PIAL1 (At1g08910) ORF sequence
|
|
- Krisztina Vinczené
- 4 évvel ezelőtt
- Látták:
Átírás
1 PIAL1 (At1g08910) ORF sequence ATGGTTATTCCGGCGACTTCTAGGTTTGGGTTTCGTGCTGAATTCAACACCAAGGAGTTTCAAGCTTCCTGCATCTCTCT! CGCTAATGAAATCGATGCGGCTATTGGGAGAAATGAAGTTCCAGGGAATATTCAAGAGCTCGCTTTAATCCTCAATAATG! TGTGCCGACGTAAATGTGATGATTATCAAACCAGGGCGGTGGTAATGGCGCTGATGATCTCAGTCAAGAGTGCTTGTCAG! CTTGGATGGTTCCCGGAGAGAGAGACTCAAGAATTGTTGGCTATCATAGACTTGATGTGGAATGGTTTCAGCTGTCCTGA! AAATGTCACCTCTTGTGTAAATAGTCCCGTCACTCTAATATCGCAGGTCATTGAGAGGTTCTATCCATGTGTGAAGCTGG! GGCATATTCTTGTTTCTTTTGAAGCTAAGCCAGAATCAAAGATGATGATGAAGGACTTCCATATTTCAAAGAAGATGCCA! CATTCTCCCAAACAGAAAGTTGGATTATTTGTTGTTCGGACAGAGGACATAAGCAGATCTAATTGTATTGTACATCCACA! AGGAGTCAGCTTTTTGTTGAATGGAAAGGGCATTGACAAGAGAGTTAACATCTCAATGGAGTCTGGGCCGCAGCTTCCAA! CTAATGTTACTGCCCTGCTAAACCTTGGGGCAAATCTTCTACAAGCAATAGGCTGTTTTGGAGGTAGTTACTTGATTGCT! ATTGCTTTCATGGATGTCATACCACTGCCCAACAAACCGTTACTGAAAGATTATGTTCATCCTGAAGTCGTTGGATCAAA! CTCAGATTGTGACATAATTGAGGGGCCATCGAGGATATCTCTCAGTTGTCCTATCAGCCGAACGCGTATCAAACTTCCTG! TGAAGGGTCATGTCTGTAAACATCTTCAGTGTTTTGATTTCTGGAATTATGTCAACATGAACACAAGACGACATCATGGC! GCTGCCCGCATTATTCTAGAAGAAGTGGGACGTAATGCTGCAGATGTGGTTATCTCTGCTGATGGAACCTGGATGGTTGA! GACGGAAAATGATGAGGACGTGGAACTTGTGCCAGAAACCACTCATGACCATGGAGACCCAAATAGTTTCATCAACTTGG! GGCCTACTGTTAAGAATCCTGCCAGAGATGAGAATGAAATGGAAACATCCACCCAAGTCGAAGAACATAATCCTTGTTTA! TCTGAGATTCAGGGTCCGTCAAATGACACACATAGGCCTGCTTCAGATTATACTATGCTTAACCAGTCTCATACTTCAAC! CAACACACTACCACAGCTGCCACGAACTTTGAATGCCTTTGATGGTCAACAATTCGTGAACTTACCACAAGTAATAAACA! CCCGAGATTCACCAGCAAGCCAAGCCTTACCTATGACATTCTCACCAACCCCATCTCCACAAGATATATTAGCTACTAAT! GCGGCAAACTTTGGCACATCAATGCCGGCTGCTCAGTCTTCTCAGTTTCAAGGCTCACATGTTACGTCCCTTGGAAATTG! TGAAGGAAGAACTTCTGATTTGATGGCGAGATGGAACCACATCTATGGACGTGTTCAAACTCAATTTCCACCTGCACCTC! TTTCGCATCATCATTATTCAATGCAGAATCAGAGCCCGTCCCCTGCACAGCAAAGACCAGTGCCATCTTACATTGCACAT! CCTCAAACTTTTCATGTCAACTACGGAGAGAACGCTGACCAAAGATGGATGCCGTCTTCCATTGCACATCCTCAAACTTT! ACCTGTTAACTACGGAGGAAATACTAACCAAAGACCGATACCATCTTCCATTGCACATCCTCAAACTTTACCTGTCAACT! ACAGGGGGAATACTGACCATAGATCGACGCCATATTCCATTACACATCTCCAAACATTACTTAACTACGGAGGGAACGCC! GATCAAAGACCAATGCCATCTTCCATTACAAATCTCCAAACTTTACCTGCCACGTACGGAGGGTACGCCCACCAAAGACC! AATGTCATCTTCCATTACACATCCCCGAACTTCACCTGTCAACTACGGAGGGACCCCTGACCAAAGACCAATGCCATCTT! CCATTACACATCCCCAAACTTTACCTGTCAGCTACGGAGGGACCACAGACCAAATACTGAATCCTGGTGGTGCAATGGGA! CAGTTCTCATCACGAGAGTTCATGAATTTGACTCCTGCTAACACTGAGAATTGGCGCCCACAAAGCCGGATGCGAGGCAG! CGTAGCACCTGGTACGGGATATGACCATATGATCATTCATCCTACCCGTCCAGTTCATCCACAAGCTCAAACACCTCCTG! CGCCTCTTTCAACATCTTATGATGGAGCAGATGAAATTCAAGCATTTATAGGGCACCCAAGCTATCCCGTTAGTAATAAC! GAAACACAAGCGGGTACCAGTTCGTTGCCAGTGGCAGAGGGTCTTGGGTATTCAGGGTCGTTTTGGTCAATGCCTCCTGA! GACATGGTGA PIAL1 (At1g08910) protein sequence MVIPATSRFGFRAEFNTKEFQASCISLANEIDAAIGRNEVPGNIQELALILNNVCRRKCDDYQTRAVVMALMISVKSACQ! LGWFPERETQELLAIIDLMWNGFSCPENVTSCVNSPVTLISQVIERFYPCVKLGHILVSFEAKPESKMMMKDFHISKKMP! HSPKQKVGLFVVRTEDISRSNCIVHPQGVSFLLNGKGIDKRVNISMESGPQLPTNVTALLNLGANLLQAIGCFGGSYLIA! IAFMDVIPLPNKPLLKDYVHPEVVGSNSDCDIIEGPSRISLSCPISRTRIKLPVKGHVCKHLQCFDFWNYVNMNTRRHHG! AARIILEEVGRNAADVVISADGTWMVETENDEDVELVPETTHDHGDPNSFINLGPTVKNPARDENEMETSTQVEEHNPCL! SEIQGPSNDTHRPASDYTMLNQSHTSTNTLPQLPRTLNAFDGQQFVNLPQVINTRDSPASQALPMTFSPTPSPQDILATN! AANFGTSMPAAQSSQFQGSHVTSLGNCEGRTSDLMARWNHIYGRVQTQFPPAPLSHHHYSMQNQSPSPAQQRPVPSYIAH! PQTFHVNYGENADQRWMPSSIAHPQTLPVNYGGNTNQRPIPSSIAHPQTLPVNYRGNTDHRSTPYSITHLQTLLNYGGNA! DQRPMPSSITNLQTLPATYGGYAHQRPMSSSITHPRTSPVNYGGTPDQRPMPSSITHPQTLPVSYGGTTDQILNPGGAMG! QFSSREFMNLTPANTENWRPQSRMRGSVAPGTGYDHMIIHPTRPVHPQAQTPPAPLSTSYDGADEIQAFIGHPSYPVSNN! ETQAGTSSLPVAEGLGYSGSFWSMPPETW*! Supplemental Figure 1. Open reading frame and protein sequence of PIAL1 as determined by sequencing of cdnas. 1
2 PIAL2 (At5g41580) ORF sequence ATGTCTACGGCGGCAGCGGCTCGTCCGGTGGCTGGAACTGGCTTACGGGAGAAGACGGCAGCGTCACTGGTCAATTCCTT! CCGATTAGCGTCGGTGACTCAACGTTTACGTTACCACATTCAAGACGGAGCTAAGGTTGATCCTAAGGAGTTTCAAATCT! GTTGCATCTCTTTCGCTAAAGGCATTGATTTTGCTATAGCGAATAATGATATTCCTAAGAAGGTTGAGGAGTTTCCGTGG! TTACTCAAACAGTTGTGCAGACATGGAACTGATGTGTACACTAAGACGGCGCTTATGGTGCTGATGATCTCTGTTAAGCA! TGCTTGTCATTTGGGATGGTTTTCGGATAGCGAGAGTCAAGAACTTATCGCTCTAGCTGATGAGATAAGGACTTGTTTTG! GGAGTTCTGGAAGCACTAGCCCTGGTATCAAAAGTCCTGGCAGTACATTTTCGCAGATCATGGAGAGGTTCTATCCATTT! GTAAAGCTTGGGCATGTTCTTGTTTCTTTTGAAGTGAAGGCTGGCTATACAATGCTGGCGCATGATTTTTATATCTCAAA! GAATATGCCACATTCACTCCAAGAGAAAATTCGGTTATTTGTTGCCCAGACAGACAACATAGACACGTCTGCCTGTATTT! CAAATCCTCCAGAAGTCAGCTTCTTGCTAAATGGAAAGGGGGTTGAGAAGAGAGTCAATATCGCAATGGATACAGGGCCT! CAACTCCCTACAAATGTTACTGCACAGCTGAAATATGGAACTAATCTTCTCCAAGTGATGGGGAATTTTAAAGGAAATTA! CATCATCATAATTGCTTTTACGGGACTGGTAGTGCCACCTGAAAAACCGGTTCTTAAAGATTACCTTCAGTCCGGAGTCA! TTGAAGCAAGTCCAGATTCAGACATCATTGAGGGGCCATCACGAGTATCTCTCAGTTGCCCTATAAGTCGCAAGCGGATC! AAGCTACCAGTCAAGGGCCAGTTATGTAAACATCTTCAGTGTTTTGATTTCTCAAACTACGTTCACATAAATATGAGGAA! CCCAACCTGGCGCTGCCCGCATTGCAATCAACCTGTTTGCTACCCTGACATTCGTTTAGATCAAAACATGGCCAAGATAT! TAAAAGATGTGGAACACAATGCTGCTGATGTAATCATCGATGCTGGTGGTACATGGAAGGTTACAAAAAATACTGGCGAG! ACCCCGGAACCTGTGCGTGAGATCATTCATGATCTAGAAGACCCGATGAGCTTATTAAACTCTGGTCCTGTTGTTTTCGA! TCTTACGGGGGATGATGATGCTGAACTGGAAGTTTTTGGTGACAACAAGGTTGAGGACCGGAAGCCCTGTATGTCTGATG! CTCAGGGTCAATCTAATAATAACAACACAAATAAACATCCTTCAAACGATGATTACTCTTCGATATTTGATATCTCTGAT! GTGATCGCACTTGACCCGGAGATTTTATCTGCTTTGGGAAACACTGCGCCACAACCGCATCAAGCTTCGAATACTGGAAC! TGGTCAACAATATTCAAACTTATCCCAAATACCAATGTCCATAGATCCAATGCCGGTACCTGTACCATTCTCGCAGACAC! CATCTCCAAGAGATAGACCAGCAACTACTTCCACTGTCTTCACCATACCGAATCCCTCTCCACAATACTCTCAGGTTCAT! GCTTCACCTGTTACACCCACCGGAACATATCTTGGTAGAACCACTAGTCCGAGATGGAACCAGACTTATCAATCTCAAGC! GCCACCAATGACAACTCCATATACGAGCCGGAAGGTCTCAGTTCCAGTAACGAGCCAGTCGCCAGCGAATGTATCCTCTT! TTGTTCAGTCTCAGCATGTCCCTAGAGTACTCAGCCAGCCTAATAATTATGGCGTCAGAGGTTTAACCAGTAGCCATGCA! AGCACTTCAAGGCAGCACCCAAGTGGTCCCACTGTTCAATCTGTTTCTCGATTAAGTGACCTAGTGGATGTAGACTTGAC! GGTTCCTGATACATCCAACTGGCGCCCGAGGATGCGAGGAAGTCTTGTGCCCGGTTCTCATTCCACTGCTCTTGACCACA! TGATCATCCGACCTAGCCAACAGTCTCAAACTTCCACTAGGCTGAATAGTTCACAGCCGGTTCAGACACCATCGGTTCAA! ACGTCTCAAGCTCAGTCACCTTTTACAACGGCTGCCTATAGAACCGAGACAGTTTTAGGAAACCGAAACCATCCGGTGCC! CGCTCCTCCTGGCATTGTTAGGCCTACTGGACCGACATCTTGA PIAL2 (At5g41580) protein sequence MSTAAAARPVAGTGLREKTAASLVNSFRLASVTQRLRYHIQDGAKVDPKEFQICCISFAKGIDFAIANNDIPKKVEEFPW! LLKQLCRHGTDVYTKTALMVLMISVKHACHLGWFSDSESQELIALADEIRTCFGSSGSTSPGIKSPGSTFSQIMERFYPF! VKLGHVLVSFEVKAGYTMLAHDFYISKNMPHSLQEKIRLFVAQTDNIDTSACISNPPEVSFLLNGKGVEKRVNIAMDTGP! QLPTNVTAQLKYGTNLLQVMGNFKGNYIIIIAFTGLVVPPEKPVLKDYLQSGVIEASPDSDIIEGPSRVSLSCPISRKRI! KLPVKGQLCKHLQCFDFSNYVHINMRNPTWRCPHCNQPVCYPDIRLDQNMAKILKDVEHNAADVIIDAGGTWKVTKNTGE! TPEPVREIIHDLEDPMSLLNSGPVVFDLTGDDDAELEVFGDNKVEDRKPCMSDAQGQSNNNNTNKHPSNDDYSSIFDISD! VIALDPEILSALGNTAPQPHQASNTGTGQQYSNLSQIPMSIDPMPVPVPFSQTPSPRDRPATTSTVFTIPNPSPQYSQVH! ASPVTPTGTYLGRTTSPRWNQTYQSQAPPMTTPYTSRKVSVPVTSQSPANVSSFVQSQHVPRVLSQPNNYGVRGLTSSHA! STSRQHPSGPTVQSVSRLSDLVDVDLTVPDTSNWRPRMRGSLVPGSHSTALDHMIIRPSQQSQTSTRLNSSQPVQTPSVQ! TSQAQSPFTTAAYRTETVLGNRNHPVPAPPGIVRPTGPTS*! Supplemental Figure 2. Open reading frame and protein sequence of PIAL2 as determined by sequencing of cdnas. 2
3 A Supplemental Fig. 3 3
4 B C Supplemental Figure 3. Alignment and structure of SP-RING proteins. A, Alignment of SUMO ligase protein sequences. Arabidopsis proteins PIAL1, PIAL2 and SIZ1 were aligned with human SUMO ligase PIAS1 and yeast SUMO ligase SIZ1. All of these proteins contain the SP-RING (zf-miz) domain as region of highest similarity. B, SP-RING (zf-miz) domain structure as modeled for PIAL2. C, Compared to PIAL2, PIAL1 contains an insertion of seven 23 amino acid repeats, which were aligned to emphasize the repeat structure (numbers denote amino acids in PIAL1). Supplemental Fig. 3 (contd.) 4
5 Supplemental Figure 4. Alignment and phylogenetic tree of plant SUMO ligases. Top, the sequence of the SP-RING domain of different plant SUMO ligases was aligned for building a phylogenetic tree. Bottom, phylogenetic tree, equivalent to the one shown in Fig. 1C, but with bootstrap values listed at the branch points. See also text and legend to Fig. 1 for further explanations. Entries were from Novatchkova et al. (2012). 5
6 Supplemental Figure 5. Gene models of PIAL1. Comparison of the intron-exon structure proposed by two repositories, TAIR (purple, and ARTADE (green, omicspace.riken.jp/artade/), with the structure obtained experimentally in this work (red). The cdna is identical to the TAIR model except for position of intron 15, and differs from the ARTADE model in the position of intron 2 and in one exon, which is part of intron 14 in the TAIR model and in the cdna. 6
7 Supplemental Figure 6. Expression of PIAL1 and PIAL2 in different tissues. RNA from the indicated tissues was isolated and used for RT-PCR (three technical replicates). AtUBC9 served as positive control. Transcripts were detected in young rosette leaves, cauline leaves, flowers, and stems. Expression was low in siliques and old leaves. Thus, the genes are apparently broadly expressed, but mostly at low levels. 7
8 WT pial1 pial2 pial1 pial2 pial1 pial2 pial1 pial1 pial2 pial2 pial1 pial2 Supplemental Figure 7. Growth habit of SUMO ligase mutants. pial1, pial2 or double mutants grow like WT under standard greenhouse conditions. In contrast, combination of PIAL mutations with SIZ1 loss of function leads to progressively decreased growth compared to. Plants were ca. 6 weeks old except in the top row, which shows plants aged ca. 4 weeks. 8
9 Growth of seedlings on plates without additives WT pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 Growth of seedlings on plates with 300 mm mannitol WT pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 Supplemental Fig. 8 9
10 Growth of seedlings on plates with 2.5 µm abscisic acid WT pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 Growth of seedlings on plates with 150 mm NaCl WT pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 pial2-1 pial2-2 pial2-2 pial2-1 Supplemental Fig. 8 (contd.) 10
11 fresh weight (mg) Supplemental Figure 8. Seedling growth without additives, or in presence of mannitol, ABA, or NaCl. Seeds of the indicated genotype were germinated on MS plates, and seedling growth was monitored after two weeks. For quantitation of seedling size, see Fig. 2. The diagram combines four diagrams of Fig. 2A in one graph. Supplemental Fig. 8 (contd.) 11
12 Supplemental Figure 9. Protein blots and Coomassie stained gels used to assess global SUMO conjugate levels., extract from plants grown on normal plates; +, extract from plants grown on plates containing 300 mm mannitol. Data with mannitol did in general not differ from data without. Lanes empty in the top images contain marker proteins (visible in the bottom images). A pair of identical gels was run in parallel, one was subsequently stained with Coomassie brilliant blue, the other one used for protein transfer to PVDF membranes and subsequent incubation with primary and secondary antibody. Resultant images were quantified using ImageJ software. Values were first normalized to protein content as determined by Coomassie staining, and then compared to the value of Col-0 WT without stress treatment. Each gel contained Col-0 WT samples to correct for blot-to-blot variation. 12
13 E1 + E2 PIAL2M SIZ1 fr. PIAL2 FL An: SUMO Immunoblot (strep tag) Supplemental Figure 10. PIAL2, but not SIZ1 catalyzes SUMO chain formation. In vitro SUMO chain formation assay using full length PIAL2 (PIAL2 FL), fragment PIAL2M, or a fragment of Arabidopsis SUMO ligase SIZ1 (SIZ1 fr.; all three linked to maltose binding protein) indicates that PIAL2, but not SIZ1 enhances SUMO chain formation. PIAL2M is not influenced by SIZ1 in its activity. 13
14 A EKPVLKDYLQ SGVIEASPDS DIIEGPSRVS LSCPISRKRI KLPVKGQLCK HLQCFDFSNY VHINMRNPTW RCPHCNQPVC YPDIRLDQNM AKILKDVEHN AADVIIDAGG TWKVTKNTGE TPEPVREIIH DLEDPMSLLN SGPVVFDLTG DDDAELEVFG DNKVEDRKPC MSDAQGQSNN NNTNKHPSND DYSSIFDISD VIALDPEILS ALGNTA* B C Supplemental Fig
15 Supplemental Figure 11. In vitro auto-sumoylation of PIAL2. A, Amino acid sequence of the region of PIAL2 contained in the maltose binding protein fusion protein PIAL2M. SP-RING in green, two SUMO1 modified Lys residues in bold. Two potential SUMO interaction motifs (SIMs) are in red. Two Cys residues mutated to inactivate the SP-RING are in bold blue. B, After conversion of two Lys residues to Arg (boldface in panel A), PIAL2M is still modified in vitro by (auto)sumoylation, as shown by Western blot of reaction contents using anti-mbp antibody (lanes 1 and 3, protein before in vitro reaction; lanes 2, 4, after reaction). C, Western blotting of in vitro reaction contents using anti-strep tag antibody to detect SUMO1 chains. SUMO modification of PIAL2M at the indicated Lys residues lowers the (initial) reaction rate of SUMO chain formation. Lanes 5, 8, SUMO1 input; lanes 6, 9, reaction with WT PIAL2M; lanes 7, 10, reaction with Lys to Arg mutant of PIAL2M (both bold Lys residues of panel A changed to Arg). Lanes 5 7, one hour reactions; lanes 8 10, reactions were allowed to proceed for two hours. Supplemental Fig. 11 (contd.) 15
16 Supplemental Figure 12. Auto-sumoylation of PIAL2 M indicates interaction with SUMO1, SUM3, SUM5 and SUM7. Protein blots with anti Maltose binding protein antibody to detect PIAL2M was assayed in vitro using different Arabidopsis SUMO isoforms as indicated. All tested isoforms result in auto-sumoylation. 16
17 A B ligase input Supplemental Figure 13. Dele$on analysis of PIAL2M. (A), Dele$on constructs tested in panel B. Yellow bars indicate intact func$onal elements (long bar, SP- RING; short bar, puta$ve SUMO interac$on mo$f, SIM1; red bar indicates mutated SIM1). (B), Ac$vity of dele$on constructs as determined by an$- SUMO protein blot of in vitro SUMO conjuga$on reac$ons. BoOom insert shows sec$on of a Coomassie- stained gel to document the amount of PIAL2M variant protein added to the reac$on. 17
18 A B Supplemental Fig
19 C Supplemental Figure 14. Kine%cs of in vitro SUMO conjuga%on. Components for in vitro SUMO conjuga%on were mixed as described in Methods. SAE, SCE and SUMO1 were either allowed to react without addi%onal protein (lanes 2, 5, 8, 11, 15, 18, 21, 24), or PIAL2M was added (lanes 4, 7, 10, 13, 17, 20, 23, 26). The VFDL to AAAA mutant PIAL2Msim1 was added to the reac%ons of lanes 3, 6, 9, 12, 16, 19, 22, and 25. Aliquots were withdrawn aver 0.5 hr, 1 hr, 2 hr and 16 hr. Note that at the 16 hr %me point, most of monomeric SUMO (dot to the right) is converted into chains. PIAL1Msim1 is apparently more ac%ve than PIAL2M (lanes 9 vs. 10 and 16 vs. 17). Lanes 1 and 14 show SUMO input. (A), Reac%ons with 0.15 µm PIAL2M / PIAL2Msim1 (B), Reac%ons with 1.5 µm PIAL2M / PIAL2Msim1 (C), Quan%fica%on of panels (A) and (B). 2 hr reac%on without ligase was used as reference (rela%ve value set to 1). Supplemental Fig. 14 (contd.) 19
20 Supplemental Table 1. A Number of seedlings used for wet weight determination. Genotype WT pial1 pial2 pial1 pial2 pial1 pial2 pial1 pial2 Row sum no stress mm NaCl mm mannitol µm ABA Column sum B Dry weight of seedlings as per cent of wet weight Genotype WT pial1 pial2 pial1 pial2 150 mm NaCl 7.5±1% 6.9±0.4% 6.2±0.2% 9.1±0.4% 20
21 Supplemental Table 2. Metabolite concentrations. Metabolites pial2-2 pial2-1 WT asp ± ± ± ± 8.33 glu * ± * ± ± ± asn * ± ± ± ± 6.61 ser * ± * ± * ± ± gln * ± 9.05 * ± 9.51 *88.53 ± ± 3.95 gly * ± * ± *95.28 ± ± hsn ± ± ± ± 0.42 thr ± * ± * ± ± 4.01 his *14.34 ± 0.96 *13.43 ± 0.98 *17.14 ± ± 0.58 ala * ± ± * ± ± arg * ± * ± * ± ± 2.99 tyr *4.20 ± 0.34 *4.04 ± ± ± 0.16 val * ± * ± * ± ± 6.48 met *5.31 ± 0.45 *4.30 ± 0.40 *3.82 ± ± 0.30 trp *54.49 ± 4.98 *56.48 ± ± ± 1.82 phe *22.25 ± ± ± ± 1.33 ile ± ± ± ± 0.56 fructose *1.80 ± 0.22 *1.64 ± ± ± 0.06 glucose *5.78 ± 0.52 *5.59 ± 0.61 *2.06 ± ± 0.38 citric acid *7.50 ± ± ± ± 0.86 sucrose *5.96 ± 1.13 *5.84 ± ± ± 0.20 putrescine 0.82 ± ± ± ± 0.07 spermidine 7.57 ± ± ± ± 0.68 lactate *5.90 ± 0.99 *8.45 ± ± ± 0.83 succinate *4.60 ± ± 0.35 *5.05 ± ± 0.23 glycerate 3.75 ± 0.41 *4.68 ± 1.05 *8.39 ± ± 0.26 fumarate 2.97 ± ± ± ± 0.10 malate 3.00 ± ± 0.70 *7.99 ± ± 0.27 sinapine 6.09 ± 0.61 *7.24 ± 0.72* 3.36 ± ± 0.45 xylose 6.30 ± ± ± ± 0.35 sorbose 6.47 ± 0.79 *8.79 ± 1.76 *8.15 ± ± 1.02 altrose *5.42 ± ± ± ± 0.18 galactose *7.43 ± 1.16 *11.01 ± ± ± 1.08 maltose 0.77 ± ± ± ± 0.12 tagatose 6.87 ± 0.74 *8.64 ± ± ± 0.96 The level of free amino acids in the leaves of wild type and SUMO ligase mutants are given in nmol/g FW. Metabolites determined by GC-MS in extracts of Arabidopsis leaves are given as ratio of the average of the relative amount of the internal standards. The data are presented as the mean ± SE obtained from four independent measurements. *Statistically significant at the 95% level (P < 0.05). 21
22 Supplemental Table 3. Primer sequences used for RNA detection and for qrt-pcr. # Primer Abbrev. Fwd Rev 1 At2g25680 SULTR5;2 AAATGCTGCCATAGGCTTTGTTGC CCCGTAGTTCCGCATCCACAAAAC 2 At1g80310 SULTR5;1 AAGCCGCTCCTCGTGATGTCTAAG AGCTGCCCGCCATTTCGTCATAAG 3 At3g12520 SULTR4;2 ACCACAGTGTGCTTTAGCAGCAAT TCTCTTGTCCACACGCCACAGA 4 At5g13550 SULTR4;1 GAGATCGGTGTCCTTGTTGGTGTT CCCAAGACAGCAATGTGAGGGTT 5 At5g19600 SULTR3;5 CAACGGGGCCATTTTCAAAGACAG AGAAGCACAAGCATCATGCAAACG 6 At3g15990 SULTR3;4 TCTTCAGCTTGTGCTGGTGAATCC TCCACTCAGACCCAATGCCTCAAT 7 At1g23090 SULTR3;3 AATGTCAGCCGTGAGCGGTGTA ACACAAGCTCGATGTCCTTCTTGG 8 At4g02700 SULTR3;2 TCACTACCGGGCCATTTTCACGTT TGCAACCGCCATCACCACGTTT 9 At3g51895 SULTR3;1 TCGTCGTAGCGGTGGCGATATCTA ACCGCAGTTTTTGGCCTCGACA 10 At1g77990 SULTR2;2 CGGTTAGTCATCGCTAGTCCCAGA TCTCGTCCAATTTTGCTCGCTTCA 11 At1g22150 SULTR1;3 GGCGATTACCTTCTCAAGGGCTTC TCCTATCGCTACAGCTTCCGTCAA 12 At5g10180 SULTR2;1 ATTGTTGCTCTAACCGAGGCGATT TGTACCCTTTTATTCCGGCGAACG 13 At1g78000 SULTR1;2 TCACCCTGTGGACGGAAGTC GTTTCATCGGAACATGTCCACC 14 At4g08620 SULTR1;1 TTCTGTCATGCACTCCGTATTCAA TGCCAATTCCACCCATGC 15 At5g43780 ATPS4 AAGATGCGTGGGTTGGCGAA CAACCAGAGGGACACATGAAACCA 16 At4g14680 ATPS3 GGCACTAAGATGAGAGCATTGGCA ATCCACAAGGACTTTCCAGCCTCC 17 At1g19920 ATPS2 TGGTTCTCTCCGAAGTGTGGAGAT TCCTGGAGAAGTAGTTCCCCAAGT 18 At3g22890 ATPS1 TGTTCATCTCCGGCACTAAGATGC TCCACCAGAACTTTCCATCCACCT 19 At4g39940 APSK2 GCTGATTTTCCCGCCCTTTCAGAA GCATATCGAACTCTCGTGCCACAC 20 At2g14750 APSK1 GAGCCACCATTGAACTGCGAGAT ATCCGACGACCTTTTCCGCCAT 21 At3g03900 APSKput1 TATACGCAGGGTCGGAGAAGTAGC GCAGGCGTCACGGTCTTTTCTATA 22 At5g67520 APSKput2 CGGTCCGGTGAAACGAAGCAAAT AGTAACGGGACAATCATGCCAGAC 23 At4g21990 APR3 GGAAGAGATCCTCCGTGAAAGC CTGTAACCTCAGAAGCAACAATGGA 24 At1g62180 APR2 TGATCGAACCCATTTGTCTCAGAG TCAGGAGCAATTAGAGTTGAAGCA 25 At4g04610 APR1 TCATTGGAGCCAAAAGTTTCGCAA TCAGAGACACAGGAGCAACATGAA 26 At1g08090 NRT2-1 TGCCAGATGGAAATCGAGCTACCT CGGCATACCACAGAATCTTTCCGA 27 At2g15620 Nitrite red GAAACCCCGATTTCACCAACTTGC CATGAGTCCCCACCACACACACAT 28 At4g05320 UBQ10 GGCCTTGTATAATCCCTGATGAATAAG AAAGAGATAACAGGAACGGAAACATAGT 29 At5g60390 EF1a TGAGCACGCTCTTCTTGCTTTCA GGTGGTGGCATCCATCTTGTTACA 30 At1g GAPDH5' TCTCGATCTCAATTTCGCAAAA CGAAACCGTTGATTCCGATTC 31 At1g GAPDH3' TTGGTGACAACAGGTCAAGCA AAACTTGTCGCTCAATGCAATC 32 At5g65080 INTRON TTTTTTGCCCCCTTCGAATC ATCTTCCGCCACCACATTGTAC 33 At1g08910 PIAL1 CATTATCTCCCCCGGAAAACTTCT CATCTGCAGCATTACGTCCCACTT 34 At5g41580 PIAL2 GTCCGGTGGCTGGAACTGGCTTAC CCCTTGTTCTAGCCTCTCAAGTTCT 35 At4g27960 UBC9 GTTGCGGAAGACATGTTTCATTGGCAGG CCATGGCATACTTTTGGGTCCAGGTCC Primer sequences of investigated genes with abbreviations (Abbrev.) and ATG numbers. SULTR Sulfate transporter, ATPS ATP sulfurylase, APSK APS-kinase, APR APS-reductase, NRT Nitrate transporter, UBQ Ubiquitin, EF1a elongation factor. 22
23 Supplemental Table 4. Vectors used in this work. pet42c-nafa pet9d- SAE1c2corr pet9d-sce1 pet9d-sce1 K15R pet-tag3-sum1 pet-tag3-sum1 H89K pet-tag3-sum3 pet-tag3-sum5 pet-tag3-sum7 pmal-pial1 pmal-pial1m pmal-pial1s pmal-pial2 pmal-pial2m pmal-pial2m- K2R pmal-pial2msim1 pmal-pial2msim1/sim2 pmal-pial2msim2 pmal-pial2m-spring pmal-pial2m-spring/sim1 pmal-pial2m-spring/sim2 pmal-pial2m-δ1 pmal-pial2m- Δ1-sim1 pmal-pial2m-δ2 pmal-pial2m- Δ2-sim1 pmal-pial2m-δ3 pmal-pial2m- Δ3-sim1 pmal-pial2m-δ4 pmal-pial2s Nucleosome Assembly Factor, a known sumoylation substrate, Flagtagged (Budhiraja et al., 2009). Dicistronic construct for the expression of both subunits of SUMO E1 in E. coli, His-tag on SAE2 (Budhiraja et al., 2009). A construct for the expression of SUMO E2 SCE1, no tags (Budhiraja et al., 2009). A mutant of SCE1 where the sumoylation site, identified by mass spectrometry, was substituted with arginine. The SUMO1 construct predominantly used for in vitro SUMOylation assays, carries a Strep-3xHA-8xHis tag (Budhiraja et al., 2009). SUMO1 used for mass spectrometry analysis, His 89 substituted with Lys to give a QTGG fragment after tryptic digest (Miller et al., 2010). SUMO3, used for in vitro SUMOylation assays, carries a Strep-3xHA- 8xHis tag (Budhiraja et al., 2009). SUMO5, used for in vitro SUMOylation assays, carries a Strep-3xHA- 8xHis tag (Budhiraja et al., 2009). SUMO7, used for in vitro SUMOylation assays, carries a Strep-3xHA- 8xHis tag (Budhiraja et al., 2009). MBP fusion construct for expression of the full-length PIAL1. MBP fusion construct for expression of the N264-P445 fragment of PIAL1 MBP fusion construct for expression of the S290-A353 fragment of PIAL1 MBP fusion construct for expression of the full-length PIAL2 MBP fusion construct for expression of the E281-A496 fragment of PIAL2. A mutant of PIAL2M where the two SUMOylation sites identified by mass spectrometry (K372, K448) were substituted with arginines. A mutant of PIAL2M where the SIM interacting motif 1 (VFDL ) was substituted with alanines. A double mutant of PIAL2M, combining the VFDL AAAA and the IFDI AAAA A mutant of PIAL2M where the SIM interacting motif 2 (IFDI ) was substituted with alanines. A mutant of PIAL2 where two Zn 2+ coordinating cysteines (C329, C355) of the SP-RING were substituted with alanines. A double mutant of PIAL2M, combining the C329A, C355A and VFDL AAAA mutations A double mutant of PIAL2M, combining the C329A, C355A and IFDI AAAA mutations A truncation of PIAL2M,encompassing S307-A496. A truncation of PIAL2M, encompassing S307-A496with VFDL to AAAA replacement. A truncation of PIAL2M, encompassing E281-P466. A truncation of PIAL2M, encompassing E281-P466 with VFDL to AAAA replacement. A truncation of PIAL2M, encompassing E281-K448. A truncation of PIAL2M, encompassing E281-K448with VFDL to AAAA replacement. A truncation of PIAL2M, encompassing E281-D414 MBP fusion construct for expression and Western blot detection of the S307-A388 fragment of PIAL2 23
Flowering time. Col C24 Cvi C24xCol C24xCvi ColxCvi
Flowering time Rosette leaf number 50 45 40 35 30 25 20 15 10 5 0 Col C24 Cvi C24xCol C24xCvi ColxCvi Figure S1. Flowering time in three F 1 hybrids and their parental lines as measured by leaf number
RészletesebbenSupporting Information
Supporting Information Cell-free GFP simulations Cell-free simulations of degfp production were consistent with experimental measurements (Fig. S1). Dual emmission GFP was produced under a P70a promoter
RészletesebbenSupplementary Table 1. Cystometric parameters in sham-operated wild type and Trpv4 -/- rats during saline infusion and
WT sham Trpv4 -/- sham Saline 10µM GSK1016709A P value Saline 10µM GSK1016709A P value Number 10 10 8 8 Intercontractile interval (sec) 143 (102 155) 98.4 (71.4 148) 0.01 96 (92 121) 109 (95 123) 0.3 Voided
RészletesebbenSupplementary materials to: Whole-mount single molecule FISH method for zebrafish embryo
Supplementary materials to: Whole-mount single molecule FISH method for zebrafish embryo Yuma Oka and Thomas N. Sato Supplementary Figure S1. Whole-mount smfish with and without the methanol pretreatment.
RészletesebbenConstruction of a cube given with its centre and a sideline
Transformation of a plane of projection Construction of a cube given with its centre and a sideline Exercise. Given the center O and a sideline e of a cube, where e is a vertical line. Construct the projections
RészletesebbenUniversity of Bristol - Explore Bristol Research
Al-Salihi, S. A. A., Scott, T. A., Bailey, A. M., & Foster, G. D. (2017). Improved vectors for Agrobacterium mediated genetic manipulation of Hypholoma spp. and other homobasidiomycetes. Journal of Microbiological
RészletesebbenModular Optimization of Hemicellulose-utilizing Pathway in. Corynebacterium glutamicum for Consolidated Bioprocessing of
[Supplementary materials] Modular Optimization of Hemicellulose-utilizing Pathway in Corynebacterium glutamicum for Consolidated Bioprocessing of Hemicellulosic Biomass Sung Sun Yim 1, Jae Woong Choi 1,
RészletesebbenNan Wang, Qingming Dong, Jingjing Li, Rohit K. Jangra, Meiyun Fan, Allan R. Brasier, Stanley M. Lemon, Lawrence M. Pfeffer, Kui Li
Supplemental Material IRF3-dependent and NF- B-independent viral induction of the zinc-finger antiviral protein Nan Wang, Qingming Dong, Jingjing Li, Rohit K. Jangra, Meiyun Fan, Allan R. Brasier, Stanley
RészletesebbenSuppl. Materials. Polyhydroxyalkanoate (PHA) Granules Have no Phospholipids. Germany
Suppl. Materials Polyhydroxyalkanoate (PHA) Granules Have no Phospholipids Stephanie Bresan 1, Anna Sznajder 1, Waldemar Hauf 2, Karl Forchhammer 2, Daniel Pfeiffer 3 and Dieter Jendrossek 1 1 Institute
RészletesebbenSupplementary Figure 1
Supplementary Figure 1 Plot of delta-afe of sequence variants detected between resistant and susceptible pool over the genome sequence of the WB42 line of B. vulgaris ssp. maritima. The delta-afe values
RészletesebbenTrinucleotide Repeat Diseases: CRISPR Cas9 PacBio no PCR Sequencing MFMER slide-1
Trinucleotide Repeat Diseases: CRISPR Cas9 PacBio no PCR Sequencing 2015 MFMER slide-1 Fuch s Eye Disease TCF 4 gene Fuchs occurs in about 4% of the US population. Leads to deteriorating vision without
RészletesebbenExpression analysis of PIN genes in root tips and nodules of Lotus japonicus
Article Expression analysis of PIN genes in root tips and nodules of Lotus japonicus Izabela Sańko-Sawczenko 1, Dominika Dmitruk 1, Barbara Łotocka 1, Elżbieta Różańska 1 and Weronika Czarnocka 1, * 1
RészletesebbenSupplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit.
Supplemental Table S1. Overview of MYB transcription factor genes analyzed for expression in red and pink tomato fruit. MYB Primer pairs TC AtMYB Forward Reverse TC199266 MYB12 AGGCTCTTGGAGGTCGTTACC CAACTCTTTCCGCATCTCAATAATC
RészletesebbenSzéchenyi István Egyetem www.sze.hu/~herno
Oldal: 1/6 A feladat során megismerkedünk a C# és a LabVIEW összekapcsolásának egy lehetőségével, pontosabban nagyon egyszerű C#- ban írt kódból fordítunk DLL-t, amit meghívunk LabVIEW-ból. Az eljárás
RészletesebbenMapping Sequencing Reads to a Reference Genome
Mapping Sequencing Reads to a Reference Genome High Throughput Sequencing RN Example applications: Sequencing a genome (DN) Sequencing a transcriptome and gene expression studies (RN) ChIP (chromatin immunoprecipitation)
RészletesebbenT-helper Type 2 driven Inflammation Defines Major Subphenotypes of Asthma
T-helper Type 2 driven Inflammation Defines Major Subphenotypes of Asthma Prescott G. Woodruff, M.D., M.P.H., Barmak Modrek, Ph.D., David F. Choy, B.S., Guiquan Jia, M.D., Alexander R. Abbas, Ph.D., Almut
RészletesebbenSupplemental Information. Investigation of Penicillin Binding Protein. (PBP)-like Peptide Cyclase and Hydrolase
Cell Chemical Biology, Volume upplemental Information Investigation of Penicillin Binding Protein (PBP)-like Peptide Cyclase and ydrolase in urugamide on-ribosomal Peptide Biosynthesis Yongjun Zhou, Xiao
RészletesebbenInvolvement of ER Stress in Dysmyelination of Pelizaeus-Merzbacher Disease with PLP1 Missense Mutations Shown by ipsc-derived Oligodendrocytes
Stem Cell Reports, Volume 2 Supplemental Information Involvement of ER Stress in Dysmyelination of Pelizaeus-Merzbacher Disease with PLP1 Missense Mutations Shown by ipsc-derived Oligodendrocytes Yuko
RészletesebbenSOLiD Technology. library preparation & Sequencing Chemistry (sequencing by ligation!) Imaging and analysis. Application specific sample preparation
SOLiD Technology Application specific sample preparation Application specific data analysis library preparation & emulsion PCR Sequencing Chemistry (sequencing by ligation!) Imaging and analysis SOLiD
RészletesebbenCorrelation & Linear Regression in SPSS
Petra Petrovics Correlation & Linear Regression in SPSS 4 th seminar Types of dependence association between two nominal data mixed between a nominal and a ratio data correlation among ratio data Correlation
RészletesebbenA rosszindulatú daganatos halálozás változása 1975 és 2001 között Magyarországon
A rosszindulatú daganatos halálozás változása és között Eredeti közlemény Gaudi István 1,2, Kásler Miklós 2 1 MTA Számítástechnikai és Automatizálási Kutató Intézete, Budapest 2 Országos Onkológiai Intézet,
RészletesebbenUniversity of Bristol - Explore Bristol Research
Tan, B. G., Wellesley, F. C., Savery, N. J., & Szczelkun, M. D. (2016). Length heterogeneity at conserved sequence block 2 in human mitochondrial DNA acts as a rheostat for RNA polymerase POLRMT activity.
RészletesebbenA cell-based screening system for RNA Polymerase I inhibitors
Electronic Supplementary Material (ESI) for MedChemComm. This journal is The Royal Society of Chemistry 2019 Supporting Information A cell-based screening system for RNA Polymerase I inhibitors Xiao Tan,
RészletesebbenSupporting Information
Supporting Information Plasmid Construction DNA cloning was carried out according to standard protocols. The sequence of all plasmids was confirmed by DNA sequencing and amplified using the E. coli strain
Részletesebbenkpis(ppk20) kpis(ppk46)
Table S1. C. elegans strains used in this study Strains carrying transgenes Strain Transgene Genotype Reference IT213 tcer-1 prom:tcer-1orf:gfp:tcer-1 3'utr unc-119(ed3) III; kpis(ppk6) This study IT283
RészletesebbenThe beet R locus encodes a new cytochrome P450 required for red. betalain production.
The beet R locus encodes a new cytochrome P450 required for red betalain production. Gregory J. Hatlestad, Rasika M. Sunnadeniya, Neda A. Akhavan, Antonio Gonzalez, Irwin L. Goldman, J. Mitchell McGrath,
RészletesebbenPhenotype. Genotype. It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? Remember the Goal. Infectious Disease Paradigm
It is like any other experiment! What is a bioinformatics experiment? You need to know your data/input sources You need to understand your methods and their assumptions You need a plan to get from point
RészletesebbenForensic SNP Genotyping using Nanopore MinION Sequencing
Forensic SNP Genotyping using Nanopore MinION Sequencing AUTHORS Senne Cornelis 1, Yannick Gansemans 1, Lieselot Deleye 1, Dieter Deforce 1,#,Filip Van Nieuwerburgh 1,#,* 1 Laboratory of Pharmaceutical
Részletesebben(A F) H&E staining of the duodenum in the indicated genotypes at E16.5 (A, D), E18.5
Fig. S1. Brg1 ablation leads to abnormal villous structure in the duodenum in the perinatal period (A F) H&E staining of the duodenum in the indicated genotypes at E16.5 (A, D), E18.5 (B, E), and P0.5
Részletesebbeni1400 Image Processing Guide A-61623_zh-tw
i1400 Image Processing Guide A-61623_zh-tw ................................................................. 1.............................................................. 1.........................................................
RészletesebbenFÖLDRAJZ ANGOL NYELVEN
Földrajz angol nyelven középszint 0821 ÉRETTSÉGI VIZSGA 2009. május 14. FÖLDRAJZ ANGOL NYELVEN KÖZÉPSZINTŰ ÍRÁSBELI ÉRETTSÉGI VIZSGA JAVÍTÁSI-ÉRTÉKELÉSI ÚTMUTATÓ OKTATÁSI ÉS KULTURÁLIS MINISZTÉRIUM Paper
RészletesebbenGenome 373: Hidden Markov Models I. Doug Fowler
Genome 373: Hidden Markov Models I Doug Fowler Review From Gene Prediction I transcriptional start site G open reading frame transcriptional termination site promoter 5 untranslated region 3 untranslated
RészletesebbenHorizontal gene transfer drives adaptive colonization of apple trees by the fungal pathogen Valsa mali. Zhiyuan Yin, Baitao Zhu, Hao Feng, Lili Huang*
Supplementary Information Horizontal gene transfer drives adaptive colonization of apple trees by the fungal pathogen Valsa mali Zhiyuan Yin, Baitao Zhu, Hao Feng, Lili Huang* State Key Laboratory of Crop
RészletesebbenOn The Number Of Slim Semimodular Lattices
On The Number Of Slim Semimodular Lattices Gábor Czédli, Tamás Dékány, László Ozsvárt, Nóra Szakács, Balázs Udvari Bolyai Institute, University of Szeged Conference on Universal Algebra and Lattice Theory
RészletesebbenSupporting Information
Supporting Information Paired design of dcas9 as a systematic platform for the detection of featured nucleic acid sequences in pathogenic strains Yihao Zhang 1,2,8, Long Qian 4,8, Weijia Wei 1,3,7,8, Yu
RészletesebbenMELLÉKLET / ANNEX. EU MEGFELELŐSÉGI NYILATKOZAT-hoz for EU DECLARATION OF CONFORMITY
TRACON BUDAPEST KFT. TRACON BUDAPEST LTD. 2120 DUNAKESZI, PALLAG U. 23. TEL.: (27) 540-000, FAX: (27) 540-005 WWW.TRACON.HU EU MEGFELELŐSÉGI NYILATKOZAT, a 79/1997. (XII. 31.) IKIM számú és a 374/2012.
RészletesebbenSUPPLEMENTAL DATA. Structure and specificity of the Type VI secretion system ClpV-TssC interaction in enteroaggregative Escherichia coli.
SUPPLEMENTAL DATA Structure and specificity of the Type VI secretion system ClpV-TssC interaction in enteroaggregative Escherichia coli. B. Douzi, Y.R. Brunet, S. Spinelli, V. Lensi, P. Legrand, S. Blangy,
RészletesebbenA BÜKKI KARSZTVÍZSZINT ÉSZLELŐ RENDSZER KERETÉBEN GYŰJTÖTT HIDROMETEOROLÓGIAI ADATOK ELEMZÉSE
KARSZTFEJLŐDÉS XIX. Szombathely, 2014. pp. 137-146. A BÜKKI KARSZTVÍZSZINT ÉSZLELŐ RENDSZER KERETÉBEN GYŰJTÖTT HIDROMETEOROLÓGIAI ADATOK ELEMZÉSE ANALYSIS OF HYDROMETEOROLIGYCAL DATA OF BÜKK WATER LEVEL
RészletesebbenThe role of aristolochene synthase in diphosphate activation
Supporting information for The role of aristolochene synthase in diphosphate activation Juan A. Faraldos, Verónica González and Rudolf K. Allemann * School of Chemistry, Cardiff University, Main Building,
RészletesebbenFATERMÉSI FOK MEGHATÁROZÁSA AZ EGÉSZÁLLOMÁNY ÁTLAGNÖVEDÉKE ALAPJÁN
4. évfolyam 2. szám 2 0 1 4 101 107. oldal FATERMÉSI FOK MEGHATÁROZÁSA AZ EGÉSZÁLLOMÁNY ÁTLAGNÖVEDÉKE ALAPJÁN Veperdi Gábor Nyugat-magyarországi Egyetem, Erdômérnöki Kar Kivonat A fatermési fok meghatározása
RészletesebbenFAMILY STRUCTURES THROUGH THE LIFE CYCLE
FAMILY STRUCTURES THROUGH THE LIFE CYCLE István Harcsa Judit Monostori A magyar társadalom 2012-ben: trendek és perspektívák EU összehasonlításban Budapest, 2012 november 22-23 Introduction Factors which
RészletesebbenArchitecture of the Trypanosome RNA Editing Accessory Complex, MRB1
Architecture of the Trypanosome RNA Editing Accessory Complex, MRB1 Michelle L. Ammerman, Kurtis M. Downey, Hassan Hashimi, John C. Fisk, Danielle L. Tomasello, Drahomíra Faktorová, Lucie Hanzálková, Tony
RészletesebbenGlyma10g15850 aagggatccattctggaaccatatcttgctgtg ttgggtacccttggatgcaggatgacacg AtMKK6, AT5g56580
Supplemental table 1. Soybean MAPK, MAPKK, and MAPKKK genes and primers for VIGS cloning Gene_ID Forward Primer Reverse Primer Arabidopsis Ortholog Glyma04g03210 aagggatcctgcagcaagaaccagttcat ttgggtaccctaatggatgcgcattaggataaag
RészletesebbenLimitations and challenges of genetic barcode quantification
Limitations and challenges of genetic barcode quantification Lars hielecke, im ranyossy, ndreas Dahl, Rajiv iwari, Ingo Roeder, Hartmut eiger, Boris Fehse, Ingmar lauche and Kerstin ornils SUPPLEMENRY
RészletesebbenUSER MANUAL Guest user
USER MANUAL Guest user 1 Welcome in Kutatótér (Researchroom) Top menu 1. Click on it and the left side menu will pop up 2. With the slider you can make left side menu visible 3. Font side: enlarging font
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet. Hypothesis Testing. Petra Petrovics.
Hypothesis Testing Petra Petrovics PhD Student Inference from the Sample to the Population Estimation Hypothesis Testing Estimation: how can we determine the value of an unknown parameter of a population
RészletesebbenBioinformatics: Blending. Biology and Computer Science
Bioinformatics: Blending Biology and Computer Science MDNMSITNTPTSNDACLSIVHSLMCHRQ GGESETFAKRAIESLVKKLKEKKDELDSL ITAITTNGAHPSKCVTIQRTLDGRLQVAG RKGFPHVIYARLWRWPDLHKNELKHVK YCQYAFDLKCDSVCVNPYHYERVVSPGI DLSGLTLQSNAPSSMMVKDEYVHDFEG
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet. Correlation & Linear. Petra Petrovics.
Correlation & Linear Regression in SPSS Petra Petrovics PhD Student Types of dependence association between two nominal data mixed between a nominal and a ratio data correlation among ratio data Exercise
RészletesebbenMarkerless Escherichia coli rrn Deletion Strains for Genetic Determination of Ribosomal Binding Sites
Markerless Escherichia coli rrn Deletion Strains for Genetic Determination of Ribosomal Binding Sites Selwyn Quan *, Ole Skovgaard, Robert E. McLaughlin, Ed T. Buurman,1, and Catherine L. Squires * Department
RészletesebbenManuscript Title: Identification of a thermostable fungal lytic polysaccharide monooxygenase and
1 2 3 4 5 Journal name: Applied Microbiology and Biotechnology Manuscript Title: Identification of a thermostable fungal lytic polysaccharide monooxygenase and evaluation of its effect on lignocellulosic
RészletesebbenCorrelation & Linear Regression in SPSS
Correlation & Linear Regression in SPSS Types of dependence association between two nominal data mixed between a nominal and a ratio data correlation among ratio data Exercise 1 - Correlation File / Open
RészletesebbenAZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, TILLING
Hagyomány és haladás a növénynemesítésben AZ ÁRPA SZÁRAZSÁGTŰRÉSÉNEK VIZSGÁLATA: QTL- ÉS ASSZOCIÁCIÓS ANALÍZIS, MARKER ALAPÚ SZELEKCIÓ, BÁLINT ANDRÁS FERENC 1, SZIRA FRUZSINA 1, ANDREAS BÖRNER 2, KERSTIN
RészletesebbenA fehérjék hierarchikus szerkezete
Fehérjék felosztása A fehérjék hierarchikus szerkezete Smeller László Semmelweis Egyetem Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet Biológiai funkció alapján Enzimek (pl.: tripszin, citokróm-c ) Transzportfehérjék
RészletesebbenTutorial 1 The Central Dogma of molecular biology
oday DN RN rotein utorial 1 he entral Dogma of molecular biology Information flow in genetics:» ranscription» ranslation» Making sense of genomic information Information content in DN - Information content
RészletesebbenSzámítógépes Hálózatok GY 8.hét
Számítógépes Hálózatok GY 8.hét Laki Sándor ELTE-Ericsson Kommunikációs Hálózatok Laboratórium ELTE IK - Információs Rendszerek Tanszék lakis@elte.hu http://lakis.web.elte.hu Teszt 10 kérdés 10 perc canvas.elte.hu
RészletesebbenHogyan szűrjük a röntgensugarat?
Hogyan szűrjük a röntgensugarat? (A röntgencsőegység állandó szűrésének nemzetközi szabványáról) Porubszky Tamás OSSKI Munkahelyi Sugáregészségügyi Osztály E-mail: porubszky@osski.hu 1 IEC 60522 (IEC 522):
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Nonparametric Tests
Nonparametric Tests Petra Petrovics Hypothesis Testing Parametric Tests Mean of a population Population proportion Population Standard Deviation Nonparametric Tests Test for Independence Analysis of Variance
RészletesebbenBKI13ATEX0030/1 EK-Típus Vizsgálati Tanúsítvány/ EC-Type Examination Certificate 1. kiegészítés / Amendment 1 MSZ EN 60079-31:2014
(1) EK-TípusVizsgálati Tanúsítvány (2) A potenciálisan robbanásveszélyes környezetben történő alkalmazásra szánt berendezések, védelmi rendszerek 94/9/EK Direktíva / Equipment or Protective Systems Intended
RészletesebbenUsing the CW-Net in a user defined IP network
Using the CW-Net in a user defined IP network Data transmission and device control through IP platform CW-Net Basically, CableWorld's CW-Net operates in the 10.123.13.xxx IP address range. User Defined
RészletesebbenCashback 2015 Deposit Promotion teljes szabályzat
Cashback 2015 Deposit Promotion teljes szabályzat 1. Definitions 1. Definíciók: a) Account Client s trading account or any other accounts and/or registers maintained for Számla Az ügyfél kereskedési számlája
RészletesebbenRevenue Stamp Album for Hungary Magyar illetékbélyeg album. Content (tartalom) Documentary Stamps (okmánybélyegek)
Revenue Stamp Album for Hungary Magyar illetékbélyeg album Content (tartalom) Documentary Stamps (okmánybélyegek) I. OPM Austrian Financial Administration in Hungary (osztrák pénzügyigazgatás) 2 II. Currency:
RészletesebbenComputer Architecture
Computer Architecture Locality-aware programming 2016. április 27. Budapest Gábor Horváth associate professor BUTE Department of Telecommunications ghorvath@hit.bme.hu Számítógép Architektúrák Horváth
Részletesebbentccattaattcgacagaccagagttaaataatccttgtatgccattgtgatcacatctacagttcagattttgtatttca
Figure Legends for Supplementary Materials: Fig. 1. Nucleotide sequence of the zebrafish lumican (zlum) gene. Exons are indicated by uppercase letters, and introns are indicated by lowercase letters. The
RészletesebbenAZ ERDÕ NÖVEKEDÉSÉNEK VIZSGÁLATA TÉRINFORMATIKAI ÉS FOTOGRAMMETRIAI MÓDSZEREKKEL KARSZTOS MINTATERÜLETEN
Tájökológiai Lapok 5 (2): 287 293. (2007) 287 AZ ERDÕ NÖVEKEDÉSÉNEK VIZSGÁLATA TÉRINFORMATIKAI ÉS FOTOGRAMMETRIAI MÓDSZEREKKEL KARSZTOS MINTATERÜLETEN ZBORAY Zoltán Honvédelmi Minisztérium Térképészeti
RészletesebbenINDEXSTRUKTÚRÁK III.
2MU05_Bitmap.pdf camü_ea INDEXSTRUKTÚRÁK III. Molina-Ullman-Widom: Adatbázisrendszerek megvalósítása Panem, 2001könyv 5.4. Bittérkép indexek fejezete alapján Oracle: Indexek a gyakorlatban Oracle Database
Részletesebben7 th Iron Smelting Symposium 2010, Holland
7 th Iron Smelting Symposium 2010, Holland Október 13-17 között került megrendezésre a Hollandiai Alphen aan den Rijn városában található Archeon Skanzenben a 7. Vasolvasztó Szimpózium. Az öt napos rendezvényen
RészletesebbenNEUTRÍNÓ DETEKTOROK. A SzUPER -KAMIOKANDE példája
NEUTRÍNÓ DETEKTOROK A SzUPER -KAMIOKANDE példája Kamiokande = Kamioka bánya Nucleon Decay Experiment = nukleon bomlás kísérlet 1 TÉMAKÖRÖK A Szuper-Kamiokande mérőberendezés A Nap-neutrínó rejtély Legújabb
RészletesebbenStatistical Dependence
Statistical Dependence Petra Petrovics Statistical Dependence Deinition: Statistical dependence exists when the value o some variable is dependent upon or aected by the value o some other variable. Independent
RészletesebbenÉtkezési búzák mikotoxin tartalmának meghatározása prevenciós lehetıségek
Étkezési búzák mikotoxin tartalmának meghatározása prevenciós lehetıségek Téren, J., Gyimes, E., Véha, A. 2009. április 15. PICK KLUB Szeged 1 A magyarországi búzát károsító Fusarium fajok 2 A betakarítás
RészletesebbenTestLine - Angol teszt Minta feladatsor
Minta felaatsor venég Téma: Általános szintfelmérő Aláírás:... Dátum: 2016.05.29 08:18:49 Kérések száma: 25 kérés Kitöltési iő: 1:17:27 Nehézség: Összetett Pont egység: +6-2 Értékelés: Alaértelmezett értékelés
RészletesebbenSAJTÓKÖZLEMÉNY Budapest 2011. július 13.
SAJTÓKÖZLEMÉNY Budapest 2011. július 13. A MinDig TV a legdinamikusabban bıvülı televíziós szolgáltatás Magyarországon 2011 elsı öt hónapjában - A MinDig TV Extra a vezeték nélküli digitális televíziós
RészletesebbenAutochartist Alakzatok gyors tájékoztató
Autochartist Alakzatok gyors tájékoztató Kérjük vegyék figyelembe, hogy ezt az útmutatót a Privátbankár fordította magyar nyelvre, amely fodítás kizárólag az Ön kényelmét szolgálja. Az angol és a magyar
RészletesebbenEN United in diversity EN A8-0206/419. Amendment
22.3.2019 A8-0206/419 419 Article 2 paragraph 4 point a point i (i) the identity of the road transport operator; (i) the identity of the road transport operator by means of its intra-community tax identification
RészletesebbenSupplemental Information. RNase H1-Dependent Antisense Oligonucleotides. Are Robustly Active in Directing RNA Cleavage
YMTHE, Volume 25 Supplemental Information RNase H1-Dependent Antisense Oligonucleotides Are Robustly Active in Directing RNA Cleavage in Both the Cytoplasm and the Nucleus Xue-Hai Liang, Hong Sun, Joshua
RészletesebbenHibridspecifikus tápanyag-és vízhasznosítás kukoricánál csernozjom talajon
Hibridspecifikus tápanyag-és vízhasznosítás kukoricánál csernozjom talajon Karancsi Lajos Gábor Debreceni Egyetem Agrár és Gazdálkodástudományok Centruma Mezőgazdaság-, Élelmiszertudományi és Környezetgazdálkodási
RészletesebbenWhole mount in situ hybridization, sectioning, and immunostaining Ribonuclease protection assay (RPA) Collagen gel tube formation assay
Whole mount in situ hybridization, sectioning, and immunostaining In situ hybridization for tie-1 and lncrna tie-1as and sectioning of ISH stained embryos were performed according to previously published
RészletesebbenWhite Paper. Grounding Patch Panels
White Paper Grounding Patch Panels Tartalom 1. Bevezető... 1 2. A földelés jelentőssége... 3 3. AC elosztó rendszer... 3 4. Földelési rendszerek... 3 4.1. Fa... 3 4.2. Háló... 5 5. Patch panel földelési
RészletesebbenA TÓGAZDASÁGI HALTERMELÉS SZERKEZETÉNEK ELEMZÉSE. SZATHMÁRI LÁSZLÓ d r.- TENK ANTAL dr. ÖSSZEFOGLALÁS
A TÓGAZDASÁGI HALTERMELÉS SZERKEZETÉNEK ELEMZÉSE SZATHMÁRI LÁSZLÓ d r.- TENK ANTAL dr. ÖSSZEFOGLALÁS A hazai tógazdasági haltermelés a 90-es évek közepén tapasztalt mélypontról elmozdult és az utóbbi három
RészletesebbenMiskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet. Nonparametric Tests. Petra Petrovics.
Nonparametric Tests Petra Petrovics PhD Student Hypothesis Testing Parametric Tests Mean o a population Population proportion Population Standard Deviation Nonparametric Tests Test or Independence Analysis
RészletesebbenTeherviselő faszerkezet csavaros kapcsolatának tervezési tapasztalatai az európai előírások szerint
Teherviselő faszerkezet csavaros kapcsolatának tervezési tapasztalatai az európai előírások szerint Joó Balázs Designing olted connections according to European standards The suject of the article is the
RészletesebbenOncogenic stress sensitizes murine cancers to hypomorphic suppression of ATR
Oncogenic stress sensitizes murine cancers to hypomorphic suppression of ATR David W. Schoppy 1, Ryan L. Ragland 1, Oren Gilad 1, Nishita Shastri 1, Ashley A. Peters 1, Matilde Murga 2, Oscar Fernandez-Capetillo
RészletesebbenAkt1 Akt kinase activity Creb signaling CCTTACAGCCCTCAAGTACTCATTC GGCGTACTCCATGACAAAGCA Arc Actin binding
Additional File 1 (Table S1): Description and primer sequences of 80 candidate genes tested as potential synaptic plasticity formation genes in qrt-pcr array. Abbreviations: LTP: long-term potentiation,
Részletesebben}w!"#$%&'()+,-./012345<ya
Flexible Similarity Search of Seman c Vectors Using Fulltext Search Engines Michal Růžička, Vít Novotný, Petr Sojka; Jan Pomikálek, Radim Řehůřek Masaryk University, Faculty of Informa cs, Brno, Czech
RészletesebbenEffect of sowing technology on the yield and harvest grain moisture content of maize (Zea mays L.) hybrids with different genotypes
A - MurányiE:Layout 1 2/18/16 9:34 AM Page 1 Effect of sowing technology on the yield and harvest grain moisture content of maize (Zea mays L.) hybrids with different genotypes Eszter Murányi University
RészletesebbenELEKTRONIKAI ALAPISMERETEK ANGOL NYELVEN
ÉRETTSÉGI VIZSGA 2008. május 26. ELEKTRONIKAI ALAPISMERETEK ANGOL NYELVEN KÖZÉPSZINTŰ ÍRÁSBELI VIZSGA 2008. május 26. 8:00 Az írásbeli vizsga időtartama: 180 perc Pótlapok száma Tisztázati Piszkozati OKTATÁSI
Részletesebbenó Ú ő ó ó ó ö ó ó ő ö ó ö ö ő ö ó ö ö ö ö ó ó ó ó ó ö ó ó ó ó Ú ö ö ó ó Ú ú ó ó ö ó Ű ő ó ó ó ő ó ó ó ó ö ó ó ó ö ő ö ó ó ó Ú ó ó ö ó ö ó ö ő ó ó ó ó Ú ö ö ő ő ó ó ö ö ó ö ó ó ó ö ö ő ö Ú ó ó ó ü ú ú ű
Részletesebben3. Sejtalkotó molekulák III.
3. Sejtalkotó molekulák III. Fehérjék, fehérjeszintézis (transzkripció, transzláció, posztszintetikus módosítások). Enzimműködés 3.1 Fehérjék A genetikai információ egyik fő manifesztálódása Számos funkció
RészletesebbenTranzakciókezelés PL/SQL-ben
Tranzakciókezelés PL/SQL-ben ACID tulajdonságok: Tranzakció Atomosság, Konzisztencia, Izoláció, Tartósság A tranzakció állhat: - Több DML utasításból - Egy DDL utasításból A tranzakció kezdete az első
RészletesebbenGENERATÍV TEST (VIRÁGOS NÖVÉNYEK)
GENERATÍV TEST (VIRÁGOS NÖVÉNYEK) MITÓZIS IVAROS szaporító szervek hím női (antheridium) (archegonium) IVARTALAN szaporító szervek Sporangium 2n n MEIÓZIS (2n 2n) MITÓZIS IVARTALAN SZAPORÍTÓSZERVEK (2n
RészletesebbenELEKTRONIKAI ALAPISMERETEK ANGOL NYELVEN
ÉRETTSÉGI VIZSGA 200. május 4. ELEKTRONIKAI ALAPISMERETEK ANGOL NYELVEN KÖZÉPSZINTŰ ÍRÁSBELI VIZSGA 200. május 4. 8:00 Az írásbeli vizsga időtartama: 80 perc Pótlapok száma Tisztázati Piszkozati OKTATÁSI
RészletesebbenFormula Sound árlista
MIXERS FF-6000; FF6000P Formula Sound 160 6 channel dual format DJ mixer with removable fader panel. (Supplied with linear faders) Formula Sound 160P As above but with PRO X crossfade fitted. Formula Sound
RészletesebbenMelléklet BAZALT ANYAGÚ CSISZOLT KŐESZKÖZÖK KŐZETTANI ÉS GEOKÉMIAI VIZSGÁLATA (BALATONŐSZÖD - TEMETŐI DŰLŐ LELŐHELY)
Archeometriai Műhely 2011/1. Péterdi et al. melléklet 1 Melléklet BAZALT ANYAGÚ CSISZOLT KŐESZKÖZÖK KŐZETTANI ÉS GEOKÉMIAI VIZSGÁLATA (BALATONŐSZÖD - TEMETŐI DŰLŐ LELŐHELY) Appendix PETROGRAPHICAL AND
RészletesebbenVálasztási modellek 3
Választási modellek 3 Prileszky István Doktori Iskola 2018 http://www.sze.hu/~prile Forrás: A Self Instructing Course in Mode Choice Modeling: Multinomial and Nested Logit Models Prepared For U.S. Department
RészletesebbenContact us Toll free (800) fax (800)
Table of Contents Thank you for purchasing our product, your business is greatly appreciated. If you have any questions, comments, or concerns with the product you received please contact the factory.
RészletesebbenRegional Expert Meeting Livestock based Geographical Indication chains as an entry point to maintain agro-biodiversity
How Code of Practice can address the question of biodiversity (indigenous breeds, peculiarities of feeding, rearing traditional or marginalized systems)? Rendek Olga, Kerekegyháza 2009 október 20. 1 2
RészletesebbenBaldwin St S Ashburn Rd Baldwin St N Anderson St Thickson Rd N Exhibit 'A' to Amendment to the Whitby Official Plan Exhibit 1 Deferral #2 Modification
Baldwin St S Ashburn Rd Baldwin St N Anderson St Thickson Rd N Exhibit 'A' to Amendment to the Whitby Official Plan Exhibit 1 Modification #3 Brawley Rd W Brawley Rd E U Add: Community Central Area Add:
RészletesebbenBúza László, M Schill Judit, Szentgyörgyi Mária, Ábrahám Ágnes, Debreczeni Lajos, Keresztúri József, Muránszky Géza. 2009. április 22.
Gondolatok a MÉZ hamisítása kapcsán MIT-MIKOR-MELY Szereplő- MIKÉPPEN-MIÉRT hamisít, hamisíthat? Szofisztikált analitikai módszerek a hamisítások megelőzésére Búza László, M Schill Judit, Szentgyörgyi
RészletesebbenAdattípusok. Max. 2GByte
Adattípusok Típus Méret Megjegyzés Konstans BIT 1 bit TRUE/FALSE SMALLINT 2 byte -123 INTEGER 4 byte -123 COUNTER 4 byte Automatikus 123 REAL 4 byte -12.34E-2 FLOAT 8 byte -12.34E-2 CURRENCY / MONEY 8
RészletesebbenIrodavilágítás színes képek vizsgálatához, CIE TC 8-10 felmérése. Schanda János
Irodavilágítás színes képek vizsgálatához, CIE TC 8-10 felmérése Schanda János Áttekintés Színes képek vizsgálata A CIE TC 8-10 célkitűzései A felmérés előkészületei Előkísérletek Az előkísérletek tanulságai
RészletesebbenANGOL NYELV KÖZÉPSZINT SZÓBELI VIZSGA I. VIZSGÁZTATÓI PÉLDÁNY
ANGOL NYELV KÖZÉPSZINT SZÓBELI VIZSGA I. VIZSGÁZTATÓI PÉLDÁNY A feladatsor három részbol áll 1. A vizsgáztató társalgást kezdeményez a vizsgázóval. 2. A vizsgázó egy szituációs feladatban vesz részt a
Részletesebben