyásoló tényezők Factors influencing the oxygen binding of hemoglobin. 5

6 A 2,3 difoszfoglicerát keletkezése és szerepe Formation and role of 2,3-bisphosphoglycerate. A leukociták részvétele a gyulladási reakcióban Participation of leukocytes in the inflammatory reaction ************* Gyakorlat/Practical ************ Hogyan határozta meg a foszfatáz enzim Km és Vmax értékét a gyakorlaton? How did you determine the Km and Vmax value of phosphatase enzyme? ** Hogyan vizsgálta a foszfatáz enzim kompetitív és nem-kompetitiv gátlasát a gyakorlaton? How did you study the competitive and non-competitive inhibition of phosphatase enzyme? LDH aktivitás mérésének módszere a gyakorlaton. Methods for measuring the lactate dehydrogenase activity Az LDH izoformák elektroforetikus elválasztása Separation of LDH isoforms by electrophoresis * A transzamináz-reakció megfordíthatósága Reversibility of the transaminase reaction ** Transzaminázok aktivitásának meghatározására használt módszerek. Methods for the determination of transaminase activity (practical). Mitokondriális energiatermelő folyamatok vizsgálata: a P/O hányados meghatározása Studies on mitochondrial energy producing mechanisms: determination of P/O ratio Mitokondriális energiatermelő folyamatok vizsgálata: ADP, oligomicin, DNP és KCN hatása az oxigénfogyasztásra Studies on mitochondria: effects of ADP, oligomycin, DNP and KCN on respiration Fenilketonuria kimutatásának módszere a gyakorlaton Method for detection of phenylketonuria Trombin-idő meghatározása és a XIII-as faktor hatásának tanulmányozása a gyakorlaton Determination of thrombin time and examination of factor XIII effect on the practice * Szérumfehérjék frakcionálása és mennyiségi meghatározása Fractination and quantitative determination of serum proteins 6