Genomvizsgálat és rokontenyésztettség. Az USA-ban regisztrált holstein-fríz bikák száma

Méret: px

Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Genomvizsgálat és rokontenyésztettség. Az USA-ban regisztrált holstein-fríz bikák száma"

Kornélia Kelemen
7 évvel ezelőtt
Látták:

1 Genomvizsgálat és rokontenyésztettség A genomvizsgálat 28-as megjelenése után számos mellette és ellene szóló érvet hallhattunk, olvashattunk. A viták bár halkultak, de a mai napig nem szűntek meg teljesen, ugyanakkor a genom eredmények használata egyértelműen a mindennapok gyakorlatává vált. Manapság már nem képzelhető el bika tenyésztésbe állítása a szülők és az egyed genom eredményeinek ismerete nélkül, sőt a tenyészetekben is mindennapos gyakorlattá vált használatuk. Ebben az írásban nem a genetikai hatásukat, hasznosságukat, használatuk veszélyeit akarom elemezni, hanem a vizsgálat elterjedésének hatását a pedigrék sokszínűségére, beszűkülésére néhány adattal megvilágítva a jelenlegi helyzetre. A vizsgálatot a kanadai tenyészérték becslő szervezet (CDN) által ingyenesen hozzáférhető teljes, és az amerikai Holstein Szövetség által közzétett aktív bikák pedigré információi alapján készítettem. A kanadai állomány a teljes Interbull állományt tartalmazza, valamint az Észak-Amerikai kontinensen genomvizsgált valamennyi bika pedigréjét. Az adatállományok értékelését az tette lehetővé, hogy azokat a Kft által használt Optimate programba beolvasva a pedigréket valamennyi elérhető információból felépítettük, elemezhetővé tettük, ami jelenleg több mint 45. bika információját jelenti. Az adatbetöltések során több hibát is találtunk, amit a korrekt pedigrék felépítéséhez javítani kell. Az utolsó adatbetöltésnél több mint 14 bikát találtunk, akik kétszer, néhányan háromszor is szerepelnek az adatállományban eltérő azonosítókkal. Ezen hibák kijavítása után válik lehetővé a pedigrék korrekt analízise. A pedigrék vizsgálatát a holstein-fríz tenyésztésben meghatározó USA-ban regisztrált, az adatállományban szereplő bika adatai alapján végeztem el a 213 augusztusi állapot szerint. Első szempontként a regisztrált bikák számának alakulását vizsgáltam (1. grafikon) 14 Az USA-ban regisztrált holstein-fríz bikák száma grafikon A grafikon adataiból az látszik, hogy 26-ban és előtte nem szerepelt valamennyi USA-ban regisztrált bika a kanadai adatbázisban, valószínű, hogy csak az Interbull értékelésben résztvevő bikák vannak az állományban. A két országban közösen végzett genomvizsgálat változtatott ezen a helyzeten, és 27-től kezdődően az adatokból kitűnően már párhuzamosan folyt a regisztráció, legalábbis a vizsgálatunk számára elsődlegesen fontos genomtesztelt bikák esetében. A grafikon a www. faircowkft.5mp.eu

2 regisztrált bikák ugrásszerű növekedését mutatja, között majdnem 5,5-szeresére nőtt a létszám. A 213 augusztus elején regisztrált bikák száma alapján valószínűsíthető, hogy az idén is eléri, vagy megközelíti a regisztrációk száma a 212 évi rekordot. A regisztrált bikák számának növekedése jelzi, hogy a mesterséges termékenyítő állomások igen széles körben keresték a következő generáció legértékesebb egyedeit, és sokszorosára növelték a szelekció intenzitását. A növekvő egyedszám, azonban nem sokat mond a pedigrék varianciájáról, erről pontosabb képet kapunk, ha az apák vizsgálatát is elvégezzük (2. grafikon) 6 Az USA-ban regisztrált holstein-fríz bikák apáinak száma grafikon A grafikon egyértelműen mutatja, hogy az apák száma is meredeken emelkedett 27 és 212 között, ami a genetikai variancia növekedését valószínűsíti. Ez a kép sem egyértelműen mutatja még a pedigrék valódi változatosságát, hiszen nagyon sok bika szerepelhet a kimutatásban csupán 1-2 utóddal, míg a legnépszerűbb bikáknak több száz utóda is lehet. Teljesen természetes, hogy a legjobbnak tartott bikákat széleskörűen használják az utódgeneráció előállítására, hatásuk jelentős a következő generációban. Ezt a hatást a 3. grafikon mutatja, ahol a 1 legnépszerűbb bika utódainak a teljes évjárathoz viszonyított arányát láthatjuk. Fair Cow Kft. 2 www. faircowkft.5mp.eu

3 7,% A 1 legnépszerűbb apa utódainak aránya a teljes évjáratban 68,2% 68,3% 65,% 6,% 55,% 62,4% 59,9% 57,7% 54,9% 53,9% 53,4% 52,9% 51,1% 5,% 45,% 4,% 44,3% 42,4% 39,6% 36,7% 35,% 3. grafikon A grafikon egyértelműen mutatja, hogy a genomvizsgálat ideje alatt a 29-es rekord óta folyamatosan csökken a legnépszerűbb 1 bika hatása az adott évjáratra, tehát több bikának volt érdemleges szerepe apaként a következő generáció előállításában. Ugyanezt a kérdést vizsgálhatjuk olyan módon is, hogy az adott évjárat 5-, 8%-át hány bika utódai adják a legnépszerűbbek közül, ezt mutatja a 4. grafikon: 8 Az éjárat 5, 8%-át adó legnépszerűbb apák száma % % 4. grafikon Fair Cow Kft. 3 www. faircowkft.5mp.eu

4 27-29-ben gyakorlatilag azonos szinten van a meghatározó apák száma, innen indul ugrásszerű növekedésnek a számuk. Valószínű, hogy ez a növekedés a csupán genom vizsgálattal rendelkező apák megjelenésének köszönhető, ezzel valós mértékben növelve a genetikai varianciát. Az eddigi elemzések azt mutatják, hogy a genomvizsgálat széleskörű elterjedése nem okozta a pedigrék beszűkülését, sőt azok varianciája még nőtt is. Nézzük meg évjáratonként a legnépszerűbb apák listáját 27-től napjainkig: 1. táblázat: A legnépszerűbb apák az USA holstein állományában augusztus évjárat Apa I. utód Apa II. utód Apa III. utód 27 REGANCREST-HHF MAC-ET 22 SANDY-VALLEY BOLTON-ET 197 RAMOS EMERALD-ACR-SA T-BAXTER 41 END-ROAD PVF BOLIVER-ET 337 REGANCREST-HHF MAC-ET ENSENADA TABOO PLANET-ET 773 ENGLAND-AMMON MILLION-ET 536 KED OUTSIDE JEEVES-ET CHARLESDALE SUPERSTITION-ET 812 LONG-LANGS OMAN OMAN-ET 543 BADGER-BLUFF FANNY FREDDIE LADYS-MANOR PL SHAMROCK-ET 681 REGANCREST ALTAIOTA-ET 54 DE-SU OBSERVER-ET GENERVATIONS EPIC 847 MOUNTFIELD SSI DCY MOGUL-ET 782 AMIGHETTI NUMERO UNO SEAGULL-BAY SUPERSIRE-ET 455 MOUNTFIELD SSI DCY MOGUL-ET 367 S-S-I DOMAIN LITHIUM-ET 351 A lista kellő sokszínűséget mutat, ugyanakkor azt is, hogy egy-egy apától egyre több utódot törzskönyveznek. Látható az is, hogy egy bika több évben is megjelenik apaként, ami különösen igaz, hogyha nem csupán a három legnépszerűbb apát vizsgáljuk. A vizsgálatot elvégeztem a teljes bikapopuláción is három generációra vizsgálva az apák, nagyapák, dédnagyapák összevont hatását. Ennek az eredménye a 2. táblázatban található: 2. táblázat: A teljes USA-ban regisztrált bikapopuláció pedigré analízise Apa Fiú Unoka Dédunoka Genetikai hatás % 1 PICSTON SHOTTLE-ET ,86 2 O-BEE MANFRED JUSTICE-ET ,79 3 S-W-D VALIANT ,73 4 BRAEDALE GOLDWYN ,66 5 TO-MAR BLACKSTAR-ET ,44 6 WALKWAY CHIEF MARK ,44 7 ENSENADA TABOO PLANET-ET ,4 8 CARLIN-M IVANHOE BELL ,16 9 ROUND OAK RAG APPLE ELEVATION ,3 1 REGANCREST ELTON DURHAM-ET ,98 11 ARLINDA ROTATE ,95 12 RAMOS ,95 13 ROTHROCK TRADITION LEADMAN ,86 14 CHARLESDALE SUPERSTITION-ET ,84 15 MARA-THON BW MARSHALL-ET ,82 16 STARTMORE RUDOLPH ,82 17 END-ROAD PVF BOLIVER-ET ,8 18 LADYS-MANOR PL SHAMROCK-ET ,78 19 SINGING-BROOK N-B MASCOT-ET ,76 2 COMESTAR OUTSIDE ,75 21 LONG-LANGS OMAN OMAN-ET ,72 22 MOUNTFIELD SSI DCY MOGUL-ET 1149,66 23 REGANCREST-HHF MAC-ET ,66 24 WHITTIER-FARMS NED BOY ,66 25 BADGER-BLUFF FANNY FREDDIE ,63 Az örökranglista érdekes képet mutat, keverednek benne a közelmúlt, és a régmúlt apái, helyet adva néhány egészen fiatal bikának is, és talán nem kell nagy bátorság kijelenteni, hogy a közeljövőben Super, Schamrock, Mogul hatása tovább nőhet, illetve újabb bikák is bekerülhetnek a 25 legnagyobb hatású bika közé. Fair Cow Kft. 4 www. faircowkft.5mp.eu

5 Az apai oldal vizsgálata az apák pedigréjének vizsgálatával lesz teljes, mivel ez mutatja meg, hogy a látszólag nagyszámú apa, milyen genetikai varianciát jelent valójában, erről ad képet a 3. táblázat: 3. táblázat: A teljes USA-ban regisztrált bikapopuláció apáinak pedigré analízise Apa Fiú Unoka Déd-unoka Genetikai hatás % 1 O-BEE MANFRED JUSTICE-ET ,21 2 PICSTON SHOTTLE-ET ,9 3 ENSENADA TABOO PLANET-ET ,91 4 ROUND OAK RAG APPLE ELEVATION ,86 5 PAWNEE FARM ARLINDA CHIEF ,63 6 S-W-D VALIANT ,45 7 CARLIN-M IVANHOE BELL ,1 8 MARA-THON BW MARSHALL-ET ,9 9 BRAEDALE GOLDWYN ,78 1 COMESTAR OUTSIDE ,74 11 TO-MAR BLACKSTAR-ET ,74 12 STARTMORE RUDOLPH ,68 13 LONG-LANGS OMAN OMAN-ET ,59 14 WALKWAY CHIEF MARK ,57 15 CHARLESDALE SUPERSTITION-ET 272 1,55 16 MADAWASKA AEROSTAR ,39 17 SWEET-HAVEN TRADITION ,18 18 CAL-CLARK BOARD CHAIRMAN ,9 19 END-ROAD PVF BOLIVER-ET ,7 2 GLENDELL ARLINDA CHIEF ,5 21 BIS-MAY TRADITION CLEITUS , 22 EMPRISE BELL ELTON ,99 23 CAROL PRELUDE MTOTO-ET ,98 24 REGANCREST ELTON DURHAM-ET ,97 25 SANDY-VALLEY BOLTON-ET ,94 Ez a táblázat is visszaigazolja azt, hogy a látszólagos sokszínűség mögött néhány bika domináns hatása rejtőzik. A vizsgálat nem terjed ki az anyák, tehéncsaládok vizsgálatára, ahol szintén találhatnánk hasonló tendenciákat, ennek vizsgálata egy másik tanulmány, cikk feladata lesz. Következtetések: - egyértelműen, jelentősen nőtt a szelekciós nyomás a fiatal generáció kiválasztásában - sokkal több apától származik az új generáció - a több apa hasonló rokonsági körből kerül ki - felértékelődnek a valóban outcross bikák - egyre fontosabb a párosításkor a rokontenyésztés precíz, tudatos kezelése. Szatymaz, 213. december 7. Fair Cow Kft. 5 www. faircowkft.5mp.eu

Hasonló dokumentumok

A világ legnagyobb mesterséges állomásának magyarországi kínálata. 2013. december

Holstein-fríz szaporítóanyag Hollandiából, a Holstein-fríz hazájából! A világ legnagyobb mesterséges állomásának magyarországi kínálata Legmagasabb hasznos éle artam Gazdaságos tejtermelés Kimagasló beltartalom