Bioinformatika előad
|
|
- Éva Vargané
- 7 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 7.. előad adás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat
2 Térszerkezet előrejelz rejelzés s főf módszerei Homológia modellezés (komparatív modellezés): ha található ismert térszerkezetű, a vizsgált szekvenciával elegendően nagy azonossággal (> 20%) rendelkező homológ, akkor annak térszerkezete alapján a vizsgált szekvencia térszerkezete modellezhető Tekeredés felismerés (fold recognition): ha található az ismert térszerkezetek között a vizsgált szekvenciával alacsony szekvenciaazonosságot mutató ám kompatibilis tekeredés, akkor homológia modellezéssel erre is készíthető szerkezet. Ab initio predikció: ismert térszerkezetű fehérjével nincs megfelelő szekvenciaazonosság és kompatibilis tekeredés sem található. A térszerkezet előrejelzése ekkor fizikai elvek felhasználásával kísérelhető meg
3 Térszerkezet előrejelz rejelzés lehetőségei
4 A szekvenciaösszerendel sszerendelések sek két k t zónájaz Aminosav azonosság % Összerendezett aminosavak száma
5 Homológia modellezés s alapesete start rokon szerkezetek azonosítása célszekvencia Templát szerkezet templát kiválasztása célszekvencia és templát összerendelése összerendelés cél modell építése a templát szerkezetből Cél modell cél modell elemzése nem igen
6 Homológia modellezés s lépéseil A gyakorlatban a homológia modellezés többlépcsős folyamat az alábbiak szerint: 1. Templát felismerés és kezdeti összerendelés 2. Összerendelés kiigazítása 3. Főlánc generálás 4. Hurok modellezés 5. Oldallánc modellezés 6. Modell optimalizálás 7. Modell validálása 8. Iteráció
7 Homológia modellezés s automatizálása Szerver URL Automatikus homológia modellező szerverek SwissModel 3D-Jigsaw CPHModels EsyPred3D Robetta Fél-automatikus homológia modellező szerverek (saját összerendelést igényelnek) WHAT If HOMER
8 térszerkezeti hasonlóság elasztáz tripszin Az elasztáz és a tripszin szerkezeti összeillesztése A két szerin proteáz, az elasztáz és a tripszin esete mutatja, hogy a kémailag meglehetősen divergens (ld. a két ábrán az eltérő karakterű aminosavakat) és nem túl magas szekvencia azonosságot mutató (kb. 37 %) szerkezetek között is nagyfokú térszerkezeti azonosság lehetséges
9 szekvencia összerendelés A homológia modellezés limitáló tényezői a célszerkezet és a templát közötti szekvencia azonosság százalékának függvényében: Sebesség Minőség Összerendelés Felismerés Első lépés: modell szekvencia - PDB szekvencia tipikus BLAST eredménye:
10 1. Szekvencia összerendelés A VATTPDKSWLTV és ASTPERASWLGTA szekvenciák összerendelési mátrixa (az összerendelési mátrix kialakítása: ld. korábbi előadások) A jobboldali összerendelést eredményező útvonalat a szürke sáv jelzi. A hasonló sajátságú aminosavakat csillag (*) jelzi. A szaggatott vonal egy alternatív összerendelést jelöl, amely magasabb összerendelési pontszámmal rendelkezne, de egy új beszúrást igényel (gap penalty)
11 1. Szekvencia összerendelés A mai gyakorlatban a célszekvenciát betápláljuk a Web-en elérrhető számtalan BLAST szerver egyikébe úgy, hogy az a cél szekvenciát a PDB adatbázis ellen vizsgálja, várunk pár másodpercet, amjd megkapjuk a találatok listáját - a modellezés alapjául szolgáló templátokat és a megfelelő összerendeléseket. Általában a legnagyobb szekvencia azonosságot mutató találatot választjuk templátnak, de ne feledjük, hogy egyéb szempontokat is figyelembe kell / lehet venni (pl. a fehérjének lehetnek aktív / inaktív kísérleti szerkezetei, fontos lehet a szerkezetben a kofaktor ill. egyéb ligandumok jelenléte, multimer komplexek, stb.). Manapság, a számítási teljesítmények növekedése lehetővé teszi többszörös templátok alkalmazását a modellezéshez és a legjobb modell kiválasztását a további vizsgálatokhoz. Ugyancsak lehetséges több templát kombinálása egyetlen szerkezetté, amelyet a modellezéshez felhasználunk. Az online automatikus Swiss-Model és Robetta homológia modellező szerverek (Peitsch et al., 2000 and Kim et al., 2004) például ezt a módszert alkalmazzák
12 2. Szekvencia összerendelés s korrekció A kis szekvencia azonosságú régiók problémája: Az A és B szekvenciákat lehetetlen összerendezni, hacsak igénybe nem vesszük a homológ C szekvenciát. A fenti példa szemlélteti a többszörös szekvencia összerendelés koncepció hasznosságát a homológia modellezés során. A rokon szekvenciák többszörös összerendelésére több program is rendelkezésre áll, pl. CLUSTALW
13 2. Szekvencia összerendelés s korrekció Jó modell Templát Rossz modell
14 3. Főlánc F konformáci ció előáll llítás Amint a szekvencia összerendelés kész, a modell készítés indulhat. A főlánc generálása triviális a legtöbb modell esetében: egyszerűen a templát szerkezet összerendelésben szereplő aminosavainak főláncbéli atomkoordinátáit át kell másolni a modellbe (ld. ábra). Ha a modell és templát aminosavak eltérnek, a főlánc N,C α,c és O koordináták és sok esetben a C β másolható. Ha az aminosavak megegyeznek, az oldallánc atomkoordinátái is másolhatóak
15 3. Főlánc F konformáci ció előáll llítás A kísérleti fehérjeszerkezetek sem tökéletesek. A hibák eredhetnek kristályosítás során történő részleges degradációból, a gyenge elektronűrűségi képból, vagy akár a szerkezetmegoldás / közététel során elkövetett emberi hibákból. Jellemző, hogy a PDB 2007 végi állása szerinti szerkezetben több mint probléma található. Kézenfekvő megoldás, hogy több templát esetén a kevesebb hibát tartalmazót válasszuk [PDBREPORT, Hooft et al. 1996]. Mi a teendeő, ha két templát szerkezet létezik, mindegyik gyengébben definiált régiókkal, de a rosszabb minőségű régiók nem ugyanott találhatóak? Nyilvánvaló, hogy célszerű a jó régiókat kombinálni. Ezen az elven alapulnak többszörös templátot felhasználó modellezési módszerek. Bár ez egyszerűnek tűnik (ld. automata modellező szerverek: Swiss-Model, Robetta), a gyakorlatban nem egyszerű olyan szerkezetet találni, amelyik ténylegesen jobb, mint a felhasznált templátok együttesen. Azt hogy ez lehetséges a CASP4 során Andrej Šali csoportja bizonyította (DALI)
16 4. Hurkok modellezése Az esetek többségében a modell és a templát szerkezet közötti összerendelés beszúrásokat ill. törléseket is tartalmazhat. A törlések esetében egyszerűen kihagyjuk a templát felesleges részeit és a képződő hiányt összekötjük. A beszúrások esetén a templát folyamatos láncát elhasítjuk, majd beszúrjuk a modellbe a plusz aminosavak alkotta hurkot. Belátható, hogy mindkét eset a főlánc konformáció változásával jár
17 4. Hurkok modellezése Jó hír: a konformációs változások nem szokták érinteni a reguláris szekunder szerkezeti elemeket. Ezért a beszúrások eléggé nagy biztonsággal helyezhetőek a hélix ill. redő szerkezeteken kívül eső régiókba, a hurkokba és kanyarokba. Rossz hír: A hurok-konformációkat igen nehéz előre jelezni (ez a homológia modellezés jelenlegi legkomolyabb megoldatlan problémája)
18 4. Hurkok modellezése A valóságban sok esetben még akkor is jelentősen eltér a cél és a templát szerkezet hurok konformációja, ha nincsenek a szekvencia összerendelésben törlések ill. beszúrások. A hurok konformációkban történő eltérések három fő oka (Rodriguez és Vriend, 1997): A felszíni hurkok sok esetben kristály szerkezeti kölcsönhatásokban vesznek rész, ami jelentős konformációs eltéréseket okozhat a cél és a templát szerkezet között. Az egyes aminosavak esetében a kicsi ill. nagy térigényű oldaláncok cseréje jelentősen befolyásolhatja a főlánc elrendeződést. Hurokbéli aminosav mutációja prolinra, ill. hurokbéli glicin mutációja bármely más aminosavra. Mindkét esetben az új aminosavnak a Ramachandran plot jelentősen behatároltabb területére kell esnie, ami normál esetben hurok-konformáció változással jár. A rövidebb hurkok esetében (5-8 aminosav) a modellezett szerkezetek sok esetben jó konformációt szolgáltatnak. A kísérleti szerkezettől való eltérés felszini hurkok esetében esetenként kristály szerkezeti kölcsönhatások eredménye is lehet
19 4. Hurkok modellezése A hurok modelezésnek három fő típusa van: Tudásbázis alapú (Knowledge base): a PDB vizsgálata olyan hurkokra, amelynek végpontjai megegyeznek a beszúrandóval, majs a hurok konformáció másolása. A főbb molekuláris modellező programok és szerverek alkalmazzák [pl. 3D-Jigsaw (Bates et al. 1999), Insight (Dayringer et al. 1986), Modeller (Sali et al. 1993), Swiss-Model (Peitsch et al. 2000), WHAT IF (Vriend, 1990)]. Rosetta-szerű: a kisebb részletekre osztott hurok részeit külön- külön hasonlítjuk a PDB szerkezetekhez (Kim et al., 2004). A kis fragmensek egy olyan ab initio hurok modellt adank, amely még ismert fehérjeszerkezeteken alapul. [p. ECEPP software by the Scheraga group (Zimmerman et al. 1977). Energia alapú: mint az igazi ab initio tekeredés predikció esetén, az energia funkciót használjuk a hurok jóságának a megítélésére. Monte Carlo (Simons et al. 1999) vagy molekula dinamika (Fiser et al. 2000) módszerek felhasználásával végzett energia minimalizálásokkal juthatunk a legjobb hurok konformációhoz
20 5. Oldallánc modellezés - Hasonló fehérjéknél a C α C β kötés körüli torziós szögek gyakran megyegyeznek - Homológ ( > 40%) fehérjék esetében (legalább 75% ): a C γ ugyanolyan orientációjú magas szekvencia azonosság: a konzervált aminosavakat teljes egészében át lehet másolni a templátból a modellbe (pontosabb, mint a főlánc átmásolása + oldalláncok ab initio módszerekkel való előrejelzése) alacsony szekvencia azonosság (< 35%): az oldalláncok az esetek 45%-ban különböznek - Gyakorlatban: az oldallánc elhelyezés tudásbázis alapú könyvtárakból - Fix könyvtárak: az egyes aminosav összes lehetséges oldallánc elhelyezkedési lehetősége tárolva van - Pozíció specifikus könyvtárak: az oldallánc megfelelő térbeli elhelyezkedésének kiválasztása a főlánc szerkezet szerint történik. - Egyszerű: a főlánc másodlagos (hélix vagy redő) szerkezete alapján - Összetett: nagy felbontású szerkezetekből az adott aminosav (módszertől függően 5-9) egymásra helyezése során kapott főlánc nyújtási foka alapján
21 5. Oldallánc modellezés - Általában adott főlánc konformációnak egy oldallánc orientáció felel meg. - Példa olyan főláncra, amelyhez két oldallánc elhelyezkedés rendelhető hozzá: A főlánc konformációhoz kétféle tirozin oldallánc elrendeződés rendelhető
22 5. Oldallánc modellezés - Az oldallánc elrendeződés előrejelzése a hidrofób részekre pontosabb, mint a felületi aminosavakra. Okai: - Kísérletek alapján: a flexibilis oldalláncok sokféle konformációt vehetnek fel - Elmélet alapján: a hidrofób részeket (Van der Waals kölcsönhatásokat) leíró energia funkciók egyszerűek, míg a felületi kölcsönhatások (vízzel való H-híd kötések és az ezzel járó entrópia effektusok) számítása sokkal bonyolultabb. De a felületi részek számítását több erőtér is tartalmazza már. - Biológiai okok: a felületi hurok részek sokszor ki kell mozduljanak, például ahhoz, hogy egy szubsztrát bejuthasson a fehérjébe
23 6. Modell optimálás A modellező programok számítás kapacitása véges, a megoldás: az atomi pozíciók rögzítése és/vagy az energia minimalizálási lépések korlátozása (pár száz ciklusra). Optimálási lehetőségek: - Molekulamechanikai erőtér: nagy molekulák kezelésére alkalmasak, csak az atommagok pozícióját veszik figyelembe. A Van der Waals vonzóerők például nehezen kezelhetők, ezért figyelmen kívül hagyják. Az erőtér pontossága nagyjából a klasszikus erőterekével összevethető. - Saját magát parametrizáló erőtér (self-parameterizing force-field): a Van der Waals sugarakat, atomi töltéseket is tartalmaz. - Molekula dinamikai szimulációk: femtoszekundum (10-15 s) időskálán szimulálja a fehérje mozgását. Előny: entrópia effektusokat is tartalmaz; Hátrány: nem elég pontos erőterek
24 6. Modell optimálás Homológia modellek energia minimalizációja klasszikus erőtér önmagát parametrizáló erőtér - 14 HM két különböző erőtérben való optimálása során számolt RMSD átlag. - Mindkét erőtér már ~500 ciklus után nagyjából kioptimálta a szerkezeteket, de a klasszikus erőtér rossz irányba mozdítja a modellt. - A modell optimálás eléri a kísérletileg meghatározott szerkezetek pontatlanságát: ha az RMSD eléri ~ 0,5 Å energia minimalizációs lépések száma x
25 7. Modell validáci ció A fehérjék 3D szerkezetvizsgálatára bemutatott módszerekkel: Ramachandran plot WhatIf PROCHECK
Bioinformatika 2 6. előadás
6. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.10.08. PDBj: http://www.pdbj.org/ Fehérjék 3D szerkezeti adatbázisai - PDBj 2 2018.10.08.
RészletesebbenFehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis. Fehérjeszerkezet analízis
Szerkezet Protein Data Bank (PDB) http://www.rcsb.org/pdb ~ 35 701 szerkezet közepes felbontás 1552 szerkezet d 1.5 Å 160 szerkezet d 1.0 Å 10 szerkezet d 0.8 Å (atomi felbontás) E globális minimum? funkció
RészletesebbenFehérjék rövid bevezetés
Receptorfehérj rjék szerkezetének felderítése Homológia modellezés Fehérjék rövid bevezetés makromolekulák számos biológiai funkció hordozói: enzimatikus katalízis, molekula transzport, immunválaszok,
RészletesebbenBioinformatika 2 9. előadás
9. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2017.11.06. Térszerkezet előrejelzés fő módszerei Homológia modellezés (komparatív modellezés):
RészletesebbenBioinformatika 2 5.. előad
5.. előad adás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 03. 21. Fehérje térszerkezet t megjelenítése A fehérjék meglehetősen összetett
RészletesebbenA fehérjék szerkezeti hierarchiája. Fehérje-szerkezetek! Klasszikus szerkezet-funkció paradigma. szekvencia. funkció. szerkezet! Myoglobin.
Myoglobin Fehérje-szerkezetek! MGLSDGEWQLVLNVWGKVEADIPGGQEVLIRLFK GPETLEKFDKFKLKSEDEMKASE DLKKGATVLTALGGILKKKGEAEIKPLAQSA TKKIPVKYLEFISECIIQVLQSK PGDFGADAQGAMNKALELFRKDMASNYKELGFQG Fuxreiter Mónika! Debreceni
RészletesebbenA fehérjék térszerkezetének jóslása
A fehérjék térszerkezetének jóslása 1. A probléma bonyolultsága 2. A predikció szintjei 3. 1D predikciók (másodlagos szerkezet, hozzáférhetõség, transzmembrán hélixek 4. 2D predikciók (oldallánc kontaktusok,
RészletesebbenBioinformatika 2 5. előadás
5. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.10.01. Fehérje térszerkezet megjelenítése A fehérjék meglehetősen összetett szerkezetek,
Részletesebben8. A fehérjék térszerkezetének jóslása
8. A fehérjék térszerkezetének jóslása A probléma bonyolultsága Általánosságban: találjuk meg egy tetszõleges szekvencia azon konformációját, amely a szabadentalpia globális minimumát adja. Egyszerû modellekben
RészletesebbenA fehérjék térszerkezetének jóslása (Szilágyi András, MTA Enzimológiai Intézete)
A fehérjék térszerkezetének jóslása (Szilágyi András, MTA Enzimológiai Intézete) A probléma bonyolultsága Általánosságban: találjuk meg egy tetszőleges szekvencia azon konformációját, amely a szabadentalpia
Részletesebben7. Fehérjeszekvenciák és térszerkezetek analízise.
7. Fehérjeszekvenciák és térszerkezetek analízise. 1. Egyszerû elemzések 2. Térszerkezet predikció 2.1. A probléma bonyolultsága 2.2. A predikció szintjei 2.3. 1D predikciók (másodlagos szerkezet, hozzáférhetõség,
RészletesebbenBioinformatika 2 4. előadás
4. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.09.24. Biológiai adatbázisok Felhasználó Keresõprogram BLAST Biológiai adatbázisok
RészletesebbenBevezetés a bioinformatikába. Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék
Bevezetés a bioinformatikába Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék Bioinformatika Interdiszciplináris tudomány, amely magába foglalja a biológiai adatok gyűjtésének,feldolgozásának, tárolásának,
RészletesebbenFehérjeszerkezet, és tekeredés
Fehérjeszerkezet, és tekeredés Futó Kinga 2013.10.08. Polimerek Polimer: hasonló alegységekből (monomer) felépülő makromolekulák Alegységek száma: tipikusan 10 2-10 4 Titin: 3,435*10 4 aminosav C 132983
RészletesebbenALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával.
ALKÍMIA MA Az anyagról mai szemmel, a régiek megszállottságával www.chem.elte.hu/pr Kvíz az előző előadáshoz Programajánlatok október 18. 16:00 ELTE Kémiai Intézet 065-ös terem Észbontogató (www.chem.elte.hu/pr)
RészletesebbenA racionális gyógyszertervezés lehetőségei. A racionális gyógyszertervezés lehetőségei. A racionális gyógyszertervezés lehetőségei
Cél: kis koncentrációban kötődő célvegyület tervezése Agonista: segíti az enzim működését, hatékonyabb, mint a természetes szubsztrát Antagonista: gátolja az enzim működését, ellentétes hatású, mint a
RészletesebbenElválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék
Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék Fő kutatási területek Enzimek vizsgálata mannozidáz amiláz OGT Analitikai kutatások Élelmiszer analitika Magas
RészletesebbenHemoglobin - myoglobin. Konzultációs e-tananyag Szikla Károly
Hemoglobin - myoglobin Konzultációs e-tananyag Szikla Károly Myoglobin A váz- és szívizom oxigén tároló fehérjéje Mt.: 17.800 153 aminosavból épül fel A lánc kb 75 % a hélix 8 db hélix, köztük nem helikális
RészletesebbenBioinformatika előadás
10. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat Genomika vs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket vizsgáljuk,
RészletesebbenElektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások. Elektrosztatikus számítások Definíciók
Jelentősége szubsztrát kötődés szolvatáció ionizációs állapotok (pka) mechanizmus katalízis ioncsatornák szimulációk (szerkezet) all-atom dipolar fluid dipolar lattice continuum Definíciók töltéseloszlás
RészletesebbenBioinformatika előadás
Bioinformatika 2 11. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2016.11.28. Bioinformatics Szerkezeti genomika, proteomika, biológia
Részletesebben2. Ismert térszerkezetű transzmembrán fehérjék adatbázisa: a PDBTM adatbázis. 3. A transzmembrán fehérje topológiai adatbázis, a TOPDB szerver
A 2005 és 2007 között megvalósított project célja transzmembrán fehérjék vizsgálata és az ehhez szükséges eljárások kifejlesztése volt. Ez utóbbi magába foglalta új adatbázisok és szerkezet becslő módszerek
RészletesebbenErőterek. Erőterek. Erőterek. Erőterek. Erőterek. Erőterek. Probléma: fehérjéknél nagy dimenziók értelmetlen QM eredmények.
fehérjéknél nagy dimenziók értelmetlen QM eredmények Megoldás: egyszerűsítés dimenzió-csökkentés Közelítések Born-Oppenheimer közelítés (Ψ mol = Ψ el Ψ mag ; E tot =E el +E mag ) az energia párkölcsönhatások
RészletesebbenA tárgy címe: Bioinformatika
A tárgy címe: Bioinformatika Kötelezően választható tárgy IV. és V. évfolyamos biológus hallgatók számára; heti 2+3 óra Előkövetelmény: Biokémia főkollégium; genetika főkollégium; alapszintű számítógépes
RészletesebbenCikloalkánok és származékaik konformációja
1 ikloalkánok és származékaik konformációja telített gyűrűs szénhidrogének legegyszerűbb képviselője a ciklopropán. Gyűrűje szabályos háromszög alakú, ennek megfelelően szénatomjai egy síkban helyezkednek
RészletesebbenHisztamin receptorok térszerkezetének vizsgálata és alkalmazása a gyógyszerkutatásban
Hisztamin receptorok térszerkezetének vizsgálata és alkalmazása a gyógyszerkutatásban Doktori értekezés Kiss Róbert Semmelweis Egyetem Gyógyszertudományok Doktori Iskola Témavezető: Dr. Józan Miklós, Ph.D.
RészletesebbenFehérjék felépítése és struktúrája. Aminosav oldalláncok. A fehérjék királis elemekből (α-l-aminosavakból) épülnek fel
Fehérjék felépítése és struktúrája Aminosav oldalláncok A fehérjék királis elemekből (α-l-aminosavakból) épülnek fel Fehérjék szerkezete Anfinsen dogmája Anfinsen dogmája (vagy: termodinamikus hipotézis)
RészletesebbenBioinformatika 2 10.el
10.el őadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 04. 24. Genomikavs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket
RészletesebbenTöbb oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek
Több oxigéntartalmú funkciós csoportot tartalmazó vegyületek Hidroxikarbonsavak α-hidroxi karbonsavak -Glikolsav (kézkrémek) - Tejsav (tejtermékek, izomláz, fogszuvasodás) - Citromsav (citrusfélékben,
RészletesebbenA fehérjék hierarchikus szerkezete
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
RészletesebbenTDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
RészletesebbenSzámítógépek és modellezés a kémiai kutatásokban
Számítógépek és modellezés a kémiai kutatásokban Jedlovszky Pál Határfelületek és nanorendszerek laboratóriuma Alkímia ma 214 április 3. VALÓDI RENDSZEREK MODELL- ALKOTÁS MODELL- RENDSZEREK KÍSÉRLETEK
Részletesebben1. Olvassuk be két pont koordinátáit: (x1, y1) és (x2, y2). Határozzuk meg a két pont távolságát és nyomtassuk ki.
Számítás:. Olvassuk be két pont koordinátáit: (, y) és (2, y2). Határozzuk meg a két pont távolságát és nyomtassuk ki. 2. Olvassuk be két darab két dimenziós vektor komponenseit: (a, ay) és (b, by). Határozzuk
RészletesebbenCélkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése
Célkitűzés/témák Fehérje-ligandum kölcsönhatások és a kötődés termodinamikai jellemzése Ferenczy György Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biokémiai folyamatok - Ligandum-fehérje kötődés
RészletesebbenA fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások
A fehérjék szerkezete és az azt meghatározó kölcsönhatások 1. A fehérjék szerepe az élõlényekben 2. A fehérjék szerkezetének szintjei 3. A fehérjék konformációs stabilitásáért felelõs kölcsönhatások 4.
RészletesebbenCserző Miklós Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Integrált biológiai adatbázisok
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Integrált biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás A genom annotálás jelentősége Genome Reference Consortium Gene Ontology Az ensembl pipeline
RészletesebbenMEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak
Modul cím: MEDICINÁLIS ALAPISMERETEK AZ ÉLŐ SZERVEZETEK KÉMIAI ÉPÍTŐKÖVEI AZ AMINOSAVAK ÉS FEHÉRJÉK 1. kulcsszó cím: Aminosavak Egy átlagos emberben 10-12 kg fehérje van, mely elsősorban a vázizomban található.
RészletesebbenFelhő használata mindennapi alkalmazások futtatására. Németh Zsolt MTA SZTAKI
Felhő használata mindennapi alkalmazások futtatására Németh Zsolt MTA SZTAKI Legyőzni a maláriát 45 másodpercenként meghal egy gyerek maláriában Évente 216 millió ember fertőződik meg és 650000 meghal
RészletesebbenA fehérjék hierarchikus szerkezete
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
Részletesebben(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.
Immunbiológia II A T sejt receptor () heterodimer α lánc kötőhely β lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma 1 V α V β C α C β EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL αlánc: VJ régió β lánc: VDJ régió Nincs
RészletesebbenBioinformatika előadás
Bioinformatika 2 11. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.11.22. Szerkezeti genomika, proteomika, biológia A biológia forradalma
RészletesebbenMolekuláris dinamika I. 10. előadás
Molekuláris dinamika I. 10. előadás Miről is szól a MD? nagy részecskeszámú rendszerek ismerjük a törvényeket mikroszkópikus szinten minden részecske mozgását szimuláljuk? Hogyan tudjuk megérteni a folyadékok,
RészletesebbenAkusztikai tervezés a geometriai akusztika módszereivel
Akusztikai tervezés a geometriai akusztika módszereivel Fürjes Andor Tamás BME Híradástechnikai Tanszék Kép- és Hangtechnikai Laborcsoport, Rezgésakusztika Laboratórium 1 Tartalom A geometriai akusztika
RészletesebbenBioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Biológiai adatbázisok. Cserző Miklós 2018
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás Mi az adatbázis A biológia kapcsolata az adatbázisokkal Az adatbázisok típusai Adatbázis formátumok,
RészletesebbenAz anyagi rendszer fogalma, csoportosítása
Az anyagi rendszer fogalma, csoportosítása A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011 1 1 A rendszer fogalma A körülöttünk levő anyagi világot atomok, ionok, molekulák építik
RészletesebbenElméleti módszerek lipidek és membránfehérjék tanulmányozására
Membránok és membránfehérjék Elméleti módszerek lipidek és membránfehérjék tanulmányozására Hegedűs Tamás tamas@hegelab.org MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport SE Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet
RészletesebbenImmunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B- sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
RészletesebbenKötések kialakítása - oktett elmélet
Kémiai kötések Az elemek és vegyületek halmazai az atomok kapcsolódásával - kémiai kötések kialakításával - jönnek létre szabad atomként csak a nemesgázatomok léteznek elsődleges kémiai kötések Kötések
RészletesebbenRobotika. Kinematika. Magyar Attila
Robotika Kinematika Magyar Attila amagyar@almos.vein.hu Miről lesz szó? Bevezetés Merev test pozíciója és orientációja Rotáció Euler szögek Homogén transzformációk Direkt kinematika Nyílt kinematikai lánc
RészletesebbenKémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Slide 1 /39
Kémiai kötés 12-1 Lewis elmélet 12-2 Kovalens kötés: bevezetés 12-3 Poláros kovalens kötés 12-4 Lewis szerkezetek 12-5 A molekulák alakja 12-6 Kötésrend, kötéstávolság 12-7 Kötésenergiák Általános Kémia,
RészletesebbenFotovillamos és fotovillamos-termikus modulok energetikai modellezése
Fotovillamos és fotovillamos-termikus modulok energetikai modellezése Háber István Ervin Nap Napja Gödöllő, 2016. 06. 12. Bevezetés A fotovillamos modulok hatásfoka jelentősen függ a működési hőmérséklettől.
RészletesebbenMakromolekulák. I. A -vázas polimerek szerkezete és fizikai tulajdonságai. Pekker Sándor
Makromolekulák I. A -vázas polimerek szerkezete és fizikai tulajdonságai Pekker Sándor MTA SZFKI Telefon:392-2222/845, Fax:392-229, Email: pekker@szfki.hu SZFKI tanfolyam: www.szfki.hu/moodle/course/ a
RészletesebbenImmunológia alapjai előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B-sejt receptorok:
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B-sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
RészletesebbenA rácsmodell. Szabadenergia felületek.
1. A spinüveg modell 2. A rácsmodellek típusai 3. A rácsmodellek elõnyei és hátrányai 4. A rácsmodellek elemzése 5. Egyszerû rácsmodellek 6. Rácsmodellek natív állapotai 7. Oldalláncok 8. Rácsmodellek
RészletesebbenImmunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B- sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
RészletesebbenBioinformatika 2 2. előadás
2. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.09.10. N.M. Luscombe, D. Greenbaum, M. Gerstein: International Medical Informatics
Részletesebben3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások)
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, enzimműködés, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, poszt szintetikus módosítások) 3.1 Fehérjék, enzimek A genetikai információ egyik fő manifesztálódása
RészletesebbenMolekuláris dinamika. 10. előadás
Molekuláris dinamika 10. előadás Mirőlis szól a MD? nagy részecskeszámú rendszerek ismerjük a törvényeket mikroszkópikus szinten? Hogyan tudjuk megérteni a folyadékok, gázok, szilárdtestek makroszkópikus
RészletesebbenGenomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)
Genomika Új korszak, paradigmaváltás, forradalom: a teljes genomok ismeretében a biológia adatokban gazdag tudománnyá válik. Új kutatási módszerek, új szemlélet. Hajtóerõk: Genomszekvenálási projektek
RészletesebbenKémiai kötés. Általános Kémia, szerkezet Dia 1 /39
Kémiai kötés 4-1 Lewis elmélet 4-2 Kovalens kötés: bevezetés 4-3 Poláros kovalens kötés 4-4 Lewis szerkezetek 4-5 A molekulák alakja 4-6 Kötésrend, kötéstávolság 4-7 Kötésenergiák Általános Kémia, szerkezet
RészletesebbenFANUC Robotics Roboguide
FANUC Robotics Roboguide 2010. február 9. Mi Mi az az a ROBOGUIDE Robot rendszer animációs eszköz ROBOGUIDE is an off-line eszköz a robot rendszer beállításához és karbantartásához ROBOGUIDE is an on-line
RészletesebbenKémiai kötés Lewis elmélet
Kémiai kötés 10-1 Lewis elmélet 10-2 Kovalens kötés: bevezetés 10-3 Poláros kovalens kötés 10-4 Lewis szerkezetek 10-5 A molekulák alakja 10-6 Kötésrend, kötéstávolság 10-7 Kötésenergiák Általános Kémia,
RészletesebbenFüggvények ábrázolása
Függvények ábrázolása Matematikai függvényeket analitikusan nem tudunk a matlabban megadni (tudunk, de ilyet még nem tanulunk). Ahhoz, hogy egy függvényt ábrázoljuk, hasonlóan kell eljárni, mint a házi
RészletesebbenKísérleti üzemek az élelmiszeriparban alkalmazható fejlett gépgyártás-technológiai megoldások kifejlesztéséhez, kipróbálásához és oktatásához
1 Nemzeti Workshop Kísérleti üzemek az élelmiszeriparban alkalmazható fejlett gépgyártás-technológiai megoldások kifejlesztéséhez, kipróbálásához és oktatásához Berczeli Attila Campden BRI Magyarország
RészletesebbenProblémák és megoldások a bioinformatikában. Válogatott fejezetek a bioinformatikából. Gyimesi Gergely, 2008. február 25.
Problémák és megoldások a bioinformatikában Válogatott fejezetek a bioinformatikából Gyimesi Gergely, 2008. február 25. Mik a fontos, megoldatlan biológiai problémák? Milyen módszereket, megoldási lehetıségeket
RészletesebbenBiopolimer 12/7/09. Makromolekulák szerkezete. Fehérje szerkezet, és tekeredés. DNS. Polimerek. Kardos Roland DNS elsődleges szerkezete
Biopolimerek Makromolekulák szerkezete. Fehérje szerkezet, és tekeredés. Osztódó sejt magorsófonala Kardos Roland 2009.10.29. Dohány levél epidermális sejtjének aktin hálózat Bakteriofágból kiszabaduló
RészletesebbenVan-e a vákuumnak energiája? A Casimir effektus és azon túl
Van-e a vákuumnak energiája? és azon túl MTA-ELTE Elméleti Fizikai Kutatócsoport Bolyai Kollégium, 2007. október 3. Van-e a vákuumnak energiája? és azon túl Vázlat 1 2 3 4 5 Van-e a vákuumnak energiája?
RészletesebbenRend, rendezetlenség, szimmetriák (rövidített változat)
Rend, rendezetlenség, szimmetriák (rövidített változat) dr. Tasnádi Tamás 1 2018. február 16. 1 BME, Matematikai Intézet Tartalom Mi a rend? Érdekes grafikáktól a periodikus rácsokig Nem periodikus parkettázások
Részletesebben41. ábra A NaCl rács elemi cellája
41. ábra A NaCl rács elemi cellája Mindkét rácsra jellemző, hogy egy tetszés szerint kiválasztott pozitív vagy negatív töltésű iont ellentétes töltésű ionok vesznek körül. Különbség a közvetlen szomszédok
Részletesebben(Solid modeling, Geometric modeling) Testmodell: egy létező vagy elképzelt objektum digitális reprezentációja.
Testmodellezés Testmodellezés (Solid modeling, Geometric modeling) Testmodell: egy létező vagy elképzelt objektum digitális reprezentációja. A tervezés (modellezés) során megadjuk a objektum geometria
RészletesebbenAtomok és molekulák elektronszerkezete
Atomok és molekulák elektronszerkezete Szabad atomok és molekulák Schrödinger egyenlete Tekintsünk egy kvantummechanikai rendszert amely N n magból és N e elektronból áll. Koordinátáikat jelölje rendre
RészletesebbenSemmelweis Egyetem / Élettani Intézet / Budapest. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Bioinformatikai modellek. Cserző Miklós 2017
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Bioinformatikai modellek Cserző Miklós 2017 A mai előadás A predikció jelentősége a biológiában Egyszerű statisztikai modellek Kyte-Doolittle hidrofóbicitás
Részletesebben1. tétel. 1. Egy derékszögű háromszög egyik szöge 50, a szög melletti befogója 7 cm. Mekkora a háromszög átfogója? (4 pont)
1. tétel 1. Egy derékszögű háromszög egyik szöge 50, a szög melletti befogója cm. Mekkora a háromszög átfogója? (4 pont). Adott az ábrán két vektor. Rajzolja meg a b, a b és az a b vektorokat! (6 pont)
RészletesebbenLIE. Lineáris Kölcsönhatás Módszere. Vázlat LIE. Fehérje-ligandum kölcsönhatás kvantitatív jellemzése számítógépes modellezéssel 2.
Fehérje-ligandum kölcsönhatás kvantitatív jellemzése számítógépes modellezéssel 2. rész Ferenczy György MTA-SE Molekuláris Biofizikai Kutatócsoport ferenczy.gyorgy@med.semmelweis-univ.hu Vázlat Kötődési
Részletesebben17. előadás: Vektorok a térben
17. előadás: Vektorok a térben Szabó Szilárd A vektor fogalma A mai előadásban n 1 tetszőleges egész szám lehet, de az egyszerűség kedvéért a képletek az n = 2 esetben szerepelnek. Vektorok: rendezett
RészletesebbenGamma-röntgen spektrométer és eljárás kifejlesztése anyagok elemi összetétele és izotópszelektív radioaktivitása egyidejű elemzésére
Gamma-röntgen spektrométer és eljárás kifejlesztése anyagok elemi összetétele és izotópszelektív radioaktivitása egyidejű elemzésére OAH-ABA-16/14-M Dr. Szalóki Imre, egyetemi docens Radócz Gábor, PhD
RészletesebbenElektronegativitás. Elektronegativitás
Általános és szervetlen kémia 3. hét Elektronaffinitás Az az energiaváltozás, ami akkor következik be, ha 1 mól gáz halmazállapotú atomból 1 mól egyszeresen negatív töltésű anion keletkezik. Mértékegysége:
RészletesebbenSzimulációk egyszerősített fehérjemodellekkel. Szilágyi András
Szimulációk egyszerősített fehérjemodellekkel Szilágyi András Szimulációs módszerek alkalmazhatósági tartományai Egyszerősített modellek Három típusát mutatjuk be: Játék rácsmodellek Realisztikusabb rácsmodellek
RészletesebbenNukleinsavak építőkövei
ukleinsavak Szerkezeti hierarchia ukleinsavak építőkövei Pirimidin Purin Pirimidin Purin Timin (T) Adenin (A) Adenin (A) Citozin (C) Guanin (G) DS bázisai bázis Citozin (C) Guanin (G) RS bázisai bázis
RészletesebbenSzerves Kémiai Problémamegoldó Verseny
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny 2015. április 24. Név: E-mail cím: Egyetem: Szak: Képzési szint: Évfolyam: Pontszám: Név: Pontszám: / 3 pont 1. feladat Egy C 4 H 10 O 3 összegképletű vegyület 0,1776
RészletesebbenFEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN. Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium. Alkímia Ma, Budapest,
FEHÉRJÉK A MÁGNESEKBEN Bodor Andrea ELTE, Szerkezeti Kémiai és Biológiai Laboratórium Alkímia Ma, Budapest, 2013.02.28. I. FEHÉRJÉK: L-α aminosavakból felépülő lineáris polimerek α H 2 N CH COOH amino
RészletesebbenSzámítógépes Grafika mintafeladatok
Számítógépes Grafika mintafeladatok Feladat: Forgassunk a 3D-s pontokat 45 fokkal a X tengely körül, majd nyújtsuk az eredményt minden koordinátájában kétszeresére az origóhoz képest, utána forgassunk
RészletesebbenII. rész: a rendszer felülvizsgálati stratégia kidolgozását támogató funkciói. Tóth László, Lenkeyné Biró Gyöngyvér, Kuczogi László
A kockázat alapú felülvizsgálati és karbantartási stratégia alkalmazása a MOL Rt.-nél megvalósuló Statikus Készülékek Állapot-felügyeleti Rendszerének kialakításában II. rész: a rendszer felülvizsgálati
RészletesebbenHálózat hidraulikai modell integrálása a Soproni Vízmű Zrt. térinformatikai rendszerébe
Hálózat hidraulikai modell integrálása a térinformatikai rendszerébe Hálózathidraulikai modellezés - Szakmai nap MHT Vízellátási Szakosztály 2015. április 9. Térinformatikai rendszer bemutatása Működési
RészletesebbenGépészeti rendszertechnika (NGB_KV002_1)
Gépészeti rendszertechnika (NGB_KV002_1) 2. Óra Kőrös Péter Közúti és Vasúti Járművek Tanszék Tanszéki mérnök (IS201 vagy a tanszéken) E-mail: korosp@ga.sze.hu Web: http://www.sze.hu/~korosp http://www.sze.hu/~korosp/gepeszeti_rendszertechnika/
RészletesebbenEvans-Searles fluktuációs tétel Crooks fluktuációs tétel Jarzynski egyenlőség
Evans-Searles fluktuációs tétel Crooks fluktuációs tétel Jarzynski egyenlőség Osváth Szabolcs Evans-Searles fluktuációs tétel Denis J Evans, Ezechiel DG Cohen, Gary P Morriss (1993) Denis J Evans, Debra
RészletesebbenSzerves Kémiai Problémamegoldó Verseny
Szerves Kémiai Problémamegoldó Verseny 2015. április 24. Név: E-mail cím: Egyetem: Szak: Képzési szint: Évfolyam: Pontszám: Név: Pontszám: / 3 pont 1. feladat Egy C 4 H 10 O 3 összegképletű vegyület 0,1776
RészletesebbenAz élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék. elrendeződés, rend, rendszer, periodikus ismétlődés
Az élő anyag szerkezeti egységei: víz, nukleinsavak, fehérjék Agócs Gergely 2013. december 3. kedd 10:00 11:40 1. Mit értünk élő anyag alatt? Az élő szervezetet felépítő anyagok. Az anyag azonban nem csupán
RészletesebbenBGF. 4. Mi tartozik az adatmodellek szerkezeti elemei
1. Mi az elsődleges következménye a gyenge logikai redundanciának? inkonzisztencia veszélye felesleges tárfoglalás feltételes függés 2. Az olyan tulajdonság az egyeden belül, amelynek bármely előfordulása
RészletesebbenSzénhidrátkémiai kutatások bioinformatikai esetek. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék
Szénhidrátkémiai kutatások bioinformatikai esetek Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék Intranet http://dspace.lib.unideb.hu:8080/dspace/handle/2437/2815 Fő kutatási területek Enzimek vizsgálata
RészletesebbenA kémiai kötés. Kémiai kölcsönhatás
A kémiai kötés Kémiai kölcsönhatás ELSŐDLEGES MÁSODLAGOS KOVALENS IONOS FÉMES HIDROGÉN- KÖTÉS DIPÓL- DIPÓL, ION- DIPÓL, VAN DER WAALS v. DISZPERZIÓS Ionos kötés Na Cl Ionpár képződése e - Na + Cl - Na:
RészletesebbenOH ionok LiNbO 3 kristályban (HPC felhasználás) 1/16
OH ionok LiNbO 3 kristályban (HPC felhasználás) Lengyel Krisztián MTA SZFKI Kristályfizikai osztály 2011. november 14. OH ionok LiNbO 3 kristályban (HPC felhasználás) 1/16 Tartalom A LiNbO 3 kristály és
RészletesebbenInfobionika ROBOTIKA. X. Előadás. Robot manipulátorok II. Direkt és inverz kinematika. Készült a HEFOP P /1.0 projekt keretében
Infobionika ROBOTIKA X. Előadás Robot manipulátorok II. Direkt és inverz kinematika Készült a HEFOP-3.3.1-P.-2004-06-0018/1.0 projekt keretében Tartalom Direkt kinematikai probléma Denavit-Hartenberg konvenció
RészletesebbenÁGAZATI SZAKMAI ÉRETTSÉGI VIZSGA KOZMETIKAI ISMERETEK KÖZÉPSZINTŰ SZÓBELI VIZSGA MINTAFELADATOK ÉS ÉRTÉKELÉSÜK
KOZMETIKAI ISMERETEK KÖZÉPSZINTŰ SZÓBELI VIZSGA MINTAFELADATOK ÉS ÉRTÉKELÉSÜK MINTATÉTEL. tétel A feladat: Nevezze meg és jellemezze a képen látható bőrelváltozást, mint a bőr szerkezetében bekövetkezett
RészletesebbenA fehérjék hierarchikus szerkezete. Szerkezeti hierarchia. A fehérjék építőkövei az aminosavak. Fehérjék felosztása
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
RészletesebbenFolyami hidrodinamikai modellezés
Folyami hidrodinamikai modellezés Dr. Krámer Tamás egyetemi docens BME Vízépítési és Vízgazdálkodási Tanszék Numerikus modellezés 0D 1D 2D 3D Alacsony Kézi számítások Részletesség és pontosság Bonyolultság
RészletesebbenNatív antigének felismerése. B sejt receptorok, immunglobulinok
Natív antigének felismerése B sejt receptorok, immunglobulinok B és T sejt receptorok A B és T sejt receptorok is az immunglobulin fehérje család tagjai A TCR nem ismeri fel az antigéneket, kizárólag az
Részletesebbentranszláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
RészletesebbenA T sejt receptor (TCR) heterodimer
Immunbiológia - II A T sejt receptor (TCR) heterodimer 1 kötőhely lánc lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma V V C C EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL lánc: VJ régió lánc: VDJ régió Nincs szomatikus
RészletesebbenSavak bázisok. Csonka Gábor Általános Kémia: 7. Savak és bázisok Dia 1 /43
Savak bázisok 121 Az Arrhenius elmélet röviden 122 BrønstedLowry elmélet 123 A víz ionizációja és a p skála 124 Erős savak és bázisok 125 Gyenge savak és bázisok 126 Több bázisú savak 127 Ionok mint savak
Részletesebben