Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak. dr. Kiss Erzsébet. SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar Genetika és Biotechnológiai Intézet

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak dr. Kiss Erzsébet SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar Genetika és Biotechnológiai Intézet

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Szakvezető Dr. Kiss Erzsébet egyetemi tanár kiss.erzsebet @mkk.szie.hu Szakvezető-helyettes Dr. Veres Anikó egyetemi docens veres.aniko@mkk.szie.hu

Genetika és Biotechnológiai Intézet Igazgató Dr. Varga László Egyetemi docens Varga.laszlo@mkk.szie.hu Titkár Katona Melinda katona.melinda@mkk.szie.hu

Genetika és Biotechnológiai Intézet Telefonszám +36 28 522 069 +36 28 522 000/1691 Fax +36 28 522 069

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Alapítás 2006 Dr. Heszky László MTA rendes tagja Genetika és Biotechnológiai Intézet akkori igazgatója

Genetika és Biotechnológiai Intézet A hazai nemesítő utánpótlás képzésének meghatározó bázisa; Három fő diszciplina oktatásának felelőse: Genetika Növénynemesítés Növénybiotechnológa

Genetika és Biotechnológiai Intézet Elsőként indított Magyarországon mezőgazdasági biotechnológus mesterképzést 2008-ban Nappali és levelező tagozaton Ez a mesterszak- az országban egyedülállóan két szakirányt foglal magában: növénybiotechnológia és állatbiotechnológia szakirányokat.

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Hallgatószáma jelenleg 52 fő 49 fő diplomázott eddig Az Agricultural Biotechnology angol nyelvű MSc szakot külföldi hallgatókkal (12 fő) 2012-ben indította a genetika és Biotechnológiai Intézet. 14 új hallgató 2014-ben

A Mg. Biotech. MSc Szakon két szakirány között lehet választani Növénybiotechnológia Állatbiotechnológia

Program 1. félév: azonos tantárgyak 2. félév: szakirány-választás / diplomamunka 2-4. félév közös és szakirány-specifikus tantárgyak

Diplomamunka Saját kísérletek! Ízelítő a választható témákból Gyujtoványfű, cickafark, imola és csodatölcsér fajok molekuláris vizsgálata taxonómiai pontosítás céljából Az Orange gén öröklődése karalábé és karfiol hibridpopulációkban Emlős embriók in vitro előállítása vágóhídról származó petesejtekből Transzpozon alapú transzgenezissel előállított transzgénikus nyulak molekuláris jellemzése

Mikrobiológiai témát is lehet választani Szakirány -választás Az 1. szemeszter végén!

Molekuláris markerek alkalmazása szántóföldi és kertészeti növények nemesítésében Kiss E., Gyulai G., Veres A., Szőke A., Tóth-Lencsés K., Kerekes A., Heszky L.

Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak Ízelítő a diplomamunka- témákból korábbi dolgozatok és publikációk alapján

Molekuláris markerek alkalmazása Genotipizálás Pedigré elemzés Hibridazonosítás Kapcsolt markerek

Miért van szükség a genotipizálásra? Nem elegendő a morfológiai összehasonlítás?

Perenne évelő rozs

Kárpát-medencei szőlőfajták mikroszatellit elemzése

Szőlő fajták összehasonlító elemzése mikroszatellit /SSR primerekkel

SSR allél adatok átalakítása vonalkóddá

MAGYAR SZŐLŐ MIKROSZATELLIT / SSR ADATBÁZIS HUNGARIAN VITIS MICROSATELLITE / SSR DATABASE KISS, Erzsébet; HALÁSZ, Gábor; *KOZMA, Pál; HESZKY, László Szent István Egyetem, Genetika és Növénynemesítés Tanszék Szent István University, Department of Genetics and Plant Breeding H-2103, Gödöllő, Magyarország / Hungary *FVM Szőlészeti és Borászati Kutatóintézet (FVM-SZBKI) Institute for Viticulture and Enology H-7634, Pécs, Magyarország / Hungary Primerek / Primers: Fajták / Varieties: A-B - C-CS - D-E - É-F - G-H - I-J - K - L- M - N-NY - O-Ó - Ö-Ő - P-Q - R-S - SZ-T - U-Ú - Ü-Ű - V-Z - ZS List of Varieties / Teljes fajtalista

European Vitis Database: közel 6 000 fajta/klón mikroszatellit/ssr és ampelográfiai adata 259 magyarországi fajta/klón

European Vitis Database N-coded SSR values in 9 loci Accession name Allél_1 Allél_2 HUN045-P14#30 - APROFEHÉR N+8 N+18 HUN045-P14#49 - AGASFARK N+8 N+8 HUN045-P14#60 - BAJOR, KÉK N+8 N+8 HUN045-P14#61 - BAJOR, SZÜRKE N+8 N+8 HUN045-P14#62 - BAKARKA N+18 N+18 HUN045-P14#63 - BAKATOR, KÉK N+8 N+18 HUN045-P14#64 - BAKATOR, PIROS N+8 N+22 HUN045-P14#65 - BAKATOR, PIROS TÜDOSZINU * N+8 N+22 HUN045-P14#66 - BAKSZEM N+16 N+22 HUN045-P14#68 - BALAFANT N+18 N+18

Almafajták mikroszatellit mintázata és allélmérete a CH03G07 primerpárral

CULTIVARS CH03g07 CH04g10 CH04e03 CH05c02 CH05d11 CH05e03 Ozark Gold 119 129 135 168 196 196 168 172 173 173 168 179 JerseyMac 165 165 135 137 184 198 160 176 165 173 197 163 173 Piros 165 179 135 135 196 198 168 176 173 175 173 173 Gala 119 129 135 135 196 198 168 170 173 173 173 185 Pioana 129 129 135 137 190 198 170 174 169 171 163 185 Gloster 123 129 127 137 198 198 160 168 195 197 160 191 Julyred 165 165 123 135 143 184 198 160 176 175 197 163 163 Wellspur Delicious 127 127 137 168 198 202 168 168 173 197 191 191 Judeline 123 129 135 135 196 198 168 174 173 173 163 185 Jonagold 119 123 129 135 135 186 198 168 174 200 169 173 175 163 179 185 Jonathan 119 123 135 135 186 196 168 200 173 175 163 185 Pinova 119 127 129 127 135 198 222 168 174 169 173 163 179 185 65 kereskedelmi és 38 tájfajta Mutsu 129 179 135 135 198 198 168 168 173 173 173 179 Akane 123 179 123 135 143 196 210 216 170 200 173 173 185 185 Sampion 119 129 135 135 190 198 170 174 169 173 179 193 Charden 119 129 135 135 198 198 168 174 200 169 173 175 175 179 185 Jonager 123 127 135 135 196 196 170 200 173 175 168 185 Summerred 129 165 135 135 184 208 168 176 173 177 170 185 Goldstar 119 129 123 135 143 190 198 168 170 173 173 185 193 Golden Delicious 119 129 135 135 198 198 168 174 169 173 179 185 Angold 119 129 135 135 198 198 168 170 171 173 173 185 Granny Smith 129 153 127 137 196 198 160 172 171 173 168 181 Kró óriás 129 129 123 137 143 196 202 168 172 173 197 168 191 Liberty 123 129 137 137 178 198 168 168 173 211 163 176 Mizsei 123 129 135 135 186 208 160 168 173 173 163 185 Reglindis 129 179 135 135 198 198 168 168 169 173 173 173 Sir Prize 119 123 129 135 135 198 204 168 168 169 173 173 179 Red Stayman 127 129 127 135 196 204 168 172 169 173 163 191 Rewena 119 123 135 135 178 210 168 168 173 173 164 185 Rubinola 129 129 135 135 184 198 168 176 173 173 179 193 Braeburn 127 129 168 168 198 202 168 168 171 173 191 191 Rajka 119 129 135 135 190 196 160 170 174 171 173 177 164 176 185 Idared 123 129 135 135 186 198 168 200 173 197 172 185 Fuji 119 127 123 143 168 196 198 168 168 173 197 163 191 Florina 123 127 135 168 196 198 168 200 173 197 163 191 Prima 129 165 123 135 143 184 204 168 176 169 173 179 185 Elstar 119 119 135 135 190 198 168 170 173 187 164 179 Remo 119 123 135 135 178 190 168 170 173 173 163 172 Red Rome Van Well 123 129 135 135 186 198 168 168 173 173 163 163 Topaz 119 129 135 135 190 198 168 168 169 173 185 193 Pink Lady 129 129 135 137 198 204 160 168 169 171 168 179 Relinda 123 129 123 135 143 196 208 168 172 173 173 172 185 Greensleeves 129 129 123 135 143 190 198 170 174 171 173 173 185 Reanda 119 129 135 137 196 208 168 168 173 181 173 185 Pilot 129 179 135 135 196 196 168 168 173 173 164 185 Fiesta 119 123 135 135 186 196 168 168 173 197 164 185

Dinnye genotipizálás

Szamócafajták molekuláris összehasonlítása RAPD M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 M 3000 OPE 02 500 AP-PCR WFRVC Génspecifikus Adh 1f/ Adh1r

Diploid, oktoploid szamóca fajták SSR adatai Fajta Fragaria vesca Rügen F. ananassa Hakras romata F. ananassa Avalon classique SSR / UDF-004 (bp) 133:133 129:143 125:131:137 F. ananassa Frapendula F. ananassa Fertődi 5 F. ananassa Gorella 125:129:143:149 125:127:129:133:149 125:129:133:139:143:149

Repce genotipizálás SSR markerekkel GKH 724 162:166:174:192 TPES 7 166:192 TPR 24 162:174 Tetraploiditás repcében

Származás, pedigré Szőlő Alma Évelő rozs

Az SSR allélek méretezése /ALF-Express/

Lokusz Izsáki Mátrai muskotály Ottonel muskotály SSR allélek méretei bpban Scu08vv 185:185 185:185 185:185 Scu10vv 208:214 214:214 208:214 VVMD21 244:250 244:267 267:267 VVMD36 254:276 276:264 264:276 ssvrzag62 191:207 191:191 191:197 ssvrzag64 139:161 139:161 139:161 ssvrzag79 240:246 240:258 258:262 ssvrzag83 197:203 197:203 193:203 ssvrzag112 237:245 237:237 237:245 VVMD5 226:232 232:226 226:228 VVMD7 242:252 242:246 242:246 VVMD32 258:274 274:266 242:266 ssvrzag21 208:208 208:208 208:208 Vmc4f3 170:170 170:204 170:204 VVMD28 234:258 258:269 258:269 VVMD31 206:208 206:206 206:210 VMC4c6 157:166 157:163 162:163 VMC4g6 123:127 123:135 125:135 VVS2 143:143 143:143 133:143

SSR lokusz Leányka Királyleányka Scu10vv 202:208 208:214 Scu08vv 185:185 185:185 VVMD21 250:250 244:250 VVMD36 266:276 254:266 VrZag64 161:165 161:161 VrZag79 240:254 252:254 VrZag62 195:197 197:207

X Seyve-Villard 12375 Csabagyöngye NEM! Zalagyöngye

Perenne évelő rozs

Kapcsolt markerek Ivar kender Rezisztencia Paradicsom: nematóda Szőlő: lisztharmat és peronoszpóra Hímsterilitás repce Szín Karfiol: rózsa Szőlő: bogyó

Ivarspecifikus marker fejlesztése RAPD fragmentumból kenderben

Nematóda rezisztens paradicsom genotípusok azonosítása molekuláris markerekkel Rezisztens és fogékony genotípusok domináns markerrel A heterozigóta és homozigóta rezisztens genotípusok megkülönböztetése CAPS markerrel Restrikciós emésztés után a homozigóta és a heterozigóta rezisztens genotípusok elkülöníthetőek

RUN1, REN1 lisztharmat rezisztenciagénekkel kapcsolt SSR markerek alkalmazása szelekcióra Egyszeres PCR Multiplex PCR

A RUN1 gén jelenlétét a (RUN1+ növényeket) a 160 bp méretű csúcs jelzi 95 bp méretű külső, ill. belső sandard 275 bp méretű külső, ill. belső standard A BC 4, a Kismis vatkana (szülők) és érzékeny fajta (Cardinal) alléljei a VMC8g9 markerrel R: Run1+ Sz: run1-

Multiplex PCR 4%-os Metaphor agarózon (BMA) elválasztva 286 bp 286 bp 286 bp VMC9h4.2 160 bp 160 bp 160 bp VMC8g9 2. Kismis vatkana: Run1-/Ren1+ 3. BC4: Run+/Ren1-, Az utódpopuláció egyedei 601: Run1-/Ren1-90: Run1+/Ren1+, 6: Run1+/Ren1-, 36: Run1-/Ren1+

Hímsterilitás Csak a hímsteril növényekben jelenik meg a 278 bp fragmentum

Színes karfiol

Kárpát-medencei bogyószín variánsok Lisztes piro Lisztes fehér Bakator piros Bakator tüdőszínű Gohér piros Gohér fehér Gohér változó Piros Sárga muskotály muskotály Csíkos muskotály Furmint piros Furmint fehér

Antocyanin biosynthesis White berried grapes No UFGT expression Reason: Gret-1 insertion into the promoter of VvMybA1 transcription factor gene SNP a VvMybA2 kódoló szekvenciában

VvMybA1 allél-variációk VvMybA1a VvMybA1b VvMybA1c M: MW marker, 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Lisztes piros, 5. Lisztes fehér, 6. Bakator piros, 7. Bakator tüdőszínű, 8. Gohér piros, 9. Gohér fehér, 10. Gohér változó, 11. Piros muskotály, 12. Fekete muskotály, 13. Sárga muskotály, 14. Csíkos muskotály, 15. Furmint piros, 16. Furmint fehér, 17. Furmint változó, 18. Kék barátcsuha, 19. Szürke barátcsuha

20D18CB9 marker VvMybA1 linked CAPS marker M: molecular weight m., 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Bakator piros, 5. Bakator tüdőszínű, 6. Gohér piros, 7. Gohér fehér, 8. Gohér változó, 9. Sárga muskotály, 10. Csíkos muskotály, 11. Furmint fehér, 12. Furmint változó, 13. Kék barátcsuha, 14. Szürke barátcsuha PCR product 329 bp 329 bp 248 bp 248 bp 213 bp 329 bp 213 bp 329 bp 248 bp 329 bp 213 bp DdeI digestion

Munkatársak, együttműködők SZIE GBI Heszky László Gyulai Gábor Szőke Antal Veres Anikó Galli Zsolt Galbács Zsuzsanna Halász Gábor Katuláné Debreceni Diána Kerti Balázs Kovács László Lencsés Andrea Kitti Molnár Stella Pilinszky Katalin Wichmann Barnabás PTE SZBI Kozma Pál Hoffmann Sarolta GK Kht Falusi János Gyümölcskutató Fertőd Dénes Ferenc Proplant Kft Dánszentmiklós Sipos Elvíra Lehoczky Péter Gyümölcskutató Újfehértó Szabó Tibor Inántsy Ferenc MGSZH Budapest Pernesz György Harangozó Tamás

Köszönöm a figyelmet!