Kvantitatív immunhisztokémia a patológiában

Méret: px

Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "Kvantitatív immunhisztokémia a patológiában"

Ábel Sipos
7 évvel ezelőtt
Látták:

1 Kvantitatív immunhisztokémia a patológiában Krenács Tibor Semmelweis Egyetem I.sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet, Budapest MPT Kongresszus Siófok, szeptember

2 Kvantitatív Patológia Célzott terápia 3+ HER2 1+ IHC Szubjektívitás?+ FISH?

3 Morfológia struktúrába rendezett expressziós profil Klasszikus patológia: Mintázat pattern felismerés (H&E) Molekuláris morfológia + in situ molekuláris információ + + Immunhisztokémia FISH HER2 CEP17 Emlő cc. HER2 In situ vs in vitro

4 Automatizálás I. In situ diagnosztikus teszt Pre-analitika Rögzítés? módja időtartama szövet előkészítés Target-feltárás hatékonysága eszköze módja Analitika Próba minőség/ affinitás detektálhatóság Automatizálás III. Kontrollok Digitális mikroszkópia A teszt Képanalízis értékelése értelmezése Poszt-analitika Automatizálás II. TESZT(Standard kit-ek) eredménye Inkubációs Körülmények Próba hígítás Standardizálás Minőségbiztosítás

5 Digitális mikroszkópia A teljes metszet dinamikus reprezentációja Folytonos nagyítás-kicsinyítés Mindig fókuszált kép Adatbázis integráció Megosztás az net-en Pontos mérések Pixel: szín - intenzitás - méret Kép szegmentálás A számítógép multifunkcionalitása + Hagyományos mikroszkópia Terület - Sejtszám - Reakció intenzitás Jelleg-felismerés: membrán folytonosság

6 Digitális mikroszkópia QUANT programok HER2 DAB HER2 Membrane Hematoxilin ER Nuclear FISH IVD FDA RGB színkezelés: 1 byte, 8bit

7 Digitális mikroszkópia integrált adatkezelés PatternQuant TumorBoard Emlőrák panel: Összeforgatás ROI kijelölés ROI klónozás Automatizált képanalízis H&E Pr Her2 Her2 Cep17

Allred score: NuclearQuant validálás (Micsik Tamás) Objektum detektálás: -színdekonvolúció -intenzitás topográfia Kalibráció 38 annotáció (195 sejt;

8 Allred score: NuclearQuant validálás (Micsik Tamás) Objektum detektálás: -színdekonvolúció -intenzitás topográfia Kalibráció 38 annotáció (195 sejt; ) A sejtek manuális kijelölése Interaktiv teszt-futásokkal a jó *.misp file definiálása Mérés -186 emlőrák; 3 patológus -3-5 ROI/eset -Korrelációk (kappa)

9 ER Semmelweis Egyetem I.sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet, Budapest NuclearQuant - kalibráció

10 ER Semmelweis Egyetem I.sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet, Budapest NuclearQuant Score 5+2=7

11 NuclearQuant ER Field Score 2+1=3

szignifikáns korreláció: Cohen-féle kappa=0.795, négyzetesen súlyozott kappa=0.

12 NuclearQuant - Validálás ER értékelés összehasonlítása. 0-2 (negatív), ill. 3-8 pozitív esetek szétválasztása Alapvetően jó egyezés: szinte tökéletes egyezés: szignifikáns korreláció: Cohen-féle kappa=0.795, négyzetesen súlyozott kappa=0.981 Spearman-féle rho= Konklúzió: A NuclearQuant modul alkalmas az ER és PgR pozitivitás klinikai igényű meghatározására emlőrákban

13 MembraneQuant validáció Cél: Az automatizált és manuális kiértékelés összevetése Kalibráció: 12 metszeten kalibrálva; 171 core/310 annotáció; 379 sejt/roi ( ) nő, (26-86 év) 207 TMA minta primer IDC, 4 ILC, 61 metastasis, 16 DCIS - Ventana Pathway HER-2/neu (4B5 clone) - 2 Patológus empirikusan core-onként Ugyanez MembránQuant-al TMA 2 mm O Szín dekonvolúció intenzitás topográfia

14 MembraneQuant validáció HER2 Score = 3+

15 MembraneQuant validáció HER2 Score = 2+

16 Variables Pathologist1 vs Pathologist2 MembraneQuant validáció HER2 értékelés összehasonlítása empirikus vs automatizált (0-1 vs 2-3) Cohen s κ Quadratic weighted κ Spearman s rho Pathologist1 vs. Consensus Pathologist2 vs. Consensus MembraneQuant vs. Pathologist1 MembraneQuant vs. Pathologist2 MembraneQuant vs. Consensus Jó korreláció a standard empirikus értékeléssel. Nagy esetszámmal a validálás folyamatban van.

17 HISTQUANT Egy vagy több jel automatizált mennyiségi meghatározása Átlag denzitás: egyedi sejtek, ill. normál vs daganatos sejtcsoportok Cx26 Cx43 Ki67 Ki67 DAPI DAPI Cx43 DAPI Ki67

18 Digitális metszet Diagnosztikai pontosság Tumor fészek Viewing history Perimeter: µm Area: mm 2

19 Diagnosztikus riport - Betegadatok, digitális metszet, mérési adatok - Reprezentatív kép beillesztése a riportba

képanalízis Adatelemzés - riport metszet riport Eset: klinikai

20 Digitális diagnosztikus munkaállomás Eset-menedzser rendszer Teljes digitális metszet Konzultáció, diagnosztika Automatizált képanalízis Adatelemzés - riport metszet riport Eset: klinikai adatok Digitális metszet archivum Makro-fotók (képalkotó) Kórházi adatbázis

21 Kvantitatív Patológia Elérhető, de sok tanulást/validálás igényel Digitális mikroszkópia Adatbázisba integrálható Permanens jelek és mérések Minőségbiztosítás Egységes kórházi adatbázishoz csatlakoztatható (szórás Mo-n) Alapvető követelmény: Pre-Analitika, Analitika standardizálása! Infrastuktúra A digitális képanalízis: fontos eszköz, de a PATOLÓGUS dönt! A digitális mikroszkópia a patológia nagy lehetősége (konzultációk, telepatológia, munkaerő optimalizálás )

22 Köszönet! Micsik Tamás Kiszler Gábor Csizmadia Annamária Parsch Edit

23 TMA microenvironment in FL

Hasonló dokumentumok

Digitalizált immunhisztokémiai reakciók automatikus kiértékelése a Pannoramic TM Platform-mal

Digitalizált immunhisztokémiai reakciók automatikus kiértékelése a Pannoramic TM Platform-mal Micsik Tamás, Kiszler Gábor, Szabó Dániel, Krecsák László, Krenács Tibor, Molnár Béla I számú Patológiai és