Proteomika alapfogalmak, módszerek, példák a proteomika alkalmazására
|
|
- Emília Orsós
- 7 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 Proteomika alapfogalmak, módszerek, példák a proteomika alkalmazására
2 Alapfogalmak és omikák : Genomika Teljes humán genom szekvenciájának meghatározása: február Genom: Winkler, 1920; GENes and chromosomes Egy szervezet, sejt, egy organellum vagy egy vírus teljes kromoszomális és kromoszómán kívüli génjeinek összessége, azaz a szervezet teljes DNS-állománya (IUPAC) - Genomika: Roderick, 1986 (Genomics, folyóirat) genom szekvenciájára vonatkozó adatállomány új gének felfedezése géntérképezés genomok összehasonlítása (fajok, evolúció) új, gén alapú eljárások
3 Alapfogalmak és omikák : Proteomika Proteom: M. Wilkins (1994) Conference on Genome and Protein Maps, Siena, Italy Protein complement expressed by a genome. Egy szervezet, egy sejt, egy organellum vagy egy vírus összes proteinje, a szervezet teljes fehérjeállománya If the genome is a list of the instruments in an orchestra, the proteome is the orchestra playing a symphony. (R. Simpson) Proteomika: 1. Proteomok kvalitatív és kvantitatív analízise, összehasonlítása különböző körülmények között (pl. beteg vs egészséges) 2. Azonosítás (szekvencia, 3D szerkezet) és fehérjemódosítások 3. Kísérleti megfigyelések összegyűjtése adatbázisban 4. A fehérjék alábbi tulajdonságainak meghatározása: - lokalizáció - módosítások (pl. poszttranszlációs módosítások) - kapcsolatok (pl. metabolikus és jelátviteli utak) - aktivitás - funkció (predikció és kísérleti eredmények alpján) 5. Betegségek megértése, diagnosztika, gyógyszerek fejlesztése
4 További omikák Bioinformatika Adat Adat Adat Adat Genomika Transcriptomika Proteomika Metabolomika Gének mrns Fehérjék Metabolitok
5 Összefoglaló Genom Proteom Genomika sejttérképezés" Funkcionális genomika Proteomika
6
7 Proteomika mint kulcsszó az irodalomban Darab közlemény Év
8 Miért kell a proteomika? Az mrns expresszió nem mindig felel meg a fehérjeexpressziónak Biológiai minták (pl. szérum, vizelet stb.) nem alkalmas mrns expressziós analízisre Poszttranszlációs változások: nem lehet egyértelműen következtetni a DNS szekvencia alapján A fehérjék lokalizációjára és kölcsönhatásaira is lehet következtetni
9
10 Proteomikák Funkcionális Aktivitáson alapuló proteomika: Funkció összekapcsolása génexpressziós és/vagy fehérjefehérje interakciós adatokkal Kémia proteomika: Proteom-szintű vizsgálatok Enzimaktivitás meghatározására, sokféle kémiai könyvtár Toxikoproteomika: Specifikus fehérjék azonosítása és koncentrációváltozásuk mérése Integrált Mikrobiális proteomika Célzott proteomika: Szövetproteomika (Kezdeményezés: National Cancer Institute) Strukturális Filoproteomika: Ismeretlen bakteriális izolátumok azonosítása az adatbázisban szereplő fehérje biomarkerek hasonlósága alapján Statisztikus proteomika: High throughput 3D/4D fehérjeszerkezeti információ analízise és alkalmazása valamennyi élettudomány alapján
11 Az expressziótól az azonosításig és tovább... Eredet meghatározás (taxonómia) Sejtlizátum -Nukleinsav -Fehérje -Lipidek -Szénhidrátok Lízis Elválasztás Fehérje expresszió Izolált fehérje Primer szerkezet (aminosav sorrend) Alegységszerkezet Poszttranszlációs mód. Lokalizáció Térszerkezet (3D) Funkció Annotáció Rokonság más fehérjével Asszociáció betegséggel
12 Az expressziótól az azonosításig és tovább... Nehézségek Eredet (taxonomia) 1. Fehérje-expresszió expresszió 1. "Sokféle fehérje" : gén fehérje 2. Eltérô expressziós profil : mennyiség, minôség - idô - hômérséklet - fény/részecske - kémiai szignál -- "természetes" -- "környezeti" (gyógyszer, szennyezés stb) Sejtlizátum - nukleinsavak - fehérjék - lipidek - szénhidrátok... Lízis 1. Nem teljes, molekuláris szintû dezintegráció. 2. Oldékonyság (hidrofób fehérjék). 3. Enzimaktivitás, degradáció.
13 Az expressziótól az azonosításig és tovább... Nehézségek Sejtlizátum - nukleinsavak - fehérjék - lipidek - szénhidrátok... Elválasztás - elekroforézis - kromatográfia - UC... Izolált fehérje 1. "Sokféle fehérje" : fehérje; kb fehérje/minta, de csak kb választható el 2D gélelektroforézissel 2. Kicsi és nagy 3. Kis mennyiség ("ritka protein"). 4. Alacsony koncentráció. 5. Nagy mennyiség ("abundant protein"). 6. Magas koncentráció. 7. Membrán/hidrofób fehérje (oldékonysági problémák) Elôfrakcionálás pi _ Pl. Humán szérum : 600 folt, ebből 205 a pi 5-6 tartományban
14 Az expressziótól az azonosításig és tovább... Nehézségek Izolált fehérje Primer szerkezet - aminosavsorrend Szerkezetvizsgálat - kémiai, enzimatikus lebontás - MS - bioinformatika 1. Diszulfid híd - alegységszerkezet. 2. Oldallánc amidkötés. 3. Nem-kovalens komplex. 4. Poszt transzlációs változáson átesett fehérje. 5. Enzim "rezisztens" fehérje (lásd prion). 6. Adatbázisban nem szereplő fehérje Pl. Humán szérum : 600 folt, ebből 205 a pi 5-6 tartományban, ebből 105 található meg az adatbázisban.
15 Az expressziótól az azonosításig és tovább... Nehézségek Primer szerkezet - aminosavsorrend Annotáció Primer szerkezet - alegységek - poszttranszlációs modosulások Térszerkezet Lokalizáció Funkció(k) - Ca 2+ kötés - Zn finger - ATP kötés Rokonság más fehérjével Asszociáció betegséggel 1. Ismeretlen térszerkezet - izolálás, szintézis, X-ray/NMR - predikció. 2. Ismeretlen lokalizáció - sejtfrakcionálás, - radioaktiv izotópos bioszintézis 3. Ismeretlen funkció - kötődés - biológiai válasz mérése 4. Összehasonlító vizsgálatok - fajok, - "normál" vs "kezelt"
16 Proteomikai munkafolyamat Minta összegyűjtése Organellumok szétválasztása Tisztítás ellenanyag segítségével 1 és 2D gélelektroforézis RP-HPLC SCX HPLC (ioncserés) Fehérje gélek Fehérje(k) (pöttyök) kivágása minta Előkészítő lépések ESI-MS, MALDI-TOF Szerkezeti vagy tömeg információk MS peptidek Fehérje(k) Keresés adatbázisban Fehérje azonosítás SWISS-PROT TrEMBL RefSeq XPs Ensembl...
17 A médium összetételének hatása az E-coli fehérjeösszetételére Arg - Arg Farrell PHO (1978)
18
19 Humán plazma részleges proteintérképe 2D gélelektroforézis alapján (JC Sanchez et al. 1995) kda méret pi = 4,0 6,0 izoelektromos pont tartományba eső fehérjekomponensek
20 Egészséges humán vastagbél epitélium fehérje térképe a sejtlizátum 2D gélelektroforézis alapján (MA Raymond et al. 1997).
21 Sejtmag fehérjék HeLa sejtekből Swiss-Prot
22 Sejtmag fehérjék HeLa sejtekből M w pi
23 Fibroblaszt lizátum fehérjéinek 2D gélelektroforézis képe A: egészséges, B: Down-kóros beteg mintája A B
24 Proteomikai munkafolyamat Minta összegyűjtése Organellumok szétválasztása Tisztítás ellenanyag segítségével 1 és 2D gélelektroforézis RP-HPLC SCX HPLC (ioncserés) Fehérje gélek Fehérje(k) (pöttyök) kivágása minta Előkészítő lépések ESI-MS, MALDI-TOF Szerkezeti vagy tömeg információk MS peptidek Fehérje(k) Keresés adatbázisban Fehérje azonosítás SWISS-PROT TrEMBL RefSeq XPs Ensembl...
25 Nem gél alapú elválasztási eljárások: kromatográfiás technikák peptidek, fehérjék analíziséhez Gélszűrés Hidrofób kölcsönhatás Ioncserés Fordított fázisú Affinitási
26 Multidimensional Protein Identification Technology (MudPIT) emésztés Denaturált fehérje komplex Peptidek Erős kationcserélő oszlop Fordított fázisú oszlop Peptidek 2D kromatográfiás elválasztása Peptid fragmentáció (MS/MS) Keresés adatbázisban A komplexben lévő fehérjék azonosítása
27 Keresés adatbázisban MS alapján MS-MS alapján Tömegspektrum MS/MS spektrum Peptide Mass Fingerprint (PMF) Fehérje azonosítás peptid tömeg alapján Szekvencia specifikus információ minden peptidre Fehérje azonosítás a peptidek szekvencia információja alapján Legalább 5 peptid tömegnek egyeznie kell Az azonosításhoz Legalább 2 fragmentációs mintázatnak egyeznie kell
28 Mit csinálnak a keresőmotorok? MS alapján történő keresés MS-MS alapján történő keresés A fehérjék elméleti emésztése Megkeresi a legjobb egyezést a kísérleti peptid tömeg és az elméleti peptid tömeg között A fehérjék elméleti emésztése Elméleti fragmens ionok generálása minden lehetséges triptikus peptidre, amely az emésztés során keletkezett Legjobb egyezés keresése peptid azonosításhoz Peptidek szekvenciáján alapuló fehérje azonosítás MASCOT: mindkét féle keresést tudja
29 TQTXT (X = 19 aminosav) peptidkönyvtár vizsgálata ESI- FTICR tömegspektrometriával I,L [TQT Q T+ H] [TQT K T+ H ] M calc. (TQTQT): M calc. (TQTK T): X = [TQTX T+H ] + - Signals m /z G A S P V T N Q, K D E M F R Y W H TQTQT/TQTKT Ms különbség: 0,368 m /z
30 Adatbázisok International Protein Index (IPI) (2001. október) Humán proteom leírása Humán fehérje szekvencia információk összegyűjtése 5 adatbázisból: SWISS-PROT TrEMBL RefSeq NPs RefSeq XPs Ensembl Fehérje szekvenciák magas színvonalú manuálisan annotált adatbázisa, melyet a Swiss Institute of Bioinformatics és a European Bioinformatics Institute tart fenn A SWISS-PROT automatikus annotációjú kiegészítése Fehérjeszekvenciák referenciagyűjteménye, melyet a National Center for Biotechnology Information tart fenn A genom annotáció során meghatározott Homo sapiens modell fehérjék szekvenciájának gyűjteménye, melynek fenntartója szintén az NCBI. Az EBI és a Sanger Centre közös vállalkozása egy olyan szoftverrendszer fejlesztésére, amely az eukarióta genomok automatikus annotációját hozza létre és tartja fenn.
31 International Protein Index (IPI) Az IPI tartalma Összes bejegyzések száma, amelyre az IPI mutat SWISS-PROT/TrEMBL bejegyzések száma RefSeq NP-k száma Ensembl bejegyzések száma RefSeq XP-k száma Elérhető: ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/ipi/current/ipi.fasta
32 Protein Protein Sequence Databases: PIR, PRF, RefSeq, SwissProt, TrEMBL Protein Family Databases: InterPro, iproclass, Pfam, PIR-ALN, ProDom Protein Structure Databases: CSD, MMDB,NDH, PDB, Protein Structural Classification Databases: CATH, DSSP, FSSP, HSSP, SCOP, Post-translational Modification Databases: O-GlyBase, RESID, Protein-protein kölcsönhatás CuraGen: Portal.curagen.com DIP: Dipode-mbi.ucla.edu Interact: Bioinf.man.ac.uk/interactso.htm MIPS: mips.biochem.mpg.de ProNet: Pronet.doublewist.com
33 Ismert 3D szerkezettel rendelkező fehérjék száma ( Ismert 3D szerkezetek száma az évben megismert az addig megismert Év 2010
34 NiceProt View of SWISS-PROT: P16070 Entry name CD44 HUMAN Primary accession number P16070 Entered in SWISS-PROT in Release 14, April 1990 Sequence was last modified in Release 35, November 1997 Annotations were last modified in Release 41, March 2002 Protein name CD44 antigen [Precursor] Synonyms Phagocytic glycoprotein I PGP-1 HUTCH-I Extracellular matrix receptor-iii ECMR-III GP90 lymphocyte homing/adhesion receptor Hermes antigen Hyaluronate receptor Heparan sulfate proteoglycan Epican CDw44 Gene name CD44 or LHR From Homo sapiens (Human) [TaxID: 9606] Taxonomy Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Primates; Catarrhini; Hominidae; Homo. References [1] SEQUENCE FROM NUCLEIC ACID (VARIOUS ISOFORMS). TISSUE=Lymphoblast; MEDLINE= ; PubMed= ; [NCBI, ExPASy, EBI, Israel, Japan] Screaton G.R., Bell M.V., Jackson D.G., Cornelis F.B., Gerth U., Bell J.I.; "Genomic structure of DNA encoding the lymphocyte homing receptor CD44 reveals at least 12 alternatively spliced exons." Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: (1992)
35 Apolipoprotein D: identification of fistula in perilymph Perilympha liquid Cerebrospinal liqued Human serum (clinical) Human serum (Sigma) Sun JP 1998
36 Apolipoprotein D: identification of fistula in perilymph - Neuraminidase + Neuraminidase
37 2D gelelectrophoresis map of proteins of fibroblast lysate from healthy (A) and from Down-diseased patient (B) A B
38 A proteomika alkalmazásai Sejt térkép Expressziós térkép Jelátvitel Proteom analízis Szerkezetmódisítás analízise Expressziós mechanizmus Gyógyszerek toxicitása Új gyógyszerek célbajuttatása Gyógyszerek mechanizmusai Proteomika (2DE, MS) Betegségek biomarkerei Az öregedés és metabolikus betegségek faktorai Ideg- és immunrendszer betegségeinek ellenőrzése Protein chip Különbségek kimutatása Nagy értékű termékek Ételek Búza, haszonállatok fehérje analízise stb. Mikrobiológia számára hasznos fehérjék felfedezése Strukturális genomika Bioinformatika
39 Összefoglalás Genom Proteom "Cell mapping" Genomika Proteomika Funkcionális genomika Tér és idő Interakciók
40 Kérdések Mi a proteomika? Irja le a proteomika gondolatmenetét! Milyen kapcsolat létesithető a proteomika és a gyógyszerkutatás között? Miért érdekes a proteomika az átlagos olvasó számára? Miként lehet ezt bizonyítani számára?
Proteomika alapfogalmak, módszerek, példák a proteomika alkalmazására
Proteomika alapfogalmak, módszerek, példák a proteomika alkalmazására Alapfogalmak és omikák : Genomika Teljes humán genom szekvenciájának meghatározása: 2001. február Genom: Winkler, 1920; GENes and chromosomes
RészletesebbenBioinformatika előadás
10. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat Genomika vs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket vizsgáljuk,
RészletesebbenBioinformatika 2 10.el
10.el őadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 04. 24. Genomikavs. proteomika A genomika módszereivel nem a tényleges fehérjéket
RészletesebbenBioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Biológiai adatbázisok. Cserző Miklós 2018
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Biológiai adatbázisok Cserző Miklós 2018 A mai előadás Mi az adatbázis A biológia kapcsolata az adatbázisokkal Az adatbázisok típusai Adatbázis formátumok,
RészletesebbenGenetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére
Genetikai panel kialakítása a hazai tejhasznú szarvasmarha állományok hasznos élettartamának növelésére Dr. Czeglédi Levente Dr. Béri Béla Kutatás-fejlesztés támogatása a megújuló energiaforrások és agrár
RészletesebbenSZTE-ELTE PROTEOMIKAI INNOVÁCIÓ: KONCEPCIÓ, EREDMÉNYEK, JÖVŐKÉP
SZTE-ELTE PROTEOMIKAI INNOVÁCIÓ: KONCEPCIÓ, EREDMÉNYEK, JÖVŐKÉP Minden elméletet úgy is meg lehet alkotni, hogy az általa sugallt kísérletek csak magát az elméletet erősítsék meg Konrad Lorenz A SEJTMŰKÖDÉS
RészletesebbenOrvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014. Április 8 Május 22 8th April 22nd May
Orvosi Genomtudomány 2014 Medical Genomics 2014 Április 8 Május 22 8th April 22nd May Hét / 1st week (9. kalendariumi het) Takács László / Fehér Zsigmond Magyar kurzus Datum/ido Ápr. 8 Apr. 9 10:00 10:45
RészletesebbenNémeth Anikó 1,2, Kosáry Judit 1, Fodor Péter 1, Dernovics Mihály 1
Németh Anikó 1,2, Kosáry Judit 1, Fodor Péter 1, Dernovics Mihály 1 1 Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudomány Kar, Alkalmazott Kémia Tanszék 2 Wessling Hungary Kft., Élelmiszervizsgáló Laboratórium
RészletesebbenBioinformatika 2 4. előadás
4. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.09.24. Biológiai adatbázisok Felhasználó Keresõprogram BLAST Biológiai adatbázisok
RészletesebbenTDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben
TDK lehetőségek az MTA TTK Enzimológiai Intézetben Vértessy G. Beáta egyetemi tanár TDK mind 1-3 helyezettek OTDK Pro Scientia különdíj 1 második díj Diákjaink Eredményei Zsűri különdíj 2 első díj OTDK
RészletesebbenProteomika Peptid szekvenálás. Dr. Csősz Éva Debreceni Egyetem ÁOK Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet Proteomika Szolgáltató Laboratórium
Proteomika Peptid szekvenálás Dr. Csősz Éva Debreceni Egyetem ÁOK Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet Proteomika Szolgáltató Laboratórium Fókuszterületek Omikák, rendszerbiológia hipotézis vezérelt
RészletesebbenA proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában
BIOTECHNOLÓGIAI FEJLESZTÉSI POLITIKA, KUTATÁSI IRÁNYOK A proteomika új tudománya és alkalmazása a rákdiagnosztikában Tárgyszavak: proteom; proteomika; rák; diagnosztika; molekuláris gyógyászat; biomarker;
RészletesebbenVérplazma fehérjék glikozilációjának vizsgálata
Vérplazma fehérjék glikozilációjának vizsgálata Doktori tézisek Dr. Tóth Eszter Semmelweis Egyetem Gyógyszertudományok Doktori Iskola Témavezető: Dr. Vékey Károly DSc, osztályvezető Hivatalos bírálók:
RészletesebbenA Proteomika Szolgáltató Laboratóriumban elérhető szolgáltatások
A Proteomika Szolgáltató Laboratóriumban elérhető szolgáltatások Dr. Csősz Éva Proteomika Szolgáltató Laboratórium műszerpark MALDI-TOF (ABSciex) PSZL ESI-4000 QTRAP (ABSciex) Kétdimenziós elektroforézis
RészletesebbenBioinformatika előadás
Bioinformatika 2 11. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2016.11.28. Bioinformatics Szerkezeti genomika, proteomika, biológia
Részletesebben9. Előadás. Fehérjék
9. Előadás Fehérjék Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E. Fischer : Gly-Gly 1932 Max Bergman és Leonidas Zervas : Benziloxi-karbonil csoport 1963 B. Merrifield : Szilárd fázisú
RészletesebbenProteomkutatás egy új tudományág születése
BIOTECHNOLÓGIAI FEJLESZTÉSI POLITIKA, KUTATÁSI IRÁNYOK Proteomkutatás egy új tudományág születése Tárgyszavak: humán genom; genomika; proteomika; kutatás; fehérjeszerkezet; háromdimenziós szerkezet; gyógyszeripar.
RészletesebbenBevezetés a bioinformatikába. Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék
Bevezetés a bioinformatikába Harangi János DE, TEK, TTK Biokémiai Tanszék Bioinformatika Interdiszciplináris tudomány, amely magába foglalja a biológiai adatok gyűjtésének,feldolgozásának, tárolásának,
Részletesebbentranszláció DNS RNS Fehérje A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti fehérjék, transzportfehérjék
Transzláció A molekuláris biológia centrális dogmája transzkripció transzláció DNS RNS Fehérje replikáció Reverz transzkriptáz A fehérjék jelenléte nélkülözhetetlen minden sejt számára: enzimek, szerkezeti
RészletesebbenHumán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP)
Humán genom variációk single nucleotide polymorphism (SNP) A genom ~ 97 %-a két különböző egyedben teljesen azonos ~ 1% különbség: SNP miatt ~2% különbség: kópiaszámbeli eltérés, deléciók miatt 11-12 millió
RészletesebbenBiomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással
Biomassza alapú bioalkohol előállítási technológia fejlesztése metagenomikai eljárással Kovács Zoltán ügyvezető DEKUT Debreceni Kutatásfejlesztési Közhasznú Nonprofit Kft. Problémadefiníció Első generációs
RészletesebbenBioinformatika 2 5.. előad
5.. előad adás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2009. 03. 21. Fehérje térszerkezet t megjelenítése A fehérjék meglehetősen összetett
RészletesebbenPeptidek LC-MS/MS karakterisztikájának javítása fluoros kémiai módosítással, proteomikai alkalmazásokhoz
Peptidek LC-MS/MS karakterisztikájának javítása fluoros kémiai módosítással, proteomikai alkalmazásokhoz Dr. Schlosser Gitta tudományos munkatárs MTA-ELTE Peptidkémiai Kutatócsoport MedInProt Tavaszi Konferencia
RészletesebbenSzénhidrátkémiai kutatások bioinformatikai esetek. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék
Szénhidrátkémiai kutatások bioinformatikai esetek Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék Intranet http://dspace.lib.unideb.hu:8080/dspace/handle/2437/2815 Fő kutatási területek Enzimek vizsgálata
RészletesebbenBioinformatika 2 6. előadás
6. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.10.08. PDBj: http://www.pdbj.org/ Fehérjék 3D szerkezeti adatbázisai - PDBj 2 2018.10.08.
RészletesebbenJuhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK
Juhász Angéla MTA ATK MI Alkalmazott Genomikai Osztály SZEKVENCIA ADATBÁZISOK Fehérjét kódol? Tulajdonságai? -Hol lokalizálódik? -Oldható? -3D szerkezete? -Accession #? -Annotációja elérhető? Már benne
RészletesebbenA T sejt receptor (TCR) heterodimer
Immunbiológia - II A T sejt receptor (TCR) heterodimer 1 kötőhely lánc lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma V V C C EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL lánc: VJ régió lánc: VDJ régió Nincs szomatikus
RészletesebbenFehérje expressziós rendszerek. Gyógyszerészi Biotechnológia
Fehérje expressziós rendszerek Gyógyszerészi Biotechnológia Expressziós rendszerek Cél: rekombináns fehérjék előállítása nagy tisztaságban és nagy mennyiségben kísérleti ill. gyakorlati (therapia) felhasználásokra
RészletesebbenBioinformatika előadás
Bioinformatika 2 11. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2018.11.22. Szerkezeti genomika, proteomika, biológia A biológia forradalma
RészletesebbenA tárgy címe: Bioinformatika
A tárgy címe: Bioinformatika Kötelezően választható tárgy IV. és V. évfolyamos biológus hallgatók számára; heti 2+3 óra Előkövetelmény: Biokémia főkollégium; genetika főkollégium; alapszintű számítógépes
Részletesebben7. Rendszerszemléletű biológia a kémikus szemével. Genomika, proteomika, metabolomika
7. Rendszerszemléletű biológia a kémikus szemével Genomika, proteomika, metabolomika 7. Rendszerszemléletű biológia Redukcionista vs. Holisztikus szemlélet A rendszerszemléletű biológia (systems biology)
Részletesebben(1) A T sejtek aktiválása (2) Az ön reaktív T sejtek toleranciája. α lánc. β lánc. V α. V β. C β. C α.
Immunbiológia II A T sejt receptor () heterodimer α lánc kötőhely β lánc 14. kromoszóma 7. kromoszóma 1 V α V β C α C β EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN CITOSZÓL αlánc: VJ régió β lánc: VDJ régió Nincs
RészletesebbenGenomadatbázisok Ld. Entrez Genome: Összes ismert genom, hierarchikus szervezésben (kromoszóma, térképek, gének, stb.)
Genomika Új korszak, paradigmaváltás, forradalom: a teljes genomok ismeretében a biológia adatokban gazdag tudománnyá válik. Új kutatási módszerek, új szemlélet. Hajtóerõk: Genomszekvenálási projektek
RészletesebbenElválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások. Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék
Elválasztástechnikai és bioinformatikai kutatások Dr. Harangi János DE, TTK, Biokémiai Tanszék Fő kutatási területek Enzimek vizsgálata mannozidáz amiláz OGT Analitikai kutatások Élelmiszer analitika Magas
RészletesebbenMiben különbözünk az egértől? Szabályozás a molekuláris biológiában
Az atomoktól a csillagokig, 2010. október 28., ELTE Fizikai Intézet Miben különbözünk az egértől? Szabályozás a molekuláris biológiában brainmaps.org Homo sapiens (Miroslav Klose) Mus musculus Farkas Illés
Részletesebben9. Előadás Fehérjék Előzmények Peptidkémia Analitikai kémia Protein kémia 1901 E.Fischer : Gly-Gly 1923 F. Pregl : Mikroanalitika 1952 Stein and Moore : Aminosav analizis 1932 Bergman és Zervas : Benziloxikarbonil
RészletesebbenIntelligens molekulákkal a rák ellen
Intelligens molekulákkal a rák ellen Kotschy András Servier Kutatóintézet Rákkutatási kémiai osztály A rákos sejt Miben más Hogyan él túl Áttekintés Rákos sejtek célzott támadása sejtmérgekkel Fehérjék
RészletesebbenADATBÁNYÁSZAT I. ÉS OMICS
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 ADATBÁNYÁSZAT
RészletesebbenTRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL
TRIPSZIN TISZTÍTÁSA AFFINITÁS KROMATOGRÁFIA SEGÍTSÉGÉVEL Az egyes biomolekulák izolálása kulcsfontosságú a biológiai szerepük tisztázásához. Az affinitás kromatográfia egyszerűsége, reprodukálhatósága
RészletesebbenBakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján
Bakteriális identifikáció 16S rrns gén szekvencia alapján MOHR ANITA SIPOS RITA, SZÁNTÓ-EGÉSZ RÉKA, MICSINAI ADRIENN 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi Albert út 4. info@biomi.hu, www.biomi.hu TÖRZS AZONOSÍTÁS
RészletesebbenDr. Máthéné Dr. Szigeti Zsuzsanna és munkatársai
Kar: TTK Tantárgy: CITOGENETIKA Kód: AOMBCGE3 ECTS Kredit: 3 A tantárgyat oktató intézet: TTK Mikrobiális Biotechnológiai és Sejtbiológiai Tanszék A tantárgy felvételére ajánlott félév: 3. Melyik félévben
RészletesebbenA genomikai oktatás helyzete a Debreceni Egyetemen
A genomikai oktatás helyzete a Debreceni Egyetemen Bálint Bálint L. GNTP Oktatás és Tudásmenedzsment Munkabizottság, 2009. június 10. Tények Debreceni Egyetemről 21000 nappali és 33000 összes hallgató
RészletesebbenIn Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van.
In Situ Hibridizáció a pathologiai diagnosztikában és ami mögötte van. Kneif Józsefné PTE KK Pathologiai Intézet Budapest 2017. 05. 26 Kromoszóma rendellenesség kimutatás PCR technika: izolált nukleinsavak
RészletesebbenSemmelweis Egyetem / Élettani Intézet / Budapest. Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban. Szekvenciaelemzés. Cserző Miklós 2017
Bioinformatika és genomanalízis az orvostudományban Szekvenciaelemzés Cserző Miklós 2017 A mai előadás Szekvencia analízis statisztikus szempontból Annotálás homológia alapján Az annotálás szempontjai
RészletesebbenBiotechnológiai gyógyszergyártás
Biotechnológiai gyógyszergyártás Dr. Greiner István 2013. november 6. Biotechnológiai gyógyszergyártás Biotechnológiai gyógyszerek Előállításuk és analitikájuk Richter és a biotechnológia Debrecen A jövő
RészletesebbenFehérjék rövid bevezetés
Receptorfehérj rjék szerkezetének felderítése Homológia modellezés Fehérjék rövid bevezetés makromolekulák számos biológiai funkció hordozói: enzimatikus katalízis, molekula transzport, immunválaszok,
RészletesebbenMapping Sequencing Reads to a Reference Genome
Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome High Throughput Sequencing RN Example applications: Sequencing a genome (DN) Sequencing a transcriptome and gene expression studies (RN) ChIP (chromatin immunoprecipitation)
RészletesebbenImmunológia alapjai. 10. előadás. Komplement rendszer
Immunológia alapjai 10. előadás Komplement rendszer A gyulladás molekuláris mediátorai: Miért fontos a komplement rendszer? A veleszületett (nem-specifikus) immunválasz része Azonnali válaszreakció A veleszületett
RészletesebbenAZ ÉLET KÉMIÁJA... ÉLŐ ANYAG SZERVEZETI ALAPEGYSÉGE
AZ ÉLET KÉMIÁJA... ÉLŐ ANYAG SZERVEZETI ALAPEGYSÉGE A biológia az élet tanulmányozásával foglalkozik, az élő szervezetekre viszont vonatkoznak a fizika és kémia törvényei MI ÉPÍTI FEL AZ ÉLŐ ANYAGOT? HOGYAN
RészletesebbenA tömegspektrometria kvalitatív és kvantitatív proteomikai alkalmazása. Szájli Emília
A tömegspektrometria kvalitatív és kvantitatív proteomikai alkalmazása Ph.D. értekezés tézisei Szájli Emília Témavezető: Dr. Medzihradszky-Fölkl Katalin Kémia Doktori Iskola Szegedi Tudományegyetem Magyar
RészletesebbenREKOMBINÁNS FEHÉRJÉK IPARI MÉRETŰ ELŐÁLLÍTÁSA I.
Az élettudományi-klinikai felsőoktatás gyakorlatorientált és hallgatóbarát korszerűsítése a vidéki képzőhelyek nemzetközi versenyképességének erősítésére TÁMOP-4.1.1.C-13/1/KONV-2014-0001 REKOMBINÁNS FEHÉRJÉK
RészletesebbenTipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során
Tipizálási módszerek alkalmazása methicillin-rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek molekuláris epidemiológiai vizsgálatai során Ungvári Erika, Tóth Ákos Magyar Infektológiai és Klinikai Mikrobiológiai
RészletesebbenPROTEOMIKAI MÓDSZEREK ALKALMAZÁSA KÜLÖNBÖZŐ EREDETŰ FEHÉRJÉK VIZSGÁLATÁRA
BUDAPESTI CORVINUS EGYETEM DOKTORI ÉRTEKEZÉS PROTEOMIKAI MÓDSZEREK ALKALMAZÁSA KÜLÖNBÖZŐ EREDETŰ FEHÉRJÉK VIZSGÁLATÁRA HORVÁTHNÉ SZANICS ENIKŐ Központi Élelmiszer-tudományi Kutatóintézet Táplálkozástudományi
RészletesebbenA PET szerepe a gyógyszerfejlesztésben. Berecz Roland DE KK Pszichiátriai Tanszék
A PET szerepe a gyógyszerfejlesztésben Berecz Roland DE KK Pszichiátriai Tanszék Gyógyszerfejlesztés Felfedezés gyógyszertár : 10-15 év Kb. 1 millárd USD/gyógyszer (beleszámolva a sikertelen fejlesztéseket)
RészletesebbenA preventív vakcináció lényege :
Vakcináció Célja: antigénspecifkus immunválasz kiváltása a szervezetben A vakcina egy olyan készítmény, amely fokozza az immunitást egy adott betegséggel szemben (aktiválja az immunrendszert). A preventív
RészletesebbenFehérje O-glikoziláció tömegspektrometriás vizsgálata. Darula Zsuzsanna MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont Proteomikai Laboratórium
Fehérje O-glikoiláció tömegspektrometriás visgálata Darula Zsusanna MTA Segedi Biológiai Kutatóköpont Proteomikai Laboratórium Fehérjeanalitika 6-as évektől: 9-es évektől: Edman sekvenálás Tömegspektrometria
Részletesebben2. Ismert térszerkezetű transzmembrán fehérjék adatbázisa: a PDBTM adatbázis. 3. A transzmembrán fehérje topológiai adatbázis, a TOPDB szerver
A 2005 és 2007 között megvalósított project célja transzmembrán fehérjék vizsgálata és az ehhez szükséges eljárások kifejlesztése volt. Ez utóbbi magába foglalta új adatbázisok és szerkezet becslő módszerek
RészletesebbenGenomika. Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel. DNS szekvenálási eljárások. DNS ujjlenyomat (VNTR)
Genomika (A genom, génállomány vizsgálata) Mutációk (SNP-k) és vizsgálatuk egyszerű módszerekkel DNS szekvenálási eljárások DNS ujjlenyomat (VNTR) DNS chipek statikus és dinamikus információk vizsgálata
RészletesebbenBioinformatika 2 9. előadás
9. előadás Prof. Poppe László BME Szerves Kémia és Technológia Tsz. Bioinformatika proteomika Előadás és gyakorlat 2017.11.06. Térszerkezet előrejelzés fő módszerei Homológia modellezés (komparatív modellezés):
RészletesebbenImmunológia alapjai előadás MHC. szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.
Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás. Antigén felismerés Az ellenanyagok és a B sejt receptorok natív formában
RészletesebbenKERINGŐ EXTRACELLULÁRIS VEZIKULÁK ÁLTAL INDUKÁLT GÉNEXPRESSZIÓS MINTÁZAT VIZSGÁLATA TROPHOBLAST SEJTVONALBAN
2016. 10. 14. KERINGŐ EXTRACELLULÁRIS VEZIKULÁK ÁLTAL INDUKÁLT GÉNEXPRESSZIÓS MINTÁZAT VIZSGÁLATA TROPHOBLAST SEJTVONALBAN Kovács Árpád Ferenc 1, Pap Erna 1, Fekete Nóra 1, Rigó János 2, Buzás Edit 1,
RészletesebbenKorszerű tömegspektrometria a. Szabó Pál MTA Kémiai Kutatóközpont
Korszerű tömegspektrometria a biokémi miában Szabó Pál MTA Kémiai Kutatóközpont Tematika Bevezetés: ionizációs technikák és analizátorok összehasonlítása a biomolekulák szemszögéből Mikromennyiségek mintaelőkészítése
RészletesebbenHUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) ÉS AIDS
HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) ÉS AIDS Dr. Mohamed Mahdi MD. MPH. Department of Infectology and Pediatric Immunology University of Debrecen 2010 Történelmi tények a HIV-ről 1981: Első megjelenés San
RészletesebbenMolekuláris biológiai adatbázisok és adatbázis keresések. Barta Endre Tóth Gábor MBK Bioinformatikai Csoport
Molekuláris biológiai adatbázisok és adatbázis keresések Barta Endre Tóth Gábor MBK Bioinformatikai Csoport Adatbázisok: megvalósítás Szöveges adatbázis általában szekvenciális, néha indexelt megfelelő
Részletesebben10. Genomika 2. Microarrayek és típusaik
10. Genomika 2. 1. Microarray technikák és bioinformatikai vonatkozásaik Microarrayek és típusaik Korrelált génexpresszió mint a funkcionális genomika eszköze 2. Kombinált megközelítés a funkcionális genomikában
Részletesebbentranszporter fehérjék /ioncsatornák
Sejtpenetráló peptidek biológiailag aktív vegyületek sejtbejuttatásában Bánóczi Zoltán MTA - ELTE Peptidkémiai kutatócsoport megalakulásának 50. évfordulója 2011.12.09 Sejtpenetráló peptidek rövid, pozitívan
RészletesebbenTranszláció. Szintetikus folyamatok Energiájának 90%-a
Transzláció Transzláció Fehérje bioszintézis a genetikai információ kifejeződése Szükséges: mrns: trns: ~40 Riboszóma: 4 rrns + ~ 70 protein 20 Aminosav aktiváló enzim ~12 egyéb enzim Szintetikus folyamatok
RészletesebbenProteomika az élelmiszer-előállításában
DEBRECENI EGYETEM Proteomika az élelmiszer-előállításában Czeglédi Levente Gulyás Gabriella Csősz Éva 2014., korrig 2015. TÁMOP-4.1.1.C-12/1/KONV-2012-0014 Élelmiszerbiztonság és gasztronómia vonatkozású
RészletesebbenMolekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén
Molekuláris biológiai eljárások alkalmazása a GMO analitikában és az élelmiszerbiztonság területén Dr. Dallmann Klára A molekuláris biológia célja az élőlények és sejtek működésének molekuláris szintű
RészletesebbenAz áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben. Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga
Az áramlási citometria gyakorlati alkalmazása az ondó rutin analízisben Hajnal Ágnes, Dr Mikus Endre, Dr Venekeiné Losonczi Olga Labmagister Kft aktivitásai HumanCell SynLab Diagnosztika MensMentis LabMagister
RészletesebbenImmunológia alapjai. Az immunválasz szupressziója Előadás. A szupresszióban részt vevő sejtes és molekuláris elemek
Immunológia alapjai 19 20. Előadás Az immunválasz szupressziója A szupresszióban részt vevő sejtes és molekuláris elemek Mi a szupresszió? Általános biológiai szabályzó funkció. Az immunszupresszió az
RészletesebbenTömegspektrometria. Mintaelőkészítés, Kapcsolt technikák OKLA 2017
Tömegspektrometria Mintaelőkészítés, Kapcsolt technikák OKLA 2017 Mintabeviteli rendszer Működési elv Vákuumrendszer Ionforrás Tömeganalizátor Detektor Electron impact (EI) Chemical ionization (CI) Atmospheric
RészletesebbenAz orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító szám: TÁMOP-4.1.2-08/1/A-2009-0011 Az orvosi
RészletesebbenBIOINFORMATIKA Ungvári Ildikó
1 BIOINFORMATIKA Ungvári Ildikó Az elmúlt évtizedekben a molekuláris biológiai, genomikai technológiák robbanásszerű fejlődése a biológiai adatok mennyiségének exponenciális növekedéséhez vezetett. Ebben
RészletesebbenNMR a peptid- és fehérje-kutatásban
NMR a peptid- és fehérje-kutatásban A PDB adatbázisban megtalálható NMR alapú fehérjeszerkezetek számának alakulása az elmúlt évek során 4000 3500 3000 2500 2000 1500 1000 500 0 1987 1988 1989 1990 1991
Részletesebbenhttp://www.rimm.dote.hu Tumor immunológia
http://www.rimm.dote.hu Tumor immunológia A tumorok és az immunrendszer kapcsolatai Tumorspecifikus és tumorasszociált antigének A tumor sejteket ölő sejtek és mechanizmusok Az immunológiai felügyelet
RészletesebbenNorvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL
Norvég Finanszírozási Mechanizmus által támogatott projekt HU-0115/NA/2008-3/ÖP-9 ÚJ TERÁPIÁS CÉLPONTOK AZONOSÍTÁSA GENOMIKAI MÓDSZEREKKEL KÖZÖS STRATÉGIA KIFEJLESZTÉSE MOLEKULÁRIS MÓDSZEREK ALKALMAZÁSÁVAL
RészletesebbenImmunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői.
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői. Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B- sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
RészletesebbenPh.D. értekezés tézisei. Dürgő Hajnalka. Témavezető: Dr. Medzihradszky-Fölkl Katalin. Biológia Doktori Iskola. MTA SZBK Biokémiai Intézet SZTE TTIK
Gümő-specifikus NCR peptidek azonosítása, vad és mutáns Medicago truncatula gyökérgümők összehasonlító fehérjeanalízise, és az NCR247 lehetséges bakteriális interakciós partnereinek felderítése Ph.D. értekezés
Részletesebben5/11/2015 TÖMEGSPEKTROMETRIA. Tömegspektrometria - áttekintés. Ionizáció és analizátor. Tömegspektrométer. Analizátor: KVADRUPOL
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM ÁLTALÁNOS ORVOSTUDOMÁNYI KAR www.aok.pte.hu TÖMEGSPEKTROMETRIA Tömegspektrometria - áttekintés VIZSGÁLHATÓ MINTA: töltéssel rendelkezik (folyékony biológiai minták, fehérjék, peptidek,
Részletesebben1b. Fehérje transzport
1b. Fehérje transzport Fehérje transzport CITOSZÓL Nem-szekretoros útvonal sejtmag mitokondrium plasztid peroxiszóma endoplazmás retikulum Szekretoros útvonal lizoszóma endoszóma Golgi sejtfelszín szekretoros
RészletesebbenGerinces és növényi ortológ promóter adatbázisok fejlesztése és elemzése. Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola
Doktori értekezés tézisei Gerinces és növényi ortológ promóter adatbázisok fejlesztése és elemzése Sebestyén Endre Eötvös Loránd Tudományegyetem Természettudományi Kar Biológia Doktori Iskola Vezetője:
RészletesebbenImmunológia alapjai. 16. előadás. Komplement rendszer
Immunológia alapjai 16. előadás Komplement rendszer A gyulladás molekuláris mediátorai: Plazma enzim mediátorok: - Kinin rendszer - Véralvadási rendszer Lipid mediátorok Kemoattraktánsok: - Chemokinek:
RészletesebbenORVOSI KÉMIA GYAKORLATOK 2014/2015, ÁOK, FOK, OLKDA 1.év/1. félév CSOPORT A GYAKORLATI TEREM CSOPORT B GYAKORLATI TEREM
TAN. HÉT 1., 8-14. 2., 15-21. 3., 22-28. ORVOSI KÉMIA GYAKORLATOK 2014/2015, ÁOK, FOK, OLKDA 1.év/1. félév CSOPORT A GYAKORLATI TEREM CSOPORT B GYAKORLATI TEREM Balesetvédelmi és tűzvédelmi oktatás. Alapvető
RészletesebbenImmunológia alapjai előadás. Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői
Immunológia alapjai 3 4. előadás Az immunológiai felismerés molekuláris összetevői Az antigén fogalma. Antitestek, T- és B- sejt receptorok: molekuláris szerkezet, funkciók, alcsoportok Az antigén meghatározása
RészletesebbenPreeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák
Preeclampsia-asszociált extracelluláris vezikulák hatása(i) a monocita sejt működésére Kovács Árpád Ferenc 1, Láng Orsolya 1, Kőhidai László 1, Rigó János 2, Turiák Lilla 3, Fekete Nóra 1, Buzás Edit 1,
RészletesebbenAlgaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben
Algaközösségek ökológiai, morfológiai és genetikai diverzitásának összehasonlítása szentély jellegű és emberi használatnak kitett élőhelykomplexekben Duleba Mónika Környezettudományi Doktori Iskola I.
RészletesebbenImmunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás.
Immunológia alapjai 5-6. előadás MHC szerkezete és genetikája, és az immunológiai felismerésben játszott szerepe. Antigén bemutatás. Az immunrendszer felépítése Veleszületett immunitás (komplement, antibakteriális
RészletesebbenIntézeti Beszámoló. Dr. Kovács Árpád Ferenc
Intézeti Beszámoló Dr. Kovács Árpád Ferenc 2015.12.03 135 millió újszülött 10 millió újszülött Preeclampsia kialakulása kezdetét veszi Preeclampsia tüneteinek megjelenése Preeclampsia okozta koraszülés
Részletesebben~ 1 ~ Ezek alapján a következő célokat valósítottuk meg a Ph.D. munkám során:
~ 1 ~ Bevezetés és célkitűzések A sejtekben egy adott időpillanatban expresszált fehérjék összessége a proteom. A kvantitatív proteomika célja a proteom, egy adott kezelés vagy stimulus hatására bekövetkező
RészletesebbenA Drosophila telomer védelmét szolgáló fehérjék fajképzésben betöltött lehetséges szerepének vizsgálata
A Drosophila telomer védelmét szolgáló fehérjék fajképzésben betöltött lehetséges szerepének vizsgálata Ph. D. értekezés tézisei Vedelek Balázs Témavezetők: Prof. Boros Imre Miklós tanszékvezető egyetemi
RészletesebbenThe nontrivial extraction of implicit, previously unknown, and potentially useful information from data.
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Méréstechnika és Információs rendszerek Tanszék Adatelemzés intelligens módszerekkel Hullám Gábor Adatelemzés hagyományos megközelítésben I. Megválaszolandó
Részletesebbenmintasepcifikus mikrokapilláris elektroforézis Lab-on-Chip elektroforézis / elektrokinetikus elven DNS, RNS, mirns 12, fehérje 10, sejtes minta 6
Agilent 2100 Bioanalyzer mikrokapilláris gélelektroforézis rendszer G2943CA 2100 Bioanalyzer system forgalmazó: Kromat Kft. 1112 Budapest Péterhegyi u. 98. t:36 (1) 248-2110 www.kromat.hu bio@kromat.hu
RészletesebbenFehérjék glikozilációja, a cukorláncok heterogenitása, és ennek tömegspektrometria alapú vizsgálata
Fehérjék glikozilációja, a cukorláncok heterogenitása, és ennek tömegspektrometria alapú vizsgálata Vékey Károly és Drahos László MTA Természettudományi Kutatóközpont Budapest szénhidrátok N-glikoproteinek
RészletesebbenA keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei
A keringı tumor markerek klinikai alkalmazásának aktuális kérdései és irányelvei A TM vizsgálatok alapkérdései A vizsgálatok célja, információértéke? Az alkalmazás területei? Hogyan válasszuk ki az alkalmazott
RészletesebbenA proteomikai módszerek fejlõdési irányai
A proteomikai módszerek fejlõdési irányai Janáky Tamás Orvosi Vegytani Intézet, Szegedi Tudományegyetem 360 Degree CEO Perspective Of The Global Healthcare Industry 2008 Frost & Sullivan. All rights reserved.
Részletesebben11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban
11. Dr. House. Biokémiai és sejtbiológiai módszerek alkalmazása az orvoslásban HIV fertőzés kimutatása - (fiktív) esettanulmány 35 éves nő, HIV fertőzöttség gyanúja. Két partner az elmúlt időszakban. Fertőzött-e
RészletesebbenSciex X500R készülék bemutatása a SWATH alkalmazásai tükrében. Szabó Pál, MTA TTK
Sciex X500R készülék bemutatása a SWATH alkalmazásai tükrében Szabó Pál, MTA TTK Hagyományos QTOF rendszer Aggályok: Termetes Bonyolultnak tűnő Nem rutin feladatokra való Következmény: Nem merjük megvenni
RészletesebbenBiológus MSc. Molekuláris biológiai alapismeretek
Biológus MSc Molekuláris biológiai alapismeretek A nukleotidok építőkövei A nukleotidok szerkezete Nukleotid = N-tartalmú szerves bázis + pentóz + foszfát N-glikozidos kötés 5 1 4 2 3 (Foszfát)észter-kötés
RészletesebbenNÖVÉNYI GENOMIKA JÓRI BALÁZS
NÖVÉNYI GENOMIKA JÓRI BALÁZS Eötvös Loránd Tudományegyetem, Növényélettani és Molekuláris Növénybiológia Tanszék, 1117 Budapest, Pázmány P. sétány 1/c. Elfogadva: 2004. december 29. Bot. Közlem. 91(1 2):
Részletesebben