DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI VESZPRÉMI EGYETEM GEORGIKON MEZGAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR KESZTHELY



Hasonló dokumentumok
BEVEZETÉS CÉLKITŰZÉS

Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Háziállatokból izolált Histophilus somni törzsek összehasonlító vizsgálata

Nagy Emese: Polimorfizmus és rokonsági körök vizsgálata kukoricában (Zea mays) Témavezetők: Cs. L. Marton G Gyulai

EGZAKT MINŐSÍTŐ ÉS OSZTÁLYOZÓ RENDSZER FEJLESZTÉSE NÖVÉNYNEMESÍTÉSI ÉS NÖVÉNYKÓRTANI VIZSGÁLATOKHOZ

AGROTECHNIKAI TÉNYEZŐK HATÁSA A KULTÚRNÖVÉNYEKRE ÉS A GYOMOSODÁSRA

MIKROSZKÓPIKUS GOMBÁK MIKOTOXIN-BONTÓ KÉPESSÉGÉNEK. Péteri Adrienn Zsanett DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

A basidiomycota élesztőgomba, a Filobasidium capsuligenum IFM törzse egy olyan

Zárójelentés. Állati rotavírusok összehasonlító genomvizsgálata. c. OTKA kutatási programról. Bányai Krisztián (MTA ATK ÁOTI)

ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA Doktori Iskola vezető: Dr. Bánszki Tamás, MTA doktora. Témavezetők: mezőgazdaság-tudomány kandidátusa

FENNTARTHATÓ FÖLDHASZNÁLATI STRATÉGIA KIALAKÍTÁSA MAGYARORSZÁGON

DNS molekulák elválasztása agaróz gélelektroforézissel és kapilláris elektroforézissel

Posztvakcinációs rotavírus surveillance Magyarországon,

Hazai méhészeti genomikai és genetikai vizsgálatok

KÁRPÁT-MEDENCEI ALMAFAJTÁK JELLEMZÉSE POMOLÓGIAI VIZSGÁLATOKKAL ÉS MIKROSZATELLIT ALAPÚ MOLEKULÁRIS MARKEREZÉSSEL. Király Ildikó

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI KOVÁCS PÉTER

Veszprémi Egyetem, Vegyészmérnöki Intézet K o o p e r á c i ó s K u t a t á s i K ö z p o n t 8200 Veszprém, Egyetem u. 10., Tel.

Nyugat-magyarországi Egyetem. Doktori (Ph. D.) értekezés tézisei

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI JÓZSA MÁTÉ JÓZSEF MOSONMAGYARÓVÁR

ŐSHONOS ÉS RÉGHONOSULT BAROMFIFAJOK FENNTARTÁSA A DEBRECENI AGRÁRTUDOMÁNYI CENTRUMBAN

A gyomnövények szerepe a talaj - növény rendszer tápanyagforgalmában

ERD14: egy funkcionálisan rendezetlen dehidrin fehérje szerkezeti és funkcionális jellemzése

Hajtatott paprika fajtakísérlet eredményei a lisztharmat elleni növényvédelmi technológiák és a klímaszabályozás tükrében

ZÁRÓJELENTÉS. A munkaterv megvalósítása. A munkát három fő területre tagoltuk, a kutatás céljainak megfelelően:

Egyetemi doktori (PhD) értekezés tézisei FONTOSABB AGROTECHNIKAI TÉNYEZŐK HATÁSÁNAK VIZSGÁLATA AZ ŐSZI BÚZA TERMESZTÉSBEN

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

NYUGAT-MAGYARORSZÁGI EGYETEM Mezıgazdaság- és Élelmiszertudományi Kar Mosonmagyaróvár Növénytermesztési Intézet

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI NYUGAT-MAGYARORSZÁGI EGYETEM MEZŐGAZDASÁG- ÉS ÉLELMISZERTUDOMÁNYI KAR MOSONMAGYARÓVÁR TAKARMÁNYOZÁSTANI TANSZÉK

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

Növekvı arzén adagokkal kezelt öntözıvíz hatása a paradicsom és a saláta növényi részenkénti arzén tartalmára és eloszlására

VACCINUM COCCIDIOSIDIS VIVUM AD PULLUM. Csirke kokcidiózis vakcina (élő)

Diagnosztikai célú molekuláris biológiai vizsgálatok

MTA ÁLLATORVOS-TUDOMÁNYI BIZOTTSÁGA. SzIE ÁLLATORVOS-TUDOMÁNYI DOKTORI ISKOLA AKADÉMIAI BESZÁMOLÓK (2016. JANUÁR )

Gyorsjelentés. az informatikai eszközök iskolafejlesztő célú alkalmazásának országos helyzetéről február 28-án, elemér napján KÉSZÍTETTÉK:

SZENT ISTVÁN EGYETEM JÁSZ-NAGYKUN-SZOLNOK MEGYÉBEN MŰKÖDŐ ÉLELMISZER KISKERESKEDELMI VÁLLALKOZÁSOK. Doktori (PhD) értekezés 2004.

A fotodegradációs folyamat színváltoztató hatása a bútoriparban felhasználható faanyagoknál

AZ EMBERI MIKROBIOM: AZ EGYÉN, MINT SAJÁTOS ÉLETKÖZÖSSÉG Duda Ernő

Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar Mikrobiológiai és Biotechnológiai Tanszék

PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR KESZTHELY Állattudományi és Állattenyésztéstani Tanszék. DOKTORI (PhD) TÉZISEK

NKTH Konferencia november 14. Richterben. dr. Pellioniszné dr. Paróczai Margit Richter Gedeon Nyrt.

SZENT ISTVÁN EGYETEM

Az orvosi kamilla (Matricaria recutita L.) nemesítését megalapozó vizsgálatok

Baktériumok szaporodása különböz anyagokon. Dipl.-Ing.Eckhard Vo, Wendel GmbH. Dipl.-Ing. Christian Störch, Herborn

Kutatási zárójelentés

A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában

1) MÁJER J. LAKATOS A. GYÖRRFYNÉ JAHNKE G: (2007): A Furmint fajta helyzete Magyarországon. Borászati Füzetek 2007/2, Kutatási rovat 1-4. p.

KUTATÁS, FEJLESZTÉS, PÁLYÁZATOK ÉS PROGRAMOK A FELSŐOKTATÁSBAN AZ OKTATÁSI MINISZTÉRIUM FELSŐOKTATÁS-FEJLESZTÉSI ÉS TUDOMÁNYOS ÜGYEK FŐOSZTÁLYÁNAK

DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS DONGÓ ANITA

NYÁR GENOTÍPUSOK AZONOSÍTÁSA DNS UJJLENYOMATUK ALAPJÁN

A gidrán fajta genetikai változatosságának jellemzése mitokondriális DNS polimorfizmusokkal Kusza Szilvia Sziszkosz Nikolett Mihók Sándor,

T Zárójelentés

A probléma alapú tanulás, mint új gyakorlati készségfejlesztő módszer, az egészségügyi felsőoktatásban

SZENT ISTVÁN EGYETEM, GÖDÖLLŐ Gazdálkodás- és Szervezéstudományok Doktori Iskola. DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

A DOHÁNYZÁS OKOZTA DNS KÁROSODÁSOK ÉS JAVÍTÁSUK VIZSGÁLATA EMBERI CUMULUS ÉS GRANULOSA SEJTEKBEN. Sinkó Ildikó PH.D.

KISVÁROSI FELSŐOKTATÁSI INTÉZMÉNYEK LOKÁLIS HATÁSRENDSZERE AZ ALFÖLDÖN

A PENICILLIUM CHRYSOGENUM LAKTÓZ HASZNOSÍTÁSÁNAK VIZSGÁLATA

Gabonacsíra- és amarant fehérjék funkcionális jellemzése modell és komplex rendszerekben

A BÜKK ÁLGESZTESEDÉS VIZSGÁLATA A SOMOGYI ERDÉSZETI

10. CSI. A molekuláris biológiai technikák alkalmazásai

A fehérje triptofán enantiomereinek meghatározása

A MAGNÉZIUM - ADAGOLÁS HATÁSA A TYÚKOK TERMELÉSI TULAJDONSÁGAIRA

A magyarországi bankközi klíringrendszer működésének vizsgálata az elszámolás modernizációjának tükrében PhD értekezés tézisei

Unger István nyá. határőr ezredes

VÁLASZ OPPONENSI VÉLEMÉNYRE

Rizoktónia. Velünk kezdõdik. A narancs a KWS egyik védjegye.

Lignocellulóz bontó enzimek előállítása és felhasználása

A Dunaújvárosi F iskola jelenlegi és volt hallgatóinak képesség-, készség- és kompetencia-kutatása

Baranyáné Dr. Ganzler Katalin Osztályvezető

Önértékelés. A Pannon Egyetem Gazdálkodás- és Szervezéstudományi Doktori Iskolájáról

PHD ÉRTEKEZÉS TÉZISEI

Génmódosítás: bioszféra

14. N.4. A klímaváltozás hatása a legelőgazdálkodásra

TOVÁBBKÉPZÉSI TÁJÉKOZTATÓ

OPPONENSI VÉLEMÉNY. 1. A B. bronchiseptica dermonekrotikus toxin (DNT) kórtani szerepének vizsgálata egérben és sertésben.

MUNKAERŐ-PIACI ESÉLYEK, MUNKAERŐ-PIACI STRATÉGIÁK 1

Pannon Egyetem Georgikon Kar Festetics Doktori Iskola

MultiMédia az oktatásban

DOKTORI (PhD) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI KAPOSVÁRI EGYETEM

1) Invazív pneumococcus populáció komplex epidemiológiai felmérése

Szent István Egyetem Állatorvos-tudományi Doktori Iskola. Sertés circovírusok járványtani vizsgálata

MEDDŐHÁNYÓK ÉS ZAGYTÁROZÓK KIHORDÁSI

Mart gránitfelület-élek minősítése és kitöredezéseinek vizsgálata technológiai optimalizálás céljából

PANNON EGYETEM GEORGIKON KAR, KESZTHELY. Növénytermesztési és Kertészeti Tudományok Doktori Iskola. Iskolavezető: Dr. Kocsis László egyetemi tanár

Csík Tibor: Egy közgyűjtemény és használó

A ÉVI BESZÁMOLÓ SZÖVEGES ÉRTÉKELÉSE

Egyetemi doktori (Ph.D.) értekezés tézisei

Növényi sejtek által előállított monoklonális antitesttöredékek jellemzése

Szent István Egyetem. Az ivarérés idejét maghatározó QTL-ek genetikai térképezése tyúkban. Szabó Gyula Doktori értekezés

Érzelmi megterhelődés, lelki kiégés az egészségügyi dolgozók körében

E N G E D É L Y O K I R A T. Magyar Kwizda Kft. Budapest

A TALAJOK PUFFERKÉPESSÉGÉT BEFOLYÁSOLÓ TÉNYEZŐK ÉS JELENTŐSÉGÜK A KERTÉSZETI TERMESZTÉSBEN

Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása: a Methylibium sp. T29 jelű, új MTBE-bontó törzs izolálása és jellemzése

Dr. Csanády László: Az ioncsatorna-enzim határmezsgye: egyedi CFTR és TRPM2 csatornák szerkezete, működése c. MTA doktori értekezésének bírálata

SZENT ISTVÁN EGYETEM ÁLLATORVOS-TUDOMÁNYI DOKTORI ISKOLA DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI TENK MIKLÓS ORSZÁGOS ÁLLATEGÉSZSÉGÜGYI INTÉZET

Az öröklődés legfontosabb alapfogalmai Genotípus X környezet interakció. A környezet meghatározó. Genetika & szelekció a vadgazdálkodásban

Regressziószámítás alkalmazása kistérségi adatokon

DOKTORI ÉRTEKEZÉS TÉZISEI HÁROMFÁZISÚ MEGOSZLÁS ALKALMAZÁSA ÉLELMISZERFEHÉRJÉKVIZSGÁLATÁBAN

AZ ÁLTALÁNOS ISKOLÁSOK IDEGENNYELV-TANULÁSI ATTITŰDJEI ÉS MOTIVÁCIÓJA

A KUTATÁS CÉLJA, A MUNKATERVBEN VÁLLALT KUTATÁSOK ISMERTETÉSE

Munkaügyi Központja Püspökladányi Kirendeltség. Jóváhagyta: TÁJÉKOZTATÓ

Nyugat-magyarországi Egyetem. Széchenyi István Gazdálkodás- és Szervezéstudományok. Doktori Iskola

Átírás:

DOKTORI (Ph.D.) ÉRTEKEZÉS TÉZISEI VESZPRÉMI EGYETEM GEORGIKON MEZGAZDASÁGTUDOMÁNYI KAR KESZTHELY NÖVÉNYTERMESZTÉSI ÉS KERTÉSZETI TUDOMÁNYOK DOKTORI ISKOLA ALTERNARIA FAJOK ÖSSZEHASONLÍTÓ ELEMZÉSE KÉSZÍTETTE: DONGÓ ANITA okleveles gazdasági-agrármérnök TÉMAVEZET: Dr. habil. FISCHL GÉZA egyetemi tanár, a mezgazdasági tudományok kandidátusa Keszthely 2005.

1. A kutatómunka elzményei és célkitzései Az Alternaria nemzetség fajai széles körben elterjedtek. A fajok jelents része kozmopolita. Szaprotróf tevékenységük kapcsán gyakran, minden elhalt növényi részen elfordulnak. Egy részük nekrotróf parazita életmódot folytat és néhány faj valódi, gazdanövény specifikus parazitaként okoz növényi betegségeket. A kórokozók tipikusan foltosodás típusú betegségeket idéznek el kultúrnövényeinken. A patogén fajok a csíranövények különböz károsodását okozzák, és ebben a fenológiai stádiumban kifejezetten jelents lehet az Alternaria kórokozók megjelenése. Ilyen pl. az A. brassicicola és az A. brassicae káposztán, az A. dauci répán, az A. helianthi napraforgón vagy az A. raphani retken. Az A. brassicicola a keresztesvirágú növények foltosodás típusú betegségét idézi el, mely a termesztett Brassica fajok legsúlyosabb betegségét jelenti. Kutatómunkánk során e faj populáció-szerkezetének vizsgálatát kiemelten kezeltük. Az Alternaria nemzetség kutatása nemzetközi viszonylatban az utóbbi két évtizedben újonnan eltérbe került, ugyanis kiderült róluk, hogy kapcsolatba hozhatók az élelmiszerek mikotoxin szennyezésével, allergiával, asztmával. A gomba sötét szín porokonídiuma és konídiumtartója az UV sugárzás fels tartományának, azaz az UV-A sugárzásnak ellenáll. A világviszonylatban növekv UV sugárzás, vagyis a Föld UV sugárzás terhelése, nem pusztítja el az Alternaria nemzetség kórokozóit, st egyes vizsgálatok szerint reprodukciós készségét fokozza. Magyarországon az Alternaria fajok rendszerezésével viszonylag kevés, elavult ismeretekkel rendelkezünk, ami indokolja a téma több irányú feldolgozását, részben klasszikus mikológiai, részben újszer vizsgálati módszerek alkalmazásával. Az Alternaria nemzetség taxonómiai összetettségére vonatkozóan ma már korszer ismeretek állnak rendelkezésre. A morfológiai alapokon végzett rendszerezés újabb eredményekkel gazdagodott, amely a kisspórás Alternaria fajokat fajcsoportokra osztja. 1

Elsdleges célunk az volt, hogy további adatokkal szolgáljunk a fajok morfológiai és genetikai diverzitásán alapuló elkülönítéséhez. Ennek megfelelen további célkitzéseink a következk: hazai növényekrl származó Alternaria izolátumok morfológiai különbségeinek vizsgálata és kisspórás fajcsoportok morfológiai alapokon történ elkülönítése; mikromorfológiai és tenyészetmorfológiai vizsgálatok elvégzése; az egyes fajcsoportok növekedésének és sporulációjának tanulmányozása a hmérséklet és a ph függvényében; ismert molekuláris módszerek alkalmazásán keresztül megersíteni a morfológia vizsgálatok szerint besorolt hazai izolátumok taxonómiai helyzetét; a mitokondriális DNS RFLP vizsgálat alkalmazhatóságának kipróbálása az Alternaria fajok besorolása céljából; az Alternaria brassicicola faj populáció-szerkezetének tanulmányozása mikroszatellit analízissel. 2. Anyag és módszer 2.1. Vizsgálatok helyszíne Az Alternaria izolátumokkal kapcsolatos tenyésztési és morfológiai vizsgálatokat Keszthelyen a VE Georgikon Mezgazdaságtudományi Karának Növénykórtani és Növényvirológiai Tanszékén végeztük 2002-2004-ben, itt tartjuk fenn az Alternaria törzstenyészeteinket is. Az abiotikus tényezk hatását, a RAPD és az mtrflp vizsgálatokat Budapesten, az MTA Növényvédelmi Kutatóintézet Növénykórtani osztályán végeztük, 2004-2005-ben. A mikroszatellit markerekkel történ molekuláris analízist az Angers-i Egyetem, Természettudományi Karának laboratóriumában (UMR PaVé) végeztük, Franciaországban, 2004-2005-ben. 2

2.2. Alternaria izolátumok morfológiai jellemzése Alternaria izolátumok Hazánkban csak néhány napraforgóról származó fajspecifikus izolátum állt rendelkezésünkre. Ezért saját Alternaria izolátumokat gyjtöttünk be 2002- tl 2004-ig terjed idszakban. Az izolátumok begyjtése során a következ adatokat jegyeztük fel: gazdanövény, fertzött növényi rész, hely és idpont. Herbáriumi összehasonlító gyjteményt készítettünk. Az izolátum gyjteményünkben helyet kaptak ffélék (Lolium spp.), gyomnövények (Amaranthus, Asclepias, Bolboschoemus, Cirsium, Schoenoplectus) és kultúrnövények (Beta, Cucumis, Cucurbita, Lycopersicon, Oryza, Petroselinum, Vitis) tüneteket mutató részeirl, illetve magjairól származó izolátumok. Az azonnal felhasználásra nem kerül növényrészeket begyjtés után szétválogatva és gondosan préselve vagy szárítva tároltuk. Referencia izolátumokat szereztünk be, abból a célból, hogy az ismeretlen azonosságú izolátumaink jellemzit össze tudjuk hasonlítani más reprezentatív, azonosított faj izolátumaival. Ezek részint törzsgyjteményekbl, részint a kutatók korábban már vizsgált autentikus izolátumai közül származtak (Franciaország, Dánia, Hollandia, Kanada, USA, Új-Zéland). Az összes kisspórás (118) izolátum közül 79 hazai és az összes nagyspórás (22) közül 6 hazai Alternaria izolátumot sikerült vizsgálatba vonnunk. Mikromorfológiai tulajdonságok vizsgálata fénymikroszkóp segítségével Adott izolátum mindhárom táptalajra (BDA, vizes-agar, DRYES) oltott nyolc napos tenyészetébl kaparékot vettünk és tartós preparátumot készítettünk, melyen 20-20 érett konídiumot választottunk ki és mértük azok hosszát, szélességét, csr hosszúságát, csr szélességét, keresztfalak és hosszanti falak számát. A különböz táptalajon kapott értékekbl szórást (s), átlagot ( x ) és relatív szórást (CV) számoltunk. 3

Konídiumlánc képzés vizsgálata Vizes-agaron a konídiumlánc szerkezetét a 7. napon 22 C-os sötétkamrában történ inkubálást követen, fénymikroszkóp segítségével vizsgáltuk. A konídiumlánc képzést 40 -es, illetve 100 os nagyítású fénymikroszkóppal vizsgáltuk. A tipikus konídiumláncokról digitális felvételeket készítettünk. A referencia fajok tenyészeteit és a konídiumképzés jellemzit szintén feljegyeztük. Telepmorfológiai jellemzk vizsgálata SIMMONS (1995, 1999) ajánlásának megfelelen, a táptalajokon végzett megfigyeléseket monospórás kolóniákból származó tenyészeteken hajtottuk végre. A morfológiai tulajdonságok meghatározásához BDA, Czapek-Dox és DRYES táptalajt használtunk. A Petri-csészéket 25 C-on, sötétben inkubáltuk. A 4. és 8. napon feljegyeztük a telep-morfológiai bélyegeket. Vizsgáltuk a tenyészetek sugárirányú növekedési ütemét, színét, zónázottságát, szélét, tömöttségét, agaros közegben fejldött kristály, illetve pigmenttermelést. Az egyes tulajdonságokat vizuálisan értékeltük, illetve mértük. Hmérséklet és ph hatásának vizsgálata in vitro a gomba növekedésére és sporulációjára Az egyes fajcsoportokból 1-1 reprezentatív izolátumot választottunk ki a megfigyelt morfológiai és genetikai jellemzk alapján. A továbbiakban az in vitro vizsgálatokat ezen izolátumokkal végeztük el. A növekedési vizsgálatokat monospórázott gombatenyészetekkel végeztük. Kilenc cm-es Petri-csészéket oltottunk be az aktívan növ, kb. 1 hetes telepek szélébl kivágott 5 mm átmérj agarkorongokkal. Az inokulálást követen az izolátumokat alumínium hengerben tároltuk és ±0.5 C hmérséklet trés kalibrált ht-ft termosztátba helyeztük. Háromszoros ismétlésben vizsgáltuk a hmérséklet és a ph hatását a fajcsoportok növekedésére és 4

sporulációjára. Az ismétlések során kapott eredményeket átlagoltuk és napi növekedési rátát, illetve sporuláció intenzitást számoltunk. A hmérséklet hatását 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 C-os termosztátban vizsgáltuk. A növekedési teszteket a 6., a sporuláció intenzitását a 10. napon értékeltük. A ph hatását 4-11-es ph tartományban vizsgáltuk. A növekedést a 8. napon, a sporulációt a 10. napon értékeltük. 2.3. Alternaria izolátumok molekuláris jellemzése Az Alternaria izolátumaink azonosításához RAPD és mitokondriális DNS RFLP vizsgálatot végeztünk. Két izolátum esetében a rdns ITS1 és ITS2 szakaszát is felszaporítottuk, majd a PCR terméket szekvenáltattuk. A teljes genomi DNS kivonását alapveten MURRAY és THOMPSON (1980) módszere szerint végeztük, CTAB felhasználásával. RAPD vizsgálat A teljes genomi DNS-ek polimeráz-láncreakción (PCR) alapuló felszaporításához az Operon Technologies Inc., OPR-02, OPR-12 és OPA-04 indítószekvenciáit (primereket) használtunk. Ezek közül az OPR-02 és az OPR- 12 ROBERTS és mtsai (2000), míg az OPA-04 PRYOR és MICHALIADES (2002) vizsgálataiban már alkalmazásra kerültek, mint a kisspórás Alternaria-k elkülönítésére alkalmas szekvenciák. Mitokondriális DNS RFLP vizsgálat A vizsgálathoz 15-20 µg összdns-t emésztettünk 15 egység mennyiség restrikciós endonukleázokkal: Bsh1236I (CG/CG), Hae III (GG/CC), Hin 6I (G/CGC) vagy Msp I (C/CGG), melyek MBI Fermentas-tól származtak. Ezek az enzimek GC felismer helyekkel rendelkeznek. A GCszakaszban gazdag magi DNS-t kis méret fragmentumokra vágják, melyek a gélbl viszonylag gyorsan kivándorolnak. Ezzel szemben a mitokondrium csak nagyon kevés GC szakasszal rendelkezik, így a feldarabolt szakaszok nagysága 5

viszonylag nagy méret marad. Vizsgálataink során ezen szakaszokat vizsgáltuk a következkben ismertetett feltételek mellett. Az emésztést 100 µl térfogatban, 37ºC-on végeztettük 12 órán keresztül. A DNS-t kisebb térfogatba koncentráltuk és 0.8%-os vízszintes agaróz gélben, 16-20 óra alatt 0.5 TBE pufferben gélelektroforézist végeztünk. RAPD és mtdns RFLP vizsgálat adatainak feldolgozása A RAPD indítószekvenciák specifitása alacsony, így azok nemcsak a teljesen azonos komplementer, hanem a hasonló szekvenciákhoz is kötdnek. Ezért annak érdekében, hogy a RAPD reakció ismételhetségét bizonyítsuk minden fajcsoportból kiválasztottunk néhány izolátumot, melyekkel kétszeri ismétlésben is elvégeztük a RAPD reakciót. Az értékelés során a reprodukálható fragmentumokat tekintettük markerként. Távolságmátrixot generáltunk, majd UPGMA módszerrel klaszteranalízist végeztünk. A mtrflp vizsgálat során kapott mintázatot minden izolátumnál kiértékeltük, az 1 kb-nál nagyobb fragmentumokat véve számításba. Molekuláris elemzés mikroszatellit alapú indítószekvenciákkal Allél variációt vizsgáltunk 53 monospórás A. brassicicola izolátum esetén. Az izolátumok különböz országokból (Franciaország, Románia, Magyarország, Hollandia, Kína, Kanada, Új-Zéland) és különböz gazdanövényekrl (Brassica, Raphanus, Crambe, Cakile) származtak. A DNS kivonást GOODWIN és LEE (1993) gyors módszerével végeztük. Alkalmazott mikroszatellit indítószekvenciák Az Alternaria brassicicola genotípusok vizsgálatát mikroszatellit alapú semleges markerekkel vizsgáltuk. A DNS minták genotipizálását, tizenhat mikroszatellit lokuszra, AVENOT és mtsai (2005) által kifejlesztett primerekkel végeztük. 6

Mikroszatellit allélek felszaporítása multiplex PCR-rel A multiplex PCR során törekedtünk úgy kiválasztani 2-3 primerkombinációt, hogy azok megfelelen mködhessenek. Ügyeltünk a primerek egyedi Tm értékeire, a dimmer képzdés elkerülésére és arra, hogy a várható termékek hosszában lehetleg ne mutatkozzon átfedés. Allélek elválasztása poliakrilamid gélelektroforézissel Az elektroforézishez poliakrilamid alapanyagú gélt használtunk, mivel az agaróznál jobb felbontó képessége révén akár 1 bp különbség kimutatására is alkalmas. A poliakrilamid gélek típusai közül a denaturáló típust választottuk, amelyre jellemz, hogy a denaturáló ágens (urea) a DNS másodlagos struktúráját megszünteti, ezért a mobilitás független a bázisösszetételtl. A gél összetevi a következk voltak: 6 % poliakrilamid, 8.0 M urea és 1 TBE puffer. Az allélek detektálását ezüst-nitrát festéssel végeztük CRESTE és mtsai (2001) módszere szerint. Mikroszatellit vizsgálat adatainak feldolgozása Populáció-szerkezet vizsgálat eredményeinek kiértékeléséhez és az egyes lókuszok diverzitásának jellemzéséhez POPGENE szoftvert használtunk. NEI-féle géndiverzitást számoltunk. A géndiverzitásokat felbontottuk teljes, alpopuláción belüli átlagos diverzitásra, populációk közötti abszolút és relatív genetikai differenciáltságra. Az alpopulációk közötti különbség statisztikai alátámasztására G 2 -et számoltunk. Az alpopulációk közötti NEI-féle genetikai távolságot dendrogram formájában szemléltettük. Az izolátumokat a hozzájuk tartozó allélek nagyságának megfelelen is csoportosítottuk, klaszteranalízissel, JACCARD-koefficiens felhasználásával, hierarchikus osztályozó rendszer csoportátlag osztályozó eljárás (UPGMA) segítségével. 7

3. Eredmények 3.1. Morfológiai vizsgálatok A mikromorfológiai tulajdonságok alapján kapott értékek valóban a sokat vitatott azonosíthatóság problémáját vetették fel, mivel az eredmények rendkívül heterogén képet mutattak és azonosítást szolgáló összefüggést nem találtunk az egyes értékek között. A szakirodalomban nagy hangsúlyt képvisel konídiumképzés típust vizes-agaron vizsgáltuk. A referencia fajok vizsgálatával meg tudtuk állapítani, hogy eredményeink összevágnak-e más típusú táptalajról származó konídiumlánc szerkezet leírásával. Igazolódott feltételezésünk, ezért a vizesagaron nyert konídiumlánc szerkezet vizsgálatot alkalmaztuk izolátumainkat fajcsoportokba sorolása céljából. Telepmorfológiai bélyegek vizsgálata kapcsán szintén heterogén képet kaptunk. Megállapítottuk, hogy az izolátumok rendszerezésére vonatkozóan ezek a tulajdonságok önmagukban nem használhatók. A hmérséklet és a ph hatásának in vitro vizsgálatát viszonylag tág határok között folytattuk. Eredményeink alapján az optimális növekedéshez tartozó hmérséklet néhány esetben nem esett egybe az optimális sporulációhoz tartozó hmérséklettel. Tehát bizonyos esetekben eltér hmérsékleti igény bizonyult optimálisnak a növekedés és a sporuláció szempontjából. Ugyanez elmondható a ph hatásának vonatkozásában is. Identifikálásra szolgáló növekedési tesztek elvégzését az egyes fajcsoportok optimális hmérsékleti (+25-30ºC) tartományban és optimális ph (5.0-8.0 ph) tartományban tartjuk célszernek elvégezni in vitro körülmények között, mert ezekben a tartományokban reagáltak legnagyobb növekedéssel az egyes izolátumok a meghatározott abiotikus környezeti feltételekre. Megállapítottuk, hogy az egyes csoportok azonosítása és elkülönítése a vizsgált paraméterekkel egyértelmen nem lehetséges. Általánosságban megállapítható, hogy a kapott eredmények a kisspórás Alternaria izolátumok rendszerezése kapcsán fontos szerepet játszanak az egyes abiotikus tényezk hatásának megismerése céljából, annak 8

ellenére, hogy ezek a tényezk az Alternaria fajok esetén fajspecifikus hatást nem mutattak. 3.2. Alternaria izolátumok molekuláris elemzése A RAPD vizsgálatot a morfológiai alapon tett csoportba sorolásunk megersítése érdekében alkalmaztuk. A vizsgáltba nagyspórás izolátumokat is bevontunk. Jelents interspecifikus RAPD polimorfizmust tapasztaltunk az egyes kisspórás fajcsoportok között. Az alternata és tenuissima izolátumok nagy számarányából látható, hogy ezen izolátumok szaprotróf/nekrotróf életmódjuknak köszönheten valóban széleskörben elterjedtek. Gazdanövények, illetve földrajzi eredet szerinti tagozódást nem tapasztaltunk. Érdekes, hogy a különböz származású A. arborescens izolátumok rendkívül homogén képet mutattak RAPD mintázatukban és morfológiájukban egyaránt. ANDERSEN és mtsai (2002) is hasonló eredményekrl számolt be az A. arborescens izolátumok anyagcseretermékeinek vizsgálata során. Az mtdns RFLP elemzését a szakirodalom más gombák azonosítása céljából bevált módszerként említi, így e módszert az Alternaria izolátumok rendszerezése céljából elsként próbálhattuk ki. A vizsgált négy restrikciós enzim közül, a Hin 6I enzimmel lehetett a legtöbb és legpolimorfabb markereket elállítani. Az mtdns RFLP vizsgálat során öt mitokondriális haplotípust határoztunk meg Közeli alhaplotípusok Ia, Ib és Ic az alternata/tenuissima aggregátumból kerültek ki. Megjegyezzük, hogy az A. infectoria fajcsoportba tartozó izolátumok mindegyike eltér fragmentum mintázattal rendelkezett, mely alapján az összes e csoportba sorolt egyedre lehetett volna egy-egy haplotípust definiálni. Mindkét molekuláris módszerrel az izolátumokat fajcsoportba tudtuk sorolni és ezzel egyértelmen megállapítottuk, hogy a hazánkban is elterjedt, általánosságban A. alternata fajként vagy Alternaria spp.-ként azonosított izolátumok voltaképpen milyen fajcsoportokat takarnak. A két módszert összehasonlítva arra a következtetésre jutottunk, hogy az mtdns RFLP vizsgálat akár a sokkal körülményesebb feltételeket igényl RAPD vizsgálat egyik alternatívája lehetne. 9

Az A. brassicicola faj populáció-szerkezetének mikroszatellit profilelemzésével sem földrajzi eredet, sem gazdanövény szerint nem tudtunk különböz alpopulációkat elkülöníteni. Az 53 izolátumos populációban 45 különböz haplotípust különítettünk el, mely alapján nagyfokú genetikai sokszínséget tártunk fel. A távoli országokból begyjtött izolátumok azonos haplotípusba sorolódásából kétféle következtetést vontunk le. Egyrészt bizonyos klónok nagy távolságra eljutottak a szaporítóanyag kereskedelem révén világviszonylatban, és ott genetikailag nem módosultak. Másrészt a keresztesvirágú kultúrnövényeket fertz A. brassicicola faj megbetegít képessége nem korlátozott egy adott növényre. 10

4. Új tudományos eredmények 1. A mikromorfológiai tényezk közül sporuláció vizsgálat céljából vizesagart használtunk, melyen elsként mutattuk ki a különböz kisspórás Alternaria-kra jellemz konídiumképzés típusokat. 2. Konídiumlánc struktúra alapján kisspórás fajcsoportokba soroltuk a hazai, ismeretlen izolátumainkat. 3. In vitro kísérletek során vizsgáltuk az egyes fajcsoportok micélimnövekedés és sporuláció intenzitásának válaszreakcióit az 5-35ºC hmérséklet és 4-11 ph tartományban. Az in vitro kísérletek közül a hmérséklet és a ph hatásának vizsgálata hozott új eredményeket a sporuláció intenzitásának szempontjából. Kísérleti úton elsként megállapítottuk, hogy az egyes Alternaria fajcsoportokat képvisel izolátumok milyen intenzitással sporulálnak a hmérséklet és ph függvényében. 4. RAPD vizsgálattal molekuláris szinten azonosítottuk a hazai izolátumok fajcsoportjait és egyben megersítettük az izolátumok morfológiai alapon tett fajcsoportba sorolásának státuszát. 5. A mitokondriális DNS RFLP elemzését elsként alkalmaztunk különféle kisspórás Alternaria izolátumok azonosítása céljából. A vizsgált négy restrikciós enzim közül, a Hin 6I enzimmel lehetett a legtöbb és legpolimorfabb markereket elállítani. Öt mitokondriális haplotípust határoztunk meg. A feltárt különbségek alapján a módszert alkalmasnak találtuk a kisspórás Alternaria fajcsoportok elkülönítése céljából. 11

6. Az Alternaria brassicicola izolátumok populáció-szerkezetének vizsgálatát specifikusan kifejlesztett mikroszatellit típusú molekuláris markerekkel hazánkban és külföldi viszonylatban egyaránt elsként végeztük el. Az elemzés alapján nagyfokú genetikai sokszínséget tártunk fel. 12

5. Az értekezés témakörébl írt publikációk Lektorált folyóiratban megjelent közlemények: DONGÓ A, FISCHL G. (2004): Hazai kis spórájú Alternaria fajcsoportok. Növényvédelem, 40: 505 509. FISCHL G., BÉRES I., DONGÓ A., KAZINCZI G., MIKULÁS J. (2004): Fungi isolated from seeds and vegetative reproductive organs of perennial weeds (Asclepias syriaca, Cirsium arvense, Convolvulus arvensis). Zeitschrift für Pflanzenkrankheiten und Pflanzenschutz Sonderheft 19: 605-609. VARGA ZS., DONGÓ A., FISCHL G. (2004): Termesztett ffajok szemtermésén elforduló mikroszkópikus gombák. Növénytermelés, 53: 37-41. YOU M.P., SIMONEAU P., DONGO A., BARETTI M.J., LI H., SIVASITHAMPARAM K. (2005): First report of an Alternaria leaf spot caused by Alternaria brassicae on Crambe abyssinicia in Australia. Plant Disease 89: 430. DONGÓ A., BAKONYI J., FISCHL G. (2005): Alternaria-fajok és - fajcsoportok összehasonlító vizsgálata RAPD-elemzéssel. Növényvédelem. (megjelenés alatt) AVENOT H., DONGO A., SIMONEAU N.B., VASILESCU B.I., HAMON B., PELTIER D., SIMONEAU P. (2005): Isolation of twelve polymorphic microsatellite loci in the phytopathogenic fungus Alternaria brassicicola. Molecular Ecology Note. (megjelenés alatt) Eladások: DONGÓ A., FISCHL G. (2003): Különböz növényekrl származó Alternaria izolátumok tenyészeteinek összehasonlító elemzése. 49. Növényvédelmi Tudományos Napok. Budapest DONGÓ A. (2003): Néhány Alternaria faj tenyészetének összehasonlítása morfológiai bélyegek alapján. XI. Ifjúsági Tudományos Fórum. Keszthely. DONGÓ A., FISCHL G. (2004): Hazai kisspórás Alternaria fajcsoportok. 50. Növényvédelmi Tudományos Napok. Budapest. BERKE J., FISCHL G., GERGELY L., POLGÁR ZS., DONGÓ A. (2005): Egzakt minsít és osztályozó rendszer fejlesztése növénynemesítési és növénykórtani vizsgálatokhoz. Informatika a felsoktatásban 2005 cím konferencia. Debrecen. (megjelenés alatt) 13

Poszter: FISCHL G., DONGÓ A. (2004): Alternaria fajok elfordulása mocsári és vízi növényeken. Hidrológiai Közlöny, 5-6: 41-42. AVENOT H., DONGO A., BATAILLÉ-SIMONEAU N., IACOMI- VASILESCU B., HAMON B., PELTIER D., SIMONEAU P. (2005): Development and characterization of microsatellite markers for the seedborne pathogenic fungus Alternaria brassicicola. 5 th ISTA SHC Seed Health Symposium 10-13 May 2005 Angers France. 39-40. 14