KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára

Méret: px
Mutatás kezdődik a ... oldaltól:

Download "KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára"

Átírás

1 KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára témavezető: intézet: cím: HORVÁTH Péter, Ph.D. Biokémiai Intézet téma címe: AKTÍV GÉPI TANULÁSI ÉS REGRESSZIÓS MÓDSZEREK NAGY LÉPTÉKŰ 3D BIOLÓGIAI KÉPI ADATOK FELDOLGOZÁSÁRA ÖSSZEFOGLALÁS A BIOMAG kutatócsoport Ph.D. kutatói állást hirdet gépi tanulás témakörben, egysejtek analízise 2/3D nagy áteresztőképességű mikroszkópos adatokon gépi tanulási módszerek segítségével témakörben. Olyan interaktív gépi tanulási módszerek fejlesztését tervezzük, melyek kevesebb es intelligensebb kérdést tesznek fel az orvos kutatóknak úgy, hogy az adatelemzés pontosságát a legnagyobb mertekben javítsak. Biológiai folyamatok közben a sejtek állandó változáson mennek keresztül, mely nem-diszkrét folyamatokat felügyelt klasszifikációs módszerek nem képesek megfelelően modellezni. Célunk ilyen folyamatok elemzése (aktív) felügyelt regressziós módszerekkel. A fejlesztett módszereket az idegtudományban es tumor biológiai kutatásban fogjuk alkalmazni. Az algoritmusokat be fogjuk integrálni az egysejt kinyerő rendszerünkbe. HÁTTÉR BIOMAG (Biológiai Képfeldolgozó es Gépi Tanulási Csoport) egy újonnan indított kutatócsoport a Szegedi Biológiai Kutatóintézetben (SZBK), illetve egy testvér csoporttal a Finn Molekuláris Medicina Intézetben (FIMM) Helsinkiben. A kutatócsoport kutatási területe gépi tanulási es képfeldolgozó algoritmusok fejlesztése es alkalmazása nagy léptékű biológiai képeken, i) az analízis javítása érdekében, ii) újabb biológiai összefüggések felfedezése, iii) kevesebb es intelligensebb kérdések automatikus generálása. A módszereinket a precíziós gyógyászat különböző területein alkalmazzák, mint például rákkutatás vagy neurodegeneratív betegségek kezelése. A betegségek pontosabb megértése céljából hisszük, hogy mikroszkopikus technikák alkalmazása egysejt vagy sejtalkotó szinten elkerülhetetlen. A közelmúltban bemutattunk egy forradalmian új módszer, mely képek illuminációs problémait javítja (Smith etal. Nature Methods 2015), új képfeldolgozási módszereket (Horvath etal. Pattern Recognintion 2009, Koos etal, KEPAF 2015), gépi tanulási módszereket (Horvath etal JBS 2011, Smith etal. JBS 2014), és magas áteresztőképességű képalkotási alkalmazásokat (Banerjee etal. Science 2014, Balistreri etal. Cell 2014). A BIOMAG csoport az SZBK Szintetikus és Rendszerbiológiai egységének a tagja (www.brc.hu/sysbiol/). Az Egység a Magyar Tudományos Akadémia részeként, kimagasló rendszerbiológiai tudásbázist, inspiráló környezetet, és state-of-the-art analízis

2 facilitásokat biztosit. A kutatócsoport az EUCAI es az SBI2 igazgatóságának tagja, melyek a világ két legnagyobb biológiai képinformatikai társasága. KUTATÁSI IRÁNY Kutatásaink során a mozgató idegsejtek sérülésének különböző kísérletes modelljeit alkalmazzuk a sérülés elsődleges helyének és időbeli/térbeli változásának követésére, illetve a sérülés mértékének kísérletes befolyásolására. Erre a célra a széles körben elterjedt, de igen drága transzgenikus állatmodellek helyett a sérülés akut modelljeit állítjuk be, melyekkel a kísérletek gyorsabban és hatékonyabban végezhetők el. Ezekben a kísérletekben olyan motoneuron populációk összehasonlító vizsgálata, melyek a humán ALS-ben (is) különböző mértékben sérülnek (III., VII., XII. agyidegi magvak, különböző gerincvelői régiók), a krónikus degeneráció folyamataira és neuroprotektív próbálkozásokra is adaptálható eredményekre vezethetnek. Mindezek a kiváltott sérülés helyének, az érintett agyrégión belüli határainak, térbeli (és időbeli) variabilitásának számszerű ismeretét tételezik fel, melyek azonban nem állnak rendelkezésre. Minthogy ezek azok a lényeges paraméterek, melyek egy kísérletes protektív beavatkozás sikerének jellemzéséhez, vagy részletesebb mikro-anatómiai vizsgálatok elvégzéséhez a mintavételi régiók helyének meghatározásához szükségesek, vizsgálatainkat ezek megszerzésére irányítjuk. CÉLKITŰZÉS Az ideális jelölt az alkalmazott gépi tanulási munkacsoport tagja lesz. A projekt keretében új gépi tanulási módszereket fejleszt majd, melyekkel sejtek viselkedését es működését szeretnénk jobban megérteni 2 es 3D képeken. A fő kutatási terület aktív és semi-supervised tanulás kombinációja lesz. Az ideális jelölt: MSc diplomával rendelkezik informatika, matematika, fizika, biomérnöki vagy hasonló tudományterületen. Gépi tanulás ismeret plusz Kezdeményező csapatjátékos, aki képes önállóan is dolgozni Anyanyelvi szinten kommunikál angolul (szóban és írásban) Érdeklődés biológiai kutatás iránt plusz Magas szintű programozási ismeretek Aktív es semi-supervised tanulási módszerek ismerete plusz Erős matematikai es statisztikai háttér plusz MatLab, Python, R, C++ ismerete plusz Fontosnak tartjuk, hogy a jövő nemzedék kutatóit keressük, akik meg akarjak változtatni a világot es a tudományos fokozat megszerzését nem csupán egy munkának, hanem küldetésnek érzik. ALKALMAZANDÓ / ELSAJÁTÍTANDÓ MÓDSZEREK Az ideális jelölt professzionális szinten sajátítja el a gépi tanulási módszereket. Haladó szinten kezeli a csoport mikroszkópjait, ezen felül betekintést nyer a modern bioinformatikai es képfeldolgozó módszerekbe. JAVASOLT IRODALOM Javasoljuk gépi tanulási és képfeldolgozási kézikönyvek tanulmányozását, ezen felül érdemes high-content screening könyvek elolvasása. Javasoljuk a BIOMAG csoport publikációinak elolvasását. a program a TÁMOP C -13/1/KONV projekt támogatásával készült

3 A FOGADÓ LABORATÓRIUM RÖVID BEMUTATÁSA Jelentősebb publikációk Smith K, et al.: CIDRE: A general illumination correction method for optical microscopy. Nature Methods, (2015) Banerjee I, et al.: Influenza A virus uses the aggresome processing machinery for host cell entry. Science, 346: (2014) Balistreri G, et al.: UPF1 and components of nonsense-mediated mrna decay restrict replication of mammalian RNA viruses. Cell Host and Microbe, 16: (2014) Smith K, et al.: Active Learning Strategies for Phenotypic Profiling of High-Content Screens. Journal of Biomolecular Screening, 19: (2014) Indranil B, et al.: High-content analysis of sequential events during the early phase of influenza A virus infection. PLoS One, 8:e68450(2013) Reprezentatív kutatási pályázatok NAP-B brain research grant (2014, 4 years, Szeged, BRC HAS) Finland Distinguished Professor award and fellowship (2014, 5 years, University of Helsinki, Finland) Center of Excellence grant of the HAS (2015) A laboratórium néhány közelmúltbeli hallgatója Koos K, Ph.D., 2014-jelenleg; Reconstruction algorithms for label-free microscopy Szucs A, Ph.D., 2014-jelenleg; 3D image segmentation methods using variational framework and GPU computations Szkalisity A, research associate, 2014-jelenleg; Active regression methods for large biological datasets Balind A, research associate, 2014-jelenleg; Correlative Light-light Microscopy Botyanszki B, predoc, 2015-jelenleg; High-content analysis of neurodegenerative cell models a program a TÁMOP C -13/1/KONV projekt támogatásával készült

KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára ROP GTPÁZOK ÁLTAL KÖZVETÍTETT JELÁTVITEL NÖVÉNYEKBEN

KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára ROP GTPÁZOK ÁLTAL KÖZVETÍTETT JELÁTVITEL NÖVÉNYEKBEN KUTATÁSI TÉMAJAVASLAT ITC hallgatónak jelentkezők számára témavezető: MÉNESI Dalma, M.Sc. intézet: Növénybiológiai Intézet e-mail cím: menesi.dalma@brc.mta.hu CV: http://www.szbk.hu/file/cv/plant_menesi_dalma_hu.pdf

Részletesebben

Az utóbbi fél évszázad változásai nyomán a társadalmi-gazdasági

Az utóbbi fél évszázad változásai nyomán a társadalmi-gazdasági A TANULÁS DIMENZIÓI ÉS A TUDÁS SZERVEZŐDÉSE Az utóbbi fél évszázad változásai nyomán a társadalmi-gazdasági fejlődéssel foglalkozó elemzések középpontjába került a tudás, a tanulás és az oktatás. Három

Részletesebben

Áttekintés. Az agy megértése: útban egy új tanulástudomány felé

Áttekintés. Az agy megértése: útban egy új tanulástudomány felé Áttekintés Az agy megértése: útban egy új tanulástudomány felé Overview Understanding the Brain: Towards a New Learning Science Az Áttekintések az OECD kiadványok kivonatos fordításai. Az Online Könyvesboltban

Részletesebben

Új lehetőségek kiváló alapok

Új lehetőségek kiváló alapok Új lehetőségek kiváló alapok Magyar sikertörténetek a 7. keretprogramból NIH Új lehetőségek kiváló alapok Magyar sikertörténetek a 7. keretprogramból 3 Köszöntő 5 FP7 részvételünk számokban 7 Magyar sikerek

Részletesebben

kutatasmodszertan:ii. KOR 2009. 10. 05. 23:27 Page 1 LÁZÁR EDE KUTATÁSMÓDSZERTAN A GYAKORLATBAN AZ SPSS PROGRAM HASZNÁLATÁVAL

kutatasmodszertan:ii. KOR 2009. 10. 05. 23:27 Page 1 LÁZÁR EDE KUTATÁSMÓDSZERTAN A GYAKORLATBAN AZ SPSS PROGRAM HASZNÁLATÁVAL kutatasmodszertan:ii. KOR 2009. 10. 05. 23:27 Page 1 LÁZÁR EDE KUTATÁSMÓDSZERTAN A GYAKORLATBAN AZ SPSS PROGRAM HASZNÁLATÁVAL kutatasmodszertan:ii. KOR 2009. 10. 05. 23:27 Page 2 SAPIENTIA ERDÉLYI MAGYAR

Részletesebben

Kognitív és affektív fejlôdési folyamatok diagnosztikus értékelésének lehetôségei az iskola kezdô szakaszában

Kognitív és affektív fejlôdési folyamatok diagnosztikus értékelésének lehetôségei az iskola kezdô szakaszában Kognitív és affektív fejlôdési folyamatok diagnosztikus értékelésének lehetôségei az iskola kezdô szakaszában Szerkesztette: Csapó Benő és Zsolnai Anikó Kognitív és affektív fejlõdési folyamatok diagnosztikus

Részletesebben

Tartalmi keretek az olvasás diagnosztikus értékeléséhez. Szerkesztette: Csapó Benő és Csépe Valéria

Tartalmi keretek az olvasás diagnosztikus értékeléséhez. Szerkesztette: Csapó Benő és Csépe Valéria Tartalmi keretek az olvasás diagnosztikus értékeléséhez Szerkesztette: Csapó Benő és Csépe Valéria Tartalmi keretek az olvasás diagnosztikus értékeléséhez TARTALMI KERETEK AZ OLVASÁS DIAGNOSZTIKUS ÉRTÉKELÉSÉHEZ

Részletesebben

4.1. A szakcikkek felépítése... 4

4.1. A szakcikkek felépítése... 4 Kutatási eredmények publikálásának módszertana 1. Előszó a fejezethez... 2 2. Első lépés... 2 3. A kutatástól tudományos közlésig... 3 4. Tudományos szakcikk... 4 4.1. A szakcikkek felépítése... 4 5. Egyéb

Részletesebben

A pályaorientáció/karrier-tanácsadás rendszere, helyzete a magyar felsőoktatásban lehetséges partnerek egy nemzeti lifelong guidance hálózatban ***

A pályaorientáció/karrier-tanácsadás rendszere, helyzete a magyar felsőoktatásban lehetséges partnerek egy nemzeti lifelong guidance hálózatban *** A pályaorientáció/karrier-tanácsadás rendszere, helyzete a magyar felsőoktatásban lehetséges partnerek egy nemzeti lifelong guidance hálózatban *** Az ÁFSZ belső és kiszerveződött pályaorientációs szolgáltatói

Részletesebben

X. Magyar Számítógépes Nyelvészeti Konferencia MSZNY 2014. Szerkesztette: Tanács Attila Varga Viktor Vincze Veronika

X. Magyar Számítógépes Nyelvészeti Konferencia MSZNY 2014. Szerkesztette: Tanács Attila Varga Viktor Vincze Veronika X. Magyar Számítógépes Nyelvészeti Konferencia MSZNY 2014 Szerkesztette: Tanács Attila Varga Viktor Vincze Veronika Szeged, 2014. január 16-17. http://rgai.inf.u-szeged.hu/mszny2014 ISBN: 978 963 306 246

Részletesebben

DISZLEXIÁS FIATALOK 21. SZÁZADI LEHETŐSÉGEKKEL 1

DISZLEXIÁS FIATALOK 21. SZÁZADI LEHETŐSÉGEKKEL 1 DISZLEXIÁS FIATALOK 21. SZÁZADI LEHETŐSÉGEKKEL 1 Gyarmathy Éva, gyarmathy.eva@gmail.com Óbudai Egyetem, Trefort Ágoston Mérnökpedagógiai Központ Renate Motschnig, renate.motschnig@univie.ac.at Ján Struhár,

Részletesebben

A kutatásalapú tanulás/tanítás ( inquiry-based learning/teaching, IBL) és a természettudományok tanítása

A kutatásalapú tanulás/tanítás ( inquiry-based learning/teaching, IBL) és a természettudományok tanítása Nagy Lászlóné SZTE, TTIK Biológiai Szakmódszertani Csoport SZTE, BTK Neveléstudományi Intézet Oktatáselméleti Kutatócsoport SZTE-MTA, Képességkutató Csoport A kutatásalapú tanulás/tanítás ( inquiry-based

Részletesebben

A Ki-67 Proliferációs Index Meghatározásának Különböző Vonatkozásai Emlőrákban

A Ki-67 Proliferációs Index Meghatározásának Különböző Vonatkozásai Emlőrákban A Ki-67 Proliferációs Index Meghatározásának Különböző Vonatkozásai Emlőrákban Ph.D. Tézis Témavezető: Prof. Dr. Cserni Gábor D.Sc. Szegedi Tudományegyetem Pathologiai Intézet Szeged 2014 0 AZ ÉRTEKEZÉS

Részletesebben

JAVASLAT A nemzeti oktatási innovációs rendszer fejlesztésének STrATégiáJárA

JAVASLAT A nemzeti oktatási innovációs rendszer fejlesztésének STrATégiáJárA JAVASLAT a nemzeti oktatási innovációs rendszer fejlesztésének stratégiájára A Társadalmi Megújulás Operatív Program 3.1.1 számú, 21. századi közoktatás fejlesztés, koordináció című kiemelt projekt stratégiai

Részletesebben

12 TUDÓS A 21. SZÁZADRÓL

12 TUDÓS A 21. SZÁZADRÓL 12 TUDÓS A 21. SZÁZADRÓL 1 2 3 12 TUDÓS A 21. SZÁZADRÓL TINTA KÖNYVKIADÓ BUDAPEST, 2009 4 A kötet a Miniszterelnöki Hivatal és a Magyar Tudományos Akadémia 2008 2009. évi stratégiai kutatási programja

Részletesebben

A Kreditrendszer Megvalósítása a Magyar Felsőoktatási intézményekben

A Kreditrendszer Megvalósítása a Magyar Felsőoktatási intézményekben A felsœoktatási intézmények regisztrácós eljárásainak a Kreditrendszer bevezetése céljából történœ auditálása 1 A Kreditrendszer Megvalósítása a Magyar Felsőoktatási intézményekben Dr. C. J. Koster & Dr.

Részletesebben

Halász Gábor A pedagógiai rendszerek általános hatás- és beválás vizsgálati rendszere

Halász Gábor A pedagógiai rendszerek általános hatás- és beválás vizsgálati rendszere 1 Halász Gábor A pedagógiai rendszerek általános hatás- és beválás vizsgálati rendszere TARTALOM Bevezetés 1 A hatás és beválás értelmezése 3 Hatás 3 Beválás 4 A hatásvizsgálat és beválás-vizsgálat 5 A

Részletesebben

I. ATK Tudományos Nap

I. ATK Tudományos Nap Magyar Tudományos Akadémia Agrártudományi Kutatóközpont I. ATK Tudományos Nap Felfedezõ Kutatások az Agrártudományi Kutatóközpontban A rendezvény célja: az MTA ATK-ban folyó alapkutatási eredmények bemutatása

Részletesebben

Jó kormányzás a sportban

Jó kormányzás a sportban Jó kormányzás a sportban Magyar Sportmenedzsment Társaság Magyar Sporttudományi Társaság A fizikai aktivitás és a sport magyarországi dimenzióinak feltárása TÁMOP-6.1.2/11/2-2012-0002 kódszámú projekt

Részletesebben

Logisztikai információs rendszerek felépítés és fejlődési tendenciái. Gelei Andrea Kétszeri Dávid

Logisztikai információs rendszerek felépítés és fejlődési tendenciái. Gelei Andrea Kétszeri Dávid Műhelytanulmányok Vállalatgazdaságtan Intézet 1053 Budapest, Veres Pálné u. 36., 1828 Budapest, Pf. 489 (+36 1) 482-5901, fax: 482-5844, www.uni-corvinus.hu/vallgazd Vállalatgazdaságtan Intézet Logisztikai

Részletesebben

Az iskolai teljesítmények alakulása Magyarországon nemzetközi összehasonlításban

Az iskolai teljesítmények alakulása Magyarországon nemzetközi összehasonlításban Az iskolai teljesítmények alakulása Magyarországon nemzetközi összehasonlításban Csapó Benő Fejes József Balázs Kinyó László Tóth Edit Magyarország a kezdetektől, az 1970-es évek óta részt vesz a fontosabb

Részletesebben

HOSSZMETSZETI FELMÉRÉSEK ISKOLAI KONTEXTUSBAN AZ ELSŐ ÁTFOGÓ MAGYAR ISKOLAI LONGITUDINÁLIS KUTATÁSI PROGRAM ELMÉLETI ÉS MÓDSZERTANI KERETEI

HOSSZMETSZETI FELMÉRÉSEK ISKOLAI KONTEXTUSBAN AZ ELSŐ ÁTFOGÓ MAGYAR ISKOLAI LONGITUDINÁLIS KUTATÁSI PROGRAM ELMÉLETI ÉS MÓDSZERTANI KERETEI MAGYAR PEDAGÓGIA 107. évf. 4. szám 321 355. (2007) HOSSZMETSZETI FELMÉRÉSEK ISKOLAI KONTEXTUSBAN AZ ELSŐ ÁTFOGÓ MAGYAR ISKOLAI LONGITUDINÁLIS KUTATÁSI PROGRAM ELMÉLETI ÉS MÓDSZERTANI KERETEI Csapó Benő

Részletesebben

Befektetések kockázatának mérése*

Befektetések kockázatának mérése* Befektetések kockázatának mérése* Bugár Gyöngyi PhD, a Pécsi Tudományegyetem egyetemi docense E-mail: bugar@ktk.pte.hu Uzsoki Máté, a Budapesti Műszaki Egyetem hallgatója E-mail: uzsoki.mate@gmail.com

Részletesebben

Forrai Szilvia. Az Európai Uniós irányelvek hatása a magyar élethosszig tartó tanulás szakpolitikájára Az elmúlt 10 év retorikája 2014.

Forrai Szilvia. Az Európai Uniós irányelvek hatása a magyar élethosszig tartó tanulás szakpolitikájára Az elmúlt 10 év retorikája 2014. 1 Forrai Szilvia Az Európai Uniós irányelvek hatása a magyar élethosszig tartó tanulás szakpolitikájára Az elmúlt 10 év retorikája 2014. 2 TARTALOMJEGYZÉK BEVEZETÉS... 4 I. A LIFELONG LEARNING, MINT SZAKPOLITIKAI

Részletesebben

Józsa Krisztián egyetemi adjunktus, Neveléstudományi Tanszék, BTK, SZTE, Szeged SZTE-MTA Képességkutató Csoport, Szeged

Józsa Krisztián egyetemi adjunktus, Neveléstudományi Tanszék, BTK, SZTE, Szeged SZTE-MTA Képességkutató Csoport, Szeged Iskolakultúra 2004/11 Józsa Krisztián egyetemi adjunktus, Neveléstudományi Tanszék, BTK, SZTE, Szeged SZTE-MTA Képességkutató Csoport, Szeged Az elsõ osztályos tanulók elemi alapkészségeinek fejlettsége

Részletesebben

A HATÁS-MONITOROZÁS NÉHÁNY MÓDSZERELMÉLETI KÉRDÉSE

A HATÁS-MONITOROZÁS NÉHÁNY MÓDSZERELMÉLETI KÉRDÉSE A Magyar Biológiai Társaság XXVII. Vándorgyűlése, 2008. szeptember 25-26. 55 A HATÁS-MONITOROZÁS NÉHÁNY MÓDSZERELMÉLETI KÉRDÉSE HORVÁTH ANDRÁS MTA Ökológiai és Botanikai Kutatóintézete, 2163 Vácrátót,

Részletesebben

A nem-formális és informális tanulás elismerése OECD RNFIL project Country Backgroud Report Hungary TARTALOM

A nem-formális és informális tanulás elismerése OECD RNFIL project Country Backgroud Report Hungary TARTALOM A nem-formális és informális tanulás elismerése OECD RNFIL project Country Backgroud Report Hungary TARTALOM 1. KÖRNYEZETI TÉNYEZŐK...3 1.1. Demográfiai összefüggések...3 1.2. Nemzetköziesedés...8 1.3.

Részletesebben

Az egész életen át tartó tanulás paradigma gyakorlati megvalósulása Magyarországon Szakmapolitikák kontra gyakorlat

Az egész életen át tartó tanulás paradigma gyakorlati megvalósulása Magyarországon Szakmapolitikák kontra gyakorlat Az egész életen át tartó tanulás paradigma gyakorlati megvalósulása Magyarországon Szakmapolitikák kontra gyakorlat Forrai Szilvia Andragógia mester szak I. évfolyam Szegedi Tudományegyetem Juhász Gyula

Részletesebben

Önképzés. 1 Aktuális. 2 Információs sarok... 4 Következı események... 5 Néhány ötlet... 5. A szerkesztı üzenete

Önképzés. 1 Aktuális. 2 Információs sarok... 4 Következı események... 5 Néhány ötlet... 5. A szerkesztı üzenete Mi az önképzés? Erre a fogalomra nincs olyan átfogó definíció, amely minden szakember számára elfogadható. Mégis, hogy tisztábbá tegyük ezzel kapcsolatos gondolatainkat, és félre tegyük az elıítéleteket,

Részletesebben